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LotjaGi6g1v0014800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0014800
Transcript ID LotjaGi6g1v0014800.1
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase family protein; TAIR: AT3G24190.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q55680|Y005_SYNY3 Uncharacterized protein sll0005; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VGN0|A0A072VGN0_MEDTR ABC1/COQ8 Serine/Threonine kinase; Found in the gene: LotjaGi6g1v0014800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:2667807..2680301) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTTTACCATGGGAAGGCTATTTATATATAAAATTTAAATTTAAATTTGGAAAATAAGCTGTCCTCACTTGCAGCTGGA AGAAGCACTGGTGGTGGCAAAGCAAACTGTCACACTTCACACCACAACCAACCACCACCGTCGACCCTTCCTCCGCCATG GACGCCGCATCGCAGCTCGTCTACTGCAAAATCGACCCCTTCCGTCGCTCCTCTCATTCCCACCGCCACAGCCTCCTCCC CCTCCGCCGTCGCTCTAATCGCATTTTCGCCGTCGCCACTGAACCAAAACCCGCTCCGGTTACAACCGTCAACGGTTCAT CCTCGAAGTCTCCGCCGAACAGACCCGTCCCCACGGTAACTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTGATTTTACCTGATTCACAG TTCTTGTTGAGCTCAATCGATTCTTGTATACTGTAAATTTTCTTCAGAGAATTGGAGATGTTTCGAAGGAGATTAAGCGA GTGAGGGCGCAGATGGAAGAGGACGAGCAGTTAGCCTCGCTCATGAGAGGTCTTCGGGGGCAGAATCTGAAGGATTCTCT CTTTGCTGAAGATGATGTTCAGCTTCGTCTCGTTGAGGTGCTGAGTTGAAACTTCACTCAGATATATATTTTGTGTAGCT TGTATTTGATGCAGGAAGAATATTCATTAGCATTGAATATTAATCAGTGTGATTGTTAATTTTCCATAAGAAAATATAAA TTGATTAGGATTGTAATGGAGTTTGGTACTTTGTGTAGGTAGATGAGAGTAGTGAGTTTTTGCCTTTGGTGTATGAACCT TCCACCATTTCTGCATATTGGGGAAAACGTCCACGTGCAGTTGCAACACGTATTGTGCAGTTAATGTCGGTTGCTGGTGG TTTTCTTTCGCGTCTTGCCTGGGATGTGATTAACAAGAAGGTTAAGGAGGTAAGCACCGTATCTTCAATGTTCAGAGAAA 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CATTGTTGATGAGGCTTATCCATATATTGCACAGGTATTAAACAGTCAGGAGTTTGCTTTTGCCTGTTCCATTGTGTTGA TTTCTCTGTGTAATTCATAACTGCATATCTGCTTGGAAATTTAGTTTTGCTTGAACCAGATAAGATTAGCCATTGGTTTT GATTTGGTAACATTATGTAGAATCTTACAAAAGGTATAATCAGCAAGATTTGGTTGGGCTATCATAGTTAGACTGTATCA TGCAGTACAGAAAAATATGAAGCCAAGTGGCACTAGGATTGGGCAGAAAAATCTCTGTCTAGTCTCTCGAAAAGGTTGAA CATTTATTAAATTGGAAGTGTTCCTGATAGACCTGCAGAATTTGATGAGCGTCATTGCATGACCCAAGCCCAAAGAGGCC