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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0023700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0023700.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Appr-1-P processing enzyme family protein; TAIR: AT2G40600.1 appr-1-p processing enzyme family protein; Swiss-Prot: sp|Q8P5Z8|Y3184_XANCP Macro domain-containing protein XCC3184; TrEMBL-Plants: tr|G7I3E3|G7I3E3_MEDTR Appr-1-P processing enzyme family protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0023700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:4149703..4170126) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAGCTATAATTCTATAAACACGCTGATTACAGTGTTTGCCGATCACAGTGTAACAATTACATAAACCTTCCTTCCCCTC AAAGGCGATGACCAAGGTTTTCTCTGGTTCCCGATTTCTCCTGAAAACCCTCACATTTAGGAGGAGTTCTCGCGTGTTCG GAGTGGACGCAGGGGCAGCTAGGTTTTCTTCCAATGGCGGCGGCGGCGGCAGCGTTCGCTTCCCGTTGTCTGCATCCAAC GCTCTGGTCATTCAAAAAGGAGACATCACCAAATGGTCCATCGATGGTTCCACTGACGCAATCGTATGTTATCAAATGTT CCTCTTTTTTTATTTTTTTATTTTACTTGAAGAACAATTATTTATATGTGAAAACAATGAATCACATTGCATTTTTTTCT CCTGTGCAGGTGAATCCTGCAAATGAGAGAATGCTTGGAGGTGGTGGTGCAGATGGAGGTAAATTGCTTTAATTTTGATC ATAGTTTTCATCAAGGGTGTGTTTTGAAATTCTTTTACAATTAGATATCAAGTGAAAATCAATTTTGGAAGAAGCTTCTT TTGAGTACCATGCTATAAATTATCACAACCATTAACCAATTCATCATGCTTGCTTATAGTCAGTGTGGTAGTGAAATTTT TTGGGAATGAGTTTTTCTTTCATGTGTAGCTAGCTGATTTTGATGGGTGTAGTAAGTTGCCTGACGACCTAACTAACTTT GGCTTTCAGCTATACATAGAGCTGCAGGCCCGGATCTTCTTCGTGCATGCCAAAATGTTCCAGAAGTCAGGCCTGGTGTT CGCTGCCCAACTGGGGAGGCAAGGATCACGTCGTGAGTGAGTTCTTCTAATTTCACGCATAACAGGACCATTTTGTTGGA TTAGCATGTATGATTTTATTTTTCACCTTATTATGTTGGATAAGCATACTTGTGAAATATGATCATGTTAGTCCTTGGAT 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TACAGAACACAGTCAGCATTAACTAACAGTAATGCTTATTATAACAGTAACTATATTACTCTAATAACACACCTAGTACT TCTCTTTTGGAAATATAGAGAAATAAATGATTATGGAAGAATATCAAGTGCAATCAAGCATACCCATTTATATACTATAT CTTAAAGGACAATAGATTCTGTTTACACAGGCTTAAACCCCATTGAGGCATATTACAAATTTTAACAAAAGAATAAACAA AAAAATTACAACTTAGATGAAGATTCAAGAAATTGCATCATCATCATCATCATCATCATGATCTTATTCAGAGTCCAAAT CCAGACAACCTGCCCAAAATCCCTTGTTTGTATGGCAAGAAAGTTTTCTTCCTCATATCATCAGATTCAGCTTTCTTCAT GGCATAGTGAAATTCATGGGCTGAAACGGGTCCCTTCCTTCTTGTTCTATCAGAGGATCTAAAGCTAGATGATCTAACCT CTACTTCATTCTTCTTGAACGCAACAGGGTACTTGTTCAATGCATCTTTGCTTGAACCTCTCCCTTCCGAGGCACTTCGA AACAGCAAAAAATCCTTCAAACTCCACCTTCTTGACCCTTTGGATGAACCAGAAGAAGACGAAATCGAAGCTCCAGAGTT AGACAAGGACAATTTTGCACTTGATTTTGATTCTTCTTTGTTGCTCTGAGCTTGTTGTTGTTGTAGTTGTTCTGATTCCA AAGTGTAGTGTGGTTTTCTAAAAGGAGAGTGTGATCTTGAGACCCTGCGACCCGAGTTCGATGATGACAAAGTTGTTGAT GCGGTTGTTGCTCTGTTTCTGTCTCTGCCTCTTCTCTGCTCTGTTTCCAAAACAGGGTTCTTATTGCTCAGAGAAGGAAG CATGCTTTCTGCCTTCATAGCTTTGATTTTGCCACCATCGAAGAGTTCTTCAGCTGAACGGGATGATTTTTCTGATTCAC GGCTAACAAAAAAAGCGAAATTGCTGCCATCATCTTCTTCATCATCGTTGTTGGTGGTGTTTTCTGCTGCTTCAATGGTG