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LotjaGi5g1v0339000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0339000
Transcript ID LotjaGi5g1v0339000.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description O-acyltransferase; TAIR: AT1G57600.1 MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein; Swiss-Prot: sp|Q09758|YA71_SCHPO Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RPQ6|A0A151RPQ6_CAJCA Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c; Found in the gene: LotjaGi5g1v0339000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:65606919..65616027) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGCACACTAAAAAAAGTGACATTTGTGGCAAATTATTTCTGGCGGTGTTAATAAACTTCCAGTATTTGACGTATTTTTGT GGCATCTTGTCAAGCTCTAACACTGGCCCTCTATTCTTCACGTTCATCCTCGCTCTCACTCTCGACCTTGCTCTCTTCTC TGATTGCTCCCTTCACCATCAACTGTGCCCAATACCCAAACCAGCCACCAGAAATCGCACACAATCATAGGTCGCAAATA GCAGTATCAGTTGCTCCACCTTCATTTTCTTCTTACCCTTTTCTCTGTCGCTGGCTAAATCACTCAAGGATTGTGTTTCT GAGGTAAATCCCTTCACCTTTGTCTTCCACTACTGTTAACTTGTGAGCTTTCTGTATGTATATTTGGGTATTTAGAATAT TGGGTTGTAAAAAGGGTTCCATGTCTTTGATGGAATGTTTGGTTGATCCTACACTATGCTACCAGGTAGCAAAAGTAACT GAAGTATCTAATTACTACCTTTTGTTTGCATAAAGATTTTGTTGCCTCATTTTGGATTCACCTCTTTTGCTGATATTTGC ATGCATTTTATGTTCTTATTGAAGTGAATGAACAATGCTGTTTTATGGACTTACAACAATATTTAGTAAGAAAAACATTT GAGATTTTTAGTTAGAGGTTCAGTCATACAGAATCTGTTAGACTTATAATTACTCAGCTACAAGTTAAACTCTCATCCAA CAAGAATATTGCTCTAGGATTGTTTGATTAGTGGGCTTAGTGGAAATGCGCAGTCCTGTGTGAAACTGTGAATGAAGGGA AAGGCAAGGAATGAATTGGAGAAAAAGGGAAAATGACCCCTACAAAGAAGGTACCTAGGGAAGAGTTAGTTGGGGGAAAG GAGGCTGTAAGTCTGTAACAACATGGACAGTCGCATGTTTAGTGGAGGAGGAATTCTGTTATGATACTAGGATTGTATTG 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GCTATGTTTTTTTTCATGCTTCTTTCTCTTAATGTTTACGTTTAAATAATTATGCTTTCTGTTGGGCATGTGTGAACATG TTTTCCAGTTCATAATTTTAATTGCATTACCAGGAGAGAAGTCTACAGGAGGACAAGTTCGGATATATCACATACCTTTG TTATTTGGTGTATGCACCACTTTATATTGCTGGTCCAATTATTAGCTTCAATGCTTTTGCCTCACAGGTCTGTCAGTTAA TTTTTATATGCTTCAAGATTGGCTTTCATTACGTTTGTAAACTTTGTATAGTTGTGGTCTCTGAAACCTCTATTGATTAA GTACATCCCTCATCTTGTTATTTTCCAAAATAGAAGTATATGGAAGAAATTATTATTTTTAATTGGAAAAGAAACCAAAT