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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0329700 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0329700.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3; TAIR: AT3G06670.1 binding protein; Swiss-Prot: sp|Q5SP90|PP4R3_DANRE Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3R9A6|A0A0S3R9A6_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0329700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:70894197..70912331) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAGATCGGGGACACTCGAGAGAGAAATTATTATAGTAGGAGGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGGGAAGAGAGAAGAGA GGAGAAAGAAAGAAACTTCACGCTGCTACGTCAATGGCGGTTAGGGTTTCCTGTTGATCCTACGAAACTTCATCTCTTCA CTACAATTGTTTCCCCTTTCATTCTTCTCCTTCTCCTCGAAACCCTAATTTCAAACCCCCGAATTGAGCATGCTCGTTGT TGTTATTGCTTAGAATTTTTCAGAAGCTGTCGTCATGGGTGCGCCGGAGAAATCAGAGGATAACGCTAATTCGATGCAGG CAAGTCTGTTTTCGAGCAATTAGCTTTGCCCTAGATTCTGCTCAATGCTTATTTTCGCATGTTTGGAGCTCGAGCTTCGA TTTCATTTGTTCAATGATATACTTTGGATTTGCATTCGTAAAATCAGTAGGAGTAGTATTCTTTAGCTATGTCTAGAGTG CTGTTATGCTTCCTTTGTGTTGCTTTTTGCTTTCTAATGGCTGGTGGTCTTGACGTGACTGTTGTTTTTCTTATTGCTGT TTAGGAGAGCTAATTCAGAGTTAATTCATCTCATAAGAACAGCTTTTGAGTTTTGTGTCATTTATATGATTGGTTATGCA CTGAAATATGAGACTTGGGATTGTTACTCGTTAGGCGTCAATTAATTTTTCCAAGCAACTAGGAAACCTGTTAACAATAT AACACAATGTTAATGCATGGAATTTGGTCTGGAGAGATGAATTTGGTGTGATTTGTTAAAATTAGAATGTACCCAATCAA GTAATCAACCATGTATTGGGAACAAAAAATGGTAAGCCAGACACATTTATTGTAGTGTTCCCCCATGATTTTGCTACTAC CAATTGTAATCTAAGAAATATTGGAAGTTGGGACTTGGGACTTTCTTTTCATTTGGCTTATTTCTGTTTTGGTTTTGTTT 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GCATGAAGACAGATTGTTTGCTCTATTTCGTGTATAGATTTGATTGTGGCTAAGTGGTTGCTGACAGTCAAAGCAATATA GCGGAGACAAAGGAATTTTACCTACAAGAGGGTGAATTCTGGTTAACTGTTGCTTCGACAATATGGGGAGATACTGTACC ATGCCGCTGAGGGGCAGGAAAACATTAGTACAGTTACATGGGTGGATCTGCTCCTATTCCTTCGGTCTGCTATTTTCGGC TTTGAACCTAGTAGTTCTTGATTTTGTATAACATTTCTGAGCAATAATTTCTCTATTTTCTTGTCTCCAAAATTTTCCTC TTCTCAGCTAATTCATTTACTTCTGTAGTTTCTGCAAAGTATCCGTGGTGCCTATGAGGGGTGTATTATCATTATTCCCC TTTTCAGTTATTTGAACTCACGGTAGAGGGTGCCAATATCTTGCCCTACACAGGTTTTACTTGTTTATGTTATCCCTTTT TTGGGTTGTGGGCGTGTTGGTCCTATATTTGTGCAGTGAGTTTCTAGGGCTAATTTTCACAAATGTAGTAGTCTGGAATC ATCATCCGCTGTAAATCTGTGTATGAAAATGTTAGTATGCAACGGACCACATCGTAATCTAGACACTGTTAATCTTCTTT GTTGTTTTTCCTTATCATACGTCCCTCCTAGGCTAAAAACCACTTTTCATTGTTAATTCATGGTTATCAACATCGCAATT