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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0138100 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0138100.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ARM repeat superfamily protein; TAIR: AT4G23540.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q5ZKD5|RRP12_CHICK RRP12-like protein; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SU51|A0A0S3SU51_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0138100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:33151750..33180111) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCCACCCCAATTTGTTATCTTTCTTACATCTTTCTCTATACCTATCTCCCTTCTTTGACCAAAAGTCAAAACCACTATT AAACCCTTGAAACGTTAAAACCCTTTCACCTCTCCGCCCTTGTTTCCTTCCTCCCACACCCACCGGTCGGCATCAGAAAT CTCCGAACCATGGAAGAAGAACAGTCGGAGCAATTCAAGGACGGTTCGGACCTCTGCAAGCAGCTCATGGACCGTTACGC CAACTCCGCCGCGCCACATCACCGCCACCTCCTCGCCACCGCCGCCGCCCTCCGCTCCAACCTCACCTCCGAGTCCCTAC CCCTCACTCCGACCTCCTATTTCGCCGCCTCCATCTCCGCTGCCGCGGCATCTGAGGCGCTGGACACCGTGGCCCTCTCC GCCCTCGCTTCCTTCATGGCCATCACCCTTCCTCTCGTGCCCTCTGGCGCTATCCCCGCCGTGAAGGCGCGCAAGGCGGC AGAGGTCCTCGTGGCGGTGCTGGCGAGGGATGGGGAGGGGTTTGGCGTGTCGGGCGCTAGGGCCGCAATTAAGTCCTTGG GGGTTTTGATTGGGTTTTGTGACTTGGAAGATTGGGATTCCATCAAATTAGGTTTTGAAACTTTGCTTATTTTCTCCATT GACAAGCGCCCGAAGGTTACTTTCAAACACAATCTCTGTTTTTTTGTGTTTAATTTATATCCAATATGCATAGGTTTGAT GTTAGATTAACAAAGTAATACAACGAACATTGGTGATTCGACATTAGTCTTTGCGCATGTGCCATTCCCAATTTCAGCAT GGTTTTTCATCACTCAGGTTGTAGATGTTGTGGTTGGTTTGCAGAAAGCACAGATGACTCGAATATGGCTATAGCATGAC ACACAATTAGTACAAAATTAATATAAAAACACAAATTTTAAACCAAAAGAGAGAATTTGAGACTTTAAATAATTGCTTGA 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CCCCCACGCTCCCAATCTTCTCCTCTGATTCTACGTTTCTTATTAAGCTTTAATGCTTGGCTTGTGGGGCCACTTGGAGT TTGAAATTGAAAAACTCCAGGAGCCACAACCTTAACCACCTTGTGTTGCTCCCTAGTTTTCCGCTCCCCATCATTAGCCT TTACTTGCTCATCATTGCTACCTTGTTGTCCATTAAGATGCCCCTTGGAATCCTTGACCACGGCCTCTTTACTCTTATCG TTCCCATTAACGTGCTTGCCTTGATTTCCGCCTTTATTCCCTTGTCGACCTTTAACGGCCGTGTCCCCATCATTACTCCT AGGATGAGCGTTATTATTTTTGAATTTTCCCTGAGCTGTCTCAGCCGCCATCTTAGGACCTTGGCTCGCTGACTTCTTCT GATTCCTCTTCTTTTTGGTAACCGTCATCCATTTCCCCAAGGGCTCCACCTCAGCCTCATCATTGGCATTTAAACTTTGT CTCTCCATTTGAATTGCCTCTTCAATGCCTTTCTCCTCATTAATGTTTGTTTCCGTAACAACTTCTTCTGGTGCCAGGTT GGCATTGGTTTGAACGTCCATTGGCCCCACCATCCCAGCAACTTCCATCGTATCCTCGTGTGCCACCGGTGTTCCTGTTG