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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi4g1v0234000 |
Transcript ID | LotjaGi4g1v0234000.1 |
Related isoforms 6 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Pantothenate kinase, putative; TAIR: AT4G32180.1 pantothenate kinase 2; Swiss-Prot: sp|Q8L5Y9|PANK2_ARATH Pantothenate kinase 2; TrEMBL-Plants: tr|K7MKQ2|K7MKQ2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0234000 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:54687780..54698758) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCACTTCCACTTGAGATATGTTTGGCCCACTTGAGTAGTAACCACGTCAGCTTCTGATTGAGGTTGTTCACTTCGATTA AGGAGGTGGTTGTTGACTTGATGAGCAACAATACGACATAGAGATTACTTGAGTCTTGAGTTGAAACTCGAAAGCAGAGG AGGGAGACCGTTACTCATGGCGCACACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAAC TGGATCTTAGCAAAGCAGCGATTCAAGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGAT ATATCTCATTTGGCTCTTGACATTGGAGGTGCTGTATTCAGTATCCAATTTCATTGACATCACATTTATATTTATATTTC ATGTTTCTTAGTTCTTTAATTTCACTTCAATGTTATTTCAATTGGCTGGAAACTAGTTTCTTAAGATTGTTTAAATTATG TTATCAGGGTCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGAAGGTT GAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGATTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCATTTTG TCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAATGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTCGTATTACTGTC TTGTTCAATTAACTTTATTTTTAGTCAGTCTTTTCTCTGCCACATTGGATAATGTTTTTTAGTTGTTTTCTTTCTATGAG ATAATTCAACTATACTTTGAGAACTAGTGAATCTAAAGTTGTGGATTTTTTTCTTTCTTATAGGTAGGGAATCATCGAAT ACCATAATTAAGGTGAGTTTGATTCTCTGACTGTTTTTTCTGTCACAATGGTGTTTCAATGCCCTAATGTGTCCACTTTG 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AATATACACCCCACATACAATATGCATGTGTGTATATTTACATTTGAAATTCAGCAATACCGAATTAACTAAGCATAAAG AATTGCATATTTTTAACACACCAAATTTAGGGTTCCTGTGTAAGTGTATGTATTATATCAGTATATGCATGTTTGTATGA AAAGATGTATCCATTGTAGAATTTTTCCATAAATATCAACTGAACACTTAATTTTTGTTGTAAATGAGCTATTCATTTTA TGTTGGAAAAAAGTTCATATTAGTTCTTTAGAGTTTGTAAGTCTTTTATTTAGTAGGATTTGATAGAAAATATGCTGATT TTAAAGTTTATTCTTTTTCTGTAGAAAGATTTTCCCCAAAAAGACTTTTCATCCAACTACAACCTAAAAAAGCATGGACA AAAATCTCTAAACATGGAATATAATCTATGATCATTATTTATAGAATAATGCTTTCTGGCAATATATCAAGATTATCTTC CTTCAGTAGTTTTCATGCTCTGTTCAACTATTTGTTCCTCCAATGATTTCCTGACCAATTGTGTTGTTTCTATCTCTTCT GTGAAGATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCACAAGGGGTCATGC CTATACCATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTACATAATGATGACCAGAGATTTTTTTGTTTGTTTTTAAT TTAATTATTATTTTGTGTTGAGATTTATATATTTATCATTCAGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCTTGCGACAT GAAGGATTTCTGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGT TGAAAGATTCCCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGAGAAGGCAA GTGAGAGGAATTGGAAAACTTTGGTGTCTGCTAGTCACCGGCTTGAGATAAATGAACTAATTAAATGCACTTACTTATAT TTTATGGTGTAAATCTGAAGCCAATTTGATAAGAATGGTATTTTTGGCTACCAATTTTGGTATCATTAAGATTGTGCCAC TTTGTTGAGTCACTGGTTTCTCTTGAAGCTGACATAATAAAATTACTAAAGCAACTCCACTAATTAGATTCTCTAGAATA ATTTTTTCATTTCTCCCCCTGGAATGAATCATATCCAATCAAATTGGACCACTTGATAACCATTTAAAAACAGATAATGT GGAATCTAGTTATATATATTGGAAAAACTTTTAAATATTGAGAAAGACATTATAAAGTGGTAAGGAAAGAAGTAAAAGAT TGGTAGGTGTGGCAGTATCCTTTAGAGTTTGCAAATATTTCTAACAAGTTGAGCTTGTAAAACACTCCTTTATATCAGCG TTTCTGATAAACTTGGTTATTGTTCTCTTAAATTCATAAAGTTTCTGCTTGTTACCTTATATGTGGTGGGTGTTTTAATT TGAATGGCATTAGCTTTGATTGTTGTTGTTGTTCTTTTCTTTCATTAGGTTTTTTTATTATCTCGTGTTTATTATACTGA ATTTATGTGTTGAGCAAGAGTTCTCTTGCTTTGCAATATTTCTGAAGCGAACCGGCTTCCTGTGCTATTTTGATTGAAGC TTTTGAATGAATGAAGCAATCAAATAGTAGATGTTAACAAACTTGGAATTGGAATGTATAGAAAGAGCAGTGGTTACGTT ATACCTGCCAAGTATGCCTATGCAGCAAATGAGCATGACAATTAAACCTTGTTACTGGTTTTATTGTATCATTTTGAGTG AAATATAGATTCAGGAAACAAGTATGCCATCTAGAGTAATTTTTCAGTTTTTTTTTTGGTGCTCTGAAGGCTCTTTGACT TTGGAAATTATATATTTTTTGCTATTCTTGTACAGATTTCATGGATGGAGAAGTTTCTGCAGAAGGGGACTGAGATTACT GCCCCTGTGCCAATGGCTCCTCCTGGAACTACTGGGCTTGGGGGTTTTGAAGTTCCTTTGTCAAAAGGAAGTGCTCTACG ACACGATGCTAGTGCTCTAAATGTTGGTGTTCTCCATCTAGTACCAACCTTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAA AAATGTATGCACGATTACTTAACACTCTGGCATTTTTTAGAGTGAAGTTATATTGGAACTCTCTTTTACTTTTAGGTTTC ATAGCATACTTTTTATAAGGTGATTTCTTGTTATCAATATTCTACTAATCTATTCTTAAAACATAAATTATGATTCTACA GATATGAGCCTAATACTATTGATCTCTCAGATCACAGCGAATTAGAGTAAGTACCATATTGTGAACTGTAAACAAATTTT AACTTCATTGTCCTTTAAGGCTTCAACTGTCTTTAGTGTGTGGCTTATGTGGCTAATGAAAATTTGTATATCTGATGTAG ATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGATCACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGTAATCGTGTGTCCTAACACCCAGCCTTTCT GCATATGCTTGTATGTCTCTTCATGTATTACAAATGCAATAAAATTAGACCACAGAGACATCCTTGCATAAATATGAAAT TAAAGCATGAAAGGTAGACCTAAGTTCTGCTTATGAAAAAGTTACAATCTCTGCCAGTAACCTAGCTGATTATGAATAAG TAATAATAGCATGAAAGATAAACTCTTTTCCTGTTTGGTTTATTTTTTCTGCCTTGTTCACCTTGTTCAAAGCATAGTAT GGAGAAAAAATTGCTTGGATTCCCCCCCCCCCTAAAGTAGTATATGATTGTAAGGTTCTCAACTAAAATGTCAGGCTGTC GCAAGTGAAGGTGGGACTGATGATGCCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTA AAACAGTCTTGAGATTCCTTTTTTCATGACTTCCTACAATTATCGAAGCATGACTATATATCTGGTTAACTTGATGCAAT GTTGCTAACTTAATTAATTATTTTATGGTTAATCAGTTTCATTAGTTTAGTTTTAACTTATTGTGAAAACCTTCATTTGA TCTTTGTTGTGGTTGATTAAATCAATTTGATTAGTGTTAATTTCTTTAAAAAATTGCGAGTCAAGCTCTCCGCTAGTGAA TTTGATGGTTTTTGAGAAAATTGAATCAATACAAATTAAAGAAGTGTATGAAAAACCTGACTTTGCTTTTGAAAAGAACT