Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0339000 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0339000.1 |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | O-acyltransferase; TAIR: AT1G57600.1 MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein; Swiss-Prot: sp|Q09758|YA71_SCHPO Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RPQ6|A0A151RPQ6_CAJCA Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c; Found in the gene: LotjaGi5g1v0339000 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:65606919..65616027) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGCACACTAAAAAAAGTGACATTTGTGGCAAATTATTTCTGGCGGTGTTAATAAACTTCCAGTATTTGACGTATTTTTGT GGCATCTTGTCAAGCTCTAACACTGGCCCTCTATTCTTCACGTTCATCCTCGCTCTCACTCTCGACCTTGCTCTCTTCTC TGATTGCTCCCTTCACCATCAACTGTGCCCAATACCCAAACCAGCCACCAGAAATCGCACACAATCATAGGTCGCAAATA GCAGTATCAGTTGCTCCACCTTCATTTTCTTCTTACCCTTTTCTCTGTCGCTGGCTAAATCACTCAAGGATTGTGTTTCT GAGGTAAATCCCTTCACCTTTGTCTTCCACTACTGTTAACTTGTGAGCTTTCTGTATGTATATTTGGGTATTTAGAATAT TGGGTTGTAAAAAGGGTTCCATGTCTTTGATGGAATGTTTGGTTGATCCTACACTATGCTACCAGGTAGCAAAAGTAACT GAAGTATCTAATTACTACCTTTTGTTTGCATAAAGATTTTGTTGCCTCATTTTGGATTCACCTCTTTTGCTGATATTTGC ATGCATTTTATGTTCTTATTGAAGTGAATGAACAATGCTGTTTTATGGACTTACAACAATATTTAGTAAGAAAAACATTT GAGATTTTTAGTTAGAGGTTCAGTCATACAGAATCTGTTAGACTTATAATTACTCAGCTACAAGTTAAACTCTCATCCAA CAAGAATATTGCTCTAGGATTGTTTGATTAGTGGGCTTAGTGGAAATGCGCAGTCCTGTGTGAAACTGTGAATGAAGGGA AAGGCAAGGAATGAATTGGAGAAAAAGGGAAAATGACCCCTACAAAGAAGGTACCTAGGGAAGAGTTAGTTGGGGGAAAG GAGGCTGTAAGTCTGTAACAACATGGACAGTCGCATGTTTAGTGGAGGAGGAATTCTGTTATGATACTAGGATTGTATTG AAAAGTGATGATATAGAGGGGGAGAGGGGGGCAAGAAGAAAATATCCATTGTTATTTTCTGGTTATATTTTCTTCAGCAT TTCATCCTACAGAGGGCAAACTTTGCTTGTAAATAGCTTTGCCGCCTTAATTTCTAATAAGTGTCAAGTTTGTATTAGAT TGACTACGCAGCTTCTCTCTTCTATCCCCTTTCTATATATTTTAACCTTTGATTTTTTAAAATGTAGGGAAGTTATTCAA ATTTTTATCATCAGCGGAGTTAATTTGATTTTGGTTTTTATCATGGGGAAACTGAAAGTAATTTACAAAAATCTCTGATT TCCTAAACAGGGAAACATGAAGTTGCTGGTGTCAAGGTGCTAACTAGAGGACTTTGGTTTCTTCATTATGGTCAAATCGC AAATGGGTACATCTGTTACGAACCAGGACAACTTAAATGGCAGTAGGAGTGGACAGTGGAAGCAAAAGGAATTGTTTTTT CTGGTGACTTATGCATTTGCTTTTTATGTTATCATAATCAGACGTTCCCTTCAACTCTCTCATGGTATATTTCTTATTTC AGACCTTTTCCCATAATTTTGTTTCTCTAATTTTTTTTCTGCCGGGTACATCTCACCTGCTTAATTATGAGCATTGTGTA TTTGCTTTTGATTTTCATAGATCATTACAAACAACTATTTGGTTTACGCCCGGGATGGCTCATTCCTCATCACCTCAATG