CTGCCGGTGCCGGAGAAGGTTTCGGTGCCGGTGGTACTGGGCCACTACACTCCCGACTTCTGTGGCCATAGCAACCACAT TTGGTGCAGATTACGTGGAGGCCCTCATACTCAACTTTATACCAGTAATCTTCAAGACATATCTTACCCACTACCGGTTT ATCAAGGTCAAGCTCTACACAGATTCTAGCAAATCTGCCTCTTTCCGCCTTGAGAGTGTTCCTATCCAATTTGATTGGTT TGCCAATTGCCCTAGCTGCTGACAGAAGATAACTCTCATTATAGAACACCACATTTAGCCCAGGAATCCGAATCCACGCT AGTGTTTTCTTGACTCGCGCCGCCGGGGAGATGAACTCTGGGCTCCATGTTGCAACCGCCAAATAATGATCGAAGACCAT CCATGGCCCTCCTCCCATAACCTTGCTTCTATCTTCGTCCCTGTCAAACCGAACCATGTAGAAGCCATTATCTACATCCA TGAGATCAAATTCACCTGCCAGCCTCCATAGGTTCGTCAGTTTCACCTTCATGGTTTTATACCCAAGCTTCCTCCCTAGC AGGGAGATAACCAGAGCATTTTTCCAAGGGGAACACATGTTCTCAATCACATCACGTTCCACTACTATTTTGGGAAGCAG TGGGTTATCATTGACATAGATTACCTTCATTGTACCATTGTCAATCAGGTCCTCAAACTGCTGAGGGGGTGGAGCCGAGG TGCCTCCCATGAGCTTATCTTTGAAAGTCGTACGCTGCGCTTGAGTGCCATCATCCGGCGGCTGCGAGCTGCCTCCTCCC GTGGGAGAGAAAGCCGATGACTCGCACTCCATTTCTAGGGTCCACCCTTGCCAAATATTACTCTGTTTAAGAAAAAACTA ATTCAAAATAGATTAAGCTCAAATGATTAGGCTTATTCTTTTGAAGATAAAAATGACTGAAGTTAGCCAGCCATTAAACA ATCTGTAAAGCACATTTATCTTCAGTACCTTGAAAAAAATTGTCCCAAGTGAATTTAGACAATGATTTACCTGCTATTCA TTTGGTTCTAAATTTTTTCCCGACTGTAATACTGTGCATTAACTATTATCATTGACTTATATCTTCACATGGCTATGTAT TTAAAACTAGAAAAACTAGTTGAAGTTATACGTTGATATTTTAGATTATAAAATGAGCCGTCAATTGAGTCGAGACAAGG AGATCAAATCCCTAATCAATATGAAAGCTAAGAGAATCATTATTATTAATCTATAATTAATAGTTAATGAATTGGTACCT TATGGAAAATTTTATCTTTTTAGGATTTTTTTATTACTTTCAACTCAGGCTCATTTGAAATTTGTAATAATTGTAGATGG TACAGTGTTGACTGATTACATTTTTGATGAAATTTCTATAATGTTGCATATTGTCTTTGCAGAATCGACATGGCAAATCA CGTGCGGCAGTCACTAATGATACAGAAATTAAGCCTGAAGATTCATCTGCCAAGGGGTATGATTTAATTTCATAAAAATA TGTAGGCTGATTTTTTGTTTCTTGGAAGCTGAATTAGAACCCTCTCTAACTCTTTCCTTGTATCTTCTTTGCAGACCAGA GGGGAAACCCAACAAGTCAGGTACCCAAGATTTGGTTAAGCATACAAAGAGAAAGAGGGAGAATAAATTTAAGACAGACT TCCCAAGCAAAATTGAATCACAGAAGTCCTCTAGCAATGACGAGTTCAAATTAGCCAAGAGAAGTAAACATTCTAATGAT AAAAATTACAAAGCAAGAAAGTCAGAAGGAATTGAAAAGAACAACAGAGGTCGGCCCAAAAGTTTTTCTGGTGGTGGTGG GAAGGGAAAGGTAAATCTGACAAGTTTGGAGAAGGACAAAGCAGCTTCTCGTGTAGGTATACGAGCTTCCAAACCACACA AGTTGGAAAGGAAGTTAAAAGGAAATTCATAGATGGCTGCAATATACTAACGTTGGTGGAACATTTCTTACAAGCGTGGC ATATGTCACTGTTGTTTAGGTATTGAATCAGAATCGGAAGATACGTTATATAGAATTAAGCAGGAGTTCAGTTTTGCCCG CTAAGCGAGAAGCACTTTTACAAGGAACTCAGCTGCCTTTGTAGGATGATGCTTGAATCTACTGACTGAGAAAATGGAAG