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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0247600 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0247600.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | bZIP transcription factor, putative (DUF1664); TAIR: AT1G24265.1 bZIP transcription factor, putative (DUF1664); Swiss-Prot: sp|O75410|TACC1_HUMAN Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HSU5|A0A1J7HSU5_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0247600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55597393..55607526) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTCTATTCACCAAGACACTGAGACAGACACCGCCACTCCAAAAACTAGGGTCGATCGAGGAGAAAAGGGTTTCGTTTCG TTGGTCGTGTACCATTTTGTTGCCTTGTTCCCCAATTCTCACTTCGGCGTTCTCGTTCTGCCACATCGCCGGAGCTCTAA ACGCCGCCGTTTCACCCTAAATGCTTCGCCGCAGACTGCACCACTAGTGGTTGGTTTCCGCCGGTGCTCGCTCGCTCGCT CACTGGCCAACACACATACACGCGCCGATGGCTCTTTCACTCGGGAAGCTCACCATCCTCCTCGGTGCAGGTCTTCATCA CTCACTCTTCTGATCCCTAGCTTCGATCGTTTTTTTTTCTCCCAATTTTGTTGTTCCCTAAACTCATGCAATCATGGTTA TGGAATTCTTGATAAATTGGTTTTGATTGATGGAGATGTGACTTCAGTGTGAATGTTTGTGTGTTTAGGCATTGCTGGTT CGGTTTTTGCGAAAGAAGGGCGCTTGCCGGATGTCTCTGGTGTTTTATCTGGTGCTTGGAAGGTTAGTTGTTTTGGTGCT GCAGTTTTTGTTGTTCACTGTATGTGGGTGAGTGAGCTTATGGTGAAGGATGTGTGCGTCTATTGTGGTGATGATTGTAG AGATTGAAAGATATAGCCATTCGAATAGGTCCGGTTTCATGTGTTAAATACAATTTTCCTCTTTTTGATGTTCTAAGTAG TATGTTTAAGATGCTGATTATGATAAGAGAAGTGAAGTTATGGGGGTTTAGTTTGTAGTTATGTTGAATGTATATGAGTA CCGGTAAAAGTAGGGGACCTATGGGGTTCCTTGATCCTTCTAAATGAATTTAGTTTGGTAAGTAAAATGAGTATGACTTG AGAAAGGAAAGCATAACTTTTTCCTCTTTATGTTGGCATTTAAACATAGGCTGCAATGCTGGACTTTAGATAAGGGGAAA ATATTGAAGAAAATGTTCATCTTGGAGTTCGATTTGATTCTATTGATACACAGTAAATCCGTGAAAAACATATAGGGTTC AATAAATGGCTATAACACTCTTTGATTCGTCAAGACTTCTCCACCTGTGTAATGCTACCATATATCTTATCTTATTAAGA TGCATTAGATGTTTATTAAATTTTTCATAAAGGCTTGTGCCTCTTGATTTTGTCTTTTATGTGCTGGTTAAGTTCAGAAC TCTGCTTGTGCTTAGGGATGTAAACGAGTTAAGCTATCCATGATTTATTCGAGCTCAACTTGTTAAATGCTCAATCAATC CTGTTTGTATGACTCAACAAACAAGTTCAAGCTTGAGCTTGGGCTCAATTATATATATTAGATAAGCTCAAGCTTTATAG GTTTGTCATTAAAAGCTCATGAATAGCTCGTGTGCTTGTGTCACACAGATACAAATGTATGTATGTGTATATGCATTTGT GTAATCAAGTAGAGGGCGTTTTAAAGGAAATTACTATACTAATAATAAGTTGAAAAATTACTATTTCATTATTTCTTTGT TCACTAGGTAATGTGTTGAACATTTTTGTGGGCATTGAAATCTACTTTTGAATTTCTTTTTGTAATAGCCAGAGATTATG AGTTTTTCATGTAATAGCTTATGGATGCAAAAAATAATGTATATTTTCTCCGTTTTATAGCATTTTTTATGTCATATTCT