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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0027700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0027700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Methyltransferase; TAIR: AT1G45231.2 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P85107|TGS1_RAT Trimethylguanosine synthase; TrEMBL-Plants: tr|V7CRN8|V7CRN8_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0027700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:4596603..4609655) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AACATATGCCAAACTTTTGAATTCGTAAAATATTGTGTAGCCACCTGTGCGCCTGCGGTTTTGAGAGGTAGCGGGAGAGA GAAGCACCATACTGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGCAATAGCATTACCATGGTCATCGCTGATTCTGACTACGAAGG TCCTGCAATCGAAGCCCTCGGTTCTCTCTTCAAGATCACCCAAGTCTTTCTCTGGTCACTTCTCACTCTCTCTACTCTCT ACTCTTTTCTCTTTTCCCTTTTCCACTCACAAAACTAGGTTTCATTTCACAGGGATGATGGCCTTCAACTTCCATTATCA ACTCAACAATCCGTGAGTTTACCTTACCCCACTTCTATCTTTACTTTACTCATCATCGTTTTTCACATCGCTTTTCGTTT CAGAAATTCACCCAAGAACCTCATGACGATGACGCCGCAGACCCTCTTCCTGGCAAGTGCTTCTCGTTTTCTATCTCAAA ACCCTTTGCTTTAAACCTCGCTTATTTTTCAAGGAATGATTACCTGTTTCATAAAAATGGTGTCTTTTCTTGGAGGGTGG TTTTTATTTTATTTTATATTATTAATCCCTTTTTTTATTTTTATCGATTTCTTGTATTTTATGTAGATTGGAGTGACCTT ATTCTACCCGAGGATTTGGAACTTAACAAGGAGATGAATGAATTGGGGCTCCCTCTTTCCTTTCAGACAACCAAGCAGGT TTGCTTATACACATTAACATATTTTTCCTGCAAGGTTTTAGTACAATTGTACAAGGTTCACATAAGTAAGGTCTCAAGTA AAAGAATTGTAGAATGTCCGCATAAGCAATGTCTTAGGAGTGACAATGTTCAAGCTCTCAGACACACTATTACCTTAGAA AGTGAGTCTGTTTTATTAGCTCAACAAGCTCAATTAGCCATGCTCAAATTCAATACCGATTCTCAACATAAAAAAAAATC CTATACCAGTTGAACTTTTTATGGCCAACTAGTTACGCAATGAGTCAGATTCGAATAAAATTCACCTGTTTATTATAATT TATTTTAAAAAGTTTAGTCATGCCAAAAATTAAACAAAAACGCATATCTAGTTATTAATGCATACAGTCTAGCTTATGAA TGTATTAGTGAACAGAGCCCTGATTAGTTTGCAAGTGACCTCGACTCATTACCAACCTTGGTTCCGATTTAAGTCCACAA TCTAACTATAAAAGTCAATTAAGGTGTGAGTTTTATGGCTGTATAATTGATGGTTTGTCTTTGCAGTAAATTCAGTAATA GGTGTTGTTGGTCCATATTAGTGGCATTCTGTTTTCAATGTGAGAGCACCAACAAGTTATACTTCTTTATCATTCATGTT CTTCTCTTTAGATGTTAGATTATTTCTGTCAAAAGTGCCATCAACTATTAAGTATTAACTATATTTTCAGTCTATCATGT CACAGAAATGTGGAACAGTAAAAGGCAAAAGAAAGGGTGCACGTTCAAAGCAACAACATCCTTCTCATGATCCTGTAGCT