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LotjaGi4g1v0234000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0234000
Transcript ID LotjaGi4g1v0234000.1
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Pantothenate kinase, putative; TAIR: AT4G32180.1 pantothenate kinase 2; Swiss-Prot: sp|Q8L5Y9|PANK2_ARATH Pantothenate kinase 2; TrEMBL-Plants: tr|K7MKQ2|K7MKQ2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0234000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:54687780..54698758) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCCACTTCCACTTGAGATATGTTTGGCCCACTTGAGTAGTAACCACGTCAGCTTCTGATTGAGGTTGTTCACTTCGATTA AGGAGGTGGTTGTTGACTTGATGAGCAACAATACGACATAGAGATTACTTGAGTCTTGAGTTGAAACTCGAAAGCAGAGG AGGGAGACCGTTACTCATGGCGCACACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAAC TGGATCTTAGCAAAGCAGCGATTCAAGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGAT ATATCTCATTTGGCTCTTGACATTGGAGGTGCTGTATTCAGTATCCAATTTCATTGACATCACATTTATATTTATATTTC ATGTTTCTTAGTTCTTTAATTTCACTTCAATGTTATTTCAATTGGCTGGAAACTAGTTTCTTAAGATTGTTTAAATTATG TTATCAGGGTCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGAAGGTT GAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGATTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCATTTTG TCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAATGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTCGTATTACTGTC TTGTTCAATTAACTTTATTTTTAGTCAGTCTTTTCTCTGCCACATTGGATAATGTTTTTTAGTTGTTTTCTTTCTATGAG ATAATTCAACTATACTTTGAGAACTAGTGAATCTAAAGTTGTGGATTTTTTTCTTTCTTATAGGTAGGGAATCATCGAAT ACCATAATTAAGGTGAGTTTGATTCTCTGACTGTTTTTTCTGTCACAATGGTGTTTCAATGCCCTAATGTGTCCACTTTG 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GTGAGAGGAATTGGAAAACTTTGGTGTCTGCTAGTCACCGGCTTGAGATAAATGAACTAATTAAATGCACTTACTTATAT TTTATGGTGTAAATCTGAAGCCAATTTGATAAGAATGGTATTTTTGGCTACCAATTTTGGTATCATTAAGATTGTGCCAC TTTGTTGAGTCACTGGTTTCTCTTGAAGCTGACATAATAAAATTACTAAAGCAACTCCACTAATTAGATTCTCTAGAATA ATTTTTTCATTTCTCCCCCTGGAATGAATCATATCCAATCAAATTGGACCACTTGATAACCATTTAAAAACAGATAATGT GGAATCTAGTTATATATATTGGAAAAACTTTTAAATATTGAGAAAGACATTATAAAGTGGTAAGGAAAGAAGTAAAAGAT TGGTAGGTGTGGCAGTATCCTTTAGAGTTTGCAAATATTTCTAACAAGTTGAGCTTGTAAAACACTCCTTTATATCAGCG TTTCTGATAAACTTGGTTATTGTTCTCTTAAATTCATAAAGTTTCTGCTTGTTACCTTATATGTGGTGGGTGTTTTAATT TGAATGGCATTAGCTTTGATTGTTGTTGTTGTTCTTTTCTTTCATTAGGTTTTTTTATTATCTCGTGTTTATTATACTGA ATTTATGTGTTGAGCAAGAGTTCTCTTGCTTTGCAATATTTCTGAAGCGAACCGGCTTCCTGTGCTATTTTGATTGAAGC TTTTGAATGAATGAAGCAATCAAATAGTAGATGTTAACAAACTTGGAATTGGAATGTATAGAAAGAGCAGTGGTTACGTT ATACCTGCCAAGTATGCCTATGCAGCAAATGAGCATGACAATTAAACCTTGTTACTGGTTTTATTGTATCATTTTGAGTG AAATATAGATTCAGGAAACAAGTATGCCATCTAGAGTAATTTTTCAGTTTTTTTTTTGGTGCTCTGAAGGCTCTTTGACT 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GTTTTTTGTACCATTCTTGTCTTCAAAATAGCCATTGAGCTCAGTTAGTATTTTAAAATTTATTGATTCTAGTTGAGATA CTCTTTTTCAGCTGATCAACTTCTACACTAATTGAATAGGTTAATGGAGGAGCCTGCTGCATACGGGAAGTTAGGCTTGG CCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGTCGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGTAA TTATGTTTTATCTATATTGAGCAATATATATGAGATCTTTTACTTGGCCTATAGATGTAACTGACAGCCTTTTGAGTCAC