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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0203900 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0203900.7 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase; TAIR: AT2G40730.1 kinase family with ARM repeat domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q55GS2|SCY1_DICDI Probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1; TrEMBL-Plants: tr|I1NIJ6|I1NIJ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0203900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:50436739..50448670) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTCAGCAATATGCATGGCTCATTGGATCACAGTACAAATCAATGGAGCTGGCAAAATCTGACTGGGCTGCAATTAAGAA GTCTCCTCCATGGTCCATTGATTCTTGGGGCATGGGTATGTTATGTTCCGTCTCTTTTAATTACAGTGAATTATAATGGG AATTTGGAATATTAGGTGGAATGTAACAAAATAAAATTAGGCTATTGTTCCATTTTTACTTGCTTGCTGATGGTGACATT TCACATCCTCTTATTGACCAGCTTAGTCAGAATGGTTGTATCACAAGACCACAACTTATGCTGTGGATTTTGTTCTCATT TAGAACTCGCTGCTTCCATAAAGAATAACAAATAAATTTATAGTTTGTTAAATAATTCTATGAAGCTCAAACACTTTTTC CTTTGGATGTCAGAGTATTGGTCAAGTTTTCGATACCAACCCATGTACGACAGTCCTCATCAGATGTCCTATTACAAATT GATTTTGTATGGGCTAGGACACTTAGCCGACATGCCTTAGACACTTAGCTGACATTAAAATAATGCTTGACATTTGAAGG ACCCAAATCTCATCGTTTTTAGATAAAGTATTGATAAAGGTCTCAGGACGCTCCATTTGGGAACACTACTTCTGTTCATT CTTGTACTTGTCAGACAGACACACACACACTCATGTAGCGGGATCATGTGAGAATTTGCGAAGTGAAAGGAGTTAATCCC TATTATACAACCTTACATTACATTGATGGTCAAAATTATCTCTTCTCATGCTCTCAACTAATACGCTTCCCCTAACCCCT AACATGCACACATACACATACATATGTAGACATCCATAGTTGTCTTGGTGTTTTATATTTTAGAGATTGTATGTGTCGGT GCGTCAAAGACATGTGTCTGGTGTCCTTGCTTCATAGGTGACATTACTTTAATTTTCTTGCTCTCAGAGATATAAGGACT 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GATCAACGTCTTATTCAATTGATTATGTTGGTCATTTTTGGTTTTTACAGTTACTTCCTTTATTAGCTTCTGCCCTTGAA TTTGGTTCAGCTGCTGCCCCCGCTTTGACTGCATTGTTGAAAATGGGCTCCTGGCTTTCAGCTGACGAGTTTCGTGTCAA GGTTGATAATAATTTCAGTCCCTTCATTCTCTCTCTGCATCTCTCTCACTCAGATGGATTCATCTCATTCTTATATTGGA TTTCATTTTCATTATTTAATAATATATAGGTGCTTCCAACAATTATTAAACTCTTTGCCTCCAATGACCGAGCTATTCGA GTTAGCCTTCTTCAACATATTGATCAATTTGGAGAGTCATTGTCTGTCCAAGTTGTTGACGAGCAGGTACTTAGCCAGAA