TTGTCATTATTGTCTAGAATTTGATATTTGAGTCAACAATTGTTAAATGAAAATGTACACTTCAATGAATTTTCTATAAC AGAATCAAACTGTTACAGTTGAGCCATAACCAGACATGCTTTTTTTTCCTGAATGTTTCTTTTGTTGCTTACTATTGTCA GTGTTTTTGAATGGTTGTTTGTGTTCTGTTGATGATACTGGGCAGCTAGATGTTCCTCAGAGTACTATTTCAGTTAGAAA TGTGACACTCTATGGTTGCCGTTGGGTGTTCAGTCTTCTTCTTGTGGAATTAATGACACATCTATTCTATTATAATGCCT TTGCTAATAGGTGAGTGCTTCAGTACTCAGTAAAGTGCCGTGTGTGATATTTATTTTCTCAATCCAATTTTATCCTTTGA TAGCTGAAATATTTTATTCTTCAGTGGTTTGTGGAAGCATTTATCTCCTATGGACGTGTTCTTCATTGGATATGGGGTAA GGGAATACATGTCTATCTTATAACCTATGTGGTTTTGCTGAGCCTAATGACATCAACCTGATATGTGCAACCAAACCCAC CCAGACCCAGTGGCATAACTGCATATTGGCTTAGTGGTGATGGTTGATATATCATGGAAACTAAATTTCCAAATTATTTC AGCATAGTGTTTATTTTCATTCTGTTATTTATTTGTTTCAGGTCTTAAACTTCATGTGGCTGAAATTTTTACTGATCTGG CGCTTTTTCCGTTTCTGGTCACTGGTACGTTATTTGCCTATCAAGCATCTTAGCATAAATGTCCAGGTACATATGTGGAG AATGTCATTAATTTTGAAGTTTTGGTTTTAGATAAACGGAATTGAGGCTCCAGAGAATATGCCAAAATGTATTAATAATT GCCACAACTTGGAAGGCTTTTGGAAAAATTGGCATGCTTCCTTTAATAAGTGGCTTGTGAGGTGCAATGGATTCATTCTC CTTGATTTTCGCTTTATTTTCTTAAATAATAACTAAAAAATTTGATAGAATTTCAGGTATATGTACATTCCTCTTGGAGG ATCTCGAAAAAAACTACTAAATGTATGGGTTATATTCACATTTGTTGCCATCTGGCATGATTTAGAGTGGTATGCTCCCT TTATTGTCAGTTTAATCCATTATATTTGTAAAAGTTGCGCACTTTTTGACCAGATATATTTTATGCTTGATTATTCTCAT GGACCTTAGGAAGCTTCTTTCATGGGCATGGTTGACATGTTTATTCTTTATCCCTGAGTTGGTTTTAAAATCAGCAGCAA AAACATTTCAGGTAATACATATCCTTCTTTACTCTTCTAAATTTTCAGTAGCTCAAATTTGTTATTCTTAATGTCTAACA TCGAGGTAAATTTGATTGTCAGGCTGAAAGTGCTTTTGGCGAATTCATATTTCGTGAATTCAGTGCTGTTGCTGGTGCAG TCACAATTACTTGCCTCATGGTTTGTCCCTGAATGCCCATGGAAGCTATAGCATATATGAATAAATCTTATAATTCTTAG TTACTCTGTCACAGCTCACAATGACTTGAACAACCGTTCTTTTTTTTTTCCTTCACTGAGTAGTTATTATTTCTGTTTTG ATGGATACTGTTGCATTTTGATTATAAAACAAAAGTAGTGAATATCTAATTTGATTAACACGACTTTTCTTGACAGATAG CAAATCTGGTTGGTTTTGTTATTGGGCCAAGAGGCATTAACTGGTTGCTTTCTTCTTTCCTTCACAAAGAAGGTCTGTCA AGATCCTTAGCTTGTTAACTTAATTGTAGTTAATACAATATAAAATTACATCAGAAATTCCATTTCACAGGGTTGCCAGT CCTCGGGGGCATGCTTATGACATTTTATGTTGGAACAAAGGTATGAATTGTTCCGCACGTGTTCATCATCTTTGAATGTT TTTTTTTCCTTTTTATAAAATAACCTTCTGGGTGAATATTTACAGATTATGTTGCGACATAGATGAAGCTAAGCAAAGGT