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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0012800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0012800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | O-acyltransferase WSD1; TAIR: AT5G53390.1 O-acyltransferase (WSD1-like) family protein; Swiss-Prot: sp|Q93ZR6|WSD1_ARATH O-acyltransferase WSD1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2S3D0|A0A0B2S3D0_GLYSO O-acyltransferase WSD1; Found in the gene: LotjaGi6g1v0012800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:2369595..2390204) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACACAAGTGAGGAAAGTGCATATCTTTAAAATAAGATAGGTGGAGAGGGTGAGAGATCGAGACCATAATTTAGTAGTGAA TTGGCAAAGCTTTTTATCTAGTGCCATGCCAGCACATGGTCTGAAGTCACTGTATTAATTAGGAGATGTTTTGGCAATTG GCTCTCTTTTAAGTCTCCTATCCCATGTTCTGTTTTTCAACGCTCTTCACAAAACAAAGTGGGTAGATCAGAGTCGAGAG GGTGAGCAAACATATATGGCATCGTCAAGAGGCGGTGGTGAACCGCTGAGTCCGGCGGCACAATTGTTCCTCGCTCCATC CTTCAATTGTTATGTGATTGCTATGATGGGTTGCAAAACAAAGATCAATCCTCAAGTCATAAAAGAAGGTTTATGTCAAA CTCTTCTTAAGCATCCTAGATTCACCAGCAAGCTCGAGGTAAGTCACTCTAAATTAAATCCCCAAATTCAAAGAATTTCA ACTTTTCTGATATTCTTGAGAATATTTGTTTCGCATGGTCATTTTTAGTAAATACTTATAAGAATAGTAAGATAAACTGA TTAGTGATTACATAGCTAGGGAGAGAGAGTTGGTGGGTGGGATTGAGTTTAGAATATTATTTGTTCTGTACTAGGGCAAG CTTACGTAAAAGAGTGACAGAAAGTAAACCCTAGCAGAGCACTAAAATAGCAAAACTACCATAAAAGGAATATTCTCATT AATGCTGAAAAAGTTGGTTTCGTACAAGTGGATGACCTCCCCTTTTATAGAGGGGGTGATCATGATATGGACTTTTCCTA TATTTGGGCCTGACAATCAGGGCCCAAATCCCTGTACATATAAGACAAATCCAAAGGAATCTTCCAGCTGGCTTGTGGGT CCATCATCTAAGGGAGGGCAATGAAGCTCGTTGTGTTGCACTTCCCGCCATGGCTATCTTCAATGGTTTATTGTTCATTT 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CATTGACCCAGTGTCTCGACTGAGTCGATCACCGGTCCGAGTCTGATAACACTGCTTTAAGGTTGTTGCACAAATATTAA GAAATAGCAATTAATGTTCTTGTTTTATTAAAATTACAGCCTAACTTCCTACTGTACCCTTTATCTCTCATATTAATTCT AACTTTTCTACCACCAATAAATGAATGGTACAATTGGTAAAGTATAATTAAGCTCTCTTGAACTTTGTAAAGTGGCAGAT AATTAGGAACAAAATTCAACTAGAAATAATGTCAGTTATTTAGGAACGGAGGGAGTATATATTAGTCTAGAGTTGTACTA ATACCAATAAATATTGATTAATGTGATGATGTATATGAAAATGTTGTGGGGGGGCAAAAATGAAAATGTTGTGGGGGAAG TTCCCCTCTTGTATAACATAGATCCTTCTTTGGGAAAATGCATTAATTAAGAACTCAAAGCTGAATTACATGTGTCAAAA GAACTAATATAACTGATAAGGTCTAAGCAAATTAAAATTGGTAGATTGTTGGACTTCTTAAACATCTACTAGTAGTTGAG AGTTCGATTCCTGAGTGATGTGTACAAAAAAAAATTGGAAAGAGACTTATCTACTTAACGTGATCTCAGAGCCTTCAGGA