TAAGATTGTTTATCTACCTTACTACTTTTTTCTTTCATTTTTGTAACAATATACAAAGATTCAGTGTTGTAACTTGTACG TTGTACATATAATTATTGTTCACATTTCTGGTCAGGTCTACCCTCATGTTGCTACTGGTTTCTCCGATACATCTGCTTTT CTGAGGGAACTTACTCTCAAGTCCATGTTAATTCTGGCTCCGAAGGTATGTCTATTTATATTCATACCATCCAAATTTTC TTTCATTTGGGACTTTGTGCTATTTGAAATGAGATTTTTGGTCCAATGAAAAATGAACGTAAATTATTTTTGACAGTCAT ATTGCTAGTACTGGTGTTTTGGTGTTGGTTTGTATGACCTTGTTATGGTGACATTTATGTTGAAGTGATCTCTATTCTAT GTAAGCTTTTATGGAAGATATGATGCAGAGCTCATTTTTCAGTTATGTGAATTTAAGGTGGAATTAAATGAAACATTATT CGTGATCTAAATGATTTCGGGCAAGTTGTGGTTAGATCTAACATGATATTTTATGCCTTGGTATCTCAATGATCTTAATC TATTGTGTGAGAGAGGGAATGGTGCTTTGATGATTATCAGTGGTTGGTAATTTCTCTTTATAAGCATAGGTCTAGGTTGT GTGAGAGCTTGGGAGTTAGCATTAAGGAGCTGTTATCACTCTTAAAATTACTTGTTTTTTCAAATTTCTGATGAATGTTT CCTAAGATGCTCAGATTTGGTTATTGGGTTTGCATAATGAAGTTTAATCTAAATCAATGAGATCATATAAGATTCGCTTA TGTTACACATTTTTAATACAAAACCAGCAAGTATTCTGTCCAATACACGGGTACTTTAGTGAGATATACACAGTTGAACT AAAAAAATTAAAATAGAAAATAATTATTTTTGTTTTATATTTTTAATATTAATCTAAATAATAGAGAATCAATTTAATAA TAATTGAAGAAATTTAAGCATCAATTAGATAAGGAGATTGATTGTCTGTAAACTTAATATTTGACAGACTTTTATGGTGT AGGCTTATTCATGTAGCTTACCTTAACTAGTGATAAAAGACTTAGATGATGATGATTAAAGAAAATAAGGAAATTAATAA TATAATTAGTATTTATACGGTTGATTAAAAAAAGGGCAGCCCAATTCATTAAAGCTCGTGCTATGCGTGGGGTCTGGGGA AGGGTCCGACCACATGATCTATTGTGCGCAGCCTTACCTTGTTTTTTTTTACACAAGAGGCTGTTTCCAGGACTTGAACC TGTAGCGTCAGTCACATAGCAGCTATTACTTTGATTGAGTCGCTATTTAATAAGGTAGTTCTGATTGATTCTAAAAGTAG TTTTTTAATATTGGATAAAATATCATTAAGATGAAGAGGAAAAATTACAAAGGAAATGGAGGGCAAGGGATCCTCCTAGA CTGTGTTGCATGGATACAACATACAAGTACGGTATCGGGTGTGGATATGATATACAAGATTCAAGACATTTAGAACTTAT 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CGAAGCAATATTATGAAAAGGTATATTCTGGAATTCGTTTTTGGTGCATTTTGTGGTTCTTAAATCTTTTTGTATATCTT TTAATATGAAATTATGAATTAGATCTTGTTGAAAATGCTGAAATGTTTAACTGAATTTCATTGATTGTAAAACTGAAGAG TACAAGAGATGATCTCTCTCTATTTATAGAGTTTACAAAGCTTGCATAAGAAGCTAACTAATTCTGTTATGACAGCTAAG ATAACTAACTTGACAGCTAGACTTAACCGCTAGGGTAACTAACTACATAACAGTAACTAACAGTTACTTAACAGAAACTA TATCTGACTATATAGTATACTCTAATAGATCTAAGTTCAAAATTATTTCTTTTTTAAACCCAGTTTTTTGATTTCATATA