ATCATGAAGATGTCAACTAAATACTAAATAAAATGAAAGAGAATAATCAAGCCATAAACAAACAAAACAGGACTAGCTCA AGTTTCTTAAAACAAGCCAAAGGAAAGCTTTAAATTCGTGTTGTTTAAATAAATGAACCATGCTTGAGTAGCTCTTTCTC CTTCACGACCCAAGCCTTAGCTTCAAATGCTAGGATTGTCTCAGCTCATTTATATTGTGCTTTTCTTGGCAAAAATTCTA GAGGCTTCTGGTTCATGCCCCGGGTAATAAGCTGCGTGAAAATGCCGGAAGGGAGAGCTTCAGTGGAAGATACATGTGGT CTAGACTAAAAAAAAGTACAATTTGTAATCCGAGGGATCTTGGTTAAGTAGGAGTGTGATGAAATATATGCCAATATAGA GTGAGTAAGATGCAAGATAACAATAACCATGTTTTGATCTGGAGATTAATGGGCATGGCACATATTGGATTCAAGTTATA TGGATGAAAGGTAGAAATGCTTTTGGCATAATTTGTGATTGTAAAGTGTCTATAAAACTCAAAAGGAGAGTTTTGCTGGA CGGCTTTAAGATAAATGATGGTCTAGTAGTGAACGTTGGCTAGTGAAATGTTCTGTTAACCAGAGCCGAAAAAAATGAGC GTAGCATAGGTAAGAATGCTAAGGTGGGTGAGTAAGGTAATAATATGAACTAAAGTACTCAGGAGAAAGTTAGAATCATA TCTGTTAATGAGAAGGTTATGAAACTTGCCTAAGGTGGTTTCATCATATGAGAAGACCAATAGAGGCTCCACTGAGGAAA ATGGATCAAGTAAAACTTATGGAAGATAGTTTAATTAAAACAGGAGGATAAGACCTATTAAAACATTAGGAGAAACTATT CAGAGAAAAGTAAAAGACATTGTTATAAATATTTTTACTTAATCATTGTGATTCTCTTATAAGTCAATGGTGTTGATCGA TCCGTATGTATAGCTGATTCCACTTTTCAAGATATGGTTGGTTGTTGGATGTTCTTCAGATGTTCAGTCTCATTCCTTCA ATTTATGCTTCATCTTAAAAACCTCAAGTTTGGCATTATTCAGATGTTATTATTATTTATTGGTTATTGGGTCCAAATTC CTGTAATATACTGAATATGTGGTAGCTGGCATTTACTTTGTAACTAACGGTGCTGGATCTATACTGATTATAGGCTTTTT TTCTTCGGGGCAGGTTGCTACGTGGTTCAAAGTCGATTCTCCTCCAACTGTTAAGAAGCCACGTAATGATGCTTTGATGG CTCAGGTCTGCATGTTGCTGTTGTTTTTAATTATTGATTAGATTTACTTTTGATTAAGAATAATTCCTAGTATAGTTGGG TCTAGTCTCATGCAACCTGCCTAACATCACTTAGATAATCTTGTATTTTTCTTGATTTCTGAGCTTATGCATATGGTTGT ATTACTTGTATCTGTGTCTTATTCATAAATCATGACAAGTAAAGTTATATTTTAACATCTTATATATATGCTAATATACA TAATATATGTGCCAACCTCAACAAGTACGTGTTTGGTACTTGCGATTGACTTCATTTGCATGTTTCAAAAAGTGAAACAG TTCACTCAAGTATTATGGTAGGTTGTATCTGTACTAGTTTTTCTTCTTACACCATTCTGAAGTAGGTACTAATCTATAAT TTACTAAAACTTATATAGTTTGAAATATATAGCATCATACAAAGTCATAAATATGACAGAAACATGTTTTGAATGTTGTT CTGACAAAGGAGAGACATGGCTTCATTGCTACAGACATGCTACTATTAAGGAGTTATGATCTATAACTGTTAGCGGATGA CAATCCAGTATGACCTGAGCTTTACAAGATTGTTGCAAAATCCTATTTGTTAATTTTTAGGCGTTTTGAATCCTCTAGGA CCGTCAGCTGCTAGTATGATATGATTATTTATAAGTTGAGTTGACAACGGGAATTTGACCTTGTAAGATGATATTGCTAG CATTCGTTTTTTGAGGGTGGGGGCGGGTGGAATGGAATCTTGTTTCCATTTAGGTAATTTATTTATTAAAGCAGATGCTG GGGCTGCTGCTTGGGGAATAGATGAAGTTCCTCAAACTACTCTTTTCAATGTTATCTATGTGATAAAACTGGCACCAAGC 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ATTCACAGGAGACTTGTTAATAGTTGCTATGTATTGTTTTGGAAAAGGGATGGATGTGTGTGTTAGTCATAACTTCATAA GCTGTATATAATTTTCCAGCTGTTAGCTGCATATTTTCTTACATTCAATGAATTCAGTAAAAGCATGATGATATTTCACA