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LotjaGi5g1v0286800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0286800
Transcript ID LotjaGi5g1v0286800.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 1; TAIR: AT1G71710.1 DNAse I-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8H0Z6|IP5P3_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1LDC4|I1LDC4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0286800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:60337920..60351267) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTTTTCTTCTTTTTCTTTAATTTGATCTTTAGGATACATGCATACATAACAAGGCCACGTGTAGCAATATAGTTGAGTAC TTGAGTCAGACAAGATGGTTGAAAGAGAAACATGTATGATGTATTATTCCATCATTTTCCAATTGCGTTATGTAAACAAG CAAACATTTTCTTTTCACATTTAGAAACATGCTATAAGTGGAAGCTCTGTACTGGAGGTGTCGTTTTTCTAGTACCAAGC TAGGAAATTCAAGATGATCTTCATCATTCACTTATGATTAAGCAAAAGATCAACCAAACCTCTTATCATAGCATGTTACT TTTTGTCTTCCCCCTTTTCCCCTGAAGATCAAAAGCCTGCAGTAGCAGCCAGCCGCAGCTAAAGAAGAAAGATAAAATTA GTCAAATACACTACACTGCTCTGCTTATCTCATCATATGAACAGAGGTAAAATTCTCTTTTTTCAGTCTTAACCTTGATA TATAATCTTCTTGTTTATATTTCTCCTCTTCTATATTAATTGATTTTCATGTTTGAGATCTAGAACTTGTTTTTATGAAA AATTAATGAATAATGTACGTAATTTTAAAATTGAACATGATATGACTTTACTCATCAATCGATCGAGAAAAGGAAAAATG GAAAATGGAATCAGACAAGAAAAATTGAAGTTTTTAAAAGAGTTTTCCCCCTCTTATATATATATATATATATACACAAA TTCAAATCTCAAGAAAAAAATTTATTAGGAGGGACATGCAACCATTTTTCAAACAAGTGACTACATCCGTCCAAGATAAA AGAAAAAAAAAAGATTTTTCGCAAGGGTAAATGTTGTTGGGAAATTCGGAAAGTTATTAACAAAGTTATATTTCCTAACT AAAAAATATTGTTGTGTGTGGTCGCGATATGTTCTGTTGTGAAAAATTTTAGAGCAATATTTGAGATCGTCGTTAGTAAA 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GGTTTGTTTTAGAAATGTAGAAAACTTAGTTTATATGTTGGTATTTCTCAATCCTCTAATATCTGGAATATTTTGGTGTA AATTTGTGTGTTCAGAGTAAGTGTTGGAACATGGAATGTTGGAGGAAAACTTCCACCTGATGATCTTGATATTGATGATT GGCTAGGCATTCATGATCCAGCTGATATCTATGTCCTTGGGTAAGTTCTACACCTCTAATATTGTACTTCCTCCGTTCCT AAATATAAGACATATTCCAAAAAATTGTGCTTATTAAGAAGACGCTTAATCCGACTAATTTGTGTATTGATTTTTAAAAA ATGCATACATTCTTCTCTATTTACCCTTTGTCATTTTCTCTCACTAATAATCATTGCATTCATAGTTAGTTGGATTAGTA GCAATTAATGGTAGGTGGTAACTTTGGAATTGAAAACATACAATTAATGTGAGGGGTGAATATGGAAGAGTACAAAACCT TTTGTTAGATTATTGTAAGAGGTCTTATATTTAGGAACATGAAAATTTTGAAACTAGGTCTTCTAATTAGGAACGGAGAG AGTACTTATGTACACCTCTTATTTTTTTGTTTGATTATAATTGCAAAAATATTTTTCTTTTTAGTAGCTAAACTCACAAC ATTTTCAAAATAATCATTTTTCTAATATGAAGAAAGATTTTGGAAAATTTAGAAGAAATGAAAATTTAATTTTTATTACT TTCTTATATTTTTCAAAAGTTTAAATAAGTTATTTAAAAATAGTAAAGTTTAGTGAAAAATGATGATTAAATAAAAGAAA ATTTGATTTAAAACACATTAAATTCAGTTTTTTTTTTAATTTAGAAATTAATTTAATTTGTAAAAATTACTTTAATAGTG ATATGATGATTTGGTGAAATTGATTGATTTAAGGAATATTAATGAAAGAAATATATCTCTTAAATTATGATTTAATATGA 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GGAGTATTTTTCATCTGTCTTCTGCTTCTGTTTAGCTGCTGTAATTCTGTTTTTACATCATTACATGTTCTGTCTAAAAG