TATGATTGTGCTCCTTCCATCATTATGACCAGTTTGTCTGTATGTATTTTCAGTAGTTGGCTAGATTGCATTCTTTTTGC TGATCCAACGCATGACTTTCTGTTTTGTGTAAAGGATGTCTCAGATGCTCAGTGGACGAATTTTCGAGGAAATATACCTG TTCTTAGTCTTGTCTTTGGAATTTTCACTCTGCTGGCCAGCTTGATGAGGGATTTTTTTAATTTAAAAGTGGGGGGAATG TCTATTGTCTGGCTTTTATTTTCTTTGGCCTACCTATCATATCTGCATGGAGCATGGTATGAAATGCACGGTTCAATTTG ATGTTGTTCTTTCTTTCACTATTGGCATTCCTTACCTTCTTCAATCTAATTTTGTGTTTGTTTCACTTTGCAGCATCATA TTTGTCCTTTCAATAGCTACTATTAATTTTCTTATCGTGAAGGTGCGTATGAGAATTATGAACAAGTATTTGTTGCTATT TGAATGTGTGATATTTATTGATTTTAATTTTTTCTTGAGGGTGGGGGGATGTTATCATAATTTTCATAAAGGGTCTCATT TGTGCTTTGGTTTTGGCTTTGAATTTGAACAGATCTAGTTATTTAAAGACAAGAATGGCCAAAGCATAATATGGTCCTTA AAATTTTAAAGGCCAAATAAATTCACTTACATACAACTTATGATGCTTTGGCCTCTTTTTTAATGTTTGAATATCCACAG CACAAATAAGATCCATTTGTCTGATCATTATAATGTATCATTTAATTACCATGTTTGTCACTCTTCCCTCAGTTATCGTG TAAGACTAAAATGGTTTCTGCAGATGTTTGCTCGGAAAAAGTACTTTCCACTTGTTGTTTGGAGTTACAATATATTTTTT CTTCTCTCTAATCGGATTTATGAAGGATATTCATTCTCTGTATTTGGGTAAGGTGCATCAAATCAATTGGTGTTCATAAA TTATATAGTAATAATTCTATTCCCACTTGAGATTATGTATTTTTATTGCAGATCACAATGGGAATTTTTGGACAATTACC GGGGCAGTTTTAGGTGGCACATAAGTTTCAACTTTGGTACTTGTTTTCTTTATTTATTTGAGTTTCTGTAGTATCCAAAG TCAGAATGGCCATGTATATGTGGTTCTTACCTATCTTTTCCCTAACCTCTTTTTTCCCATTTTGTTGGTTGCACGGTTCT CTTCACCAGCATTCATATGAAGCTATGCCAACTCAATTATATCCATTCCTCACATTGAAACTGATTTCATGTCACCCTGG TCTATTATTTAGAACAACCACGGGCTATGAGATTAATTTCATGATCTCAACATTTTTAAACTTTTATGTGCATTTTATGA ATTATAATTTATATGTGCATTCTCATTTGGCATACCATTGTGTAATGTGGCAATAACAATATATGTCTCGTTATATTTAA ACATAGTTGTTTGTGGCAGTTGTTTTGCGCATGATAAGCTTTGGATTTGATTATCATTGGACAAATCAAGATTCTCATTT TGATCAGGAGGTATCACTTTCTTTATGAATATGATACTTGTTTGTTTTGAGTATAAGCTTCTACTGTATTGTCTCTTAAT TTTTGATGATTAATTATAATGCTGTCGACAAATGCTTTTGAAACTTTATTAATGAAGAGTAATATTTGAAATTACCTCAA ACACATATTTTTTTAACACCTTTTAGAGCTTATATTATGTTTGATTACTATTTAAATAATTTTGTGCTGAATTCTTAACT TACATAAGGCTTGTCTTGTTTAATTAGGTGGTAGTTTTTGTATATTTCTACATTTAATTTTGGTCTAGGAACAACCTTCT TGGAATCATTTTCTTTATACAAAGTCTATTATGAGACTGCCCTCATGTTTCTTTAGTCGTCAATTTGTTAGACAATGTAT TGCTTCAGACATACTAACTTGCAGTATCAATATATAATGCACGTTCTGTCATGGAGCTGTTGATCTGTTGACTGATTCAT GTGATTAATCAATACTTTTGCTTATATTTTATTCTTTGGTGATTGCAGAAACATCATCAGCGTTGTCATATTTGTAATTC AGGAAAATCATGCTATCAAACTTTACAGGTTAGAATGGCTCTTAATTAATAACAAGCATGAGGTGAAATTTATTGTAGAT GCTATGTTTTTTTTCATGCTTCTTTCTCTTAATGTTTACGTTTAAATAATTATGCTTTCTGTTGGGCATGTGTGAACATG