AAACCATCCTTATATTTTTAATTGGACACATCTTCTTGAGTGTAACTTAATCTCTAGTCTAATCTCCCTTCAAGGATAAT GTGTCATTTCTAACTTCTCTTCTTTTTATTGAGATCGCACATCGACTAGTCCAAATCAGGCCTAGTCACTTCTTTTGTCA ATCCTCACCTTAAAAGTTAGCTTTTGAAGTAGAGTTAGGCCTAGTCCATATTTTAAGATTATGCCAAAGTAGGGCTTATA TAGCCTTTGGTAATCCTCACCTTACGAGCTACCTTCTAGGGTTGAGTTAGGCCTAGCCAAATTCAAGATAATATCATAAT CTATCCTAGATCAGTTTTGGGACACTCACCGCTGTTTAAAAATTTTCCTAGCCCCGTAGGTTTTTTAGTGCAATAAAAAT TCATCCAATAATCTCCACGCTCTAGATGTCCAATCCTAGGTGTGAGGGGGTGTGTTGAGATCCCACATCAGTTAGAGATA TGGCCAAAGCAGAGCCTGTAGAGCCTATAAAGGCTCTGACAATCCTCATGTTATGAGATAGCTCTTGGGGTTGAGTTAGG GCTAGTGCAAATTCAAAACTTATAAATTTTGAATTCAAATTCTTTATAGTCAATTACTTCGTTATATTTTTTAAACATTT TTTTAATCTACATTTTTTTAGATTTTGTGTAAATTAAGGGTGCACTCTCCACCATAATTTTATACATGTTTCTTCCTCAA TTTTTTTTTTACTTATTTATGTGAATTCTAAAACATACTTGTCCAATCAGAAATGTTTGAATACGTGCTAGTTCCTATAT TCTTTACATGATTTACAGAATACATGGTGGTTCCAGCATCGTTTACATGTCATCTCAAATTATTCATTTTACTAATGATA TCCTTGTAAATGAGGCATCATGTGTGAAGAAAGCACAATTTTTGCTGGCTGAATCTTCAACTCTAAGTTTAAAAGAATTG TTTCTGATGGTGTTAGTTCCCCCTGGTGATTTGTTATACTGATGTTCATGTTCTTGTCTGTCTTTCTGTTACAGACAAAT ACAGCTGAGGCAACTGGGGGGGCAGGCATGGGAATGTCATCAATTCCAGGAAATGCAAGTTTACTTGGGTAAGGCAGTCC AAACTTTGTGTCTCCAGGCCGTTCACATGTTAAGCAATAAAGAGAAAGCAGGAGTGTTCAATATGAGTTTGATTTCATTT AAATATTTATGAAGTTTCCCTTTTCCATTTTTTAAATTAATATTACCTAAAAATACACAGAATAATTGCTAATTCTTGAT TACTTGTCTATATCGGTCATAATAGTATTTAAACACTTGATTTAGTGGCCACATATAAATGCATTTGAATGCGGAGGATT GCTATTGGTTTCGCAGAATAATTGCTAGTTGTAGGTTACCTATTTATGTAACTAACAATAATTGCGAATAACTTGCTTAG TGTCTCGTCTTAAAAATCTTAGGGTGCCTCATTTTTTAGTTGATCTTGAGTTCTCTTTAACTGCACATGTGCTGCTGAGA ATTTTCTCTACATTTAATGCATGGCTTCTGATGTAACTCTCATTCTATGCAGATGGGCTATGAGCTCCTTGACCCTGAAG GGTAAACCTTCTGATCATGCTGCTCCTGTTGCTTCTATGAGTTCTTCTGCTCTTACTCCAACATCTTCGAATGCCAGCTC AGGTATGCCAAATCATCAGTCTCTTACAAATAAATTTATGTTTTAGTGTCTTGAGTGAATGATTGTCTTGAATAATGAAA CCACTAGAGGAGAAAAAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCGTTTT TTAAGAGGGTAGCAAAAAGTTGAGCAGTAGCTCCTATTATGAGATAAAGTCTGCAGTGCGGTGCCTCAACCTTGGGTTCT CATTCTCTTGTCCATTTTTTAGCTTCAGCTCCAGTGCGCCTTCTCCATGATTATAGAGAAAGTCTTTTCTTGTGGATGAA