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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0039400 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0039400.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Small subunit processome component 20 like; TAIR: AT4G30990.3 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O75691|UTP20_HUMAN Small subunit processome component 20 homolog; TrEMBL-Plants: tr|I1MYQ8|I1MYQ8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0039400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:7603317..7625432) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGCTTTGCAGCTTTCAATGCATCACAGTAGTGTGGAGAAGGAGGCGCAAAAAAAAGAAGCTGCTTGGTGGGCTCTGTTTT GGGCCGGTTCAAATAATTCATTCATTCATCTTTCTCAAAGAAAAAATAGGTTTTGACCGAAAAATCAAGTGATAGTCGGT TTTGTTCCCTCCCTTCTTTCTTTCTCTTGTTGAAGGAACCTTGCTTGCCGCAACTGCAACACTCGAACATGGCGACTCCG TCACACGCTCAAGCTGTCAAGTCTCTCAACAAATCCCCTGGTCGCCGTCGCTTTGTTGTAAGCTCAACCGATTTATGCTA TATAGCAACACTGCTTAAACCCTAAACCCTGTTTATTGTATTAATTGCTTTTTTATTTAATTGAATGTTGTGCAGTTTAA GTCATTCTCTGAGAGAGTTGATGATATCGATATCGACGTCTATCGAAGCCTCCACAAGCTCAAACCTGAGCCATCTGAGG GTTCCTCTTTTTTCAGAGACTGCCTTATTGAATGGAGGGTATGAATTTTTATTGTGCTCTGCTGCGCGCTGCAATTGTAT ATTTGTATGTAATTGATTCTCATAGGATAAAAGTTGTGTGCCGCTCGCTCCCTTTGTAACAAAAGAAAAAAAGTGCTAAC TATTAGCTTGCTTTTTATTAGTATGTATGTACAAGTGAGAGAAATTGACTGTTTTATGAGAAAAAGGATCATACACCGAC GGTGTTTACACCGTCAACCAATCAGATTTCAAGGATGTGCCACATCAATTAATTAATGAAATTAAATAAAAAGAGAGATT TTCTCACATCCTTGAAATCTGATTGGTTGACAGTGTAAAAAATCTTTACACCGTCAGTGTACAGACATTAAACATTCAGT TACGAGAGTAGGGAAATTATATGTATGCAGATTATGATGGAGTTAGTTATGCAACTGCCTAGCTAACTTCTAACATACTA 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ACAGAGAGAGGGAGCGTTAGGTAAGGTTTGGACTAGTCTTGGGAGAGTAAGGGTCTCTCGAATGCCCCAAGTTCATGTTT ATCTTTGTTTTCTATCTCCTTGATTACACTGATCAGTGGAAAATAACTCAATATGATACTACTTGTTACTGTCTTACCAT TTTCTTCTTTGCAAGTCTGATTTTGACATGTGAAATTGCTGGTCAGGTTTTAGGGCTGCTGATTGAGGTGGTAAAGAAAG GATTTCATAAGCATATAGACCGTGTCTTGCCAATGAGTTTCCGCATCTTGCAGTCTGCTATAGATGCAGTCACAAACAGT CAAGTGGGCTTTTCAGCTGAAACTACCGTTCCCTTTTGGAAGGAGGCATACTATTCTCTTGTTATGTTAGAGAAGATGAT TCATCAGTTCCATGATTTATGCTTTGCACAGGATCTCGAGGTAAGTTCCTTTGTTAAATAGCAATGTGTTGCTTATGTCA TGTTAGTTTTATGAAATATATGTAGATGCATATGGTTTTTGATGCAATATATCTGTCTCCCTGAAAGAATAGATGGAGGT