TATGTTGCATGTGTAGATTTTTTCTTTTTTTTAGCCCTTTGGCCTCTAGATGTAACTAACAGCCTTTTGGCCTCTAGATG TTTTATCTCCATTTGAATTATTTTAATTTTAGTTCGAAAAGATTTGTTAAGGGTAATTTGTTTTTCATCTAGCCAAACCC TTATATGGTAGCCATGAAAACCTGGATAAATGTTTAAATTTTATCTAAATGAACTTGTTGAGTATTTAGTTCTTAATAGA AAAATTAGCCTTGTTTGATCCATATAGTCAATCCTAGAAAATTTTATTTGTTAATGTTGCATCATAAAAGATACAAGCTT TAGATGTACAACTTTAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGCAGACACTTCCCGGTTGTCAATGTGAACGCAAGTTCAAATGATC TTCAGACCTGCATTCTCCTAAAAAAATCCTTATTCTTGATCTCTTAAATTCGTTATTGGTGTGTATATGCATATCACAGG GAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATAGTTTGGATGAGGTATGCTTAACTATTAC TATAACCCTCTGAATTTAGCATGGTGGGAGGAATTAATATTGGTTCCATCTTGTGAAGTACATATGGCTGGTACATGCAA CTAATGCATCATTCCTTTTTGAGTAAATGTTTTCAATATACAAGTGAGTAGAAGTGACACTGTATGTATTTCATTTTTTA TGCCATGCTAGGTCTAAACACAGTCTTGTCACATAAGTGTAGTCTTTTTGGTTCAGTTGCGTGCCTAAGCCACCCTAGCT TTGCATACATAAATCATGTCCGCGTGTAAACTAATTCTGAAAACCTTTTGTTGCAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATT GAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGA AATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGTAGGTGCATTTCATCATATCCATTGATGAGGATATT TTATTTCTAAATTTATTTATCATTGTTGATGGTTGAATACTAAGCTAATTTTTTTTTTGTCATCTAGGTGGACAATTTTG ATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTTTTGTGGATAAT GCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTGAGTTCTCTTTT TGAAGAAAATTTGAAGTTACTATACTGGACTAGATACTAAATTTCCCAACAAATTATTTGATTTAATTTTAGATTCTTCA TGATTTTAATAAATGCTGTACTGGTGTTTTGATTGAGTAAAGGTGTTCTAGAATTACCTTGTTCACTTGATAAATATGTA AACTGAATCTTAACAAGATCTTCAATAGCTGAAAATCTTATGATATATTCCCGAATTCTGACACCCCCTCCCAAAAACAA TCTTGTTATGATTTCATATGTCAAAGTAAATTTATGACTGCTATCATCAAGCAAATTAGGAGATTTTTTTTATTGTTTTG GCTGCTATGCAGTCATTTGATCCTATGCTTACTAGTTGTGTGATGTTAATATGAAAATAATGAATGAGTGCAGGTGGTTC TGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAAGGTT TGTGTATTTTGATGAACTTAATTTGTTATCTCTGGAACATTTGTGATGTTCCGAGAGCCCCTTGTAAAATTCTTCTGAAT GTCTACCATCAATCAGTTACTTCTCTTTTTGTGTCTTCCCCTTGAGGTAAAATGACATGCTTGCTAAACTTCTGGTAAAG AATCCTTGCAGATAAAATTCGGCATGCAATGATGTTATACCAAACACACTTTCTTACTGTCGTGTATTGAACGAAAACTT CTGTACCTGCATGTCTTGTCACTTTCCATATTTGTTGGAATTTCTTTTTCCTTCTTCACTTCATGACCTTCCCTTTACTT TTGTGTATCATAAATATAATCCAACCAAATAAACTTTTGCATGAATTTATGATATGTAATAGTTATGCTTTTCTTCTTGA CATCAGCTGTCAAGTATCTAGTGTGGTATCATTGATAAAAGTAAAAAAAGTATCTATTATGGTATCTGATTTAAAGTGTA CTTGCAAAGATCCTGACTTCGCGAACCTTATGTTTGATGTCAATTTGTTTATGATGTTGAATACACATTACTAATTCTTC TACATTACAGCACTGTGACATTCTTAGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAG ATAGTCCCAGACAAAATTTGCCTTCGGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGG CAGGTCAGCTCTGAGCTGGCTGCTGCTGCAAAAGGTGCAGATCTGGTGAGTAAACCATTCTATTTATGTTTAGAAAATCA AGGAGAAGAGCATATTCTAACTTCGTTTTATCCATTTGGTAGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAA CCTCAATGCTCGATTTCAGTGTGATGCTTTAAAGGTATGGTCATCATCTTGGTTTAAACTTTATAAGGATTTAATTTATA TGCAACATCCAATGATATTTTGTCATTTTTTATTTATTAATGATGTGGTAAAATAGTGAATCCTGATTGAATGTATGTGA AAAACTTTTTTACACTATCAATGAATTGTTATTAAACTCTTGTGTTTTACAATCAGCTGACACTCGTCATTGTGTTCTGG TGTATAGTTACTTAGCTAATGCTACTCTAAGATTTCTTCTCCTATCTATGATGCTTGTCTTGTCTTTAAAACTTAACTGT