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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0032100 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0032100.4 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HEAT repeat-containing protein 6; TAIR: AT4G38120.3 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q7ZY56|HEAT6_XENLA HEAT repeat-containing protein 6; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3S9G8|A0A0S3S9G8_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0032100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:6013176..6044979) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGAGCTTCAGACAAAAAGTCAGGGCATCAGATTCAGATGGAGTTTGAACTTGTAGCTTCTAAGTGCAAAAGCTCGCAGTG TTTGCTGAATCGATTTCCACCGAAGGCATGCGCGACGAGAAGAAGCTAGCAACCGCCGTTTAGCGACAGTTTCTTCTCTC ATGGCGGGAACGGGATTCGGCGCAGCAGCGCCGTCGCCACTGGTCAGGACGTGGAGGACTTCCTTCCTGTCGCTGAGGGA TGAAACCCTAACGACCCCTCCTCGCACTTCTTCTACTCCTCAAATGCTCCAGAATCTCATTTTCTCGCATTCTCATGCTC TGGTTTCTGCCGCCACCGAACTTCCCTCTCACGAGGTATCTTCTTCAACACACCAATGCATTCTTCGCTTTCTTCTCATT TCCCTTAATTATCGATCTTACTATTTGCTGTTTGAAATTTTCTTTCAGGTTTTGTCAGACGTTTTGTTCTTGATGGATTT GGTTGCTGCTACTTCTTCCGATGAAGACGATTGTAGTCATATCTATACTCATGCATCACGCTTGGTATCGGTTTTGCTTT CTTGGTTTCCAGTTCTTTTGTTTGTAAATTTGCTACTTTAATTCGTTAATGTTAGTATTTTTTTTTTTTAAATCATTTCG CGAAGTGATTATTCTTCTTGTGTTCTTGTCGCAGATCCATGATATTTGTGGTCGCGTGTCTATGGATATGAATTTATCCT CTTTCAGTAGAGTTCTTAACTGTTTTGGGAAGATGATAGATCTTTCTCTCCGAAAAGGTGCTAATCGTGATGAGTTAACT GGAACTAGCGGTGCTGCTACGATAGTTCCTGCTATTGAATGCTTGAAGGCTATCAGGTTTTTTCATGCTTCTTAATAGAA TCGATCCTTGACGCATCTTGAGTAGGCATTATATGGACCTGTCCTTTTTTTTGGTAGTTGTTATGCTGTAGTCGTAGTTT 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ATGGCGGGAACGGGATTCGGCGCAGCAGCGCCGTCGCCACTGGTCAGGACGTGGAGGACTTCCTTCCTGTCGCTGAGGGA TGAAACCCTAACGACCCCTCCTCGCACTTCTTCTACTCCTCAAATGCTCCAGAATCTCATTTTCTCGCATTCTCATGCTC TGGTTTCTGCCGCCACCGAACTTCCCTCTCACGAGGTTTTGTCAGACGTTTTGTTCTTGATGGATTTGGTTGCTGCTACT TCTTCCGATGAAGACGATTGTAGTCATATCTATACTCATGCATCACGCTTGATCCATGATATTTGTGGTCGCGTGTCTAT GGATATGAATTTATCCTCTTTCAGTAGAGTTCTTAACTGTTTTGGGAAGATGATAGATCTTTCTCTCCGAAAAGGTGCTA ATCGTGATGAGTTAACTGGAACTAGCGGTGCTGCTACGATAGTTCCTGCTATTGAATGCTTGAAGGCTATCAGATGTATA ATTACTTTATCTCATAGAGGATGGTCGCTGTCTGAAGATACTATACTAGTTAAATTTCTACTTGATGTTATTGGTAGCAC TCACGGTGTGTCATGTCGGATTCCTCAATCAATATGTCAAGAAAAATCTGCAGAGATTAATTTTAGATTTTCCCCTGAAA TCAGTTTAAGTGAACTGCAGACAGTAGCTTTTGAGATGCTCAGTGAAGCAATCTCAAGAGCTGGGTCATCCTTTCCAGTT