AGTTATAATGATTTAATCAATTCCAATTCATTTTCAGGAGAATAATTTGGTTGGGTGACCTGAATTACCGTATCAACTTG TCATATGAGAAAACAAGAGATCTTATCTCAAAAAAGCAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGATCAGGTAATATTATATAA CCCCATACATGTCATAGTGTACTTGTTACTTATATACCATTCTTGATGCTTCCTCATTGGTTGAAGTTAGATAACTATGC TCCATAGTCCATGCCATTGTTAATTTTTGGTTCTATGAAATGGATTATGAAATGTGGAAGCATCTTAATAAAAAAAGAAC TCAAGTTGTTAATTGACTAGTTTTGACTAGTTTGGCTGTTTAGTATAATGACATCTAATTATGACAGCTTATCAAAGAAA TCCATAAGGGTGTATTTGAAGGATGGTCAGAAGGAGTTTTAAACTTCGCACCAACTTACAAGTATGTGACTAACTCAGAG AAGTACTATGGAGAGGATCCAAAGGTTGGGAGGCGTACACCAGCATGGTATGTTTGAGTTTATTTGAACTAAGATTTTGC TTCCATGTCTGTCATGTATTAACAATTTTGGTCGTGTTTGGAAGAGCTTATTTGAGCTTATCTTATAACATAAGTGCTTA TTCAGGTGTTTGGGTAAGCTTATGACCTACCAATAATTTGTTTTGAGTTTATTTTCATAAGTTGCTCGTGTTAGCCTATG AATAAGCGCTTATATTTACCTATAAGCTATTTATCAATTCAGCTTATGAGTAAACACTTTTTTATGATCTTTTACTGTCG TAAGTGTTTAATTAAGCTTTTTGCCCAAATGCACCATTTGTGTGTCCAAATGCATGCATGATCCTACCGTGTCTTGAATA 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GGTCACGGTGCCCCTGTATTTTTAGATTCCTAACTTATTCTGTTTCTATGGCTTGTTATTTATTTTATTTCGTGGGTTCT ATAATCTGTTGCCTTCTTTGTTTCTCTAACTTGATACATTTCCAGGGTTTTCTAATTCATCACATCTCTGACTAATTGCA TCTATGGGGTTCTCTAACTTGTAGCATTTCCAAATTACTTTATCCTATGCAATATTTAGGTTCTCTTATTAAAATTTCAA GAAGCGTTATTTGTTTTGCACGTATGAAACTTAATTTCTGTGTATGGATAAAACAAATTCAATAAAGAAGTTGAACACCA AAGTTTAGCTTTCAGAAGTTCAACTTCTAAACTTCTAACGGTCTTGGATGTAACTTAAAAGTGTTGTAGGCAACTGTACC CTCCGATTTTGACCACCCCAAACCCGGCTTAGGTCTGAACCACATTCCTTCTCCTTCAGCATTCAAGGAGAGCTATGCAC AAACCATAACCCCTCCTCCAATCAGGGGTTGTCGTAACCCTCTCCATCTAAATTAATGGCTCAGCCTTATTTAATAGGCT AATCATGGTGTTTGAATGACACCATCAATGTGCCACAAAACTGGTAGAAACCCCAACAATCTAAAGGGCAAAGTGAATCT TTATAAGAGAATTATGAGCCAACATTTGAGATATTTTCATTCACTGTGAATTCTTGACCCTAATGCTAAGTGCTCGATCA ATCCCTTTAGCCTACCTTCGAAATTTGGAGGGAACAACAACAAATTATTTTGAGTGAGCAAATTAAATATCATTTGATAG GTGTCTAAAAAATATCGGGTAAATAGCCAAGTTGGTCCCTGAAAGTGTCCGCCGCCTTCAACTTCGTC 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0286800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGCAAGGATCAATCAACAACAAGCAACAGCACTTATGGGCAACCATGGTTATGCGCAAATGGCTTAACTTAGGAAG AAACGAGTCTGATTACAGTGCTGACCCTGATGATGATGATACTGAGGATGACCCTGAAAGTGATTCAGACATTGAAGAGT GTGGAAGACAGTTGCGGTTCGAGGACATCAAAGAGGATGAAGCTCTAGATGAATCAAATGATTTCCTTCCAAGGTTAAGG AGGCAAAAGTCATTAACTTCCAGGTCTCAATACATAAACAAGAAAGAACTAAGAGTAAGTGTTGGAACATGGAATGTTGG AGGAAAACTTCCACCTGATGATCTTGATATTGATGATTGGCTAGGCATTCATGATCCAGCTGATATCTATGTCCTTGGTC TTCAAGAGATTGTACCCTTAAATGCTGGTAACATTTTTGGTGCTGAGGACACTCGCCCTGTTCCAAAATGGGAAAATATA ATCCGAGACACTCTGAATAGAGTTCGATCGATAACACCAAAGATGAAGTCCTTCAGTGATCCTCCATCTCCATCAAAATT TAAACCATCAGAAGATGTCCCTAACATAGAAGAAGAAATATTTGAAAGTGATAGTGACATTGGTGAGGAAGTTCATCCTT