Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0247600 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0247600.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | bZIP transcription factor, putative (DUF1664); TAIR: AT1G24265.1 bZIP transcription factor, putative (DUF1664); Swiss-Prot: sp|H7BZ55|CRCC2_HUMAN Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2; TrEMBL-Plants: tr|I1N500|I1N500_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0247600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55597320..55607079) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAAATCAATCTCAACCGTTATTTATAGCATAAATAAATCCCACGGCTTAGATTCCCCGGGTACAGGTATCCTATTCTAT TCACCAAGACACTGAGACAGACACCGCCACTCCAAAAACTAGGGTCGATCGAGGAGAAAAGGGTTTCGTTTCGTTGGTCG TGTACCATTTTGTTGCCTTGTTCCCCAATTCTCACTTCGGCGTTCTCGTTCTGCCACATCGCCGGAGCTCTAAACGCCGC CGTTTCACCCTAAATGCTTCGCCGCAGACTGCACCACTAGTGGTTGGTTTCCGCCGGTGCTCGCTCGCTCGCTCACTGGC CAACACACATACACGCGCCGATGGCTCTTTCACTCGGGAAGCTCACCATCCTCCTCGGTGCAGGTCTTCATCACTCACTC TTCTGATCCCTAGCTTCGATCGTTTTTTTTTCTCCCAATTTTGTTGTTCCCTAAACTCATGCAATCATGGTTATGGAATT CTTGATAAATTGGTTTTGATTGATGGAGATGTGACTTCAGTGTGAATGTTTGTGTGTTTAGGCATTGCTGGTTCGGTTTT TGCGAAAGAAGGGCGCTTGCCGGATGTCTCTGGTGTTTTATCTGGTGCTTGGAAGGTTAGTTGTTTTGGTGCTGCAGTTT TTGTTGTTCACTGTATGTGGGTGAGTGAGCTTATGGTGAAGGATGTGTGCGTCTATTGTGGTGATGATTGTAGAGATTGA AAGATATAGCCATTCGAATAGGTCCGGTTTCATGTGTTAAATACAATTTTCCTCTTTTTGATGTTCTAAGTAGTATGTTT AAGATGCTGATTATGATAAGAGAAGTGAAGTTATGGGGGTTTAGTTTGTAGTTATGTTGAATGTATATGAGTACCGGTAA AAGTAGGGGACCTATGGGGTTCCTTGATCCTTCTAAATGAATTTAGTTTGGTAAGTAAAATGAGTATGACTTGAGAAAGG AAAGCATAACTTTTTCCTCTTTATGTTGGCATTTAAACATAGGCTGCAATGCTGGACTTTAGATAAGGGGAAAATATTGA AGAAAATGTTCATCTTGGAGTTCGATTTGATTCTATTGATACACAGTAAATCCGTGAAAAACATATAGGGTTCAATAAAT GGCTATAACACTCTTTGATTCGTCAAGACTTCTCCACCTGTGTAATGCTACCATATATCTTATCTTATTAAGATGCATTA GATGTTTATTAAATTTTTCATAAAGGCTTGTGCCTCTTGATTTTGTCTTTTATGTGCTGGTTAAGTTCAGAACTCTGCTT GTGCTTAGGGATGTAAACGAGTTAAGCTATCCATGATTTATTCGAGCTCAACTTGTTAAATGCTCAATCAATCCTGTTTG TATGACTCAACAAACAAGTTCAAGCTTGAGCTTGGGCTCAATTATATATATTAGATAAGCTCAAGCTTTATAGGTTTGTC ATTAAAAGCTCATGAATAGCTCGTGTGCTTGTGTCACACAGATACAAATGTATGTATGTGTATATGCATTTGTGTAATCA