AGATTAATGTCATTGCTGCCAGTTGTGAGATATTTTGGTAGAAAAAAAAACTAAAACAAGCCTATGCGAGAAATTATCCC ACGAAGAAAAATTAGGATACTCTCAAGCTATATAGATCAAGATAAGAGATGAGCAACCTTATTTCCCCCATGAGCTAACC CAATAGAGGAGAAATATGAGCATTAAGATCTACAATCCAAGATAATAGAATCTAAAGATGATATGCTACGATTGTGCCAG AAACAAGTGTATACCTCAAGCGAATCAGTTTCAAAAACCACCACCCACCTTCGTTTCCAGTTGATGTTCCATATATACAT TGCCTAGCGAAAATATTATGTATGTAATAACTAATAAGTAACTGTGATTCTGTGAATAAACTGTTCCTAGATTATCATCC CGCACCACCATGTCCAATGTTTTAAAAATATTTTTTTCGTAAATTGTTTTTTATGATTTTTAATTAAGAAATCCAAAATG ACACACATCATTTGTTCCTTTAATTTTATTTTTCCAAATTTGTTTTTAATATTCTTACAGGTGAGGAAGGGAAGGAATAC CGGATGGACGTTAACAACAGTTAACTTAGATGACCATGTCATAGTTCCTGAAATAGATTCTGTAATAGATTTCCCAGATA GGTTTGTTGAAGACTACGTATCCAATCTCACTAAAACTCCACTGGACTTGTCCAAACCACTTTGGGAACTACACATCCTC AACATCAAAACCACAGATGCTGAGGCAGTTAGCATTTTTCGGATCCATCATTCCATGGGGGATGGTGCCTCTCTCATATC GCTCCTCCTTGCTATTACTCGTAAAACCTCTGACCCTGACGCGTTACCAACGATCCCAACCCATAAGAGAGCTAGCTCAA TTTCACAATCCAACTCTTTCTTGTGGTTCTTCATGGCAGTCTGGTGGGGTTTGGGCCTTATTTGGTACACTGTGGTGGAT ATGGTTCTTTTTGTTTTAACCATTTTCTTCATCAAAGACACCCAAACTCCTCTAAAAGGTGCACCTGGAGTCGAACTCAA TACTAAGCGGTTCGTGTATCGCACGGTTAGTATGGATGACATCAAGCTTGTGAAGAATGAGATGAAAACGGTAACTTACT ACCCTATTTTACTTTACTCTATTAAATTGGTATACAACCTTTAGCGTACATATATAACAATGTGTTTTAATTAACGTGCT TATACTAAATCATGTTTAATTAGACCATCAATGACGTTTTGTTAGCTGTAACACAAGCTGGTCTTGCTCGCTACTTAAAT CGAGAATATTGTAAGTTTCTATATTTGTTATGATCTAATTTGCCATTTTATCACTACAAAAATACCATAATGTTAAAAAT CATTAGAATTATCATTTTTTATAAAAAAAATCATTTGTATTTAAAATGAAAAGAACTCAAACAATTGACTTTCAATATAT AATGCTTTGTTACTCATGTAATCCTCCAAACAGGTGCAGGTGCTAATGGGGCTGCAGAATGGAATTCAAGTAGTATCCTT AAGAAAATTCGCCTTAGGGCAGCAATTCTTGTCAATATTAGACCTGTAGCTGGAATCCAGGTAAATTTAGTTTGCAAATT ATTATTGTCGTGGAGATATTACAGGATAATTTGATATATTATAAACTACTAAATCAAAATGAATTCTTCATCTCGTAACA AAAAAAAAGAATGAATTTGCCCGTAGTACAAAAGGGTTTTTATAACACAATGTATGTTTGTCATGAAGCATTTATTTTAA AAGCAAACAAAATGAATTATTATATAAATAAAATACAAGATGTACCTAAGATAGTGTACAATATCATGTTAAAAGGAACA TATTAAAATAATTTGCTGTTACATGCCTATTGTCACTTGTCTTCAACTAACCTTCCAACATTAGAAACCTACTTTCTTGT TACATAATTGTTACTCCATTTTACGATCATTTATATATATCATATACATGCAAATATTTATAATTTGTTGCATATTCCCA TTAGATTTTGTTTTAATTTTGCTTTCTACATAGCGAAAAAGTTATAATAAGTATATATTGAGTCATTGCCAATGATTAAT TAATAAACTTATACAATATTCATTAGGATATGGCAGATATGATGGCTGAGAAATCAAAAGCCAAATGGGGTAATAGGATG GGATACGTAATCCTCCCGTTTTCCATGAGTTTACATGAAGATCCATTAGAATATGTTCGCCAAGCTAAGGCCACAATTGA