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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0111200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0111200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162); TAIR: AT3G50380.2 vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162); Swiss-Prot: sp|Q55FG3|VP13C_DICDI Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13C; TrEMBL-Plants: tr|K7MHD3|K7MHD3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0111200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:15885108..15919123) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACCCTAGGCACGGACACTCAACACCGTTCAGTTGGACAGAGACGTGCCAGCCAAGCCTTACCCTTACCCTTACCCTTTCC CGCCGATTCATTCACCCATTCCACTCCTCTAACTATAAATTCTGTTACTCCTCTCTTCACAACTCTACACTTCACAACCA ATCAATCCATGAAACTTCTACAACTATCACCACCATGCTCTTGAAAACCATAATCCACCGGAGACTACTCTCTCTACTCA ATCCATGGCTACGAGAAGAGCCCCAAATCGACCTCCAATTAGGGTTCTTCCACTCCCTCGCCGTCGCCAACAACCTCCGC TTCGACACCTCCGTTCTCAACCACCTCTTCGACGCTCCTCCGTCCCTCGTCATCAAGGACCTCACCGTCGAACGCCTCAC CGTTCGATTCTCCGCCTGGTCATCGCCGGACTTCACAATCGAACTTCACGGCGTTCGCCTCGTGCTGGCGTTCGAGTTAG TAACCGCTAACATCCTCTTTGTTTTCTCTTTTGATTGTTATTTGAATCAGTTATTGTTGAATGAATGGTTTTCATTTCTT TAACTGAATTAAGTAACTGTTTGGTTTTGAAGGAAGCCGGAAACGGAGGAATGCGCGAGGCGGTTGCGGAATTGGAAGTA TGATCATTCCGATTATCTCAGGAAGAAGCTTTCGGAACTCGATCCTGAGGTAAACTACTACTTTTTGCAGTTTTTGAACT CAATGACTCTTGCTACTTGATGAAGCTTTTTTTTGTTATCGGAACTTATGGCACTTCCTCTAGGTCATTAGTCCAATCGG AATGTCTCGCGATTAAAATTATTGGTGCAATTCACTAATTCGTAACGGTTTCTTTATTAGGCCGGTTCTTGTTTAAATCA AATGAATCTTGAGTACAAGTAAAGAGAGAGACATACCAGGAAGAATTAATTTGTTAAATATCATATCAATATCATTATGG 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0111200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTCTTGAAAACCATAATCCACCGGAGACTACTCTCTCTACTCAATCCATGGCTACGAGAAGAGCCCCAAATCGACCT CCAATTAGGGTTCTTCCACTCCCTCGCCGTCGCCAACAACCTCCGCTTCGACACCTCCGTTCTCAACCACCTCTTCGACG CTCCTCCGTCCCTCGTCATCAAGGACCTCACCGTCGAACGCCTCACCGTTCGATTCTCCGCCTGGTCATCGCCGGACTTC