Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0145700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0145700.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transducin/WD40 repeat protein; TAIR: AT3G49400.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|A9V790|LIS1_MONBE Lissencephaly-1 homolog; TrEMBL-Plants: tr|G7I991|G7I991_MEDTR Transducin/WD40 repeat protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0145700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:37006561..37018846) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TAGGGACGAATTAGAGGATTAACCCTTTAGTTTAATTGCAAGATCCAGGAATCGAACCCTCATCTTCTCCCCTTCACCGC ATAAACTAGACAGTTGCACAACACAGGATGGCTTGTCCCTGCCCGTTAGAGCCTGCTATGCTTCTGGGTGCCCCCTCTTT TCCAAACTCCATTGCCTGGTCAGACGACAACCTCATCGCTGTTGCTTCTGGTCACCTTGTCACCATCCTAGTACCAATTC TCTCTCTTTTACTTCCACACCATTTAAATACGCTTTCATCTATGTTTTTCACTCTAGCAAGTTCTTTTTTTCCAGAGGCC AGACTTGCCTAATGGACCACGTGGCCTGATTAAAATCTCCCCGCGTGAACCCCTTCTTGTGGGCTTTGTGGAAAGAAAAG GTATTGAATTGAAATCACAGTACTGTTTTACTTCACTAGTTGCATGCACTAACGCCATTAATTTAGTAACTCTATGATAT GATCATGATTTGCATTGCACCACACGGTTTATTAGTGGTGCACTAGTAGCGTACGTACATGAGCTATATCCCCCGTTTGG CGAGCTTATTTGAGCTTATCTTGCCGCATAAACACTTATGCCAGTGTTTGAGAGAGCTTATGTAAATAACTTATTACCTG TCTATAAGTTGTCGTGAGCTGATTTTCCAAGCTGTTCAGATTAGGTTATGAATAAGAGCTTATGTTTATCTATAACCTAT TTTCTACTTATTTTATTAAGTTTCTCAAATTAGCTTATCAATAAGTGCGTTGCTAAGCTGTTTACCCAAACATACCCTAT GTTAATAAGTATCTCCAGGATAGTAGTATATGTGCTTCTATGTGGTGTTTAATGTGGTTGTGTGTTTTAGAGAGCAAAAA GTAAGTGATTCATTCACTAAGTAGTGATTCATTTAACAAAGCTACATTAATACTGCATCTAACTAACAACTTACTAACAG AATAGAGAAAACCAAAGAAACTAACTAACTGACTCGTATTATAAATAGATAATAACTGACATCTAACTACTAACTGCTAT AAGAATGCATGCTACTATCCTGTAATGTAATAATTAATAAGTGACATTTATGAGTAAGAAATGATAAAAATTTCATATGT TCTAATGTTAAATGGGAGTTTGAGATTTTCACATGTTGGAGCTGAATTGTGCAAGATTTACACTCTGGATGCCTCCTGCC TACATCTTTGTATCGGGATGATAAGCCTGTTGTCAGATCAATATCATGGTCTCCACTTGGCATGGCTGCAAACTCAGGGT ATGAGTTTATTTTCTTTCTTGATTCATTTCATTTGATAGTTTTGTTTTATCCCCTTAAAAAGCTCTGGGGCTCAATCTGT TCCCAGAAGGTAGCAGAATCAGTTTTTTCTTGTACATATTAAACCTCACACGGTGTTATGGTTGTGGGTTTTGGAGAGGT AATTGATTTCTTTTCCCAAAGTGGCGATTTTAGGGCCTAGGCTTTTGATTCCATAATATTTCAGATAAAATTCACCTGGA GTGTTGTGAAGTCATAGTTTGTTCATTCATGAAAAGTTAATGTTTTTACTTTTTATGCATTTAAATGTTATTTTATATTT