CCGGAAGAAGCACTCATTGGAAGCTGTTTGCACTTATGTTTGCGCAAAATTGTTACTCAATTTATTTGGGGTAAAGGTAT GAATTGAATTTCTATGTTTTTTTTTTCTATAGACAAATGTTAGTTGTTAGTAATGTTAGTAAATTAGTCATTCTCAAGAT TCGAACTATGGACCATTCACCCTTCATTCCACCCAACCTTATGTAACTTTGTAACTTAATCTTCAAGCTAAAAAATGATA GACGTTAAAACAAAGAATTATCTTCACGGTAAACTACTTATTTTAAGAAATCAATAATATTCAAGTATGGCCTTAGTTAT TGTATTTTTCATCTTTTATAAAATATTCTTACATTTTAGGACTTGCCTGCAGGTTGCTGCTTCCATAGCACGAAGAGTTC TCTTTAACACCACTGTGGCCTTCTCAAACGTGCCAGGTCCGGTTGAAGAGATTAGCTTCTATGGCCATCCTTTGGCATAC ATTGCTCCTAGTGTGTACGGACATCCTCATGTAAGTGTTCAAATATTCACAATTATATTATACTAGCATAGAGGATCATG CTTCGGGTGGTAATCTATGTGACTTAATTCATCCCTTGACAAATATTGCTCCTAGTGTGTACGGATATAGGTCTTAAAAG TGAGGTTATATTAGATAAATATATGATACTTTGATTTGAAAAGTAAGCTTAATAGTATAATCCCAAACATAGTTAAACTT TCTAAGCCAATGGTTTTTAGGGGAAATAAAAGTTACCCTAATTAGCCGAGGTCATAAACTAATGCATTTCCTTTTGATTT CTTTTATAGGCACTCACTATCCATTACCAAAGTTATGCTAATAAGATGACAATTTCTCTCTCAGTGGACCCGATTGTCAT TACAGATCCCTACCTCTTGTGTGATGATTTACAGGAATCACTCAAACTCATTTGTGATGTTTTTCGGGGAAGGCATATTG ACAATGTATAAGCTTGACAATAGATAATCTAGTTGAGCATTTTTTAAATGAAAATGATTTATGGAGATACAGATTTTTGC CACATCTATCTGATATACCATTTAGTAAGGGTTTAATCGTAAAAAACATTAGCAGCGGTTAATAACCGTCACTAAATGAA ATGTCAGAAAGATGTCACGATATTTTGTATGTCGGTCTATAAGAGCTCTTTATAAAACTTTAAAAAATTTAAATTTTTTT TTTATCATTGATCAATTGGAAATTTAAATAATGTTCATAACTTGTGCCAATACAACACTTGTAATTTGTAAACTTTGATT TGTAACGGTGTGAAATAAAGTTTGTACCTTAGCTCTCAAGTTCTTATTTTATTGGTAAAATATGTATACATTCTTCTCTA AACTCACTAGCAAGAGCCTTCTCCTTGCTTCGTTTGGTTGAGGTTTCGGG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0012800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATCGTCAAGAGGCGGTGGTGAACCGCTGAGTCCGGCGGCACAATTGTTCCTCGCTCCATCCTTCAATTGTTATGT GATTGCTATGATGGGTTGCAAAACAAAGATCAATCCTCAAGTCATAAAAGAAGGTTTATGTCAAACTCTTCTTAAGCATC CTAGATTCACCAGCAAGCTCGAGGTGAGGAAGGGAAGGAATACCGGATGGACGTTAACAACAGTTAACTTAGATGACCAT GTCATAGTTCCTGAAATAGATTCTGTAATAGATTTCCCAGATAGGTTTGTTGAAGACTACGTATCCAATCTCACTAAAAC TCCACTGGACTTGTCCAAACCACTTTGGGAACTACACATCCTCAACATCAAAACCACAGATGCTGAGGCAGTTAGCATTT TTCGGATCCATCATTCCATGGGGGATGGTGCCTCTCTCATATCGCTCCTCCTTGCTATTACTCGTAAAACCTCTGACCCT GACGCGTTACCAACGATCCCAACCCATAAGAGAGCTAGCTCAATTTCACAATCCAACTCTTTCTTGTGGTTCTTCATGGC AGTCTGGTGGGGTTTGGGCCTTATTTGGTACACTGTGGTGGATATGGTTCTTTTTGTTTTAACCATTTTCTTCATCAAAG ACACCCAAACTCCTCTAAAAGGTGCACCTGGAGTCGAACTCAATACTAAGCGGTTCGTGTATCGCACGGTTAGTATGGAT