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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0270300 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0270300.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein MOR1; TAIR: AT2G35630.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94FN2|MOR1_ARATH Protein MOR1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0I414|A0A0R0I414_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0270300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58340141..58359241) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCGTCGGAGGAAGAGAAGCTGTTGAAGGAGGCCAAGAAACTGCCGTGGGAGGATCGCCTCTTCCACAAGAACTGGAAGGT TCGCAGCGAGGCTAACGTCGATTTAGCCTCCCTCTGTGACTCCATTTCTGATCCCAAGGACTCTCGCATCCGTGAATTCG GTCGGTACTTTTGAATTTTTAGGGTTTTTGTGTTTTCCGATTTGGTCTTGATCTCCGGATGGTGGATCTAGTTGCTGGTT TCTGTTGAGATTGTGGTTGTTGTGCTGCATTTTGATTTTGATTTGGATCTTGATGCTGATGTGTTTGTATGTGTGTGTGT TGTTTTTCTCTGAAATTTGTAGGTCCTTTTTTTAGAAAGACTGTGGCGGATTCGAATGCTCCGGTGCAGGAGAAAGCGCT CGATGCATTGATTGCTTACTTGCGAGCTGCAGATGCTGATGCCGGCAGGTGAGAATTTCGTGTGGTTAATTTTTTCTATG CTTTTCATATTTAGTTGCATGCGTTTTTTTTTTGAGAATGAATGAAGTTACCGTTCTGACTTGAGTTTGAATTTGAATTT GAATTTCGGGGTAGGTTCGGTAAGGAAGTTTGTGATGCGATTGTGGCCAAGTGTATGACGGGAAGGCCTAAGACGGTGGA GAAGGCTCAAGCAGTGTTTATGCTTTGGGTGGAATTGGAGGCTGTGGATGCATTTCTGGTACATTTCTTTCCTACTTGGT TTCTTTGGCATTGAGTGGTTTTCCTTCCTGTTTTTTTGGGGGGTAGGTTACTAGGTTGTTGTCGTTTGCTGTTTTAGCTT GGCATTTGTGTCTAGCTGACTATAGGGTTGCTCACATGTTTTGTTCCGGTAGGGAGGCTTATCCTGTTTACCTAGCTTAA TGTATATTTACAGAATACAATGCGTGCCGGGAAAAAAAAAACTTCTGGCAGTTGTAATCACAATGCAAATTTTCAGCCTG 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TTGTGAGGAACTCATCTTTTGATTCATTTGTTTATTTTCTCCTTTTTCTGTAAAAATAAAGTCTCACATTGTTGTAATAT AATGGTGTTGTTTTTGTGTATACTTGAAAACATTATATGATAAGTTAATCGCCTGACTAGTGATTGTCAATACAGGATAA TGCAGATCGGACATCATCCTTTGTCGTCCTAATCAATCTTTTACGTCCTCTAGATCCATCAAGGTGGCCTTCCCCAGCAT CAAATGAGTCATTTGCCTCCAGGAATCAGAAATTTTCTGATTTGGTTGTCAAATGCCTTATCAAGCTTACAAAGGTAACT TTCACAGTCAGCAGTATAATCCTGAAGATCAGATAAATTCTTTGTTTGGGTATTATTCTCTCATTAGTGTGGTGCTGTGT GCCTGTGTTTTGATAAGTTTAATTACATATCGTACTGGTCTAAATAATATTTCCCATTTTAATTGAATCCCGTTATTTTG