CCCTGTAATCACTAATGGCTCCTTTGACACATTTTTCCCCTTATATATTTTGTTAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGA TTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATATATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGAAAGCTCTGTGTACA AACTCAGAGCCAAATAATGCTATCATCATGCAACTTCAAAGGGGACCTAAAAACTTCTGGGAGCAGAATGCTGTGTTCAA ATTTTAGGATACATATTTTTTTTTTGTCTCATTGAGCAATGTATATCTATTGTGTAACTTGATGGGATTGGTAGATGCGC GCGGGAAATTCTTAGATGGGAATGTTTGCTGGAGGAAATATAAAAATTTGCGTAGGTTAAAACTTATTTTGCCGGCTTAT AAACTTTTTAAGAATGTATTTGGGTAAACAATTTAATTAAGCGCTTTTGACAGTAAATATTTATTCATAAGTTAATTTGA AAAACTTATTGAATTAAGTTGGAAATAAGTTTTGAACAACTTTTGAAAATAAACTCAACAACTTTTAGGTAGACCATAAC ATATTGACATTAGCTCTCCCCAATACTTTCATGAGTGATTGTGTTATAAGATAAACTCAAATAAGTTCTTTCAAATGAGG CTTAAATATGTTTGACAAGGAGTTTATTTCAATAGTTTATAGAATTTTTTTAAAAAAGGCTTAAATACTCTGGTGATCTC TAATTGTAGGAGTATGAAAATAAGTCCCTGAATTTTTTTTCCCCGATTTGGTATCCCTGATTTTTTTAGGCTTAATTGCA CTTTTGGTCCCCCAGTTATTGCCTTCTTGCAGTAATCGTCCACAAACTTCAAAATTAGCAAAAAACGTCCTCCAACTAAA CATGTTGTTGCACTTTTGGTCGGCCGTTTGCCTTCCGTGAGAAAACTAACGTGAGAAGCTGATGTGGCTCCCTCACGCGT GTCTCACGTGACTTTCTTC 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0234000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGCACACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAACTGGATCTTAGCAAAGC AGCGATTCAAGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGATATATCTCATTTGGCTC TTGACATTGGAGGGTCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGA AGGTTGAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGATTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCA TTTTGTCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAATGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTAGGGAAT CATCGAATACCATAATTAAGGCTACTGGTGGTGGAGCATTCAAATATGCTGAACTTTTTAAAGAGAAACTCGGGCTTAGC CTTGACAAAGAAGATGAAATGGCTTGTCTTGTAGCCGGAGCCAATTTCTTGCTCAAGGCAATTCGCCATGAAGCTTTTAC ACACATGGAGGGTCAGAAAGAGTTTGTTCAAATTGATTCTAATGAGTTGTATCCTTATCTTCTAGTTAATATTGGATCAG GTGTTAGTATGATCAAGGTTGATGGGGATGGCAAATTTGAGAGGGTTAGTGGAACAAATGTAGGTGGTGGTACTTACTGG GGCTTGGGAAGGCTGTTAACAAAGTGCAAGAGCTTTGATGAGTTACTCGAGCTGAGTCAGAAAGGAGACAACAGAAACAC AGATATGCTAGTTGGAGACATTTATGGGGGTATGGACTATTCTAAGATTGGCCTATCGGCTTCTACAATTGCGTCAAGTT TTGGCAAGGCTACACTGGAAGGAAAGGAGCTTGAAGATTACAGACCTGAAGATATATCACTCGCTCTGCTACGGATGATT TCATACAACATTGGCCAGATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCAC AAGGGGTCATGCCTATACCATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCT TGCGACATGAAGGATTTCTGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCAT CAGTTAGTTGAAAGATTCCCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGA GAAGATTTCATGGATGGAGAAGTTTCTGCAGAAGGGGACTGAGATTACTGCCCCTGTGCCAATGGCTCCTCCTGGAACTA CTGGGCTTGGGGGTTTTGAAGTTCCTTTGTCAAAAGGAAGTGCTCTACGACACGATGCTAGTGCTCTAAATGTTGGTGTT CTCCATCTAGTACCAACCTTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAAAAATATATGAGCCTAATACTATTGATCTCTC AGATCACAGCGAATTAGAATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGATCACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGCTGTCGCAAGTG AAGGTGGGACTGATGATGCCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTTAATGGAG GAGCCTGCTGCATACGGGAAGTTAGGCTTGGCCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGT CGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGGAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATA GTTTGGATGAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATTGAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCA TGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGAAATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGT GGACAATTTTGATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTT TTGTGGATAATGCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTG GTTCTGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAA GCACTGTGACATTCTTAGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAGATAGTCCCA GACAAAATTTGCCTTCGGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGGCAGGTCAGC TCTGAGCTGGCTGCTGCTGCAAAAGGTGCAGATCTGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAACCTCAA TGCTCGATTTCAGTGTGATGCTTTAAAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGATTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATA TATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0234000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAHTGTGTANTPIHRSSSRPQLDLSKAAIQGNVEDRDPTILLPNQSHDISHLALDIGGSLIKLVYFSRHEDHSTNDKRMR RLRSLKDKLGFPNGNRRSYPILGGRLHFVKFETNKINECLDFIYSKNLHHGRESSNTIIKATGGGAFKYAELFKEKLGLS LDKEDEMACLVAGANFLLKAIRHEAFTHMEGQKEFVQIDSNELYPYLLVNIGSGVSMIKVDGDGKFERVSGTNVGGGTYW GLGRLLTKCKSFDELLELSQKGDNRNTDMLVGDIYGGMDYSKIGLSASTIASSFGKATLEGKELEDYRPEDISLALLRMI SYNIGQISYLTALQFGLKRIFFGGFFTRGHAYTMDAISFAIHFWSKGATQAMFLRHEGFLGALGAFMSYEKHGLDDLMVH QLVERFPMGAPYTGGKIQGPPHRNLNEKISWMEKFLQKGTEITAPVPMAPPGTTGLGGFEVPLSKGSALRHDASALNVGV LHLVPTLEVFPLLADPKIYEPNTIDLSDHSELEYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFARAFSAHLVRLME EPAAYGKLGLANLLEMREECLREFHFVDAYISIKQRENEASLAVLPDLLMELDSLDEETRLLTLIEGVLAANIFDWGSRA CVDLYHEGTIIEIYRMSRNKMQRPWRVDNFDAFKERMLGTGDKKLPPHRRALLFVDNAGADIVLGMLPLARELLRRGTEV VLVANSLPALNDVTAMELPDIVAEAAKHCDILRRAAESGGLLVDAMTYTLDSPRQNLPSVPLMVVENGCGSPCIDLRQVS SELAAAAKGADLIILEGMGRSLHTNLNARFQCDALKLAMVKNQRLAEKLVKGNIYDCVCKYEPAN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 22 22 -
PIRSF 1 865 865 0.0
PANTHER 46 416 371 2.2E-185
PANTHER 46 416 371 2.2E-185
SUPERFAMILY 49 184 136 8.42E-37
Pfam 51 387 337 1.3E-132
TIGRFAM 51 388 338 7.1E-111
Gene3D 53 387 335 5.1E-125
SUPERFAMILY 156 389 234 4.14E-68
Gene3D 186 381 196 5.1E-125
Gene3D 266 310 45 5.1E-125
SUPERFAMILY 481 863 383 2.49E-83
Gene3D 504 587 84 8.1E-6
Pfam 573 851 279 9.5E-42

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Pantothenate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + pantothenate = ADP + D-4'-phosphopantothenate.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Coenzyme A biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of coenzyme A, 3'-phosphoadenosine-(5')diphospho(4')pantatheine, an acyl carrier in many acylation and acyl-transfer reactions in which the intermediate is a thiol ester.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0234000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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