TAATTTGCTACAGGTGCTTGATAGCAGTTTGCACCAGCGAAGGACATGTGAAGGTTTATCGTCCGCCTTTCTGTGATTTT TGTGCTGAATGGATCGAGGTATGTCATAGAAGTGGTTATTCCTGCAGAATTGGCTTTGATGCCATCTGTTTCTGCTTGAA AACAAACATGATGTTGAAATTGTAAACTATTGGATCCCGGTGAGGGCTATTGTAATATTGAGTACTATAGTGACTGTAGA ATATACATGAATTTACTGATCCTAGCCTCAGCCAATTCTATTATTATGTTAGCACTAGTTACATCTAGACTCGACAGTCC CAATTGCCTCACATAACATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCACCCCACCCACCCCACCCCCCCCCCCCCGCCTCTATATAT TAGAGCATGTTATCTGTTTCTTCTTTCTCTGAAATTCTCTCAATCTATTATGGTATCAAAATCCATATCCTAATTAGAAC CCTACCTTCACCGAAAAATCATCAATTCTGGTGATCCTCCACCTTCACACTCATCGCCAATCAAGGCGACTCCACTCATG CGGCTTCTTCTTCGTTTTCTCAACTAGTGAATGCATTGACAATCTTCTCACATTCCATATTGGACAAGCTTGATGATTGC TACTGCCTCTTTTGGAAGCAACATGCCGAGCAACTAATGTTAGGGTTCTAAATATTGGGCCTCGTCAAGTTTGATGTCAG TGAGTTTAGACGAAGTAAGTACTCATAAACTCAGTGACTGGGGGGGTCTTCCCTTCACCCTTAGTCTTAGAGTTGTCTTC AGCCATAACTCAGAGAGTAATCACCAATGAAGTAAAATAAACTCAATACCCAGCGCACCATATGAACGCTGGTTACCAAC AAAAAACACATGTTCCCACCTTTAGAGCACACTGAGTCACATCATTGCACCTCGAACCGTCACCAAATCACTACCGATGG CTGTGAAAACCACTGGGCTTTCCTCAGACAGCAAGCATGGCCTGCTCTGTCCCTGAAACGTACGTTATCTGGCTCCGAAA CAGCAACTTCGCGGTTGCTCACATGAACTGCGATTTTGGCATTCTGCCAATTTCTTCAAGATCTGGCCGCCAAAATATTT TTTCTACCCCCCAACAACCGTTGTCCCCCCTTTCCTATCTTGATACCGTGTAAAGGGAAAGAGATATTGTAATGGGATAC ACTGTAAGGTGCAACCTCCCTCATATATTTAATACTAGGTTAAGAGTAGTACAACGTATAGTACAAAGTACGAACTTAAA GTACATATGGACCTGACCCATGGACTCTACATCTAACCATAACTCTTAACATAATCCTTACTGCTAACAATCCTTATCGC TAACACAACTTAACTAACTTCTACATCTATATGTATTAGGCAGTGTAGAAAAATATGTCAAAAAGAATGTCATTTCAAAA GTATTTCCCATTTATGGTTTCGTGCAATATAAAGAAATGAAGAGGTTTCAATATTTTGTACGTGTACATTGTTTCAAGTA TAATATGATATTCGTATTTTGTTTAGGTTTTGGACATATCTGAAATGCTGCATGAATATTTTCAATGTACGGAATTTCGA GGTACAGGGATTCATTCATTGGATCTTTCTGATGTAAGTTATTTAACTCATCCGTGTCATTGATTGTTTGTCCTTTTATA ATTCTCCATGGGGGTGAATTAGTTAGTATGAGACAGGTCATGCTCCATTTGTTCTTTCCTTATTTATCAGCTTCTGGCTC ATCCATTGGATGTCTAGAGAAAAGATATGATAAACTACTAACCTGCAAACTGTCTTAAGGAAGGGATATATGTGAAGTGT GTATGAACTAGTGTTATGTTACTTATATCTAACTAGTCTATTTTACATGTATACCAGATTACCAGTATCTGAACATTGTA TTTTTACTGAAATTTTATTTCTCCCTTATAGCAATTAACTTCCGCGTGTTTTGTTCTTTGTGCAATGGCATTTACTGTGT CCAGAGATTCCTATAAAAGACTTTTGTTACCATCAATTGTGAGCATGAAAATGCTTGCTCTAGTCCCTGCATAGATATGG