CCGACTGCATTGAAATAAATTTTCTACATGTTCACTTTATGGAGGCTTTGGTGATTTTTCAGTACTAAGTTAAGTTTAGA GGGACCATTACTAGCTCTGATACCATCTTAGAATTGGGTTTAGGCCTAACTCTACCCCCAAAAGCTAGCTTAGAGGTGAG GGTTGCTTTGACCTTTATAAACACTTATTTGGTCATAGCTGTAGTTAGTGTGAGATTTCTCAAGAGAGAGATCTAGGTCT CTCCCAATGCCCAGTTACAATTATCCCCAAAAGATAATATTTCACACTAACTCTTATTTATAACATTTTCTCAAACTAAC CCAAGCTACCTCAACTAACTAACTATGGGTACCTATCATGTTTGTTGGATATTTAATTAGAAACCAATTTATTCAACTTA TAATAAAGCCGTGCGTAACGGTAAAAAGTTGTTGCCATGTGACTGAGGTCATGGGCTCAAGACCTGGAAACAACCTCCGC GAACCCGCTCATTGTGAGAGCTTGGATGCCCTGGGCTGCGCTTTTTTTTAATATAATAAATAGTTCTATTTAGTGTTTAG AAACAGTGCGTGATATTTAGTATTTAGCCACGTATTGGTAAATTGTATATAATATTTGGCCTCATGAACTGTAGCATGTA ATAGTTTTTTTTTCATTATCAAGAAGAGGTGTTTGCAAGAGCTGTAATGTATTTGCAAAAAATTATCTGGATGGAATTGG TCTTCCAAATACTTGTTGCTCAGTACTATTTTACATACATTTTCCTGTGCTTCAGGTTCTTCAGAGCACCATCTATGATG TTGATCTAGATCGCATTCTTCAAAGTATCCATTTGTATCTTCAAGACTTGGGAATGGAGGAAATTAGGAGAAGGTATAAC TATTGTTGGATATAGTTACTACGTAGTACATACCACTATTTGCTTTTCATTTTCTGACGTTCGATTTTCTTAGGGCTGGT GCTGATGACAAACCCTTGCGAATGGTAAAAACTGTTCTGCATGAGCTTGTCAAGCTTCGTGGTGCAGCTATAAAAGGTCA TCTTTCAATGGTTCCTATTGATACGAAACCTCAGCCTATCATCCTTGCCTACATTGAACTTAATCTTGAGGTATGCATTA ATTTCTTTTTAATTCCATTTTATGGGGGGTTGATTTCTTTATACTTCATATCTATTCTTGATTTCCAGACTTTGGCTGCT GCAAGAATGTTGACTGCATCTGGGCCTGGGGGACAAAACCACTGGAGCGATTCAGCAGCCAATAATTCAGCCTCTGGAAC ACATTCTGCTGATGCCCAATTGAAGGTAACAAACATATGCTTCATAATTTTCGAAGGTTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0270300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGAGCATAAGAATCCAAAGGTTCTCAGTGAGGGAATTTTGTGGATGGTTTCTGCTGTTGAGGATTTCGGTGTATC ACATTTAAAGCTTAAGGATTTAATCGATTTTCTTAAAGAAACTGGGCTGCAGTCAAGTGCAGCTGCTACTAGAAATGCTT CAACTAAGTTCTTGGGTGTTCTGCACAGATTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTTCTTGCTGATGTTAAGCCTGCACTA CTCAGTGCCCTTGATGCAGAGTATGAGAAGAATCCATTTGAGGGGGCATCTGCAATCCCCAAAAGAACTATTAAGGCAGC AGAGTCATCTTCATCTGTGGCGGCTGGTGGGCTGGATGGCTTGCCTCGTGAAGACATTAGTGGAAAGATCACTCCAACTC TCCTGAAGACCCTAGAAAGTCCTGACTGGAAGGTACGTATGGAGTCCGTTGATGCTGTAAACAAAATACTGGAAGAGGCT AATAAGCGCATTCAAGCTACTGGAACTGGTGAGTTATTTGGGGCTCTTAGGGGACGGCTCATTGACAGCAACAAAAACAT AGTCATGGCTTCGTTGACAACCCTTGGTAATGTTGCATCTGCAATGGGACCTGCTGTGGAGAAAGCGAGCAAGGGCACTC