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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0286800 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0286800.1 |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 1; TAIR: AT1G71710.1 DNAse I-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8H0Z6|IP5P3_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1LDC4|I1LDC4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0286800 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:60337920..60351267) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTTCTTCTTTTTCTTTAATTTGATCTTTAGGATACATGCATACATAACAAGGCCACGTGTAGCAATATAGTTGAGTAC TTGAGTCAGACAAGATGGTTGAAAGAGAAACATGTATGATGTATTATTCCATCATTTTCCAATTGCGTTATGTAAACAAG CAAACATTTTCTTTTCACATTTAGAAACATGCTATAAGTGGAAGCTCTGTACTGGAGGTGTCGTTTTTCTAGTACCAAGC TAGGAAATTCAAGATGATCTTCATCATTCACTTATGATTAAGCAAAAGATCAACCAAACCTCTTATCATAGCATGTTACT TTTTGTCTTCCCCCTTTTCCCCTGAAGATCAAAAGCCTGCAGTAGCAGCCAGCCGCAGCTAAAGAAGAAAGATAAAATTA GTCAAATACACTACACTGCTCTGCTTATCTCATCATATGAACAGAGGTAAAATTCTCTTTTTTCAGTCTTAACCTTGATA TATAATCTTCTTGTTTATATTTCTCCTCTTCTATATTAATTGATTTTCATGTTTGAGATCTAGAACTTGTTTTTATGAAA AATTAATGAATAATGTACGTAATTTTAAAATTGAACATGATATGACTTTACTCATCAATCGATCGAGAAAAGGAAAAATG GAAAATGGAATCAGACAAGAAAAATTGAAGTTTTTAAAAGAGTTTTCCCCCTCTTATATATATATATATATATACACAAA TTCAAATCTCAAGAAAAAAATTTATTAGGAGGGACATGCAACCATTTTTCAAACAAGTGACTACATCCGTCCAAGATAAA AGAAAAAAAAAAGATTTTTCGCAAGGGTAAATGTTGTTGGGAAATTCGGAAAGTTATTAACAAAGTTATATTTCCTAACT AAAAAATATTGTTGTGTGTGGTCGCGATATGTTCTGTTGTGAAAAATTTTAGAGCAATATTTGAGATCGTCGTTAGTAAA 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GGAGTATTTTTCATCTGTCTTCTGCTTCTGTTTAGCTGCTGTAATTCTGTTTTTACATCATTACATGTTCTGTCTAAAAG AGTTATAATGATTTAATCAATTCCAATTCATTTTCAGGAGAATAATTTGGTTGGGTGACCTGAATTACCGTATCAACTTG TCATATGAGAAAACAAGAGATCTTATCTCAAAAAAGCAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGATCAGGTAATATTATATAA CCCCATACATGTCATAGTGTACTTGTTACTTATATACCATTCTTGATGCTTCCTCATTGGTTGAAGTTAGATAACTATGC TCCATAGTCCATGCCATTGTTAATTTTTGGTTCTATGAAATGGATTATGAAATGTGGAAGCATCTTAATAAAAAAAGAAC TCAAGTTGTTAATTGACTAGTTTTGACTAGTTTGGCTGTTTAGTATAATGACATCTAATTATGACAGCTTATCAAAGAAA TCCATAAGGGTGTATTTGAAGGATGGTCAGAAGGAGTTTTAAACTTCGCACCAACTTACAAGTATGTGACTAACTCAGAG AAGTACTATGGAGAGGATCCAAAGGTTGGGAGGCGTACACCAGCATGGTATGTTTGAGTTTATTTGAACTAAGATTTTGC TTCCATGTCTGTCATGTATTAACAATTTTGGTCGTGTTTGGAAGAGCTTATTTGAGCTTATCTTATAACATAAGTGCTTA TTCAGGTGTTTGGGTAAGCTTATGACCTACCAATAATTTGTTTTGAGTTTATTTTCATAAGTTGCTCGTGTTAGCCTATG AATAAGCGCTTATATTTACCTATAAGCTATTTATCAATTCAGCTTATGAGTAAACACTTTTTTATGATCTTTTACTGTCG TAAGTGTTTAATTAAGCTTTTTGCCCAAATGCACCATTTGTGTGTCCAAATGCATGCATGATCCTACCGTGTCTTGAATA CACACCCAACAGTCAAAATGAGGCATGTAAGATTGTAAATCAGGATTATTAGAAACATGCTGAGTGACCTAGAAGCTTTC