GTTTACGCAGAAGGTGTTAAAAGTGTCAGTAGTTAAAATAGAATTGCTATTTCTCCTTCTTGAATTGACTTCTAAAACTT AAGTAATATGAGGTTAATTGAAAATGCTGATTAGACCTTTGATGTACAGGTTGCCAGCCTTCAGCAGGAACTACAACGTC TTGGTAGAGATGGATCGATCACTATTGTAAATGCAAGTGGAACAGGTTTTGGTTATCTACTCCCTTTTACATTACAGGAG CCTTTTATTCTTTCTTCATGAATTTAAGAGATGCTAAATTTTTTATTTGCAAACTCTGTGATCACTGATTTGGTCATAGA TTATGATTGTGTCCATAATTTTCATAAGTTAATCAAAGTTTCCTTACATCTTATTTTTTGCTATTTTCTGACCTGCTTTG TCTTACAGGTGGAAGAAAGTATGTCACCGTGATTGTTATTGTTGTGGTTGGATATGGATACATTTGGTGGAAGGTAGCAT TTTTTTCTTCTCTGATTTTTTTATTGAGTAACAGGATGTGTTGGTAATACATTCTTGCAGGAAGCTTCTAACTCAATTTT AAGTTTGTGTGCTTTTAATGGGGCCATATGCTATATAGCTACATGATTAGTGTGGTATGCTTGGCTGTTTGGGCTGTTGT GGTTGCTTCCTGGATGAATAACTTGCTCTAATATTCAATTTAACTTAGCCAAACAGCTTTTATCATTCTTTTCTGAGAGT TTGCTTTCCTAACGCAATTCATTTTACATCATCTCATTTTTCTACCAATACTTATTTATGTGATTTGGAGCAGAATCAGT TTTGTGAAATTGGATGATAAAAAAATCCAGCAATTGCTTACTACTTACTTGGTCCGTCAATGTCAATATGTCATAGGTTT AGTTATACTAAACTTCAAGCCAGAGCAGGATGCTCATTTTAACTGAATCTAAGTTTTTTTCTAACAATTTTCTTACCATA ATGGCATAATCTTCCTATCTTCAAGTATGTTCTCCATGAAGATCACTGTTTTATGGCCTTCCTTATTTTTGCAGGGATGG AAGCTTCCTGATATGATGTTTGCAACAAAGCGTGGTTTATCTGATGCTTGCACATCTATAGGTAATCAGCTGGGGAAGGT TTATGAATCAATTGAGGTAATTTCCTTTTCTTACAATATAGTTTGTTCTTCTTACATCATGTTCATAAATTAAAAGTAAA ACACAGGCATTCTCTATTAGTGATGGCATAAAATGTTCTATTAGTATAGCCTTTTTTTTGGCAAAAATAATACAGTCATG TAGATTTATATAAGAGAAGACCATATGAACTTGATTTGGATATTTGTTTTTTTTTATTTATTTATATATTGTGCCCATGT GTGGTACTTCTGTAACACTGCAATCGCGTATACACACAAGATAAATGTCATTGTGGGACATTTTTCAACGACAATATAAA TTTGTCTTGGGTGCATGGTTGGTCATTTTTTAAAAAAAAAGTGTTGGTCATTGGTTATAGTCTACTGAGCTGTAAACAGA CAGAGAGATGAAAATTCAGTTAGTTTCTGTTCTTTATAAAAAGCATTCAAATGGCCCTTCTATGTGGACTTATCTGCAAG GTTCTCTGTAATCTTAATCATGTCTTTTTTTCTGACATAGTTAAGTGCTTGACCTGCTTTTTCATTTTTCATCATGATGC ATGGTATGGTTCTATTATTAAACAAGTTAATTATATCATGTATTTCCCATAAAATTAATTTTGAATAGAACTTTCTGTGT TCTATAATAATGATATTTTGAAGTCTGCATTATGCTCAATTTATTTTTCTGACTTTCTTTTGATATTTAAAAAAATTGCT GATGGTTGTTTTACCATGGAGTATTTGAGGATGCATATTTACTTATCTGTAATGGTTTCAGGATGCCAAGAAAAAGTTAT CTGCAAAAATTAATCGTGTCGATAAAGGTCTAGATGAAAGTCTATCCCTTAGCAAAAATACAAGGGAGGAGGTCAGTATA GAAGTTAGGGTTTATACTTTTGGCTTCTTTACAGTTTAACAACAACATGTATTCTGTTACAGATCTCTGTAATACGAAGC GAGGCAGATGCTATGAATGGTGACATCAAGTCAGTTCATGTTGCACTTCATGTTATCGTAAGTCATTTGCAAGAATTCAG TTATTTCTTTAGTTCTTTTGCTGGATGTTTAACTTAAGCTTGATTACTTCTCAGGAATCTAAAATCCAAGAAATAGAATG GAACCAGGTATAATCTGTTAAATTTATGTCACTGCATTATTTAATTATAATAATTCTTCTTATCTTTTAAGGGGACTGAT