CACTGTGTGGAAAATGTATATTATAGACAGAAAGCGTGGGAGAAATTACATTTTTTGAATTTTGGTTAGAAGTAGAGAGA ATTGAAAGGAAGCTGTGTTTATATTATTACTGAACTTTCACTTTTTGTGGAACATTCCTAGCTACATTTAATATTTTTAC AACCATCACTATGTATAACTGGCCTGTGCTAGTACTCTATCTAGATTCTCTTGAGTAATATAAGTTGATGTTCATCCATT TCAATGATAGAGGCTCCTCACTGATGAATCGCCTCGGCTAAGGAGTGCTCTGCGTTACACTATATATGGAAAATCTGGAG TTTTTGATGCAGAAAGATTTATTGATGTCATGCAAGCCTTCGAGAATTTTATTACTGCCGCCAAAAGTGGTGGTGGAGAG GATCTGAAAGGGAACATGGCTGGTCTTGGGGCTATTACTGGTCAGTCAGAATATCTCTTGCAGGGACTTCAGTCTGTTAT CCCTCAACAACAACAGCCAGTACAAACAAGGGCAGCTTTAGCGTTTTTGCTATCTGATAGGGGCAATTTTTTCCGAGAAT 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CATATTTGACAGAATGGACAAAATCACAATGACCAGTATATATAAACCAATTACCTACGTTCAGATTTCTGAAAATTTCT TAACCACGCTGTGTATAAGATACTCACTTTACCTCCTAGTGTATACGAAGTCGATTGTATAAGCTATTATTTCCTTCTGT TATCCCAAAAAGAGTTTTAATGTTCAAGACTTCAAGTGTATACATATAGGAGGACTATAGTATCCCACATGGTTTTATCA TGGGTTGATGTAGTGTGAAGAGCTGCCTGTATTCATTGTATCTAAGAATGCCTACACGGCTGCACTATTTTCTGAATATG AACATTATATTGACGTATATATCTCTTGATACCAGTTTTTGCACCAACTTTCTTTTCTTTTCTATCACATCACTCATTAT ATCTGTTAGAGATAAATATGCGTAATATCCTACGGGATATTCCTTTTACTATTATTTATATATTTTGTAATATGTCTCAT AATATTCCTTAGAATATTCTGTAATTTCTTTATTATAAATAACATTGTCTACCTCACACAATTGGTGGTGAGAGTATCCA ATCTTACATGGTATCAGGTTTAAGGTTCTAACCCTAGCCTCCAAACCCTGCCGTCACTTTCTCTCTTTTTTAAGCTGCTG CCGTCGCCTTGCTTTATGTGCAAGTGCTTCACTTTTTCTTGCCAGCAGCTACTCTCCGTGCAGCAGCCACTGACGTCATC CCTTGTCCCTTGTGCAGCCGACATCATCTGCACGTGCTTCCTGCTCTGCGCCCACGTTCTTGTCTCTGCCGCCGACAACT TTTGTCTCCTTGCTGCCAGCCACGCGGGACACGCGCCAGCACGCCGTCAGTCCTTTTTTCCGCGCCGCCAGACAACTTTT CTGTCTCTCCTGCCCGTTGGTGCTAGCTAGCGTTTGTTGCGCCGCCAGACACCTTGCTTTCCGCGTGCTGCCGTATGTTT CCCAGACAGCCGCCAGCCACTTGTGCCTAGATTCCGTGCATCATCGATTTCCGTGCCGGCACACCAAGCCTTGTTGACCG TGCTGTCCCCCACACCTTGTTCCTGCGTCAGCTAATTTGTCTTTCTTGTTGGCAGTTTATTTATTTATTTATTTTTGGGA CAGTTGTGTTCTCTTTACCATGGCTTCGGACGCTACACCTCCGACATTTTCCTTCAACACTTTGGTGCATATGATTACAG TGAAACTAAAATCAGATAATTTTCTTCTCTGGCGTAAACAGGTCACGACTCTTCTTCAGAATCAAAATCTTTATGACATT GTTGATCCTACCGTTGATCCACCACCGGAGTTTGTGCCACAGCATGTTTCTCCTGGTTTGCGTGCTGTTCCAGGTCCAAA TCCTTCCTTTGCTCAGTGGCAGACTCGCGATCGCAACGTCAACAGTCTCCTTCTTTCCTCACTGACTGAGGAAGCTTTAT