AAGGATAAAGATAAATGTCACGTGATGTTGTTTTCCTTATGAGTGTGTTGTCATAAACCAACTATTCCAGAAGCTTAAGC TGTTTGGTCAAGACATATGAATGGTTTTATACTGTATTTCTAACTCACACAGTCGCACACACCCACACATATGAAGTTAA CTAAAATCCTATGATGTTTCTTACTTGCATAAAAAACTACTTGATGTAAACTATGTTTAATCCATAGTTGTACATTCACC AATGCAACGTGATTCTCTTGCAAATTTTGGTTAAGCTCTACTTCAACCTGAAATAATTGTGTTTAGTTCGATCTAAATAT CACTATTATTTGTTCTATTGATATATAGGTTCCTAACTTTGGACAGTGTCTGCTGAGAAATAAATCAGATCAAATAGATT CTACATCTAAACCTAATGGAGAAATATCAAATGAAGTGCCCGAGAGCCAAATGCTGCCACTGATAAGTGCTGGTCAATAT GCATCTCGTAGTGCAATGCTATGTTCGCTTGTTATTTCGTGGTCTCCCTTGCTGCGTACAGCATCTGAGGTTTTTCCTGT TGATAATACTTGTGCTTCTGTCAGTCTGCTTGCTGTTGGATTGAAGTTTGGTGCCATTTCTTTGTGGAGATTTCACCAAA GAAGTTGCCATACTATTGAGGATGGAAAAGCCCCAACTACTGTGAAGTTTGTTGGCCTTCTTCAGGCACATGGTTCATGG GTCACATCAATAAGTTGGTCGTTGTTTGGTTTTGATTCTTCAAATCCTCAAATTATATTAGTTTCTGGAAGCACTGATGG GAGGTGAGTTAAATATTCTGATTTCTGATTAAGTTGTGTTACATTTGTATTCTCATTTCAATACATCTTGTTAAGCTACC ATACACAGTTCTGGAGTTATGCACCTTGCTTTCTTATTTGATCTTTATCTGTCTCATTGTATTAATAAGGGGACTGCTCT CAGTGATTGCCAATTTAATTTATCTAATAAAAGTTGACCTTTGGTTTCTCTATCTTATCTAAGATAATTCTTAATATCCA CTTTAGTGTGAGCAACGCTGATAGTTGATACCACTAGACAGCAAAAATGCGGTTTTGAAAATCTATATGCAGAGTTGCAG ACTACAACTGTATTTTGACTTTTTGATATTAGAGTTTTTAAACCTACTCAGTGTTAAGTGCTAACCTTTATCTTCTACAT TTATTACGTGATCATGATGTATGAGTCTCATTGGCTTATTAACCTAAACAAATGTATTTCATTATCTCCATTCATTCATT ATTCATGATATATAAATCTCATCGACTTATTAACTTTATAAGATGTCTTTCATCCATCCATTCATTCATGGCGGTACTGT TGCAGTTCACAAAAAATCAGTATTTTGGATTTGATTTGATGGCATTCATGGCGGAAGACGTAGAGTTTTGAAATAACTAT TTTGTGAAGCTTTGGGCAAAAAAAGCAGTCAATCCGATATGATTTTTTTTTAAAAGTACAAAAACCTGACAAAGATCAGT ATTTTAAGATAAAGAAAAAGAAGAGAATTACCCCAGGCTTTATATAAAAGAATACTTAGGCATCTTCCTTACTGATTAGA TGTACTCAATCAAGAAAATAATCTTTGTATCATGCCTAGTATATTTATAAACTTATTACAGCCTATCCTATAAAAAATGG GATAAGGTAGTTGTATTAGGATTAGAGTTCCTATTTGCATATTTATTAAGAAAAAATAACACTTAGACATCAATACTGCA CCCAGGTAAAACCTAAACAATGTAGTTGGAAGTATGCTAGCCACATATTCTCTAACATTCTCTTCTTCATCACACTTTGA TCGTGGGTGAAATACGTCTAAGAGCCACCAAATAGGGTGTAGTTCCCACTAAATAAGCAGTGAGGCCCACATGATTTCGA GGGATCCGCATGAATTTCACCCAATAATAAATAATGTGTAGAATAGAATGTTTGAGTTTGTTGTGACCATTCCTCATGTA ATTGTTAGATTTAAATACCCCAGATGTGTGTAGTATGAAAAATCATATTTGGTTGTGCACCACCTAGTAAGTATTTTGGA ATATTTGATTCATGACATTGAACCTAACCTAAGCCTATTGTACTTAGTGATCAAAGGTTTGATCCTCATTTTCCTCACAC