TTGATGGAGAGGTTGCAGAATCCCATGACTTCAGGTGTTTTGAAGTGTAACTATAAGACTGTATAGTCGGTTTGAGACTC GATCAACAGATTTAAACAGTTATAGATGAAATTGATAAATACTACTCCTGCTTAA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0329700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGTGCGCCGGAGAAATCAGAGGATAACGCTAATTCGATGCAGCGTGTCAAAGTGTACCGTCTGAATCATGATGGAAA ATGGGATGACCAGGGTACTGGACATGTCACTGTTGATTATTTGGAGAGATCAGAAGAGCTGGGCTTACTAGTTTATGATG AAGAAGACAATGACACCATACTTAGGCAGCGAATCAGTTCTGATGATATTTATAGGAAACAAGAAGATACCATTATCTCA TGGAGAGATCCTGAATATGCTACAGAACTGGCCCTTAGCTTTCAAGAGCCCACCGGATGCTCTTACATATGGGACCACAT TTGCAATGTGCAGAGGAACATACATTTCAATAATATAAATAATGAACCATTTCAGAATGTTAACAGTGAGTTAAGGGAGT TGCCTGCTATTGAGCTATCGACACTTCCTTTGATTCTTAAGACTGTGGTTGAAAGTGGCATTGCAGATCAGTTGCGGCTT ACTGAGCTAATATTAAGTGATCAAGAATTTTTTCGTAAGCTGATGGAAGTATTTAGTGGATGCGAAAAGTCGCAAAACAT GGATGGCCTTCACATGATATTCAAAATAGTCAAAGGGATCATTTTGCTCAACAGTACTCCAATTCTTGAGAGAATTTTTA AAGATGAATTTATAGTGGACATTATCGGTGCCCTCGAGTATGACCCAGAAATTCCTTCTGTTCAACATCATCGTAAATTC TTACATGAGCATGTTGTTTTTAAGGAGGCCATACCTATTAAAGACCCCCTTGTGTTATCAAAGATACATCAGACTTATAG AGTTGGTTATTTGAAGGATGTTGTTTTGGCTAGAGTTTTGGATGAGGCCACGAGTGCAAATCTTAACTCCATAATACATG CTAACAACGCTTGTGTTATTTCATTGTTGAAGGATGACAGCAAATTTATCCAGGAGTTGTTTGCTAGGTTAAAATTGCCC ACCACCGCTCAAGAATCGAAGAAGAACTTGGTCTATTTCTTACATGAGTTTTGTAGTGTAAGCAAGAGCTTGCAGATGGT TCAGCAGCTTCGGCTTTTTAGGGATTTAATGAATGAAGGCATCTTTGACATTGTCACTGATGTTCTGCAAAATGATGACA AGAAGTTTGTGCTCACTGGGACAGACATTCTCATTCTTTTCTTGAATCAGGATCCTAATCTTCTGCGGTCATATGTTGTT CGGCAGGAAGGAATTACTCTTCTAGGACTCTTGGTTAAAGGAATGGTAACGGATTTTGGAGAAAACATGCACTGCCAGTT TCTTGAGATTCTTCGCTGTTTATTGGACTCATGCACATTGTCTGGACCACAGAGGGACACTATTATTGACATTTTCTTCG AGAAGCATTTGGGTCAACTGATTGAAGTTATCGCAGCATCATGTCCTTCAGAAAATATTGCTGATGGAAGAACTGGAAGA AGAGTTAAGTGTCAGAATGGAACAAAGCCGGAGATATTATCAAACATATGTGAATTACTATGCTTTTGTGTTCTACATCA TCCATACAGGATAAAGTCCAACTTTCTTCTTAATAACGTGATTGAAACAATTTTGTTACTGACACGGAGAGCAGAAAGAT ACTTAGTTGTTGGTGCTGTCCGTTTTGCTCGAACTCTTCTCTCCCGCCATGATGAGCATTTGTTAAATTATTTTGTTAGG AATAATGTTCTCAAACCGATTGTAGATGCCTTTGTTGCAAATGGCAATCGTTACAATCTGCTCCATTCTGCTGTTTTGGA ACTTTTTGAGTATATTCGGAAGGAAAATCTGAAATTATTGCTGAAATATATAGTTGATTCTTTCTGGGATCAGCTGGTGA GATTTGAGTATTTGGCATCGATTCGCTCGCTGAAAGTAAAATATGAGCAGTGTTTGGATAATGGTGGGACAAAAGATGCC GCTACTGTAGTTGACCTTCGGAGACGAACTGATGAGCGTGCTCTGGAGAGAGAAGAGGAACGCTACTTCAATGAGGATAG TGATGAGGAGGATATAGCTTCTGCATCTGTTTCACATGATCAGAATGAACATCAACAACCTACTCTTTCCAATGGAGTTG