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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0287200 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0287200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | F-box family protein; TAIR: AT3G23880.1 F-box and associated interaction domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9LIR8|FBK67_ARATH F-box/kelch-repeat protein At3g23880; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S8F0|A0A151S8F0_CAJCA F-box/kelch-repeat protein family; Found in the gene: LotjaGi5g1v0287200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:60388711..60403276) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTAATATTTGTTTTTATTTCCACCTAAAGTCTCTCTCACACAAGCCCTAATTCTCTCTCTTCCTGAAACGAGTTTCTCT CAAACTCTCCTCTCCCCTCAGGCATCAGCGCTCCTCACCGCCACACGCTTATTTTCCAGAAATTGGCCCAACGTAGGTAA GTAACCTCCCCTTCTTCCTTTTCTTTTCTTGTCTTGTGGTCGCTCAGCAATATCAATATCTGTTTCTGTGCATCTCTTAG AGAATATTGTTCCCTTTGTCATTTTTTTTTCTTCTGATAGCCACGGTTTCACATATGTAGTATGTTTTCTGAATTTTCAT TTTTTATTCCTGAACAGCTCCGTTGGTAATTTTGCATGCTTAATTTCTTTATTACATGAAGTTGATTGGTTAATTTTAAG ATTTCTGCAGTTGTCAATTTAATTTGTCAAATGTGAGTCTGTGTATTTTATTTAGTTTCTGATGTTGTATAATGAAAACT TCACTTCTCTTACCCTTTTGACTACTATCCTAAGTTTATATAAATTGGAATTAAGAATGGATTGTGCCTAACTTAACCTC AAGCTTATTCAAGAGGGAAGTATTGTCTATGAAGACTTGTTTTGCTCTTGAACTCCCCCATGTGGGACATCTTCACTATT ATTTCATCACTTTCTTAAAGCCAATCCTCAACGTTCTTTTGATTTTATGCGGATAAATTATGAGCATGACTTTTGACAAG CAAGAAATAACAAATTCCATATCAGATTTTCAGAATCAAAGCAGGTTTGGATTAAGATATTTTACCTGGTTCAGATTATC GAACTAACTAGTTACTACCAATTATTCTAAGCTCTAGAAGGTGAAGTAGTCCTACTACAAGTCATAGAAATTATCAGGGC ACACAAAATGAAACGAAATCCCAGCAAGTATTCTAAAACTACCTAGCACTCATCTTCAGTTGGCACTTGGCAGTATATCA TCCTCAAACTCCTAAATTAAATGCTTATGTTACATACACCTATTTGTAACATCTTCAAGTTAACATGCTTCCTCAAATGA TCACAAGCCTTTACTAATCATAAAATTAGGAAGCAACAAAATTTAGTAAACAGTTAACCACCCAATCCGAGTTCTACAAA TATATCATTTGATAAGTCACCCCAAAAAGAAAGAAAAGAACAAGCATACTGCTCCAATGTAGGGGCACTGAAACAAGTGG GAAATTAATGTTTTAAGAAGAGGTAACCTACCTTCTGCCTCAATGAATAACATACTGCTGCAAAGCCAGGAAATTCATTA ACTAGCGGCTTAAAAATCAACCTGAAAACGCCAGTAAATCCTATATTTTTTACCTGAAGAACAGAGAGTGTAAGAGCACA