AGTAGAGGGCGTTTTAAAGGAAATTACTATACTAATAATAAGTTGAAAAATTACTATTTCATTATTTCTTTGTTCACTAG GTAATGTGTTGAACATTTTTGTGGGCATTGAAATCTACTTTTGAATTTCTTTTTGTAATAGCCAGAGATTATGAGTTTTT CATGTAATAGCTTATGGATGCAAAAAATAATGTATATTTTCTCCGTTTTATAGCATTTTTTATGTCATATTCTATCATGA AGATGTCAACTAAATACTAAATAAAATGAAAGAGAATAATCAAGCCATAAACAAACAAAACAGGACTAGCTCAAGTTTCT TAAAACAAGCCAAAGGAAAGCTTTAAATTCGTGTTGTTTAAATAAATGAACCATGCTTGAGTAGCTCTTTCTCCTTCACG ACCCAAGCCTTAGCTTCAAATGCTAGGATTGTCTCAGCTCATTTATATTGTGCTTTTCTTGGCAAAAATTCTAGAGGCTT CTGGTTCATGCCCCGGGTAATAAGCTGCGTGAAAATGCCGGAAGGGAGAGCTTCAGTGGAAGATACATGTGGTCTAGACT AAAAAAAAGTACAATTTGTAATCCGAGGGATCTTGGTTAAGTAGGAGTGTGATGAAATATATGCCAATATAGAGTGAGTA AGATGCAAGATAACAATAACCATGTTTTGATCTGGAGATTAATGGGCATGGCACATATTGGATTCAAGTTATATGGATGA AAGGTAGAAATGCTTTTGGCATAATTTGTGATTGTAAAGTGTCTATAAAACTCAAAAGGAGAGTTTTGCTGGACGGCTTT AAGATAAATGATGGTCTAGTAGTGAACGTTGGCTAGTGAAATGTTCTGTTAACCAGAGCCGAAAAAAATGAGCGTAGCAT AGGTAAGAATGCTAAGGTGGGTGAGTAAGGTAATAATATGAACTAAAGTACTCAGGAGAAAGTTAGAATCATATCTGTTA ATGAGAAGGTTATGAAACTTGCCTAAGGTGGTTTCATCATATGAGAAGACCAATAGAGGCTCCACTGAGGAAAATGGATC AAGTAAAACTTATGGAAGATAGTTTAATTAAAACAGGAGGATAAGACCTATTAAAACATTAGGAGAAACTATTCAGAGAA AAGTAAAAGACATTGTTATAAATATTTTTACTTAATCATTGTGATTCTCTTATAAGTCAATGGTGTTGATCGATCCGTAT GTATAGCTGATTCCACTTTTCAAGATATGGTTGGTTGTTGGATGTTCTTCAGATGTTCAGTCTCATTCCTTCAATTTATG CTTCATCTTAAAAACCTCAAGTTTGGCATTATTCAGATGTTATTATTATTTATTGGTTATTGGGTCCAAATTCCTGTAAT ATACTGAATATGTGGTAGCTGGCATTTACTTTGTAACTAACGGTGCTGGATCTATACTGATTATAGGCTTTTTTTCTTCG GGGCAGGTTGCTACGTGGTTCAAAGTCGATTCTCCTCCAACTGTTAAGAAGCCACGTAATGATGCTTTGATGGCTCAGGT CTGCATGTTGCTGTTGTTTTTAATTATTGATTAGATTTACTTTTGATTAAGAATAATTCCTAGTATAGTTGGGTCTAGTC TCATGCAACCTGCCTAACATCACTTAGATAATCTTGTATTTTTCTTGATTTCTGAGCTTATGCATATGGTTGTATTACTT GTATCTGTGTCTTATTCATAAATCATGACAAGTAAAGTTATATTTTAACATCTTATATATATGCTAATATACATAATATA TGTGCCAACCTCAACAAGTACGTGTTTGGTACTTGCGATTGACTTCATTTGCATGTTTCAAAAAGTGAAACAGTTCACTC AAGTATTATGGTAGGTTGTATCTGTACTAGTTTTTCTTCTTACACCATTCTGAAGTAGGTACTAATCTATAATTTACTAA AACTTATATAGTTTGAAATATATAGCATCATACAAAGTCATAAATATGACAGAAACATGTTTTGAATGTTGTTCTGACAA AGGAGAGACATGGCTTCATTGCTACAGACATGCTACTATTAAGGAGTTATGATCTATAACTGTTAGCGGATGACAATCCA