TTTGTTTATACCCATGATTTGTTGTTTCTATCTGCCTAGGAGGAAACAAATAAAGGTGTGGATTGGTTGTGTCAGCGTGC CAAGACTTTGGAAAAAAATAGCAGGACCCCAGAGTATATTCAGGCATGCACCAGCTTTCATTACAAATGAATTTTTAATT TTTATTGTCTGGCTTGACTTCACAGTCTGATTTTGAGATATGCTTTATATTACTTTCTATATTAATAACATGATTTAAAT TTTATAGGCATCTTCATCCAGTTCTTCCAGGCCGTCCATTGTTGAGCTACCCCCAGATTCACCCTCTTCCCGGGTAATTA TTTTATCAGGCTTAGTTATTACTGCGACTATGTCCTTTTTAAAGAACTGTTATTATACATTTGTTGCGATAGTAATATTT ATTGTAAATTACTTGGAATTATTTTAGTTAACAATATACTTTGTTCATCGGACATGTAGATATTTTATTTAACTATAAGC CATACAATCAATATACAGTCATTAAGTTTGGCTTTATATTTCAGTCACTGCCCCCCCTTTTTCCTTTGAAATTTGTTCCT GTGTTAACTCTAATCTGAATTATGCAGGGTGCACAATCAGCTTCTCCCTGGCTATCTCTCGAGCCACCACCTTTTACACC ATCAAGGGTAACTTCTATAATCATACGGGAATATATAAACAAACAAATAACAATTTATAGCAGAGTTGTTCTGTTATGCT TAATTCCTTATATTTCTAGGGTCCTCATGGTTGAGTTGGTGGATAGGTGGGACCGTGGGACAATGGCAAGTTTGGGAGGA AAAAAACTTTTCACTTGTACATTGTACAACTGAAACATGAGAAGATGGAAAACAAAATGCACTCGTTTTTAACTTCTTTT TTTCCCTCTATTCCAACGTATTTTCAACCTTCCCCTCTTTTTACTACACCTTCCCCTCTTTTTACTACTCAAGCAAAGAA ACCCTGTAATTTTTACAACTCTTCCCTTTCCTTCCCATTCCCTTCCCGTCTTTAAAGAGGGTATTCTCTAAAAATCCTCC AAACAAGGGTGCCACTTTTCCCTTACCTCCCTTGCCTCTCCTCACCTCTCATCCAAACATATGTAGGACATGCAGCGCCT GTAATTGTTGATTGTTCTTAGCTTTTAATTGAAAGTGTTAGCTGCAACCTTGGTATTGTGTGTTTGATGATCTCCTTCCT ACCAACAGACTGGATCCTTGCCTCCTACTCTGTCAACTGATCCACTATCTCTGCCGAGTCCTGCTGGGTCTTACCAGGTC TGATATTTCTCATTTACTTGATTCATTTATGTGCTAACATCAATGATCTAGCTATGCGAACTTATAGTTATGTGCGAACA TCAATGATCTATAAAATGCACTAATGCAACTATCGCCATGCGATATTCCCATATCTCCTTTATAGATGCATGGCTATAGT TGCTTTAGTGCATTTAATAGATCATTGATGTTAGCACATAACTATACATGTTGACAGGTGACACAGCTGACAGAGTTGTT TATATCCATTACTGTTGGAATGAAATATTTTCTTCTCAAACTTCCAAAGCCTAGTTACATAAATTTAATTTATATACATA GACAATGCAAAAGAGCTTTATACAGACAGTCAGACATCATGTTATATCTTGCCATGTTTCTGGTTTGATATTTTCTTATT TTAGTTTATGAGTTTTATTTATGAAGTGGTGGAATATTTTGATTGTACGTATCTGTAAAACTTTTTTGCAATGTCAGTTC ATGAAACTATTTTCATTGTTGTAATTTTTACTTTGTCTTATATTTTTTGTCTGTTTTTTCAGCAGAGTAGTCGGATTTCT AAGGAAAGAAATCTCTCCAATGGTACAGAAGCCGAGACCCCTGGATCTAGTTCTGGCTTGTTTGGGCTGTTTTCAAATGT TTCTGCTTCATTTCTATCAAGAACTCGTAGTGCAACAGATGCAGTAGTACAAAAAACTCGTACATAGCAAGAAGAGGCCT GATTTTTTTGGTCAGCTTTTTAATGGATCCCCACTAAGAACATAGAATATTGGACCTATTGTGGGGGAGAAAAACTTCAC CATTGAGTTTGGCTCCTCAGAAATTGTAGGCACCTTCAATTACAATACAATTACAAGTTTGTCCAAGCCAATTTTGCAGA TATGCTGTTCTGAACAGTTTCAGTAGATTATTATAACTTAAATAAGAGTTTCTCCAATATTCAACTGGGAAAGCCGGAAA AGGTTAAATTATTGGGAATTCCTTGTTCTAGTAGTATTATTTCGAGGATAAAATACAAAATCCTGTTTAGATTCACTTCG