ATGAGACCCTCAGTGCTACCACTGCCCGGGATGTTTGGACTGCTCTTCATTCTGCTTATGCTTCACGCAGCAAGGCCCGT GAACTGCGTCTTCGTGATGAGCTCCAACTCATGCGTCGTGGTTCCCTCTCCGTTTCTGAATATGGCCGGAAATTCCGCAC TATTTGTGATCAATTGGCTGCTATTGGTGCCCCTGTCGCTAATGATGACAAAGTTCACTGGTTTCTTCGTGGTCTTGGCC CCTCGTACGCAAATTTCTCCACAGGACAGCTTGATCAGGTACCCTTACCTTTCTTTACTGATATTCTTTGTAAGGTCGAG AGCCATGCTATTTTTCAGGCTTCTCTTGAGGAATCAGTGACTCCTCCACCTGCTGCTTTCCATGCGAGCAATCAGACTCG CTCTTCTGGCAATCAGTCTTCCACTAGTGGCAACCGTGGTAATTATGGTGGTGGTTCTCGTGGTGGTCATCGTGGCAACT CTAATGGTGGATCTCGTCCGCGTCGCACTAATGGTGGCTCTGGTCGTCGTGGCTCTTACATTCCTCGCTGTCAAATTTGT CGTGAGCAGGGTCACTATGCTGATAAGTGTCCGGTTCGCTGGGATCGTTCGGTTCGCTGGGATCGTTCTTCTGAGTCTGC CAATTTAGCTCAATCTTTTGATGCGGGTTGTTCATTGGATAACTCCAACCGTTCCGACTGGTATATGGATACAGGTGCCA CCTCTTATATGACTCCTTCTCTATCTCAGCTGACGGACTCTCAAGATTACTCCGGTAATGGTCGTGTTCTTGTTGGTAAT GGGGCTGGTTTACATATTTCTCATATTGGTTCTCGTTCTGTTTCACATTCTGTTCCTTTATCTAATGTTTTGGTTGTGCC TCGGTTAACTAAAAATCTTGTCTCTGTTAGCAAATTGACTCGTGAACATAATGCTAAAGCTATTTTTCTGGATGATTCTT TTGTTATTCAGAACCGACAGACAGGCGCCGTTCTGGGAAGGGGCCAATGTGATAAAGGACTTTATGTGCTTGACCAAGGA TCGCATGCGCTACTTACTACCAGTTCTCCATTACCTCGTGCCTCCTTTGAATTGTGGCACTCACGATTAGGACATGTCAA TTTTGAAATAATTCAACAATTGCATAAACTTGGCTGTTTTAATGTTTCATCTATTTTGCCTAAGCCTATCTGTTGTACTT CTTGTCAGATGGCTAAGAGTAAACGTTTAGCCTTTTATGATAATAATAAACGAGCTTCTGCAGTTTTGGACCTTATCCAT TGTGATTTGTGGGGACCATCTCCTGTTGCTTCCGTTGATGGTTTTTCTTACTTTGTTATTTTTGTGGATGATTTTTCCCG GTTTACTTGGTTTTATCCATTAAAGCGCAAGTCTGATGTTTATGATGTTCTTGTTCGATTCAAAGCGTTTGTGGAAAACC AATTCTCCCGGTCGATCAAAGTTTTTCAAAGTGACAATGGCACTGAGTTCACTAATCATAAAGTACACACTTTATTTGCT TCTTCGGGTGTGCTTCATCGGTTTTCCTGCCCTCATACTCAAGCACAGAATGGGCGAGTTGAACGGAAACATAGACATGT TCTTGAGCTTGGTCTTGCTATGTTGTATCACTCACATGTCCCTACTAGCCATTGGGTTGATGCTTTCAGTACTGCGGTAT ATATTATTAATCGTGTTCCTTCTAAGGTGCTCTCTAATCAGATTCCATTTCAGCTTCTGTTTCATGTTGCGCCTACATAT ACTAATTTCCATCCCTTCGGCTGTCGGGTGTTTCCGTGCTTGCGTCCATACATGAAACATAAGTTTAGCCCCAGGAGTTC TCCTTGCATATTTTTGGGATACAACGGTCAACACAAGGGATTCAAATGCTTTGATCCGGCTATCTCTCGGACTTATGTGT CCCGTCATGCTCAGTTTGATGAATTTTGCTTCCCTTTTGCAGGTTCTCCCTCTTCTGCTAATGACTTGGTGGTCTCTACA TTTTATGAACCGTCTGTAGGACCACCTCCATCTGCACAGCCTGATGTCCCCGTCATTCGGGAGAGTTCCCCACATACTGG