ACAATCGAACTTCACGGCGTTCGCCTCGTGCTGGCGTTCGAGAAGCCGGAAACGGAGGAATGCGCGAGGCGGTTGCGGAA TTGGAAGTATGATCATTCCGATTATCTCAGGAAGAAGCTTTCGGAACTCGATCCTGAGGGCTGTTCATTGCATCACATTT TGGAGAGGATCTTATTTGCTGTCCCTGAGAGGAAGGATTTTACATCATCTGTTTTGAATCTCATCATGAATAGCTGTCGT CTTGAAGCGCGTCACATTCACGTGGCGATTCAATTCCCCATATTAAATGACGAGTTTGAATGTTTTGGAGAAATAAAGGA GGTCAGTGCAAGTTCTAAGTATCTGGATAAAAAATGTCTTCTTAGAGGTTTTCTTAGTACAATTTTTATTCCGATGAGAG AGAGCTCTTTTACATTGAATGGCATTGGAATCAGGGTCGGATTAATTGGAAAGAATGACACAAAGCGTGTTTTGCTCTCA TCTGATGTCCGGAGTTTCATTAAATTCAGAGATCTTGAGCTGGCAGATTGCACACTCTGTTTTCCCGAACTAGCTTTTTC ATTCTCTCCAGATGACATCTCTAAGTATATTCATTTAGACGAATTACTATCTAATAAGTCCAACCAAGCTAGGAATGCTA GAGAATTATGGAGAATAGCTTCCAGCAGAATCGGCCACGTGACTTTATCTCCCAGATTGTCATTGCAAAGATTAGTTGGT GTTATAGGCCAATGGATAAACTATGTCAATACTTATGAGAATATCTTGCTTCTTACTGGATATTCTACTGGCCACACATG GAAGAAGTCCGTTTCTAAGGTGTCTCATAACAAACTGATTTTGAGTTCTGCTAGACACCATTGGGAGTTGATCTCTGACA TTGAGAAAAATTTGCCTGTTGAAGGTATAACACTGGCAAGGCGAATAGCTCGTCATAAAGCATCCTTGAAAATTCCATTT GATTGTCATAAGGAATTTGCGGCCACAAGTAATTTCTTTCACCCATTTCTTTCTATACTGGCATTTATATGGCAAGTCAT CTCAAAGATAATACATTGTATAGTGCTCATCTTTTACCGGAAGAAAATAATGCAAGATCCTGATATTGATGGATGTTTTT TGGGAAGTCTAAATGAAGAGCCTTGTCAAAGGTGTTATTTTGTGGTGAACTTTGGGAAAATCATAATATCAGTTTCTCGA ATAAATGAAATTCAACCATCTGCATGTGAAAAATTTCAGTCACATACTGGGATTTCAAACTCAGATTTCCTTTCAATATA CTTCTGTATGGATGCTTTGTTATTAGTATCTGTGAAAGACATTTTTGAACAAAGGGTCTTTCTATCATGTGGGAAAATGA AGGTTAATCTTGCACCCTTGAAAATGTCAGCAGAATCAATTACAATGGATATGCTTCGTTCAGTCAAAGGAAACGGAAAG GAAAGCATTAATGATATGGAATCACTTCTGTGGGTTGAACCTGCAAAGATGTTTCTCCTTTCAGAAACTAATGTTGCTGA ATTTGAAGATTCTGTTGATTCTCATATTGAAAGCTTTATGGGAAAGTTGTCAGCGAGTTTGAAAGGAATTTACAGCAATT TGGGTGAAAGTGAGATTGAGTATTCTGAAAATCCATGCCTTCTATTTAAGATTGAGATATATTCCACATATCCAGACAAC AATAATTCAGATTTTGGGTTTTGTGAATGGGGTTTAATGCTAGGAAAGTTAAATTTAGTTCTGACTCATTCTTCAGTAAC ATCGGTGTCTCTCATTCTTAGACAAATACAACATGCTGTTTACTGGAAGAACAAGAGGGAAATGTGTACTGTTCCAAATT