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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0274400 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0274400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | RabGAP/TBC domain protein; TAIR: AT5G52580.1 RabGAP/TBC domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8TC07|TBC15_HUMAN TBC1 domain family member 15; TrEMBL-Plants: tr|G7JE75|G7JE75_MEDTR RabGAP/TBC domain protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0274400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:64387514..64400524) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCAACCGTTTATTTCATGTGCTGTAGTCATACATTCCACGAAAACACGAAATGAATTCGTACCCGCGTTATACACAAAC AAACAAGTTACAACACATAGAAACGTCTCGCATTTTCCTTCCTCATTTCTCATTTCTCTTCATTTTCCCTCATCACCGAT TTTCCTTCGTCTCGAAGAAACCCCTCTCTATCTCTCTCTCACACAGTGTTCTCAGTTTCATGCAAAATCGCCGATGCTAG AATCAGAGCTTCACGACCTCTCCGACGACGCCGATTACGCCGCTGCGTCGCAGCAACAAGTAAGACCACCACCGTCCTCC GATCAATTAGGGTTTTATCGATTCAATTTCACACTGTTTGTTATCTTATCAATCGACTGAATTTTGTGAATATTTATTTA ATTTTTGGGGATTAGGGTTCTTCTAGCACGATGCTACGGAGCGATAGCGCCAAGCAAAGCTCATCGTCCAGTGAGCGAGA GGGTGCTGAGATTGTGTTTTTGAAGGATAATGTTGCAATTCATCCGACTCAGTTCGCCATCAGTGGGAGACTCAAGTTGA TTAAGCAAGGCGCTGCTTTGTTTATGGTAATCAAACTTTGGTTGTTTGTTTACGCTTACTTGTGGTTTGCAGTTTGCTGT TTATTTATGTGAATGAATGTCTTGTTTTCGCTTTGTAGACTTGGTTGCCTTACAAAGGCCATGGTTCAGATGATGGGATC TCTGATAAAGGTAGTTTGCATTTAGAGTAGTAGACTGCTTGGTTTACTTTGTTTACTGCCTCATGCGGCGTGGTTTAAAT GTTGAAGTTTGTTCTGTTTGTTGTTTAGACAGAAGCCTCTACACCATTAGTGCGGTGCCCTTCACTGACATCAGGTCCAT TCGGAGGCATACCCCTGCTTTTGGGTGGCAATATATCATTGTTGTTCAATCATCAGGTGAATTTCTGTTGATGAGACTAA TCGATTTATATTTTTTGTGGTTGTTTTCAAACAAAATTATGTATTGTTCCCCTCGCTCTCTGCTATTTATCAACCAGGCA ACTTTTATTTGTGGGGCCATTTCGGGTGGGGGTGGGGGGTCACATGCGATTTGATGGTATGGTTGCTAATTTGCCATAAG GTATTAAGGTGTTAATTTCTTAGTTTTGGAATAAATGTTAAGGAAGCACTTCATAGGATGGATTCATCTAAATGGTCAGT AAATTAAAGTTGCCACTTGCGTTATGCACATTATTAGTAAAAGTAACAAATGTTCCATTGGATTTAATGTGCAAGTTGGC AGCAACACTACATCAAATTCTCTGAAATTTGACCTGACACAAAATGAGTAGATAGTCATAACTTGTTCAATCATATATTC AAACTTAGTCATCAAATGTTGGGAACTAGGATTCTCAAAATTGACCTGGAAAAATGGATAGCACTTATTTTATAGGCCAA