TCTTCATTGGTTTAACTTTGTATGATATTACTTTTTGCAACTACTATATGAGTGAGCTGAAACATATGTGCCTTGCAGTG TGAAGGTTTGGATGGGTGACAATGACAAACTGCTGGAGTCATCAGGAGTGCATGAAGCTTCATTCTTTTTATTGAAGGAG GTCATTCCTACTTTCTTTCCTGCATCTCTTTTCATTTGTTTCTCTTCTTTGTGAATAATTCCTTTATGCAACTTTCAATT TCTAATTAGGTTATAACTGTCAATGCTGTCCCAGTTTCTGTACTTTCAGTAACTGTGCATGTTCAGTACTCTTCCAAGAT GCTTTTAGCCATAGGAAAAGGTTCTGGTTCCTTTGAAATATGGCTATGCGATATATCTACTAGGGAATTTGATAAGCTTG GGTCATATGATGCACATGATTGCATTGTAAGTTTATTCCCTCCCTTTTTGTGTTAGATGAAGGCTTGAGGCTGCATTCCT CTTTTGGTTTTATATTTTTAATTTCCTTCAGATTACAGGTTTAGCCTGGGCATTTGGTGGAAGATTTTTGTACAGCTGTA GCCAGGTTATTTTCTTTTCCTTTGTTAATTTGGCCGATTTTCTGTCAAGATACCATTAAAATTTCAATTATGTAGCAAAA AATAATTGTGGACATAAATACATTCTATAATCCATACTAAGTTTCTTCATCATTTGTATCTTCTTTTATTTACATACATT CTCTATTTCCACTCCCCAGTTAATTAAACATGATTGTCTTATCATGGATTATGGTTGCGTCCCTGCATGTTTTTGCTGTC ATTTTTGCAGCTTAGAGTGTCATATGAGTTGTCATATTTAATGTTATAGACTTATAGTGAACTGTACTTCTCTTTAAAAT GATTTACAGAATTACTGTTTCATCCTCTGCAAGCTGAAGATTAAAGGAAATTATATATGCATTTAAAGTTTAAACTTCCA AAAAATGATGAATATCATTCTTCTAGAACTTGAAAGTCTGAGCTTCCTTCAAGATTTCAACTTAATGATTTTCATTAAGC AGCAGAAATTTGATATCCAGAATGATAAATTTTCTGTTTATCTTAAGATTTTGAAAACAATATTGGCTTATTAAAATAAA CATCACTTGAAAGAACTGAAATTTTTTCTCAATTGAATTATCTATACTCATCTACATGCAATCTAGAGAGCTACATAGAA TATGAAATAAATCTTTCCTATTACTAGTACAATAACAGAATAGTTTTACATGATCAGAAATAAAATAGGAAATAATGATA TGCACAACATCAAACACGTAATAGTGCTTCCGATGTGTACTTAAATAAATGTATTTATGATTGATGAACGGTTGCTCATA TGTTGGTAGGATAATTTATTGCATAGCTGGATCTTGCACGAGAGTCGCCTAGATGAAGTATCCATTTTATCTGATTTTCC CCGGAGTAATGATTCAATCTGCGTATGTTACTACTTTCCTTTGTGGTTTTTACCTTGTTTTTGGTTTGATCTTTGTTGTT CTTACTAAATCAAATATGCATTTATTTCCTTGCAGCCATCAAGAGATGCATTTAATTCATGTTTTGGTGTAGCTGTATCC CATGGAAATCTTGTCATTGCAACTGTATGATATTTCATTTCCATTTCAATCTTTGCATTTATGTATCGATCTTGATATGT TCCTGATGTTTACTAAACCAAAAGTGAAGTGCATATTAAATGCTCAGATATGGTCAATAGCAATGTGCCAAATGCCTAGG AATTATCAGTGTATCCCTGAAAAAGAAAGGGAAAAAACAGAACAAGGTGGTATAAGAGGTCTAACAATTTTTATTAGTCT CAACTTTCAAAACTGCAAGATTTCTTTTTCCTTTTCTCAAAGAGGCATAATGTTGAATGAATTGATTTCATATTTATTAA ATGACGAGAAGTGGTGCTGAACAAATATATTTCCTGAAAACTTGCAGCTTTGTTTTCCTCTATGATCTCTTCTATTTGTT TATATTTGCACTATTGATTATGAGCACTGTGGGCTATTAGCTATATATACTCATGAAATCTTCGCCTTTCTTTTTCTTTG TCCATGAGTATTTTTGTTTGTTTATTGCAGGTTAATTGCTTCGATGTTGAGAAACTAAATCGAATGTATGAAGGAAGGTA