TTGTGGAGAAAACAGAAAATGCTTGGGTTAAAAAATATGAACGTTTTTTCAAAGGATTGATTTTGGCCTTGCTTCAAAAG CTTCCAGAGAAACACATTCATTTTGGAGTGTTTGTTGATGGTTCTTCTGTAAGATTTTCACACAGAAGGGAGGCCAGTCT TGGTTGTAAAGACATTAATGACAATATCAGTCAGGATGACTTTGACTTCGCTTTTGATTTCAATGCGATTGAAGCTGTTG TCAGTTCTCCTCCTTTAGTTGGCATTGCATCATTGTCAGGTCACTTGGGGCTTGATACTACCAAAGCAGAGTGTATTACA TTGGAACCTCAAGTGATTGAAATGCCAAAACCCAACAATGATAAGTATGCTTCCTTAGGAAAGACTTCAATTGGTACCTA CCTTCATCTAAATGGCTTAAATGCTTATTTGGAGAAATCAGCAGAAGACCATCAGATTCAACTTTTTATATTGAAGCCAA TTACCGTCCAGATGCTATCCTCTAGGGATTACATTTATTCCTTGAGCACAACAATGTCTGCATTTTCATCTGCTTTGGAC ATAACAGCTGGAGGATTCACGGTTTTGTCATTTTTGGATGAGGTGTACATGATCTATAAGGCAGTTGCAAATTTGTCTAC TGCAGTATCTTATCTGTTTCATAGCTTTGAAGATGCTGATTGCATACATCCAGAAGTTATGGAACAAGAAGCATTTTTTG CAGAACCTGCTCGTGGTGTGGCAATTACAGGAGGGGATTTACAGACAAATGACATCTGCCCGTTTTTTATTAACGGGACC TGCAGATTCTATTCGATGGATGTCATTCTTCATTATTCTAGGACAAGTGATAATTTGGAGAGAGGTGCTAGAAAGTTTGA ATTTTTAACTGGCAACAAAATGGCTGTGAGAACGTTGCCTGAATGTGGAATTTGGTTTTCTATTCAGCAGGGAACTATCA TAGCATCTTGTGAAGAAGGGAAAATGGATATTGTCACTGATTTATCTGGAATCATGTCTTTTATTTTTGAATACCAGAAA CCTTTGGGAAACAACCATGATGATATTGTACTAGAAAATTTGCTATTGCAATCTGTTAATTGTTTACATGAAATATCTCT TTCTGGTTGCACATTTTCTTTATGCTTGGGTCTCGCTCAAAGTATCTCATCGTCAGGAAATTACAGCAAACCATTTGGTA GTTCTAATTCTGATGCTAATATATCTTACATGGCGCTAGAATCCAACTTGGCAGTCTCTCAAAGATCAAATAACCAATCT GCCTGCATGGTTGAAAAAATGGGGTCTCCTACAAATATCAGCGCATTAGCGTCAGAAAGTCACTGGTTATTGATAAATGT TGCAGTAGATAATATCTTCGTTGGTAGACGCTCAAAGAAGAGTGATCTGGTTCAAGCACATAAATTGAATAAGCTTCTAT CTTTGCTTTCTATTGGAGGAGAGTTTCATATGATATCCTGGGAAATCCAGGGTGGACTAGTTCTTCTTGAAACAGCATCG TTGCCAATGGCCATGGATAACTATTCTTCATATCTTCATTATATTGGGAATCTCACTTCTGATGTACAGCAACCTAATAA AAGCAAGCAGAAGGTAGAGCATGGCAAAAAGAGCGATAATCTCGATGACGAGATTGGTCAAGGGACTATTAGCACTTCTG AACAAGCTGAAAGTGTATTGCCGGATGCATTTGACTTATCTTTGTCACACTTTTCTCTTGTTTTAGCTCTGGAAAATGAA CATGGTAGTATCCAAGAAATCATACTGGAGGTTGACATGCATCTAAAATTTGAATTGGCAACTAATGGGAGAAAATTAAC AGTTAACCTTTCTCGTTTATCAATCCTCTCTCAAACTATTCATGATAGAGTGGAAGGTGAAATGGAAATTCCTCATTTTT