Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0272500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0272500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Cytosine-specific methyltransferase; TAIR: AT1G69770.1 chromomethylase 3; Swiss-Prot: sp|Q94F88|CMT3_ARATH DNA (cytosine-5)-methyltransferase CMT3; TrEMBL-Plants: tr|A0A151T2T3|A0A151T2T3_CAJCA Cytosine-specific methyltransferase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0272500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58595371..58602765) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATTTTCTCCTTCCCGCTCACACCTTCAAATTTTCACCCTCCTCCTCTTCCGCCGTCGCCACCGCCGCTGTGCTACCTC CGGCGTAGTGAACTCCTCATCTTCTGCAACCATGCCTAGAAAGCGCAAAACCCCCACACCCTCCGCCGCTGCATGTGCTT CCTCCGGCGAGGCTCCGAACAAGTCAAGGAGAAAGACGAATCGGAAGAGTTCCGCAGCTGAATCAGCTCCTGCTGCCGTC GAAAAGATCAACGCTGCTGTCGTCAATGACAGTGAAGGAAGTAACACCAGATTCGTCGGAGATCCAGTCCCTGCCGAGGA AGCAAGGCAGCACTGGCCTCACCGGTACCAGGAGAAGGTAGCTTCGTATTATCCTATGATCTGGTTTCTTTGTTGTTTTC TTATATTGTTTATATAAACGATGACTCATGATCATGTTCATAATTTTTGTTTAGTTCATAATTTTAGCAAACATGAAATT TGATATTGTTTTATTCATGGATTTGGATTTTGAAACAGAAGCAATCTGCTAGGTCAAAGTCAAGCAGGTATACATTCTAA GTTTCGCGAATTACATTTTGACATTATGTTATCAGTAAATACTTGTAAATTGTGATGTTCTTCTGATGTTTGTATGCCTT GCATTAGTGATGATGATATTCTCCAAGCTCGTCGGCACTATAGAGAGGCAGAAGTAGATGGGTCTACGCTTTACAAACTT TATGACGATGCCCATGTTAAAGTGAGTTAAAATGTGAATGAAGTATTTGAGTTCATATATGTTTACTATTTGATTTGATT ACCACTCGCTGCATACCCCTATGTTGTATATGCTTGAAATTTGTTGTTGTTGTTGTGATGTTCATGTACTTTTTTGGCTA AGTCTAAGGATGTGTTTGGTTCAATTTTTATATTCAGGCAGAGGAAGGAGATGACAATTACATTTGTAAAATTGTGGAGA TGTTTGAGGCATGTGATGGGACCTTACATTTCACTGCACAATGGTACTATAGAGCAAAAGACACTGTAAGTTATATTATG TTACTTGTTTGTAGATGCTATACGAATACGATATTTAACCAAAGTAATATTGGGTGGGTGCTTATTGAGTTTGATGCTTT GTCTACTTTTCAGGTCATTAAAAACCTTGCCTTTCTTATTGAAGAACCAAGGCGAATTTTTTATTCAGAAGTTAAGGATG ACAATCCACTGGATTGTCTTTTAGAAAAGTTAAACATTGCAAGAGTGACGTTAAATGTATGTTAGCATGTTATGATTATC TTTTGGTTTGCTATCTTTAGTTTTATTTTATATGTAGTATTGTTGCATTTCTTGAATTTGTCCTAATTAAGTAATATTTC AGGTGGATTTGGCGGAAAAGGAGAAAACTATTCCACTATGTGATTATTACTGTGACACCCAGTATATTTTGCCATACTCT