GATATCTGGAGATCAATGCTTGAGGTGGTCAGAAAAACAATGGATACCTTGGCATTAAAATCCCCAGTTGTGGAAGATAG TGTTATGTCCAGGTTTTATGAATCTTTTCTGTGCTGCCTGCATCTCATCCTTAGTGATTCTAAATGTTCTGTTTCTGATC ATGTGTCAGCTTTTGTTGCGGTTTTACGAATCTTCTTAGTTTATGGCCTTTCTGGCAGAACATCAAGCACTTCTCTGCTT GTTGGTCATGAGGAGAAGGATATTAGTAATGTGAGTCCTAATGCACCCAAGGAACAACTAAATACGTCAAATCGTAGTGC TTATAGACCTCCACACTTGCGCAAAAGGGATGTGAAGCACAATAGAGCTAGGTGTTCCCAATATATCTGTGATAACGAAT CTTCTACTATTAATGTTACATCTTCAGATTCAGATTTTAGTGATGGAGACAGTTCAGCTAAAGAGAGCGGTAGAGTGCAG AACTCTAGAGTTAGAGTAGCTGCTATAATTTGCATAGAGGATCTTTGCCAAGCTGATTCTAAATCTTTCTCTATGCAATG GTCCCTGCTTTTGCCAACCACTGATGTGCTGCAACTAAGGATGCGTGATGCAACTTTAATGACATGCTTGCTATTTGATC CTTGTTGGAAGGCACGTATGGCATCTGCATCGACTCTAGTGGCCATGTTGGATGGTCCCTCTTCCATTTTCCTGCAAGTT GCAGAGTATAAGGAATCCAGCAAATTTGGATCTTTTACAGCACTTTCAAGTTCCCTCGGGCAGATTTTACTGGAACTTCA TAGAGGCATTCTTTACTTAATAATGAATGAAGCTCATGGTAAATTGCTCGCAATGTTGCTCAAGATCCTCAGGCTTGTGA TACTATCTACACCATATTCAAGAATGCCGCCAAATTTGTTGCCTACTGTTATCACATCTCTTAGGACAAGGATTGAAGAA GGGTTTTGGTTCAAAAGTGACCAGAGTAGTCTGCTGCAGGCTGCTGCTGTTGGTTGTTTGACATTAGCTCTGTCTATCTC ACCATCCTCTGCTCAAGTAAGGAAAATGCTCTGTGATGAAGTTTCTTCAGGTTATATCGAGACCGAAAAGAAGTCAGGCG TTCTTTATTTGTTATTGGAATATTCAATGCAATGGAGTTGCCAAAGCATTTGCCTTGAGGCCCTTCAGGCACTTAAAGCT GTATCCCACAATTACCCTAACATAGTGAATGCATGCTGGGAACAAGTTTCTGCGATTGTGTATGGCTTCCTTAGAATTGC ATGCTCTGAAGTTCCTTTAAAGCAGTCAAGTGAACATGATGGTAGCCCAACTACATTTATTAGTGAAAAAGTTCTTATAA CTGCTATTAAGGTTCTAGATGAGTGTCTTCGGGCTGTGTCTGGATTTCAAGGAACAGAAGATCTTTCAGATGATAAATTG GTGGATATTCCTTTTGCATCTGATTTCATTAGGATGAAGAAAGTGTCATCTGCTCCATCTTATGAACTAGAGTACAGAGA GGACGATGTAATTAACTCTGAAGAATGTAAATCTGGAATTCAACAATGGTGTGAGGCAATCGAGAAGCACATGCCTCTTA TATTATGTCACTCTTCTGCATTGGTGAGAGCTGCATCAGTTACATGTTTTGCGGGCATGACTTCTTCAGTGTTCATTGCT TTCACTAAGCAAAAGCAGGACTTCATTTTGTCTTCTTTAGTCCATGCTGCTGTGCATGATAATGTGCCATCAGTGAGGTC TGCTGCGTGTCGAGCCATTGGTATCGTTTCATGTTTTCCACAAGTGTGTCAGAGTGCAGAGGTACTAGACAAGTTTATCA ATGCTGTTGAGATAAACACTCGAGATGCCCTATCCTCGGTGAGGATAACAGCTTCTTGGGCATTGGCAAATATATGTGAT GCTATTTGTCACTTTGTTGGAATTCTTCCTTTCAAACATACCAGTTCAAACTGCAATCCCCAACTGATTTTATCATTAAG TGAATGTGCTTTGCATCTTACAGAGGATGGAGACAAGGTTAAATCTAATGCTGTAAGGGCTCTTGGGTATATTTCTAGAA TCTTTAAATGTTCAACATCAAGATTTCAAGACATGTCAGTGGACTACCGGGACCATAGGACTGAGGCCAATCTCTGTACT GACAATATAAGATTTCGTCTGCAACATTGGCAATTGGATTATCCAGAAGATTTTTTTAGGCTGGAGAAAATAGTTCAGGC GTTCATTTCGTGCATTGCTACTGGGAATGTGAAGGTTCAGTGGAATGTTTGTCATGCTCTAGGGAACCTATTCTTAAATG AAACATTAAGGCTGCAAGACATGGACTGGGCTCCAGCAGTTTTTGGTATTCTTCTGCAACTATTACGTGATTCATCGAAT