GTAAAAGCCTGAAGGGAACCTTAGCCTACACATGCCTGCCTAATATAGGAAAAAACTAAACTGAGGACTTTTGATTTGAG AGGAATAAACTGAGAAACTGTTTTTCTCTTTAACCTGGATATAGCATGAGAAAAACTTATAAGTATGGAAAAAGGTTCCT TGATGTAGGGGATAAATTAATACCCAGTATTTACTTGTACATATGATTTATTGTGAAGCATGGATAGAGTACTTGTAAAA AAATTAGGCACAGGGTGCTGCCAGATATTTGTTATATAATTGTGAAAAAATTAATGTATGTAAGAATTAATGCTGTTAAT AAATATCAGAAAGTGACACTATCTTTCCTTTTAAATAATACCTTTCAGAAAATACAAGCATATTAGCTGTTTTGATGTTT TTTCCAAGTTGAATACATTTTAAGAATGTTTTTTTAGAAGTTGACATACTTTGTTCTGTTTCAAAACCATCCTGAGATGT TTTTGGCTTTTTGCCTATTCTGTTTCATCCCTGCTTCTGACATCATAACTATTAGCTAACTTATATATTAACGTAAAACT TCCAGTTTTTGCCAGTTTCTGAAATATCAAGCATTTGTTCCTACCCTTGGTCCGTATCATCCAATTACAATGATTAAAAA AAGCATGTTCGGTTTTTCAATTTATCTGCCAAGTGAATACGTATCTGCTGCTGCATTTAATTGCTGGATGTATGTTTTCT CTTTGAAAGTCTGTTGTGGCTCATTTTTTTAAGTGTTCTCGGCCAAGTGAATACGTATCTGCTAGCTGTATTATTTTTAA GTGTTCTCGGCCAAATTTGGTGAATTAGATGTTTGTGTTTGTTTACAACACTGTTTATTTCTAAGGCGGGATTCTATACC TTTTGTTCTGTTTTTGACAGTTCAATCTTGTGTGAATAAATATGTATGCAGGACTTGCTCATCCTCCACTCTACTTTTAT AGTGGAGGAGTCAAAGAATTCCTTGCCACAGTAAAACAACATGTTCTTCTTGTGAGGTTAGCTTCTGGTTTGACGCCATT ATTTTTTTTCATTTTGTCACTTAGCTTAGTAAATAATATAGTCACCATTCTATTGATAATATGCTGTACACCATATTAGA ATTTACCTGGGAACCAAGAAAGCTTGTGGGATCGTTATGAGGCTAAGTCTAAGCTAGCAAGCTCTAATAAAAAGAAGTTA ATTGATTCCCATAGCTCACTTGTATCGTATCAATAAAAAGCCAGGCTTGCTGAAGAGTTCTGAAGAGAAAGATGACAATA GAATAATGGAATAATAAAAGGGAAAAGGAGAAAATTGAAAATGGAACGGGGGTAAAAGACTGTATCATCATATCATGATG TCTGACCTGGATATCATTTTTTCTAAACTGATTGTTTGCGTAAATTTTCTATTTGCTTATTCCTTCATGGGAAGATGTGC CAAGAATAACTAATACCTTCACAAAGACAAATGTTTTCATATAGTCTCACTAAGAATGACATGGAACATGATTTTAAGTT CTTTGAGAATACCCATATGTGCTGTTGAATTTCTCCCTACTGGTTGTTTTTACTCTCTCTGTTCTTAAATCCATAGCAAC AAAAACAGTGGCAACTACTAGTTACTAGACTTGCCCACAAAAAGTAACTATTAAAAACACTCAAGACCCTGTTTGTTTGA GCTTAAAAGCCTTATTTTAGGAATTAAAAAAATAAAGGATTTGTTTTCAGAGCTTTTATTTAAAATAACAGTTACTTTGC GTTTGGTTGCAATCATAAAAACACATTTTACACTGTTTATTTCTTAATGCATGAATCAAGAGGGTTTTCCCTTATCCTTG GCATCAGCAAAAACAGCGTTGTTATTCATTTCAATGGTAGTTGGTTTTTTGTTGTTTTACCAGTTAATCATACACCAGAA CTCATGTGCTGATTATTTGTTAAGTTCTCAATGTCCTCGCTCTAACTATTATAAGAACTGATTAGTGAATCCATTTTTAT