TGTCTGACATATTGAAATGTCTTAGTGACAATAAGAAGCACATGAGAGAATGTGTGCTGAATACTTTAGACTCTTGGCTA GCTGCTGTTCATCTTGATAAAATGGTTCCTTATGTTACAATTGCTTTGACGGATTCTAAACTTGGTGCGGAAGGGCGTAA AGATCTCTTTGATTGGTTATCTAGGCATCTTTCTGGGCTAAGTAGTTTTGCTGAAGCTGCGCAACTTCTGAAGCCAGCTT CTTCTGCGATGACAGATAAATCCTCCGATGTTCGCAAGGCAGCAGAGGCTTGCATTACTGAGATACTCAGAGTTAGTGGA CATGAAATGATTGAAAAGATTGTCAAAGACATTCATGGACCAGCGCAAATACTAATTCTTGAGAAGTTGAAACCACATGG AGCTTTTCAAGAGTCATTTGAGCCAGGTAGAGCAGTTTCAGTGGGTGTAACATCGAAAGGTGTTTCAAAGGTTGGGAAAT CAACTGCCAATGGTGTTGCAAAGCATGGAAATAGAGCTGTGTCTTCGCGGGTCGGGGCAACAAAGTTAACCAAGGCTGAA TCAATATCTGTTCAAGATATAGCAGTCCAGTCTCAAGCCTTATTAAATATCAAGGATTCAAATAAGGAAGATAGAGAGAG AGTGGTGGTTCGAAGGTACAAGTTTGAGGATCCACGAATTGAGCAGATTCAAGATCTTGAGAATGATATGATGAAGTACT TCAGAGAGGATTTACATAGGAGACTCTTAAGTGCAGATTTTAAGAAGCAAGTTGATGGACTTGAAATGCTGCAGAAGGCA CTTCCATCCATTGCTAAGGATGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTTTTAAGGTGGTTTGTGTTGCAGTTCTGCAAATCAAA TACAACATGTCTATTGAAGGTGCTTGAATTTCTTCCGGAACTGCTTGACACGTTGAAGGATGATGGGTACTCTTTGACAG AGTCTGAAGTGGCAATTTTTCTTCCATGCCTAGTAGAGAAGTTGGGGCATAACATCGAGAAAGTACGAGAAAAAATGCGA GAGCTGACCAAACAATTTGTTTCTGTATATTCTGCATCTAAATGTTTCCCTTACATATTGGAGGGTTTACGCTCTAAGAA CAACCGAACTCGAATTGAATGCGCTGATCTTGTTGGTTTTATTGTTGATCATCATTCAGCTGAGATTAGCGGGCAGCTGA AGTCATTGCAAATTGTTGCAAGTTTGACAGCAGAACGGGATGGTGAAATTAGAAAAGCTGCATTAAATACACTGGCCACT GGTTATAAGATTCTAGGTGAGGACATATGGAGGTTTGTTGGGAAGCTAACTGATGCTCAAAAAAGCATGTTAGATGATAG ATTTAAGTGGAAGATCCGGGAGATGGAAAAGAAGAAGGAAGGAAGACCAGGCGAAGCAAGGGCCATTTTAAGGCGTTCTG TCAGGGAAAACGGGTCTGATGTCGCAGAGCAAAGCGGAGAAATAGCTAGATCTCTTGCTGGGCCAATATTGAGGAAAAAT ATTGGTCCATCTGATAATACCATTGAGAGACAATTGATGCCTCGTCCTGTAGCTGTTGCTAGTGGCCCCACAGATTGGAA TGAAGCCCTTGATATTATATCTTTTGGTTCTCCTGAGCAGTCTGTTGAAGGAATGAAAGTTGTTTGTCATGAGTTGGCTC AGGCCACTAGTGAACCAGAAGGCAGTGCTATGGATGAGCTCGTTGCAAGAACTTTTGACTTCAGTTTGAGTGGGGCTTCA TCACGGTCTTGTAAATATGTGCTCAACACTCTGATGCAGACTTTTCAGAATAAAAGATTGGCACATGCTGTAAAGGAGAG CACTCTTGATAGTCTGATTACTGAGCTTCTTCTGTGGCTCTTGGATGATAGGGTTCCTCATATGGATGATGGAAGCCAGT TGTTGAAAGCATTGAATGTATTGATGCTTAAGATCCTTGATAATGCAGATCGGACATCATCCTTTGTCGTCCTAATCAAT CTTTTACGTCCTCTAGATCCATCAAGGTGGCCTTCCCCAGCATCAAATGAGTCATTTGCCTCCAGGAATCAGAAATTTTC