TTTAAAATCAGGATACAAGCTGCAGCAGCCTTAGCTGTGCCCGTATCTGTGCAAGATTATGGTCGATCCTTCTCAGACAT TGTGCAATCTGTAGAGCATGTAATGGAGAATATAGATCAGGACCCAATATCAGGGCCGTCAAATTTCAAGTATAGGGTTT CATTACAAAAGCAGCTTACCTTGACAATGTTACACCTCCTACGCTTTACATCAAGCACAGATGATCAACAGTTGAAAGAT TTTCTAGTCAAGAAAGCACCGTTTCTTGAAGATTGGTTCAAGGGACTATGCTCATCTGTTGAGAGCACACTTGATGTTCA AGATAAGTCCATTGCAGACCGAAAGAAAGCAATGATATCGAGCGCAATAGGATCATTAATAGAAGTGTGCAAAGAAAAAC AACAAGATGCATTCGCTCAAAAGTTTGAAGAATTGAAGAACGGTGTATAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0032100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGTGFGAAAPSPLVRTWRTSFLSLRDETLTTPPRTSSTPQMLQNLIFSHSHALVSAATELPSHEVLSDVLFLMDLVAAT SSDEDDCSHIYTHASRLIHDICGRVSMDMNLSSFSRVLNCFGKMIDLSLRKGANRDELTGTSGAATIVPAIECLKAIRCI ITLSHRGWSLSEDTILVKFLLDVIGSTHGVSCRIPQSICQEKSAEINFRFSPEISLSELQTVAFEMLSEAISRAGSSFPV DIWRSMLEVVRKTMDTLALKSPVVEDSVMSRFYESFLCCLHLILSDSKCSVSDHVSAFVAVLRIFLVYGLSGRTSSTSLL VGHEEKDISNVSPNAPKEQLNTSNRSAYRPPHLRKRDVKHNRARCSQYICDNESSTINVTSSDSDFSDGDSSAKESGRVQ NSRVRVAAIICIEDLCQADSKSFSMQWSLLLPTTDVLQLRMRDATLMTCLLFDPCWKARMASASTLVAMLDGPSSIFLQV AEYKESSKFGSFTALSSSLGQILLELHRGILYLIMNEAHGKLLAMLLKILRLVILSTPYSRMPPNLLPTVITSLRTRIEE GFWFKSDQSSLLQAAAVGCLTLALSISPSSAQVRKMLCDEVSSGYIETEKKSGVLYLLLEYSMQWSCQSICLEALQALKA VSHNYPNIVNACWEQVSAIVYGFLRIACSEVPLKQSSEHDGSPTTFISEKVLITAIKVLDECLRAVSGFQGTEDLSDDKL VDIPFASDFIRMKKVSSAPSYELEYREDDVINSEECKSGIQQWCEAIEKHMPLILCHSSALVRAASVTCFAGMTSSVFIA FTKQKQDFILSSLVHAAVHDNVPSVRSAACRAIGIVSCFPQVCQSAEVLDKFINAVEINTRDALSSVRITASWALANICD AICHFVGILPFKHTSSNCNPQLILSLSECALHLTEDGDKVKSNAVRALGYISRIFKCSTSRFQDMSVDYRDHRTEANLCT DNIRFRLQHWQLDYPEDFFRLEKIVQAFISCIATGNVKVQWNVCHALGNLFLNETLRLQDMDWAPAVFGILLQLLRDSSN FKIRIQAAAALAVPVSVQDYGRSFSDIVQSVEHVMENIDQDPISGPSNFKYRVSLQKQLTLTMLHLLRFTSSTDDQQLKD FLVKKAPFLEDWFKGLCSSVESTLDVQDKSIADRKKAMISSAIGSLIEVCKEKQQDAFAQKFEELKNGV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 779 | 779 | - | – | |
| PANTHER | 15 | 1180 | 1166 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 327 | 353 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 332 | 348 | 17 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 400 | 1135 | 736 | 2.61E-25 | ||
| Pfam | 403 | 580 | 178 | 9.9E-46 | ||
| Gene3D | 752 | 945 | 194 | 6.9E-8 | ||
| Phobius | 780 | 801 | 22 | - | – | |
| Phobius | 802 | 1189 | 388 | - | – | |
| Gene3D | 953 | 1118 | 166 | 7.7E-7 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0032100.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…