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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0160200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0160200.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinesin-like protein; TAIR: AT5G65460.4 kinesin like protein for actin based chloroplast movement 2; Swiss-Prot: sp|Q9FKP4|KN14B_ARATH Kinesin-like protein KIN-14B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FBU8|A0A0R0FBU8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0160200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:28566010..28586392) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGTGTTTTAAATTTAATGAACAATGTTTTGGTATTTTTTCTTTCCGCGGATTTCAGTGTCGGCGCAACCTTTCTATGGT TCTTGTGTGAACTTCAATTAATGGCTAGAAGGGTTCCGTCCCTGGCTAGAAGATATGAATCCATGAACTATCTTTTATAA TATTTTAGGTACTTGCATTGCACATTCTTGCAGGCCAATTCTGCCTGTTACTGTTTTTATATGGTGCCCATACTGATTTG TATTGTTTTAGACTTTTAGTCATGCATTAACAATTGCATCAAATATTTTGCAAAGCTTGCTAGAGAAGACTATTTGCAGT TAAGGCAAGAAGCGAGTGAACTTCAAGAATACTCAAATGCAAAACTTGATCGAGTTACACGGTATCTTGGTGTTCTAGCT GAGAAAACCCGCAAGCTAGGTAAGAAACTAATTTGTCTTGACCGTCAGCTCATGCTAGATTAGCAAAAGATTTTGGACTG AGAATCTGTTAGTCTAAAATATTTTGCTTGATTAAATCAAATAATTTCTTTGACAAAACGAAACTTATTCTTCAAACATA TGTTGGTAAATGAGAATGGTGTTTTTCACATAGGTACATGGTTTTGAGCTGTGCTGCTGCAATAAATCTGGCAGTTTTAG CATTTAGTTTCTAGAAGTACATGGAGTTATGTCATATTTTATTAATTTATATTTTTTGGATCCAAAAGTTCAGGGGGAGA GTAGGTATGGCAAGGGTTTGGTTCACTAATTTTATCCTTTTTTTCATGTCTAGTTATTTTATGGTTGGTTTTCTTCTATT AAACTTTGAAATTTGTGGCCTACTTATGAATTTCAGATCAAGTTGCCCTGGAAACTGAAGCAAGAATATCGCCGTTAATC AATGAGAAAAGAAGATTGTTCAATGATTTATTGACATCTAAAGGTAATTTCTGTGTATAATTTTTCCTTTAGTATTGGGC 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CTATACTGAAGCAGTTTAGGTCAATTCTCCCATTTACACCCAACTCAGTTCCAGAGTTCTTCTCATTCCTGAGCTGTATA TTATATTTCAAAAAACTTAATTATGTTTCTATAATCATAGTTATCAATCACGGATCACAGCCACCGAAAGAACTGGGATA GCGGAATGGCTGCGATATGGTGGTTGCCGGAGGTCCGTCAGAGAGAAGGTCGGGCGGTGGCCGTTCGCGCCTGAGAGAGA AAAGGAGACGAAGTTGTGTTTCCCAGGTCGTGGAGGTGGAGGCGTGCAAGCTCCCCGTCTTTCATTTAGGGTTTCTTTCA TAGGGAAGTTCCATAAAAGCCCCTCACAAAACCTTTTAAAGTCAAGGGTATTTTCATTCAGGGTATCTTTAATAGGGAAA TTCCATAATAGCCCCTAAGGTACCCACTTAACCTTTTAAAGTCAAGGGTATTTTCATAAGTCTAGAGCCCTTCCCTATCG CGCTGCATCGCAAATAGGCGAGCGGAGACGTGATGAGCCCTGCCGTCCCAAGGGGTCGGAGCGCTCACGCGCAATAGATA