TTTTCCAGTTCATAATTTTAATTGCATTACCAGGAGAGAAGTCTACAGGAGGACAAGTTCGGATATATCACATACCTTTG TTATTTGGTGTATGCACCACTTTATATTGCTGGTCCAATTATTAGCTTCAATGCTTTTGCCTCACAGGTCTGTCAGTTAA TTTTTATATGCTTCAAGATTGGCTTTCATTACGTTTGTAAACTTTGTATAGTTGTGGTCTCTGAAACCTCTATTGATTAA GTACATCCCTCATCTTGTTATTTTCCAAAATAGAAGTATATGGAAGAAATTATTATTTTTAATTGGAAAAGAAACCAAAT TTGTCATTATTGTCTAGAATTTGATATTTGAGTCAACAATTGTTAAATGAAAATGTACACTTCAATGAATTTTCTATAAC AGAATCAAACTGTTACAGTTGAGCCATAACCAGACATGCTTTTTTTTCCTGAATGTTTCTTTTGTTGCTTACTATTGTCA GTGTTTTTGAATGGTTGTTTGTGTTCTGTTGATGATACTGGGCAGCTAGATGTTCCTCAGAGTACTATTTCAGTTAGAAA TGTGACACTCTATGGTTGCCGTTGGGTGTTCAGTCTTCTTCTTGTGGAATTAATGACACATCTATTCTATTATAATGCCT TTGCTAATAGGTGAGTGCTTCAGTACTCAGTAAAGTGCCGTGTGTGATATTTATTTTCTCAATCCAATTTTATCCTTTGA TAGCTGAAATATTTTATTCTTCAGTGGTTTGTGGAAGCATTTATCTCCTATGGACGTGTTCTTCATTGGATATGGGGTAA GGGAATACATGTCTATCTTATAACCTATGTGGTTTTGCTGAGCCTAATGACATCAACCTGATATGTGCAACCAAACCCAC CCAGACCCAGTGGCATAACTGCATATTGGCTTAGTGGTGATGGTTGATATATCATGGAAACTAAATTTCCAAATTATTTC AGCATAGTGTTTATTTTCATTCTGTTATTTATTTGTTTCAGGTCTTAAACTTCATGTGGCTGAAATTTTTACTGATCTGG CGCTTTTTCCGTTTCTGGTCACTGGTACGTTATTTGCCTATCAAGCATCTTAGCATAAATGTCCAGGTACATATGTGGAG AATGTCATTAATTTTGAAGTTTTGGTTTTAGATAAACGGAATTGAGGCTCCAGAGAATATGCCAAAATGTATTAATAATT GCCACAACTTGGAAGGCTTTTGGAAAAATTGGCATGCTTCCTTTAATAAGTGGCTTGTGAGGTGCAATGGATTCATTCTC CTTGATTTTCGCTTTATTTTCTTAAATAATAACTAAAAAATTTGATAGAATTTCAGGTATATGTACATTCCTCTTGGAGG ATCTCGAAAAAAACTACTAAATGTATGGGTTATATTCACATTTGTTGCCATCTGGCATGATTTAGAGTGGTATGCTCCCT TTATTGTCAGTTTAATCCATTATATTTGTAAAAGTTGCGCACTTTTTGACCAGATATATTTTATGCTTGATTATTCTCAT GGACCTTAGGAAGCTTCTTTCATGGGCATGGTTGACATGTTTATTCTTTATCCCTGAGTTGGTTTTAAAATCAGCAGCAA AAACATTTCAGGTAATACATATCCTTCTTTACTCTTCTAAATTTTCAGTAGCTCAAATTTGTTATTCTTAATGTCTAACA TCGAGGTAAATTTGATTGTCAGGCTGAAAGTGCTTTTGGCGAATTCATATTTCGTGAATTCAGTGCTGTTGCTGGTGCAG TCACAATTACTTGCCTCATGGTTTGTCCCTGAATGCCCATGGAAGCTATAGCATATATGAATAAATCTTATAATTCTTAG TTACTCTGTCACAGCTCACAATGACTTGAACAACCGTTCTTTTTTTTTTCCTTCACTGAGTAGTTATTATTTCTGTTTTG ATGGATACTGTTGCATTTTGATTATAAAACAAAAGTAGTGAATATCTAATTTGATTAACACGACTTTTCTTGACAGATAG CAAATCTGGTTGGTTTTGTTATTGGGCCAAGAGGCATTAACTGGTTGCTTTCTTCTTTCCTTCACAAAGAAGGTCTGTCA AGATCCTTAGCTTGTTAACTTAATTGTAGTTAATACAATATAAAATTACATCAGAAATTCCATTTCACAGGGTTGCCAGT CCTCGGGGGCATGCTTATGACATTTTATGTTGGAACAAAGGTATGAATTGTTCCGCACGTGTTCATCATCTTTGAATGTT