TTTTTTTTCTATGTAAATAACTTGAAAGGATTTGGGCTTTGTCTGGGAAAAGCATGGATGGGCTGCAATATGACTGATTA TGGGTAGCTGAAGAATAGAATTGGGCAACCCAATATCTAATTTCTAATTTGAACCATATCTATGCTAATTTCGACCTGAA TTTAATTGATTCTGCTAGAGTATTAGTTCTCAAGATTTTGCCATTATGGGTTATATTGAGTGAGAGTATTAATCAGCATA CAATGTTCAAATGATTTGTAACTTTGAAAACCATAGAGATTGCTCGTTTGGCTTATTGGAGTCTGTTTGCAATTTTTAAT TTTGGGTTTTGGCCTGAAGTTAATAAGGACAGTGCGACTCAAATTTCAAGAAACTGCTTTTATGGATTGTAACAGAAAAC TTAAAAGTTTCATAGTCGAAGTGGTTCTGCTGTGTTCCATGGCTGCATATTGCAGAGTGTAGACTGTTTCTTCCCTGCCC TTTACACAAGAACTAATTTTGTTTGATCAAAAAATTTCCATTTAACTTCCCAGACCCTTCAGTTTACCATTTCTTAGTGA GCATCCTGACATAATTTTGTTCCCACGCATTTCAGGATATATGGGAAGCAATATGTGAGATGATGTTGCACCCACACTCA TGGATACGCAACAGATCAGTTCGCCTGATAGCTCTGTACTTTGCAAATGTAACAGATGTTAGCAGAGAAAATCATCAAAG CTCCTTCAGTAGTTATTTTCTTATGAATCCTAGCAGACTATTTTTATTAGCTACTTCTCTTTGCTGCCAACTGAAAATGC CACTCATAGATGTCGACGTCAATGTGATGACCCAGAATATTGTCTTTGCCATTTGTGGTGTCCATTCTTTAATGGGGCAA ATAGGGTGCATAGATCCCCCAGCATTCTGGTCTACTCTTGAGCAACACGAGAAAGAGCGGTTTCTGAAAGCTTTTGACTT GATTGATTCAAGAAAAGGAAGAAGCATGTTCATGTCCTCATCTCTTACCACTTCTGTATATGAAGATAACAGTCAGCTGA ATGTTGATAATACCCGATATAGACTTGTCTTCTTGTTGCTTAGGAAAATGGGGAAAATTGTTCTTCAAACTGATGATATT CAGGTTGGACGATATCTCTGTATATGCATTCTTTAGTCTTGATCAATGTGCGTGTGATTGATATTATTTATTATTTCATT TATTGAACACAGATGGAAATAGTCTTCAAAAGTTATGGGAACATTATCTCACAGATCAGTAAGGATGACAGCATGCATTA TGCACAAGCTGTCCTGTTACCTCTGTATAAAGTTTCTGAAGGATTTGCTGGAAAAGTGGTTGCTGGTTAGTTTCTCTTAA 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AAATGATTGTTGTGCAGTTTTTTTACTGTCATCTGCTTGCTTGAAGCAGAATGAGGTTTATGGAGATCGTGATTGAATTG GTATAATAGATGTCTCAGGCGGCAGAGGACAAACATGACTGAAAGGACAGGTTTGGAATGTTCTTGATAAATTTGGAATT TCACTTTCATGACATGGTAGTAACCATCTAATTCTTTTATGAAAGCAAAGTCCATTTACAGTTAATGCACTTAGAAGGAC AGCTTATTCTTTTGCCTCGAACAGCTGAGGAAGACTTCTGTAATGAATGATTAGACTTGTTTCTGCAGATTTTTGGGTAT AGCCAACCTTTTTTTGTACATAGTGTGTAGCATTGGGTAGGAGAACATTCTTTGGGATCTGTTGGTTGTTTGATTCTAAA GTTCTGCTTTCTCTGCTGATGTTATCCTTGGGTCATGGCATTGTCGACAGACTTAGGTAGATGGGGCAGTCGCTCCAAAG AGAAATGTTTTTGTAGAGCAAAATTTTGATAGTGTATTTGCCCATTATTCAATTAGTCATTATTGATTTTATTCAAGTGT TAAATTTTCGCCCTCATTGTTCATCACATAAAATTCTTATTGACCTGCTCGGCCTGCGTTTTCCAGATTCCTTTGAAAGT AACTCTTCAGTCACTTCAGAGGCTACGTGAAGATGAGTGTTTTTTTTTTGTACTAGAGTTATACGCAAAATCGTATGGGC