CTTCTGTCACATCAAAAGATTCAAGATTTCAGAATTTTGGTGAATTGAACTCAGTTAATGGTGCAAGTAGTTCAAACGAC CCTGTTCCTGTTCAGTTAAGTCATCAGAACCAAATTTTAAAAGATTTCAGGGCTCTCTTGTCACTAGAGAGGCCAGACAA CGGATCTTTGCATTTGTCTCGGCATTGGTGTGGCACTGGTTCTCTCTCAGGTTTGGAGTTGACACTTTCTGTATATGAAG TTCAGACAATTTTGTCAATAGCCTCCTCACTCTCTGGGATATCCAGTCAGGATGCAGTTAAAGAATCGGAGAAAAATCAT AGGTCTACAAGCCATGAAATTTTAAATAGTTTGGAAGCGGTGATTCCTGATGGTGCAATTGTGGCTATTCAAGATGTCAA CCAGCACATGTATTTTACAGTTGAAGGTGAAGAAAAGGCTTTCAGTATAGGTGGTACCATTCATTATTCTCTTGTAGGAG AAAGGGCTCTTTTCAGGGTCAAACACTGTACCCAACGGAGATGGAATTCTACAATTTTGTGGTTTTCCTTGATATCACTG TATGCTAAGAGTGATATGGGTGTGCCGTTGAGATTAAATTGTCGATCAGGATCATGTTTTGTGGATATCTCTTGTACTAA CGATGGAGGATGCGCACTTTGGAGAGTCGATCCTCAACAGGATGAAAATTATGAACAAGTTGCTGACTGGGAAGCTTCCA GTCAATCAGTGAAGAGAAATTTCTATCTTGTGAACAAAAAGAATAACTCTGCTATTGCTTTCATTGATGGTGCTCCGGAG TTTGTTAGGAAGCCTGGGAATCCAATCAAATTTAAAGTTTTTGATGATCTTTCTGTTTCTGATGATGTTCCAGGGACAGC TAGCTACCCTAGCATGGCTCTGAAAACCTCTTGTCAGGGTGGAAAACTTCCTTGTATTGATATTAAAATTGAGAAATTTT CTATGAGTATTTTTCATGAACTTTCAGACACTGAAGATCTCTTCCCTCTCATTTGCTTGTTCATCAACAATACACAACTT GTTATACAAAGTTTAGCAACAAAATCCAGGGTCATGAGCACATCAAGGGCAGCGGTACATTACTTTGATGCTCAAAGAAA CTTATGGGGAGAACTACTCCATCCTGTAGAAATTTGCATTTTTTACCGATCTAATGTTGAGGCCCAGCTTTCAGAATATG CATCTCAAGCAGTGCCTGTAAATTTCTTCTGCCGAATAAAAGAGCTGGACATATCCCTAAATGAGAATTCACTGGATGTG CTTCTCTTCGTGATCGGGAAATTGAACCTGTCTGGTCCTTATTCACTGCGAAGCTCCATGGTTCTGGCTAACTGCTGCAA GGTGGAGAATCAGTCAGGGTCAAGTCTTCTATTTCACTTCAATCAGCAACAGATAATAATACCCAGGAAACAGTCAGCCT CCATTTTATTAAGGAGTCTCTCTGATCTCAAAAATCAAGATTTAGAATCTGCAACTTCTGCTTCTATCCAACTTGATTGT GGTTCCTTTGCAACTTCTTCTATTCATCTCCTACTTTCAAAAACACAGACTCTTGCTTGGAGAACCCGAATTATGTCAAA AGAAGGTTCAAGAACCTTCCCAGGGCCAATTTTAGTGGTCAACATTTCTAGAAATTCAGAGGTCGGCTTGTCATTTGTGG TTTCTCCTTTGATTAATATACATAATGAAACTGGATTTTCATTGGAACTTCAATTCCAGCGACCTGAGCCAATGGAAGAT GAATTTGCATCTGTGTTGTTAACACCAGGGGATTCTATTGATGATTCTGTGGCTATGTTTGATGCCACAAACTTATCTGG