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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0133300 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0133300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Tubulin folding cofactor B; TAIR: AT3G10220.1 tubulin folding cofactor B; Swiss-Prot: sp|Q67Z52|TBCB_ARATH Tubulin-folding cofactor B; TrEMBL-Plants: tr|I3SPY8|I3SPY8_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0133300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:31304467..31328262) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAGCAACCCGGGAGAGAAGAGAAGCGAATTTGGATCCTCTCGTGCAAACTTTTTCCTCCAGCCCCTCCAACAGTAATATT AACCGTTTGATGGATCCAAGGGTTTAGATAATTCAAGTATTGAAATTATAGTAATTATATTCTGAAAATTATCTCAGCCA TAAAATTAATCAAATGGTTGAAATTAAATAGGGATTAATCAATGAAAATCCCAATGAGTCCGCCTTCGTTCTCCTTCGTT CCTCACCGTTGTCGCCGTAGTTCCGACCTTCCCCACCCTCTACCGGTGGAATTGGTGAACGAGACTAGTTGGTTTTTATT CTTAGCACCATCCACAGGTTAAATCTATGATCTATCAATTATCTTCCTTGCATTTTATCCAATTCTGGTATCTGCAACTT TAATTTGCCCCTTTTTCTGCACTTTTTTGACAGACAGAGAACAATAAACTTAAAGAATTCTTGGGATTGGTAAGTGTAGG CAAATTTTGTTAATTTCATACTAAGGAGAAGGATTTTTTGCGTGTTATTTCTGCACCGCTGGATGCATCTGATGGCTGTC TTTTGATGTCTGAAATTATTTTAGTCATAGCTCGGTCGAAACTCCATCGCACTCACCGCGTTGCTGCTAGTCCTCCCCCA TCCCCACCCTAATCGCGGAGGTACATTCTGGTTTTGAATATCCTGTGCAAGTTTGAACCAAAGCTCTGGTTTTTTTCTGA ATGGAGGGTGCTTGGATCCTCACAGTTCAAGGAAGATAGAGAGCCTTGCTTTACTTTTCTTTTTCATTTAAACTCTATGT TTGCATTGGATTTTGGTAAATCCTCTCATTTGTGTGATAGCATTAGTTCCTGTAGTGTTCATTGATGATAAGATAACACC ATGATATATTATTGTCTCACCAAGATATATTATATTATTGTTCATTCAAAAATTGATCTCATAGAATGAGGCATGCCTTC 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TCATACCAATTGATAGAAACTGGATCGGATTGAATAGAACAAAGAAGAAAAGGACAACGAGATGAATTCTCTTATTGAAA GAAGAAAATGATTGGTTACAATCTCTAACATTTGAGAGGTTAGTCTCTCCACAAAACTGATACAATTTCTAGAATGATCT CCCTAACTACCTCCTAGGAATGTCCACTAACTAATTGTTTCAACGAATTCGGACCCTCTCATGTGACATGACAATGTCAA GTGAAACATTGTGTCCATCCCTCTCTTCATAAATATTCAATGGGTCCCACATATTTAATACATATGAAGAGAGAGATAGA CACAAAAACTTCATATGAGAGAGTTTTCACATTAGAGGATCCTGTCATAATCTAACTGTTACAATGGCCTATTCATTCAG ACCCAAACTAACAAATAAATTTCCGCTAATAGGCCCAGGCCTATTATCTCCTAATTCTTTGTGTCTTCTATTATACACCT TTTTAATAGGAGGTCTAAGGCAGATTCCTATCAAATATATATTTTCATGTTCATACTACAGTAATAACTATCATATATCC ATATCTGATAGTAGAAACTGAAATCAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGAAATGATTGTGTA TATTGCTTGGTTTGTTACATCAGAAGAGGCTTCTTATATAGAAGCATGTAGCTTACAGAGCAAGCTACCAATCCTAACAG AAAGCCTAACTGCTTCTAACTGCATGTGTCCAGATGGCACTGCTTACATCACATCACACTAACTCGATATTTTATATATC ATTTATATCTATTACACTTATAATATCATCTAGCTTTCATGGATTCAATCTTTTTTAATTTATTTTGTTTCTGAACTCCA ACTTCAAAATATTAAGGTAGGATCCAGATGTGAAGTTGAACCTGGGGGAAAAAGGGGCGTAGTAACATTCGTTGGTCGGG CAGAACCACTGGGTCCTGGTTTCTGGGTTGGAGTACAATATGATGAACCCTTGGGCAAACATGATGGCATGTAAGTAAAA TAACTATCTTTACATATATATGTAAATCAGATGAGTCCTTACTTGACTTATCATCTTAAGTTCTTAATTATTCTATGTCA TTCTTTTTTTTTCCATTTAGAAACTTCAGATTATGCCTACAGTTATTTTAGAATTTCCCTTTGTTATTTTACAGGGTCAA AGGAGTACGCTACTTCGAATGCCCTCCATCTCATGGTGGAATAGTCAGGCCGGAGAAAGTGAAGGTTTGTTATAACATGC TGTAGTTGTTCTTTAATGTTGGATACTTGTCATCATTCATGGCATTTTTTTTTCCACTGATAAAAGAAAATTTATTAACA CTACAAAAAATGGGAGGATTATGAATCCTCTTTAACCCAAGAACAAAGTAAAATATAAAGGAGGATATCTGCCAGATCCC AAAAAAATATGTCAAGGAAACTCCATGAAAAACTATGTGCTTTATAGCAGCAAATTCAATCTAATTGCCTATTCCTATCC CAAGTCAAATGCTGTGTGATGCTGCTCTTTTCTTGCAAATTGCACATACAAGCATATTATAAATTGACAAAACATATTAT GATATATATAATATATAGCATATGCATAGCTGATAGTCTCTGTGCTTCCGTTAGTGGAAAGAAAGATTTGAAACTGATAT CTTCGAGAGATAACAACTAGCACTATAACTTTGCTGTTTAAGCATATGTCGAGCATGTTTAGTTCAAAATATGCAATAAC TGGAACATGATATACTACATAAAATGCAATCAATGGGGTTATACTTTAATGAGGTTCTTAGGTTTATGATTAAGACATGT ACAATTTGAAATTTTGAATAATGTTAAATCATCCATTATATATTTTTGCGTGTTGTGGTTTTTGTCCTTTGACCATTGAT CCTTTCGTTTCACGTTTATTTAACTGAGCTAATTTTCTAAACATTGCTATTTGGAATTTTGGATATATCTTTGATGTGCA ATAGCAGGTATTATTTGACATGCTATAACGGGGTAATGAATGGTGTTATCTGACATTTTCGGAAGTAGTTAGTTAAATTT TCAACTTCTATTTTTTGTGAACTAAGATGTCATTTGCTAAACATAACAATTAGTATATTTTCCGATGTACCAAAAAACAT AACAATTAGTATTGATCGTGCATTGCTAAACATTCATAGAGAATCAAACAATTAGCATTGATCGTGCAATGGCGAGACTA GGTCTAGTAGAGGCATAAAATCTTTATTTACACATATATTTTGGTCGTTTACCTTCAATTTTATATTTGATAGCATTTGT CCAAAAATTCTGATTTTTTTTCTACAAACAAATTCTTTCCAGGTTGGTGACTACCCTGAACGAGATCCCTTTGAAGAGGA TGAAATATGAGTCTTAATGAAGAAGCTACTTTTAATGTGCATGGTTTTTTCTCCCTACAGTTTTCCTTTGGTAGAAGTCA AACATTAATTTGGGAAACTCGCCTTTGTTGGTATTTCAAGGTACAATATGTCAAGTTGAAAATGGGCTGCATTGCGGTTT GCGGATTTTTTGCATTTCTCTGTCGAAAGAATCCAAGTTGCAATGGGAAAAACAAAATTTGGAAGTTAATTTTTTTTTCT TGTTAAGATACAAGAATATACATTCTTCCCATACTTGTTTCCGTTATCTACACATTAAATAACTTCATGGAAATTTCTTT GCCACCCAAAATGTTCCAAAATGTTTGTTATTTAGAAACTCAATGCATTTTTTTGCTAATTTCTTCCACACTCATATAAT AGAGTTTCTCTCACTTATCGCTTTTCATATTAACCAGCTACAACTCTATTACTTACAATCTTCTCTATCAAAGCATAATT