TCAGTTTGTGGTCGTCAAAATCTATGCCTTCTGTGTTCTTTTTTATATGGCTTGTCTTATTGGGACGCCTAAAGATAAAC TGATTATACCTAGGTGAGATTTCGTCTTAATTATTACAACAATAACAACGATCAAGTCTTTTCCCATTAGGTGGGGTCAG CTACAGGGATTGTGTAACGGCATAATACCTTATAATGTATTAAATCTAATGATAGACCATGTACCTCTAATAAATCTCTC TTGATTGTGTCTCATAGTTTTTGCTTGGTCTCTCTCTACCTCTTAACACTGATTATCCCCGAATCCCGATGTCTTCCATT TGGTCAACCACTCAACCCTCTTTTTCGATACTTTTGCAGACCTTCTCAAAACGTGCTGAAACCACCTAAGACAAGACTCT GCCATCTTTTTTACAATAGGAATTAACCCGACTTTTCTGTAATGATCGTTTCATAACATCAAACTAACATTTTCATCTCA GCAACACTGAGCTTGCTTTCTCATGGGCTCTAAAGCACCCAAAGTTCCATCTCATACAACATTGCAAGTCTTATAGTTGT GTGATAAAAGTTTACTTTAAGCTTGGGTGGTACTTTTCTATAGCAGATCGCACATGAAACATTTCTCCATGTCATCTACC TTGCTCAGTTTTTATGGTTGGCATCCCTCTCTATATCCATCATTTAGTGTGATAGACCTAACGTACTAAAAAATGTGAGA TTTGTGATATTCTCCATTTTTTCACCTTCACTATCCGGTCTGGTCTACTTTTTAGTTAGGCAAAAACCATGTGTTTTGAA GACATTTCTCTGTATCTTTAACTTTCCTTTGATGTCTTCTTTTGACACTTTAACTGCATTATCCGCAAACAACATGTAAG GCACGGTCTTTTGGATGTGTCCAGGAAGCACATCTAGAACCATGATAAAAAGATAAGGCTGGACACTAACCCTTGGTGCA CCCTTATAGTTATAGGGAAATTTTCATTATTCCCACTTTGTGTTCTTGATGAATGGATCAAGGTACCTTTCCTTCATTCC TGTATCCTCAGCATCCTCTTAACCTGATATTCTCGTTTAGCAAATTTGTAGGCCATCTTATATCTTTCTCACCTAACCCC TTTCATACCTCGATCATTATATTATGTGGTCCAACTACCTTTAGCCAATTTCTTTCATGCTTCTCTCACCTTAGATTCTC CAATTATTAGGTAGTAGGATTGATTTTGAGAATTTGATCCCCCCTATAGTGCCAAGTTTATTGGACTTGAGAGAAGACTT TAACGTTCATGGAAATAACACTGCCATCTTTCATTGATATCTTGTTCTTTGACCAATATTCCCCCCTCATCATCTTTAAT GTATTTTACCTGATTCAAGTCTCTTGTTTTTCTTTCCTGACTTTTGGCAAGTTTATAAATTCTATCTTCCCTACTTTGGT ATCTATGGATAACTGGATAAGTATAACCCATTAAATCCCCTCTCTCTAGCTTCACTACTGTATTTTTAGTTTCTTTCTTA GCTACCTTATGTTTAGTCTAATTTTTGTTGCCGGTCCTAAGGCCGGATAAAGGAGGAAGGTTGTGTTAGGCCTGCGTAGG CCATGTAAAACTGGCCATATCTTTACTATGGATCATATATCCACATAGTCAACCTCACTTACTGGGACAATGCTTATGTT ATTGTTATTAGACAAAGATCATCATCATGTTTTATAATACTTCCTTTAATAAGTGAAGAAAATTTAGGGGCAGAAGACTG AGAAACCGTGAGTGAAAGGCACAACTGAAGATCTCATCCCTCATATTATTCGCCCTTTTGAGGCAAAGCTATTCATTTAC TCCATCGTCTGATCTGTTGATGCTGCCTTAATTTGTTCGGCTTCATTTGGATGGTTTCCTTCTACGTGGAAAACTTTACA ATTTAACTGTGTTTATTTCATCTCTTTTTCTAGGTATTCTAGCTGTAGAAACTCCTTCAACAGCACCCGTCCGTGTAAGC