CTGTTGTCTATTGGGGACTGGACTACTGGAGAGTGATAGATCGGGGAGCACAAGAGTGAATTTTTGCAGACTATTTTACA TCAACACTTTCTGAAAAAAAAAAAAACCACTTATTTTAATTTGTTTGTATTAGATTTTGATAAAGAAGTAGAGTCTGCAA AGAATAAACAATTTAGCTTTTCTCTAAAAGCTGTTATGAGAAGCTTTTCAAAATAATCATCTGCAATAGATGGGAGTAAG AGACACAAAGTAAAATGTGTTTTTATGATTGTAACCAAACACGAAGTAACTCTTATTTTAAATAAAAGCTCTGAAAACAA ATCCTTTATTTTTTAATTCCTAAAGTAAGGCTTTTAAGCTCAAACAAACAGGGTCTTGAGTGTTTTTAATAGTTACTTTT 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TTCTGAAAAAAGGAGGAAAATTTACCTCACTAGTGATACGAGACCATGAGTAACTTTGTCTTTTTCTTAAATACACCAAA AGTCAAATAACTTGCCTTGCTATCAAGAAAGATTAGAAGAATGAAAATGTTTAGCTTACATTTGAAATTCCGATAGGCCT CTGAAGTATTACTTGATTAATATAAGATTATGTTATTTTATTTTATTTGGCTTGCTGAATTTTCTAATGCTTGGTTGACG TCCAGAGGACATTGTCTTCCTTGGAGCTGCCAAGGGCTGTTTCTCTTGCATGCGGACCTTCAAATACACCTCTCAATGAA TCCTCTTTGAATGAGAACCAGGAGAACGGTGATAGTGGTGTCTATAATGGAAGTGCCAGTGTTCCTCAGTTCCATGGGAG GCCAAGACATAAAGTTCAAGATCCTGCTCGGGACCTCTCTATTCAAGTTTTGGAGAAGTTCTCTCTTGTCACAAAATTTG CCCGTGAAACAACTTCACAACTCTTTAGAGAAAACCATAGCAATGGGTTTAGTGTCCATGAGAGGAGAACCCATATCCAG AGTAACCTTGATCCTCCGAAGAAGTCTTCCAATGTTGCAGAAAACATTTCTGATGAAAGTCCTGCTGTCTTAGATTCTCA GGAGGTAACCCCCCTTTCTTTGGTGCTAAGGTTTTGAATGTACAACATGAAAACTTTGTGACGTTGTTGCAAATATTTTT TTTTGATTGGAGATGTTTGGTGCTTACTTTATTCATATATTCTACCCTGAATAAAATTAACTTCCTAAACAGTGGGATGC CATTTTAAAAACAGTGTTATGTAAAAGGTCCTCAGCTATGTGTAGTTTTTGGAATAAGTGTGCATTTTCATTGAAATAGG AATTATTATTTATCTATTTTCATTTTTTTTTTGTCTACTTTTACTTCAGTATAATGGGTTATTGAATATGGTTATGACTT ACATCTACACATACATGTTAATCTTTTGGCATCTCCTAATTTGTTGTTTGTCTTTCAATAGCTACTATCTTTACCATTAT CTACTTGGCTGTAATTTTGGCAGTGTTTAGAGAATTATTGCACATGCAACCTAAGCTTGGTTAAAATAAGAGTACGTAGA TTAAGGGTTTTTTTATTCCGGTTCAAGGTAGTTCTTAAGATGATAAAATCATGCCTACAACAAACCTAATCCATAATGCA TTTGGGAAGGGGATCTTTAAGTCTCTTAAGGTGCATCCAGTGCGATGATCTGTGGCCTGTATCTTTTAAGTGTACCGACA GCTGAAGCTATGCCAGTAAAATACACTTCATAAGAGATAACTAATCTCTTCAGTCTTAATGCAACTCCCACTGCTTGTGC TAATATTACGTAATTTGAATTTATATTCTCAGACCAACTAATGTTGACCTTCATCATTAATAAACAGAATGTTTCATGTT TGAAACATGAACATGGTGAGAAAGCTGCCACCAGTGTGGGGAACTTTTGAGCTTATCAGTTGTAAGGAGGTATAGGAAAT ATCTAGTTTATGGGTTCACATGCCTTTAAATTTTTTCATCACTGGTGAGTGTGAATGTGATAGTGAGCTTGTTTAAGATC