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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0226200 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0226200.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | F-box protein PP2; TAIR: AT1G09155.1 phloem protein 2-B15; Swiss-Prot: sp|O80494|P2B15_ARATH F-box protein PP2-B15; TrEMBL-Plants: tr|I3SET7|I3SET7_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0226200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:53283500..53309674) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACACCAACAGAACATGTCAAAGTCCAACAATGACACCTATCAAATTCGCCTATGTTAAGCAGCCCAAAAGCCAACCTTGA TCATATTCTATTATTTTCTAAAGACCAAAGTACCAATCTCCAAACCTCAAATGGCAACTGGATCCACCATAGAAACCTTG CATGAGGAATGTGTTTCAGAAATTCTATCTCACACATCTCCACCGGACGCATGTAGATTCTCCATGCTCTCCTCAACTAT GCGCTCAGTGGCTAACTCTGACATGCTCTGGCGTAGCTTCTTACCCTCTGATTACTCTGACATCATCTCAAGAACTCTTA ATCCTCTCTCCCTCAATTCATCATCTTCATTCAAGGACCTCTTCAAAGCTCTTTGCAATCCACTTCTCTTAGATGGTGGC ACCATGGTAAGTATATATTATGTCAGTTTGAATCAGCTTCTTTCATCATTCATTTCATGCTTGATTTACAACAATAGAAC ATTTTCTCTTATTAATTTTGTTCCTTTGATACATTCAGATTTTCAAATTGGACAATTTTTCTGGCAAAAAATCCTATATT CTTTCTGCAAGAGAGCTATTGATAACATGGAGCAGTGATCCAATGTATTGGACCTGGAAACCAATGCGTGAATCAAGGTA ATTAAATTGACTTTTACTTATGTGTGTATTTGGATTAAACTCAAATACCTACTTGATGTACTATTATTCAAAAAAAAAAA AAAAAAAAATTGGCACGATCAAGTTTTCTTATTTCAGAATCAATTTTGACTCAAATAGATTATGGAATAAGGATTTCCGG AAGGTGAATAATCAAATTAGTCCCCAAAGCCAAAAGTGTTAGTTAGTAACAAGTTCATTCATAAAAAAAGGAAATATATC TACCACTCTTAATTGTATAAAATGCCTATCAAGTCATATGATTTGATCAGAAAGACTAATTTGGCCGACATTTACACAAT 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AGTTAGCTTTCATAAAAAATTGGTTTCACTCAATGTGGAATTCTGTAGAGAGAGTTATGATCTCTACAACACAAACTGTT AGGGTATTTGCGGGCATAACAGAACCTAAATTTCCCCAGAACCTCAATTTTGCCCAAAATCAATTTTGCCCACCACAATT TTACACTCAACACAGTATCTCAGTTCTGAATTTTCAAAGAAGTTGGGGGTTCCTTCATGTTAAACTCAACCTCTGTTATT CTACAATTATACAAGGTAAATTCAAACCCTTACCTTCTATGACACCGGTACAAAGCCTCCTAGACCCTTTTCTTCTTGAA GATCAAATTCTAGGTTTTCTCCACCTTTTCTCCTCTCCTTCACCTTTCACGTGTTTCTCTGTTCTGTTGCTTCTCTAATC CTAATTTTCTTTCTTTCCTTCTACTTATATCTCTCCTAACCCTAAACTAGTAATACTACTGGGATCCGCTCCATATATCA CAATAAAACCCAAAAACCTTATTTATCTGTATTACATAATCACTTAATTATCTAATAAAATCACTTAATGACCTTATCAT CTAATTAAATCACATAATCAAATAATCATCAAATTAAATCACATAAATTATCAAATTACCATATAGTATGATAATTAAAA TAAAATAATAAATAACCTAATAACGAAAAGTGGGGTGTTACATTTTTTCTTCATTTGACTATTTTTAAGCACATTGAGCT TATTTATTCTCTCATCATGCTACCGCTAATGCTCTATTCAGTAGTTTATAATTGTTTTCTCTTCATTTTACCATTTCAAA