TGGATGAAGAACACAACAATGTCTATGATGGAACCTCAGATAAACCAATCACCAATAGTTTACAATCATCAGATGCTGCT GTTATTGCCGACTCTGAAGTGCAAGTTAAACATGTTCTACAGACACAGGTTTCTTATCCCAAGAGTTTGAGTCGGCTAAA TTGTTTCCGCGATGAATATTTATCAGAAAACATAGAAACACCACCTGCACAACCACAACTATCTAGAATGATAAGTGGTT CTGAAAGGATTGGTTTGTGTTGGCCAGAGCCACCACTACATCTTCTACCACAGAGAGTGTTGGAGAGACCAACTTCTTTT AAATCTTTCAAATCCTTCAATGCATCAAAGTCTTTCAGAACATGTCAATCATTCAGGCAAAACATGGATGACATAGGTTT GCTCGGTGAGATTGACCTTGGAGCTTTGATGAAGAGGAAAAGAAGATCATCATATGTAAAGTTAGTGAGCAAGCAGATGG TTGGGATTTTCATCACTGTATGGGTTCGGCGCAGCTTGCGAAAACATATTCAGAATTTGAAGGTGTCAACTGTTGGTGTT GGTGTTATGGGCTATATTGGTAACAAGGGATCAATATCTGTGAGCATGTCCATATATCAGACGCTTTTCTGTTTTATATG CACCCACCTTACGGCTGGTGAAAAGGAAGTAGATGAACTAAAAAGAAACGCTGACATTCGAGAAATACATCAAAGAACCC ATTTCTTTTCAGATATTGGACTTCCCAGAAGCATCCTTGATCATGAGAGAATAATTTGGTTGGGTGACCTGAATTACCGT ATCAACTTGTCATATGAGAAAACAAGAGATCTTATCTCAAAAAAGCAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGATCAGCTTAT CAAAGAAATCCATAAGGGTGTATTTGAAGGATGGTCAGAAGGAGTTTTAAACTTCGCACCAACTTACAAGTATGTGACTA ACTCAGAGAAGTACTATGGAGAGGATCCAAAGGTTGGGAGGCGTACACCAGCATGGTGTGATCGTGTTCTTTCATATGGC AATGGAATGAAATTACTTTGTTATGGAAGGAATGAGCTTAATTTTTCAGACCACAGACCTGTGACCGCCACCTATTTGGC CGAGGTTGAGGTGTTCTCTCCAAGGAAGCTACAGAGAGCACTTACTTTCACCGATGCAGAGATTGAAAATGAAGAAATCA TGACAAATTTTGGCACTTGGAACTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0286800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKQGSINNKQQHLWATMVMRKWLNLGRNESDYSADPDDDDTEDDPESDSDIEECGRQLRFEDIKEDEALDESNDFLPRLR RQKSLTSRSQYINKKELRVSVGTWNVGGKLPPDDLDIDDWLGIHDPADIYVLGLQEIVPLNAGNIFGAEDTRPVPKWENI IRDTLNRVRSITPKMKSFSDPPSPSKFKPSEDVPNIEEEIFESDSDIGEEVHPLDEEHNNVYDGTSDKPITNSLQSSDAA VIADSEVQVKHVLQTQVSYPKSLSRLNCFRDEYLSENIETPPAQPQLSRMISGSERIGLCWPEPPLHLLPQRVLERPTSF KSFKSFNASKSFRTCQSFRQNMDDIGLLGEIDLGALMKRKRRSSYVKLVSKQMVGIFITVWVRRSLRKHIQNLKVSTVGV GVMGYIGNKGSISVSMSIYQTLFCFICTHLTAGEKEVDELKRNADIREIHQRTHFFSDIGLPRSILDHERIIWLGDLNYR INLSYEKTRDLISKKQWSKLIEKDQLIKEIHKGVFEGWSEGVLNFAPTYKYVTNSEKYYGEDPKVGRRTPAWCDRVLSYG NGMKLLCYGRNELNFSDHRPVTATYLAEVEVFSPRKLQRALTFTDAEIENEEIMTNFGTWN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 364 364 -
PANTHER 9 618 610 8.1E-282
PANTHER 9 618 610 8.1E-282
MobiDBLite 28 53 26 -
MobiDBLite 33 50 18 -
Gene3D 76 179 104 9.4E-16
SUPERFAMILY 77 604 528 1.36E-66
SMART 318 593 276 4.9E-45
Gene3D 325 616 292 1.2E-85
Phobius 365 382 18 -
Phobius 383 621 239 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Phosphatidylinositol dephosphorylation The process of removing one or more phosphate groups from a phosphatidylinositol.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0286800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…