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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0025300 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0025300.3 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein; TAIR: AT4G11800.1 Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q3YRS0|ERA_EHRCJ GTPase Era; TrEMBL-Plants: tr|I1M8J6|I1M8J6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0025300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:4336077..4346300) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGCTCTGATAAGCAGTCGGCTGGTTTTCTTGATACAATAAAGATGGAGAGGGTTAGAACTATATTTACCCACACTTA TCCTTACCCTCATGAGCATTCCCGCCATGCCATAATTGCTGTTGCTGTGGGTTGCCTGTTTTTCATCTCATCTGACAATA TACATACTCTAGTAGAAAAATTAGATAACAATATTAAGTGGTGGTCTATGTATGCCTGCTTGTTTGGGTTCTTTTATTTC TTTTCAACACCTTTTATAGGCAAGACTATCAAGCCAAGCTATTCAAATTTCAGTCGATGGTGAGTTTCTTTAACAAATTG ATCTCCCTGTATGTGAATGTTTACTCTGTATCTTTATGAGGAAGAATTCAATTTACAGGATTTGAATTAAGTTGATGTCT GCTTTGCAGGTACATAGGGTGGATTTTAGTGGCAGCTGTGTATCATCTTCCTAGTTTTCAGTCAATGGGAGTGGATATGA GAATGAATCTATCTTTGTTTTTGACAATATATGTATCGTCTATTGTATTTCTTACTGTGTTCCACATTATATTTTATGGA CTCTGGTATATTGGCCTGGTTTCGCGTGTGGCTGGGAAGAGACCAGAGATCTTGACCATTCTTCAAAACTGTACTGTAAG TTTGGAAGATGATTTTTTGTTCCTCGCAAGACTCTATATTATTCTGATGTTTATTTAAAAATAATGTAATAGGTACTTAG CGTGGCATGCTGTGTATTTTATAGTCATTGTGGCAACCGAGCCATGTTAAGAGAAAGACGGCCTGACCAAAAAAATTCGA ATTGGTTTTCTTTCTGGAAGAAAGAAGAGAGAAACACATGGCTTGCGAAGTTTCTTCAGGTGTATGAGTTGAAGGACCAG GTTTGTTCATCTTGGTTTGCTCCAGTTGGATCTGCAAGTGATTATCCTCTTTTGTCAAAATGGGTTATTTATGGCGAGGT ATTTAATTTAGTTATATAAGTTGTAAAGTCTTCTATGTCTATGTCCGTGTAGTTCTTTCCATGTGATGATGTCAGAGTTA TTTTTGTGTTTTAGATAGCTTGCAATGGTTCATGTCCTGATTCATCTGATGAAATTTCTCCCATCTACTCACTCTGGGCT ACGTTTATTGGGCTTTACATGGCAAATTATGTGGTTGAAAGGTCCACTGGGTGAGTAGTTCTTTTCAGTTGGTTTTATGT GCCGAACTTTGTTATTTTCTGCATGTTAGTATGATCATTTCTTTTTCGTAGTCCAAAGTATAAAAATTGTGTTGAAAAAT GCTTTTGATAATAATGCAAATTAGCGTCATGTAATATACAGTCTTTTTTAATTAAATTGATCAATAAATAATGTCAGTTT TTGTTCTTGGCAGCAATCTTCTGTCGAGCATTTCTGAAGATTTGTAACAGATTTATTGTGAAAATTTTGACCTAATTTAA CATTTTTTCCTTTTTTCCATCCTTCATAATGAGATTTTCAGAACAGAATGAGATTAAGACTTAAGTTTTCCTATATATTA