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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0132700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0132700.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinesin-like protein; TAIR: AT3G10180.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4J2K4|KN7O_ARATH Kinesin-like protein KIN-7O; TrEMBL-Plants: tr|K7MMZ4|K7MMZ4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0132700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:31063342..31098571) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGAACTATAAAATTAAAAAAGTGGAGATGAATTTTCCCGTCAAAAACTTAAACCAATTGAATCCGCCAAAACCCTCTGTG CTTGGCACTGCCCAATTTTCACTTTCTGATGGAGAGGATTCACGTCACCGTGCGCGCAAGGCCTCTATCTCCGGAGGACG CCAAAACAAGCCTCTGGAGGATCTCCGGCAACTCCATCTACCTTCCCAACCACTCCTCCAAGTTCGAATTCGGTATTCTA CTCTCCTTTCATTTCCATTCTCATTTTTTCCAACTTCGAAATTCAACTCATGCTCCTCCTCCTCCTCCGCAGATCAAATA TTCAGTGACAATTGTGAGACCTCCCAAGTCTATCATGCTCGCACCAAACACATTGTCGAGGCCGCAGTTCGTGGATTCAA CGGTTTGCAATTGCATCCATCCATCCATCCCTATTTGGTTTTTTTTCGTTGTGCTATTAACTTTTTTTGATAGACAAATG TAGTTGTTAGTAATGTTAGTAAATTAGTTCCTTCACCAGGGTTTGAACCCTGACCCAACCCTCATGTCCCCTAGCTCTTA CCACTTGAGCTAACCCTCGGGGGTTCTGGTGCTATTAATTAACTTGGGGATTGTGACCTGAAGGTACTGTTTTCGCTTAC GGACAAACAAATAGTGGCAAGACTCATACCATGCGAGGCTCCAAAGCTGATCCTGGAGTTATTCCTCGCGCTGTGCGTGA TTTGTTTCAAATTATTCAACAGGTAAGTACCAACCACCCCATGCCCACCGCCCTCTGTTGTTAATTTTGCATTTTTCTCT ACTGATAGAAGCTCTTTACTATCATGCGTGAATGGTTTTAATATGCTGTGAACTCTTTGTCAAAAGAGTGCTATTTTACA AGGTCATTGTGAAACTTAAAATGTTTATGTTTAATAGAGAGGCCAAACGTGGACATTGTTAAGTGAGTGGTATTTTACAA 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0132700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGAGGATTCACGTCACCGTGCGCGCAAGGCCTCTATCTCCGGAGGACGCCAAAACAAGCCTCTGGAGGATCTCCGG CAACTCCATCTACCTTCCCAACCACTCCTCCAAGTTCGAATTCGATCAAATATTCAGTGACAATTGTGAGACCTCCCAAG TCTATCATGCTCGCACCAAACACATTGTCGAGGCCGCAGTTCGTGGATTCAACGGTACTGTTTTCGCTTACGGACAAACA AATAGTGGCAAGACTCATACCATGCGAGGCTCCAAAGCTGATCCTGGAGTTATTCCTCGCGCTGTGCGTGATTTGTTTCA AATTATTCAACAGGACGTGGATCGGGAGTTTCTTCTTAGAATGTCATACATGGAGATTTATAATGAAGAGATAAATGACT TATTGGCTCCTGAACATCGAAAACTGCAGATTCATGAAAATCTAGAGCGAGGAATCTATGTTGCGGGGCTGCGAGAAGAA ATTGTTGCCTCTCATGAGCAAGTCCTTGATCTCATGGAGTTTGGAGAATCTCATAGACATATTGGAGAGACAAATATGAA