TTTAGTTTATTGTCATTGATGGATGTTGGGCTCTTGATGAATGTTATAGTCATACACCAGTCATTTGCAGAGTCCTCCTG TGACATACAGCACTGACTGGTTAGGTTATAGTAAAAATAATTTGTCTTTCTTCTATATCTCTTCATCTATTTGGTAAATA TGTGAAACCAGTGTAGATACCGATCTTAATTTTTCTGTCAACTGTCTGGTTGGCTAAACTTCTAACATTAGATCTTATGG GTGTTAGATGCCCTTGTGAAGCTTCTGGTTTATTTGGCTACTAGGATATGTTGACTTAAGCAAAAATTAATTCCTAGTGA GTATAAGAGAGTAAGATAGTCAAATATAACAAAAGTAAGATCTAAGGGACATGTAGGTGCAGTTGCAGAGATTGATCTCT GTAAAGGATAACTCCACGATGTGTGGTACCAATAAGTGCAGATTTCATTGAAGAAAGGAATTATTCATTAACATTAAAAA AAATAAGAAATTAATGAAACTTTACTATTTTGCATAATTTGCCATATAAATTAGCTACTCAAACTCAACATTTATGGTAA AAACTAAAATAAAATATTTATTATCCAAACCCAATCTCTTTGTCTGACCAACTGTTTTTATAAATTTGGAGCCATGTTTA GCATCTCATTTAGCAAGTTAGCAACATGTTGTGCACTACTTTCATTTCAGTGTGTAAAACGCTTGAACAATATTATTTTA AGGTTCTAGAATTTGTTCAAGGGTAGTATAGACAATAGTAAAAATTGTATGTCATTTGGCTAGTTCACATTGCATCTTGG TGGCATGTTTCAATCTGTGTTAATATAGTAGTCACAACCCAACATAATATCTGTTCTGTATGATTATGGATTGATTTAGG ATAGTGCACATTTTTGCTAAACTTTAGTGTTTTTCCCTGTTCCCTTTTATACTGTGTAATCTTAATTGTATCTTTTTTTG CTTCTGTTCTGGCAGTTTGATAAACTATCACTGGTATGGGGAAAACCACGGCAACCCCCTTTAGGTTCTGAAGAGGTATG AGTTGTATATTTCATAAACGATTAATGCAAGTTTTCCTAATGCAAATGACATAATCTAGTAGGATTTTTTCTTCTTGGGG TCTGTAGCTTTTGGTACAATAGTTTGTTCTCCTGGAATTTCTATTAGCTTGCTCTTTGAGGATCAGCAGACCATCTATGT GAAAGTAGTTCTTTAGTAGTTAAATGTTTATTTTATCTTCATTCTTCAATGATTCAATCAGATGCTTATAAACTTATAAC TAGTTATAGATAAAAAACATTTTCTTTCCTCATTATCTTTGATGAGATATTTGAGGTAAATAAAAATAGTGGTACATTGC AAATAACTACTCTGTTAAAGTTCGTGTTAGAATAAAATGCATTCATTTATATAATACTTGACATCCCATAGGCAGGGCTG GATGTAAGTTAGCTTAGTTGAATAAACTATTGTAATTGATTATACTATGAAACAGAGTACAATATATATATATATATATA TATATATATATATACACACACACAAGAGTAATCCCATAAGTTTAGGGATAGCAATCACCTAAAATAAGGAAAGGGTCTAC CTATCATCAAGGTAATATAGTTACAATAGACAAGATATATTGACTCCCTATTTACTGTATTTACAGTATATCTCAACAAG CTTGTTCTCAAACTACCCAACCCTTTCTGCAAGTACTTGATCTATTGGATATCAAAACTATCAAAATTTGATGTTTTCCG TTCTATTCCAAATTTCAAGGAGGTCCTGTCACTGTCACAGACATGTTATGATAATTGAAAATACCTGAAACATGAAGGGG GATCGATAGTTTTGGAGGGAACTGAGAGAGTGAGTAAAATTTCCATTTTGGGGTTAAGAGAGCTATATAGTGTTTATAGA ACTGAACAAGGCATTAGAAGGTTTCATGATAATCTGTCATTATATTCCTTTCATTCTAAAAAAATTTAAATATGGAATTT CTACTGGAAATGAAAAATGTCCATTGTCATTCATGTTATTTATCCAGAAAGTTTTCAGTTGTTGTTTGCTTATTGTTTGT