AAATCAGAAAGGTTTTAGTCACAACTATCCCTATAATTTTATTCACAACTATCCCTTTTAGTTTCAGAGCTAAATGACAA TATGTCCAATTAAATAAACTGGAAGAATTTGCTAGTGAAAAGTTCTTTCTATCCTAATATGTCCATGGTTGTTTTGAAAT AAAACTCACTACAAATATTAAAATCACAGGCTTGACTATAAGATGAAATGAATAACTTTACCTTCTTCTTTCTGCACTTC TTGGCAGAAGCAGAGTTGCTAGTGTATCCACTTATAGCAGTAGCCTGAAATATTTTTCCGATCATCAAGGATTAGCAAAA AACAGTGACAATAAACACAAATCAAATCACTGTCATGAAATAATGCTTGAGGAATGCAATGCACCTTATTATATATAACA CACATCATGCTATTGCTACTTGCTATAAAAATACTCTTTATTCATCAAACTCCTTCTCTGCATAATGGGTTTTTGTCCCT TTGTTTCTCCCCAAAACCATCCTAATCTAGAAATACACCTACAAAAGCATACCATCACCATGGAAGGACCAAAGAAATTC CAAAAGGGTGGTTGGAAATCAAGGTGGGTCAAGGCCAAGAGCAACAGAGGATTAAAGTACCTTTGATTTACACATGAATT GAGGCCTAGTCAATTTTCAGATTCAGTTTGAGCAATTCTTATGTAACTCTAATTATTGTTTTGGTAAAAAAATAGAAACC ATTGTCTTCCTCACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGAGAAAAAAAAATCACAAACCCAGTACTAGC ATCAACGAACGAAACTCAAGACAAGAACAAAACAGATATTTTCAACTCCAAAAACAAAATCAAATTCGAAAAAACAACAA CAACCACAACAACAATACTGCAAAATTTGTGAAAGAATCAAGAGATTTTACCTGAATGAAGAGGGAAGAAAGAGCCACTC CATGAATCGGGAGAGCGAGAACGAGAGAACGAGATCGCAGAGAGGTTGAGATCGGGAGCGAGAACGAAAGAGCGAGATCG GGAGAGCGAGAACGAGAGAACGAGATCGGGAGAGTGAGATCGGGAGAGCGAGAACGAGAGAACGAGATCGCAGAGAGGTT GAGATCGGGAGCGAGAGTGAGATTGGGAGCGAGAACGAGAGAGTGAGAGACACGAGCCAGTGAGGGATTTTCCAATTACT TCCAATTTTGAGGGTATTTTGATTACCCCATAATCCCTTCATTAAATTACCTCTTTTAATTACCAGTATTTTTAGAATTC CACAAATAAATATCCAAACAAGGTATTTCAATTTAAGGGATTTAAAATACCCTCTAGAATTACATTCCCCCCAAAAATCA CCCCATCCAAACACAACCTTATTTCATTTGTTTGTTCAATAAGCATTCGTAATTCTTTTTTACTTTGAGTTGTCTAAATA ACCTATGATAAATTTTGGGTTAAGTAACTCATCATTCAATCCCATTAAAGATAATTGAGTTGAAATTTCTATATTTTATT 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TAGGTGCGTTAGGCTTTCTTTTCACCTTCGCCCCTTGTGCATTTCAGAAAATGTGGTGGTTCTGGTGAGATCTAATGATG GTCATGTAGTTATGTTTAACACAAATAATGGCAAGTTGAAGTTTCCTAAGATCAAGGGAAGAATTAGTCACGATATGCAT ATTTACCATGAGTGTTTAGTTTCACCATTGTAGAGTCTTCCTATTTTTACTTATATGGTTTTGAAATTGTTTTCTTAATA AGTAAGAACATTTGATCTCATGACTCCAATATTACGAAATTTATGAGACTTAAAGTTGTTTGGGTGAACCTCAATTATGT ATTACCAGTGTTGTATTCGCCTTATATTTTTAGACTTTAGTTGTCTTCTTCCTCTCTTGTATTTAGATAGCATATTCATG TGATCTAAGAGAACACATGTGTTTTAGATGTTCTTAGTGCAGAAACATTTAATCGATGCTAATATCATTAGTTGACGTAG