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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0273500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0273500.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transducin family protein/WD-40 repeat protein; TAIR: AT3G33530.1 Transducin family protein / WD-40 repeat family protein; Swiss-Prot: sp|Q9BZH6|WDR11_HUMAN WD repeat-containing protein 11; TrEMBL-Plants: tr|I1LZP4|I1LZP4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0273500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:64262755..64277418) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TACTCCGGGAAGGGACCAAAACCAGCGCTCGCTCAAACATCAGGGACCATTTTCATTGTTTTCCCTAAAAATAAAACATA AAAACTTGATCTCACTCGCAGTAACGAAGCAAAAACTCGCGATCGAAAGGAACGTTCCTTCCTCGCTACAGTATACAGTG GAGGAGACTCCGGTAGCCACCACCACCACCGCCACTGGATTGAACCACCACCATCATCCACCACGATGTTGAGTGCTCTG AGTCCAAGAGCAACAGCAACACCTTCATCCCCATCATCATCATCACAATCACAATCACAAGAATCATCATGGGAATCAAT GCTCCCCGGTCCACCCAGCCGCAACAACTTCGGATCCGCAGATCTGAGCCCTCACGGCCTCCTCGCTTTCCCTTCCGGCA GTTCCATCTCCATCGTCGACACCCATTCCATGCAACTCCTCTCCTCATTCCCCATCCCTCCACCACCTTCCTCCGCCGCG CCCTTCGTCACCGCGCTCCGCTGGTCCCCTCTCCCCTTATCCCGGCAGCTTCTCTCATCAGAACCCTCCTCCTCACACCT CCTACTCGCGGCTGCCGATCGGCAAGGCCGCATTGCTCTCCTCGACTTCCGCCTCCGCTCCGCCGTCATCTGGTTCGAAA CCGACTCCAAACAAGGCGTTCAGGATCTCTGCTGGGTCCAGGCCCGACCGGAAACCTACCTCCTCGCCGCCTTGATCGGA CCCTCTCTGCTTTCGCTCTTCAATTCCTCCACCGGACGCTGTATTTGGAAATACGACGCCTCGCCGGGATTCTTCTCCTG CATTCGCCGCGATCCATTCGATTCGCGTCGCGTCTGTGCGATCGGGCTCAAGGGGTTTCTGCTGTCTGTTCTCCTTCACG GTGAGACGGAGGATGGTGTTGTTATCAAGGAGCTTCAGATTCCGACGGATTCTTCTGAATTGGTTAAGCTCGAGAGAGAT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0273500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTGAGTGCTCTGAGTCCAAGAGCAACAGCAACACCTTCATCCCCATCATCATCATCACAATCACAATCACAAGAATC ATCATGGGAATCAATGCTCCCCGGTCCACCCAGCCGCAACAACTTCGGATCCGCAGATCTGAGCCCTCACGGCCTCCTCG CTTTCCCTTCCGGCAGTTCCATCTCCATCGTCGACACCCATTCCATGCAACTCCTCTCCTCATTCCCCATCCCTCCACCA CCTTCCTCCGCCGCGCCCTTCGTCACCGCGCTCCGCTGGTCCCCTCTCCCCTTATCCCGGCAGCTTCTCTCATCAGAACC CTCCTCCTCACACCTCCTACTCGCGGCTGCCGATCGGCAAGGCCGCATTGCTCTCCTCGACTTCCGCCTCCGCTCCGCCG TCATCTGGTTCGAAACCGACTCCAAACAAGGCGTTCAGGATCTCTGCTGGGTCCAGGCCCGACCGGAAACCTACCTCCTC GCCGCCTTGATCGGACCCTCTCTGCTTTCGCTCTTCAATTCCTCCACCGGACGCTGTATTTGGAAATACGACGCCTCGCC GGGATTCTTCTCCTGCATTCGCCGCGATCCATTCGATTCGCGTCGCGTCTGTGCGATCGGGCTCAAGGGGTTTCTGCTGT CTGTTCTCCTTCACGGTGAGACGGAGGATGGTGTTGTTATCAAGGAGCTTCAGATTCCGACGGATTCTTCTGAATTGGTT AAGCTCGAGAGAGATGCTGCCGGTGGAGGGTCGTCCCCATCGCCGCCTGCCTCCGCGGCGTTTCCTCTTTACATGGCGAG GTTCGCGTTTTCTCCGCTGTGGAGGCACGTTTTGTTTGTCACGTTTCCGAGGGAGTTGGTTGTGTTTGATTTGCAGTACG