ACATAGATGATAATTGCATTCAATGTATCATCAACATAAACAAGGTGAAAGATGCAAACAGAATTCTATTATTTTTGTAA TGCTGATATACAAGGGAGAATTTCATTACAAGAGTTACCCCTTTACATCTGAAAGGCTTAGTTCTGTAACAATTATTCCC TAACTAAACTAAATCACTTCTCCTATTTCATATATTCCTTCTAACCAACTATTGTCAATAACCCAATGTGTTACCGAACT AATTATCCCACTATCTATTTTTCGTGTTTATTTCTTCGGCTGTTCACCTACTTTATTTTGTTGCTCAAGCCTGTTGTTGA CAATACCTCCTGTCAATCAATCAACCTATTAGAATTCGAGGTAGGCCTAACTCTGCCCCAACTATACGCAGTCTGAACTA TATGAATTCTAATATGATATCAGAGCTTCCTAGGTTTGTTTTTTGGGCTAACCATAAATGGGCATCCCACAATGTCTAGT CCTGCAAACTTCACGCTCAAATGTTCAGCCTTGGACTTGAGGGGTGTGTTGTGTTAAGGGTCTAGAGAAATTCTCACCCC TGAGCTACCTTTGAGGATAGAGTTAGGCATAACCTAAATTTGAAGGCAACCAGGTCCTCGAGTCAAGGTTGAATTTTTGA AACTGGTCACAAGAGGTAGATAGATCCGCTCTCACATAGCCTCTTCTGCTGTTTTATCATGACATTGTACCAAAATCTGA TCCATATAGTTGCCTTGCCTACTAACAGAACGGGTTGCCAGTATTGTGATGGGCTTATATAAAGCTCAAGCAACCCATAA TTCTTCCAAGAGTTAAGACTGCGCGATCTCCCACTGCCTTCTTTAGTTGAGATACGTGAATTCTAGGTTGTAGCCGGGAG ATGGAATTGGAAAGCTACTGGTCTGGCCTAGTGGAGAACCAAAGAAGGGCTGAAATAACCGGCAGTTAGCTTTGGGTGCT GATGAGTATGCATGAATCCCTGCCAATTGAACCTCATTTTCAAATAGACCCAATCTCCTTGCTGCATACTAGAGGGTTTC ATATGAATCTTAGCTCAGCGGATCAAATGGGGTTGAGCTTGAACTAGATCCTGTAATAGATATTTGAGTTGGAAAATCAT TTAGATCTGCAGGAAAGACCAACAAGACCGAGCCAGAAAATCTAGATATACTCCTCGACCTTTCCCACCTGATTCATTCA TACGTCCGTAGACTTCGACTTTCAAATATTTTGAGCAGCAAGATGATGAAACTCTCCCAAAAATGTTCTCAACACCCATG CTTAACTGCTTCAGATTTACAGGCAGGAAGAAAAATATCAAATGGGACCACGTAAGGGGAAGCATGTGGGAACCTATAAC TTGATGGATGGGAAATATGAGTAACTTTGAGGTGCCGAAGGTAGACTCAAGTAGCAGTTCAGCATCAATATAGGGCATCC TTTGTCTCCCATGTAGCAAGCTCAGTTTTGTAATTGATTGCAGCAGAGGACCTGTCAATATGACACATCCCTCTGCCTTT CATAAACACCTTGGTTTGAAACTAAACGTTCTACCCATTAAAATTAGCTTAGAAGATTTTGGTTGCCATTGTTTAGAAAA TCTTAAAGTCTAAACTTGGGATGAAAACAAATCACGTAATGTGGGGAATATAATCAATAGACCGCATGGGCTAAAGCTAG AAAAACTGACTACCTAGTATAAGAGAGAAAAATCTATGTTGCCTTGTGAAAGTGTCTGAATGACCTTTATGTATTTTTCC CATTTATGTGTATGATCTATGGGTACTAACTCTATTTAGTGCAATTATACATTTTAAGTGCCAGTTAATTAGGATTCCTA ATTATTAAATGTGCTAGTTGGCTGCTGCACTAACATGCAAAGTTGAGTCTTTTTCATATCATTTTATGGTGATCATCCCG TCCTCTGTTCACCTGGTATTTAGGAGTTTATAGCACTATTTAAATGATCACCAATGCTTAAAGTTTGCTGTTGTTTATGC TGGAGCTGAGTACTAAGGATTGAATTGCTGGAAAAGTATTTCGATTGATTTTCTTGTGGTGCCTAAATCCTCTATTCTGT TGTGATACAGTCAATTCCTGAAGAAGATGACCACATTCAAGATCCATCTCATGGTCGCAAATCAACAGATCTGGGGTCTG GATCTGAAATTGATGTGGCACAGTGGAATGTACTCCAATTTAATACGGGTGCTAGCTCACCCTTTATAATAAAATGTGGA