ATACTTTATGCAGCATTAACAAAATAGAGGCAAAGTTGCTAATATCATGATCATAGTTAACCTCAAACATTATGGCATTA TTAAATGTGTAAAGCTTGAAGGACAAATCCAGGTAGTATATTTTTATATTCATATCCCATCAATTTGATTCTGTGTGCTA CATAAACCAGATATTCTCAACTCCATCCCTCCCTCAATCCAAAAAAGGGATTGATAAACAAATTTTAGTTAAAATAGTCA CAAACAATCACACATTGTTCGAGGTTATATATGTTAGTTACAAATACAATAGGCTAAATTGTTGGGGAGAGTCACGGCGC GGACCCATAGGCCAAGGCCGAGAAGAGACACCAAGGAGATCTTGGACACCACATCTTAACCCAAAACCTTAAGGCATTAA GTTTATGGGTCACATTTCTTATAAACAAAATATCATGTCCTTAGATGTTATTGATTGTTAAAAACTCTGTACTAAGCTAA CTCGTGAAGAATGCCAATTCACATGGAACAATTCACAGTTCCATGCTTTGTGAGTCCAGTAAGGTAGGCTTCGTCAACCA GTATTGTTGAAACCTCTCTGCCTTGCATAATTCTTGTAGTCAAAATCAATTTTATTTGCCAAATAACTCTGCAATTCCGT ACATGCAATTATGCAAAACATATTTATGAGCATACAATACATAGCTAGAAGTTACAGATGTCTACATTTTTTTAAAAATA AGGCTCAAATAGACTTTTAGTCTCCCTGGTATTATGTTTGGGTGATGCTGGTCCCTCTAATTTTTTTCTTTAAATTTGAT CCTCTAATTTTAATCAATTAATTTTAGTCCTGCATTTATCTTTCAATCAAAATATTAAGGGTTAAGCGTTATATTGGTCC CTGTCTTTGTCTCGCTGTCTGAAGTAAGTCCCTCCCCGGAAAATTTATTGCATTGAGTCCTCTTCTTTGAAATATTTTTG GGGCAGATCCTCGCCGGAGGGCGGAGCTCCGGCAAGTGCATGTGTGGCATGCTGACTAGGGTTAATGAAGTGACGTGGCA TTAAAAAAAATAAAAAATAAAAAAAATAAATTACAAGTCAGATTTTTAAACCTAATTATCCCCTCCCCAAATTAACACAA AATTAACTTCATCTTCACAAAATCATCACCCAGAAATGAGCTTCATCATCACCTCCTCCTTCATCTTCATCATCAAAGGA CCCAGATCTCCCCAACCCGCAACCTCACCCCCACCCCCTCACCCCAACCTGAAACCCATTTTCTTCATGGAGCCATCGTG ACACATCCGAGCATCATCTTTCATTCTTCTTCTTCTTCATTGCGCTCACGCTCAACAATGAAACCCACATCTGAGCTTGC CTCTCCCACCCTCATGGATCAATTTTGGGTTTCGCAGATCTGAGCTTGCCACCAATTTTCTTCTTCTTCTCTTCAGATCT TCTTTGAAGAACAATTTCTTCTCTTCTCCGCTGCAAAGGTTAGGGTTTCGATTTCCTTCTCCCTTCAATCATTCATCTTC ATCTTCTTCCTCTTACGCTTCACTCTTCCTGCATCTCTTCGAATTCGAATTTCAACCTGATTTACTCTTTATTTATTTTT TTGTTTTTTTTGTGGGTATTATTCAGTGTTTCAGAATCTGTTGTTGTTTGGGGGTGAAGGTGAGGTTGCAAGTGGATGGG GGTGAGGGTGAGGGTGAGTTTGCAGGTTGGGGTTTGGGGGTGGGGATGAGGTTGCAGCGGGTTGGGGTTTGGGGGAAGGT GAGGTTGCAAGTTGGGGTTTGGGTTTGAGGATGAAGTTGCAGATGTGTGAGGGTGAGGGTGAGGGGTGGGGTTTGGAGTG AGGGTTTGGGGTGAGGTTGCAGGTGGGTGAGGGTGGGGTTGAAGTTGGGTGAGACCGTGAGGGTGAGGTTGAAGGTTGAT GGTTGATGGTGGGGTTCTGGGTTTGAAGGTTGATGAAGGTTGATGGTTGATGGTTGATGGTTGATGGTTGATGGTGGGGT TCTGGCCTTCTGGATTTGAAGATTGATGGTTGATGGTAAGATTGATGAAGCTGAGGATAGTTCAAAAGGAATTGAGTTAA