AGAGTGTGGTATTTTCTGCTGCGTTGCCTCGTGGTTGCGGCAAGTTTCTGGACGTGTTGCCTGATCCGAATAATGAGTGG ATTTACTGTGCTCATCTTGATGGCAAGCTCAGCACCTGGAGGAGGAAACCTGGGGAGCAAGTACACATTATGTGCTCATT GGAAGAGATAATGCCATCAATTGGTACCTCTGTCCCTTCTCCTTCAATTCTTTCTGTCCTTCTATGCCAATCAGATACGA CCCTTCAGAACATTGGCAAGAATTATTCTGATGTACCTAGTTCTCCTTACCTTCTTGAGGATTTTGATAATCCTTTTGAT TTTTGCTATGAGTCCATGATTGTTTCTAAGATACATTTGATCTCCATATCTGATGATGGAAAAATATGGAACTGGTGCTT GACTGCTGAAGGGAATGCAGACACTCAAAAAGATGATAAGAAGTTGGGTTTGGCCTGTGATGACCATACAGTATTATTTC CCGGGGCCAACTCTAATGCCATAGTATCTTCTGCTGGTAGACGGGACCTCAATGTAGGCAGGCAACAAGAGAGTCTCAAT GATCCTGGAAGCCGCTTGCAAAGCTCAATCTTCAACCAGGAAGAAATTTCAATGAAAATTAGCTTAGTTGGACAGCTTCA GCTGCTTTCTTCAACAGTGACCATGCTTGCAGTACCAACCCCTTCTCTGACAGCCACTCTAGCCCGTGGAGGAAATCATC CTGCAGCAGCTGTTCCCCTGGTTGCTTTGGGAACACAGAGTGGAACAATAGATGTAGTTGATGTTTCTGCTAATGCTGTT TCATCAAGTTTATCTGTACATAATGGCATTGTTAGGGGTCTACGATGGCTAGGAAATTCACGACTGGTTTCATTTTCTTA CACTCAGGCCAGTGAAAAATCTGGAGGATATATTAACAAGCTAGTTGTGACCTGCCTTCGAAGTGGCCTTAACAAAACGT TCCGAGTTTTGCAAAAGCCAGAACGTGCGCCCATAAGAGCGTTGAGAACATCTTCATCGGGAAGGTATCTTCTAATTTTG TTTCGTGATGCACCTGTGGAAGTTTGGGCAATGACTAAAAATCCTATCATGCTTAGATCATTAGCTCTTCCATTTACGGT ATTGGAATGGACTCTTCCTACAGTTCCACATCCTTCTAAGCGTCAACCATCTGGGGCATCAGATGAAGCATCCGAACCAT CAAAGGTTTCCTCGTCAGATTCAAAGAGTTCGGGCACAGAAGGATCTCAAGATGACACTTCTGAAAGTTTTGCATTTGCT CTGGTGAATGGGGCACTTGGAGTTTTTGAAGTACATGGTCGAAGAATTAGAGATTTCAGACCAAAATGGCCTTCTTCTTC ATTTGTATCATCAGATGGATTAATTACTGCAATGGCCTACCGCCTACCTCATGTGGTCATGGGAGACAGAATAGGGAACA TAAGGTGGTGGGATGTGACAACTGGACATTCTTCCTCATTCAACACTCACAGAGAAGGAATCCGTCGAATCAAATTCTCA CCTTTTGTACCAGGAGACCATAGCCGGGGGCGTATTGCTGTTCTGTTTTATGATAATACCTTTTCTGTATTTGATTTGGA CTCACCAGACCCCTTAGCCAATTCAGTTTTGCAACCTCAATTTCTGGGAACCCTTGTATTAGAACTTGATTGGTTGCCCT TGCGGACTAATAAGAATGATCCACTGGTACTGTGCATTGCTGGAGCAGATAGTAGCTTTCGCCTTGTTGAAATTAGTGCA AATGATAAAAGAGTTGGTTTTGCACCCCAGATCAGACACACAAAGGATAGGTTCAGGTCAATGCCTATATGTTGTCCCAT ACTACTTCCTTCACCACATGCCTTGGCACTGCGCATGATTTTGCAATTGGGTGTTAAACCTTCCTGGTTTAATACTTGCA GTACAACCATAAAAAAAAGGCCTCACTTAATTCCAGGAGCTCCTTCTTTTACTGGGGATCTGCGCACATACATGATCAAC ATACCAGCTCTTGGGGACTCAGTGGTTCCAGAGATGCTTTTAAAAGTATTGGAACCATATCGAAAAGAAGGTTGCATGCT GGACGATGAGAGAGCCAAGTTGTATGCTAGTGTTGTGGATAAAGGTTGTGCCGCAAGGTTCGCTTTTGCAGCTACTGTAT TTGGTGAATCCTCAGAAGCTCTGTTTTGGCTACAGCTGCCTCGGGCGCTTAAACATTTGATAAATAAGTTATTGAGAAAG CCTCCATCAAAAGTGGCCACAGAAGAACCTGTCTCTGAGGTTGATGAGACATCTTTACTGTCTAGGATATCATCAAAGGG AAAACCAACAGAAGAATTGGAGAGAGATGGTCAAGGTCAACTAAGGTTGATGGCTTTTGACCGAGAAGATTTGTGGAAAA GTGCCAGCGAGCGTATTTCATGGCATGAAAAATTAGAAGATGATGAGGCCATACAAAAACGTATACATGAGCTTATCTCA GTTGGAGATCTAGAAGTTGCAGTTAGTTTATTGCTTTCTACACCTCCAGAGAGTTCTTACTTCTATGTCAACGCTCTTCG CGCTGTTGCTCTTTCTTCTGCTGTTTCAAGATCTCTTCATGAACTTGCAGTGAAGGTTGTTGCAGCCAACATGGTGAGGG