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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0280500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0280500.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exocyst complex component, putative; TAIR: AT1G76850.1 exocyst complex component sec5; Swiss-Prot: sp|Q8S3U9|SEC5A_ARATH Exocyst complex component SEC5A; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HXP8|A0A1J7HXP8_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0280500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:59553414..59568956) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTTTTTCTTACACAGTGACAATTTGACAAAAAAAATACATTGAAATTGGAAGAGTCTTCTTTGAACAATCGGTGAAAAT CAAACAATACACATACAGTGAAGAATTGTATGACTCAGATCTAAAACTCACCATCGCGATTCTTCTCTCCTTCCCATCGA AGAAGAAGAAGCATCGTCACCAGCAATGTCAAGCGATAGCGACGAAGACGAGCTCCTTCAGATGGCGTTGAAGGAGCAAG CCCAACGAGATCTCAACTACGGCAAATCCTCCTCCAATTCCCGCAAGCCCGTCGCCAACTACGTCCAACCACCTTCTTCT CAGCCCAAGCGCCCCGCGCCTCAGGCCGCCAAGTCCGCTCCCAAAGGAAGAGTCGCCGATGACGACGATGATTCCGAAGT GGAGCTGCTTAGTATATCTAGTGGTGATGAGGATAATGCTAGAGATCCGGTTGCTCCGTCTAAGAGCCGTGGTGGTGCTG GTGGTAGCGGAAGGCAGCCGTCAAGGGATGAGGATCGGACTTGGGATGGTGAGGAGCCTAGTCGATGGAAGCATGTTGAT GAGGCTGAGGTATGCTGTGCTTTCTGATTTAGGGTTCATTTCGTATATGTCACACTTTACTCTCTTGCTTTTTTCCCCAA TTTGTATGATAGGAAGTTTTAACCTAGATAAGATAGAGGCTAGAGCTGAAAATTGTAGATACCAATAGTGTAGCAATGTT GCAAGTGCCTTGGTCAGTAGTAGAAAATGATAGGAAATCAGAAAGAGAGGAATCCATAGTCATACTTCACTCTCTGACTC TGTAATCTTGCTGATGACTAGAATGTTGAACTGTTGTGATTAGCTATTTGGGGGTTCTATTCAGAATTTGGATGTCAAAG CTTTAGGGTGTGTTTGGGTAATTAACTTACTTAAATGCTTATTCATTAGCTAGTAAAAGAGCTTATAGGTAGATCGTAAG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0280500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCAAGCGATAGCGACGAAGACGAGCTCCTTCAGATGGCGTTGAAGGAGCAAGCCCAACGAGATCTCAACTACGGCAA ATCCTCCTCCAATTCCCGCAAGCCCGTCGCCAACTACGTCCAACCACCTTCTTCTCAGCCCAAGCGCCCCGCGCCTCAGG CCGCCAAGTCCGCTCCCAAAGGAAGAGTCGCCGATGACGACGATGATTCCGAAGTGGAGCTGCTTAGTATATCTAGTGGT GATGAGGATAATGCTAGAGATCCGGTTGCTCCGTCTAAGAGCCGTGGTGGTGCTGGTGGTAGCGGAAGGCAGCCGTCAAG GGATGAGGATCGGACTTGGGATGGTGAGGAGCCTAGTCGATGGAAGCATGTTGATGAGGCTGAGCTTGCTCATAGGGTTC GTGCAATGAGAGAAACGAGGACAGCACCCGTGGCTCAAAAATTTGCTCATAAAATTGAAAGGAAAGGTTCTGCATTGGGT AGAAAGGGGCTTACCTACTTACAGTCATTCCCTCGTGGCATGGAATGTGTTGATCCACTGGGATTAGGGATCATAGACAA CAGAACATTAAGGTTGATCACTGAGTCTTCACACAGTTCTCCTAAGACTGAAAAAGATAATGAGGATAGCGCCCTTCGTG AGAAATTGCTGTATTTTTCGGAGAATTTTGATGCACAGTTGTTCTTATCACGGATACACAGTAATACAAGTGCTGCTGAT CTGGAGTCTGGTGCCCTTGCTTTGAAAACGGATTTCAAAAGTCGTACTGAGCAGAGAAAGCAGTTGGTGAAGGACAATTT TGACTGCTTTGTCTCATGCAAAACCACAATTGATGATATTGAGTCAAAGTTAAGACGAATTGAGGATGACCCTGAAGGTT