GCGAACTCAAGTTCAGAACTAGTCATTAAAGCTGATGCTCGAGTTCAGGAACCTAAAGGCGGTGAAATTGTGAGAGTTGC CCCTAGACCCTCCATTTTGGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGAAACAAGTATTTGCCGAGCTACCTGAGGCTCTAAGCT TGCTTGCCCTAGCAAGGACTGCAGATGGCACTCGGGCACGATATTCTAGGTTATATAGGACTTTGGCTACCAAGGTTCCA TCCCTTAGAGACTTGGTCAGCGAGCTCGAAAAGGGGGGTGCTCTCAAGGATGTAAGAACATGA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0160200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGGATCAAGCTATGATCGGGGTTTATATGCTCGTTGTTTTGAGGAGTTATTTGATCTAGCCAACCTGGACACAAC ATCTACTTCACAATATAAATTCTGTGTTACAGTTTGTGAGCTCTATAATGAGCAGACAAGGGATCTACTTTTGGTATCAG GGAAAAACATGCCTAAACTATGTTTGGGATCACCTGAATGCTCCATAGAACTGGCGCAGGAAAAAGTTGATAACCCTCTG GACTTTTCTACAGTTTTAAAAGCTGCATTTCAGAGTCGGGGAAATGATTTATTAAAGATTAACGTATCTCATTTGATTGT CACGATACACATATTTTATAACAATTTGATCACTGGTGAAAACTCATATAGCAAACTTTCTCTGGTTGACTTGGCTGGAA GTGAAGGTTCAATAACAGAAGATGATAGTGGTGAGCGTGTCACAGATTTGCTGCATGTTATGAAGTCACTTTCAGCGCTG GGAGATGTTTTGTCTTCTTTAACATCAAAGAAGGATATTGTTCCTTATGAAAATTCGGCATTAACGAAAGTACTTGCAGA TTCACTTGGTGGGAGTTCAAAAACTCTGTTAATTGTGAATGTCTGTCCAAGTATTTCGAATTTATCTGAGACATTGTTGT CTCTAAATTTCTCTGCTAGAGCTCGAAACTCTGTATTAAGCCTTGGAAACCGAGATACAATTAAGAAGTGGAGAGATGTT GCTAATGATGCACGTAAGGAGTTGTATGAGAAGGAAAAAGAAATCCATGATTTAAAGCAAGAGGGTCTGGGACTCAAGCA AGCACTTAAAGATGCCAATGATCAGGGTGTTCTACTCTTCAATGAAGTACAAAAGGCTTGGAAAGTTTCTTCTGCACTGC AGACTGATTTGAAGTCGGAGCATATTTTGCTTTCTGATAAGTATAATATTGAGAAAGAACAAAATACTCAGCTTAGAAAT CAAGTTGCTCAACTCTTACAGTTAGAGCAGGATAAAAAATTGCAGATACAGCAGCAAGATTCAACCATCAAAAGTTTGCA GGCTGAAATTAGAACTCTTGAAACTCAACTCAATGAAGCTCTTAGATCCAGCGAAAGTAGGTCAAAGTTTGTCTTAGAAA AAAGCTCTGAGACTCTATCTGATTCCAGACCAACTGGAGATGGCATGGAGACTTCTGCAGTAACCAAAAAATTAGAAGAA GAACTCAAGAAACGTGATGCCCTGATTGAGAGGCTGCATGAAGAAAATGAGAAATTATTTGATAGATTAACTGAGAAAAA ATCTGTGGCTGGATCGCCCAAGATGACACGTTATTTTCAGCTTTCAAGTCCATCACCTCGTGAATCAGTTAATGCTCAGC CTCGAGATATGGGAAGGAATGGCACCAGCAATACAACATCTCAGTCCATGAATGTTCTCCCTTCACCTTTGGCCACTGAT AAGAATGACGGCACAGTTGCATTAGTTAAATCTGACTCTGAAATAGTTAAGACTACCCCTGCTGGTGAATACCTTACTGC TGCCCTGAATGACTTTGATCCAGATCAGCATGAAGGGCATGCTGCCATTTCTGATGGTGCAAACAAGCTTTTGATGCTGG TTCTGGCTGCTGTCATAAAAGCCGGTGCCTCTAGAGAACATGAGATACTTGCTGAAATTAGGGATGCTGTTTTCTCTTTT ATTAAGAAAATGGAACCAAAGCGAGTTATGGACACCATGCTTGTTTCCCGTGTTAGAATTCTGTATATACGATCTTTACT