GAAACTCTATATGAAGCGAATGTGGAGGAAGTTGCATCTCTTGCTGAATTTCATGATAAAACAAACAGTTCTATATCTTG TATATCAATACTAGGCCAAAGTGAATCATCTTACTGTGATGGTGCAGTGGAAGTTGATATGACCCATTGTGCCTCTGGTG AAGGAGAATTAGAATCGCTTCCCACATGTTCAGAAGGGAGTGGATGTGACAGAATTGATGGGTCAAATTATTGCAGTGAA CATGGAGAGTGGATGGTGCTCTGGGATACTTTCTATAAGAGAAGATACTTTTATAATGTCACAACGGACTCTTCTACATG GGACCCACCTCCAGGGATGGAACATCTAGCAATTGGTGGGTCTACTGAATCAGATGATAATGAAGCTCTAAAATCAGCAG AGGACCATGGAACACAAAATAACAATGAACCACCTGACGAAACCTGGATTGAAGAGAACGCATCAGGAAAGCCACATGAA GGTTATTCAGCTCAGACTGGAGTTGCTGCTGGCAATTTTGTCTTTGAAATGGCTACAAATAATGAAGACCAATCCATTGA TCATTCAGATGAGAATTTCGAGAGTAGTTGCAATGATGGAGTTTCATGTTGCTCAGTTTTAAATGCCCTGGATCATATCA TTAGGTATTTTATGAGCTAAACTTCTAATGCTAGTTCATGCTTCTCTCTAAACTATCATCAAATTGTTTAGAATTATCTG TATAAAATTTTCTTTACTCATTATTTTATTAAACTAATGTAGATTTGTCCTGACAAGGTTTGCAGCTTGCAAATAACAAT ATAACTGTTGGACCTAAAACTTTTTGTCTTCTAAATAGGCCTAATGGGACCAAACTTAAGATACTATGAATCACAAAGTT GACAAAGCCTTTCAATGCCAAAAAAAAATTTAGAGTAAGCAAGTGTCCAGGATTAACTCTCCCATAAGCTTAAGTTGTTA AGTGAAAGCCATGAACTGTTTAGCTTGATCAATGTAAAGTAGCATAGTTCCGCACTCAATGTATTTTTTTTTGGCCATAT TAGGGATGGAAAGAATATAAGTTAATTAATTACTGACCTCTTTGTTAAAGGAATAGAAAAGTACCTCTTAAGCTCAGAGG AAAATTTTGCTGCATAGCTATAAGACCTGCGATATTGTGCGGGATTAGTGTTGGACGGTTAAGAGGTAGAATGTTATGAT GGATGAGTGGCAAATTAAGACAAGATAGGATGAAATACAATCAATAGAGTCTTGTCTTAGGTTGTTTGGGCATATGTGGA GAAGAACCATAGACGCATCAAGAAGGACTAAGGAGGGTTGACCTGATGGAGGAGATAGACGATGGTCAAACTCAAATAGG TAAATATAGAGGGAGACTGAGGAAAATTGTAGGCCAAACAATTAAAAGAAATTTAGATGTAAATGGTCTACCTTTAAACT TATGGATGACCGAGCATTTTGGCAATTGTCATCATATGATTTATGTAGCCAACCCTACCTTAGGGGGAAAAGATTTGGTT ATTAATTGTAGTTGAGTTAAAAGAGCTGTGATTTGATGTGAAGAGCCAAACCTCGCAAAGCTAAAGCTTCTAAGTGGAAG CCAATGAATGGTTTGACTCTAACAAGAATAGTAATATGAAAATGGATGTCTCAACGTACCTTTCTGATATTGTATATTTT ACTTTGTCTTCAAACAACTGATATGCTTGATGCATTGCAGCTCTAATGGAAGATACATTCAAGAAGAACCAGAGGTTGAT CATACACCCATGGAAAACATGGTAATTGATATTTCTGAATTGGATACCGAATCTGATCCTTCTACGTCAAGAAAGGAAAA GAAAACGAAAAAGATAAGAAGACAAAAGCAGAGGAAGTTGTATAATGAAACTGAAGGTTTGTAATAAATACTTTATTATC TGGCTTCTTCAATTTGGTTGGTATTCTTCTAAATCTCTTAGCTAATTGGCTCTAATTTTATGACAATACTTTCTACTTGG AGTCAAATTCATATAACACTTGGTAGATGCTCATATGATTGCTTTGCTGTAGTAATAATCAAATACAGAGTATGGGATAG ATACTTGAATGATGGACACAAGCTAATTTGCTAGTGTCATGTGAGACGTTAATGCCTAAATATGTATTTTGTTCTTTAGT