TAATACTCCAATAATTGCATGATACTAGTAAAATTAAATAAGCGTACTATAAATAATTGTCATCTTACTTTTTATATCAC AACCTTAAACAACAATGGTGAAAAAATAAAATGAAAAATGTAATTAATCAAATTGTTTGATTTAAATTTCAAAAAAACTT AATTGAATAATGCCATAAAAACGTCAAAGGAACTAATTGAATCTTGTGTGTTTAATGAGCCTATTCATTCCAATTAACCT TGACAATACAAGTCACACACATCAATAGATGCATATAGGAGGGTCTCCGGAAGCCTCAGACCTCAGTTTTGTTATAAGTA AAATTTAAATACTTGTACATTGATTCTCAATCTTATAAAGGGACAACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGTTACAAA GTCAAAAGGTCACTCATTTCTAATTGAAATTCCAAGTGCTCCACTGTCAAACATGGCGTATCTGTTCAGTGCATTCCAGA TTCCATTTACAATACGATAAAATATCAAACTGACGACTCTATCTTCTCATCGATACATGTTTTACCTATCTACCTGCACG AAGATACAAAGAAAATAACAAGATTTAAAGCCACTATTAAGTTACCGATTTATATTGCAAAATTTGTGTGTAGTGCAATC TATACATACCGGTGTGCTTCTCCTTATATCAAAAAGCAAAATTGTTTTTGCCCAATTTTTTTTATGGATAAAGAAAAATT AAAAAATATCAACGATGAATATATAATACAAGAAATTCATATACATTTGCTTGCTTCGAAAACCAGAATCTGCCTATTCT GCAACCTTTTTAAATCATCGTAAGGGATAAAAATGATCAACATTTGGTCTGCACAAACATTTGTTTGCTTCAAAAACCAA ATTAGCAAATAATTGAACATAATATTAAACTGCAGCATTTTCTAAAGTTGTCACGTCATGCTTTCTCACGAGTCAATAAC CTATTCTGTCCATTTATTGTTAATTGTTTTCATGTAAGTGATAATTGTATATGGAAATTCTGTTGATTTTCACGTTGCCA GGAGAAGTTAATATGAGAGAAGCTACTCCTAGTAGTGTTGTGAGAAAAGTAATTTTGAAAGGATTAAACGTGAAACCAAA TGTAAAAGCAAACAGAAGACGCATTAGTCCTTAATTGCTTATCCTTGTAGAAAGGTGTACCTCCTTGACCCAATAGCTCT TCTTTTGGAGACAGAGATATCACCCTTTCCATCTTTCACATTGCTTTTCTTAGCTCTGGACCGTTGAGTTCCTATAATTG GAAGCTCTTTAACAATTAATTCTAACAAATAGAACATAACAGATCCGCAAAAGATTTGTCTAATGTTTACACTAACCTCT CATCTTAGTTATTGGTGATTGGACTTCAATATCCACTTGATCTGGCTCAATCAACTCACTCGAAGCACCAGAAGATGCTT CCGGTACATGCTTAGATTGTGATTTACCATTTAAAGACAAAGTATCTGTCTCATCAGCGCATCCATCAATTACTTCACTG TCTGTTTCATCTGCAGAAGACAAAGATTATCAGTAAAATATGTGTTTGCATTTTTCTATCCAGTAAAATTCATTTTACAC TTACATATCCATCTTCTTTGCCAACATGTCAGTGGATTTGGCATTTGCACTACATTCTTAAAGGTTGGCTTTATTCCATA GTTTTAAAGATTTATCATGTAAATCACAGCTCACATACGAAAGGTTCTTTAATATCATGTTTGATGTAACAATAAATGCA ATTTTACAGGCCCCTTTTTCTATGTAAGGGTGCATTTATACATTGTTGAATTCCTTTTAAGGCAATATCAAAAGCCCAAG ACAACAAAAAGAAGGTTAGAATAAAAAGATCAATCAAGTGCTAGAGTGGCTTGGGTTGTATATGCCAGCACCATTGCAAA TACTAGTAGTTTACCAAGACACTAATCTTCCCTTGTTTATTACAATATTTCCCAGTTGGAAACATCATAATATTCATAAT AACAAATCAAATTTGGCAGAATAGTAAATTAGAAGCAGAGGCCTAGAGCAGAAAATGAGAGGACGTACATTCTAAAATGC ACTCATGAGGCATGGTTACTATAATCACTCATAATGTACTAAACTAATACTACAGGGTCATAAGGAAGAGAGCATAAAAC CTGAATATATTAAAGTTTAAAAAGTTAACCTGAAACAGTATTAGATTCCGAGTGATCTTCAGAATTTGTAGCCACATTAA