TGCAAGATCCCCAGAGTTGCAATCGATTAAGGTCTTGCCAGTTGAGTGCTTTCTTGAGAAGACTAATACTGGTCGAAGTA GAAGTTCCAGCCGAGGGAATAGTCCTGGAAGGTCTCCTGTGCAATATGTTGATGAGCAGATCCAGGGCTTTAAAGTAAAT TTAAAGCCAGAAAAGAAGTCTAAATTTTCGTCTGTTGTGTTGAAGATACGTGGGATTGATCAGGACATCTGGAGGCAGCA AGTAACTGGTGGAAAGCTTAGAGAAATTACTGAGGAAGCCAAAATTTTTGCAATTGGGAACAAGGCTCTTGCTGCACTCT TTGTACATACTCCAGCTGGTGAGCTGCAGCGCCAAATTAGATCCTGGCTTGCAGAGAATTTTGATTTTCTCTCTGTTTCT GGAAATGATGCATCGGAGGGGTCAACTGGTCAGTTGGAACTTCTTTCAACTGCAATTATGGATGGTTGGATGGCTGGACT AGGTGCTGCTCTACCTCCTCACACTGATGCTCTTGGCCAGCTATTATTTGAATATTCAAAACGTGTGTATACTTCTCAAC TACAGCACTTGAAGGATATTGCTGGTACCTTGGCAACAGAAGAGGCTGAAGATGCAGCACAAGTAGCCAAGCTGCGGTCT GCTCTAGAATCTGTTGATCATAAAAGAAGAAAGATTCTGCAACAAATGAGAAGTGATGTAGCTTTATTGACATTGGAAAA TGGTGGTTCACCAATTTTGAATCCTTCTACTGCAGCTGAAGATGCGCGATTAGCATCTCTTATTTCACTTGATAGCATAT TAAAGCAAATCAAGGATATAACAAGACTTTCTTCTGTGAGCATCTTGAGCAGAAGTAAGAAAAGAGCGATGCTTGCTTCT CTCAATGAACTAAAAGATCAAATGCCGTCACTTCTTGAAATTGATCATCCATGTGCTCATAGCCACCTTGCAGATGCTTG CCACATGGTTGAGTCAATTCCTGAAGAAGATGACCACATTCAAGATCCATCTCATGGTCGCAAATCAACAGATCTGGGGT CTGGATCTGAAATTGATGTGGCACAGTGGAATGTACTCCAATTTAATACGGGTGCTAGCTCACCCTTTATAATAAAATGT GGAGCGAACTCAAGTTCAGAACTAGTCATTAAAGCTGATGCTCGAGTTCAGGAACCTAAAGGCGGTGAAATTGTGAGAGT TGCCCCTAGACCCTCCATTTTGGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGAAACAAGTATTTGCCGAGCTACCTGAGGCTCTAA GCTTGCTTGCCCTAGCAAGGACTGCAGATGGCACTCGGGCACGATATTCTAGGTTATATAGGACTTTGGCTACCAAGGTT CCATCCCTTAGAGACTTGGTCAGCGAGCTCGAAAAGGGGGGTGCTCTCAAGGATGTAAGAACATGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0160200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEGSSYDRGLYARCFEELFDLANLDTTSTSQYKFCVTVCELYNEQTRDLLLVSGKNMPKLCLGSPECSIELAQEKVDNPL DFSTVLKAAFQSRGNDLLKINVSHLIVTIHIFYNNLITGENSYSKLSLVDLAGSEGSITEDDSGERVTDLLHVMKSLSAL GDVLSSLTSKKDIVPYENSALTKVLADSLGGSSKTLLIVNVCPSISNLSETLLSLNFSARARNSVLSLGNRDTIKKWRDV ANDARKELYEKEKEIHDLKQEGLGLKQALKDANDQGVLLFNEVQKAWKVSSALQTDLKSEHILLSDKYNIEKEQNTQLRN QVAQLLQLEQDKKLQIQQQDSTIKSLQAEIRTLETQLNEALRSSESRSKFVLEKSSETLSDSRPTGDGMETSAVTKKLEE ELKKRDALIERLHEENEKLFDRLTEKKSVAGSPKMTRYFQLSSPSPRESVNAQPRDMGRNGTSNTTSQSMNVLPSPLATD KNDGTVALVKSDSEIVKTTPAGEYLTAALNDFDPDQHEGHAAISDGANKLLMLVLAAVIKAGASREHEILAEIRDAVFSF IKKMEPKRVMDTMLVSRVRILYIRSLLARSPELQSIKVLPVECFLEKTNTGRSRSSSRGNSPGRSPVQYVDEQIQGFKVN