GAAGAGTCAGCAATGGAGGCAAAGTACTCAAACTCGCTATACAGCTGAGAAATTCTTGAAGGACTCGTGGGGGCGCTCAA GTAATATTCACCAAAGCGTTTTGGTGAAGAAGGAGCACTCAAATAAGGTGAACTCATGGTTCCACTGCTGAAATCAAAGT TATCCATGGGGGGACTACTAGGACTCTGTACCACCACTTCCATTTCCTGTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTGTTGTTCCAAT CTAAACTTTTTTATGATTTGTGTTTTGTTAACAAATGTTTGTGTTGTTGTTGTGTCATATATACTCACAAGGGAAAGTGG TTGAGAAGGATCATGTTCATGTCATGTGTGAAAATGTGTTGAGATTGTTTTGTTGACCAATGGCATGGCTTGGTCATGAA GGGGTTTGTATTAATTAAGCCGCCTTTGAATACCGGTTTTTTGTTGTTTACGTGAAAATTCTTCCTTCTAGCCTGTTGAG GTGTGTGTGGTCAGAAACTGACACATTGTTGCTCCCACATGGCTGATTTTTATATTGGGGATTTGGTAACCATGGATGTG AATTGTGATGAATACATATATAGCTTGTAGTTTTAGCTAAACTGATCATCCTCCACATATGAATTTTGTGAGGGCACACA GCACCACTGAAGTAGATGGCTGCATTATTTAATGTTCACGTTCCATATGATAAAACATTATATATAGAATAGTTATGTGT CTACTAACCTTAGGTGTATACCACCCATTTTTAATAAATATAGAAGAGAAATTGAGAAACGTTATTGATGATATGATATA GAACAATCCTGTATCGCGGTATAGTATAAGTTAATATTGAACACCTTATTTTTGTGACAGTTTTTAATTGTTAATCTACT TTGTGATCGTAAAAAAATTATCATAAAAGTGAATTCACAATAGTGGTTGACATTATTTTGCGGTTCACATATTATTAATG GACAGAGAGAGTGAAGAAGAGAGAATGAAGACAAGAGATGGAAGGGAGATAGGGAGTTTAAAAGTTAATGTTGTAATTGG TATAGGCCAAGCTACTTTAATGAAACTCTCTTGTATAATTTCACCTATTAAATAGATTGTTAAAAAATGTTTATTGTTAT GTCATATTATGACAAAACTTTTAC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0023700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACCAAGGTTTTCTCTGGTTCCCGATTTCTCCTGAAAACCCTCACATTTAGGAGGAGTTCTCGCGTGTTCGGAGTGGA CGCAGGGGCAGCTAGGTTTTCTTCCAATGGCGGCGGCGGCGGCAGCGTTCGCTTCCCGTTGTCTGCATCCAACGCTCTGG TCATTCAAAAAGGAGACATCACCAAATGGTCCATCGATGGTTCCACTGACGCAATCGTGAATCCTGCAAATGAGAGAATG CTTGGAGGTGGTGGTGCAGATGGAGCTATACATAGAGCTGCAGGCCCGGATCTTCTTCGTGCATGCCAAAATGTTCCAGA AGTCAGGCCTGGTGTTCGCTGCCCAACTGGGGAGGCAAGGATCACGTCAGGTTTTAGGCTGCCTGCTTCTCATGTTATTC ACACTGTTGGCCCCATCTACAATGCTGTTAGTGATCCTTCTGCCTCTCTGGCAAGTGCTTACAGGAATTGTTTGAGGATT GCAAAAGAGAACAACATCCGCTATATAGCATTCCCAGCCATATCATGCGGTGTCTATGGATATCCTTATGAAGAAGCTGC TACAGTGGCGATTTGTACCATCAAAGAGTTTTGGAATGACATTAAGGAGGTATCAATAGAGCAACCAATCTTGGCAAGTA CCTCTCCTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0023700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTKVFSGSRFLLKTLTFRRSSRVFGVDAGAARFSSNGGGGGSVRFPLSASNALVIQKGDITKWSIDGSTDAIVNPANERM LGGGGADGAIHRAAGPDLLRACQNVPEVRPGVRCPTGEARITSGFRLPASHVIHTVGPIYNAVSDPSASLASAYRNCLRI AKENNIRYIAFPAISCGVYGYPYEEAATVAICTIKEFWNDIKEVSIEQPILASTSP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 29 | 205 | 177 | 8.4E-87 | – | |
| PANTHER | 29 | 205 | 177 | 8.4E-87 | – | |
| ProSiteProfiles | 40 | 216 | 177 | 27.774 | ||
| Gene3D | 42 | 212 | 171 | 7.3E-61 | ||
| SMART | 52 | 190 | 139 | 4.3E-49 | ||
| CDD | 53 | 204 | 152 | 1.27966E-77 | – | |
| SUPERFAMILY | 53 | 204 | 152 | 7.57E-52 | ||
| Pfam | 73 | 190 | 118 | 1.4E-38 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0023700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…