TTTTTTTCCTTTTTATAAAATAACCTTCTGGGTGAATATTTACAGATTATGTTGCGACATAGATGAAGCTAAGCAAAGGT CGTCTTGAACCGGGCAATTACTTTGTGACCGTAATCCTTTGTGTAACTGCAAATGTGCAAAGTGTAAATTCACGTGTAGC GCTTGGAGTCACTAATCTGGTACTGAGCAGTGGGATTGGCTTGGAGGTACCCTGTGGGTATGTTTTTTGACACTCTGATT GATTTCCCAATGCATTGTCCCTCAAATTGGGAGCCATGTCTTAGAATTTTGTAATCCATGTAATGTAAAAATCAAATTAA CAGCAGACATGATACTTTTGAACTTCTGTTGAAAATAGGGTAGGTTTACAACTTTACATGTAAAATGCGACATGATAATT TTGAACTTCACACCTTATTGCTGCATGTTTAGCTTAGTTGTTCTTTGTCTGCCTTATGTTGTTTCAAGAGGAGTGTTTAA GCATCATGTGTATACAATCATCAAATAATACTCATAACGGCATGTTGAGCAGGAAATTATAAGATAGGGAAACTATGAAG TAATGCTAATGCTGGACTTTTATTTCATTTTTCATTAAACATAAACATAACATTTGACATCAGCCAAAAATACGATTGAG AGTTGCTGCCAATCGAACTCCTCCTTGAGCTAATCGCAAATTGACAATTGGCAAACGTGAGAGGAAGTAATCATCTGCAA AGTATTGTGTAATGATATAGTGAGAAAATGTAGATGAAAAAACTCTAACTTCAATAAGTATTGCAGCTTACCTTCTAGTA CTGAACCATCACTGACACCTTTATATGCCCATTGACATGCTGCCTTTATATCTTCAGATGCATATCTGAAAAATTACCCA AGTTAAGCTAGTAAATTTCAACAGCTTCATATGTAGATCAAAACACTAAACTAAATGTATTGCAACCAGCAAAATTCTTT AAATAAAACTAGTAATGAAGGAATAAAACTTTCAGATAAATAAGCACTAATGGGACTTACATATCTGGGCATGTGGTCTC ATTAGAATTGCAGGTTTCCCATCCTTCTACTTGACTGGACCATGTTTTCTATATCAGAAAATTTAAAGTGAACATTAAAC TTTGATAAGCAGTTCATTAGATTAAGTATACAAAAAGCTGCTGCATAAAATACCGTAATATTCTGTTGAATGGCATCAAT GAATTCATCTATGTTCGAGTCATAGAATCTTTCTTCTGCTGTCTCAATTATGTTCGCGTCCCAACACTGTGTGGAGTAAA AATTAGTCAGTGTAGTAGATAGTGAACTAGATCTGTGGTAGTTGATGAAGCTGAGATCTATATTCACTCACATGGTGAAG ATTTTGTTTTCTTGTATACCAGTGAACATTAATTGAATTGCCTCCCCTGTCTGAGGTGAAACCCACATGTAGAGGCTGCA GATTAACAAAGCAGAAAAAAATCATGATTATTAGATTGCTAATTAAGATATAAGCTTAGTGTATGATGATTTGGGGACTT TATCAAGTATACCTGATGGATATCTCCCATAAAATGAGCAAGGAACATCAGGGCTTGTGTCAGGTTATCTGATATTGTTT GTGATTTCACCATGTGGAACAAAAATTGTTTAGTCAGTAGATAAGATATAAGAAAAATAAATTAGGGTGCACATAAAGTT TGTTGTCTCGTAACAAAAATTTACATGAATTGTCTGTGCCATGGTTGAGGAGCTGGGTGGTGTAATTGTTAATTGCTCCT GCAACACATCTTCCCTTCTCTCCATTCTGATCCTTGCAATCCCCTGAATGTTCAAACAACTGGTTAACACTCAGTACTGC ACTACACCATCATATACCTATCTAATATCTATCACATCATTCACTTATCCATAAATTCCAAAAACTAATTTAATTTTTAA GATATTATCAGAAAATGAGAAACTTTAAAACAAGCCAAAAGTTGTGTGGTTTATGGTATCAGATACAGATAGCAGAACCA AACTGCTTTTCACAACACACACAGAAGCCCAAGCTAATGTCATGGATCACATGACTAATTATAGCATGCTTGTTTTCACA TTTGCAAGTGGTAAGTTGATTCTCCACTTTCAGAATCAACTTTTTGGTGTGTGGATGCTGTTTTTTCACAATTAATTCTA ACTCCAAAATCAATTCTTGGATGAATCTAGAAACCATAGCTTCTGCAATTGACATAACCAATTATGAGATTTCACAATAC GATTTTACAACATTGCCTACATAAACCTTTTTTTTTTTTCATAAATGTCTCAACACAAATCACTTACATTTGTTATCAAT