GTATGACCTGAGCTTTACAAGATTGTTGCAAAATCCTATTTGTTAATTTTTAGGCGTTTTGAATCCTCTAGGACCGTCAG CTGCTAGTATGATATGATTATTTATAAGTTGAGTTGACAACGGGAATTTGACCTTGTAAGATGATATTGCTAGCATTCGT TTTTTGAGGGTGGGGGCGGGTGGAATGGAATCTTGTTTCCATTTAGGTAATTTATTTATTAAAGCAGATGCTGGGGCTGC TGCTTGGGGAATAGATGAAGTTCCTCAAACTACTCTTTTCAATGTTATCTATGTGATAAAACTGGCACCAAGCAGGAATG GAAGAAATGAAATGTTACCGAAGAACCATAATTTCCCTCTCAATGTGATAAGAACCAAGAACGGGGGAGATATTACAAGA GTGAACTACGAGAATTCGAGTATCTCAGTTCATCCTACTCCATAATTGTCCAATACAACAACTGTATCCCTGCTAACTGA CTTATTTTTTATACTACCTAGTTAGCAGCTGTTAACTAACTTTTAACCAATTACTAACTGACCAGCCAATTAGTTACTAG GCAGTAATCCCCTACAACTCACTCATGCTTCCTCTTATATACCTTTGTAATTGGAGGCTCACTATTCCTATCACTATGAT CTCCTTATGTAGAGTGCTACTAGTGCATTATATGAAAAAGCCAGTGATCATAGCTTGAGGATTGTAAATTTACTTGTAGA TAATGCAAATTTTAAATTTGTGAACCCTATTCTTCCATTCACACTTAAAACATATAAATGCTTATCCACCCCTAAATTAA ATGAGAGTACCCACACTTGAACATGAGGCGCTCATTCACTAATCTTGCTGCCATGGTTAACCACATGGGTTTCTAAATAA CCTCCATGCGGCCTCTTTAATTTTTTTTTTCTTTCTGATTTTTTATATTCATTCAAATTCAACTTGCTATTTATCCCTTA ATAACAGCATATTGATTTTAAATTTAAACTAATCATCCCCTAATATGTATATATAAATAAATGAAAACTCTATTCAATAT AGTTATCCTCTACAATCTACACATTGAATTCAAATAATTCATTTTAAAATTTATCTAATGATCTGATAATTTTAAATATT TAAATCAGGTAATTTATTATATTCTTACAATTGTTTATAACATTTATTTGTATGTACATTTATCTGTATATACCTTTTAT TATAAAATTTTCGTTTTTATCTCTTAATTTTTTTTCTTTTAATATTATTTTTAAATTTAAAAAATACCATGCAATTCACA GGAGACTTGTTAATAGTTGCTATGTATTGTTTTGGAAAAGGGATGGATGTGTGTGTTAGTCATAACTTCATAAGCTGTAT ATAATTTTCCAGCTGTTAGCTGCATATTTTCTTACATTCAATGAATTCAGTAAAAGCATGATGATATTTCACAGTTTACG CAGAAGGTGTTAAAAGTGTCAGTAGTTAAAATAGAATTGCTATTTCTCCTTCTTGAATTGACTTCTAAAACTTAAGTAAT ATGAGGTTAATTGAAAATGCTGATTAGACCTTTGATGTACAGGTTGCCAGCCTTCAGCAGGAACTACAACGTCTTGGTAG AGATGGATCGATCACTATTGTAAATGCAAGTGGAACAGGTTTTGGTTATCTACTCCCTTTTACATTACAGGAGCCTTTTA TTCTTTCTTCATGAATTTAAGAGATGCTAAATTTTTTATTTGCAAACTCTGTGATCACTGATTTGGTCATAGATTATGAT TGTGTCCATAATTTTCATAAGTTAATCAAAGTTTCCTTACATCTTATTTTTTGCTATTTTCTGACCTGCTTTGTCTTACA GGTGGAAGAAAGTATGTCACCGTGATTGTTATTGTTGTGGTTGGATATGGATACATTTGGTGGAAGGTAGCATTTTTTTC TTCTCTGATTTTTTTATTGAGTAACAGGATGTGTTGGTAATACATTCTTGCAGGAAGCTTCTAACTCAATTTTAAGTTTG TGTGCTTTTAATGGGGCCATATGCTATATAGCTACATGATTAGTGTGGTATGCTTGGCTGTTTGGGCTGTTGTGGTTGCT TCCTGGATGAATAACTTGCTCTAATATTCAATTTAACTTAGCCAAACAGCTTTTATCATTCTTTTCTGAGAGTTTGCTTT