GTCTTGCATGTGCTTGAGATATCTATACTGATCATGTCAAAACTGATGAGCTAGGACTCCCAATCTTTGCCTTCTTTGAT CTTTCCCTACGTGCCCCACCACCCCCATTCTTAATTGTATATAGTATATATCTCTACCTCCAACAGAAGACTGAAAAGAA AAAGGCCTAGTTGTGTGTAAGATGAATAGATGATAAGTCAAGGAAATTGATTTTTTAATCCATGACCTGCTATTTGATTT TGATGGTTAGTTTCTGTTACCAATATCATCCTAATTATTCCATATGATTGCAGTTGGTTTTTTAACTTTCTTCTGATTTT ACTTTTATACTCCCTCAATGGCATTCTAAATATTGTCAGATCATAACACTTTTAATAAATTCTTGGTTGTCTACAGATGC TCAGCTATGTGTTTGAGTTTCCATCCATGATCCTTTTTGTTCTCTCTTATATGTTATTCTTCTCTGTTATATAATCATCC ACTTTTTCAGGATTTGATAATTCTACTAATATCATAACCTCGTGCTTTAAGTCTTCTAAAATTCAGTTTCATTTGGATAA GTTTTTTGTACCATTCTTGTCTTCAAAATAGCCATTGAGCTCAGTTAGTATTTTAAAATTTATTGATTCTAGTTGAGATA CTCTTTTTCAGCTGATCAACTTCTACACTAATTGAATAGGTTAATGGAGGAGCCTGCTGCATACGGGAAGTTAGGCTTGG CCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGTCGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGTAA TTATGTTTTATCTATATTGAGCAATATATATGAGATCTTTTACTTGGCCTATAGATGTAACTGACAGCCTTTTGAGTCAC TATGTTGCATGTGTAGATTTTTTCTTTTTTTTAGCCCTTTGGCCTCTAGATGTAACTAACAGCCTTTTGGCCTCTAGATG TTTTATCTCCATTTGAATTATTTTAATTTTAGTTCGAAAAGATTTGTTAAGGGTAATTTGTTTTTCATCTAGCCAAACCC TTATATGGTAGCCATGAAAACCTGGATAAATGTTTAAATTTTATCTAAATGAACTTGTTGAGTATTTAGTTCTTAATAGA AAAATTAGCCTTGTTTGATCCATATAGTCAATCCTAGAAAATTTTATTTGTTAATGTTGCATCATAAAAGATACAAGCTT TAGATGTACAACTTTAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGCAGACACTTCCCGGTTGTCAATGTGAACGCAAGTTCAAATGATC TTCAGACCTGCATTCTCCTAAAAAAATCCTTATTCTTGATCTCTTAAATTCGTTATTGGTGTGTATATGCATATCACAGG GAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATAGTTTGGATGAGGTATGCTTAACTATTAC TATAACCCTCTGAATTTAGCATGGTGGGAGGAATTAATATTGGTTCCATCTTGTGAAGTACATATGGCTGGTACATGCAA CTAATGCATCATTCCTTTTTGAGTAAATGTTTTCAATATACAAGTGAGTAGAAGTGACACTGTATGTATTTCATTTTTTA TGCCATGCTAGGTCTAAACACAGTCTTGTCACATAAGTGTAGTCTTTTTGGTTCAGTTGCGTGCCTAAGCCACCCTAGCT TTGCATACATAAATCATGTCCGCGTGTAAACTAATTCTGAAAACCTTTTGTTGCAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATT GAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGA AATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGTAGGTGCATTTCATCATATCCATTGATGAGGATATT TTATTTCTAAATTTATTTATCATTGTTGATGGTTGAATACTAAGCTAATTTTTTTTTTGTCATCTAGGTGGACAATTTTG ATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTTTTGTGGATAAT GCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTGAGTTCTCTTTT TGAAGAAAATTTGAAGTTACTATACTGGACTAGATACTAAATTTCCCAACAAATTATTTGATTTAATTTTAGATTCTTCA TGATTTTAATAAATGCTGTACTGGTGTTTTGATTGAGTAAAGGTGTTCTAGAATTACCTTGTTCACTTGATAAATATGTA AACTGAATCTTAACAAGATCTTCAATAGCTGAAAATCTTATGATATATTCCCGAATTCTGACACCCCCTCCCAAAAACAA TCTTGTTATGATTTCATATGTCAAAGTAAATTTATGACTGCTATCATCAAGCAAATTAGGAGATTTTTTTTATTGTTTTG