GCTGCTTACTGCAAGCATATTGTTGGGGGAGGAAGAGGTGCTGACTGGTGAGGATAACTGTTGTTGACACAGGATGACTT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0138100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAAGAACAGTCGGAGCAATTCAAGGACGGTTCGGACCTCTGCAAGCAGCTCATGGACCGTTACGCCAACTCCGC CGCGCCACATCACCGCCACCTCCTCGCCACCGCCGCCGCCCTCCGCTCCAACCTCACCTCCGAGTCCCTACCCCTCACTC CGACCTCCTATTTCGCCGCCTCCATCTCCGCTGCCGCGGCATCTGAGGCGCTGGACACCGTGGCCCTCTCCGCCCTCGCT TCCTTCATGGCCATCACCCTTCCTCTCGTGCCCTCTGGCGCTATCCCCGCCGTGAAGGCGCGCAAGGCGGCAGAGGTCCT CGTGGCGGTGCTGGCGAGGGATGGGGAGGGGTTTGGCGTGTCGGGCGCTAGGGCCGCAATTAAGTCCTTGGGGGTTTTGA TTGGGTTTTGTGACTTGGAAGATTGGGATTCCATCAAATTAGGTTTTGAAACTTTGCTTATTTTCTCCATTGACAAGCGC CCGAAGGTGCGAAGATGTGCTCAAGAGTCACTTCAAAAGATTTTTGGGTCTCTCAAATCCTCCACTGTTATCAAGGAGGC TAGCAAGTTGGTTTTGTCAGAGCTGAAGAGATGCATTGCTTTGGCAATGAAATTAATTGCTTCCAGGACTGATAATGAGT GCAAAGGTGATGAGATTTCAAAACAAGAGCATCTGGAGGTGCTACATATGCTAAATGTTGTTAATCTGACTGCTGCTTAT CTTTCTGCGAAAGTGATTCCCAAAGTTCTTTTGGAAGTGCATAAATTATTGGATTCTCAGTTCTTGGCACTTACAAGACA CACTCTTAAAACTATTGAGGCTATTTTTGAAGCTTCAAAAGTTCAAAATATAGTCCTAGAGACAGAGGACATTGTAGTTT CTCTTGCTTCTTTTGTAACTTTGGGTGAAAGGAACCCCGTGGATAGCATGATTCTTGCAGCAACCTTATTAAGACTTGCA ATGGACCTACTTTATACAAATCAATCAAGCTTTTGGATCAAGAATCTTCCACTTGTTTGTAGATCTATGATCGGTCTTCT AAATTTTGAGGGAAACACTGCTTCACAAGCTTCAAGTATTTTGAAGGATGTGCTCAAACATCATGTTGGTCCCCAAAGCT TATTAATTGGGACGGATCAAACAATCAATGATAGTAGTCAGGAAAGTGTGGAAGGCGATGCAATAAAATCAACATGTGAA GTTTTTGAGAATGCCCTTTCTGCTGATGGTGGAATTCCAAATGAGCATATTTTGTCAGTCATGTCTGTTTTATTTCTTGA GCTTGGACAATTCTCATTTGTATTCGCGAGGGATATTGTGCTTAAACTTGCTGACTCTGTGATTCATAGTTCCGGAGGCA AGATTAGTAATGAGCATCTTCAGAAATGTATTGGATCTGCTGTTTATGCTATGGGACCAGATAGATTTCTCACACTTGTA CCTATCTCTTTTAATGAAGACAGCTATGCTTATTCAAATTTTTGGCTGGTACCGATCTTGAAGCGCTATATTTTTGGAGC ATCACTTGCTTACTATATGGACCATATCATGCCTCTTGCAAAGTCCTTTAAGAAGGCTAGTCGTAAAGTAAAAGATCCAG GGACTAGTCAAGATTTGCTGGCTCGTGCCTATGAACTGTGGGGATTGCTGCCCAGCTTTTGTCATCATGCGACTGATACT TACCAAAATTTCACTCGTCTCTCGGATGTCCTTGTTATTTTTCTTAAAAAGGACCCCTCCATGCATGAAAATGTTTCCAA AGCGTTACAGATTCTTGTGAACGAGAACAAAGCTGCACTTAGCCCTAGAAAGAACGAGTTAGATTTATCTGCAGAACATG ATTCTTCGTTAGAGTTCGGCATGCAACCTGCTTATTCAAAAAAAGCTGCTACCAGAAACTTAAAGTCTTTGACATCTTGC TCAAATCGGTTGCTTTACATTTTATCAGATATATTTATCACTTCACTTCCTCAAATGCGCATTTCTTTGAAGGGTGCAAT CAGGTGCCTGGCCTCTATCACTGATTCTTCTGTAACGAAAGACGTTCTTATGTCTCTGTTCAAGAGGTTGCAGTTTATAG ATCATGAAGAAGAAGCTGAAAAATTGACTAGTAACAGTAGCAAGCTTGATAGTGAACCAAGTGATGTGAAGGAATATGAT CAAAGGTGTCTGATGTTGGAAATAGCATCTTGTCTTGTTGAAGGAGCCAACGATAATCTTATTGAGATAATTTATAATTT