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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0008700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0008700.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Myb/SANT-like DNA-binding domain protein; TAIR: AT4G02550.2 Myb/SANT-like DNA-binding domain protein; Swiss-Prot: sp|Q9FFJ8|LIMYB_ARATH L10-interacting MYB domain-containing protein; TrEMBL-Plants: tr|K7LCA7|K7LCA7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0008700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:1690767..1700918) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCTCGCTCTCGCTCCCGATCTCGCTCCCGATCTCACTCTCGCTCTCTTGCTCTCGCTCGCGATCTCACAGTCTCTGCAA TCTCGTTCTCTGCAAATCCCGATCTCACCCTCTCTGCAATCTCGCTCTCCTGATCTCACTCTCTCTGCAAATCCCGATCT CACTCTCTCTGCAATCTCGCTCTCTCGTTCTTGCTCTCCCGATTCATGGAGTTTCTTCCCCCTTGATTCAGGTACAATCT CTTGATTCTTTCACCAATTTTGCATTATTGTTGTTGTTTTTTCGAATTTGATTTTGTTTTTGGAGTTGAAATATCTGTTT TGTTCTTGTCTTGAGTTTTGTTTGTTGATGCTAGTACTGGGTTTGTCATGTTTTTTGCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGA AGCAGATGAACATAGGTGTGAACATATGCGTACTGGGTTTGTCATGTTTTTTGCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGAAGCA GATGAACATAGGTGTGAACATAGGCGTACTGGGTTTGTCATGTTTTTTGCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGAAGCAGATG AACATAGGTGTACTGGGTTTGTCATGTTTTTTCACCTTCACGCTCTGGATGTCATTGTTTACTTGAAATGAATGGATCAA TAACTACTTGCTACTGTGTGCAATTGATTCTACCAATGCTAGTGCTAAATTTCCTCTGCTGGTTAACTTTTCTATTTGTG GCCATTTGGTGCGTCTGATTTTTGCTGTTCACCTCAGGATCTCTTGGTTTCTGCTAATTTTGACAACAAAAAAATATAGT AAAAATGTTGATTTTTTAGTCTATGTTCCTTATGTTCTTGGATTTTGGGAAACCTGTTTTGCATTGTTTTGAGGGGTTGG TTATATCTGGTTTTGCCCTTCACATTTTCTAATTCTTTCTTGTTTTATCTTTTTTCTGACAGTTGAATTGTTGGAGCTGC 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ACATAAGAATTGCTCAAACTGGATCTGCTTCCATGGTGATGGTCTGCTTTTGTAGGTGTATTTCTAGATTAGGATGGTTT TGGGGATAAACAAAAGGACAAAAACCCAATACGTAGAGAAGGAGTTTGATGAAAGAGTAATTTTATAGCAAGTAGCAATA GCATGATAGATATATATAATAAGGTGCATTGCATTCCTCAAGCATTATTCAAGTTGTCATGACTGTGATTTGATTTATGT CTCGGTTTGTTTTTTATGTGACTTTGTATCGTGTGTTTATTGTTTGTTTGCATATTGATATACTATATAGCACTTTCAGC TTCTCTTAGGTGTAGTTTCTGGTTTGGTTTGAAATTATGAACACAACTAAGCAATCAAACTCACAGAGTGTAGTCTTTCT CTTCTTTCCTTCAGCTAAGGTTGTGGTTGAACTTGCGAAATCCAGACTAATCCAAGCTGTTGTGCAATTACACCCATCAT TTGTCTCTCTGGATGACATCAATGGTATGAATTCTCAATATTTAGCATTTCTTCTCTCTGCATATTTTAGTTATTGAAAA CTTCACTGTATCTTCTAAGGATGACTACCAAAATTATGTTGCAGCTTCTTGTCATACCATTGAAATAGGCAATTAGGCAT GTTCGGAATATAACTACAGTCCTCAGTCACTTCCTAAATAATCATATTTGTCTTCACGCTGACTTGCATTGTTTTTTACA GTTTCTACATACTGCTGGTTTATCATAATCATTACATTTTTTAAATTTGATTTAATGAAAGATAAATAGATTTGGTAAAC ATCTTATGCTGAGCCTAAATATTGAGCACTTCACTTTATAAATGATGTTGAAGAGATTCTAAGGTTCTTGTTTTCCTGTC