CGTCTTGAACCGGGCAATTACTTTGTGACCGTAATCCTTTGTGTAACTGCAAATGTGCAAAGTGTAAATTCACGTGTAGC GCTTGGAGTCACTAATCTGGTACTGAGCAGTGGGATTGGCTTGGAGGTACCCTGTGGGTATGTTTTTTGACACTCTGATT GATTTCCCAATGCATTGTCCCTCAAATTGGGAGCCATGTCTTAGAATTTTGTAATCCATGTAATGTAAAAATCAAATTAA CAGCAGACATGATACTTTTGAACTTCTGTTGAAAATAGGGTAGGTTTACAACTTTACATGTAAAATGCGACATGATAATT TTGAACTTCACACCTTATTGCTGCATGTTTAGCTTAGTTGTTCTTTGTCTGCCTTATGTTGTTTCAAGAGGAGTGTTTAA GCATCATGTGTATACAATCATCAAATAATACTCATAACGGCATGTTGAGCAGGAAATTATAAGATAGGGAAACTATGAAG TAATGCTAATGCTGGACTTTTATTTCATTTTTCATTAAACATAAACATAACATTTGACATCAGCCAAAAATACGATTGAG AGTTGCTGCCAATCGAACTCCTCCTTGAGCTAATCGCAAATTGACAATTGGCAAACGTGAGAGGAAGTAATCATCTGCAA AGTATTGTGTAATGATATAGTGAGAAAATGTAGATGAAAAAACTCTAACTTCAATAAGTATTGCAGCTTACCTTCTAGTA CTGAACCATCACTGACACCTTTATATGCCCATTGACATGCTGCCTTTATATCTTCAGATGCATATCTGAAAAATTACCCA AGTTAAGCTAGTAAATTTCAACAGCTTCATATGTAGATCAAAACACTAAACTAAATGTATTGCAACCAGCAAAATTCTTT AAATAAAACTAGTAATGAAGGAATAAAACTTTCAGATAAATAAGCACTAATGGGACTTACATATCTGGGCATGTGGTCTC ATTAGAATTGCAGGTTTCCCATCCTTCTACTTGACTGGACCATGTTTTCTATATCAGAAAATTTAAAGTGAACATTAAAC TTTGATAAGCAGTTCATTAGATTAAGTATACAAAAAGCTGCTGCATAAAATACCGTAATATTCTGTTGAATGGCATCAAT GAATTCATCTATGTTCGAGTCATAGAATCTTTCTTCTGCTGTCTCAATTATGTTCGCGTCCCAACACTGTGTGGAGTAAA AATTAGTCAGTGTAGTAGATAGTGAACTAGATCTGTGGTAGTTGATGAAGCTGAGATCTATATTCACTCACATGGTGAAG ATTTTGTTTTCTTGTATACCAGTGAACATTAATTGAATTGCCTCCCCTGTCTGAGGTGAAACCCACATGTAGAGGCTGCA GATTAACAAAGCAGAAAAAAATCATGATTATTAGATTGCTAATTAAGATATAAGCTTAGTGTATGATGATTTGGGGACTT TATCAAGTATACCTGATGGATATCTCCCATAAAATGAGCAAGGAACATCAGGGCTTGTGTCAGGTTATCTGATATTGTTT GTGATTTCACCATGTGGAACAAAAATTGTTTAGTCAGTAGATAAGATATAAGAAAAATAAATTAGGGTGCACATAAAGTT TGTTGTCTCGTAACAAAAATTTACATGAATTGTCTGTGCCATGGTTGAGGAGCTGGGTGGTGTAATTGTTAATTGCTCCT GCAACACATCTTCCCTTCTCTCCATTCTGATCCTTGCAATCCCCTGAATGTTCAAACAACTGGTTAACACTCAGTACTGC ACTACACCATCATATACCTATCTAATATCTATCACATCATTCACTTATCCATAAATTCCAAAAACTAATTTAATTTTTAA GATATTATCAGAAAATGAGAAACTTTAAAACAAGCCAAAAGTTGTGTGGTTTATGGTATCAGATACAGATAGCAGAACCA AACTGCTTTTCACAACACACACAGAAGCCCAAGCTAATGTCATGGATCACATGACTAATTATAGCATGCTTGTTTTCACA TTTGCAAGTGGTAAGTTGATTCTCCACTTTCAGAATCAACTTTTTGGTGTGTGGATGCTGTTTTTTCACAATTAATTCTA