GTTTTTTAGGTAATATATGTATTAGTAATTTATTTTTGCAATACTGTTTTCATGGACTATATTTCCCTGTGAATAGAAAC GTGCAATAGTGCCATGAGCCTTTGGCACAATAGTGCACATTGAGAAATATTTATTATGGGTGGTATGGCATTTTCATTTT GCATTACACCAGCCTTTATTTTCTCATTATTTTACTTAATTTCTTTGTTTATATGTTTTAAAAATTAACAGGTGGGCTCT CACTCACCCATTATCTGTTAAAGAATATGAGAAGGTGAAGAAGAAGCAGATGAAGCCTAATTTTTTGGACATGGTTCCTT GGTACTCTGGGTATGTGTATAAAATATTTTGTTCCAAATTACTTTTATATTATATTTCAAAGGTGTTTTGAAGGTTTTCT TGGGTGCATGGTCACACTTGCTAAATGATGCAGAACATCTGCCGATTTATTCAAAACAGTTTTTGATCTCATTGTATCAG TTACTGTCTTTGTTGGGCGTTTTGACATGCGTATGATGCAGGTAACATTTTTACTTTTCCTTGCCCATTGTATTTCATTT AAATTTAAAATTATAGCTTGAAGATCAAAGTTATTTGCTACTGTATTATATTCTACGTAGTATTAAATTATAATAATTGT TGCTGCAAGTATTTTCATAAATTTAATTCGAATAAGTTTTTAGTTACTCACTTACTCCATATATGATGTGAGGATAATGT TAAATCGTTGTAGTTCTCTATGTTGTGCCCAATGACCTCGTATGTGGTCTTTGTTTCTTGAAGAACATCACGATAAATTC AAAGCCTGAATCGTGGATGTGCTTGCATACAAATTATAGAAGGGGTTTTATGATAGACAATTTTTTCATGCTTGTAAAAT CTTCTTAACATTTAACTTCTAGTCTCTAGGTTTAGATTTAAATTGTTCAGCGCAGTTTTTAACTTTCTATTGAGCATGCA AGTGCTGAACTTTTTTTCACCTGTCTTTGCTGATAGTTTATCACTAATATCTTTAAGAAGTCTTCGTACATGGCACTTTT TAATTCTCATATTTATGGTTGAGGATGTATTATTCTCAAATTTGTAGTTTGCTTTGCATTATTCCTTATTGTTGTCACAA CACTGTCATCAACAGGCAGCAATGAGTAGGGCTGATGACGGAAAGCAACAAGGTGACCTTCTATATGATCATTTTAGTGA GAAGGATGATTTTTGGTTTGACTTCATGGCTGATACTGGTGATGGTGGGAACTCTTCTTATGCCGTTGCACGACTTCTTG CTAAGCCTTCCATTCGCACACTAAAAGATGATTCTGAGGTTTCGTTACCACGTGGAGACTTGCTAGTTATTGGGGGTGAT CTTGCGTAAGTGGCCATACTTATTTGTTGTGGCTATTATCACATGATTTGGTCAATTATTATTTATTAACTTCAAGCTTC GGAATGATAAGTTGATACCATTTATATCATGGTTCTTGATTCAGAATTTTGAAAACCTTGGTTTAGAATCACATCGTGAA CAACAAAATGCCGAGCCTTCTCGTTAGTTTGGATTTTTTTTTTTCAACTTCTACTTGAATTAAGATTGAAAGTATTTAGT TTTGTGTGTCTAACTCTTGGTTTCTGGAGCATGTGAGTTATAAATCCTCATTATAGAACCTAACAAATTCAATGTAAGAA CTTGTGAACTTCATCCAATGCTTTTAGATTTTTGGACCGTGATTTTGCTATTCTCCCACCCTTTGAAAGTCTCTGTAGTT TAGCTAAGATTAAATGTCTTAGCTTGCTTTGACATTGACAGCTGATTTCCCGCTTCACCCTTTTGCATAAACCTGATGGC TAACTTGTGGCGATTTTATGACATTAGATTTACTGATTTTGTTTGAGGTTTGTTGACACATTGTGAGACACCGAAACTGC TTTTTCAACTGACATCAATAATCAATTATCTTTTCGTAATCTTTTGAAGTTTTAACTCTTTTCTTTTCATTATTCTTTTT TCTATTTCTGTGCTATTCTGCAATGACTTATTTATGTCATGTTATAGATATCCTAATCCATCAGCATTCACATACGAAAG