CCTAACGCAATTCATTTTACATCATCTCATTTTTCTACCAATACTTATTTATGTGATTTGGAGCAGAATCAGTTTTGTGA AATTGGATGATAAAAAAATCCAGCAATTGCTTACTACTTACTTGGTCCGTCAATGTCAATATGTCATAGGTTTAGTTATA CTAAACTTCAAGCCAGAGCAGGATGCTCATTTTAACTGAATCTAAGTTTTTTTCTAACAATTTTCTTACCATAATGGCAT AATCTTCCTATCTTCAAGTATGTTCTCCATGAAGATCACTGTTTTATGGCCTTCCTTATTTTTGCAGGGATGGAAGCTTC CTGATATGATGTTTGCAACAAAGCGTGGTTTATCTGATGCTTGCACATCTATAGGTAATCAGCTGGGGAAGGTTTATGAA TCAATTGAGGTAATTTCCTTTTCTTACAATATAGTTTGTTCTTCTTACATCATGTTCATAAATTAAAAGTAAAACACAGG CATTCTCTATTAGTGATGGCATAAAATGTTCTATTAGTATAGCCTTTTTTTTGGCAAAAATAATACAGTCATGTAGATTT ATATAAGAGAAGACCATATGAACTTGATTTGGATATTTGTTTTTTTTTATTTATTTATATATTGTGCCCATGTGTGGTAC TTCTGTAACACTGCAATCGCGTATACACACAAGATAAATGTCATTGTGGGACATTTTTCAACGACAATATAAATTTGTCT TGGGTGCATGGTTGGTCATTTTTTAAAAAAAAAGTGTTGGTCATTGGTTATAGTCTACTGAGCTGTAAACAGACAGAGAG ATGAAAATTCAGTTAGTTTCTGTTCTTTATAAAAAGCATTCAAATGGCCCTTCTATGTGGACTTATCTGCAAGGTTCTCT GTAATCTTAATCATGTCTTTTTTTCTGACATAGTTAAGTGCTTGACCTGCTTTTTCATTTTTCATCATGATGCATGGTAT GGTTCTATTATTAAACAAGTTAATTATATCATGTATTTCCCATAAAATTAATTTTGAATAGAACTTTCTGTGTTCTATAA TAATGATATTTTGAAGTCTGCATTATGCTCAATTTATTTTTCTGACTTTCTTTTGATATTTAAAAAAATTGCTGATGGTT GTTTTACCATGGAGTATTTGAGGATGCATATTTACTTATCTGTAATGGTTTCAGGATGCCAAGAAAAAGTTATCTGCAAA AATTAATCGTGTCGATAAAGGTCTAGATGAAAGTCTATCCCTTAGCAAAAATACAAGGGAGGAGGTCAGTATAGAAGTTA GGGTTTATACTTTTGGCTTCTTTACAGTTTAACAACAACATGTATTCTGTTACAGATCTCTGTAATACGAAGCGAGGCAG ATGCTATGAATGGTGACATCAAGTCAGTTCATGTTGCACTTCATGTTATCGTAAGTCATTTGCAAGAATTCAGTTATTTC TTTAGTTCTTTTGCTGGATGTTTAACTTAAGCTTGATTACTTCTCAGGAATCTAAAATCCAAGAAATAGAATGGAACCAG GTATAATCTGTTAAATTTATGTCACTGCATTATTTAATTATAATAATTCTTCTTATCTTTTAAGGGGACTGATTTTGTTT ATACCCATGATTTGTTGTTTCTATCTGCCTAGGAGGAAACAAATAAAGGTGTGGATTGGTTGTGTCAGCGTGCCAAGACT TTGGAAAAAAATAGCAGGACCCCAGAGTATATTCAGGCATGCACCAGCTTTCATTACAAATGAATTTTTAATTTTTATTG TCTGGCTTGACTTCACAGTCTGATTTTGAGATATGCTTTATATTACTTTCTATATTAATAACATGATTTAAATTTTATAG GCATCTTCATCCAGTTCTTCCAGGCCGTCCATTGTTGAGCTACCCCCAGATTCACCCTCTTCCCGGGTAATTATTTTATC AGGCTTAGTTATTACTGCGACTATGTCCTTTTTAAAGAACTGTTATTATACATTTGTTGCGATAGTAATATTTATTGTAA ATTACTTGGAATTATTTTAGTTAACAATATACTTTGTTCATCGGACATGTAGATATTTTATTTAACTATAAGCCATACAA