TGCTATGTGTTGTTGAAAGTTGACAGCTATTACCCATGTAATAATCATTTTTGCATTTCTCAGATCTTCACTTTCAAAAC ATACCTGAAGCTTATTCTGCTACGATTGGCAAATATTGGTGTCAGAGGTATATTTTGTTCTCTAGATTTGATGATGGTGT 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ACTTCCGCTGAGAAATTTCTTCTTTGAAAATGGTTGTTGATCTCTGTACTTGACTATCAATTATTTGATATTACAGGTGT GGGCATGTAATTGCAATTGATATTGATCCATTGAAGATTGATTATGCGAGACATAATGCTTCTATTTATGGGGTGGATGA TCAAATTGAATTCATAATTGGTGATTTTTTCCTCTTGGCGCCAAAGTTAAAGGTGCTATTCTATGTTACTTGTTTTACCG CTGCTGCTTCTGTCGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTAAAATTATTATAATTATTATTATTATTATTACTATTATTATTTGT TTTGTACAAGGGAGGCTGTTAGGATTGTCAATTGTTAGGATTGTATAATCCTAATAGCCAACAACAAGACAATGGAAGAG GAATAGGAAGTATTGTTGGTATTTTGATTATATATGTTGAATATCTGTTAAGATTTAGTTTATTATTAGTCTTATCTCAT AGAGATATAGTTAAGATTTGTTTATCTATTTTACATTAGTATCTATTTAAATAGAGATGATATCTATTTAATTAGAGATA GGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTATTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCACGTATTATCAATGAA ATATAGATATATTTTATCAAATTGAAGTTGGTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGT GAGCCCCCTCATGGTGACCTTCCAAATCTCTTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCC TTTTCTTACGGCCTCGTTTCTTTCTGATTATGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAA AACAACCGCGCCTTCTTCTTCGGCGCGTGAAGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTC CGTTGTAGTATAGTTGGTCAGGATATTTGGCTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTC CTTTAATGCAGTTGCGTGATTGGAAGAAATTGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATG ACATAATAATTCTTCACTGCCAGCGAGAGTATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGA TATTGGAAGTTTCTGATGATGCCAGAATGAAGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAGCCAAGTTCTCAATTAGTGAGTT GGGTTACTCTGGTAATATTTCTTCGGTTGAATGGATGTATGCATCTGATGTGCACTGCAACTCTTTCTTAGAGTCCAATA TTGAAGCTGCTATTGTTTGAAAGGGAAAAGTCTTTACCTAATCGTTGGGAGTAGGCGGTGAAGGGAAATTTCAAGTCTCT ACGATTTCTGATTACCGCATTGCATTGTGTGGCAGTAGCTTCTCTTCTCGAGTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCAT ATGATATATATGCTCTAGCTTGAGGGGAAGTGTTGTGTGAATTTCTCTCTCCGACAGCAGTGGCTTCTTGAGTTAATAAT ATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATGTATGCTATAGCTTGAGGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAG ACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGTTGTATCCAAGAATGATGCTTCTATG