GCGTCTTTTTGTTCCCTTTGAGTATGCTCTCCAGCCTCCTCCATGGTATAAAGCAGAGCAGATAGCTGTGAATAAACCCG AGGTACCTTTTGGAGCTCAACTGAAACAGTATGATGGACCTCAGTGTTTTGTTATTCCTGGGAACCATGGTTAGTTTTGC TCCTGGTTTGAGCCTCAGCAAATTATATGTTACTTTTTCCAAAGTTCATTGAAGTTTCATAGCTTTCCCTTTTTGTGTCT ATTATTATTAAGTTTCGTTTTTCCCATTTATTCTTTCTTTTTGTCGTTTTTCCTTATCTCAGTTTTCAAAAGACTTTAAA CTTGTATTTTAGGCCTAATGCCATTATGATGTATTGTTATTATTGTTTGATTCACAGACTGGTTTGATGGACTTCAGACT TTTATGAGGTACATATGTCATAGAAGTTGGTTAGGTGGATGGCTCATGCCCCAGAAAAAGAGTTATTTTGCTTTGCAACT TCCTAAACGGTGGTGGATTTTTGGGTTTGATCTAGCTCTTCACGGTGATATCGATGTGTACCAATTCAAATTCTTTACAG AGCTGATAAAGGAAAAGGTAGAGTATTCTGTCTATTTCTTTGTTATATGATGGTGAAATACATCATGAATGTTTTTGTTC ACATTTTTGCTTGAAGGAACTGTTATATGATAATTTATATCATATACGGTCAATTTTGGTAGAATGACTTAAGTGTCAGC ATGTCAAGTCTCAAGACTCAGACAATGATATGTAGTGAGTTCATTGTAGAATGTGGTTATTTCACTTATTTGATTATAAA GAGTTGTGATTTCTTGACTAAATTTTAAATTGTTGACTGTTTGATTCAGTATTTCAACAGCATCTATTTGAAATCTTGTT ATGCATTTTTGATATTTTACTAGTGATCTCAGTTTTTCTTGTGGTCACCATTGTTTTTCTTGATCTCAGTTTCACTTACT GATTGCATTTAGACATTCAAAGTATCAGCTATCATGCTTTATGACTAATTTTGTAAGGTTATGGTTACTCTGTCTTTTGA GACCTTCTTGGATATTATGCTTATGATTTTGGTTTATATCTAGGCTAGGAATGTAATTTCTGCTTGATGCTTCTAATCAT TCATAGTTTCTTGGAATGGCTACAACATTCCCCAACTACAGGAATGAATTTCGATGTTCACTCATAATTTATTTAATTTT GAAGCAAACTTAGTATTATACATGGATATAGATTTGGCTCCCTCAAAATTAAATGTTCTTATCTTGAAGTCTCTTGATTC TAATGTAGTTTTACTAATGTTATTTGTACACAGCACTTTGCACCCCTTTATTACCAGTCATCTTTTTGTTGTTACAAAAT AATGCTTGATGTATATATAACATTTACTAGTAAAAGACTTTGGTATGAGAGGTGGAAAAAGGATTAGGATTAAAATCTGT CCTATATTTTTCTGGCTGCTATAATCATTGTCATGGACTATGTATTTCATCGAAGGGGCCAGTGAATTTTGTTTTATCAT AAGACTAGTGAAACATATTAAGTACCATAATATGCTGTGTTTTTATTATGTACTTTTGCTTATGAGTGGCTGTCCTGATC TATAAGTTTTGACTAGTGGATACAATATAGTTTTTTTTTTGTTCTTTATTTACTGTTGCATATTACTTTCTGGTTACAAT TTGGACCCTCTCTGTCTTTATACTTGCTTTATACCTCCTTATTTGATCCATAGACTGATTGAGCTTACCTGTTCACATTA TGACAATTTAGGTTCAAGAGGATGACTCTGTGATCATTGTTACTCATGAACCTAACTGGCTTACTGACTGGTATTGGAAC GATGTTACTGGAAAGAATGTTTCACACCTGATTTGTGATTATTTAAAAGGAAGATGTAAGCTTCGAATGGCTGGGGACTT GCATCATTACATGCGTCATTCCCATGTAAAGTCAGATGGGCCTGTCCATGTTCACCACCTTCTTGTAAATGGTTGTGGTG GAGCATTTCTACATCCCACCCATGTTTTCAGTAAATTTAGTAAACTTCATGGAGTTTCCTATGAATGCAAAGCTGCATAT