CTGGGACTGCCCATTTGTTTAATATTATTCAAGAAGTTAGTTCGCAGGCCAGTCATGCTTTGAAGCCTTTATTTGAGAGA CAGGCTCAAGCAGAAAAAATCAGGAGTGTACAGGGAATGCTACAGAGGTTCCGCACGCTTTTCAACCTACCGAGCACTAT CCGTGTTAGCATTAGTAAGGGTGAATATGATTTGGCAGTCAGGGAATACAAGAAGGCCAAGTCAATTGCTCTTCCCTCTC ATATTCAGGTCGGGATCCTGAAACGTGTTCTCGAAGAGGTTGAAAAAGTGATGAATGAGTTCAAGTCTATGCTTTTCAAG TCTATGGAAGATCCCCTAATGGATCTTACAAGTCTTGAGAATACTGTGAGGTTACTGTTGGATTTGGAACCGGAGTCAGA TCCAGTATGGCATTATTTGAACATACAGAATCAGAGAATTCGTGGTTTGCTTGAGAAGTGTACTTTAGATCACGAGGTCA GAGTGGAAAATTTGCATAATGAGTTGCGTGAAAAGGCTCTTTCTGATGCCAGATGGAGGCAAATTCAAGAAGAACTGAGT GAATCTTCAGATGTCAACAACTCTTCTATTAATGGTAATTCCGATCCGGCGGTCCAGTCTCATCCTGTAGACCTAAGTAG TGAAGAGGTTGATGGTTTAAGAGGAAGGTATATCCGAAGATTAACTGCTGTAATCATCCATCATATACCAGCCTTCTGGA AGGTTGCACTCTCGGTTTTCAGTGGTAAATTTGCAAAGTCTTCCCAAGTACCCACAGATTCAAATTCCAATACTTCTGCA AATAAAATTGAAGAAAAAGCTGGAGAAGGGAAATATTCTAGTCATTCCCTTGATGAAGTTGCCGCAATGATATGCAGCAC AATATCACTGTATGGAGTTAAGGTTACTAACGTTTTTCAGGATCTAGAAGAATCAAATGTCCTCCGGCCCTACATGAGTA AAGCCATTGAAGATATATCTAAAGCATGTGTGGCTTTGGAATTGAAAGAAGCTGCACCTCAGATTGCTGTTTCTGCACTC CGATCACTGCAATCAGAGATTATAAGGATTTATGTTCTGAGGCTTTGCTCTTGGATGCGAGCATCAGTTGAAGAGGTTTC AAAAGATGTGACATGGGTTATTGTTTCAATTCTTGAAAGGAACAAATCCCCATATGCAATCTCATACTTGCCTTTAACAT TCCGTTCAGCTGTTGCCTCTGCAATGGATCAGATCCATTCGATGCTTCAGTCCTTAAAGAGCGAGGCAGAAAAATCAGAG GATACATTTTTTCAACTTCAGGAAATTCAAGAATCTGTCAGACTTGCATTTTTGAACTGTTTCCTGGATTTTGCTGGTAA TCTGGAGCGTATTGGAATTGAACTTGGCCAACATAGATCAGAGAAAGAAGGATCCCAGTTACTGAATGGATATACATATG AATTAGAAGAAAATGAACCTTGTGATCTTCAAGGAGGCGTTACTGATCCCCATCAACAGTTATTAATTGTTCTAAGCAAT ATCGGATATTGCAAGGATGAACTTTCTTATGAGTTATATGACAAATATAGACACATATGGCTGCATTCGAGGGGAAAGGA TGAAGGAAACAGTGATGTACAAGATCTTACTATCTGTTTCTCAGGGCTTGAAGAGAAGGTCCTTGAACAGTATACTTTTG CAAAGGCAAACTTGACCAGATCTGCTGCCATGGGTTATCTGTTGAATTCTGGTATTCAGTGGGGAGCAGCACCTGCAGTT AAAGGTGTTCGTGATGCAGCAGTAGAGTTGCTGCATACATTGGTAGCTGTGCATGCAGAGGTTTTTGCTGGTTGTAAACC TCTCTTGGATAAAACACTTGGCATTCTTGTGGAAGGCTTGATTGACACATTCATCAGCATTTTTCATGAAAATGAAAGTC AAGATCTTAGAGCACTTGATACAAATGGATTCTGTCAACTCATGCTTGAGCTTGAATACTTCGAGACTGTATTAAACCCA TATTTTACATCTGATGCAAGAGATTCCTTAAAGTCACTACAAGGATTACTTTTGGAAAAAGCCACCGAAAGTGTGACTGA TGCTGTGGACAATCCAGGACATAATCGCCGGGCAACTCGCGGGAGTGAAGATGCACTTGTAGATGATAAGCAACAAGGAA CATCCATATCACCCGATGAACTCATTTCTCTTGCCCAGCAGTACAGCTCTGAGTTCCTACAATTGGAGCTTGAACGGACA CGCATTAACACAGCATGCTTTGCTGAATCCATTCCTTTGGACTCTGTGCCTGAATCAGCCAAATCTGCCTACTCTCCCTT CAAGAACTCGATGGATTCTCCTAGCAAGAACTACAGAGGTAACTTTAATACTGGATCATCAGGTTTCTCACGGCAGAGAC ATTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0280500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSDSDEDELLQMALKEQAQRDLNYGKSSSNSRKPVANYVQPPSSQPKRPAPQAAKSAPKGRVADDDDDSEVELLSISSG