TGGTGTCAAACATCTGCAGTTGATTACTTTCTTGGATTCTGAAGGGCGAGTCACAGATTCAGAAGCTTTTAGGAAGAGAA TATTTTATGGTGGACTTGACCACAAATTACGAATTGAGGTTTGTGTATTTATTCTGTGATGAGTTTTTTGGGTACATAAT CTGTGATGAGTTTAAGGCTAAGTATTTTTATCATAAATTAAAATATGCACTTCCTCTGATAAAGCTTTTATATAAATGAT AGGTTTGGGGTTTGCTTTTGGGATACTATCCCTATGAATCAACATATGCTGAGAGAGAATACCTGAAGACAGTTAAGAAG TCAGAGTATGAAACCATAAAGAACCAGTGGCAGGTTTTCATTTATCCCAATCTTCTTTTTCATTGATATAATTGAGAATA TTTTTCCAAATCATATGTTAGGTGCAGCTGATCATATGAGGTCAGTTTCTGTTGTATTAATACTTATTATCCTAAAATCA TGAGATTATGAGATTATCAGCTAACCGTTGGTTTCTTGTTTGTTAAATAATTAAATTAATACCATGCTAGAAGGACTTTA CTTTCAGCATTAAATAAGTCTACTGATGCAACACCGAGGATACGGTATCTAATATGGGTGTAATGAGTCAGATTTGGATC AAATATTGTTAAACCACTTGAAACCACATTGTAGCTGCATCTGATATTTTTCTTCTCACCTGGAACCAAGCTAGAATTTA TGTTCTGCAGTTACTGCTATCCCCAGTGATCTGGGTTTTGGATTATGTGACCCCGAAATAGAAGATTGTACAAACCCTAA CCCTGCCAGTTACACAAATATGATATAATCTGAACCTGGATTAAGTCATCTGATTCCTTTTGTCAGTTTGTTTTCTTTTT CAATTAATACTTGTGTGAGGATTCTAATCACGGATATATCTGCCGTATTTTGCATTAGTTTTCTCCTGTAATACTATACG CCCTCAACTAAGCCTTTTTCAGAATATGAATTTGTTTGTATAATTTTCTATGTAGAGTATCTCCTCAGCACAGGCTAGAA GATTCACAAAATTTAGGGAAAGGAAAGGGCTTATTGAGAAAGACGTGGTAAGCTGGAAACAAGTTTTAAATTGAAATGAT TGTAAATTAGCAGAAATTGATGATCGTGTAGCTTTAACTGTTTTTTCTCGTATTTTTGAAGGTGAGAACTGATAGATCAC TCAATTTTTATGAGGGGGATGATAATCCAAATGTGAATGTTCTGCGAGATATCCTGTTGACATACTCATTCTACAACTTC GATCTTGGTTATTGTCAGGTACTATACAGTGGATCTTGGGCTTAATCTTATAATTACAACAGCAAATAAATCCTTTTACC AGTAGGTTTGAGCACAATCTTAATTCTTCTGAATAGCTGTTAGGTAACCTGTAACTCCTCCTAAGTAGCTTGTTAGTTTG AAATTTTTGTGGTTAGCTAGAGAGGAAGAGATGCCTGGGTTTTCATGGAAGGAAAGAATAGAGGTCTTTTGGTTTAGAGT CAATATTTGGAGTTAAGATCTCAGGCCTCATCATTACCTGGTAGGATATAGGGTGATTAACATATTGGATGTGTTCTGTA TCACATTTTTCCTGCAGCAGAGGCAATTTCTGCAATGAAGGTTTTCCTTTGTCTTTCTGAACCCGTATGGCAGTATCTAG CACTATTATATTAACCCAAACATTTTGTTCTGATCTTTTTTTTTTTTGAAGTTATCAGCCCTATTGGGTATCTGTGCGGT TGCTGTAAATGTTTTATGATTATTTTATCAAACAAAGAATATTATGTATTTGCTGTCGTCAGGGAGTGTCTCAATAACTA TTATCCTTCCAAGAACCATCATGTGTCTGTTTATTGCTTAGATTTGCCATCTTCTCTTCCTCAATCCCAAAAATGAACAG GTAATAGTTGAGGGGTATGTTCAGGAAATCTTATATAATGCTAATTTGCAGGGTATGAGTGATCTTCTGTCTCCAATACT GTTTGTGATGGGTGATGAATCAGAGGCATTTTGGTGTTTTGTTGCGTTAATGGAGCGCCTTGGGCCCAATTTTAACCGTG