TCCGCAACTGATTTCGCTGAGCAACCTGTCCCTACGTCTCCTACGTCAACAGATGGCTGGGGGGAACTAGAGAATGGACT CGATGGGCCTGAGAATGACAAGGATGGGTGGGATGATCTGGAACCACTTGAAGAAACAAAGCCAGCTCCAGCTCTTGCGA ACATTCAAGCAGCTCAAAGGCGGCCTGTATCTCAACCTGTTTCGCAGTCAAAACAAGGTACTAGGTATTCAACTATTTGT ATTCTGCTAGGGATTTACTCATTTCCATGACTGCAAGTTACTAACTTGTGTTAATAATTTTCAATATATAAGATTTGTAG TTATTTATCTATTGTATTGAGTAAACAAATTCTTATATGCTTATCCCCATGACCAATGACAATTTCCTGAGGAAGTGATT GGTGTGAGTGTAGTTCAGGTTTGCACTCAATGATTGTAGTGTAGTAGTGTTTCGTGAATCAGTGATTAAAGCAGCTGCTT TGGTCACCTTTTACTAAGAAATGAGCTTTGAACTTTTACTAAGGTTTCGGGTTTTATGTTTAGCCTCAAGTTTGAAATCC AAAAACACGCCAAGGTTGAGCAAGGATGAAGATGATGATTTGTGGGGTGCCATAGCAGCTCCTGCTCCAAAAACATCTTT AAATTTGAAATCAACTACGACTGAGGATGATGATCCCTGGGCTTCCATTGCTGCTCCTGCACCCACTACCAGGGCCAAAC CCTTATCAGCTGGCAGAGGGAGGGGAGCCAAACCTGCTGCTCCGAAATTAGGTGCTCAGCGGATAAACCGGACGTCGTCA TCCGGAATGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0203900.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGCTGGCAAAATCTGACTGGGCTGCAATTAAGAAGTCTCCTCCATGGTCCATTGATTCTTGGGGCATGGGTTGTCT AATCTATGAGCTATTCTCTGGCGTGAAGTTGAGCAAAACAGAGGAGTTACGCAACACTGGCTCCATTCCTAAGTCTCTGC TTCCAGATTACCAGCGGCTGCTGAGTTCCATGCCTTCTCGCCGATTAAATACATCAAAGCTTATAGAAAATAGTGAGTAT TTTCAAAATAAGTTGGTAGACACAATACATTTCATGGAAATTCTCAGTTTGAAAGATAGTGTTGAGAAGGATACCTTCTT CCGCAAGCTTCCAAATTTAGCAGAGCAGCTTCCTCGTCCGATTGTGTTGAAGAAGTTACTTCCTTTATTAGCTTCTGCCC TTGAATTTGGTTCAGCTGCTGCCCCCGCTTTGACTGCATTGTTGAAAATGGGCTCCTGGCTTTCAGCTGACGAGTTTCGT GTCAAGGTGCTTCCAACAATTATTAAACTCTTTGCCTCCAATGACCGAGCTATTCGAGTTAGCCTTCTTCAACATATTGA TCAATTTGGAGAGTCATTGTCTGTCCAAGTTGTTGACGAGCAGGTCTACCCTCATGTTGCTACTGGTTTCTCCGATACAT CTGCTTTTCTGAGGGAACTTACTCTCAAGTCCATGTTAATTCTGGCTCCGAAGCTGTCTCAAAGGACCATTTCAGGATCA TTACTAAAGCATCTGTCTAAGTTACAGGTTGATGAAGAAGCAGCAATAAGAACAAATACTACCATCTTATTAGGAAATAT TGCAAGCCACTTAAATGAAGGGACAAGAAAGAGAGTATTGATTAATGCATTTACAGTCCGTGCTCTGCGTGATACTTTTC CACCTGCTAGAGGAGCAGGGATTATGGCTTTATGTGCCACCAGTTCTTACTATGACATCACTGAAATTGCTACACGAATT CTTCCTAATGTTGTTGTACTCACAATTGATCCTGACAGTGATGTTCGTTCTAAGGCATTTCAAGCTGTTGATCAGTTTCT