ACACCAAAAAAATGTACAAACAATAGCAAACAAAATTCCCAAAAGTTCATGCTAAAATAAAATTATCCTCATTAGCATTA TGTTGGCCCAAAGAATATTTGGCCCAAGGCCCAAAACCAAATGGGTTTAGTGGAAATGAGGCCAAGGAAATCAGGAATAG GCTAAGTTACTTGGCTACTGAATCTCGACAACGTTGACACTGGCAACCGTTGCTATTTAAAAGGGCAGGTGCAGCACGTG CGTTTATGGTGAAAACGTGCCACAAATGAGAATCAGTTGGAAGAGCGAATGCTTCTCCCCACGATGTCCATCCACGTGGC AAGCAAAGCAGTTGAAGCACAACCCCCTTCCCCACTACGCATAGAACCTCCGGAGCAAGCATCAGATCGTGGGCAAGCCA AACCCGCTAACCCGTCCATCCAGAGGAAAAAACCGCCAAGAACGTGCAAGACCATGGAGTGCTATAAATAGAAGAACGTT CATTCAGAAAATGGGTTCCCAACTCAACTCTTAAACTCACTAAAAATCTCTCATGTCCGCATCAAAGAGACTCAACGAGC CTAACGTGATCATGGAGGAGTATGTTGCAGAACCAGCCATTTACGATTCTTGCACTTAGATGCTTTCGAATTTGTTGTCA TTCTCTTTAGATTTCCTGTCGATTTTCTGTGTTTGGGTGATGTAAAGCTTTTCGAATTATATACTTCGCTTTTACTTAAT GAATTATACTTTTAAGCACTTTTAATTGTCTTTTGTTTTTCGAATCCTTATTTTCTTTTATCCCCTGACACACGGTTGTC GAAAAACCTGGTTTCACACACACGCTTTGGCAAGACGTTTTCCCAAAAGAACCCTTAATTCGCAAAACTCTTAAACTTTT TCCAGTCGAATTTGGAAGATGTTTGTTTACTAAATATCACGGTAAACAAATTGGCACGCCCAGTGGGACCGTTTTTGTGA AAACTAAGTTTTACAGAAGCGCTTTGTGTGTAAGTTATTGTTCTTACATGTTACTTTCTACTTGGTTTCGTCCCTGCTTG CGTGAGTTAGTTTTATGCACTTGAGAAGTGGTAGAACAGTAAGTATGGCGAATAGTAGAGGTAGAACCTCACCTCAGGGG 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AAGTTCACTAAGTTTTCTGGGGACTCAGGGGAGTCCACTGTGGAACACGTGGCGAGATACCAGATTGAGGCTGGAGACCT GACCATTAACGAAAATCTGAAAATGAAGTATTTTCCAAGTTCTTTGACCAATAACGCATTTACATGGTTCACAACCCTTG CTCCTAGGTCAGTCCACACTTGGACACAATTGGAGAGGATTTTCCATGAGCAGTTCTTTAGAGGGGTGTGCAAAGTGAGC CTAAAGGACTTGGCTAGTGTCAAAAGGAAAAAGGAGTAAAAATCGGGGTCTTGGATCCGCCACTGAATTTCAGAACCGTG GTTTTGGAAAGTGATTCCACATTAGCGGTCGGGTGGGTTAATAATAGAGGTAGGAGGCCATGGAAGCTATACCAAATTCT AGGGAAGATAGACCTGCTTATGCCGTTGGTAAATTGCCTAGGCGTCTATCATGTCATGAGGGAATGCAATGAGGTTGCTG ATTTATTAGCAAAGAGTGGGAGAGATGGGAGGCTACTGCTATGACAAGAGTGTGATGAAGGAATTCCTAATATTGTTTGA AGAGGGCACATGCCGACATGGACTTCTGCATCTGTTCTGAAGGGTCAGGTCTTGTTTTTAATCTCTGTCTACTGATCTAG TCTTCATCTGATATCAGCATATTATTGTACTGCCTGTGATAAATTTAAGGGGGCTAGTGGAATAGTTGGGTTATTATTAA GGAGGGGTTACTACTGGATTTTAATTTGGACAGTGGGGTGGTTGTTTAGCGAGTTTCTTTTGTGATAAATAGGAGGTATA TGTGTGTGATTGACTGGGTGGGGATGTTTTAATTGAGCTTGTGGTTCTGGTAGGTAAGGTTGACAAAATCGCGAGTCAAC TCGTAGAATCGCACGATTCTACGATGTTACAAGGCCCTTACGTGTTGAATCGGTAACAGAATCGCAATTTGGTATAATCG AGTGGAATCGCCGTTGTTACCGGTAGAATCGTGGAATCACGAGCCGTGGCCGATTCTACTTTCTGGAAACCAAACCCGCT GACCCATCAAACCGGATCCGACCCTGGGTTTTAAATGGAACCTTACAATTTTAGAAGTATCAACACACGTTTCTCTCCCA CTCCTCCGCACTCCATCGTCACTCTTCCTTCGTGTGCCGACAGTGCCGTCGTCGTGCTCCTCCGTGCGGCGACGCTCTTC