GGGAGTAAAGAGGGCGATAATGTCTTTAAGTGTTGGTAACTTCTTATTTTCATTTAGACCTAAAATGACAGAGGAATTGA TTACCTCTGAAAGTTCTTTTTCATCGGAATGGTCGGCTTATATTAAAGGTGGGAAAGCTGTGCGTCTATCTGGAATATTT GATAAATTAAACTACAGAGTTCGTAAGGCTTTGTTTGAAAAATCAGTTAAATGTTCCTTTAGCACAGCCCATTGTACACT CAAGTCTGAGGGTGTATCTGTTTCCAAAATGCATTTTCTCATTCAGACAATTGCTAGAGAAGTACCTATTGCATCACCTG AAAAGTCTGCTGCTGTGTTAAAAAATGAGAATTCAACAGTATCATTGCTGGAGCAGAAAGAAATATTTCTTCTTCCTACT GTACGAATGACCAATTTATTGCATTCGGAGATAGATGTCCTTCTAAGTGAAACAGGTCAGCCAAAGCTGGTTGAATATGA CAAAATTGGGAAGCAGGCAACAATATCATGTGGTTCAACAGTTGACTTTTATGCCAATCCAGAACTTATATACTTCACTG TGAATCTAACTTCTTCTACTTCTAGTTCCAAGCCTGTAAATAGTGGGGATTGTGTGAAGAAGTTACTGAAGCAGAACAAT GATGTCCAACATGTCGATATAAAGTTGGACCTTGATGGAGGAAATTTTTCTGCAACCTTGAGATTGTACCGTGGAAATAG GGGCATTCTGGAGGTTGTTGTTTTTACATCATATTCTATGAAGAATGATACAGCGTCACCAATTTATGTTCTTGCAACCA AAAGGTGGCCTCTATCCAGAGTTGAATTAGACAATTTAAATTCTAACATTCCTTCAGAGCTAGGCTTATTTTTGCCTCCA AAGTCAACCAGATCATGGTTCTTGAAATCTGAAAAAGTGCAACTGAAATTGCTGGAGGACCATACATCTGAGGCACTTCT AGACTTTGGTTCTTTGTCAGGCCTCACAGAAATAAGCTTTAAGAAAGAAGAAGGATCTGGTATAAAATCTGTAACAAAGA TTGGAGTGTCTATTGGCCCTTCTTCAGGAGAAATTGTCGTGCCATCACAAATGGTGACTTTGGTTCCACGATATGTTATA TGCAATGAATCTGAAGAACGTATAATTGTTCGCCAGTGCTATTTTCAGGATGAGGAGGCAGGTTTCGTCTCCATTGACAG CAAACAGAGAGTGCCACTACAGCTGAAGGAAGGATTGAGCAAGAAAAGAGAGTTCAGTGTATTTGAGCATTTTATCAGAA AGCACAGATTTTCTAGTGACAATTCCTTGTTATATATCCAGATTCAGACAAATGAGCCTGGATTGGGATGGTCTGGGCCA GTGTGTATAGCTTCTCTTGGACATTTTTTCTTGAAATTCAGAAAAGAGACGGATGAAGTTAAAACATTAGACAACAAAAT GACACAATTTGCAGCTGTTCATGTTGTAGAAGAAGGTTCTACTCTTGTTTTGAGTTTCTACAAGCCACCAAATTTGAGTC TGCCTTATCGAATTGAGAATTGTTTGCATAGTCTATCAATAACTTGCTATCAAAAGGATTCATTAGTGCCAGAGGTTCTT GGACCTGCATGCAGTGCTGATTATGTCTGGGATGATCTGACTCTTCCTCGTAAACTGGTTGTCCGCATCAATGATAGCCT TCAATTACGAGAGATTAAGTTGGATAAGGTGCAAGCATGGAGACCTTTCTACAAACTTGGGCAACAAGGAGTGTTGGCTC CACGTTTGCTCTTTGACAAAGGATCAAGAGATCAGAGGGTGAGTTTCAGGGAGCCTAGTGGCATGGAGATGGAAAAAGTG GGGTTTGAAATATATGCAGAGGGACCAACCCGAGTTTTGCGAATTTGTGAGATCTCTGATAGTTTCAAGAGACAAACAGT