ACCAAAATGGAATGCACTCTCAGCTTTTTGCATTATCAAAGGTTTTACTCTTGTTCTCTTTCCCCCTGACAAGCCACATA CACAGACCTGATTTTTGCTTTTTGATCATTGAAGTCCTCAAATTTTGTATGTTTACTCTTTTTTTTTGTCTTCAGTGGCC TTTTCCTAACATTATACAATATATTATTTTGTAAGATATGTACACAAGCTCATTATGCATTCATCTTATAAGTAGTTGCA TATACAGGGATGTACTTGAACGGTTTGACTCTGAAAGATTATAAATGGAGGATATTGTTCTGATTTTCCATACCTTTGAT ACTTATAAAGAGGTTGTGCTGCTGGCTCTGACCGGCTTTACTGATGTAACTAGCTTATGATGATTCTTAAGTTGTATGAA AATAAAAATTCTTCAACTTTTTGCCATTTAGTCTTGCCGGTATGTCTGATTCTGCAATATAGAGAAATTAATATGATATC AGTCACCCATATAATCTATATGTATTCTGATACTTTTATTGGAAATCGATTTTCTATTGATCCTTCTGTAGCAGAAACTG GCATTGATACTTTTTGATGATCTGTGTGTTATGTTGTGTTTATCTGTACCATCCGATCACATGTGTTGCATTTTTGGGTA ACTGCTGGTCTCCACAACTCTGTAGGAAATTTATACTGAGATGCATTGCTTTTGCCGCTCCTAACTAATATTTCTTTGTT GCAGTTGGTGGAGCTGCTGGATAGTCCATTGCATAACTATTTTAAGCAGCGTGACTGCTTAAATTACTTCTTTTGTTTCC GCTGGGTTTTGATTCAATTTAAAAGGTTAGATTTCTTGAATTGCTATACTTGTCATTGTGCATTAACTTCTGATACATAC TATGTTAAATGTGTTTAGTTTCTATGTTATCTAATGTTGTTGTTTTCTCTTCAAATCTTTTTGATTTACATTCCTCACTG AATTACATTCTGCCTATCTGCTTGCTAGAGATATTATTGCCTCATTTTATTGCCTCATTTCTATTTAACCTAAATTGAAT CTTAAAAATTGATTTGGGACTTATGATAGACATGTTGTGGACAATGTTCTCTAGTTTGCTAATACTTTGAAGTCATTGTG CTTCATTTCTGTCTTACAATGTTCAACAGTCCAAAAGGTTTGTTGACCCATGGCTGAAAGTATTAGTGTGGTCTCTCTTC TCATGACAGTTTCTTCAACATTTAAATTGGGAGAAATTACACTCTCCAGAGATTATAATTGGGAGATTTTGTACTGTCTG TTCTCGTGGAGATTACAAATGAGTTATTATTGGTGTTTCTAATTTAAGTTTCTAGTCTTGGTAGGTTTAGCCTTGTCTTG AATCATCAGAAACATTTTTCTGCAATGCTTGTTGAGACTAATAAAAAGTATTGATTGAAATTTCAGGGAGTTTGAGTACG AGGACACAATGCGCTTATGGGAAGTATTATGGACGCACTATCCGTCCGAGCATCTACACCTCTATGTATGTGTGGCAGTG TTGAAACGATACCGAAACAAAATAATAGGAGAGGAAATGGACTTCGACACCCTCTTGAAGTTTATTAATGAGCTAAGTGG TCACATTGACCTGGATGCAACCCTCAGAGATGCAGAGGCTCTATCCATATGTGCTGGTGAGAACGGTGCAGCTCGTATAC CACCTGGAACCCCACCATCCTTGCCTGTTGATGATGGTTCATTTTACGTCCAACAAGATGATGAAGTTTTGTAAATAAAT TCACGGTTATCTTAAATATCTTTAGCGATACATGAATATATTGATCTCATTGTGTATTGCCTGATTTGATTACAATATGG TCTTAGCATATTAAATGCAATTCTTAACTAGATTTGTACTTTTGAGTCAAAGCTGGGGCTGAGTACAACAATAAAGCTAG ATAGTGCAAACTCGTCCGGTGAAATACAAAAGGGTTAAATATGTTCGGGGTTCCTGAACTATAGTCAGAAATTGGTATTC