TTTGGGGGAATTGGGATTAATTTGGGGGAGAAATTAATTTTGTTAATTAGATTAGGTTAGAATTAGTAATATGTTTTAAT TTTGTTAATTTTATGATGTGTAATTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTTTAAAATTCACATAGGCATTTTAAATCCAGT CAGCATGCCACACATGCACTTGCCGGAGCTCCGCCTTCCGGCGAGGATCTGCCCCAAAAATATTTCAAAGAAGAGGACCT AATGCAATAAATTTTCCGGGGAAGGACTTACATCAGACGGCGAGACAAAGATAGGTACCAGTATGACGCTTAACCCAAAT 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TTTATACTTTTATATATTTTTTATAACTCTACCAAAGACCAATATTTTAGTGATGTGTAAGTTTTTTCTTAAAAGTAGTA ATGAGTAATATTTGCATTCATTAAAATGTCATTTTCATAACAAAATTCATACCCTTTAGTAATTACACACATTTAAAAGT ACTTTCAACTAATATTACCCAAACAATATTATTTTATCCAACACTGTTTTGAAACAAAAGTATCCAAACATAAATCACAT TACACTCAACCTACTTTTGCTCAAACTCTATTTTGCAAACACACATTCACTCAAACTCTGTTTTGCAAACTGAAATCCAA ACGCACAATCGTCAATGCAACATACAAATTTTCATCAGTTTCTTCGTTCATTTCCCTTATTCATATACTTTTTCCGTCTT TATCTATTTTTTACTACCTTTATTTACTTCCATTTATGTCTTTCTTTCTAGTTGTTTAAGTCTTTACTCATCCGCTTTTT ACCATTACCTTAGTTTCATTCTACTATCTCGTCTTCAACCTCATAATAGCAATCAACATGAGTTTTTTAGAGTGTTTAAT GAACATGCATTTAGAAACATAATATCTTCCTCGAATAATTATTTATTTAAAGAATCATCATATTATTCGAACCAACAATT TTTTTCACTTCATGTTACTTCCAGGTCAAATAGCATAATCGTTCTTATTTTTCTTCATTCCAAATAGGGGTGTACCGAAA GAAGGCTATAGGAACGGTCAAAATTGAATACTCTCATCGTTAAATTTCTTACGTAAAATTTTTATACCTATTTTTTTATA TTACTGTATTTATCCCACTTATGCATGTTTAGAGGGCGTTGATAACCGAGCTCCCATTGAAGGTTAGGAATGTTGTTATT GGCTGATGTGTGTGGTGTCTCCTTTGTGAGACCTTAGTTTTTGTTTCCTTTTTGTCAATGTACCAAAAAAATAGAGGGCG TTGTTCAACTTTTTTTCACTAAAAATAATTTTTAATTAAAAATAACTTTTTTTCAAAAAATTAAGATGTTAGTTTTAGCT TTTTGAAAAATCATCATTTTAAATAAGTTGAAATTAGATTATTTTGAAAAGCTACTTTAATTAGCTTATCAAGAAAAAAT ATATTATGATAAATAAATGAGAGAGAAAATAAAAAATGTTAATTAGTGTAAGCAACACAAATCATATTATTCTTTCAAAA AAAAAACACAAATCATATTATACTTTTCTTAGAATATTTAAAATATGACCTCTCTATATTTTAGACAAATAATTTTTTTT AATGAAACAAACACGCTCTTAATTCATAGACTATCATACATCTTCATACTTCAAGTGCATAGCTTCTGTATGCCATCAAT GTCTTAGACGATTCTAAGCTAGGGATATGTTTATGTTAGAAATCTGGTTGTGATAATCCTGGATAACTTCGAAAATCGTG TTTGCACACTTTCCGAACAAAGTATTTCGACCCTATTCTTGCCTGGGTTCACGAAATCCTTGTTGGGATAATTTTGAAGA TCAATCTGCTTCTGGCAATAGAGAACAGATCAGAAAGTAGAGAGCGATTCTGGTTTTGTTTTCTGTGTATTTTTTCCTTA GGCTGCAAGCAACCTTATATAGAAGGTTGTGTTTGCACGAATGATCACAATTGTTCCGAAAAATCACAATTCTTCAAACA