GTGATTGTTTAATAGCAGCGTGTTTTGGAGTATCCAACAATCGTTCCTTTGCTTTCCTATTTCTCCATAATCCAGTTTGT GCTAATGTTTTTGGGAGAGGCAGAAGCATCAGGTTGAATCTAATTGTATTGCTCCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTAT TTGTGTTTCGGCCAGATTTGAATTTTAAGGTCTTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCCAGTCT TCCTCTTCCAGTTTGGTTCATGGGTCTGGTGTGTTTTTCTCATCTGCGAGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGATCTTAGTT TGTGTCTCATTGTTCGAGATGCTCTTATTATATTGATCTTAGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGAAGGTGACATTGTC ACCTTCGTTTGTTTCGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTAGTTGTTTGGTTTTCTGGTTTAGGGCTTCAGCTGCGAGTTGCGC TGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTTCAGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAATGT TTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTCTTAGAAGCCATCAATCGGTCGACCTCAAGTATGTTTTATT TCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCGTATTGTTGCTGGTTTTTTTTCGCCC TTGTTTGCTGGCTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTAT GAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGAATTTAGCAGAAGTTCAAAAGATTATTCAATTTGAAGTATTAGAAGTTGTCTTT TGCTGCCATGGATTTACTCGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAGATTCACCAAGATCGTCATTATTAAGGGATATCT ATTAAGATAATGTTCTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAA TATCTGTTAAGATTTAGTTTATTATTAGTCTTATCTCATAGAGATATAGTTAAGATTTGTTTATCTATTTTACATTAGTA TCTATTTAAATAGAGATGATATCTATTTAATTAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTATTTGTTAGTC TATATATATTGTAGTTTTCAGTCACGTATTATCAATGAAATATAGATATATTTTATCAAATTCAAGTATATAAACTGAAA AATAAAATAAGAAGAAAGGAGAGATACAAAGAGAGGAATACGAAAAACAATCCTAATGGATCCGCAAGATGGAGAACCTT CTTTCCACGGGTGAAACCCTTCTGAGGGAAAATCCCTTTACAAACTCTATTACTCAATTTATGCTCTAACCTAAGGAGAG TACTCCGATTTATAATAAACTAACCCTACTAAGTAAATGACACTGGCTCAACATAGGCCCAACTCAAATAAGAAAAGCTA GCTTAATACCAAAGCAACTAAAAAAACCAAACCTAGGCCCAAACACCAGGCCCACTGACTCTAAACCCTAAACCCTAGCC ACACCGTCTATAAGACTTTCGATACAAGGAGCCGTCACCATGGCCACACCAACCATCGACTCTGATACCACTTGTTGGGG AGACATGGGGAGCCCATGGGCCACAAGACACCAAGAGAACCCGACCCTACATCTTTACCTAATCCCTTAAGGCATTGGGT TTAGGGGTCACATCTCTTATAAAGCACTCATTCTTAACCAATATGAGACTCCAACTCACGTGAACTCTCAAGAGTACCAA