TTTGTACAGTAGTAGGTCTCATACTATTTTCCGCATGATTATTGAGAGTAGGGATAGAAGTGAAGATGATAGCAATGGCA GCACATGTGATGCTGTTCGTGTATCAGTGTTGAATTTAGTGGATCTTGCTGGTTCAGAGCGTGCTGCAAAAACTGGAGCT GAAGGTGTCCGACTGAAAGAGGGTTCGCACATAAACAAAAGCTTAATGACTTTGGGAACTGTGATTAAAAAATTGAGTGA AGGTGCGGAGAGTCAAGGCGGTCATGTTCCTTATCGAGATAGCAAGCTTACACGAATTTTGCAACCTGCATTAGGGGGAA ATGCTAACACAGCTATAATATGCAATATCACACTTGCACAGATACATACAGATGAAACTAAAAGTAGCCTCCAATTTGCA AGCAGAGCTTTACGTGTCACAAACTGTGCTACAGTCAATGAGATTTTGACAGATGCTGCATTACTAAAGCGCCAAAAGAG AGAGATTGAAGAACTTCGTGCCAAATTAATGGGTTCGCATTCAGAGCATTTGGAAGAGGAGATTCTAAACCTTCGAAATA CATTATTACAGACCGAACTGGAAAGGGAGCGCATAGCTTTGGAGTTAGAGGAGGAAAAGAAAACTCAAGCTGAATGGGAA AAGAGAGTAAAGGAGCAAGCCAAGAAAATTGAAAATTTGAGTTCAATGGTTTTGTTATCAAATAGGGATGAGAGTCGTGA ACATATTAAAAAGGAGAAGAGGCGAGGTACATGGTGTCCAGGAAATCTTTTGGGGGAGCATCTAAGAGATGTACACTCTA GCATCCAATCAAATGCTTCTACTGTGAAACTCATGAGACCTAAGCGAGACATGGGACCGCTTCTTCCTTTCCAGGAACTT GTAAATGATGTTTATGTGGATAATTCCTTTAAGCAAGAAGATAATAATACAGGTGATACAAATGAGAACTGCAGTCTACC AAACCCTTGTGCTTTATTACATGTAACGAATAGGAAAAGGGCTCCATCGCAGAAGAGAAGCTTATCTATGGAAGACAACA AATATCTTGAATTGCAGGAAGAATATGAGAATTTACTTATAAAATTCGAAACTCAGATAACCATGAATGAGATACAGACT GAATCATTGAGAAAACAGCTAATTGAGGCAAATTATCTTCATTCTACAGAATCTATCGACGGTTTAAATTGGGCCAGTAA TGTTAACTTGAATGGGGATAAAAATGTGAGTTTTAGAGAGTCTGAGGCTATTCTTGTCATCAAGAGACTGCAAGAACAGA TTAAGGTTTTGGAAAACGAAAAGCTATCGAGCCAAGAAAACCTGGATAACGTTGTTGATCTGGCAACTGAGCAGAACATA TGTGCCAGGGAGAGATTTGACGAGCTCTACAAAGAGCTTATAAATGCACAGGAGGCAGCTCGACTGGCTATTGAACAGCT TACTTCCAGTAATATTATGAGCAACATTAATGATGAACATTTTGACTTTGTAAGCAATGTTTTCATGGGAGTTCAAGAAA TAATGTCCGAAGTACAAAACTCAAAGGAAGCAGTTCAAAGTGTTATGTTGATTGTTGATGATGCTACTAGAAGTTTATCT GCACTCCGTGATATGTTCCTTGATTTCAAAACCTCAGTAGCTCAGGATTCTGCAGAACAAAATTTAATTTGGAGTAATTA TCAGAAGTTAATTTCTTGCTTGAGAGAAAAAGTATCTACGATTGAGAATGAGAAGATTCTTCTGGACAGTCGATTAGCTG ATCTGCAAAAAGATCTTCGGGAAACTGAACTAGATTCTAAGAATTCCCAAAATTCTTTGCAGGAACGTTTAGGACAGCAG GAATTGGAAAATGAAGAGCTGATTTCTTATCTTCAAACTCTTGAAAAAGATATATCAGGTTTAACTTCATCTTCAGTGGC CAAGGAAAGGGAAACTCTAAGAAGAGATCTTGAGAAGGTAAAAAGCAAATTGAAGGAAGCTGAGGCTAAGCTTAAGATTG CTGTCCAAGAGAAAACAAAACTTGAGGGTGAGAAAGCCCATGCTGAACGAGAGATCAAACGGTTGCATGGTCAGAACTCT CTTCTTGAACGTGACATCAGTAAACGTGATTCACTTGCTGGCAGAAGACGTGATTCAATTGTTGAAAGGAGTGGAAAGAT GTTTGATCCCAAAAGACAAAAGGGTGTTTCATTTTCTATGGAACAAACATTACAGGAAGAGCACAAAAAACTGGAAGTTT