TCTTACAACACTGATCCAAACAACATACTAAAATCCTCAAGGGGAAAAGGAGAATTATTAGAAAGCAACTTACTTTCATA CTGGTAAGTGCAAAGATTGTCAGGGGTGTCAATATAGTGTAAAGCAGAGGACCAGGGCAAATAGAACTTGACATGATCAG CCCATGAACACATGCTGGCCAAGTCATTTCCTGGTGGCAGCAACTCTTTGACTTTCTCTGCAGCTGTATTGCTGAGACGA GCCTGTTCATTGAAAAGGGGAAGGTAATGTGATGCTGCTATTGCTAGAGCTACATTTATCAGAATGAATTCTGAAACCAG AAGCATTTTGAATTGATTATGACTTGATAATTAATTGTAAAAGGGTTTCTAAACACGCAGAAAAAAGAACGTTACTCACC TGAGCAATACTGCAAACTATGGTGTGCCCATCTTCTCCCCATCCTTGTGTGTTTGGAAACACAAGCATCAATGACACTAT GGCCACCAGTTGGATTCTGAAAGAATACTCCATCTTTCTGCTTCACTACAAAACCATGCATATGGTACCTTGCCCTGTGC TTATATAATACCCTTGAATGAGTAATTTATTACATTAATTTAGTTCAATATGAAATTTGAAATGACAGG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0339000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCAAATCGCAAATGGGTACATCTGTTACGAACCAGGACAACTTAAATGGCAGTAGGAGTGGACAGTGGAAGCAAAA GGAATTGTTTTTTCTGGTGACTTATGCATTTGCTTTTTATGTTATCATAATCAGACGTTCCCTTCAACTCTCTCATGATC ATTACAAACAACTATTTGGTTTACGCCCGGGATGGCTCATTCCTCATCACCTCAATGATGTCTCAGATGCTCAGTGGACG AATTTTCGAGGAAATATACCTGTTCTTAGTCTTGTCTTTGGAATTTTCACTCTGCTGGCCAGCTTGATGAGGGATTTTTT TAATTTAAAAGTGGGGGGAATGTCTATTGTCTGGCTTTTATTTTCTTTGGCCTACCTATCATATCTGCATGGAGCATGCA TCATATTTGTCCTTTCAATAGCTACTATTAATTTTCTTATCGTGAAGATGTTTGCTCGGAAAAAGTACTTTCCACTTGTT GTTTGGAGTTACAATATATTTTTTCTTCTCTCTAATCGGATTTATGAAGGATATTCATTCTCTGTATTTGGATCACAATG GGAATTTTTGGACAATTACCGGGGCAGTTTTAGGTGGCACATAAGTTTCAACTTTGTTGTTTTGCGCATGATAAGCTTTG GATTTGATTATCATTGGACAAATCAAGATTCTCATTTTGATCAGGAGAAACATCATCAGCGTTGTCATATTTGTAATTCA GGAAAATCATGCTATCAAACTTTACAGGAGAGAAGTCTACAGGAGGACAAGTTCGGATATATCACATACCTTTGTTATTT GGTGTATGCACCACTTTATATTGCTGGTCCAATTATTAGCTTCAATGCTTTTGCCTCACAGCTAGATGTTCCTCAGAGTA CTATTTCAGTTAGAAATGTGACACTCTATGGTTGCCGTTGGGTGTTCAGTCTTCTTCTTGTGGAATTAATGACACATCTA TTCTATTATAATGCCTTTGCTAATAGTGGTTTGTGGAAGCATTTATCTCCTATGGACGTGTTCTTCATTGGATATGGGGT CTTAAACTTCATGTGGCTGAAATTTTTACTGATCTGGCGCTTTTTCCGTTTCTGGTCACTGATAAACGGAATTGAGGCTC CAGAGAATATGCCAAAATGTATTAATAATTGCCACAACTTGGAAGGCTTTTGGAAAAATTGGCATGCTTCCTTTAATAAG TGGCTTGTGAGGTATATGTACATTCCTCTTGGAGGATCTCGAAAAAAACTACTAAATGTATGGGTTATATTCACATTTGT TGCCATCTGGCATGATTTAGAGTGGAAGCTTCTTTCATGGGCATGGTTGACATGTTTATTCTTTATCCCTGAGTTGGTTT TAAAATCAGCAGCAAAAACATTTCAGGCTGAAAGTGCTTTTGGCGAATTCATATTTCGTGAATTCAGTGCTGTTGCTGGT GCAGTCACAATTACTTGCCTCATGATAGCAAATCTGGTTGGTTTTGTTATTGGGCCAAGAGGCATTAACTGGTTGCTTTC