ACTCCAAAATCAATTCTTGGATGAATCTAGAAACCATAGCTTCTGCAATTGACATAACCAATTATGAGATTTCACAATAC GATTTTACAACATTGCCTACATAAACCTTTTTTTTTTTTCATAAATGTCTCAACACAAATCACTTACATTTGTTATCAAT TCTTACAACACTGATCCAAACAACATACTAAAATCCTCAAGGGGAAAAGGAGAATTATTAGAAAGCAACTTACTTTCATA CTGGTAAGTGCAAAGATTGTCAGGGGTGTCAATATAGTGTAAAGCAGAGGACCAGGGCAAATAGAACTTGACATGATCAG CCCATGAACACATGCTGGCCAAGTCATTTCCTGGTGGCAGCAACTCTTTGACTTTCTCTGCAGCTGTATTGCTGAGACGA GCCTGTTCATTGAAAAGGGGAAGGTAATGTGATGCTGCTATTGCTAGAGCTACATTTATCAGAATGAATTCTGAAACCAG AAGCATTTTGAATTGATTATGACTTGATAATTAATTGTAAAAGGGTTTCTAAACACGCAGAAAAAAGAACGTTACTCACC TGAGCAATACTGCAAACTATGGTGTGCCCATCTTCTCCCCATCCTTGTGTGTTTGGAAACACAAGCATCAATGACACTAT GGCCACCAGTTGGATTCTGAAAGAATACTCCATCTTTCTGCTTCACTACAAAACCATGCATATGGTACCTTGCCCTGTGC TTATATAATACCCTTGAATGAGTAATTTATTACATTAATTTAGTTCAATATGAAATTTGAAATGACAGG 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0339000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTCAAATCGCAAATGGGTACATCTGTTACGAACCAGGACAACTTAAATGGCAGTAGGAGTGGACAGTGGAAGCAAAA GGAATTGTTTTTTCTGGTGACTTATGCATTTGCTTTTTATGTTATCATAATCAGACGTTCCCTTCAACTCTCTCATGATC ATTACAAACAACTATTTGGTTTACGCCCGGGATGGCTCATTCCTCATCACCTCAATGATGTCTCAGATGCTCAGTGGACG AATTTTCGAGGAAATATACCTGTTCTTAGTCTTGTCTTTGGAATTTTCACTCTGCTGGCCAGCTTGATGAGGGATTTTTT TAATTTAAAAGTGGGGGGAATGTCTATTGTCTGGCTTTTATTTTCTTTGGCCTACCTATCATATCTGCATGGAGCATGCA TCATATTTGTCCTTTCAATAGCTACTATTAATTTTCTTATCGTGAAGATGTTTGCTCGGAAAAAGTACTTTCCACTTGTT GTTTGGAGTTACAATATATTTTTTCTTCTCTCTAATCGGATTTATGAAGGATATTCATTCTCTGTATTTGGATCACAATG GGAATTTTTGGACAATTACCGGGGCAGTTTTAGGTGGCACATAAGTTTCAACTTTGTTGTTTTGCGCATGATAAGCTTTG GATTTGATTATCATTGGACAAATCAAGATTCTCATTTTGATCAGGAGAAACATCATCAGCGTTGTCATATTTGTAATTCA GGAAAATCATGCTATCAAACTTTACAGGAGAGAAGTCTACAGGAGGACAAGTTCGGATATATCACATACCTTTGTTATTT GGTGTATGCACCACTTTATATTGCTGGTCCAATTATTAGCTTCAATGCTTTTGCCTCACAGCTAGATGTTCCTCAGAGTA CTATTTCAGTTAGAAATGTGACACTCTATGGTTGCCGTTGGGTGTTCAGTCTTCTTCTTGTGGAATTAATGACACATCTA TTCTATTATAATGCCTTTGCTAATAGTGGTTTGTGGAAGCATTTATCTCCTATGGACGTGTTCTTCATTGGATATGGGGT CTTAAACTTCATGTGGCTGAAATTTTTACTGATCTGGCGCTTTTTCCGTTTCTGGTCACTGATAAACGGAATTGAGGCTC