TTGCATTTGAATCAGAAACTAGAATCACTTCGCTGGAAGAACAAGTTAAAGCTGCATTGAAAGAGAAAGAAGAGATAATA TCTATTAATGAAGGTTTGAATTTAGAACTGGAAGGCTTGACTGAAAAGCTGAATACATCAACCTCGGAGCTATGTTATTT GAAGGAGGAAATATCAGCTCTTAAACAAAGTTTGGAAGAATCTGTTCTGAACCAAGAAAAGTTGGAAAGCTCTATCAAAG TATTGATGGAAGAAAAGGAGGAGTTGGCTTTGCAACTCACAAATTCCCTTTTAGAAACAGAGGAGGAAAGAGCAATTTGG TCTGCCAAGGAGAAAGATGTGCTTCTAGCCATAGAAGAACAGGCAACGTCAAACAACGTGCAAATCACATCATTATCAAC AGAATTATCAGAAGTAAGGAATGAATTGGAATCCTGCAGAGAAGAATGCAGGAACCTTCAGGGAAGATTGACTATTTCAT ATATCAAGGAACAATTCAGTGAAAAGAGTCTAGAATTGGATCGGCCGCCAAATAATCTTGAAATGGCAGATGCTGAGAGC AAACATTCCCAAAAAGAGCTGCATGACTGTCCTGAGAAAGAGAAAGCAAATGAAATTCAGAGGGAAGATCATCTAAATAA AGGAGATAATCTATCAAGTCTAAGGGAATTGAGTACTACGTCAGAATCTTTATATGAGTTTGAGAACCTCAAGAACAAAC TTTCCATTGTCACAAAAGAAAGGGACAGCTTGATGAATCAGATGGAAGATCAACAAAAGCATGTTATGGAAGTGGAATTT CAGCCAAAGGTCCAGGATGAGTTATCAAGGGCAAAGGTCCATGTTGAGGAACTAAGTCGGGAAATTTCTTGCATGGAAGT TAAAATGCACGTGGATAAAGTAACAAACAACAAAGAGACAAGTAAGCTCAGAATGAGACTTCGTGGAACACAAGCGAAGC TAGATGCTTTCCGTTGCAGATATAAGGAAGCAATCGATGAATCAGTTTTACTGAATAAGAAGTATGGAGAAGCTGCAGAG AACCTGAAAGACCAGTTGGCTTCAAAAGCAATAGAGGTTCTCAACCTGAAGAAACAGCTAGCTGTCACCAAAGGCCAATA A
Protein sequence (LotjaGi5g1v0132700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MERIHVTVRARPLSPEDAKTSLWRISGNSIYLPNHSSKFEFDQIFSDNCETSQVYHARTKHIVEAAVRGFNGTVFAYGQT NSGKTHTMRGSKADPGVIPRAVRDLFQIIQQDVDREFLLRMSYMEIYNEEINDLLAPEHRKLQIHENLERGIYVAGLREE IVASHEQVLDLMEFGESHRHIGETNMNLYSSRSHTIFRMIIESRDRSEDDSNGSTCDAVRVSVLNLVDLAGSERAAKTGA EGVRLKEGSHINKSLMTLGTVIKKLSEGAESQGGHVPYRDSKLTRILQPALGGNANTAIICNITLAQIHTDETKSSLQFA SRALRVTNCATVNEILTDAALLKRQKREIEELRAKLMGSHSEHLEEEILNLRNTLLQTELERERIALELEEEKKTQAEWE KRVKEQAKKIENLSSMVLLSNRDESREHIKKEKRRGTWCPGNLLGEHLRDVHSSIQSNASTVKLMRPKRDMGPLLPFQEL VNDVYVDNSFKQEDNNTGDTNENCSLPNPCALLHVTNRKRAPSQKRSLSMEDNKYLELQEEYENLLIKFETQITMNEIQT ESLRKQLIEANYLHSTESIDGLNWASNVNLNGDKNVSFRESEAILVIKRLQEQIKVLENEKLSSQENLDNVVDLATEQNI CARERFDELYKELINAQEAARLAIEQLTSSNIMSNINDEHFDFVSNVFMGVQEIMSEVQNSKEAVQSVMLIVDDATRSLS ALRDMFLDFKTSVAQDSAEQNLIWSNYQKLISCLREKVSTIENEKILLDSRLADLQKDLRETELDSKNSQNSLQERLGQQ ELENEELISYLQTLEKDISGLTSSSVAKERETLRRDLEKVKSKLKEAEAKLKIAVQEKTKLEGEKAHAEREIKRLHGQNS LLERDISKRDSLAGRRRDSIVERSGKMFDPKRQKGVSFSMEQTLQEEHKKLEVFAFESETRITSLEEQVKAALKEKEEII SINEGLNLELEGLTEKLNTSTSELCYLKEEISALKQSLEESVLNQEKLESSIKVLMEEKEELALQLTNSLLETEEERAIW