TCATGCTTTGTGTGCAAAAATTCAACTGAGAGTTTCTCAGTTTGCAGTTCACCTACTTGAACATGTAACACAGGAGGAAG ATGACAATGAGCGAAAAGATTTTTCACCAATTGTAGTTGCAAAGCTTGGGAATCTTCACATGATTACTATTTCTAATAAT CACCAGAAATATAATCAATTCAGTATACAGTACTTGAACTTTGATCTTAAGTGGAAAGGAGCTCCTTTTTCATCTATGCT TCGTGGACATCAATTAGATTACAGTGAATCAAATGATAGTGCACTGAAGGTTGTTTTGGTCCTACTTACATCCAATTCCA ATGTTAAGCAATTAAAATATTCATCAATTTTTCTTCAGCCAATTGATTTGAACATTGATGAGGAGACATTAATGAAAATT GTGTCATTTTGGAGATCATCCCTTAGTGCTTCAGAGAGTCAGCGCTACTATTTCGATCATTTTGAAGTTCATCCAATAAA GATCATTGCAAACTTTATTCCTGGGGAACCACGTTCAAGTTATAGCTCAGCTCAGGAGGCTCTAAGGTCCTTAATTCATA GTGTGGTTAAGGTGCCTTCCATAAAAAGTAGGGTAGTTGAACTGAATGGGGTTCTGATTACCCATGCTCTGATAACTATG CGTGAATTATTTATTAAGTGTGCTCAACATTATTCATGGTATACTATGAGGGCCATATATATTGCTAAAGGAAGCACCCT TCTTCCTCCAGAGTTTGTATCTATTTTTGATGACCTGGCTTCATCATCTCTTGATGTCTTCTTTGATCCATCCCGCGGGT TAGCAAATTTTCCAGGATTCACTTTAGGTACTTTCAAGTTGATAAGTAAATGTATCAAAGGTAAAGGTTTTTCAGGGACA AAGCGCTACTTTGGTGATCTAGGGAAAACTTTGAGATCAGCTGGTTCCAATATAGCTTTTGCAGCTGTAGCAGAAATATC AGACTCTGTTCTGAAAGGTGCAGAGGCAAATGGTTTCGATGGATTGATGAGTGGCTTTCACCAAGGAATTCTAAAATTGG CTATGGAGCCATCATTTCTTGGAACTGCATTGATGGAAGGCGGTCCAGATAGAAAGATATTGCTTGATCAAAGTCCAGGT GTTGATGAGTTATACATTGAAGGATATATCCAAGCCATGCTGGATACAGTTTATAGACAAGAATACCTTAGAGTCAGAGT TATTGACAATCAGGTTATCCTGAAAAACCTACCCCCCAATCACTCTCTTATCAATGAGATCACAAATCGTGTCAAGGAGT TCCTTGTGAGTAAGGCATTGCTAAAAGGAGATCCCTCAACTACATCCCACCCTTTACGCCGTCTTCGCGGAGAAAGTGAA TGGAGAATAGGACCAACAGTCTTGACATTGTGCCAGCATCTTTTTGTTAGCTTTGCGATACGCATATTGCGTAGGCAGGC CAACAAGTTTTTTCTCAGCATTAAGGGGGATAAGAAGTCAGATATTGGCGATCACGTAGATAACCCTCCAAGCTCTATCG AAAAAGTGCAGAAACTGAATTTCGTCCGAAAATGGGGCGTCGGCAAATTTGTGCTGTCTGGCTTGTTGGCATACGTTGAT GGACGTCTATGTCGTAGTATTCCCAATCCTTTAGCACGGAGAATAGTGAGTGGCTTTTTGTTGAGTTATATTGACAAAAA CGATGATGAATAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0111200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLLKTIIHRRLLSLLNPWLREEPQIDLQLGFFHSLAVANNLRFDTSVLNHLFDAPPSLVIKDLTVERLTVRFSAWSSPDF