CAGAGAATATGCCAAAATGTATTAATAATTGCCACAACTTGGAAGGCTTTTGGAAAAATTGGCATGCTTCCTTTAATAAG TGGCTTGTGAGGTATATGTACATTCCTCTTGGAGGATCTCGAAAAAAACTACTAAATGTATGGGTTATATTCACATTTGT TGCCATCTGGCATGATTTAGAGTGGAAGCTTCTTTCATGGGCATGGTTGACATGTTTATTCTTTATCCCTGAGTTGGTTT TAAAATCAGCAGCAAAAACATTTCAGGCTGAAAGTGCTTTTGGCGAATTCATATTTCGTGAATTCAGTGCTGTTGCTGGT GCAGTCACAATTACTTGCCTCATGATAGCAAATCTGGTTGGTTTTGTTATTGGGCCAAGAGGCATTAACTGGTTGCTTTC TTCTTTCCTTCACAAAGAAGGGTTGCCAGTCCTCGGGGGCATGCTTATGACATTTTATGTTGGAACAAAGATTATGTTGC GACATAGATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0339000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVKSQMGTSVTNQDNLNGSRSGQWKQKELFFLVTYAFAFYVIIIRRSLQLSHDHYKQLFGLRPGWLIPHHLNDVSDAQWT NFRGNIPVLSLVFGIFTLLASLMRDFFNLKVGGMSIVWLLFSLAYLSYLHGACIIFVLSIATINFLIVKMFARKKYFPLV VWSYNIFFLLSNRIYEGYSFSVFGSQWEFLDNYRGSFRWHISFNFVVLRMISFGFDYHWTNQDSHFDQEKHHQRCHICNS GKSCYQTLQERSLQEDKFGYITYLCYLVYAPLYIAGPIISFNAFASQLDVPQSTISVRNVTLYGCRWVFSLLLVELMTHL FYYNAFANSGLWKHLSPMDVFFIGYGVLNFMWLKFLLIWRFFRFWSLINGIEAPENMPKCINNCHNLEGFWKNWHASFNK WLVRYMYIPLGGSRKKLLNVWVIFTFVAIWHDLEWKLLSWAWLTCLFFIPELVLKSAAKTFQAESAFGEFIFREFSAVAG AVTITCLMIANLVGFVIGPRGINWLLSSFLHKEGLPVLGGMLMTFYVGTKIMLRHR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 20 20 -
Phobius 1 28 28 -
PANTHER 19 534 516 2.3E-211
PANTHER 19 534 516 2.3E-211
Phobius 29 48 20 -
TMHMM 29 48 20 -
Phobius 49 85 37 -
TMHMM 84 106 23 -
Phobius 86 104 19 -
Phobius 105 115 11 -
Phobius 116 147 32 -
TMHMM 126 148 23 -
Phobius 148 155 8 -
Phobius 156 175 20 -
TMHMM 161 183 23 -
Phobius 176 259 84 -
Pfam 201 484 284 1.0E-39
Phobius 260 279 20 -
TMHMM 260 282 23 -
Phobius 280 299 20 -
Phobius 300 322 23 -
TMHMM 303 325 23 -
Phobius 323 341 19 -
TMHMM 340 362 23 -
Phobius 342 362 21 -
Phobius 363 415 53 -
Phobius 416 431 16 -
TMHMM 417 434 18 -
Phobius 432 436 5 -
Phobius 437 454 18 -
TMHMM 438 457 20 -
Phobius 455 474 20 -
Phobius 475 497 23 -
TMHMM 477 499 23 -
Phobius 498 516 19 -
TMHMM 514 533 20 -
Phobius 517 533 17 -
Phobius 534 536 3 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0339000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…