GTCCCTCAACTAAATTTTCATTGCTTTCCATCTTTTAATTTGTAAAGCCGTTTGACTGTCATCTCTTTACCGGTTCTTTG CTTATTTGGCATGTCAACTTGCCGGTCAAGTGATGACATGTAAGTGTTTTTTTTTCCTTCCTCTTTTCAAAAGAATTGAG GCTTCCCCTTCCCTTCCACCACAGTAACATCCACTCTTTCTCATTGCCCCCTTTTCAGCCCTCCTCGTCCTCCAACCCAA TTCCTCTTCCCATGCTGCTTCCACCTCTCCGCTTCCCTCTCCCGCTCCGACGATCTCAACAGTTGGGCTATCCTCGACTC CCCCACCACCACCCACAAAGGTATCTTCGATCTCTACGTTTTGCTCTCTCTCTCTCACTCAAATTATTGAAGCTTCCAAC TTGTGTGCAGCGTTTCCTTCGAACTCTATAGTGGGTGTTGGCACTTCTCTC
CDS sequence (LotjaGi4g1v0274400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTAGAATCAGAGCTTCACGACCTCTCCGACGACGCCGATTACGCCGCTGCGTCGCAGCAACAAGGTTCTTCTAGCAC GATGCTACGGAGCGATAGCGCCAAGCAAAGCTCATCGTCCAGTGAGCGAGAGGGTGCTGAGATTGTGTTTTTGAAGGATA ATGTTGCAATTCATCCGACTCAGTTCGCCATCAGTGGGAGACTCAAGTTGATTAAGCAAGGCGCTGCTTTGTTTATGACT TGGTTGCCTTACAAAGGCCATGGTTCAGATGATGGGATCTCTGATAAAGACAGAAGCCTCTACACCATTAGTGCGGTGCC CTTCACTGACATCAGGTCCATTCGGAGGCATACCCCTGCTTTTGGGTGGCAATATATCATTGTTGTTCAATCATCAGGAC TTGCTCATCCTCCACTCTACTTTTATAGTGGAGGAGTCAAAGAATTCCTTGCCACAGTAAAACAACATGTTCTTCTTGTG AGATCTGCTGAAGATGCAAATGTATTTCTTGTGAATGACTTTCAGAATACACTGCAGAGGACATTGTCTTCCTTGGAGCT GCCAAGGGCTGTTTCTCTTGCATGCGGACCTTCAAATACACCTCTCAATGAATCCTCTTTGAATGAGAACCAGGAGAACG GTGATAGTGGTGTCTATAATGGAAGTGCCAGTGTTCCTCAGTTCCATGGGAGGCCAAGACATAAAGTTCAAGATCCTGCT CGGGACCTCTCTATTCAAGTTTTGGAGAAGTTCTCTCTTGTCACAAAATTTGCCCGTGAAACAACTTCACAACTCTTTAG AGAAAACCATAGCAATGGGTTTAGTGTCCATGAGAGGAGAACCCATATCCAGAGTAACCTTGATCCTCCGAAGAAGTCTT CCAATGTTGCAGAAAACATTTCTGATGAAAGTCCTGCTGTCTTAGATTCTCAGGAGTTTGATAAACTATCACTGGTATGG GGAAAACCACGGCAACCCCCTTTAGGTTCTGAAGAGTTGATTACTTTCTTGGATTCTGAAGGGCGAGTCACAGATTCAGA AGCTTTTAGGAAGAGAATATTTTATGGTGGACTTGACCACAAATTACGAATTGAGGTTTGGGGTTTGCTTTTGGGATACT ATCCCTATGAATCAACATATGCTGAGAGAGAATACCTGAAGACAGTTAAGAAGTCAGAGTATGAAACCATAAAGAACCAG TGGCAGAGTATCTCCTCAGCACAGGCTAGAAGATTCACAAAATTTAGGGAAAGGAAAGGGCTTATTGAGAAAGACGTGGT GAGAACTGATAGATCACTCAATTTTTATGAGGGGGATGATAATCCAAATGTGAATGTTCTGCGAGATATCCTGTTGACAT ACTCATTCTACAACTTCGATCTTGGTTATTGTCAGGGTATGAGTGATCTTCTGTCTCCAATACTGTTTGTGATGGGTGAT GAATCAGAGGCATTTTGGTGTTTTGTTGCGTTAATGGAGCGCCTTGGGCCCAATTTTAACCGTGACCAAAATGGAATGCA