TTTTATGTTGTCATGTCCATTTACTTGTCTATCTACTTAATTTTGAATTTTCATTTACACTGTCAATTCTTCCTTTCCTG TCCTAACATGCTTTGATTGTTTCAATAGGACTATAGGTACTAATCAATAAGTTGTTTGTGTGTGTTGTAAAATCTAAAAG AGGAATAAAGTTATCTGTGAAGTTCAGTTTATAAAAAATAGTTTTCCTAGCGGAAGCTAACAGAGATTTAGAGTGTTTTT TCCTTACTAAATGAATATTGATGTCTTTCTAGTATTCAATCATTATTTTTATACTATTTGATTAATCTGACGTATAATTT GTAGCTTCAAATTGATTGCCATGGCAAGTTCATACTTTTTAGATATTTCTTCCACTTCAATGCTCCAGTACTTTTTACTT TTTTAGATATTTCTTCCAGTTAAGCCCTATGCTTGAAACCTTATTATATTCTGCCATGACAATTTGAGAAAAAAATAGAA ATTTGAGTTTAAATTCTGTCCACATTCAGTGTGAATTTTTTACAGTTTGTTTGAAAGATGAGCAAACCATAATGAGTGTT TTTTACGCTATTATTTAGAGAATGTTTTAACTTAACTCTTCACATTTTCTTAGTGAGCTTGTACACATCCCTTGTCCTTT TTAATCACATCTTATCCATTTTATGTTTAAACTAGCTGATTCTGAATCTGATTGAGTTAGCTTCTCTTACTTCCTATTTT CTTAATAGTGTCATGCAATATTGATGTTTTATTATATGTTTTTTTATAGTTAACAAATGGATCTTAGAGTAGTTGACACT TCAGTTCTTTTACGAAAACGTAAAAGAAATGAAGAAGAAGAGGCAAAATTGCAGGAGCAAATAACATTCATTGTTGCTAG TGTCGTTGCTATGCTTTTAGGTGTAGTAGCTTGGTATCATGAGATGCATTTTGTTAAGGAACCGTCCCGAAATTGGGAAT TGGAAAGACACAATTTCCTTAATCGTCTATATAGAGGAACTGAAAGTGATTGCATTGAACAATTAAGAGTCAGTAAAAGG GCATTTTTTTAAACTTTGTGGAATTTTACAAGATAAAGGACAGTTGGTAAGAACAAGAAATGTCCCAACGATTGAAGCAG TGGCAATGTTTTTGCACATCCTTGCTCACAACCTAAAGTACAGAGTAGTGCACTTTACCTATTATAGATCCAAAGAAACA ATAAGTAGGCAATTCAACAATGTCCTACGAGCTGTGATGAAAGTGAGTGGGGAATATTTGAAGTTTCAAGACCATAATAA TCTAGAGGGCTCTGAGGCATACAAATGGAGATGGTTTCAGGTAAACTTATCACAAGCTTGAGTAATTATGAGATTTCTAG TAATTACAACTTATTTATGATTTTTAAACTTTTTTAGAATTCGATTGGAGCACTTGATGGGACACATATTCCAGTAACAG TGGCAGCAGAAGATAAACCTAGATACCGTAAGGGTGACATCTCTACGAATGTGTTAGGGGTTTGTGGTCCAGATTTAAAG TTATGTTGTGTCTGTTATCTGTTTGTAACAGTGGCAGCAGAAGATAAACCTACATATTTGTTTGTTGTGTCTGTTATCTG TTTTTCCATTTCGTATGTGTTTCTTGTTTATTTCTGTAGTTGCTTTGTTCTGTTGTGTGTGTTGGCTCACTTGGAAGAGT CTTGTTTCCAAGCTTTTTATCCTATTAATATTAATTGAATGATTGATCAGAACTAACTGTGGCTTGATTCATCCAATTAT TAGTTAAATGCTTAGTATGTTGTCTTGTATATGTATATTCTGTTTATTTTCAGAAACTCTTCATGATTATTTATTTTCAA ACAGGGTTACAGCTGGACCAGAGACTTGGACAGTGAGGAGCTATTGGAACAGTTGCTATATTGACTTGTTGGTTGCCGGG TAATATTTTATAACTTGAGGATATTCATCATCTTTTTGTTATTAGGTTCAAGTGCTCTATTTTTCTTCTGGTTATTAGTA ATTGTCTAATGTTTGTTTATGTTTGAAGGAGAGATGAGGGGAAAAAGGAAAATGACGGAAGCTAGTAATGAGGATAAGAA AGATGATAGCAGAGCTTACTTTACTTGGAACTTGGAGATGGACCGTGCACTTGCTGATATCCTTAGAGATCAAAGAAGCA TGGGAAACAAGAGTGGTGGTGCATGGAAAGGAGTGGCATATAACACTGCGGCTCAAATGTTGTCTTCACGCTTCAATTTG CAACTTATTGGAGAGAATGTTAAAAACCGCATCAAGCTGTGGAGATCATGGTATGGCATTGTTAGTGACATCCTTAGTCA AAGTGGTTTTGATTGGGATGGAACCAAATATATGATTTCTGTTTCAAATGAAGATGCATGGAATGAGTATGTCAAGGTAA TGATTTTTAATGTTATTACTATTTAATTAAATTATTGTTTGTGTTAGTATTAATATGCTGTCTATTTTCTTTGTAGTCAC ATAATGACGCTAAGAGGTTCCGATTTAAGGTGATTGCTAATTGGGATGACATTGTAGACTTGTGTGCTAAAGATAGAGCA ACAGGAATTGGAGCAGAGACATCCTTGGATGCAGATGACATCATGAGCAAAGAAGCAAATGAGGATGGAGCTTATATTGT