TCTTTTGCTTTGTCCTTCTTGTGATGACTCCGATGTTCTGCAGGTTCCTCATGATGATGCACCACCCTCGCCGGTTCCTC ATAATGCTGCCCCACCTTCGCCGGCTCCTGCTTCCCCAGCACCGCTAGCCGCCCCTACTATTGTGGCTCCAGGTCCCCCT GCTTCCCCACCGGCTCCTTCTCCGGTTGTAGCTCAGGTTCCTCTTGCTCCTGATGCTGCTCGCCCTCGGACTAGATCTCA GAATGGTATTTTTAAGCCTAATCCGCGTTATGCTTTGGTTCATGCTCAGCCTACTGGCCTTCTTACTGCTTTGCATACTG TTACTGAGCCTAAGG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0014800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGACGCCGCATCGCAGCTCGTCTACTGCAAAATCGACCCCTTCCGTCGCTCCTCTCATTCCCACCGCCACAGCCTCCT CCCCCTCCGCCGTCGCTCTAATCGCATTTTCGCCGTCGCCACTGAACCAAAACCCGCTCCGGTTACAACCGTCAACGGTT CATCCTCGAAGTCTCCGCCGAACAGACCCGTCCCCACGAGAATTGGAGATGTTTCGAAGGAGATTAAGCGAGTGAGGGCG CAGATGGAAGAGGACGAGCAGTTAGCCTCGCTCATGAGAGGTCTTCGGGGGCAGAATCTGAAGGATTCTCTCTTTGCTGA AGATGATGTTCAGCTTCGTCTCGTTGAGGTAGATGAGAGTAGTGAGTTTTTGCCTTTGGTGTATGAACCTTCCACCATTT CTGCATATTGGGGAAAACGTCCACGTGCAGTTGCAACACGTATTGTGCAGTTAATGTCGGTTGCTGGTGGTTTTCTTTCG CGTCTTGCCTGGGATGTGATTAACAAGAAGGTTAAGGAGAATGAAGTTGCTAGGGCCATTGAATTGCGGGAAATTGTGAC ATCTTTGGGTCCAGCGTACATAAAACTTGGGCAAGCGTTGAGCATTCGACCTGATATACTGTCACCTGCAGCAATGACAG AGCTGCAGAAGCTTTGTGATAAAGTTCCTTCATTTCCAGATGATATGGCTATGGCTCTAATTGAGGAGGAGCTTGGTCAG CCATGGCAAAATCTTTATTCAGAATTATCATCTTCTCCCATTGCTGCTGCATCTCTTGGACAGGTATATAAGGGCCGCCT AAAGGAAAATGGGGATCGGGTGGCTGTTAAAGTGCAAAGACCTTTTGTTCTTGAGACAGTTACTGTTGATCTATTCATTA TTAGGAACCTGGGTTTGGCTCTCAAAAAGTTTCCCCAGGTCTCCATAGACGTGGTTGGGTTGGTTGATGAGTGGGCTGCT CGATTTTTTGAGGAGTTAGACTATGTGAATGAAGGTGAAAATGGAAACTGTTTTGTTGAAATGATGAGGAAAGACCTACC ACAGGTTGTCATACCAAGAACTTACCAGAAATATACATCAAGGAGGGTTCTTACAACAGAATGGATTGATGGAGAGAAAC TGTCACAGAGCACAGAAAGTGATGTTGGAGAACTGGTTAATGTTGGAGTCATCTGCTATCTAAAACAGCTGCTTGATACT GGAGTTTTTCATGCTGATCCACATCCAGGGAACTTGATCCGCACTCCTGATGGAAAACTTGCCATACTTGACTTTGGGCT TGTTACAAAATTGACTGATGATCAAAAGTATGGGATGATTGAAGCAATTTCTCATCTCATCCACAGGGACTATACAGCCA TAGTGAAAGACTTTGTTAAACTTGGTTTTATTCCAGATGGCGTCAATTTGGAGCCTATCTTGCCAGTTCTGGCCAAGGTC TTTGATCAGGCTTTAGAAGGTGGAGGGGCAAAAAACATCAATTTTCAGGAGCTAGCATCAGATTTGGCTCAAATTACCTT CGATTATCCTTTTAGGATACCCCCATACTTTGCCCTTATAATTAGGGCTATTGGGGTTTTGGAAGGGATAGCATTAGTTG