CTGCAAGCTATTCACAGTCAAGTCCAAAATCACTGGTTGACTATGATGATGATGAGGATGATGAAGATTACCGACCACCA CCAAGGAAGCAGCCAGAACCTTCTGAGGAAGATGATGGCATAATGGAGTCTTTAAGGCTGAAAAGGAAATTGCCTTCAAA GGATAGGGAACCCGAACTTGTGAAGAAGCAGAAGTCACCCAAGAACATAAAATCTAAAGAGAGTGTTTTTGCTGCCTTGT GTTCAACATTGAGCCAATCTGTGCTACCTAGTAAGAAAGCTGCAATCAACATTCATCTAGGTGCTCGAACAGTTGAGGGT AGGATGAGCTCAAGTCAAGACAAGCAGGAAGAAGAGGGATCTAGTGTTTCTAGTAGCAGCTCTGATGATAGCAACACAGC GGCTGAAGATAACCATGTTGAGAAACAAACTGCAGCTTCTAAAAGCTTTTCGGACTGTTTGCATGCAACATCAGATAATA TACAGTTGGGGGGTGAGGATCGTCCATTGGTTCCCCCAAATTCCTCGCCGGAGATGGCTGTAAATGGATCGTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0329700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGAPEKSEDNANSMQRVKVYRLNHDGKWDDQGTGHVTVDYLERSEELGLLVYDEEDNDTILRQRISSDDIYRKQEDTIIS WRDPEYATELALSFQEPTGCSYIWDHICNVQRNIHFNNINNEPFQNVNSELRELPAIELSTLPLILKTVVESGIADQLRL TELILSDQEFFRKLMEVFSGCEKSQNMDGLHMIFKIVKGIILLNSTPILERIFKDEFIVDIIGALEYDPEIPSVQHHRKF LHEHVVFKEAIPIKDPLVLSKIHQTYRVGYLKDVVLARVLDEATSANLNSIIHANNACVISLLKDDSKFIQELFARLKLP TTAQESKKNLVYFLHEFCSVSKSLQMVQQLRLFRDLMNEGIFDIVTDVLQNDDKKFVLTGTDILILFLNQDPNLLRSYVV RQEGITLLGLLVKGMVTDFGENMHCQFLEILRCLLDSCTLSGPQRDTIIDIFFEKHLGQLIEVIAASCPSENIADGRTGR RVKCQNGTKPEILSNICELLCFCVLHHPYRIKSNFLLNNVIETILLLTRRAERYLVVGAVRFARTLLSRHDEHLLNYFVR NNVLKPIVDAFVANGNRYNLLHSAVLELFEYIRKENLKLLLKYIVDSFWDQLVRFEYLASIRSLKVKYEQCLDNGGTKDA ATVVDLRRRTDERALEREEERYFNEDSDEEDIASASVSHDQNEHQQPTLSNGVAASYSQSSPKSLVDYDDDEDDEDYRPP PRKQPEPSEEDDGIMESLRLKRKLPSKDREPELVKKQKSPKNIKSKESVFAALCSTLSQSVLPSKKAAINIHLGARTVEG RMSSSQDKQEEEGSSVSSSSSDDSNTAAEDNHVEKQTAASKSFSDCLHATSDNIQLGGEDRPLVPPNSSPEMAVNGS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 10 | 130 | 121 | 2.6E-34 | ||
| PANTHER | 11 | 840 | 830 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 11 | 840 | 830 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 14 | 111 | 98 | 3.08E-14 | – | |
| Pfam | 168 | 356 | 189 | 3.5E-66 | ||
| SUPERFAMILY | 169 | 611 | 443 | 8.83E-12 | ||
| MobiDBLite | 657 | 762 | 106 | - | – | |
| MobiDBLite | 678 | 704 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 716 | 762 | 47 | - | – | |
| MobiDBLite | 795 | 877 | 83 | - | – | |
| MobiDBLite | 809 | 826 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 837 | 851 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0329700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…