TGATTTGGTTGTCAAATGCCTTATCAAGCTTACAAAGGTTCTTCAGAGCACCATCTATGATGTTGATCTAGATCGCATTC TTCAAAGTATCCATTTGTATCTTCAAGACTTGGGAATGGAGGAAATTAGGAGAAGGGCTGGTGCTGATGACAAACCCTTG CGAATGGTAAAAACTGTTCTGCATGAGCTTGTCAAGCTTCGTGGTGCAGCTATAAAAGGTCATCTTTCAATGGTTCCTAT TGATACGAAACCTCAGCCTATCATCCTTGCCTACATTGAACTTAATCTTGAGGTATACTTTGGCTGCTGCAAGAATGTTG ACTGCATCTGGGCCTGGGGGACAAAACCACTGGAGCGATTCAGCAGCCAATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0270300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKEHKNPKVLSEGILWMVSAVEDFGVSHLKLKDLIDFLKETGLQSSAAATRNASTKFLGVLHRFVGPDIKGFLADVKPAL LSALDAEYEKNPFEGASAIPKRTIKAAESSSSVAAGGLDGLPREDISGKITPTLLKTLESPDWKVRMESVDAVNKILEEA NKRIQATGTGELFGALRGRLIDSNKNIVMASLTTLGNVASAMGPAVEKASKGTLSDILKCLSDNKKHMRECVLNTLDSWL AAVHLDKMVPYVTIALTDSKLGAEGRKDLFDWLSRHLSGLSSFAEAAQLLKPASSAMTDKSSDVRKAAEACITEILRVSG HEMIEKIVKDIHGPAQILILEKLKPHGAFQESFEPGRAVSVGVTSKGVSKVGKSTANGVAKHGNRAVSSRVGATKLTKAE SISVQDIAVQSQALLNIKDSNKEDRERVVVRRYKFEDPRIEQIQDLENDMMKYFREDLHRRLLSADFKKQVDGLEMLQKA LPSIAKDVIEVLDILLRWFVLQFCKSNTTCLLKVLEFLPELLDTLKDDGYSLTESEVAIFLPCLVEKLGHNIEKVREKMR ELTKQFVSVYSASKCFPYILEGLRSKNNRTRIECADLVGFIVDHHSAEISGQLKSLQIVASLTAERDGEIRKAALNTLAT GYKILGEDIWRFVGKLTDAQKSMLDDRFKWKIREMEKKKEGRPGEARAILRRSVRENGSDVAEQSGEIARSLAGPILRKN IGPSDNTIERQLMPRPVAVASGPTDWNEALDIISFGSPEQSVEGMKVVCHELAQATSEPEGSAMDELVARTFDFSLSGAS SRSCKYVLNTLMQTFQNKRLAHAVKESTLDSLITELLLWLLDDRVPHMDDGSQLLKALNVLMLKILDNADRTSSFVVLIN LLRPLDPSRWPSPASNESFASRNQKFSDLVVKCLIKLTKVLQSTIYDVDLDRILQSIHLYLQDLGMEEIRRRAGADDKPL RMVKTVLHELVKLRGAAIKGHLSMVPIDTKPQPIILAYIELNLEVYFGCCKNVDCIWAWGTKPLERFSSQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 109 | 109 | 6.9E-19 | ||
| PANTHER | 2 | 1004 | 1003 | 8.9E-300 | – | |
| PANTHER | 2 | 1004 | 1003 | 8.9E-300 | – | |
| SUPERFAMILY | 3 | 942 | 940 | 2.1E-45 | ||
| Gene3D | 118 | 346 | 229 | 8.0E-57 | ||
| SMART | 119 | 352 | 234 | 8.1E-39 | ||
| ProSiteProfiles | 133 | 239 | 107 | 10.243 | ||
| CDD | 137 | 239 | 103 | 4.49497E-4 | – | |
| Gene3D | 414 | 671 | 258 | 1.7E-67 | ||
| SMART | 442 | 678 | 237 | 1.7E-52 | ||
| Coils | 545 | 565 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0270300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…