GGTGATACATGTGTTAGGCTATGTCGCCTACTGGACATATTTTATCCTCATCTACTCTCTGCCTGCTTTGGTCTCTGTGC TTACCTGTACATGGGTGATTACCCATGAATGATCCTTTCTCAACCTAGTGAAAAATGTGTGTATAAGAAAATTGTGATCT AATTGTTTTCTGAATGGGCTCCTTGCTGGTTGTGATAGACTAGTGTCTAAAGGAGAGGATCATCTGATATCGTTTTTCCT GGCCTATTTCCCTTTTTTCGTAGTTTATGCCTATGTTATCTCATATAGAATTGGATGATTAAGAAGGGGTGGATTTGATT GAAGATTGTGGATGTTGCAAGAATCCAATCCTTGTATATTTAAATTATGTATTAATAAAAAAGCACAGCTATTCTATTGA TAACGGATGATATTAAATAATTTAATTACTATTATTATTATATGACGACACAAATAGAAGAGTGATAGATTTAGCAACTT TTTTGTTTAGTGATGTTGAGATAAAGAGAAACAAGAGACAAGTACTTTGGAATCTGTATGTTAGTTACACAATGGGGAAT ATTACATGACAATCTATCTCATCATGTTCGATTCTCTTATGAAGCACTGGATTTGAGGCAATATGCATGACGCCTGGATA AAAGACACCATTTGTAAAGTCTGCCCAAACCTACTGTTTGAGCCATATAAGTTCAAAGATGGTTGCAGCCATGGCTCAAT ATTCTGCTTTTGCACTTGATCTTGTAATACAGTTGTTTTTATTGTTTTTATTGCATTCTAGGAAATCAATCAACAATAAA AATGCAGTACTCAGAAGCATGTCTAACCTGCATCTGAATGTCCCACAGCTCTAGTTTGATTTTGTCTTCATACAAGAGAC GTTTTCATGAAGCTCCTTTAATATTTCAAGATGTGATGGACTGCCTCCCAATATCCTTCATAGGAAGAGTTAGGAAATTG ACTTACGAGACTGACTACAAAGGTGCTATCTGGATGAGTGACAATGAGATAATTTAGTTTCCACATCAGTCTTACATATC TCAGAGTCTGGAAATGGCTCTCCCCGACTTGACTTAAGTTTGGCATTGACATCCATAGGATTATCAACAATTTACTTTTT CAGCCTTGTTTCCTCTCAAGTTACTTTGCATACTTCTTTGGAAAATCACAATATCATTCTTTAATTGACATCCCTAAGTA GTATCAAAATCTACCAACATCTTTTGTTTGAAAATGGTGACAAAAATGCTGCTTTACCGGTGTGATGCCATGGTGATTAC TACCTGTACATAATCTAGTAAATGCACTCTGCTGGTTAAACGACAATAGAAAACTTAGTGGTCAGCCTCAATCCATGTCA TACCAAACCATTGAATCACAATTCACAATACTGAATCTACCGAGCCATACCTAGGAGATTGTTTGGGACCTTATAATGAT TTGCAGAGATGACAAACAAGTTTTCATTTAAACTTCTTTTTTAACGTCATCATGGAGGATAATGTTTGTGCATATCAAAC TGGTATTGAGGCCAATGACGAAGAGCAACCATAAGCAAGCATACCTTAGCAAATGCCATTTTAGCCCCAAAAAATTGTCA CCATAATCCTACACAAATACTTGTATATTTCAAACTTCATTATATGCCTAATCCATAGTAGTTAAGCTTTTAGAATGGTT GGATTTGAGTATAGTATCTATGTTGACCAAGTAGTAAAGGTCTCCAAGAGTATATCCTTACCACCCACATTTTTCTGATT AAATTAAAAGAAATCGGCATAAAGTTTAATGGGTTTATATGTGATTTCTAATTGCAAGGGGCATATTCAAGATAATGACC AAATCATTCATGGGCTTCATAAATTACAATAATGGGGCACACTTTTGGGTTTGTTAATGACAATATTTTGTCTTGCAGGC TGATACTGTTTTCTTATCTCCACCTTGGGGGGGACCTGATTATGCTAAGGTTGCGACTTATGATATGAAGACAATGCTTA GACCACATGATGGGTGGGTAGATGCTTGTCTGGTTGCTTTACATTTCCTCTTTGTTTTATCTTCTAGTTAGATAAATAAC TTTTTTTTAGTAGTTCTTGGATACATAACGAATAACTTTAGTCTCTCATTGTAACCAATTGCTGCTTCTGTGTAGATATA