SAKEKDVLLAIEEQATSNNVQITSLSTELSEVRNELESCREECRNLQGRLTISYIKEQFSEKSLELDRPPNNLEMADAES KHSQKELHDCPEKEKANEIQREDHLNKGDNLSSLRELSTTSESLYEFENLKNKLSIVTKERDSLMNQMEDQQKHVMEVEF QPKVQDELSRAKVHVEELSREISCMEVKMHVDKVTNNKETSKLRMRLRGTQAKLDAFRCRYKEAIDESVLLNKKYGEAAE NLKDQLASKAIEVLNLKKQLAVTKGQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 347 | 347 | 1.4E-125 | ||
| SMART | 1 | 334 | 334 | 1.6E-146 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 357 | 355 | 1.54E-112 | ||
| ProSiteProfiles | 3 | 326 | 324 | 118.197 | ||
| CDD | 4 | 326 | 323 | 2.20139E-159 | – | |
| PANTHER | 30 | 891 | 862 | 3.5E-146 | – | |
| PANTHER | 30 | 891 | 862 | 3.5E-146 | ||
| Pfam | 34 | 324 | 291 | 1.4E-106 | ||
| PRINTS | 69 | 90 | 22 | 1.3E-38 | ||
| PRINTS | 184 | 201 | 18 | 1.3E-38 | ||
| ProSitePatterns | 222 | 233 | 12 | - | ||
| PRINTS | 223 | 241 | 19 | 1.3E-38 | ||
| PRINTS | 276 | 297 | 22 | 1.3E-38 | ||
| Coils | 332 | 416 | 85 | - | – | |
| Coils | 528 | 548 | 21 | - | – | |
| Coils | 600 | 627 | 28 | - | – | |
| Coils | 772 | 792 | 21 | - | – | |
| Coils | 797 | 817 | 21 | - | – | |
| Coils | 830 | 885 | 56 | - | – | |
| Coils | 935 | 983 | 49 | - | – | |
| Coils | 1005 | 1036 | 32 | - | – | |
| Coils | 1062 | 1089 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 1119 | 1154 | 36 | - | – | |
| MobiDBLite | 1119 | 1150 | 32 | - | – | |
| Coils | 1167 | 1187 | 21 | - | – | |
| Coils | 1208 | 1228 | 21 | - | – | |
| Coils | 1279 | 1299 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Microtubule motor activity | Catalysis of movement along a microtubule, coupled to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate (usually ATP). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Microtubule-based movement | A microtubule-based process that results in the movement of organelles, other microtubules, or other cellular components. Examples include motor-driven movement along microtubules and movement driven by polymerization or depolymerization of microtubules. | ||
| Molecular function | Microtubule binding | Interacting selectively and non-covalently with microtubules, filaments composed of tubulin monomers. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0132700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…