CTACTCGTGATTCTTAGGGTGCTTGTGCTTATATCAATGAACACATGTTCTATAAGTGGCTTATTCAGAAGTTTATTGAA ATAAGTTTATAGGTTTAAGCGTTTTTTCTTGAAAACATCAAGTCATGTGTCTTGTATATATATCTAAGGGTGTGTCTTAT AAAGAGATGTTTTTGTATGGGACTATTAAAAATAAATCATGACCTTAGAAGGTAATTAAAACAAGTTTCACATGAATAAT AAAGGAGGGATTCACTTACCCAAAAAAAGATTCTTTAATGTTTCTCAGGGCAGAGGAGTGCAAATTTCAGTTTAAGTTCC TCTCCATGGAGAAGAGTGTGTGTTTTAAATAAAAGATAAGAAAAGTGTAATTGAAGTTTTTCTTAGGGAAGAAGAGAGTA ATTTACTCGTTTTTCTTAAAAACAAATATATATTTAGGCCGTTCGTTTTACAATTTTATCAATACAAATCCGTGTTATGA GGTATTTTTTGTGAGAAGTTACAATGAAATTGAATGGAATAAAATAGTTTCCTA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0247600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCTTTCACTCGGGAAGCTCACCATCCTCCTCGGTGCAGGCATTGCTGGTTCGGTTTTTGCGAAAGAAGGGCGCTT GCCGGATGTCTCTGGTGTTTTATCTGGTGCTTGGAAGGTTGCTACGTGGTTCAAAGTCGATTCTCCTCCAACTGTTAAGA AGCCACGTAATGATGCTTTGATGGCTCAGGTTGCCAGCCTTCAGCAGGAACTACAACGTCTTGGTAGAGATGGATCGATC ACTATTGTAAATGCAAGTGGAACAGGTGGAAGAAAGTATGTCACCGTGATTGTTATTGTTGTGGTTGGATATGGATACAT TTGGTGGAAGGGATGGAAGCTTCCTGATATGATGTTTGCAACAAAGCGTGGTTTATCTGATGCTTGCACATCTATAGGTA ATCAGCTGGGGAAGGTTTATGAATCAATTGAGGATGCCAAGAAAAAGTTATCTGCAAAAATTAATCGTGTCGATAAAGGT CTAGATGAAAGTCTATCCCTTAGCAAAAATACAAGGGAGGAGATCTCTGTAATACGAAGCGAGGCAGATGCTATGAATGG TGACATCAAGTCAGTTCATGTTGCACTTCATGTTATCGAATCTAAAATCCAAGAAATAGAATGGAACCAGGAGGAAACAA ATAAAGGTGTGGATTGGTTGTGTCAGCGTGCCAAGACTTTGGAAAAAAATAGCAGGACCCCAGAGTATATTCAGGCATGC ACCAGCTTTCATTACAAATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0247600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALSLGKLTILLGAGIAGSVFAKEGRLPDVSGVLSGAWKVATWFKVDSPPTVKKPRNDALMAQVASLQQELQRLGRDGSI TIVNASGTGGRKYVTVIVIVVVGYGYIWWKGWKLPDMMFATKRGLSDACTSIGNQLGKVYESIEDAKKKLSAKINRVDKG LDESLSLSKNTREEISVIRSEADAMNGDIKSVHVALHVIESKIQEIEWNQEETNKGVDWLCQRAKTLEKNSRTPEYIQAC TSFHYK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 242 | 242 | 1.2E-109 | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 242 | 242 | 1.2E-109 | – | |
| Phobius | 3 | 14 | 12 | - | – | |
| Phobius | 15 | 22 | 8 | - | – | |
| Phobius | 23 | 92 | 70 | - | – | |
| Coils | 57 | 77 | 21 | - | – | |
| Pfam | 91 | 210 | 120 | 3.3E-43 | ||
| Phobius | 93 | 109 | 17 | - | – | |
| TMHMM | 93 | 112 | 20 | - | – | |
| Phobius | 110 | 246 | 137 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0247600.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…