CTCTCTTCCATGTTGCAAAGGAGATTGCTCCCAGAGTTGTTATGTTCCTTCCAAAAAATATAAATTTTAATCAACTGGCA GAATTATGTCTATCTGCCTGTCCGCCATGGTCACTAGAGGTAATTTCAACTTTTTGTCTAATTGACATGTTTAACCATAA AAATGGAGGGTCAAACAATATTTCATGTTTTGATAAGAATATTTTATCGTCTTGGTAGTGTGAAGAGCGTTTTTTGTAAA CTATTGGAATGAAGTTGTTTTACATGATCAAATTATGTGTTCTTTGCTGGCTTGAGAGATTTGACAGAGTAAATAGAAGT TGTACTGTCATGAATAATTACTTAGGTGTATGATGTGGTAACTATTTGTCTCCATCTTCCATTAACTAACGTTTATGATG TTCAACTTCCCACAAGTGTCCTGTTAGAGATAGAGGGTGGTTTGGGGGACCTTTAGTTTGGAGGACGCTACTAAGAAAAT AATCGAATATGAAAACAGTGTAGGCTGTACAATGGGAGTATTGGAACTTGAAATTAGGAATCGTGAACAGTATGATATAT GCAGTTTGTTGACCCTTGGGGTGGAAATAGGTTAGGCCAAGCTTGACTTTGTGTAAATAAGTATGATCTACTTAAAATTT TAAAGGCCTAAGTTTGGTTTGTTACCTGTGATAGACATTTTTTTTTTGGGTTTGACCTGCTATTCTTGAAAGCCTGACTT GATCTGATAGCCTATTGGCCTCATTTTTTTTTGAAACTCTAGGGCCTAGTTAAATAATATTAAACAATTTTTTCCATAAG AAGGCCAACAAGATGATAAACTAATAGGTAGAGATAGAAATATGCTCGGTTATGTTGGATTATCTATAGTCTGAAATCTT ATTTAAAATCATACGTCACAGTAAGGTATTAACATAGGTCATAAATCGACTTCTAAAATGACTATCCTTAATTCATTATA TTTTTCAACTTGTTTAAACTTATAAATATGTAAATAAATATATAGCATTAAGATATTATAATAAATTCTAACGTACAATA ATATCAATCATAAAACACACTTATATTAATTATATTTATTTCAATATGCTAGCCTAATAGACTTATAATGTTTTTTGTAT GACCTGAGCTTAACATTTTTAACTAAATAGGCTTTTAAAAAACACTAGTTTTTTTTTTCTTTTCAATTTAGCCTGACCTG CCTGAACTTGCGACCATGACCTCCCTTTACAAGCGGCATGACTTATTCCCACCCCTAGTTGACCCCAATATGATCGTTTT TATCGTCAATGTTATATTATTATTATTATTATTTTGGGTCAAACAATTGTAAAGTTTTATTATCATTTGCTATGTCAATA ATGCAGAAACATTTGTCATGTAGGTTAATTTGAACTTCAGCTTCCTGGCAACTGGTGTTATGCGAGTCATATTGTCGTAA TAACAAAACGGTTTTTTTTGTCATCAACCAAATTGGGGGGGGGGGGGGGGGGTTAAATTATGTGTTTTTATGCCATCATA ACATCATTGTTTTCTTTGGTTGCTTAGTAAATATCTTTCCCTGGTAAATTTTAACCCTTCTATCATATTTTCCAGGTGGA GAAAGTGCATTTAAATGGAAAATTGAAGGCGATCACGGCATATTTCAGTGATACAGCTGTTGGAGGGTGCTGAGTTAAAC CGATTCAGAAACGTAGCTGAGGTGGTTTTGAAGTTATGCTCCTGTTATTTTAAACTTGTTTTCCACAGCATTTCTAACTT ATTATCCAGAATATCACACTACTATCCTATTTTAACTTTGTGACACTAGATGTACAGAGAGAATGGTCTGGGGGATTCTA TGAATTCTGGTTCACATGGAGATTAAAAAGCTGGGTTGGTGGCGACAAAAAATATTTATTTTTTGGTATGTTTGGATGTC TAATGTTGGGTGGAAAAATGAAGAGACTGTCATTAATGTGACCTCCAACAATTGTAAAGTAAATTCAATGTGTATATATT TCTTCTGCCTTTCTACCGAATAGTTGTACTATGACATCAACCGTTAGATTAGAAGTTACTTCCGCATAGATCATATTTAA CACTCTAGATTTTATTTTTTTGTTAATCTAAAGTCTTATATCTGAGTGCTGCTCCCTCATGTTTGCCTGTGCCATCAGTA