TCAATATACAGTCATTAAGTTTGGCTTTATATTTCAGTCACTGCCCCCCCTTTTTCCTTTGAAATTTGTTCCTGTGTTAA CTCTAATCTGAATTATGCAGGGTGCACAATCAGCTTCTCCCTGGCTATCTCTCGAGCCACCACCTTTTACACCATCAAGG GTAACTTCTATAATCATACGGGAATATATAAACAAACAAATAACAATTTATAGCAGAGTTGTTCTGTTATGCTTAATTCC TTATATTTCTAGGGTCCTCATGGTTGAGTTGGTGGATAGGTGGGACCGTGGGACAATGGCAAGTTTGGGAGGAAAAAAAC TTTTCACTTGTACATTGTACAACTGAAACATGAGAAGATGGAAAACAAAATGCACTCGTTTTTAACTTCTTTTTTTCCCT CTATTCCAACGTATTTTCAACCTTCCCCTCTTTTTACTACACCTTCCCCTCTTTTTACTACTCAAGCAAAGAAACCCTGT AATTTTTACAACTCTTCCCTTTCCTTCCCATTCCCTTCCCGTCTTTAAAGAGGGTATTCTCTAAAAATCCTCCAAACAAG GGTGCCACTTTTCCCTTACCTCCCTTGCCTCTCCTCACCTCTCATCCAAACATATGTAGGACATGCAGCGCCTGTAATTG TTGATTGTTCTTAGCTTTTAATTGAAAGTGTTAGCTGCAACCTTGGTATTGTGTGTTTGATGATCTCCTTCCTACCAACA GACTGGATCCTTGCCTCCTACTCTGTCAACTGATCCACTATCTCTGCCGAGTCCTGCTGGGTCTTACCAGGTCTGATATT TCTCATTTACTTGATTCATTTATGTGCTAACATCAATGATCTAGCTATGCGAACTTATAGTTATGTGCGAACATCAATGA TCTATAAAATGCACTAATGCAACTATCGCCATGCGATATTCCCATATCTCCTTTATAGATGCATGGCTATAGTTGCTTTA GTGCATTTAATAGATCATTGATGTTAGCACATAACTATACATGTTGACAGGTGACACAGCTGACAGAGTTGTTTATATCC ATTACTGTTGGAATGAAATATTTTCTTCTCAAACTTCCAAAGCCTAGTTACATAAATTTAATTTATATACATAGACAATG CAAAAGAGCTTTATACAGACAGTCAGACATCATGTTATATCTTGCCATGTTTCTGGTTTGATATTTTCTTATTTTAGTTT ATGAGTTTTATTTATGAAGTGGTGGAATATTTTGATTGTACGTATCTGTAAAACTTTTTTGCAATGTCAGTTCATGAAAC TATTTTCATTGTTGTAATTTTTACTTTGTCTTATATTTTTTGTCTGTTTTTTCAGCAGAGTAGTCGGATTTCTAAGGAAA GAAATCTCTCCAATGGTACAGAAGCCGAGACCCCTGGATCTAGTTCTGGCTTGTTTGGGCTGTTTTCAAATGTTTCTGCT TCATTTCTATCAAGAACTCGTAGTGCAACAGATGCAGTAGTACAAAAAACTCGTACATAGCAAGAAGAGGCCTGATTTTT TTGGTCAGCTTTTTAATGGATCCCCACTAAGAACATAGAATATTGGACCTATTGTGGGGGAGAAAAACTTCACCATTGAG TTTGGCTCCTCAGAAATTGTAGGCACCTTCAATTACAATACAATTACAAGTTTGTCCAAGCCAATTTTGCAGATATGCTG TTCTGAACAGTTTCAGTAGATTATTATAACTTAAATAAGAGTTTCTCCAATATTCAACTGGGAAAGCCGGAAAAGGTTAA ATTATTGGGAATTCCTTGTTCTAGTAGTATTATTTCGAGGATAAAATACAAAATCCTGTTTAGATTCACTTCGCTACTCG TGATTCTTAGGGTGCTTGTGCTTATATCAATGAACACATGTTCTATAAGTGGCTTATTCAGAAGTTTATTGAAATAAGTT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0247600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCTTTCACTCGGGAAGCTCACCATCCTCCTCGGTGCAGGCATTGCTGGTTCGGTTTTTGCGAAAGAAGGGCGCTT