CCTTCCTTTGAAGATTCAAGCAGGGTTTGTAGTTGCTTGTTATTGTCTTCCATAATTTTAAGCACTAAATCCTTGTTTTC TAATACGCTACTAGAACATTATGGTGTAACATATTTTTAAATTTGATGCAGATTGCATTAGGGAATATCCTAAAATTTCG AAAGAAGAACTGGCAATTTGATTTTATTGGTGGCATTATATATTTTGTACTAGTCTTTTCAATGTTTCCACAAGTGAGTT CCTCCATTTCTTTGGTATTCTCTAGTTTTTTTTAATATTCTTATGATGTTAATTTTGTTTTTATTTATTGGATTCTTTTT CTTTCCTTTTGGCCCATAGAGTTAGCACTATTAAACTTTATGCTTATCAGATACAGATAGGGTAATGTCATTTGTCACTA TCATGTAACAATCTTCTTTTACTTATTTTCTAGTGTGAGCTGAATCACATCCTCCAAGATGATACATTTTCTGGTCAACT AAGAAGTTTCCTTGGTACTGCGTGGAATGGATTTATATATATCCTGAATCACTCTTATGTGTCATTCGCGGGAGCTATGC TGTTATTAATTGCAGCATATTCTTTTGTTCCACCCAAATTGTCACGGAAGAAACGAGCAATGGTTGGAGTCCTTCATGTT TCTGCGCACCTCACTGCAGCACTGATCCTTATGTTACTTCTTGAAATTGGCATTGAAACATGCATCCGGCATAACTTGCT GGCAACTTCAGGTTTTGTTTTCCTTCCTGTTGAATGATTGGTATTGATATCTTTTTCTGGAACATGTACTGCCTAAGTTG ATTAATTTTATAGGTCCATTCAGTTTCACTAAGCTTTTATTTTGGTTCCTCTTCTGAAATGCAACTTGTGGTTTTGAAGT TAATGCTATTAAGGCCCCATGACGGATTGGCATTGATGTGGTACTATGGCATGCCATTTCCAATGTCCAGAAAAAAGATG CTTTATCATCAATTTTTATTATTTTTATTACTATTCTTGTTGCCATGTCACTGCACAGTGCCATATCAGCACCAAACTAA TGAGTGTACTTAACTGCATCATTTTGAAAATGATTAGAAATATAACTTTGTTCTTGGGCATTCATGGAACTTTGTGTTAG TAACCCAAGACTCGGAACTGAGAATATATTTTTATTGAAAGAAAAGAATAGGAGAGTAATCTTCTCCAAGGGTTGCCCCT TACAACTGAGCAACTTCTTTGTTTCTCCCAAGTATACATCTGAGTTCCTCCCTCCAATCTCACATCCTACTATATCTAAC TAATCATCTCATGTTATCTACTAACTAACTGCAACAGCCCTAACTACTATAGAAGCCCCTTACTCATTTTTCTTCACTCT CTACATCCTAACACCTTCCTAGCTTTTAGGTAAGTTGTTCTTAAACGTAGTATTAGAGCTTCTAAATTCATATGATTAAT TGGTTTGGTATTTGATTTGTACTGCCCTTATTTTAATTAATAAGTTAAACTTTGGTAGTTGTATTGACCACATTTTAGGT GAAGCATTGCCCACATTTTAACCCAAAGATCTATTGAGTGGGGCAGTTTGCTAGAAATATTAAAACAATATTATGAGAAT AAAAGCATAACGTGCAGTGAAAGTGACTAATAGGGATGGCGTGGGTCCAAGACCCATTGGGTACCCACAAAAAATACCCA CAATGGGTAGGGTAAAAACCCGCTAGATGGGTATGGGGTTGGGTATGGGTAAATACCCGCAAAAACTAATGGGTACGGGT GCGGGTATGGGTACTATAGTACCCAACCCGCCCCATACCCGCACACATATTATACATTTGCATACACATAATTGGTAGTA TATGTTAATAAACTTAAAGTATAACTTCCTCACTTCTTTTAAAAAATACGTAAGTGAAGTCTTAATATTATATATACGAA TCATAATTATTCTCACTTATTTTTAAAATAAATTATTAACCGACAACTTTAGGAGTTTATCAATAATCTAAATTTATAAA