TCTATTCTGGTATGCTTCATCGTGCTCCCACGCTCTTCTCTCTTCATTGCACTTTCTTGTTCTTGCTTACCTCTAGTTGT GCGTATGATTGGTTTTGTTCTCCATTGATGGATATTATGCTTTCTAGTTTCTAGTGTTTAGATTCTGTCCCTATAAATTT ATAGCCAAATAATCAAAATGGGATGATGAACCAAACACCCTAGTTTCTGAAACGTGGCCCTTAGTGGGGTTTAGCTGCTA CCTGGCAATTGGCATGATGAACCAATATGATTCGTGTCAATTAGAGTAGCCAACTCAATATTGATTTCTCTTTTCTTTTA TTATTTGTTAGTTTTTTTGTGAAATAAAGATGCTATTGAATTGACTCAGGCCAGGAATATAGATTGAGTCATATTTCAGC TTTGCTTTGTTTTTCTCGTGAGTAATAAATGAGGCTAAGAAATAAAAATGTTAAGGTATTTTGTATGCATATATATGAAT TTATATGCGTATAATATATTTATACATATTTGTAGAATCGTAGCGTCCATGTTACGTTTATACGAGTTTACGATTCTGCA CCCCTTTTCCGTCTTACGTAGAATTGCAATTCTGTCAACCTTGCTGGTAGGCGTAATAGTGTTCTTTTGGGGGAGAAGGC TTGTTCTTTTTGTTTTGTCTTAATTTGCACGTTGTTTAAAACACTTAAAACATGAGGTGAAGGATTGACGTGTGGATTGA CTTGAGGCTTTGTTGCAAGCTGATGATACATTGAATGAAGCAGGGCTGTTGCTAGCTTTGTTTGGAAATGCATGTTGACA GATTGGATAATGTATTGGTTATGTTGTGGTTGTAATTTTCCATACGGTTTTTGGGTTTATGGTGGGGTATTGCCTATGTA CTTTGTTGGTTTTGACCATAATGACATATAATATAAGATAAACTTAAAAAGAAATTATTGGTAGACCGCGAACTAAATCT ACACTTATTTTATATCTATCTTTATATTTTTTTATCACTTCATATTATATATTACATTAATCATTTTTAATGTCTACCTT GAAATGTTGTACAATACCAAACATTATTCTTATCCATCGCAATAGTAGATGTTCTTTGAATTTATTCCACAACAAGTCGG CACACCTATAAAGAACATGTCAAAGTCCAAAAATGACACCTATCAGATTCACCTATTTAAGCAGTCCAAAAACCTCCCTT GATCATATTCTATTATTTTCTAAAGACCAAACTCCAAACCTCAAATGGCAACTAGATCCATCATAGAAACCTTGCCGGAG GAATGTGTTTCAGAAATTTTGTCTCACACATCTCCACCAGACGCATGTAGATTCTCCATGCTCTCCTCAACTCTGCGTTC AGCGGCAAACTCTGACATGCTCTGGCGTAGCTTCTTACCCTCTGATTACTCTGACATCATCTCAAGAGCCCTTAATCCTC TCTTCCTCAATTCATCATCTTCATTCAAGGACCTCTTCAAAGCTCTTTGCAATCCACTTCTCTTAGATGGTGGCACCATG GTAAATATATATTGTGTTTGAATTAGCTTCTTTCCATCATTCATTTCATGCTTGATTTCCAAGAATAGAACATTTTCTCT TATTAATTTGTTATTTATGCTATATATATGTTGTTCCTTGACACATGCAGATTTTCAAATTGGACAAGTCTTCAGGCAAA AAATCTTATATTCTTTCTGCAAGAGAGCTATCGATAACATGGAGCAGTGATCCATTGTATTGGACCTGGAAACCAATGCG TGAATCAAGGTAAATTGACTTTCAAGATTCAACTGACCATGTTTGCTTAAGCATTTAACTATGTATGTGTGTATTTGGAT TAAACTCAAACATCTATTTTATGTACTATTATTAAAACAAAATCATCAAGTTTTCTTATTTCAGAATCAATTTTGTCTCA AATTGATTATGTGATAAGGATTTTCAGACTGAATAGTTAAATTGGTCCCTAAAATGTCAGCATGGAGAAATTTGTCTCCA AAACAAGGAAATGTCGTTGATTGTCAGTCAAGTTAGTCCGTACCAATCTTTTAACCGCAAGAATTGACTAAACTGTCGTG GACATTTCTGAAATCCTTAAACGAACATATTAGTTGTCAGCGTTCAACACTTTCAAGGACCAATTAGAACATTTATTAGG ATTTCCAAGACTTAACAGAAATTTAATATTTTTGCAGATTCCAAGAGGTAGCTGAGCTAAGAACAGTGAGCTGGTTACAG ATTCAAGGCAAAATCAGGACACAGATTCTAACACCAAACATGTTGTACTCTGTTTACCTCATCATGAATGTCTCACACCG