CTTGTAAGGGATAAGATCTTAAACTTCTAAACTTCCCTGGTCCAAATTACATAAATTCCTTTTCCTAATATTTTGTTGGG AACATGATTTTATCTGATACATGATTTTTTTCATTTTCTTTGTAATGTTTGCCATTTACTTTCAGGTGTGATCGTGTTCT TTCATATGGCAATGGAATGAAATTACTTTGTTATGGAAGGAATGAGCTTAATTTTTCAGACCACAGACCTGTGACCGCCA CCTATTTGGCCGAGGTTGAGGTGTTCTCTCCAAGGAAGCTACAGAGAGCACTTACTTTCACCGATGCAGAGATTGAAAAT GAAGAAATCATGACAAATTTTGGCACTTGGAACTAAGCTGCATAATCTGAACAGGTGAATGCTTCATAAACAAGCGATCT TGCTTCCCTGAAGTTTGAATGAACTATAAGTCATAAGCTATAAGTTATAAGCTATAAGCTCAAACGCCACTTAAAGTAGC GTTTTAAAATACGCTGCAACTAAATAAAGAAGCTCGTAACAAATAACTCTACAATAGTTAAATTATTAAGCTCATAAGTT TGTTGAAATGACTAATCAAATACACTCAACTATATTTGACTAAAGTAGTTGATAACCTAGTTGAAAACTAAATAGTAGTT AGTTTTGAGTTGAATGATAGCTGTTAAGCAAATTCATCAGATTAAAAGTTTTTGGTTAAATTTGAGGTTGAACTAGCTAA AGAACATATGCTGCAACTGTTACTTGTGTCTAGGCTTCATGTCTATTAACTTGACTATATTGAACATCTATAAATAACAC ATCTCCATAATCTTTACTTTCCAGTGCAGGGTATGAGTTCTGAATGATGTATTATACTTACTGAGTTGAAGGAGCAACAA 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GGTCACGGTGCCCCTGTATTTTTAGATTCCTAACTTATTCTGTTTCTATGGCTTGTTATTTATTTTATTTCGTGGGTTCT ATAATCTGTTGCCTTCTTTGTTTCTCTAACTTGATACATTTCCAGGGTTTTCTAATTCATCACATCTCTGACTAATTGCA TCTATGGGGTTCTCTAACTTGTAGCATTTCCAAATTACTTTATCCTATGCAATATTTAGGTTCTCTTATTAAAATTTCAA GAAGCGTTATTTGTTTTGCACGTATGAAACTTAATTTCTGTGTATGGATAAAACAAATTCAATAAAGAAGTTGAACACCA AAGTTTAGCTTTCAGAAGTTCAACTTCTAAACTTCTAACGGTCTTGGATGTAACTTAAAAGTGTTGTAGGCAACTGTACC CTCCGATTTTGACCACCCCAAACCCGGCTTAGGTCTGAACCACATTCCTTCTCCTTCAGCATTCAAGGAGAGCTATGCAC AAACCATAACCCCTCCTCCAATCAGGGGTTGTCGTAACCCTCTCCATCTAAATTAATGGCTCAGCCTTATTTAATAGGCT AATCATGGTGTTTGAATGACACCATCAATGTGCCACAAAACTGGTAGAAACCCCAACAATCTAAAGGGCAAAGTGAATCT TTATAAGAGAATTATGAGCCAACATTTGAGATATTTTCATTCACTGTGAATTCTTGACCCTAATGCTAAGTGCTCGATCA ATCCCTTTAGCCTACCTTCGAAATTTGGAGGGAACAACAACAAATTATTTTGAGTGAGCAAATTAAATATCATTTGATAG GTGTCTAAAAAATATCGGGTAAATAGCCAAGTTGGTCCCTGAAAGTGTCCGCCGCCTTCAACTTCGTC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0286800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGCAAGGATCAATCAACAACAAGCAACAGCACTTATGGGCAACCATGGTTATGCGCAAATGGCTTAACTTAGGAAG AAACGAGTCTGATTACAGTGCTGACCCTGATGATGATGATACTGAGGATGACCCTGAAAGTGATTCAGACATTGAAGAGT GTGGAAGACAGTTGCGGTTCGAGGACATCAAAGAGGATGAAGCTCTAGATGAATCAAATGATTTCCTTCCAAGGTTAAGG AGGCAAAAGTCATTAACTTCCAGGTCTCAATACATAAACAAGAAAGAACTAAGAGTAAGTGTTGGAACATGGAATGTTGG AGGAAAACTTCCACCTGATGATCTTGATATTGATGATTGGCTAGGCATTCATGATCCAGCTGATATCTATGTCCTTGGTC TTCAAGAGATTGTACCCTTAAATGCTGGTAACATTTTTGGTGCTGAGGACACTCGCCCTGTTCCAAAATGGGAAAATATA ATCCGAGACACTCTGAATAGAGTTCGATCGATAACACCAAAGATGAAGTCCTTCAGTGATCCTCCATCTCCATCAAAATT TAAACCATCAGAAGATGTCCCTAACATAGAAGAAGAAATATTTGAAAGTGATAGTGACATTGGTGAGGAAGTTCATCCTT TGGATGAAGAACACAACAATGTCTATGATGGAACCTCAGATAAACCAATCACCAATAGTTTACAATCATCAGATGCTGCT