AACCTCCCCTGCTGTCAATCTTCTGTTGATGGATTTGGGCATTTCGAGCAGTAACTTCCTGCTCCTTTTTTTCCATGTGG AACTTATTCAACTTATCCTCAAACTCCTCGATGCAAGACTTCATTTCAAGTTTTGCAAACTTCTTTCCCTGATTTAAGTT TAAATTGGACAAGAAAAAGCCTTAGCCATTTTCACATAAAGTAAGCAAGAGTAGTAAAAACATATTTTACCTTGTTTACT ATGTTCCTGAAGTGATCCATAACAGAATCCTCTGACAACACATGTTCATATGTCTTAAATAACTCTATGAGCTTTTTCAT TCCTTTTTCAGTAAAAGATAGCTGGGAGAGACAATAAGATATATGTTGCCATTGTCGGACATCTGCAGAGAATTAAAGTC ACAACCGATTACTACAAGCAGTAAACTAAAACAATT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0133300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGTCGAGCTTGCAGAAGATTGATGGGGATGAGACTGTCCTCTTGCGTGTCACTCATTCAAATCTCAAAACTTTCAA CCCTGACATCCGCTTCTCGCTTCAGCTGACAGTGGAAGCCGTGAAAGAAAAGCTGTGGAAAAAATGTGGCACTTCCGTGA ACTCGATGCACCTCGAGCTTTACGACGACACTCACGTCAAAATCACTGATCTCACTGATAACTCCAAACCCCTTGGATTC TATTCGCCTCTGGATGGGTTTCGTTTGCATGTTGTGGATCTTGATCCATCTTCTGTTACTTCCGGTGGATGGCTGGAAGA TACTTCATTGGTGGAAAAATACCAAATTTCTGAAGAAGCCTTCAATAAACGAGAAGGGACTTTCAGAAAATATAAGGAGA AATTGACTTCCCAAATTCCATCAAATGTTGAAGCAAAGATACCAGACAACTACATGGAAGACCTCTGTGTTGATATCAAG GTAGGATCCAGATGTGAAGTTGAACCTGGGGGAAAAAGGGGCGTAGTAACATTCGTTGGTCGGGCAGAACCACTGGGTCC TGGTTTCTGGGTTGGAGTACAATATGATGAACCCTTGGGCAAACATGATGGCATGGTCAAAGGAGTACGCTACTTCGAAT GCCCTCCATCTCATGGTGGAATAGTCAGGCCGGAGAAAGTGAAGGTTGGTGACTACCCTGAACGAGATCCCTTTGAAGAG GATGAAATATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0133300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSLQKIDGDETVLLRVTHSNLKTFNPDIRFSLQLTVEAVKEKLWKKCGTSVNSMHLELYDDTHVKITDLTDNSKPLGF YSPLDGFRLHVVDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEAFNKREGTFRKYKEKLTSQIPSNVEAKIPDNYMEDLCVDIK VGSRCEVEPGGKRGVVTFVGRAEPLGPGFWVGVQYDEPLGKHDGMVKGVRYFECPPSHGGIVRPEKVKVGDYPERDPFEE DEI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 8 | 101 | 94 | 2.89E-20 | ||
| Gene3D | 12 | 97 | 86 | 4.9E-28 | – | |
| CDD | 14 | 93 | 80 | 1.13862E-31 | – | |
| Pfam | 14 | 98 | 85 | 1.5E-27 | ||
| PANTHER | 61 | 234 | 174 | 1.9E-59 | – | |
| PANTHER | 61 | 234 | 174 | 1.9E-59 | – | |
| SUPERFAMILY | 103 | 231 | 129 | 2.49E-34 | ||
| Gene3D | 149 | 239 | 91 | 1.9E-29 | ||
| Pfam | 161 | 227 | 67 | 1.1E-21 | ||
| SMART | 161 | 228 | 68 | 2.1E-28 | ||
| ProSiteProfiles | 181 | 223 | 43 | 17.605 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0133300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…