GCTAACACTAGATCTTTGAATCATCCAAATGTATGGCGATGAACTTTGCGGTGAGTGGATGGTTGAAATCGGCGTAGAAA AAAGAGGAGGAATGAGGAGAGAAAATATCTAAGATCCCGGTGATGGTGGGCAGGCTCTTGCGGGTTGAGGGTGGTTGTCG GGATAACGGTGTTTGGGTTAAAAAAGAAAGAGACTGAAATGCTTTGGTGATACTGTCCTAATCTTTTTCTAATAGTTGTG TGTCTTTGTCCTCTTTTTATAATTTCACTGTTTATAATTCTTTCATATCACATGACAATGTTGAGTGAAGCATTATCTAT CGTTCTCTTCACA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0027700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCATCGCTGATTCTGACTACGAAGGTCCTGCAATCGAAGCCCTCGGTTCTCTCTTCAAGATCACCCAAGTCTTTCT CTGGGATGATGGCCTTCAACTTCCATTATCAACTCAACAATCCAAATTCACCCAAGAACCTCATGACGATGACGCCGCAG ACCCTCTTCCTGATTGGAGTGACCTTATTCTACCCGAGGATTTGGAACTTAACAAGGAGATGAATGAATTGGGGCTCCCT CTTTCCTTTCAGACAACCAAGCAGTCTATCATGTCACAGAAATGTGGAACAGTAAAAGGCAAAAGAAAGGGTGCACGTTC AAAGCAACAACATCCTTCTCATGATCCTGTAGCTGAAACTCTATATGAAGCGAATGTGGAGGAAGTTGCATCTCTTGCTG AATTTCATGATAAAACAAACAGTTCTATATCTTGTATATCAATACTAGGCCAAAGTGAATCATCTTACTGTGATGGTGCA GTGGAAGTTGATATGACCCATTGTGCCTCTGGTGAAGGAGAATTAGAATCGCTTCCCACATGTTCAGAAGGGAGTGGATG TGACAGAATTGATGGGTCAAATTATTGCAGTGAACATGGAGAGTGGATGGTGCTCTGGGATACTTTCTATAAGAGAAGAT ACTTTTATAATGTCACAACGGACTCTTCTACATGGGACCCACCTCCAGGGATGGAACATCTAGCAATTGGTGGGTCTACT GAATCAGATGATAATGAAGCTCTAAAATCAGCAGAGGACCATGGAACACAAAATAACAATGAACCACCTGACGAAACCTG GATTGAAGAGAACGCATCAGGAAAGCCACATGAAGGTTATTCAGCTCAGACTGGAGTTGCTGCTGGCAATTTTGTCTTTG AAATGGCTACAAATAATGAAGACCAATCCATTGATCATTCAGATGAGAATTTCGAGAGTAGTTGCAATGATGGAGTTTCA TGTTGCTCAGTTTTAAATGCCCTGGATCATATCATTAGCTCTAATGGAAGATACATTCAAGAAGAACCAGAGGTTGATCA TACACCCATGGAAAACATGGTAATTGATATTTCTGAATTGGATACCGAATCTGATCCTTCTACGTCAAGAAAGGAAAAGA AAACGAAAAAGATAAGAAGACAAAAGCAGAGGAAGTTGTATAATGAAACTGAAGATCTTCACTTTCAAAACATACCTGAA GCTTATTCTGCTACGATTGGCAAATATTGGTGTCAGAGGTATATTTTGTTCTCTAGATTTGATGATGGTGTAAAAATGGA TGAGGAAGGATGGTTTTCTGTCACTCCTGAGGCAGTTGCTCGGTATCAATCAATACGCTGTGCTAGTAGCACTATAATTG ACTGTTTCGCTGGCGTTGGTGGGAATGCTATCCAATTCACGCAACGGTGTGGGCATGTAATTGCAATTGATATTGATCCA TTGAAGATTGATTATGCGAGACATAATGCTTCTATTTATGGGGTGGATGATCAAATTGAATTCATAATTGGTGATTTTTT CCTCTTGGCGCCAAAGTTAAAGGCTGATACTGTTTTCTTATCTCCACCTTGGGGGGGACCTGATTATGCTAAGGTTGCGA CTTATGATATGAAGACAATGCTTAGACCACATGATGGATATACTCTCTTCCATGTTGCAAAGGAGATTGCTCCCAGAGTT GTTATGTTCCTTCCAAAAAATATAAATTTTAATCAACTGGCAGAATTATGTCTATCTGCCTGTCCGCCATGGTCACTAGA