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LotjaGi4g1v0149200.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0149200
Transcript ID LotjaGi4g1v0149200.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase; TAIR: AT5G58140.1 phototropin 2; Swiss-Prot: sp|P93025|PHOT2_ARATH Phototropin-2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151R110|A0A151R110_CAJCA Phototropin-2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0149200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:24353163..24369973) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TATGAGTTTTGCTTTATTACTTTAAAAAAATAAAAAATATAAATAATGTGGTATTGGGCAACTAAAGGAACATTAACATG GATAAACAATAAAACACCAAAAATCAGGACAATGAAGGCTGGTCATGATTAAGAAAATCTAATGTAAATGAAAACAAAAA CAAAGGAAACTGCCGGAATGAGGAGAACAACCGTGTAGCTCTGAGCCTGCCTCAATGGGGTGTAGCTCCAAGCTCCAACA TGGTAGTGGGTAGGGTAATGGATATCAGATGCTCATATGAAGAAATCACAGTCGGTGGTGCGGTGCCACCCAACTTCTCC GTGAAGGGCCAAACTTTGCATGATATGTGAAAATAGAGTATGGTGGGTGTAGGAGCAATCGAAACTAAGTGAGTAATTGC TTAAATAAGCTTGGTTGTAAAATTATGTTGATTTTCATTTCTGTCAATTCTACTTATAAACCCTTTTTCTCTATATATTA TGTACAGTTTTTCTGTAAAGTTGATAATTGCAAATAGCAAGAAATCGAGGGTGACTTTGATCTGATCCTAATTTAGTTAT TAGGCCCCATTTAGAATAGCTTATTTGAGCTTATCTGATAGCATAAGCGCTTATGCAAGTGTTTAGGAGAGTTTATGCAA ACAACTTATGGCTTACCAACTTATAAAAAAGAGCTTATGCTCATATACTCAATATGTCTATGTTGTTTCAAAACAATAGT GTTTTGTTGTTTCGTCGTACTCTATTGTTCAACATTATATTGTGTCTTAGATTCTCCGTGTGCGATTACATACTTGAATA TCTTCATCAATTGTCTCTTATATACCAGGTTAAAGCCACTGCAGAAAATGTTGATGAAGCTGTCCGAGAACTTCCTGATG CCAACTTGGTAAGGTATTCTTTTTGGGTTTGCATCTGGGTTTGGTTTATAAACTCTAGGTGTTTTTCTCTTCAGTTTTTC 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TACTAATATGGTTCTCAAATGGCATTTACTTTATTTATAGTGTTGGCAAATACGAGGAAGAGAGGGGGACCCAAAATAAC CTAAAAAGTATACTATATTCAACTAAAAAATTCAAAATATGGTGTATTTTCAAAGAAAGTGGCATTAACATGTGTATACC AAACTACCAACGGTTGGATAATATCAGTCCTGTAACTTAAAATATCCATAAAAGATAAATTTAATGCATGAGCAGGCAAC CCATCCTAAACAGGAGAGGAGAAAATTCATGAAACAAGTACACCTAAACAAAAGAAGGAAAATGATACAATGAACCTTCG CGGAATTAAATATACATGGAAAATGACTATTAGTATCAGTCTAGCAGATTATGGCATACCGATCAAATAAGCAAGTAATC AAAAGAGCTTACCCACAAAAATGTAAAGGTATATATTTGCATGTGCCAATAAACTATGAGCAGATTCAAATAGATCGACT TTTTTCATCGGGGTAAGTTACCTTTTCAATTGAATGGAACTATGGAAGTTTGTTTTGACTTTCACGTTGTTGTGGAATAT GGTCATTCTCAGAGATTTTAAAATTGGTAATTAATGTTGCTAGTACTTCTACCACCACATTAATCTCTCTGCATAATTTG GAAGACTTTTGTCTTCGTACTATTTAGTATTTACTTGTCTAGGAAACAGAGAAAGGTGTTTAAAAAATGTGCTCTTATTG CAGCGTATGGTTTGCTTGGCTAGAGCATAATTCTAAAACTTCCTTTGGGGATTGGGCTGTTTTTTCCATTCCTTTTCTAA GTTATCTCATCAGGCTTCGTGGGTTTTTTTTGTGTGTATTTATTCACACTACTCCCTTCTTTTTTTCCACAAAGCACTGG TTTATTGCATATCATTGCTTAGGCAGTAATATGTCCTAATTTTTTTTACCACTATGCACAATAATGAGAGGAAAGAAAAA 