GCCGGATGTCTCTGGTGTTTTATCTGGTGCTTGGAAGGTTGCTACGTGGTTCAAAGTCGATTCTCCTCCAACTGTTAAGA AGCCACGTAATGATGCTTTGATGGCTCAGGTTGCCAGCCTTCAGCAGGAACTACAACGTCTTGGTAGAGATGGATCGATC ACTATTGTAAATGCAAGTGGAACAGGTGGAAGAAAGTATGTCACCGTGATTGTTATTGTTGTGGTTGGATATGGATACAT TTGGTGGAAGGGATGGAAGCTTCCTGATATGATGTTTGCAACAAAGCGTGGTTTATCTGATGCTTGCACATCTATAGGTA ATCAGCTGGGGAAGGTTTATGAATCAATTGAGGATGCCAAGAAAAAGTTATCTGCAAAAATTAATCGTGTCGATAAAGGT CTAGATGAAAGTCTATCCCTTAGCAAAAATACAAGGGAGGAGATCTCTGTAATACGAAGCGAGGCAGATGCTATGAATGG TGACATCAAGTCAGTTCATGTTGCACTTCATGTTATCGAATCTAAAATCCAAGAAATAGAATGGAACCAGGAGGAAACAA ATAAAGGTGTGGATTGGTTGTGTCAGCGTGCCAAGACTTTGGAAAAAAATAGCAGGACCCCAGAGTATATTCAGGCATCT TCATCCAGTTCTTCCAGGCCGTCCATTGTTGAGCTACCCCCAGATTCACCCTCTTCCCGGGGTGCACAATCAGCTTCTCC CTGGCTATCTCTCGAGCCACCACCTTTTACACCATCAAGGACTGGATCCTTGCCTCCTACTCTGTCAACTGATCCACTAT CTCTGCCGAGTCCTGCTGGGTCTTACCAGAGTAGTCGGATTTCTAAGGAAAGAAATCTCTCCAATGGTACAGAAGCCGAG ACCCCTGGATCTAGTTCTGGCTTGTTTGGGCTGTTTTCAAATGTTTCTGCTTCATTTCTATCAAGAACTCGTAGTGCAAC AGATGCAGTAGTACAAAAAACTCGTACATAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0247600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALSLGKLTILLGAGIAGSVFAKEGRLPDVSGVLSGAWKVATWFKVDSPPTVKKPRNDALMAQVASLQQELQRLGRDGSI TIVNASGTGGRKYVTVIVIVVVGYGYIWWKGWKLPDMMFATKRGLSDACTSIGNQLGKVYESIEDAKKKLSAKINRVDKG LDESLSLSKNTREEISVIRSEADAMNGDIKSVHVALHVIESKIQEIEWNQEETNKGVDWLCQRAKTLEKNSRTPEYIQAS SSSSSRPSIVELPPDSPSSRGAQSASPWLSLEPPPFTPSRTGSLPPTLSTDPLSLPSPAGSYQSSRISKERNLSNGTEAE TPGSSSGLFGLFSNVSASFLSRTRSATDAVVQKTRT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 350 | 350 | 6.0E-119 | – | |
| PANTHER | 1 | 350 | 350 | 6.0E-119 | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 3 | 14 | 12 | - | – | |
| Phobius | 15 | 22 | 8 | - | – | |
| Phobius | 23 | 92 | 70 | - | – | |
| Coils | 57 | 77 | 21 | - | – | |
| Pfam | 91 | 210 | 120 | 7.7E-43 | ||
| Phobius | 93 | 109 | 17 | - | – | |
| TMHMM | 93 | 112 | 20 | - | – | |
| Phobius | 110 | 356 | 247 | - | – | |
| MobiDBLite | 231 | 329 | 99 | - | – | |
| MobiDBLite | 231 | 266 | 36 | - | – | |
| MobiDBLite | 282 | 329 | 48 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0247600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…