GGTGGAGAAAGTGCATTTAAATGGAAAATTGAAGGCGATCACGGCATATTTCAGTGATACAGCTGTTGGAGGGTGCTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0027700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVIADSDYEGPAIEALGSLFKITQVFLWDDGLQLPLSTQQSKFTQEPHDDDAADPLPDWSDLILPEDLELNKEMNELGLP LSFQTTKQSIMSQKCGTVKGKRKGARSKQQHPSHDPVAETLYEANVEEVASLAEFHDKTNSSISCISILGQSESSYCDGA VEVDMTHCASGEGELESLPTCSEGSGCDRIDGSNYCSEHGEWMVLWDTFYKRRYFYNVTTDSSTWDPPPGMEHLAIGGST ESDDNEALKSAEDHGTQNNNEPPDETWIEENASGKPHEGYSAQTGVAAGNFVFEMATNNEDQSIDHSDENFESSCNDGVS CCSVLNALDHIISSNGRYIQEEPEVDHTPMENMVIDISELDTESDPSTSRKEKKTKKIRRQKQRKLYNETEDLHFQNIPE AYSATIGKYWCQRYILFSRFDDGVKMDEEGWFSVTPEAVARYQSIRCASSTIIDCFAGVGGNAIQFTQRCGHVIAIDIDP LKIDYARHNASIYGVDDQIEFIIGDFFLLAPKLKADTVFLSPPWGGPDYAKVATYDMKTMLRPHDGYTLFHVAKEIAPRV VMFLPKNINFNQLAELCLSACPPWSLEVEKVHLNGKLKAITAYFSDTAVGGC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 70 | 607 | 538 | 9.0E-125 | – | |
| Gene3D | 197 | 236 | 40 | 1.3E-5 | – | |
| SUPERFAMILY | 198 | 229 | 32 | 4.28E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 202 | 230 | 29 | 9.891 | ||
| ProSitePatterns | 202 | 228 | 27 | - | ||
| CDD | 211 | 230 | 20 | 0.00300931 | ||
| MobiDBLite | 227 | 282 | 56 | - | – | |
| MobiDBLite | 252 | 266 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 358 | 382 | 25 | - | – | |
| Gene3D | 400 | 609 | 210 | 1.2E-75 | – | |
| SUPERFAMILY | 412 | 570 | 159 | 2.04E-24 | ||
| Pfam | 451 | 605 | 155 | 4.0E-40 | ||
| CDD | 451 | 532 | 82 | 9.00355E-10 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | RNA methylation | Posttranscriptional addition of a methyl group to either a nucleotide or 2'-O ribose in a polyribonucleotide. Usually uses S-adenosylmethionine as a cofactor. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. | ||
| Biological process | 7-methylguanosine RNA capping | The sequence of enzymatic reactions by which the 5' cap structure, an inverted 7-methylguanosine linked via a 5'-5' triphosphate bridge (m7G(5')ppp(5')X) to the first transcribed residue, is added to a nascent transcript. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0027700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…