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GTTAATTCAGTAGTGTTTCCAAGATATTTTGGATATTATCATTTTACACCTCGCTACAAAATACTTAAACAATTTGTCTA GATGTCTATATAGAATAAACTTACATTCACTGTTCCAAGTTTAATAACACTGATGAAATCACACGATTACTGAAATATGA TTCTTTTATAGAAAGCTACTATTATGAGTTTTAGCACGAGGATAAAAGAATAGTTATTTATCAAAGAAGCTCCCTGTTAT CATTTTCATTTTTTAAAAACCAGTCTTTCCAAGATATTTTGGATATGTTCATTTTACACCTCACTACAAAATACTTATAC AATGCCTATATAGTTTATTTTGTGTGTTAAATTGCTCTGTCACTTCCGACCCGATTGTGGTGATGAGTCTCTTCAAGAGT GTGGCTCCTAAGAATTGAATTCTCATTCAAGGGGTTCAAACAACTACTTTTTATCACTACGGTCGGCACACATTAAATCT ACACATGTATA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0149200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGGCAATGGAAAAGGCTGCACTTCTAAATCGTAATAAGGTTCACCGAGCATGTGTTGAACGAGAGATTATATCATT ACTGGATCATCCTTTTCTTCCAACACTATACACCTCATTTCAGACTTCGACACATGTTTGCTTGATTACTGACTTTTGCG CCGGGGGAGAGTTGTTTGCATTACTTGACAAGCAACCAATGAAAATTTTCAATGAAGAATCATCAAGATTCTATGCAGCG GAGGTTGTCATTGGTTTGGAATATCTCCACTGTTTAGGTATAATTTATCGTGACTTAAAGCCTGAAAATGTCTTACTTCA GAAAGATGGCCATGTTGTATTAACTGATTTTGATCTATCGTTTATGACATCTTGTAAACCCCAGGTTGTGAAGCACTCAC TACCTGGTAAGAGAAGATCACGGAGTCAACCGCCACCAACATTCGTTGCAGAGCCAGATACGCAGTCAAATTCATTTGTT GGGACTGAAGAATATATTGCTCCTGAAATTATAACCGGAGCTGGGCATTCTAGTGCTATAGATTGGTGGACCCTTGGTAT CTTGTTGTATGAGATGCTCTATGGTCGGACACCTTTCAGAGGAAAGAATAGACAGAAGACATTTTCCAACATCTTATACA AGGATCTTACCTTTCCAAGCAGCATCCCGGTTAGTCTAGCAGCGAGGCAGTTGATTAATGCGCTATTGCAAAGAGACCCA GCCAGTCGACTAGGGTCAACTACTGGAGCCAATGAAATCAAACAACATCCTTTTTTCCGTGAAATCAATTGGCCTTTAAT CCGCAACATGAGTCCACCCCCATTAGACGTTCCTCTTCAATTGATAGGAAAAGATCCTGTGGCAAAGAATATAAATTGGG AAGATGATGGGGTGCTTGTTAGCTCCGTTGATATGGATATTTTTTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0149200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKAMEKAALLNRNKVHRACVEREIISLLDHPFLPTLYTSFQTSTHVCLITDFCAGGELFALLDKQPMKIFNEESSRFYAA EVVIGLEYLHCLGIIYRDLKPENVLLQKDGHVVLTDFDLSFMTSCKPQVVKHSLPGKRRSRSQPPPTFVAEPDTQSNSFV GTEEYIAPEIITGAGHSSAIDWWTLGILLYEMLYGRTPFRGKNRQKTFSNILYKDLTFPSSIPVSLAARQLINALLQRDP ASRLGSTTGANEIKQHPFFREINWPLIRNMSPPPLDVPLQLIGKDPVAKNINWEDDGVLVSSVDMDIF 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

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SUPERFAMILY 1 284 284 5.91E-71
ProSiteProfiles 1 259 259 40.711
SMART 1 259 259 7.9E-64
Gene3D 1 56 56 3.8E-85
PANTHER 1 282 282 5.7E-174
PANTHER 1 282 282 5.7E-174
CDD 1 282 282 0.0
Pfam 2 259 258 4.9E-54
Gene3D 57 274 218 3.8E-85
ProSitePatterns 94 106 13 -
MobiDBLite 132 155 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0149200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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