TGGTTACGGCCTTGATTCTGCGCCGTCTGAGGTATCATCGACGGTGGCGAACAACGTCATGCACACCAAGAAAGTGTATC TGTGGAATAAAAATGAGAAGAACATGTGTGAGAAGTATACCCTGTTTCGCGGGTTCCATAGGGATGTTGCAAGAGAGACT TTGATCATTCAAGATCAGATAAATCCAGGTCCATTGAAAAGAGATGATGGGTGGATGGAAATTGAGGTGGGTGAATTCTT CTGTGATGGTGAAATTGATGAGGAGGTTAAGGTGAGTGTTATGGAGGTGGGTTATCAGTTGAAGGGAGGGCTTATAGTTG AAGGCATTGAAGTAAGACCTAAGCAAGTTTGACTAAACAAGATCAAGGGTATAGGGAAAGCTAATCCTTGCTTGTACAGT GTGAGAATTAATTACTTGATTTTAGCCATAGAAGCTGTCATGTAAAAGTGTAAATAGCTCTGAAATAATTGAGGGGAGAT TTTTTTTTTCAAAATTATACTCCTACTAGCTTCTTTTTATATAAAGATTGGTTGACCAATCTTGTAAGATTCATGAACCA ATCTTTTTAGTGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0226200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAACTGGATCCACCATAGAAACCTTGCATGAGGAATGTGTTTCAGAAATTCTATCTCACACATCTCCACCGGACGC ATGTAGATTCTCCATGCTCTCCTCAACTATGCGCTCAGTGGCTAACTCTGACATGCTCTGGCGTAGCTTCTTACCCTCTG ATTACTCTGACATCATCTCAAGAACTCTTAATCCTCTCTCCCTCAATTCATCATCTTCATTCAAGGACCTCTTCAAAGCT CTTTGCAATCCACTTCTCTTAGATGGTGGCACCATGATTTTCAAATTGGACAATTTTTCTGGCAAAAAATCCTATATTCT TTCTGCAAGAGAGCTATTGATAACATGGAGCAGTGATCCAATGTATTGGACCTGGAAACCAATGCGTGAATCAAGATTCC AAGAGGTAGCTGAGCTAAGAACTGTGAGCTGGTTAGAGATTCAAGGCAAAATCGGGACACAGATTCTAACACCAAACACG TTGTACTCTGTTTACCTCATCATGAATGTCTCACACCGTGGTTACGGCCTTGATTCTGCGCCGTCTGAGGTATCATTGAC GGTGGCGAACGACGTCGTGCACACCAAGAAGGTGTATCTGTGGAAGAAAAATGAGAAGAACATGTGTGAGAAGTATACCC TGTTTCGCGGGTTCCGTAGGGATGTTGCTGGAGAGACGTTGATCATTCAAGATCAGAAAAATCCAGGTCCATTGAAAAGA GATGATGGGTGGATGGAAATTGAGGTGGGTGAATTCTTCTGTGATGGTGAAATTGATGAGGAGGTTAAGGTGAGTGTTAT GGAGGTGGGTTATCAGTTGAAGGGAGGGCTTATAGTTGAAGGCATTGAAGTAAGACCTAAGCAAGTTTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0226200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATGSTIETLHEECVSEILSHTSPPDACRFSMLSSTMRSVANSDMLWRSFLPSDYSDIISRTLNPLSLNSSSSFKDLFKA LCNPLLLDGGTMIFKLDNFSGKKSYILSARELLITWSSDPMYWTWKPMRESRFQEVAELRTVSWLEIQGKIGTQILTPNT LYSVYLIMNVSHRGYGLDSAPSEVSLTVANDVVHTKKVYLWKKNEKNMCEKYTLFRGFRRDVAGETLIIQDQKNPGPLKR DDGWMEIEVGEFFCDGEIDEEVKVSVMEVGYQLKGGLIVEGIEVRPKQV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 2 | 113 | 112 | 1.8E-7 | ||
| PANTHER | 4 | 287 | 284 | 2.2E-134 | – | |
| PANTHER | 4 | 287 | 284 | 2.2E-134 | – | |
| ProSiteProfiles | 4 | 50 | 47 | 8.623 | ||
| SUPERFAMILY | 5 | 83 | 79 | 2.52E-13 | ||
| Pfam | 6 | 50 | 45 | 3.7E-5 | ||
| Pfam | 102 | 286 | 185 | 1.0E-49 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0226200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…