TTTAAAGCTTCAATTCTCGCTTATTCTTTTTATAAAATTTATACCTATTCCAATGATTTTACTTCTTAAATATTCGGATG ATCGTTTGTATTTTTAATTTATGCTTTTTTCGCTAGCTAAATTGCGGGTAACGGGTACGGGTATGGGCATATAGGTACCC ACAGGGTACGAGGACGGGCATTCAGGCTGCTACCCACGCGGGTATGGGAACGAATACAGGTACTTTTTGGAAACTCGGGT ATGGGGATGGGTACTATAGTACCCTACCCAAACCCTACCCATTGCCATCCCTAGAATTGAGCTTCAGTTGAACTAGGAAG ACCATTAATGTAGTAAGGGATGTATTGTATGTAGCTGTGCAGCCAGGATCGTAAGCCACACAATACTGATACATCCACAA TAGCCAGAGTGCTTATAAAATATTAACTATCATATTCATAATTATTTACTCAGGTATTTATTTATGCTTCAGTTAAATGT TAGGAACTAGGTTCAATGTTAGAAACTAGGTTCAGTTGGTTGGCTCCAATAATCTTGTTTTGACTCCTAATCTGGTGAAT TTTAGTTGAGATCCAGTTACTCTGTCATTATTTATCACAATAATTTAATGAGAAAAGGATATGCATCCTTTGTAAAATGT AAAGTAGGGTTATTGAAGGTGGCCTAACTCAACCCGAAAGCTAGCTCACGAGTTAAGGTTTGCACAACCATATATAAGCA ATTGCTTGGCCACATCTCTAGCTAATGTGGGACTCTAACACACCCCCTCACGCCCAGTGTAGAACATCTGGAGCGTGGAA TGAAACGGGTGACCCAAATATGGGGAGTCAACAAATGGATCTAGGATAGGGGCCCAGGCCCATGGTCAAACAACCATCAG CTCTGATACCATGAAGGAGGCCTAACTCAACTCAAAAGCTAGCTCAAGAGTTAAGGTTTGCACAACCATATATAAGCAAT TGCTTGACCACATCTCTAGCTAATGTGGGACTCTAACAGTTATGTCCGAGTATCCTATTTGGGACCATTTTTTTAGTACT TATGTTGTATGCACTACACCCCTGATAGTATTGCCGTTTATTCTTAAATGGCTTGTTTCCTCTTTGGGTTATAATGACTA GTTATTTGTCTGTAATTCAGGTTATCACACTTTATATCAGTGGTATCAACAAGTGGAAAGTGAACACTTTCCAGATCCAA CTGGCCTCCGAGCTCGAATTGAGCAATGGACATTTGGTCTTTATCCAGCATGTATCAAGTATTTAATGTCTGCTTTTGAT GTGCCAGAGGTATGACAATTGTCGTGATTTTTAATTCTGACCTCTTATTGTCCTTATAGCGAGTACTGTAATGGAGATTA TTTTCTCAGGTCATGGCTGTCTCACGAAACAATATTTGCAAGAATGGATTGGAGTCTATTTCCCGAGGGGGTGCTGTAAT ATATTATTTTTCCATCTTCCTTTATTTTTGGGTTTTCTCGACCCCTGTTGTTTCCTTAGTATTTGGAAGCTACCTATATA TTTGCATCAACTGGCTTCACTTGCACTTCGATGAAGCCTTCTCATCTCTCCGAATAGCTAATTACAAGTCATTCACGCGA TTCCACATCAATTCTGATGGTGATCTTGAAGTTTATACACTGGCTGTTGATAAGGTAGGAAGCCATTATTCATTTTATGT AAGTTGAAGTATTGAGTTGGTTCAGGTTACAATCATTAGTTAAACAGAGTTACCGAAGATACTTTGATTATGTGATTGCT GTGTTGTTTTGCTTTCTTTAATATTTTAGACTCCTTTTTTCTACACTATCAAGACACTTGCTCTTATTGACTGCACAATA AATCCCACATCCCCTTTTTGTGTTTACAAAAATTAAATATTAGATAGAAGAAGAGCATGTATATATTCATTGGAGAGGAG TGCTACTATCATACTCTTTTCAAAACACACACACACTCCATATGATTGGTCTATTTATAAAATAGTGAGAGAAATTCACA TATTAAAAAATGTGTTGACTTTTGAAAAATTAAACCAATCAAGTTGAAGTGTGTTGCTAGCATTTCTCATTCATTGGTAA