GGATATTGATGCTGATGAACAAAGCTCTACAACAAGGAAAAGCAAACAACCAATGAAATTCAAAAAGGGAAAAAGTGGAG AAAAGAATGGGATAATTACTTCAATGAATAAAGTGGCTGAGTCATTGAGTGAATTTGTACAAGCAACTAGAAAAGGGGTG AAAAATGTCCAAGAAGTGGTTCATGATGTGATGGATGAGCTAAAGAACATTTCGGACCTAAATGGCACTCAATGGCTAAA AGCAGTGGATTGGCTTTCAGAAAATCCAAATAAGTTGGAGATTTTGAAAGCTCTTCCCATTGAGAGAATGAAAAATTACA TCTTAGCTTTTATGCACTGATTCGTGATTTGCTATAGTTTATGGACCCATTTGTAGTGTTTCCAACTTTCCACTATGTCA CTGTTGAGATTTTTTTTATTTAATTTTCATTTGGATTGATGTTAGCACTTGTTACTGTTGAGACTTTCTTTTATTTAATT TTCATTTGGATTGATGTTAGCACTTGTTAAAAACACAGTTTTAAATTTAAAGTAATAGGAAATGTGATATCTCCATGAAT GTATTAGAAATTTGTGATCCAACTAATTTCAGATTTTTGAGTCAATTCAGGGGGTTTGGGCCGATTATAAAATTCTGGGT TAATTTTAAGTTAAGTTTTTTTATTATAATTATCCAAATAATATTCATTAGATTAAAAAAATAAGAGAAAGGAAATTCAA TTGATTCAATTGAATTCCCTAGCATTACCCAAACAAAGAATTTTAAAATTGATGGAATTTAATCACCTTATCCAAACAAG GGAATTTAAAAATTAAGGGAATTCAATTGAATCAATTAAATTCCCTAGAATTTAAAATCCCTTGGATTTCTA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0008700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTTGAAGGAGAGATGAGGGGAAAAAGGAAAATGACGGAAGCTAGTAATGAGGATAAGAAAGATGATAGCAGAGCTTA CTTTACTTGGAACTTGGAGATGGACCGTGCACTTGCTGATATACTTAGAGATCAAAGAAGCATGGGAAACAAGAGTGATG GTGCATGGAAAGGAGTGGCATATAACACTGCGGCTCAAATGTTGTCTTCACGCTTCAATTTGAAACTTATTAGACAGAAT GTTAAAAACCGCATCAAGCTGTGGAGATCATGGTATGGCATTGTTAGTGACATCCTTAGTCAAAGTGGTTTTGATTGGGA TGGAACCAAATATATGATTTCTGTTACAAATGAAGATGCATGGAATGAGTATGTCAAGTCACATAATGACGCTAAGAGGT TCCGATTTAAGGTGATTGCTAATTGGGATGACATTGTAGACTTGTGTGCTAAAGATAGAGCAACAGGAATTGGAGCAGAG ACATCCTTGGATGCAGATGACATCATGAGCAAAGAAGCAAATGAGGATGGAGCTTATATTGTGGATATTGATGCTGATGA ACAAAGCTCTACAACAAGGAAAAGCAAACAACCAATGAAATTCAAAAAGGGAAAAAGTGGAGAAAAGAATGGGATAATTA CTTCAATGAATAAAGTGGCTGAGTCATTGAGTGAATTTGTACAAGCAACTAGAAAAGGGGTGAAAAATGTCCAAGAAGTG GTTCATGATGTGATGGATGAGCTAAAGAACATTTCGGACCTAAATGGCACTCAATGGCTAAAAGCAGTGGATTGGCTTTC AGAAAATCCAAATAAGTTGGAGATTTTGAAAGCTCTTCCCATTGAGAGAATGAAAAATTACATCTTAGCTTTTATGCACT GA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0008700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFEGEMRGKRKMTEASNEDKKDDSRAYFTWNLEMDRALADILRDQRSMGNKSDGAWKGVAYNTAAQMLSSRFNLKLIRQN VKNRIKLWRSWYGIVSDILSQSGFDWDGTKYMISVTNEDAWNEYVKSHNDAKRFRFKVIANWDDIVDLCAKDRATGIGAE TSLDADDIMSKEANEDGAYIVDIDADEQSSTTRKSKQPMKFKKGKSGEKNGIITSMNKVAESLSEFVQATRKGVKNVQEV VHDVMDELKNISDLNGTQWLKAVDWLSENPNKLEILKALPIERMKNYILAFMH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 29 | 124 | 96 | 4.3E-15 | ||
| PANTHER | 34 | 285 | 252 | 1.8E-101 | – | |
| PANTHER | 34 | 285 | 252 | 1.8E-101 | – | |
| MobiDBLite | 187 | 207 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0008700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…