GACATCAAGCTTGTGAAGAATGAGATGAAAACGACCATCAATGACGTTTTGTTAGCTGTAACACAAGCTGGTCTTGCTCG CTACTTAAATCGAGAATATTGTGCAGGTGCTAATGGGGCTGCAGAATGGAATTCAAGTAGTATCCTTAAGAAAATTCGCC TTAGGGCAGCAATTCTTGTCAATATTAGACCTGTAGCTGGAATCCAGGATATGGCAGATATGATGGCTGAGAAATCAAAA GCCAAATGGGGTAATAGGATGGGATACGTAATCCTCCCGTTTTCCATGAGTTTACATGAAGATCCATTAGAATATGTTCG CCAAGCTAAGGCCACAATTGACCGGAAGAAGCACTCATTGGAAGCTGTTTGCACTTATGTTTGCGCAAAATTGTTACTCA ATTTATTTGGGGTAAAGGTTGCTGCTTCCATAGCACGAAGAGTTCTCTTTAACACCACTGTGGCCTTCTCAAACGTGCCA GGTCCGGTTGAAGAGATTAGCTTCTATGGCCATCCTTTGGCATACATTGCTCCTAGTGTGTACGGACATCCTCATGCACT CACTATCCATTACCAAAGTTATGCTAATAAGATGACAATTTCTCTCTCAGTGGACCCGATTGTCATTACAGATCCCTACC TCTTGTGTGATGATTTACAGGAATCACTCAAACTCATTTGTGATGTTTTTCGGGGAAGGCATATTGACAATGTATAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0012800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSRGGGEPLSPAAQLFLAPSFNCYVIAMMGCKTKINPQVIKEGLCQTLLKHPRFTSKLEVRKGRNTGWTLTTVNLDDH VIVPEIDSVIDFPDRFVEDYVSNLTKTPLDLSKPLWELHILNIKTTDAEAVSIFRIHHSMGDGASLISLLLAITRKTSDP DALPTIPTHKRASSISQSNSFLWFFMAVWWGLGLIWYTVVDMVLFVLTIFFIKDTQTPLKGAPGVELNTKRFVYRTVSMD DIKLVKNEMKTTINDVLLAVTQAGLARYLNREYCAGANGAAEWNSSSILKKIRLRAAILVNIRPVAGIQDMADMMAEKSK AKWGNRMGYVILPFSMSLHEDPLEYVRQAKATIDRKKHSLEAVCTYVCAKLLLNLFGVKVAASIARRVLFNTTVAFSNVP GPVEEISFYGHPLAYIAPSVYGHPHALTIHYQSYANKMTISLSVDPIVITDPYLLCDDLQESLKLICDVFRGRHIDNV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 180 | 180 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 33 | 33 | 5.0 | – | |
| PANTHER | 8 | 470 | 463 | 1.5E-201 | – | |
| PANTHER | 8 | 470 | 463 | 1.5E-201 | – | |
| SUPERFAMILY | 9 | 168 | 160 | 1.07E-8 | – | |
| TMHMM | 15 | 33 | 19 | - | – | |
| Pfam | 95 | 256 | 162 | 7.2E-13 | ||
| TMHMM | 181 | 200 | 20 | - | – | |
| Phobius | 181 | 212 | 32 | - | – | |
| Phobius | 213 | 478 | 266 | - | – | |
| Pfam | 323 | 466 | 144 | 2.9E-52 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Diacylglycerol O-acyltransferase activity | Catalysis of the reaction: acyl-CoA + 1,2-diacylglycerol = CoA + triacylglycerol. | ||
| Biological process | Glycerolipid biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of glycerolipids, any lipid with a glycerol backbone. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0012800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…