ACATTTGTGAAATTTCCACCAGGTTTTATTCTTTCCTTGGACTTTTATTTGATGTTGTCAATTTTTTATTTTTAAGTGAG TCTCATTCAAACTTTTATTCAGAAAGCAAAGAAATTAGTAGTGATACTTCGTCCACAATATCTTCTGAAACCAATGTAAC TGGAAAATCTGAGGTGGACTCTCAACATAAGGATACTTCCAATAGTGAAGAAAAGAAAGATTCAGAGCTTAAGTTGCTAG ACTTGTACTCTGGGTGTGGCGCGATGTCAACTGGTTTATGCCTCGGTGCAAATTTGTCCGGTTCGAATCTTGTTACAGTG AGTCCTTTGCTTCTTTGTAATTGTAGCAATGCAATCCATTGGATTTTTTTGCTTTGGTTTTATTTTGATCTAACCTTAAG CCTTTCTCTTTGAATAGAGATGGGCAGTAGACTTGAGCGAATATGCTTGTGCAAGTCTTAAATTAAACCATCCTGAAACT CAGGTAATTCTGTGTGCTTTTGATTGTAATTTTTTTTTTGAAGCGCTAGTGTTTTTTTGATATAATATTATATTTGAATT CTGAATTCCTCTATTGTTTACACTCCTAATCAGGTTAGAAATGAAAAAGCTGAAAATTTCCTCTCATTATTAAAAGAATG GGAGAAGCTATGTAGTTACTTCTCTTTAGTCCAAAACAAGGTGCCACATAAGCAATATGTGGATCTTTTTAGTGTAGAAG AGGATGATGAGACTGAGAGTGTTGAAAGTAGTGATGAAGATGATGATGAAGTGTTTGAAGTTTTGGAATTGCTTGCTATA CGCTATGGTCATCCAAATGAGGAAAATGAGCAATGTTTATACTTCAAGGTGGTTGATGTTTGACTTTTGTCAATTTTTTT TTTAACTTTATGCTACATTTACTAGTTATTTCTCTACCTTGTGTTCTCTTCTTAAACATGATTATTTTCAATGTTTTTTC TTTCTTTATATCCGTTTTAGGTTCGTTGGAAGGGATATGAATCTGATGCAGACTCTTGGGAGCCAGTTAGTGGTTTAAGG TAAGCTACAATTAGTTTTTCTAATGGCCATTTATTGCGGTTAGTGAAAAAATGTCACAAAAAAAATATGACTGATGATGT AATAATAATTTTACAATAATAATTTGATTATTTTTTCATATCATACTTAAAAAAGCACGTAGAACTTTTACATAGTTGAA TAAAAAATAATATAACAACTGCTCCAGTTGAACAGAATAGAGAAGAACAAGCAGAATTGTATTTGCACAAACACGTGGGT TATGATGAATAGTGGTGCCTTTTGTCTTGTTTTTTTTTTGAAATCACCTTTTGTTGGTTTAAGCTATAGCTGCTATACTG ATTTAAATATTCTTTTTCTCAACAGTAATTGCAAGGAAAAAATAAAGGATTTTGTCACTCAAGGCTTCAAGTTGAATATT TTACCTTTGCCGGTAAGTAGCAAATGATTTTGATAAAATGTCCTTGAAATTATATCATATGTTTAACTATTCCAACACAC AATAAATTCAAGGTGACGTTGATGTAATATGTGGTGGACCTCCATGCCAAGGTATTAGTGGTTTCAACCGCTTTCGGAAC GAAGAGAACCCATTGGATGATGAGAAGAACAAGCAGCTAGTGGTTTACATGGATATTGTACAATATCTTAAGCCCAAATT CGCATTGATGGAAAATGTAGTTGATATTTTAAGATTTTCAAAAGGCTTTATGGGAAGGTATGCTTTGGGCCGTCTTCTTC AAATGAATTATCAAAGTCGCTTGGGAATTATGGCTGCTGGAGCTTATGGGCTTCCTCAATTTCGCTTGCGTGTCTTCATT TGGGGGGCGGCACCTACAGAGGTATTTGATTAGTTTTATGTGTTGCGATTGTTTATGCCTAAACTTCTTGACGAATTTGT TTCTCTTTTAGCATGCATCTTATCCAATTTATGATTATTTTGTTCTTTCCCTTAGCAATTCATCTTTGTTGTGAAGTCTT