TTTTTTGTATATTCCTGGTTAAAATATTTTAATTGTATACGCATTTAGCGTTCTCTGTAATCGATGAAAGGTTCAAGAAC ACTAAGATTGCTCAGATTCTTGACTGGAAATTCTTTGGGGGCTGCATGAGAAAATTTTAAATAATAACTATATTATCTTG GATTTGATTAGTTTTCACCGCTTTATTAAACAGTGTTAATATTTTGAATGTGTAGGTTCCTAAGGAGTGGAAGCTCGATC CTGATTGGGATGGGGAGCCAAAACAACCAGAACATTTGAGCTATATGAGAAGCTTTCCTAGCAAATGGAGGGCAGCCACT GCCCACCAGGATCCAGTGCATACTGTCAAAATTGTTGACCATTTCGTTATTGAACGAACTGAAAAGAATGACAATGTTAC TGCTACAGCAGCTAACGAGCCAGTTCAATGATTTGTTGATTTGGTTATTCTAGTTGTAACATAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0025300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGCTCTGATAAGCAGTCGGCTGGTTTTCTTGATACAATAAAGATGGAGAGGGTTAGAACTATATTTACCCACACTTA TCCTTACCCTCATGAGCATTCCCGCCATGCCATAATTGCTGTTGCTGTGGGTTGCCTGTTTTTCATCTCATCTGACAATA TACATACTCTAGTAGAAAAATTAGATAACAATATTAAGTGGTGGTCTATGTATGCCTGCTTGTTTGGGTTCTTTTATTTC TTTTCAACACCTTTTATAGGCAAGACTATCAAGCCAAGCTATTCAAATTTCAGTCGATGGTACATAGGGTGGATTTTAGT GGCAGCTGTGTATCATCTTCCTAGTTTTCAGTCAATGGGAGTGGATATGAGAATGAATCTATCTTTGTTTTTGACAATAT ATGTATCGTCTATTGTATTTCTTACTGTGTTCCACATTATATTTTATGGACTCTGGTATATTGGCCTGGTTTCGCGTGTG GCTGGGAAGAGACCAGAGATCTTGACCATTCTTCAAAACTGTACTGTACTTAGCGTGGCATGCTGTGTATTTTATAGTCA TTGTGGCAACCGAGCCATGTTAAGAGAAAGACGGCCTGACCAAAAAAATTCGAATTGGTTTTCTTTCTGGAAGAAAGAAG AGAGAAACACATGGCTTGCGAAGTTTCTTCAGGTGTATGAGTTGAAGGACCAGGTTTGTTCATCTTGGTTTGCTCCAGTT GGATCTGCAAGTGATTATCCTCTTTTGTCAAAATGGGTTATTTATGGCGAGATAGCTTGCAATGGTTCATGTCCTGATTC ATCTGATGAAATTTCTCCCATCTACTCACTCTGGGCTACGTTTATTGGGCTTTACATGGCAAATTATGTGGTTGAAAGGT CCACTGGGTGGGCTCTCACTCACCCATTATCTGTTAAAGAATATGAGAAGGTGAAGAAGAAGCAGATGAAGCCTAATTTT TTGGACATGGTTCCTTGGTACTCTGGAACATCTGCCGATTTATTCAAAACAGTTTTTGATCTCATTGTATCAGTTACTGT CTTTGTTGGGCGTTTTGACATGCGTATGATGCAGGCAGCAATGAGTAGGGCTGATGACGGAAAGCAACAAGGTGACCTTC TATATGATCATTTTAGTGAGAAGGATGATTTTTGGTTTGACTTCATGGCTGATACTGGTGATGGTGGGAACTCTTCTTAT GCCGTTGCACGACTTCTTGCTAAGCCTTCCATTCGCACACTAAAAGATGATTCTGAGGTTTCGTTACCACGTGGAGACTT GCTAGTTATTGGGGGTGATCTTGCATATCCTAATCCATCAGCATTCACATACGAAAGGCGTCTTTTTGTTCCCTTTGAGT ATGCTCTCCAGCCTCCTCCATGGTATAAAGCAGAGCAGATAGCTGTGAATAAACCCGAGGTACCTTTTGGAGCTCAACTG AAACAGTATGATGGACCTCAGTGTTTTGTTATTCCTGGGAACCATGACTGGTTTGATGGACTTCAGACTTTTATGAGGTA