TAAACATATTTTCCAGCGACTAGAATTTTGCACCCCTTGGAAATAAAATGCAGTAAAAATTGCAACTTGGGTTTGTTAGA AATCCTAAGTTAGAACCACACAACACCACAAAACCTTAGGCTTAAGGCAATGGGTGTGTGTGTTCTTTATTATATATGCA CTTGTGCACTTGCTAATCTAGGCAATGTGGGACTTCTTTGAGTCACCACTTTATTATCTCTATTACTCTCCCTCAATTGG GACTCCATTTTTTTGTTTTGCATGTGCCTTGCACTCCAGCGGGAACATCAGTGGTCATCGGACTTGTGCTCCTTCGTCTG AGTCTGCCTTTCGACTTTCTTTGTCTGGGCTAGTACTCTAGCGGGAACATCGGAGTTCCTTGGACTTGTGCTCCTTCGTC TGAGTCTGAGCCCTGAGGTCTTGGCTTGCGCAAATGGGACTGCCATTTTTGCTTTTTTTTTTGGGAAGCGGAAGTCATGG CTTGGATCAGACCAGCTCTGATACCATGTCAGAAATCCTAAGTTAGAACCACACAACACCACAAAACCTTAGGCTTAAGG CAATGGGTGTGTGTGTTCTTTATTATATATGCACTTTTGCACTTGCTAATCTAGGCAATGTGGGACTTCTTTGAGTCACC ACTTTATTATCTCTATTAGGGTTTGAAACAGAAATTTACCGAATTACACAGAATACACAAGTACACAAATCTGGTAGATA AATTTCTCTAGCAGCCTAAGAGCCAAGGTTATCCTTTGAGTAAAAAATTCCCAGTCTTACCGGCGTAAAGCAGAATACAC AAAGAAACTGTCCCGAATTCTCCCCTATAACTACACCACATACTGTTAAGAGGTAATAACTGCCATATCACAACTTCCCT ATTACAAAATTAAATAACTACTACATAACTGCCCTGCTTCGTGGTTCGTGTTTTGATGGTGGGTGCTGGATCCCGTTTTG GTCGGTCGTGTTACTGCTTCTTCTCAGGCCCCCGTTAGAGATGGTTCTCTTCGGTTTTTTTTTCTGTCTTTATGTTCCTG TTCCTTTTTTTTTTGTTTTCGTTTCAGGGTTTGTTTCTCAGCCTTTGGGGGCATTTGGTTTGTTGTTGGGATTTTGCCCT CCGCGGCTGGATTTGATCTTGTCTAGGATCTTTCCGAGTAGTGTAAATGGTAGGGTCATTGGGTAGGTGTTGGCTGGGTG CTTGTGGGGCGTTTAGAGGTTTTTGGGAGGGTTTTGGCTGTGCTGGCCGGGGTTTTTGTCAGCCTTTTGGTTGGCTGAGG TACTGTACGTCATAACTATCCTACTACTAATTCTGGCCTGCTATTTTGTTATTGCTCCTAGAGTACAGAAGCCACATTTT AGGCTTATTTTCAGCATGATCCACAACCTGGCCCACATCTTTGCTTTGGCCTCTAACTCTACTCATGTCTCTCTATAACA TTATGGCATCGTTTAATTCATGTAGTTGACCCCATCATGTGGGAAAATACTTGGCTGAGGTACTGTACGTCATAACTATC CTACTACTAATTCTGGCCTGCTATTTTGTTATTGCTCCTAGAGTACAGAAGCCACATTTTAGGCTTATTTTCAGCATGAT CCACAACCTGGCCCACATCTTTGCTTTGGCCTCTAACTCTACTCATGTCTCTCTATAACATTATGGCATCGTTTAATTCA TGTAGTTGACCCCATCATGTGGGAAAATACTTGGTTATTATTGTTGTTATTTCAGACCCAAGTAGCAAGAGAATGCCCAA GGGTAGATATCTCGTTTATTTACAATGATTATGCTACTATATCTTGAAAATTCAGACAAAAACTACACTCCTTAGCTAAT TTCTCACTTTCCTTTTTATCCCTTGCCTTTTCCAAAGCAGAGATTTTATGAAATAAAAATTTGTAAATGTGGATATTTGA CATTTTCTTCAACTTTTGACAGGATTCTGAGGGCAGCTATTGAATACTTCTGGATTGGTGGGCTACATGTGGATGTTTGG TTGAAACCTCCCTTTTCTTGCTACATTGAAAAATATTCCAGTTTTCCAGAGAAAGAGTTAACTTATTGGGGGGCCAATAT CATATGGTCTTTAAACCAATATCAATGTCTTGATAAGCCTCTGGTTCTTTGGGATATAATTGCAGCATTATTGGGTTTGA