TTTTGTTCATTGTTGGTGTTGAATTGCATCTTGGTTTAGAATGTGTATAGCAAGTTGATCCTTGGAGCAAACATGCCACG TTTTAATATCACTGCAAAGAATTTTCAGTCTGATAAAATGACAATCACCTTATATATACATAGTTCTCTCATCAAAGTTT GAATTAGCGCATAAGTGCAAAGCTGATTGGTTCTCCATGGAATCAACAACAATGTTGTATTCTATATGGATAAGGACTAG ATATATTGTTCCTTTAGAATAGGATATGATAAAAATTTATTGTTTAAACTTTATTTATAGTTGATTAAGAAACTGTTGAT TAATAATTTTGTTGAATTTTTTACTTAGATTTATATTAAATTGTATTCTTAATGTATTGCAGAAGCTTCCTCAGTTTCCA CTTCCAACACATGATGTTATATTAAGGGGTGTCATTCCTGTGGAGTTTGAGGTATGTGTAGATGGATATAATGTCTTCAA CCACATTTTCTTAGTAGAGTAATGCTAGATTAGTTGTAATATAAAAGCACATCATTTCATATGTGTGTGTGTTGACGTAA TCGTAGGGTGGGTGGCATGTAATTGTGAAAATTTAACTTAATAGTATGTTTTACTTGCTTATAAATTCTATCACAATCTT ATCTTGAATTTTATTCTTTAAATTGCACTCTTCTCCTTTGATGAGCTAAATCTAGATGTCATAATTTGGGTGCGGATCGA CTTGAAATGAAGCTAATTAGTTATAAACTTATAATTTAGCAGTGAAAATTATAAAGTAGATGTGACTTGTGAGGTCCCAT TTATGTTCTACAATAGGTACTTTTAATTCATTGTTAACGGTTATTGATTATGTGATATATAATTGTAATTTAGTACACCT GAAGTTGTTTGTTTACCTTCAAATGTAATGGTTAATTGTTGTATTAAACAACTATATCCTTTCTTCATCTTTTTTTTTGT TTGTTTTAATAGCTTAATTTGAATACTTAAATCACAGAACTTAACATGAAAGACAACATCCTTCAAAATCCTTATTAGTA GTACTTAGTAATTAGTATATTGGAAATTAGTTATTTTGAACTTGAAGCTTGTGATGCCTTGCGACACTCATTAAAGTTTT AGGTCCAAGATTTGATTTAGTGTGTTTACAATACATGCAGATAAACACAGTTGCATATAATGAAGGACACAATGAACAGT TGCAAAGAAAACTGTTGTTGGAAGATGCTATTTCTGACCTTCCTCCGGTATCTATTCATTTTGTTATGATTGTTGTGGAT ATTTTCTTTTCTATTTCTTGCTCTTTAGATTTTTTTTTGGGCTAGCTTACAATAATATATTTTATTTTGTGAATATATTC AGATTGATAATAACGAAAGGCGAGATGAGATGCAATATGATAAGTCTCCCCAGACTGAGTTCCAGAAGTTCATTAGATTA AGCAAAAATGGTAATAGATTATTAAATGTTTGTTTTTGTTTTATATAAAATTAACTGTGTTTGTGCTTGACAAGTTATTT TTTGGAAGCACTAAGGTAAAGTAGTTATTAAATTGATTTATCAACAATTTGATAAATTGTGTGGTTAAGCCTGCTGGTTT GATATGTTTTTTAACCAATGCTTGTATTATACACATTAATATTAAATATGAACAATTTTCCTTTACTAGCTTTTCATTGG GACATGACAAACTAAGTGATTTGTTATTTGTTTAATGGCTGCAGAAATGCTGGGTATTCCAACTAGAAAAAGTTCAAATT CTATGCTTTACGATCATCGTTCACTAAAATTAAATGCAGATGATTATCAACGCGTGTGTCGGATTCCTAAAAAGAAGGTT GTTGTTGATCCTTTTTGCTTTTATTTGTTGCAAAATAAGTTTATTATCCAATGTGTAAGTTTATTTGTTAATAATGAATT TTTTTTTGTTGCTCTTAGGGTGGATGCTTCAGAGATTTACCAGGTGTTCGTGTGCGACCAGATAATAAGGTTGAATGGAA TCCTGATGTAAAACGAGTCTATTTGGGTTCAGGAAAACCATTGGTAATAAGTCTTTTTCATATATATTTTCAGGGATCTC