CTCTCAGCTTTTTGCATTATCAAAGTTGGTGGAGCTGCTGGATAGTCCATTGCATAACTATTTTAAGCAGCGTGACTGCT TAAATTACTTCTTTTGTTTCCGCTGGGTTTTGATTCAATTTAAAAGGGAGTTTGAGTACGAGGACACAATGCGCTTATGG GAAGTATTATGGACGCACTATCCGTCCGAGCATCTACACCTCTATGTATGTGTGGCAGTGTTGAAACGATACCGAAACAA AATAATAGGAGAGGAAATGGACTTCGACACCCTCTTGAAGTTTATTAATGAGCTAAGTGGTCACATTGACCTGGATGCAA CCCTCAGAGATGCAGAGGCTCTATCCATATGTGCTGGTGAGAACGGTGCAGCTCGTATACCACCTGGAACCCCACCATCC TTGCCTGTTGATGATGGTTCATTTTACGTCCAACAAGATGATGAAGTTTTGTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0274400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLESELHDLSDDADYAAASQQQGSSSTMLRSDSAKQSSSSSEREGAEIVFLKDNVAIHPTQFAISGRLKLIKQGAALFMT WLPYKGHGSDDGISDKDRSLYTISAVPFTDIRSIRRHTPAFGWQYIIVVQSSGLAHPPLYFYSGGVKEFLATVKQHVLLV RSAEDANVFLVNDFQNTLQRTLSSLELPRAVSLACGPSNTPLNESSLNENQENGDSGVYNGSASVPQFHGRPRHKVQDPA RDLSIQVLEKFSLVTKFARETTSQLFRENHSNGFSVHERRTHIQSNLDPPKKSSNVAENISDESPAVLDSQEFDKLSLVW GKPRQPPLGSEELITFLDSEGRVTDSEAFRKRIFYGGLDHKLRIEVWGLLLGYYPYESTYAEREYLKTVKKSEYETIKNQ WQSISSAQARRFTKFRERKGLIEKDVVRTDRSLNFYEGDDNPNVNVLRDILLTYSFYNFDLGYCQGMSDLLSPILFVMGD ESEAFWCFVALMERLGPNFNRDQNGMHSQLFALSKLVELLDSPLHNYFKQRDCLNYFFCFRWVLIQFKREFEYEDTMRLW EVLWTHYPSEHLHLYVCVAVLKRYRNKIIGEEMDFDTLLKFINELSGHIDLDATLRDAEALSICAGENGAARIPPGTPPS LPVDDGSFYVQQDDEVL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 41 | 41 | - | – | |
| MobiDBLite | 15 | 41 | 27 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 647 | 621 | 2.7E-280 | – | |
| PANTHER | 27 | 647 | 621 | 2.7E-280 | – | |
| Gene3D | 40 | 171 | 132 | 6.6E-6 | – | |
| Pfam | 97 | 186 | 90 | 6.1E-18 | ||
| MobiDBLite | 198 | 223 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 198 | 237 | 40 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 334 | 526 | 193 | 7.59E-51 | ||
| SMART | 354 | 592 | 239 | 3.6E-59 | ||
| ProSiteProfiles | 357 | 567 | 211 | 38.36 | ||
| Pfam | 361 | 589 | 229 | 7.9E-53 | ||
| Gene3D | 378 | 493 | 116 | 2.1E-19 | – | |
| Gene3D | 494 | 624 | 131 | 4.9E-32 | – | |
| SUPERFAMILY | 502 | 621 | 120 | 1.96E-34 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0274400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…