AGGATAACAAGTCAAAATATGTAGAGAATTTACTGATTAACTGGCTCTCATTATCATTTCTTGGATATCATATGGACCTT CTTCCTGAAAATGTTTTATCATGTGTGTCTTCAAGCTTGCCAAACGTTCCTTCTCGACTGCTACATTTGCTCAATATAAT ATGTAGGCGCGTGGTGTTAGCAGAGCTCGATGCTGATCAAATAACTGGAATAAATAGCAAGATTCGAAACTTGGAAGGGG CCTGCCCTGACACTGAAAAGAAAATTACTATGTGGATCGAAATTCTTTTGCGCAGTGAAAGAGAGCTCCGAGAAAGGCTT GTGGGTCTTACTTTTTCTGCTTTCCGAAATAGCATGTCCTCTTTCGAAGCAACTCCTTCCCGACCTGGCTGTTGGTATCT TGTTGGACTAGCACAGATGGAACAATGGGTTGCATTAGACCAGGAACATGTACGAGAGCAGTTGAAATTCATTGCATCAG AACTTACTCATGAAAAAAGGTACTGCTTGCTTGTATTTGTATATTTTAGATACTGTTCCTTTTTCCAATTCTGTAATTCT AGCTATTTCATAGCTTTGTTTGAGCACAAACTTCTTTTCCCTGGAATTGAGGCTAGCCAGATTTCAATCTGAGTAATATA CATTAGTATTTTTTTTTCCCAAAAATGGTGAAGAAACATTATCTGATTGTAGTGAAAACTGTAGATGCTGCAATTCTTTT TTCTGTTTGTTGAATTTGATGGAAAGTATACTCAAAATATTAGGGGAAGAGATTTTCCCATAATAATTTTTTAGGAATAA ATGTAAAAAACCCCTTGGTAAAAAATATCAGATAAGAAATAATTAACATTGCTGGTAAAAGTTGTCAACAGAGCGGCTGG AAAATTCAAAATAACTATTTTTATCAAAATAATTATTTTATCATAATTATTATGATTTTGTTACTTTCCTTAATTTAACT GGTAAATTCTTGTTGATAAGAAATTTCCTTACAGCTAGTAGAAATCTGCTTGCATAAATTTACTGAGTAAGAACCATAGA ATAGTTAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAACCATAGAATAGTTACTAAGCTTGTAAAGTAAAGTCTTGCAATGCTGTGG ATTCGGTCCAGAACTTAAAATATGCTAATTGCAATGTGTTTTTCTTTTAAATGGCAGGTTTGTGACTAGTGGATATTCAG AAGTGGAGCCATGCAGTTATTGTTCTGCATCTGTTGTATTTGAATCCCCCGAGTTTGGTTTGTGCCAAGGTGAAAATTGC AGTAGTGGCAATGTTAAACGGCACCAGTTGTTGAGATGTGCTGTTTGCATGGAGGTTTGCCCTAGTACTCCCCTATGGTT TTGTGTTTGTTGCCATAGGTTTGCATTTAGGTTGGCACCAGAACCACTTTTTAGAATGTCTTCATTTTGTCTAGATTTAG ATTCTTCAACTAAATCATCCTCTCAAGTAGTATCCTCAAGACCGTTGTGTCCCTTTTGCGGGATACTGCTACAAAGAAAA CAACCAGACTTTCTACTTTCACCGACACCTGTATAGGAATGTTTAGCTATTTTTCTATTTTTTTATGTAAAATAATATTA TGTAATTGTAATAGGTTGTGTACTTGTGGTGTCAATGGCTTCATCCTAATCCTATATGTATTGTATAAAAGAGAAGGTTA TTTGTATGAAACCACTAGAAACTTATAACATTATTGATTCTGATTGTAGTGTGATATTTTCAATTGACATCTTGTAACGG GTTTTAATGTTTTCTGGTCACATGGGTTGTTCTATTTTTCACTGCTGTATGATAAAAATTATGATGAACCTGTATTTGGT CTGGTTAGCATTTGATGAACTGATTTCTTATGGGATGAATTCAACCTGTTTGATAAAATGACTGGGTCACATTTAAAGTG TTCTTTCTATGTTAGCTGGGTAATATATCAATGTCTTGATATGATTAGATCGGTTTTTTGTATTTGTTTTAACCATGATT CCTTAATTAATCTTTTATCAAATGCTATGTTGATCTCTCTTTCAACCAGCTTGAGTTCCCACTGGTGAGGGACCAAAAGT