CATATGTCATAGAAGTTGGTTAGGTGGATGGCTCATGCCCCAGAAAAAGAGTTATTTTGCTTTGCAACTTCCTAAACGGT GGTGGATTTTTGGGTTTGATCTAGCTCTTCACGGTGATATCGATGTGTACCAATTCAAATTCTTTACAGAGCTGATAAAG GAAAAGGTTCAAGAGGATGACTCTGTGATCATTGTTACTCATGAACCTAACTGGCTTACTGACTGGTATTGGAACGATGT TACTGGAAAGAATGTTTCACACCTGATTTGTGATTATTTAAAAGGAAGATGTAAGCTTCGAATGGCTGGGGACTTGCATC ATTACATGCGTCATTCCCATGTAAAGTCAGATGGGCCTGTCCATGTTCACCACCTTCTTGTAAATGGTTGTGGTGGAGCA TTTCTACATCCCACCCATGTTTTCAGTAAATTTAGTAAACTTCATGGAGTTTCCTATGAATGCAAAGCTGCATATCCTTC CTTTGAAGATTCAAGCAGGATTGCATTAGGGAATATCCTAAAATTTCGAAAGAAGAACTGGCAATTTGATTTTATTGGTG GCATTATATATTTTGTACTAGTCTTTTCAATGTTTCCACAATGTGAGCTGAATCACATCCTCCAAGATGATACATTTTCT GGTCAACTAAGAAGTTTCCTTGGTACTGCGTGGAATGGATTTATATATATCCTGAATCACTCTTATGTGTCATTCGCGGG AGCTATGCTGTTATTAATTGCAGCATATTCTTTTGTTCCACCCAAATTGTCACGGAAGAAACGAGCAATGGTTGGAGTCC TTCATGTTTCTGCGCACCTCACTGCAGCACTGATCCTTATGTTACTTCTTGAAATTGGCATTGAAACATGCATCCGGCAT AACTTGCTGGCAACTTCAGGTTATCACACTTTATATCAGTGGTATCAACAAGTGGAAAGTGAACACTTTCCAGATCCAAC TGGCCTCCGAGCTCGAATTGAGCAATGGACATTTGGTCTTTATCCAGCATGTATCAAGTATTTAATGTCTGCTTTTGATG TGCCAGAGGTCATGGCTGTCTCACGAAACAATATTTGCAAGAATGGATTGGAGTCTATTTCCCGAGGGGGTGCTGTAATA TATTATTTTTCCATCTTCCTTTATTTTTGGGTTTTCTCGACCCCTGTTGTTTCCTTAGTATTTGGAAGCTACCTATATAT TTGCATCAACTGGCTTCACTTGCACTTCGATGAAGCCTTCTCATCTCTCCGAATAGCTAATTACAAGTCATTCACGCGAT TCCACATCAATTCTGATGGTGATCTTGAAGTTTATACACTGGCTGTTGATAAGGTTCCTAAGGAGTGGAAGCTCGATCCT GATTGGGATGGGGAGCCAAAACAACCAGAACATTTGAGCTATATGAGAAGCTTTCCTAGCAAATGGAGGGCAGCCACTGC CCACCAGGATCCAGTGCATACTGTCAAAATTGTTGACCATTTCGTTATTGAACGAACTGAAAAGAATGACAATGTTACTG CTACAGCAGCTAACGAGCCAGTTCAATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0025300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGSDKQSAGFLDTIKMERVRTIFTHTYPYPHEHSRHAIIAVAVGCLFFISSDNIHTLVEKLDNNIKWWSMYACLFGFFYF FSTPFIGKTIKPSYSNFSRWYIGWILVAAVYHLPSFQSMGVDMRMNLSLFLTIYVSSIVFLTVFHIIFYGLWYIGLVSRV AGKRPEILTILQNCTVLSVACCVFYSHCGNRAMLRERRPDQKNSNWFSFWKKEERNTWLAKFLQVYELKDQVCSSWFAPV GSASDYPLLSKWVIYGEIACNGSCPDSSDEISPIYSLWATFIGLYMANYVVERSTGWALTHPLSVKEYEKVKKKQMKPNF LDMVPWYSGTSADLFKTVFDLIVSVTVFVGRFDMRMMQAAMSRADDGKQQGDLLYDHFSEKDDFWFDFMADTGDGGNSSY