TTTTTGTAATTATGTTTTTAAGTGGATGAAGAGTATCATAGGAATTTGATAATGAATGATCCGACTACTTTAAGTTTAAT GTTTTGTAGATTGCATTATAGAACAAAAATTAGAAATATTTCAATGCTATGTTAAAGAATTGTTTTGGTTATGATATGCC CTTAAAAGAAATTGTGGCCCTGGCATGCTCAACACCACACTTAAGGGGACAGATAAAACAAACTACTACCTACCCCTAAC TCAAAAATTGAATGAAACTCTAAAAATAAACCTCAGTTTCCTCCATTAACTTAATGCTATTAAGTGTTCATTATGTGGTC AAACTTCTAAATTACCACCTGACCCTTCTCTTTCGATTGTTGCCTTAGGTTCCTGATTATGCCATGTCTTTTGTGGGCGG AACGTCATCAAAGTAAGTGTTACACCAAGATTGAGAATTATTGTTTAATGTTATAATTTTGTAGTGAATGCTTTGCATTT CTATTCTCCTAATAAGTTACTTTGGAAATGCTTTATACTCATACGTCAGACCTTTTGCTCGGTTATGGTGGGATGAAACT GTTCCAACAGTTGTGACTAGAGCAGAACCTCATAATCAGGTAAACTTTTCATATTTTAAAGTCTTTGGAATGGTTCTATG GGGAATGACCTAAAATCACAAGTTTTTTTTGTTTGTATTAAAATATTGTGGATTTTAAATTTAAATATTAAAACTAAAAT TAATTCTGAAGCACCAGGTTAAGAAACGTTAGTAACGATAAAGAAGTATGAAAAACCAACTTCGAATGTGTATTATGTGT TGGCTCTTAAGAATCAACATGATTTGTAACCTGTCAGATTTGAATGTTTTATCAGGCAATTCTGCATCCAGAGCAAGATA GGGTTTTGTCAATTCGTGAAAATGCAAGACTTCAAGGTTTCCCCGACTACTATAAGCTATGCGGGCCAGTCAAACAAAGG TAACTCTAGTGTTTCTTATCTTCTGTTAATACAATTTATGTTCATGAAAAGTAGAACAAATTATTGCATGTCAACCGAAA TATATGTTAAATCTGTAAGGTTTGAGAATCTTGTCATGAAGAAAACTTCAAAAATTGGAAAATAATCTCTTCACACCCGT TTCCATTCCACACCTATAGGGATATAAGAATAGAAGAGATGTTGAATCTACAATAGTACTGAACCTATGCAGTGCTTCAC ACAAAGACACAGTGGAGAGCAATCACACACAGAAACTATCAAGAAGAGAGAAGAAAATATTTTTTATATTAACTCTTCTA ATTGTTGACAATGCATAATACACTTTTTATAGGCAGTGGTGGTTTACAACCTTAGAACTACCAACTACCACACTAACTAA CATAGCAACCATGAAGTTGAATTACATCACAACACCCTCCCTTAATTTAGTTTCTCTAAAGTCTAAACACTTAACACCTA GCTTACTTCTATGCTCTTCAAACATGTCTTACTTCGATGGTTTGTTAAGATATCTACAACCTGAATTAATGATTGTGTGT ATTTCTCAGTTTATATCCTGTTTTTTTAATTCTAGGACATTCCTAAACGTTTGGTATGGTTTTAGGTACATTCAAGTTGG GAATGCAGTTGCAGTTCCGGTGGCTCGAGCTTTAGGGTATACTTTAGGTCTTGCCTTTCAAGGTGCAGTTGGGGATGGTC CACTATATAAATTAGCTGATGGATTTCCCATGAATTTCCCATCTTCATCATCTGAAGAAAATGTGTAATGTTACATTAAT TCTGCATGTGTTTGGACAAGTACTATTTCGTTGATGTTTGACCTATTTGGTTGTTGTTTGGAAACATTGTCAGTACTATA TTCATTATTATAATTCATTTTCATTTTGAAAATAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0272500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATATTGTACAATATCTTAAGCCCAAATTCGCATTGATGGAAAATGTAGTTGATATTTTAAGATTTTCAAAAGGCTT