TCTGATTCCTTTGTAAATTGGAATGGATGGTGAGTTTGATTTTGGC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0145700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTGTCCCTGCCCGTTAGAGCCTGCTATGCTTCTGGGTGCCCCCTCTTTTCCAAACTCCATTGCCTGGTCAGACGA CAACCTCATCGCTGTTGCTTCTGGTCACCTTGTCACCATCCTAAGGCCAGACTTGCCTAATGGACCACGTGGCCTGATTA AAATCTCCCCGCGTGAACCCCTTCTTGTGGGCTTTGTGGAAAGAAAAGATTTACACTCTGGATGCCTCCTGCCTACATCT TTGTATCGGGATGATAAGCCTGTTGTCAGATCAATATCATGGTCTCCACTTGGCATGGCTGCAAACTCAGGGTGCTTGAT AGCAGTTTGCACCAGCGAAGGACATGTGAAGGTTTATCGTCCGCCTTTCTGTGATTTTTGTGCTGAATGGATCGAGGTTT TGGACATATCTGAAATGCTGCATGAATATTTTCAATGTACGGAATTTCGAGGTACAGGGATTCATTCATTGGATCTTTCT GATGTTCCTAACTTTGGACAGTGTCTGCTGAGAAATAAATCAGATCAAATAGATTCTACATCTAAACCTAATGGAGAAAT ATCAAATGAAGTGCCCGAGAGCCAAATGCTGCCACTGATAAGTGCTGGTCAATATGCATCTCGTAGTGCAATGCTATGTT CGCTTGTTATTTCGTGGTCTCCCTTGCTGCGTACAGCATCTGAGGTTTTTCCTGTTGATAATACTTGTGCTTCTGTCAGT CTGCTTGCTGTTGGATTGAAGTTTGGTGCCATTTCTTTGTGGAGATTTCACCAAAGAAGTTGCCATACTATTGAGGATGG AAAAGCCCCAACTACTGTGAAGTTTGTTGGCCTTCTTCAGGCACATGGTTCATGGGTCACATCAATAAGTTGGTCGTTGT TTGGTTTTGATTCTTCAAATCCTCAAATTATATTAGTTTCTGGAAGCACTGATGGGAGTGTGAAGGTTTGGATGGGTGAC AATGACAAACTGCTGGAGTCATCAGGAGTGCATGAAGCTTCATTCTTTTTATTGAAGGAGGTTATAACTGTCAATGCTGT CCCAGTTTCTGTACTTTCAGTAACTGTGCATGTTCAGTACTCTTCCAAGATGCTTTTAGCCATAGGAAAAGGTTCTGGTT CCTTTGAAATATGGCTATGCGATATATCTACTAGGGAATTTGATAAGCTTGGGTCATATGATGCACATGATTGCATTATT ACAGGTTTAGCCTGGGCATTTGGTGGAAGATTTTTGTACAGCTGTAGCCAGGATAATTTATTGCATAGCTGGATCTTGCA CGAGAGTCGCCTAGATGAAGTATCCATTTTATCTGATTTTCCCCGGAGTAATGATTCAATCTGCCCATCAAGAGATGCAT TTAATTCATGTTTTGGTGTAGCTGTATCCCATGGAAATCTTGTCATTGCAACTGTTAATTGCTTCGATGTTGAGAAACTA AATCGAATGTATGAAGGAAGGATTCTGAGGGCAGCTATTGAATACTTCTGGATTGGTGGGCTACATGTGGATGTTTGGTT GAAACCTCCCTTTTCTTGCTACATTGAAAAATATTCCAGTTTTCCAGAGAAAGAGTTAACTTATTGGGGGGCCAATATCA TATGGTCTTTAAACCAATATCAATGTCTTGATAAGCCTCTGGTTCTTTGGGATATAATTGCAGCATTATTGGGTTTGAAG GATAACAAGTCAAAATATGTAGAGAATTTACTGATTAACTGGCTCTCATTATCATTTCTTGGATATCATATGGACCTTCT TCCTGAAAATGTTTTATCATGTGTGTCTTCAAGCTTGCCAAACGTTCCTTCTCGACTGCTACATTTGCTCAATATAATAT GTAGGCGCGTGGTGTTAGCAGAGCTCGATGCTGATCAAATAACTGGAATAAATAGCAAGATTCGAAACTTGGAAGGGGCC TGCCCTGACACTGAAAAGAAAATTACTATGTGGATCGAAATTCTTTTGCGCAGTGAAAGAGAGCTCCGAGAAAGGCTTGT