LKPEKKSKFSSVVLKIRGIDQDIWRQQVTGGKLREITEEAKIFAIGNKALAALFVHTPAGELQRQIRSWLAENFDFLSVS GNDASEGSTGQLELLSTAIMDGWMAGLGAALPPHTDALGQLLFEYSKRVYTSQLQHLKDIAGTLATEEAEDAAQVAKLRS ALESVDHKRRKILQQMRSDVALLTLENGGSPILNPSTAAEDARLASLISLDSILKQIKDITRLSSVSILSRSKKRAMLAS LNELKDQMPSLLEIDHPCAHSHLADACHMVESIPEEDDHIQDPSHGRKSTDLGSGSEIDVAQWNVLQFNTGASSPFIIKC GANSSSELVIKADARVQEPKGGEIVRVAPRPSILENMSLEEMKQVFAELPEALSLLALARTADGTRARYSRLYRTLATKV PSLRDLVSELEKGGALKDVRT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 262 | 262 | 4.1E-49 | ||
| PANTHER | 1 | 1054 | 1054 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1054 | 1054 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 1 | 261 | 261 | 1.28E-48 | ||
| SMART | 1 | 232 | 232 | 5.7E-13 | ||
| Pfam | 1 | 223 | 223 | 3.1E-46 | ||
| ProSiteProfiles | 1 | 224 | 224 | 48.123 | ||
| ProSitePatterns | 124 | 135 | 12 | - | ||
| PRINTS | 125 | 143 | 19 | 3.9E-11 | ||
| PRINTS | 174 | 195 | 22 | 3.9E-11 | ||
| Coils | 234 | 275 | 42 | - | – | |
| Coils | 308 | 331 | 24 | - | – | |
| Coils | 336 | 363 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 364 | 396 | 33 | - | – | |
| Coils | 395 | 429 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 434 | 479 | 46 | - | – | |
| MobiDBLite | 435 | 478 | 44 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Microtubule motor activity | Catalysis of movement along a microtubule, coupled to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate (usually ATP). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Microtubule-based movement | A microtubule-based process that results in the movement of organelles, other microtubules, or other cellular components. Examples include motor-driven movement along microtubules and movement driven by polymerization or depolymerization of microtubules. | ||
| Molecular function | Microtubule binding | Interacting selectively and non-covalently with microtubules, filaments composed of tubulin monomers. | ||
| Biological process | Chloroplast accumulation movement | The relocation process in which chloroplasts in photosynthetic cells move toward a brighter area in a cell to optimize photosynthesis. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0160200.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…