GCTGCTATGCAGTCATTTGATCCTATGCTTACTAGTTGTGTGATGTTAATATGAAAATAATGAATGAGTGCAGGTGGTTC TGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAAGGTT TGTGTATTTTGATGAACTTAATTTGTTATCTCTGGAACATTTGTGATGTTCCGAGAGCCCCTTGTAAAATTCTTCTGAAT GTCTACCATCAATCAGTTACTTCTCTTTTTGTGTCTTCCCCTTGAGGTAAAATGACATGCTTGCTAAACTTCTGGTAAAG AATCCTTGCAGATAAAATTCGGCATGCAATGATGTTATACCAAACACACTTTCTTACTGTCGTGTATTGAACGAAAACTT CTGTACCTGCATGTCTTGTCACTTTCCATATTTGTTGGAATTTCTTTTTCCTTCTTCACTTCATGACCTTCCCTTTACTT TTGTGTATCATAAATATAATCCAACCAAATAAACTTTTGCATGAATTTATGATATGTAATAGTTATGCTTTTCTTCTTGA CATCAGCTGTCAAGTATCTAGTGTGGTATCATTGATAAAAGTAAAAAAAGTATCTATTATGGTATCTGATTTAAAGTGTA CTTGCAAAGATCCTGACTTCGCGAACCTTATGTTTGATGTCAATTTGTTTATGATGTTGAATACACATTACTAATTCTTC TACATTACAGCACTGTGACATTCTTAGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAG ATAGTCCCAGACAAAATTTGCCTTCGGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGG CAGGTCAGCTCTGAGCTGGCTGCTGCTGCAAAAGGTGCAGATCTGGTGAGTAAACCATTCTATTTATGTTTAGAAAATCA AGGAGAAGAGCATATTCTAACTTCGTTTTATCCATTTGGTAGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAA CCTCAATGCTCGATTTCAGTGTGATGCTTTAAAGGTATGGTCATCATCTTGGTTTAAACTTTATAAGGATTTAATTTATA TGCAACATCCAATGATATTTTGTCATTTTTTATTTATTAATGATGTGGTAAAATAGTGAATCCTGATTGAATGTATGTGA AAAACTTTTTTACACTATCAATGAATTGTTATTAAACTCTTGTGTTTTACAATCAGCTGACACTCGTCATTGTGTTCTGG TGTATAGTTACTTAGCTAATGCTACTCTAAGATTTCTTCTCCTATCTATGATGCTTGTCTTGTCTTTAAAACTTAACTGT CCCTGTAATCACTAATGGCTCCTTTGACACATTTTTCCCCTTATATATTTTGTTAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGA TTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATATATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGAAAGCTCTGTGTACA AACTCAGAGCCAAATAATGCTATCATCATGCAACTTCAAAGGGGACCTAAAAACTTCTGGGAGCAGAATGCTGTGTTCAA ATTTTAGGATACATATTTTTTTTTTGTCTCATTGAGCAATGTATATCTATTGTGTAACTTGATGGGATTGGTAGATGCGC GCGGGAAATTCTTAGATGGGAATGTTTGCTGGAGGAAATATAAAAATTTGCGTAGGTTAAAACTTATTTTGCCGGCTTAT AAACTTTTTAAGAATGTATTTGGGTAAACAATTTAATTAAGCGCTTTTGACAGTAAATATTTATTCATAAGTTAATTTGA AAAACTTATTGAATTAAGTTGGAAATAAGTTTTGAACAACTTTTGAAAATAAACTCAACAACTTTTAGGTAGACCATAAC ATATTGACATTAGCTCTCCCCAATACTTTCATGAGTGATTGTGTTATAAGATAAACTCAAATAAGTTCTTTCAAATGAGG CTTAAATATGTTTGACAAGGAGTTTATTTCAATAGTTTATAGAATTTTTTTAAAAAAGGCTTAAATACTCTGGTGATCTC TAATTGTAGGAGTATGAAAATAAGTCCCTGAATTTTTTTTCCCCGATTTGGTATCCCTGATTTTTTTAGGCTTAATTGCA CTTTTGGTCCCCCAGTTATTGCCTTCTTGCAGTAATCGTCCACAAACTTCAAAATTAGCAAAAAACGTCCTCCAACTAAA CATGTTGTTGCACTTTTGGTCGGCCGTTTGCCTTCCGTGAGAAAACTAACGTGAGAAGCTGATGTGGCTCCCTCACGCGT GTCTCACGTGACTTTCTTC