TIELHGVRLVLAFEKPETEECARRLRNWKYDHSDYLRKKLSELDPEGCSLHHILERILFAVPERKDFTSSVLNLIMNSCR LEARHIHVAIQFPILNDEFECFGEIKEVSASSKYLDKKCLLRGFLSTIFIPMRESSFTLNGIGIRVGLIGKNDTKRVLLS SDVRSFIKFRDLELADCTLCFPELAFSFSPDDISKYIHLDELLSNKSNQARNARELWRIASSRIGHVTLSPRLSLQRLVG VIGQWINYVNTYENILLLTGYSTGHTWKKSVSKVSHNKLILSSARHHWELISDIEKNLPVEGITLARRIARHKASLKIPF DCHKEFAATSNFFHPFLSILAFIWQVISKIIHCIVLIFYRKKIMQDPDIDGCFLGSLNEEPCQRCYFVVNFGKIIISVSR INEIQPSACEKFQSHTGISNSDFLSIYFCMDALLLVSVKDIFEQRVFLSCGKMKVNLAPLKMSAESITMDMLRSVKGNGK ESINDMESLLWVEPAKMFLLSETNVAEFEDSVDSHIESFMGKLSASLKGIYSNLGESEIEYSENPCLLFKIEIYSTYPDN NNSDFGFCEWGLMLGKLNLVLTHSSVTSVSLILRQIQHAVYWKNKREMCTVPNFVEKTENAWVKKYERFFKGLILALLQK LPEKHIHFGVFVDGSSVRFSHRREASLGCKDINDNISQDDFDFAFDFNAIEAVVSSPPLVGIASLSGHLGLDTTKAECIT LEPQVIEMPKPNNDKYASLGKTSIGTYLHLNGLNAYLEKSAEDHQIQLFILKPITVQMLSSRDYIYSLSTTMSAFSSALD ITAGGFTVLSFLDEVYMIYKAVANLSTAVSYLFHSFEDADCIHPEVMEQEAFFAEPARGVAITGGDLQTNDICPFFINGT CRFYSMDVILHYSRTSDNLERGARKFEFLTGNKMAVRTLPECGIWFSIQQGTIIASCEEGKMDIVTDLSGIMSFIFEYQK PLGNNHDDIVLENLLLQSVNCLHEISLSGCTFSLCLGLAQSISSSGNYSKPFGSSNSDANISYMALESNLAVSQRSNNQS ACMVEKMGSPTNISALASESHWLLINVAVDNIFVGRRSKKSDLVQAHKLNKLLSLLSIGGEFHMISWEIQGGLVLLETAS LPMAMDNYSSYLHYIGNLTSDVQQPNKSKQKVEHGKKSDNLDDEIGQGTISTSEQAESVLPDAFDLSLSHFSLVLALENE HGSIQEIILEVDMHLKFELATNGRKLTVNLSRLSILSQTIHDRVEGEMEIPHFSSVTSKDSRFQNFGELNSVNGASSSND PVPVQLSHQNQILKDFRALLSLERPDNGSLHLSRHWCGTGSLSGLELTLSVYEVQTILSIASSLSGISSQDAVKESEKNH RSTSHEILNSLEAVIPDGAIVAIQDVNQHMYFTVEGEEKAFSIGGTIHYSLVGERALFRVKHCTQRRWNSTILWFSLISL YAKSDMGVPLRLNCRSGSCFVDISCTNDGGCALWRVDPQQDENYEQVADWEASSQSVKRNFYLVNKKNNSAIAFIDGAPE FVRKPGNPIKFKVFDDLSVSDDVPGTASYPSMALKTSCQGGKLPCIDIKIEKFSMSIFHELSDTEDLFPLICLFINNTQL VIQSLATKSRVMSTSRAAVHYFDAQRNLWGELLHPVEICIFYRSNVEAQLSEYASQAVPVNFFCRIKELDISLNENSLDV LLFVIGKLNLSGPYSLRSSMVLANCCKVENQSGSSLLFHFNQQQIIIPRKQSASILLRSLSDLKNQDLESATSASIQLDC GSFATSSIHLLLSKTQTLAWRTRIMSKEGSRTFPGPILVVNISRNSEVGLSFVVSPLINIHNETGFSLELQFQRPEPMED