ATTTAAAACAGCGGGACCCCAGCCAGGGGCTCCGCCCCTTGGACCCCGGTTCGTATTCGCGGTCAATTATGCGTTGGCTC ACCGAGCGTGCACTCCGCACTATACTGACTCGATTCTGAGCCTAACGCATAATTGCATCAGCCTTTAGTAGATCACATTA CTATTAAAATACATTGATAATTCTAAAATCACCAACAGTTTATTTCATAGTTTCTGATTTTTGTCTTCTTTTTTCTAATC ACAAAAAAATTCATACATATAAAAAGAAATAAATACAAATTCAACCTGAAAGAAATTTCACACGAGAGAATCTCCAATTT TTTGTCCACTATATAAGTTTCACATAAAATTATATATTTTGTTAATTCTTAATCCAATCCTCCAAATATTTCCTAGATTT CCAATTAGAATTTGGACCCCCGAATATTTGTAGATTCTTTTCATTGTTTAAAAAATCAAATCAAGAAGCAAATAAATTAT TAATAATATTTTATTTATTTTTCAAATTTCAATAATTAAATCATAAATCTTATCTTAATGAGATTTTTTTTGAAAGTATC TTAATGAGAAATTAAATCAGCAATATATCTTAATGAGATATTAAGTCAACTCATCATTTAATGAACGGGTCTTCTGTCGT TAACAAATTGAGGGATGAACCAAAATTGCTCAGGGCACAAAATGTTGGAGATTAAAATTGCTCCTTTTAAAATAAGGGGA CCAAAATTTCATAATCGTGAAACATCAGGGACGAAAAGAGGAATCAAGCCTAATATTTAAGAAGTGAATAATCATTTGGA AGAGCTTATTTCAGCTTATCTGATAGCATAAACTCTTATGTCAGTGTTTGAGAGAGCTTATGCAAAAACCATAAGCTGTT TTGGGTTTATTTTCATAAGCTGCTCATGATAGCTTATAAAAAAGAGCTTATGCTTATGTATAGCTTATTTTTAATTTATT TCAATAATTATTTTAAAATAGCTTATGAATAACTATAAACGCTTAATTAAGCTGTGTTTCCAAACGAGACCTATATATTT CTTAAGAGATAGAAAGCTAATCAAACAAGAGAGGTTCTCATTCTCATAATCGTTGAAATAGGATTGAAGCGAAACCACCG CTGCGACCGAAACCACCACCGCTATGAGGCAACCGCGTCCACGGTTGTTGTCGCCGCCGGCGGTCTTACCAGAGGAACTC ATCGCCGAGATTCTCTATAGGCTTCCGGTGAAATCCCTTCTGCAATTCAGGTGCGTCTGCAAATCCTGGAAAACCCTAAT CTCCAATCCCCAATTCGCGAAGGACCACCTTCGCATCTCAATCTCCAATACAAGCTTAACCCACCAACGATTGGCCTCTT TCACCAACGACAACTATGGTTATTACAGAATGGAAACATGTTCTGTGCCTTCATTGTTCGAAAACCCATCAACCCCTGCG AAAACCCTAAGCTTCCAGGTAGAACCCTACAATAACCAATTTATTGTAGGTTCTTGTGATGGGCTGGTATGTTTTTGTGA TCAAAATGGTTATTTAAGATTGTGGAACCCTTGTACTAGATTGGAATCTAAGAAATCGCCGCCCGTGGATTTAAAACCGG GCAGGGTGAATCATCGGTGGTTCTGGGATTATGGCGGTTTGGAGAAACGGTTCGCACATTATGGGTTTGGTTATGATCAA GTTAATGACAAGTACAAGGTGCTAATTGCTGACAGTCGCCATGGCACTCTTTATGCGACGAGAGTTCATTCCTTTGGTAC TGATTCTTGGACAACCATTCAGAATTTCCCGTGCGCGCTCACTTCGCAGGTGGGAAAATTCGCGAGCGGTACTCTGAATT GGCTGGCGCGGAAAGGGGATGGTTCCATTAAATCTTTGATTATTTCATTTGATCTGGAGAAGGAGACTTATGGTAAAGTG TTGCTCCCTCCACATGTGGATGGTGATGAGTTGGATGTCTTGAGTAGCTGTCTTTGTTTGTGTGAATTTAACGGAATTCA