CTGACCGGTCACTATCCGGCACTCATCTTCTCTGTGCAGTTGGAAGATATCAAGAAGCATGTTCTCAGCTACAAGATGCT GGGTGCTGGGCAGACGCTGCAACCTTAGCTGCTAGTCACTTAAAGGGATCAGATTATGCAAGAGTGTTGCAAAGATGGGC TGGACATATTCTGCACTCTGAACATAATATATGGAGGGCTCTGATCTTGTATGTTGCGGCTGGGGCACTACAAGAGGCAT TGGCTGCTCTCCGTGAGGCTCAATTACCTGACACTGCTGCAATGTTTATCCTTGCATGCCGTGAAATCCATGCAGAAATG GTTTCTAACTTAGGCATTACCGATGATGAATCAAGTTCATCTGTTGAGGATAAGCTACTAAGCTTGCGCGCTTTAGATCC TGAGAATGAAGATGTCATAGCAGTTGATGAATATTTTGGCCAATACCAACGAAAACTGGTACATCTATGCATGGATTCAC AGCCATTCTCTGACTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0273500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLSALSPRATATPSSPSSSSQSQSQESSWESMLPGPPSRNNFGSADLSPHGLLAFPSGSSISIVDTHSMQLLSSFPIPPP PSSAAPFVTALRWSPLPLSRQLLSSEPSSSHLLLAAADRQGRIALLDFRLRSAVIWFETDSKQGVQDLCWVQARPETYLL AALIGPSLLSLFNSSTGRCIWKYDASPGFFSCIRRDPFDSRRVCAIGLKGFLLSVLLHGETEDGVVIKELQIPTDSSELV KLERDAAGGGSSPSPPASAAFPLYMARFAFSPLWRHVLFVTFPRELVVFDLQYESVVFSAALPRGCGKFLDVLPDPNNEW IYCAHLDGKLSTWRRKPGEQVHIMCSLEEIMPSIGTSVPSPSILSVLLCQSDTTLQNIGKNYSDVPSSPYLLEDFDNPFD FCYESMIVSKIHLISISDDGKIWNWCLTAEGNADTQKDDKKLGLACDDHTVLFPGANSNAIVSSAGRRDLNVGRQQESLN DPGSRLQSSIFNQEEISMKISLVGQLQLLSSTVTMLAVPTPSLTATLARGGNHPAAAVPLVALGTQSGTIDVVDVSANAV SSSLSVHNGIVRGLRWLGNSRLVSFSYTQASEKSGGYINKLVVTCLRSGLNKTFRVLQKPERAPIRALRTSSSGRYLLIL FRDAPVEVWAMTKNPIMLRSLALPFTVLEWTLPTVPHPSKRQPSGASDEASEPSKVSSSDSKSSGTEGSQDDTSESFAFA LVNGALGVFEVHGRRIRDFRPKWPSSSFVSSDGLITAMAYRLPHVVMGDRIGNIRWWDVTTGHSSSFNTHREGIRRIKFS PFVPGDHSRGRIAVLFYDNTFSVFDLDSPDPLANSVLQPQFLGTLVLELDWLPLRTNKNDPLVLCIAGADSSFRLVEISA NDKRVGFAPQIRHTKDRFRSMPICCPILLPSPHALALRMILQLGVKPSWFNTCSTTIKKRPHLIPGAPSFTGDLRTYMIN IPALGDSVVPEMLLKVLEPYRKEGCMLDDERAKLYASVVDKGCAARFAFAATVFGESSEALFWLQLPRALKHLINKLLRK PPSKVATEEPVSEVDETSLLSRISSKGKPTEELERDGQGQLRLMAFDREDLWKSASERISWHEKLEDDEAIQKRIHELIS VGDLEVAVSLLLSTPPESSYFYVNALRAVALSSAVSRSLHELAVKVVAANMVRADRSLSGTHLLCAVGRYQEACSQLQDA GCWADAATLAASHLKGSDYARVLQRWAGHILHSEHNIWRALILYVAAGALQEALAALREAQLPDTAAMFILACREIHAEM VSNLGITDDESSSSVEDKLLSLRALDPENEDVIAVDEYFGQYQRKLVHLCMDSQPFSD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 43 | 43 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 1336 | 1310 | 0.0 | ||
| PANTHER | 27 | 1336 | 1310 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 43 | 343 | 301 | 2.35E-16 | ||
| Gene3D | 44 | 377 | 334 | 2.5E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 275 | 875 | 601 | 7.32E-18 | ||
| Gene3D | 400 | 666 | 267 | 3.4E-8 | ||
| MobiDBLite | 676 | 712 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 677 | 712 | 36 | - | – | |
| Gene3D | 728 | 903 | 176 | 2.0E-10 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0273500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…