DEDNARDPVAPSKSRGGAGGSGRQPSRDEDRTWDGEEPSRWKHVDEAELAHRVRAMRETRTAPVAQKFAHKIERKGSALG RKGLTYLQSFPRGMECVDPLGLGIIDNRTLRLITESSHSSPKTEKDNEDSALREKLLYFSENFDAQLFLSRIHSNTSAAD LESGALALKTDFKSRTEQRKQLVKDNFDCFVSCKTTIDDIESKLRRIEDDPEGSGTAHLFNIIQEVSSQASHALKPLFER QAQAEKIRSVQGMLQRFRTLFNLPSTIRVSISKGEYDLAVREYKKAKSIALPSHIQVGILKRVLEEVEKVMNEFKSMLFK SMEDPLMDLTSLENTVRLLLDLEPESDPVWHYLNIQNQRIRGLLEKCTLDHEVRVENLHNELREKALSDARWRQIQEELS ESSDVNNSSINGNSDPAVQSHPVDLSSEEVDGLRGRYIRRLTAVIIHHIPAFWKVALSVFSGKFAKSSQVPTDSNSNTSA NKIEEKAGEGKYSSHSLDEVAAMICSTISLYGVKVTNVFQDLEESNVLRPYMSKAIEDISKACVALELKEAAPQIAVSAL RSLQSEIIRIYVLRLCSWMRASVEEVSKDVTWVIVSILERNKSPYAISYLPLTFRSAVASAMDQIHSMLQSLKSEAEKSE DTFFQLQEIQESVRLAFLNCFLDFAGNLERIGIELGQHRSEKEGSQLLNGYTYELEENEPCDLQGGVTDPHQQLLIVLSN IGYCKDELSYELYDKYRHIWLHSRGKDEGNSDVQDLTICFSGLEEKVLEQYTFAKANLTRSAAMGYLLNSGIQWGAAPAV KGVRDAAVELLHTLVAVHAEVFAGCKPLLDKTLGILVEGLIDTFISIFHENESQDLRALDTNGFCQLMLELEYFETVLNP YFTSDARDSLKSLQGLLLEKATESVTDAVDNPGHNRRATRGSEDALVDDKQQGTSISPDELISLAQQYSSEFLQLELERT RINTACFAESIPLDSVPESAKSAYSPFKNSMDSPSKNYRGNFNTGSSGFSRQRH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1093 | 1093 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1093 | 1093 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 122 | 122 | - | – | |
| MobiDBLite | 22 | 44 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 104 | 122 | 19 | - | – | |
| Pfam | 257 | 436 | 180 | 3.1E-46 | ||
| SUPERFAMILY | 330 | 451 | 122 | 4.66E-6 | ||
| MobiDBLite | 478 | 505 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 479 | 501 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 547 | 568 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 547 | 563 | 17 | - | – | |
| Coils | 702 | 722 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 987 | 1012 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 993 | 1007 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1056 | 1094 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 1062 | 1094 | 33 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Exocyst | A protein complex peripherally associated with the plasma membrane that determines where vesicles dock and fuse. At least eight complex components are conserved between yeast and mammals. | ||
| Biological process | Golgi to plasma membrane transport | The directed movement of substances from the Golgi to the plasma membrane in transport vesicles that move from the trans-Golgi network to the plasma membrane, where they fuse and release their contents by exocytosis. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0280500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…