GAAATCCTGATTTTGCCATTGTTGATGAGGCTTATCCATATATTGCACAGAGGCTCCTCACTGATGAATCGCCTCGGCTA AGGAGTGCTCTGCGTTACACTATATATGGAAAATCTGGAGTTTTTGATGCAGAAAGATTTATTGATGTCATGCAAGCCTT CGAGAATTTTATTACTGCCGCCAAAAGTGGTGGTGGAGAGGATCTGAAAGGGAACATGGCTGGTCTTGGGGCTATTACTG GTCAGTCAGAATATCTCTTGCAGGGACTTCAGTCTGTTATCCCTCAACAACAACAGCCAGTACAAACAAGGGCAGCTTTA GCGTTTTTGCTATCTGATAGGGGCAATTTTTTCCGAGAATTTCTTTTGGATGAGATTGTTAAGGGCATTGATGCAATAAC AAGGGAACAACTGGTAAGAATGATGTCCATACTAGGAGTTCAGAATGCAACCCCTGTTTTCAGTATGGTATCTACTATGG GACCCTTTAAGCCTGCAGCTCTTATACCGACCATAACTGAAGAGGATGAAGTTATACTGAACAATGTCCAGAAAGTGGTG GAGTTCTTGACTGCAGGAAGTTCTCTATCAAGGACATCTAGTCAGGCACTGAATGTTCCTCAGATTATCCAAGAACTTCT CCCAGTGTTGCCGGGCATCACTGTTAAAGTGCTTCCAGAGATTGTCAGCAGATTATCTTCTCGGGTATTAGCACGATTAA TACGTGATTCATTTTTGTGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0014800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDAASQLVYCKIDPFRRSSHSHRHSLLPLRRRSNRIFAVATEPKPAPVTTVNGSSSKSPPNRPVPTRIGDVSKEIKRVRA QMEEDEQLASLMRGLRGQNLKDSLFAEDDVQLRLVEVDESSEFLPLVYEPSTISAYWGKRPRAVATRIVQLMSVAGGFLS RLAWDVINKKVKENEVARAIELREIVTSLGPAYIKLGQALSIRPDILSPAAMTELQKLCDKVPSFPDDMAMALIEEELGQ PWQNLYSELSSSPIAAASLGQVYKGRLKENGDRVAVKVQRPFVLETVTVDLFIIRNLGLALKKFPQVSIDVVGLVDEWAA RFFEELDYVNEGENGNCFVEMMRKDLPQVVIPRTYQKYTSRRVLTTEWIDGEKLSQSTESDVGELVNVGVICYLKQLLDT GVFHADPHPGNLIRTPDGKLAILDFGLVTKLTDDQKYGMIEAISHLIHRDYTAIVKDFVKLGFIPDGVNLEPILPVLAKV FDQALEGGGAKNINFQELASDLAQITFDYPFRIPPYFALIIRAIGVLEGIALVGNPDFAIVDEAYPYIAQRLLTDESPRL RSALRYTIYGKSGVFDAERFIDVMQAFENFITAAKSGGGEDLKGNMAGLGAITGQSEYLLQGLQSVIPQQQQPVQTRAAL AFLLSDRGNFFREFLLDEIVKGIDAITREQLVRMMSILGVQNATPVFSMVSTMGPFKPAALIPTITEEDEVILNNVQKVV EFLTAGSSLSRTSSQALNVPQIIQELLPVLPGITVKVLPEIVSRLSSRVLARLIRDSFL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 4 765 762 0.0
PANTHER 4 765 762 0.0
MobiDBLite 41 68 28 -
MobiDBLite 47 62 16 -
Coils 68 88 21 -
CDD 217 458 242 5.16435E-89
SUPERFAMILY 220 455 236 1.43E-21
Gene3D 233 452 220 6.3E-7
Pfam 236 354 119 5.2E-27
ProSiteProfiles 248 643 396 9.729

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0014800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…