TTCTTTCCTTCACAAAGAAGGGTTGCCAGTCCTCGGGGGCATGCTTATGACATTTTATGTTGGAACAAAGATTATGTTGC GACATAGATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0339000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVKSQMGTSVTNQDNLNGSRSGQWKQKELFFLVTYAFAFYVIIIRRSLQLSHDHYKQLFGLRPGWLIPHHLNDVSDAQWT NFRGNIPVLSLVFGIFTLLASLMRDFFNLKVGGMSIVWLLFSLAYLSYLHGACIIFVLSIATINFLIVKMFARKKYFPLV VWSYNIFFLLSNRIYEGYSFSVFGSQWEFLDNYRGSFRWHISFNFVVLRMISFGFDYHWTNQDSHFDQEKHHQRCHICNS GKSCYQTLQERSLQEDKFGYITYLCYLVYAPLYIAGPIISFNAFASQLDVPQSTISVRNVTLYGCRWVFSLLLVELMTHL FYYNAFANSGLWKHLSPMDVFFIGYGVLNFMWLKFLLIWRFFRFWSLINGIEAPENMPKCINNCHNLEGFWKNWHASFNK WLVRYMYIPLGGSRKKLLNVWVIFTFVAIWHDLEWKLLSWAWLTCLFFIPELVLKSAAKTFQAESAFGEFIFREFSAVAG AVTITCLMIANLVGFVIGPRGINWLLSSFLHKEGLPVLGGMLMTFYVGTKIMLRHR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 20 | 20 | - | – | |
Phobius | 1 | 28 | 28 | - | – | |
PANTHER | 19 | 534 | 516 | 2.3E-211 | – | |
PANTHER | 19 | 534 | 516 | 2.3E-211 | – | |
Phobius | 29 | 48 | 20 | - | – | |
TMHMM | 29 | 48 | 20 | - | – | |
Phobius | 49 | 85 | 37 | - | – | |
TMHMM | 84 | 106 | 23 | - | – | |
Phobius | 86 | 104 | 19 | - | – | |
Phobius | 105 | 115 | 11 | - | – | |
Phobius | 116 | 147 | 32 | - | – | |
TMHMM | 126 | 148 | 23 | - | – | |
Phobius | 148 | 155 | 8 | - | – | |
Phobius | 156 | 175 | 20 | - | – | |
TMHMM | 161 | 183 | 23 | - | – | |
Phobius | 176 | 259 | 84 | - | – | |
Pfam | 201 | 484 | 284 | 1.0E-39 | ||
Phobius | 260 | 279 | 20 | - | – | |
TMHMM | 260 | 282 | 23 | - | – | |
Phobius | 280 | 299 | 20 | - | – | |
Phobius | 300 | 322 | 23 | - | – | |
TMHMM | 303 | 325 | 23 | - | – | |
Phobius | 323 | 341 | 19 | - | – | |
TMHMM | 340 | 362 | 23 | - | – | |
Phobius | 342 | 362 | 21 | - | – | |
Phobius | 363 | 415 | 53 | - | – | |
Phobius | 416 | 431 | 16 | - | – | |
TMHMM | 417 | 434 | 18 | - | – | |
Phobius | 432 | 436 | 5 | - | – | |
Phobius | 437 | 454 | 18 | - | – | |
TMHMM | 438 | 457 | 20 | - | – | |
Phobius | 455 | 474 | 20 | - | – | |
Phobius | 475 | 497 | 23 | - | – | |
TMHMM | 477 | 499 | 23 | - | – | |
Phobius | 498 | 516 | 19 | - | – | |
TMHMM | 514 | 533 | 20 | - | – | |
Phobius | 517 | 533 | 17 | - | – | |
Phobius | 534 | 536 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0339000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…