CDS sequence (LotjaGi4g1v0234000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGCACACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAACTGGATCTTAGCAAAGC AGCGATTCAAGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGATATATCTCATTTGGCTC TTGACATTGGAGGGTCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGA AGGTTGAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGATTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCA TTTTGTCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAATGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTAGGGAAT CATCGAATACCATAATTAAGGCTACTGGTGGTGGAGCATTCAAATATGCTGAACTTTTTAAAGAGAAACTCGGGCTTAGC CTTGACAAAGAAGATGAAATGGCTTGTCTTGTAGCCGGAGCCAATTTCTTGCTCAAGGCAATTCGCCATGAAGCTTTTAC ACACATGGAGGGTCAGAAAGAGTTTGTTCAAATTGATTCTAATGAGTTGTATCCTTATCTTCTAGTTAATATTGGATCAG GTGTTAGTATGATCAAGGTTGATGGGGATGGCAAATTTGAGAGGGTTAGTGGAACAAATGTAGGTGGTGGTACTTACTGG GGCTTGGGAAGGCTGTTAACAAAGTGCAAGAGCTTTGATGAGTTACTCGAGCTGAGTCAGAAAGGAGACAACAGAAACAC AGATATGCTAGTTGGAGACATTTATGGGGGTATGGACTATTCTAAGATTGGCCTATCGGCTTCTACAATTGCGTCAAGTT TTGGCAAGGCTACACTGGAAGGAAAGGAGCTTGAAGATTACAGACCTGAAGATATATCACTCGCTCTGCTACGGATGATT TCATACAACATTGGCCAGATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCAC AAGGGGTCATGCCTATACCATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCT TGCGACATGAAGGATTTCTGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCAT CAGTTAGTTGAAAGATTCCCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGA GAAGATTTCATGGATGGAGAAGTTTCTGCAGAAGGGGACTGAGATTACTGCCCCTGTGCCAATGGCTCCTCCTGGAACTA CTGGGCTTGGGGGTTTTGAAGTTCCTTTGTCAAAAGGAAGTGCTCTACGACACGATGCTAGTGCTCTAAATGTTGGTGTT CTCCATCTAGTACCAACCTTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAAAAATATATGAGCCTAATACTATTGATCTCTC AGATCACAGCGAATTAGAATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGATCACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGCTGTCGCAAGTG AAGGTGGGACTGATGATGCCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTTAATGGAG GAGCCTGCTGCATACGGGAAGTTAGGCTTGGCCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGT CGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGGAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATA GTTTGGATGAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATTGAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCA TGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGAAATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGT GGACAATTTTGATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTT TTGTGGATAATGCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTG GTTCTGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAA GCACTGTGACATTCTTAGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAGATAGTCCCA GACAAAATTTGCCTTCGGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGGCAGGTCAGC TCTGAGCTGGCTGCTGCTGCAAAAGGTGCAGATCTGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAACCTCAA TGCTCGATTTCAGTGTGATGCTTTAAAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGATTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATA TATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0234000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAHTGTGTANTPIHRSSSRPQLDLSKAAIQGNVEDRDPTILLPNQSHDISHLALDIGGSLIKLVYFSRHEDHSTNDKRMR RLRSLKDKLGFPNGNRRSYPILGGRLHFVKFETNKINECLDFIYSKNLHHGRESSNTIIKATGGGAFKYAELFKEKLGLS LDKEDEMACLVAGANFLLKAIRHEAFTHMEGQKEFVQIDSNELYPYLLVNIGSGVSMIKVDGDGKFERVSGTNVGGGTYW GLGRLLTKCKSFDELLELSQKGDNRNTDMLVGDIYGGMDYSKIGLSASTIASSFGKATLEGKELEDYRPEDISLALLRMI SYNIGQISYLTALQFGLKRIFFGGFFTRGHAYTMDAISFAIHFWSKGATQAMFLRHEGFLGALGAFMSYEKHGLDDLMVH QLVERFPMGAPYTGGKIQGPPHRNLNEKISWMEKFLQKGTEITAPVPMAPPGTTGLGGFEVPLSKGSALRHDASALNVGV LHLVPTLEVFPLLADPKIYEPNTIDLSDHSELEYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFARAFSAHLVRLME EPAAYGKLGLANLLEMREECLREFHFVDAYISIKQRENEASLAVLPDLLMELDSLDEETRLLTLIEGVLAANIFDWGSRA CVDLYHEGTIIEIYRMSRNKMQRPWRVDNFDAFKERMLGTGDKKLPPHRRALLFVDNAGADIVLGMLPLARELLRRGTEV VLVANSLPALNDVTAMELPDIVAEAAKHCDILRRAAESGGLLVDAMTYTLDSPRQNLPSVPLMVVENGCGSPCIDLRQVS SELAAAAKGADLIILEGMGRSLHTNLNARFQCDALKLAMVKNQRLAEKLVKGNIYDCVCKYEPAN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 22 | 22 | - | – | |
PIRSF | 1 | 865 | 865 | 0.0 | ||
PANTHER | 46 | 416 | 371 | 2.2E-185 | – | |
PANTHER | 46 | 416 | 371 | 2.2E-185 | – | |
SUPERFAMILY | 49 | 184 | 136 | 8.42E-37 | ||
Pfam | 51 | 387 | 337 | 1.3E-132 | ||
TIGRFAM | 51 | 388 | 338 | 7.1E-111 | ||
Gene3D | 53 | 387 | 335 | 5.1E-125 | – | |
SUPERFAMILY | 156 | 389 | 234 | 4.14E-68 | ||
Gene3D | 186 | 381 | 196 | 5.1E-125 | – | |
Gene3D | 266 | 310 | 45 | 5.1E-125 | – | |
SUPERFAMILY | 481 | 863 | 383 | 2.49E-83 | ||
Gene3D | 504 | 587 | 84 | 8.1E-6 | ||
Pfam | 573 | 851 | 279 | 9.5E-42 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Pantothenate kinase activity | Catalysis of the reaction: ATP + pantothenate = ADP + D-4'-phosphopantothenate. | ||
Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
Biological process | Coenzyme A biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of coenzyme A, 3'-phosphoadenosine-(5')diphospho(4')pantatheine, an acyl carrier in many acylation and acyl-transfer reactions in which the intermediate is a thiol ester. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0234000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…