AVARLLAKPSIRTLKDDSEVSLPRGDLLVIGGDLAYPNPSAFTYERRLFVPFEYALQPPPWYKAEQIAVNKPEVPFGAQL KQYDGPQCFVIPGNHDWFDGLQTFMRYICHRSWLGGWLMPQKKSYFALQLPKRWWIFGFDLALHGDIDVYQFKFFTELIK EKVQEDDSVIIVTHEPNWLTDWYWNDVTGKNVSHLICDYLKGRCKLRMAGDLHHYMRHSHVKSDGPVHVHHLLVNGCGGA FLHPTHVFSKFSKLHGVSYECKAAYPSFEDSSRIALGNILKFRKKNWQFDFIGGIIYFVLVFSMFPQCELNHILQDDTFS GQLRSFLGTAWNGFIYILNHSYVSFAGAMLLLIAAYSFVPPKLSRKKRAMVGVLHVSAHLTAALILMLLLEIGIETCIRH NLLATSGYHTLYQWYQQVESEHFPDPTGLRARIEQWTFGLYPACIKYLMSAFDVPEVMAVSRNNICKNGLESISRGGAVI YYFSIFLYFWVFSTPVVSLVFGSYLYICINWLHLHFDEAFSSLRIANYKSFTRFHINSDGDLEVYTLAVDKVPKEWKLDP DWDGEPKQPEHLSYMRSFPSKWRAATAHQDPVHTVKIVDHFVIERTEKNDNVTATAANEPVQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 1012 | 1012 | 0.0 | – | |
Phobius | 1 | 36 | 36 | - | – | |
PANTHER | 1 | 1012 | 1012 | 0.0 | – | |
TMHMM | 36 | 58 | 23 | - | – | |
Phobius | 37 | 55 | 19 | - | – | |
Phobius | 56 | 66 | 11 | - | – | |
TMHMM | 65 | 87 | 23 | - | – | |
Phobius | 67 | 86 | 20 | - | – | |
Phobius | 87 | 97 | 11 | - | – | |
TMHMM | 97 | 116 | 20 | - | – | |
Phobius | 98 | 116 | 19 | - | – | |
Phobius | 117 | 127 | 11 | - | – | |
Phobius | 128 | 155 | 28 | - | – | |
TMHMM | 129 | 151 | 23 | - | – | |
Phobius | 156 | 166 | 11 | - | – | |
TMHMM | 166 | 188 | 23 | - | – | |
Phobius | 167 | 188 | 22 | - | – | |
Phobius | 189 | 273 | 85 | - | – | |
Phobius | 274 | 291 | 18 | - | – | |
Phobius | 292 | 333 | 42 | - | – | |
Phobius | 334 | 352 | 19 | - | – | |
Phobius | 353 | 690 | 338 | - | – | |
SUPERFAMILY | 382 | 648 | 267 | 1.8E-20 | – | |
Pfam | 385 | 590 | 206 | 2.2E-10 | ||
Phobius | 691 | 714 | 24 | - | – | |
TMHMM | 691 | 713 | 23 | - | – | |
Phobius | 715 | 733 | 19 | - | – | |
Phobius | 734 | 759 | 26 | - | – | |
TMHMM | 737 | 759 | 23 | - | – | |
Phobius | 760 | 770 | 11 | - | – | |
Phobius | 771 | 794 | 24 | - | – | |
TMHMM | 772 | 794 | 23 | - | – | |
Phobius | 795 | 878 | 84 | - | – | |
TMHMM | 879 | 901 | 23 | - | – | |
Phobius | 879 | 907 | 29 | - | – | |
Phobius | 908 | 1022 | 115 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0025300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…