AACTATACAATCATTTCAGGCAACTAATGAAAGTGTTCAGCATGAAGCATACAGCACTTTGAGCAAAATTTTGGAGGAGC ACCCATGTTTTTCTTCTCCTCGTTATATGGAGCTAATTGATTTATTACATGGTCTGAAGCCTCCAACTGCTGTTTCAACT CTTAGAAGTCGGTTTGCTTGTTTTCACAAGCTAATGGTACAGACAGTAAAGATTAGTTTAGAAGAGGAGGATAACTCAAA GGCTTTTCTTATTCTCAATGAAATCATTCTCACTTTAAAAGATGGAAATGATGAAGCTAGGAAAGAAGCTCATGATCTAC TCTTAAATATAAGTTCTAGCTTGAGAGACTTATCATTTGCAGGTCCCATTGAACCATATCACAAACTAGTCAGCATGATA ATGGGATATCTTTCTGGCTCATCTCCCCATATAAAAAGCGGAGCAGTTTCTGTGTTGTCTGTATTGGTATATAAAGATGC AAATCTTTGTCTCTCCATTTCTGGTCTTGTCCCTTCTCTTTTATCTTTGCTTCATACCAAAGACTTGGAAATCATAAAAG CTGTCTTGGGATTTGTAAAAGTGATGGTATCTTGCTTACAAGCAAAAGAGTTGCAGAATATTCTTTCAGATGTTGTTACT GAAATCGTCCGGTGGTCATCTGTTTCAAGAAATCATTTTAAATCAAAGGCATGTCCAATTTCTAATATTAAGCTCCTAAT CATAAATATGCATGGGTGTGCTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0138100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEEEQSEQFKDGSDLCKQLMDRYANSAAPHHRHLLATAAALRSNLTSESLPLTPTSYFAASISAAAASEALDTVALSALA SFMAITLPLVPSGAIPAVKARKAAEVLVAVLARDGEGFGVSGARAAIKSLGVLIGFCDLEDWDSIKLGFETLLIFSIDKR PKVRRCAQESLQKIFGSLKSSTVIKEASKLVLSELKRCIALAMKLIASRTDNECKGDEISKQEHLEVLHMLNVVNLTAAY LSAKVIPKVLLEVHKLLDSQFLALTRHTLKTIEAIFEASKVQNIVLETEDIVVSLASFVTLGERNPVDSMILAATLLRLA MDLLYTNQSSFWIKNLPLVCRSMIGLLNFEGNTASQASSILKDVLKHHVGPQSLLIGTDQTINDSSQESVEGDAIKSTCE VFENALSADGGIPNEHILSVMSVLFLELGQFSFVFARDIVLKLADSVIHSSGGKISNEHLQKCIGSAVYAMGPDRFLTLV PISFNEDSYAYSNFWLVPILKRYIFGASLAYYMDHIMPLAKSFKKASRKVKDPGTSQDLLARAYELWGLLPSFCHHATDT YQNFTRLSDVLVIFLKKDPSMHENVSKALQILVNENKAALSPRKNELDLSAEHDSSLEFGMQPAYSKKAATRNLKSLTSC SNRLLYILSDIFITSLPQMRISLKGAIRCLASITDSSVTKDVLMSLFKRLQFIDHEEEAEKLTSNSSKLDSEPSDVKEYD QRCLMLEIASCLVEGANDNLIEIIYNLTIQSFQATNESVQHEAYSTLSKILEEHPCFSSPRYMELIDLLHGLKPPTAVST LRSRFACFHKLMVQTVKISLEEEDNSKAFLILNEIILTLKDGNDEARKEAHDLLLNISSSLRDLSFAGPIEPYHKLVSMI MGYLSGSSPHIKSGAVSVLSVLVYKDANLCLSISGLVPSLLSLLHTKDLEIIKAVLGFVKVMVSCLQAKELQNILSDVVT EIVRWSSVSRNHFKSKACPISNIKLLIINMHGCA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 978 | 977 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 978 | 977 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 395 | 977 | 583 | 2.99E-15 | ||
| Pfam | 398 | 596 | 199 | 3.5E-42 | ||
| Gene3D | 733 | 962 | 230 | 3.1E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0138100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…