TTGTGGCCTGTGGTTGATGAAAGAGTATGGTATTCAAGAGTCTTGGACAAAATTGGCCTCAATTCCTTACGGGGGGGTGC ATTATACCTTATAACTTTAGCCCCTTGTGCATTTTCAGAAAATGGTGTTGTTCTGGGATCTGTAAATCTCCAATTAGTTA TGTATAACCCAAATAGTGACACGTTTGATTTTGATTATCCTAAGATCAATAAAAGGTTTAGACAGGATATATATGTTTAC CATGGGAGTTTAGTTTCACCATAATTGATGATGATAATCAAGGAAGTCCCATTGAAGAGGAGAGGGAGAAAGCATTCGAA GGACTCCAAGGACCAATGACAGGAGAAAATGCAAAAAAGATAAAGCTGGATCTGAAGAAGATGGTCACATTTTAAAGTAT ATCAATTGCATATATTTGAAAGGTATCGGTTCAAATGGGTTAATTTAGTTGTTATTGTATTCGATATGATTTTATTTTAC TTTGATTTTATTTGAAAGTTTTTGTTCGGGTATTTTATTAGGTTTAATTTTTATAAGTACTTTTTGGTAAAGAAATTTGA ACTTGAATTTAGTTTGAATCCTAACTTTGAATTAGGCAGCCAATTTGTGATAGTGCATCTTTTAGGTTCTTGAGTGAGCC AATGTTCTTTAATCTTATCAAGAGGCCAAAACTCTTGTGGTGATTGTTCATTCGGCTTATCAATCATTGATTGTGACAAA ATGTTCTATTTCATCTTATTCTTATCCATTTTTTTTCTTCTTTAAATTCTTGTTTTAAATGTGATCCTAATACGTTTTAT GAGTGAGATTCTCAGCCATTTGTCTGTGTTTCTGACTATATTGGTAGTAAACAGTAATCAACTGAGGAAATGCTGAAGGC ATCCACATCTTGTTAAGCTAACTGGGTACTGTATTGAGGAGGAGCACAAGCTTCTGGTGTATGAAGGATTGAACTAGAGT AGAAAGTCACAGAGTTCATTTCCTATAGTGTAACTAAGTCCAACCAAATTCCAAGATCTATGTTGCCTATAGCTAGTATA TGAATCAATTGCCATGCATGTTCTGTCATTTACTATCAAGCACAATTTATTTATTCAAATTTATTTTGTTTCATATCCAT TCTGATGAGAAATATCTTGATAACTAAGGATACATATTCAAAATATCTATCATAACTATTTGGAAATTAATTTCTTACTC AAGGCCTGTTCTCTTCTCTTTGTTTTATTCTAATACAAGCAGAAGCAGGATACTCTGGTGCCTTACCATGGTCAACCAGG ATGAAAATTGCATTAGGTGCAGCTAAGGGTCTGGCTGGCCTTCTTTCCCAAAGAAGATAAACCAGTAATATACAAATAGC AATAAGGTCTTCAATTTATTTTTGATGAATTTGGGGTTCATGCTTTAAAATGATATATTGATAGCTTATGGATTCCATAA TTGCTCATGAGGAAAGACAAGTTGATTCAAACATGCTATGAATTAGTTACTTTAATATTTTAATCAGAAGTTAATTTATT TCAGTTCACCTTTCCACTAGGACTGATGTGTATGTTGGTTAGTTAATTTATTTCAGATCACCCTACACTTCATTTACATA TCTTACTCCTTTTTGTTACTCTACCGTCTACACTGCTCTGGTTGTTCTAGATTTGACTCTTAGCTGCTATAATTCTGTCA CACTATAATAAATGGACGTTGGTTAGTTAGCTAAGTTGAGTCCTGGTCATTCTAAAATCTAAATTGTCGCCACTTCCTTG CCAACATGTGCTTTCGGAAAATTATTTATGGCCACTTCCTAGTTGATGTTTCCGTTAAAGGAAAATGAATAGGTCAATCT GTGTTTTCCTTTAACTGGAACATAAACTAGGTTTGGTTAATTCTAAGAAACTATTCTCCGATTCAGTTAGTAAATTCACA AGGATAGCTGATTGAGAATGCAGATTTAAAGTTTATATAGAAGCCACGTGTTCTGTACTAGGGAGATCTGACGTCGGAAA CTGACAGAAAGTAAACCCTAGCAGAGTACTAAAAATATCACAAAAGGAATATTCTCATTAAATATTCAAAAGGTCCTTTT