GGGTCTTACTTTTTCTGCTTTCCGAAATAGCATGTCCTCTTTCGAAGCAACTCCTTCCCGACCTGGCTGTTGGTATCTTG TTGGACTAGCACAGATGGAACAATGGGTTGCATTAGACCAGGAACATGTACGAGAGCAGTTGAAATTCATTGCATCAGAA CTTACTCATGAAAAAAGGTTTGTGACTAGTGGATATTCAGAAGTGGAGCCATGCAGTTATTGTTCTGCATCTGTTGTATT TGAATCCCCCGAGTTTGGTTTGTGCCAAGGTGAAAATTGCAGTAGTGGCAATGTTAAACGGCACCAGTTGTTGAGATGTG CTGTTTGCATGGAGGTTTGCCCTAGTACTCCCCTATGGTTTTGTGTTTGTTGCCATAGGTTTGCATTTAGGTTGGCACCA GAACCACTTTTTAGAATGTCTTCATTTTGTCTAGATTTAGATTCTTCAACTAAATCATCCTCTCAAGTAGTATCCTCAAG ACCGTTGTGTCCCTTTTGCGGGATACTGCTACAAAGAAAACAACCAGACTTTCTACTTTCACCGACACCTGTATAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0145700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MACPCPLEPAMLLGAPSFPNSIAWSDDNLIAVASGHLVTILRPDLPNGPRGLIKISPREPLLVGFVERKDLHSGCLLPTS LYRDDKPVVRSISWSPLGMAANSGCLIAVCTSEGHVKVYRPPFCDFCAEWIEVLDISEMLHEYFQCTEFRGTGIHSLDLS DVPNFGQCLLRNKSDQIDSTSKPNGEISNEVPESQMLPLISAGQYASRSAMLCSLVISWSPLLRTASEVFPVDNTCASVS LLAVGLKFGAISLWRFHQRSCHTIEDGKAPTTVKFVGLLQAHGSWVTSISWSLFGFDSSNPQIILVSGSTDGSVKVWMGD NDKLLESSGVHEASFFLLKEVITVNAVPVSVLSVTVHVQYSSKMLLAIGKGSGSFEIWLCDISTREFDKLGSYDAHDCII TGLAWAFGGRFLYSCSQDNLLHSWILHESRLDEVSILSDFPRSNDSICPSRDAFNSCFGVAVSHGNLVIATVNCFDVEKL NRMYEGRILRAAIEYFWIGGLHVDVWLKPPFSCYIEKYSSFPEKELTYWGANIIWSLNQYQCLDKPLVLWDIIAALLGLK DNKSKYVENLLINWLSLSFLGYHMDLLPENVLSCVSSSLPNVPSRLLHLLNIICRRVVLAELDADQITGINSKIRNLEGA CPDTEKKITMWIEILLRSERELRERLVGLTFSAFRNSMSSFEATPSRPGCWYLVGLAQMEQWVALDQEHVREQLKFIASE LTHEKRFVTSGYSEVEPCSYCSASVVFESPEFGLCQGENCSSGNVKRHQLLRCAVCMEVCPSTPLWFCVCCHRFAFRLAP EPLFRMSSFCLDLDSSTKSSSQVVSSRPLCPFCGILLQRKQPDFLLSPTPV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 7 | 840 | 834 | 9.5E-246 | – | |
| SUPERFAMILY | 10 | 424 | 415 | 2.87E-22 | ||
| Pfam | 16 | 160 | 145 | 6.5E-16 | ||
| SMART | 75 | 120 | 46 | 11.0 | ||
| SMART | 272 | 318 | 47 | 5.3E-6 | ||
| Pfam | 278 | 317 | 40 | 9.6E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 279 | 317 | 39 | 9.172 | ||
| ProSiteProfiles | 279 | 327 | 49 | 9.098 | ||
| Gene3D | 337 | 482 | 146 | 5.8E-7 | ||
| SMART | 386 | 425 | 40 | 0.36 | ||
| Pfam | 389 | 424 | 36 | 0.006 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0145700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…