GTTATTGCCGACTCTGAAGTGCAAGTTAAACATGTTCTACAGACACAGGTTTCTTATCCCAAGAGTTTGAGTCGGCTAAA TTGTTTCCGCGATGAATATTTATCAGAAAACATAGAAACACCACCTGCACAACCACAACTATCTAGAATGATAAGTGGTT CTGAAAGGATTGGTTTGTGTTGGCCAGAGCCACCACTACATCTTCTACCACAGAGAGTGTTGGAGAGACCAACTTCTTTT AAATCTTTCAAATCCTTCAATGCATCAAAGTCTTTCAGAACATGTCAATCATTCAGGCAAAACATGGATGACATAGGTTT GCTCGGTGAGATTGACCTTGGAGCTTTGATGAAGAGGAAAAGAAGATCATCATATGTAAAGTTAGTGAGCAAGCAGATGG TTGGGATTTTCATCACTGTATGGGTTCGGCGCAGCTTGCGAAAACATATTCAGAATTTGAAGGTGTCAACTGTTGGTGTT GGTGTTATGGGCTATATTGGTAACAAGGGATCAATATCTGTGAGCATGTCCATATATCAGACGCTTTTCTGTTTTATATG CACCCACCTTACGGCTGGTGAAAAGGAAGTAGATGAACTAAAAAGAAACGCTGACATTCGAGAAATACATCAAAGAACCC ATTTCTTTTCAGATATTGGACTTCCCAGAAGCATCCTTGATCATGAGAGAATAATTTGGTTGGGTGACCTGAATTACCGT ATCAACTTGTCATATGAGAAAACAAGAGATCTTATCTCAAAAAAGCAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGATCAGCTTAT CAAAGAAATCCATAAGGGTGTATTTGAAGGATGGTCAGAAGGAGTTTTAAACTTCGCACCAACTTACAAGTATGTGACTA ACTCAGAGAAGTACTATGGAGAGGATCCAAAGGTTGGGAGGCGTACACCAGCATGGTGTGATCGTGTTCTTTCATATGGC AATGGAATGAAATTACTTTGTTATGGAAGGAATGAGCTTAATTTTTCAGACCACAGACCTGTGACCGCCACCTATTTGGC CGAGGTTGAGGTGTTCTCTCCAAGGAAGCTACAGAGAGCACTTACTTTCACCGATGCAGAGATTGAAAATGAAGAAATCA TGACAAATTTTGGCACTTGGAACTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0286800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKQGSINNKQQHLWATMVMRKWLNLGRNESDYSADPDDDDTEDDPESDSDIEECGRQLRFEDIKEDEALDESNDFLPRLR RQKSLTSRSQYINKKELRVSVGTWNVGGKLPPDDLDIDDWLGIHDPADIYVLGLQEIVPLNAGNIFGAEDTRPVPKWENI IRDTLNRVRSITPKMKSFSDPPSPSKFKPSEDVPNIEEEIFESDSDIGEEVHPLDEEHNNVYDGTSDKPITNSLQSSDAA VIADSEVQVKHVLQTQVSYPKSLSRLNCFRDEYLSENIETPPAQPQLSRMISGSERIGLCWPEPPLHLLPQRVLERPTSF KSFKSFNASKSFRTCQSFRQNMDDIGLLGEIDLGALMKRKRRSSYVKLVSKQMVGIFITVWVRRSLRKHIQNLKVSTVGV GVMGYIGNKGSISVSMSIYQTLFCFICTHLTAGEKEVDELKRNADIREIHQRTHFFSDIGLPRSILDHERIIWLGDLNYR INLSYEKTRDLISKKQWSKLIEKDQLIKEIHKGVFEGWSEGVLNFAPTYKYVTNSEKYYGEDPKVGRRTPAWCDRVLSYG NGMKLLCYGRNELNFSDHRPVTATYLAEVEVFSPRKLQRALTFTDAEIENEEIMTNFGTWN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 364 | 364 | - | – | |
PANTHER | 9 | 618 | 610 | 8.1E-282 | – | |
PANTHER | 9 | 618 | 610 | 8.1E-282 | – | |
MobiDBLite | 28 | 53 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 33 | 50 | 18 | - | – | |
Gene3D | 76 | 179 | 104 | 9.4E-16 | ||
SUPERFAMILY | 77 | 604 | 528 | 1.36E-66 | ||
SMART | 318 | 593 | 276 | 4.9E-45 | ||
Gene3D | 325 | 616 | 292 | 1.2E-85 | ||
Phobius | 365 | 382 | 18 | - | – | |
Phobius | 383 | 621 | 239 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Biological process | Phosphatidylinositol dephosphorylation | The process of removing one or more phosphate groups from a phosphatidylinositol. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0286800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…