GCAGATGGCGAAGCAATATTATGAAAAGACAAATACAGCTGAGGCAACTGGGGGGGCAGGCATGGGAATGTCATCAATTC CAGGAAATGCAAGTTTACTTGGATGGGCTATGAGCTCCTTGACCCTGAAGGGTAAACCTTCTGATCATGCTGCTCCTGTT GCTTCTATGAGTTCTTCTGCTCTTACTCCAACATCTTCGAATGCCAGTATTCTAGCTGTAGAAACTCCTTCAACAGCACC CGTCCGTGTAAGCTCCGCAACTGATTTCGCTGAGCAACCTGTCCCTACGTCTCCTACGTCAACAGATGGCTGGGGGGAAC TAGAGAATGGACTCGATGGGCCTGAGAATGACAAGGATGGGTGGGATGATCTGGAACCACTTGAAGAAACAAAGCCAGCT CCAGCTCTTGCGAACATTCAAGCAGCTCAAAGGCGGCCTGTATCTCAACCTGTTTCGCAGTCAAAACAAGGTACTAGTTT GAAATCCAAAAACACGCCAAGGTTGAGCAAGGATGAAGATGATGATTTGTGGGGTGCCATAGCAGCTCCTGCTCCAAAAA CATCTTTAAATTTGAAATCAACTACGACTGAGGATGATGATCCCTGGGCTTCCATTGCTGCTCCTGCACCCACTACCAGG GCCAAACCCTTATCAGCTGGCAGAGGGAGGGGAGCCAAACCTGCTGCTCCGAAATTAGGTGCTCAGCGGATAAACCGGAC GTCGTCATCCGGAATGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0203900.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MELAKSDWAAIKKSPPWSIDSWGMGCLIYELFSGVKLSKTEELRNTGSIPKSLLPDYQRLLSSMPSRRLNTSKLIENSEY FQNKLVDTIHFMEILSLKDSVEKDTFFRKLPNLAEQLPRPIVLKKLLPLLASALEFGSAAAPALTALLKMGSWLSADEFR VKVLPTIIKLFASNDRAIRVSLLQHIDQFGESLSVQVVDEQVYPHVATGFSDTSAFLRELTLKSMLILAPKLSQRTISGS LLKHLSKLQVDEEAAIRTNTTILLGNIASHLNEGTRKRVLINAFTVRALRDTFPPARGAGIMALCATSSYYDITEIATRI LPNVVVLTIDPDSDVRSKAFQAVDQFLQMAKQYYEKTNTAEATGGAGMGMSSIPGNASLLGWAMSSLTLKGKPSDHAAPV ASMSSSALTPTSSNASILAVETPSTAPVRVSSATDFAEQPVPTSPTSTDGWGELENGLDGPENDKDGWDDLEPLEETKPA PALANIQAAQRRPVSQPVSQSKQGTSLKSKNTPRLSKDEDDDLWGAIAAPAPKTSLNLKSTTTEDDDPWASIAAPAPTTR AKPLSAGRGRGAKPAAPKLGAQRINRTSSSGM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 2 | 78 | 77 | 5.8E-5 | – | |
| PANTHER | 2 | 589 | 588 | 2.0E-298 | – | |
| PANTHER | 2 | 589 | 588 | 2.0E-298 | – | |
| Gene3D | 79 | 359 | 281 | 6.7E-86 | ||
| SUPERFAMILY | 90 | 348 | 259 | 5.04E-31 | ||
| ProSiteProfiles | 163 | 201 | 39 | 8.663 | ||
| MobiDBLite | 432 | 474 | 43 | - | – | |
| MobiDBLite | 432 | 451 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 488 | 592 | 105 | - | – | |
| MobiDBLite | 489 | 511 | 23 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0203900.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…