TACAAGGGGTTGACCTCTCCTTTTATAGAGGGAATGATCATAACGTGGACTTTCACTGTACTTGGGCCTGACAACCGGGG CCCAAGCCTTTATACATATAAGACAAAACTAAAGGAATCTTCCAGCTGGCGCGTGGACCCATCCAAAAGAAGGGCGGGCT TCGACG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0287200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTTGAAACCACCAATATGAAGCAGCCACCTCCACCGTTGTTGTTGTCGCTGGTCTTACCCGAGGAATTGATCATCGA AATTCTCCTTAAGCTTCCAGTGAGATCCCTTCTACGATTCATATGCGTATGCAAATCATGGAAAACTCTTATCGACAGTC CCCAATTTGTGAAGGACCACCTTCGCAACTCCATGTCAGATACAAACATGACCCGTCAACAATTGGTCTCTTTTGCAAAA AATGAATCGAACAAAATAGAAACATGTTCAGTGCAGTCATTGTTCGAAAACCCATCAGCCCCTCCGGAAATACTTAGCTT CAGGGTGGAGTCCAAGCACCAATATATTGTAGGTTCATGTTATGGGCTGATGTGTTTGTGTGATCATAACGGTTATTTCA GGTTGTGGAACCCTTCTACTAGATTGGCTTCTGTGAGATCTCCACGCATCAATATTGTGAAATTGTTCACTCGTTATGGC TTTGGTTATGATCAAGTTAATGACAAGTACAAGGTGCTAATTGCTGACAGTCGCCATGGCACTCTTTATGCGACGAGAGT TCATTCCTTTGGTACTGATTCTTGGACAACCATTCAGAATTTCCCGTGCGCGCTCACTTCGCAGGTGGGAAAATTCGCGA GCGGTACTCTGAATTGGCTGGCGCGGAAAGGGGATGGTTCCATTAAATCTTTGATTATTTCATTTGATCTGGAGAAGGAG ACTTATGGTAAAGTGTTGCTCCCTCCACATGTGGATGGTGATGAGTTGGATGTCTTGAGTAGCTGTCTTTGTTTGTGTGA ATTTAACGGAATTCATTGTGGCCTGTGGTTGATGAAAGAGTATGGTATTCAAGAGTCTTGGACAAAATTGGCCTCAATTC CTTACGGGGGGGTGCATTATACCTTATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0287200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLETTNMKQPPPPLLLSLVLPEELIIEILLKLPVRSLLRFICVCKSWKTLIDSPQFVKDHLRNSMSDTNMTRQQLVSFAK NESNKIETCSVQSLFENPSAPPEILSFRVESKHQYIVGSCYGLMCLCDHNGYFRLWNPSTRLASVRSPRINIVKLFTRYG FGYDQVNDKYKVLIADSRHGTLYATRVHSFGTDSWTTIQNFPCALTSQVGKFASGTLNWLARKGDGSIKSLIISFDLEKE TYGKVLLPPHVDGDELDVLSSCLCLCEFNGIHCGLWLMKEYGIQESWTKLASIPYGGVHYTL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 14 | 60 | 47 | 10.531 | ||
| Gene3D | 15 | 96 | 82 | 5.3E-10 | – | |
| PANTHER | 18 | 293 | 276 | 1.4E-51 | – | |
| PANTHER | 18 | 293 | 276 | 1.4E-51 | – | |
| SUPERFAMILY | 18 | 66 | 49 | 1.16E-14 | ||
| SMART | 20 | 60 | 41 | 6.8E-10 | ||
| Pfam | 20 | 59 | 40 | 1.8E-9 | ||
| TIGRFAM | 118 | 294 | 177 | 1.3E-24 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0287200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…