EFASVLLTPGDSIDDSVAMFDATNLSGGVKRAIMSLSVGNFLFSFRPKMTEELITSESSFSSEWSAYIKGGKAVRLSGIF DKLNYRVRKALFEKSVKCSFSTAHCTLKSEGVSVSKMHFLIQTIAREVPIASPEKSAAVLKNENSTVSLLEQKEIFLLPT VRMTNLLHSEIDVLLSETGQPKLVEYDKIGKQATISCGSTVDFYANPELIYFTVNLTSSTSSSKPVNSGDCVKKLLKQNN DVQHVDIKLDLDGGNFSATLRLYRGNRGILEVVVFTSYSMKNDTASPIYVLATKRWPLSRVELDNLNSNIPSELGLFLPP KSTRSWFLKSEKVQLKLLEDHTSEALLDFGSLSGLTEISFKKEEGSGIKSVTKIGVSIGPSSGEIVVPSQMVTLVPRYVI CNESEERIIVRQCYFQDEEAGFVSIDSKQRVPLQLKEGLSKKREFSVFEHFIRKHRFSSDNSLLYIQIQTNEPGLGWSGP VCIASLGHFFLKFRKETDEVKTLDNKMTQFAAVHVVEEGSTLVLSFYKPPNLSLPYRIENCLHSLSITCYQKDSLVPEVL GPACSADYVWDDLTLPRKLVVRINDSLQLREIKLDKVQAWRPFYKLGQQGVLAPRLLFDKGSRDQRVSFREPSGMEMEKV GFEIYAEGPTRVLRICEISDSFKRQTVHALCAKIQLRVSQFAVHLLEHVTQEEDDNERKDFSPIVVAKLGNLHMITISNN HQKYNQFSIQYLNFDLKWKGAPFSSMLRGHQLDYSESNDSALKVVLVLLTSNSNVKQLKYSSIFLQPIDLNIDEETLMKI VSFWRSSLSASESQRYYFDHFEVHPIKIIANFIPGEPRSSYSSAQEALRSLIHSVVKVPSIKSRVVELNGVLITHALITM RELFIKCAQHYSWYTMRAIYIAKGSTLLPPEFVSIFDDLASSSLDVFFDPSRGLANFPGFTLGTFKLISKCIKGKGFSGT KRYFGDLGKTLRSAGSNIAFAAVAEISDSVLKGAEANGFDGLMSGFHQGILKLAMEPSFLGTALMEGGPDRKILLDQSPG VDELYIEGYIQAMLDTVYRQEYLRVRVIDNQVILKNLPPNHSLINEITNRVKEFLVSKALLKGDPSTTSHPLRRLRGESE WRIGPTVLTLCQHLFVSFAIRILRRQANKFFLSIKGDKKSDIGDHVDNPPSSIEKVQKLNFVRKWGVGKFVLSGLLAYVD GRLCRSIPNPLARRIVSGFLLSYIDKNDDE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 411 | 411 | - | – | |
| PANTHER | 33 | 3079 | 3047 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 33 | 3079 | 3047 | 0.0 | ||
| Phobius | 412 | 439 | 28 | - | – | |
| Phobius | 440 | 502 | 63 | - | – | |
| Phobius | 503 | 522 | 20 | - | – | |
| Phobius | 523 | 3042 | 2520 | - | – | |
| MobiDBLite | 1223 | 1246 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1227 | 1243 | 17 | - | – | |
| Pfam | 2191 | 2492 | 302 | 4.0E-23 | ||
| Phobius | 3043 | 3063 | 21 | - | – | |
| Phobius | 3064 | 3150 | 87 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0111200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…