TATGGGAAGGTATGCTTTGGGCCGTCTTCTTCAAATGAATTATCAAAGTCGCTTGGGAATTATGGCTGCTGGAGCTTATG GGCTTCCTCAATTTCGCTTGCGTGTCTTCATTTGGGGGGCGGCACCTACAGAGAAGCTTCCTCAGTTTCCACTTCCAACA CATGATGTTATATTAAGGGGTGTCATTCCTGTGGAGTTTGAGATAAACACAGTTGCATATAATGAAGGACACAATGAACA GTTGCAAAGAAAACTGTTGTTGGAAGATGCTATTTCTGACCTTCCTCCGATTGATAATAACGAAAGGCGAGATGAGATGC AATATGATAAGTCTCCCCAGACTGAGTTCCAGAAGTTCATTAGATTAAGCAAAAATGAAATGCTGGGTATTCCAACTAGA AAAAGTTCAAATTCTATGCTTTACGATCATCGTTCACTAAAATTAAATGCAGATGATTATCAACGCGTGTGTCGGATTCC TAAAAAGAAGGGTGGATGCTTCAGAGATTTACCAGGTGTTCGTGTGCGACCAGATAATAAGGTTGAATGGAATCCTGATG TAAAACGAGTCTATTTGGGTTCAGGAAAACCATTGGTTCCTGATTATGCCATGTCTTTTGTGGGCGGAACGTCATCAAAA CCTTTTGCTCGGTTATGGTGGGATGAAACTGTTCCAACAGTTGTGACTAGAGCAGAACCTCATAATCAGGCAATTCTGCA TCCAGAGCAAGATAGGGTTTTGTCAATTCGTGAAAATGCAAGACTTCAAGGTTTCCCCGACTACTATAAGCTATGCGGGC CAGTCAAACAAAGGTACATTCAAGTTGGGAATGCAGTTGCAGTTCCGGTGGCTCGAGCTTTAGGGTATACTTTAGGTCTT GCCTTTCAAGGTGCAGTTGGGGATGGTCCACTATATAAATTAGCTGATGGATTTCCCATGAATTTCCCATCTTCATCATC TGAAGAAAATGTGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0272500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDIVQYLKPKFALMENVVDILRFSKGFMGRYALGRLLQMNYQSRLGIMAAGAYGLPQFRLRVFIWGAAPTEKLPQFPLPT HDVILRGVIPVEFEINTVAYNEGHNEQLQRKLLLEDAISDLPPIDNNERRDEMQYDKSPQTEFQKFIRLSKNEMLGIPTR KSSNSMLYDHRSLKLNADDYQRVCRIPKKKGGCFRDLPGVRVRPDNKVEWNPDVKRVYLGSGKPLVPDYAMSFVGGTSSK PFARLWWDETVPTVVTRAEPHNQAILHPEQDRVLSIRENARLQGFPDYYKLCGPVKQRYIQVGNAVAVPVARALGYTLGL AFQGAVGDGPLYKLADGFPMNFPSSSSEENV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 345 | 345 | 2.5E-183 | – | |
| Gene3D | 1 | 117 | 117 | 1.8E-43 | – | |
| PANTHER | 1 | 345 | 345 | 2.5E-183 | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 325 | 325 | 30.373 | ||
| Pfam | 2 | 317 | 316 | 2.6E-27 | ||
| SUPERFAMILY | 2 | 318 | 317 | 7.75E-51 | ||
| PRINTS | 8 | 22 | 15 | 1.7E-5 | ||
| PRINTS | 54 | 67 | 14 | 1.7E-5 | ||
| Gene3D | 118 | 284 | 167 | 1.2E-78 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0272500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…