ACATGATCCAAATGAACTGTTGTGTCTGTAATTCTTGTCGCATTTACACATCAAATTTCTTTTACATTTTTTCCACGAAT AAATGTAGAATGAATATAGAGTCGTTATTCAACTTCTTGGTTTATTACATTAATTACTTATGAATCAAAATGAGCGTGGA ATATGTTACTCTGGCATTTCTCATGTTACTTTTTTAGTTTTAGATTTCCCGTAAAAATAAAAATAAATTCATTGGTGAAA TTCAATAACTAGTGATGGTTGAATCGTTTACTGGCA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0039400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACTCCGTCACACGCTCAAGCTGTCAAGTCTCTCAACAAATCCCCTGGTCGCCGTCGCTTTGTTTTTAAGTCATT CTCTGAGAGAGTTGATGATATCGATATCGACGTCTATCGAAGCCTCCACAAGCTCAAACCTGAGCCATCTGAGGGTTCCT CTTTTTTCAGAGACTGCCTTATTGAATGGAGGGAATTGAACACCGCAGAGGATTTCATCTCACTGTATGAAGAAATTATG CCTTGGACACAATCATTGCCCCTGGTGCTGTTGCACAAGGAAACATTGATATCAATGCTTCTTTCTAGGTTGCACATGGA AGCAAGGCTATCCCTTGACGCGATTCTCAGGTTAATTGCAGCTTTAGCCAGAGATCTCCTAGAGGAATTTGTTCCGCTGT TTCCGAGAATTGTTGATGCTTTAGTATCTCTTCTAGAAAGTGGTGCTGATAGGGAGCCAGATATCATTGAGCAGATCTTC ACATCATGGTCATATATTATGATGTATCTGCAGAAATATTTAGTACACAACCCATCAGATGTGCTCAAGGTCACAGCGAA ATTGAGGTATTACAAAAAGGAATATGTTCAACAATTCATGGCAGAGGCTATGTCATTTGTTCTGAGAAATGCCCCGGATG AGCAGCTCAAAAGAGGAATTAAAAGAGTCTTTGCTGAGGCAGCAAAGAAGCCATCTCCATACCGAGAGTATGGTGTTGAA GCATTGCTTTATAATATTATGAAAGGTTACTCATCAAGATTTCATTCAAAAGCAGAGCGGGTATTGCAAATATTGACAAG TGAAGCAATTTATCCTTTTGATGATAAAGTTGACCAAGAGTCAAGAACTATTTTGAACATTGTAAAATCTGTCTTTAGTA AAGTATGTGAGAATATGGAGCCGGAGGAGTTGGATTTGGTATGGAACTGCTTATATAAAGAAGTGCATGAATGTGTTAGT TCCGGAAACAACAGGCATTTAAGACACAATTTATCCGTGCTTGTCTCAGCTGTAAAGATCCGAAATGGGCAGAAGGTGTC TGATTATAAGCCTATGCTTGCACTTGTCCTCCTGCTTGTGCGTACATTTATTACGCCTCATGGAGCAATTGAGTCAAAGG AAGATATGTATTTAGTTGTTAATAAAGTTTTGAAATTAATGTCAGCCATTCTTGAAGGGCTTTGTCATTGCAGTAAGTTA AAGATATCAGAGTGTGCTTTCCAATGGGCTCCAATTTTTAAATTACGTTGCCCAAGTTTGCTGTGTTTCATTAGAAAACT GCTCCAGAAGGATCCTTGTTTACTTCCTTTCAGAAGTCATGTTTTAAGTGCAATAAATGACTTTATGGAGATTTCAGAGG AAGAGGCCATACATTTATTACAATCCTTTTGTGAGAAAATGCGATCAGATATGCGAAACTCGGACTTTGTTGATGGAGCA AGTGCAAAAGAACTAGCTAGAATACACAGTCATTTGCAAGGGATCATCAGTCATTGGATTAGAAAAATAAACGATATTGC ACATTCTGATGTATCTTGTCAAATTGATGAAGACAAGTTGGCGCTGCTATGGGGAGTTGTGAACTGCTATTCTTATATGT CAATTGTTGAAGCCAATCCATCCTTGTTGGTTGATCTCATGGATGCTATACATCAGCTTCTAACTGTTAAACCTGATACA TCTAGAAAAGCCTGGGAAAGCATTATAGGTGCTTCACTTGGTTCATACAATAGACTGTACAGTGACAGAAACATCGGAGC TGATGAAACTGGAAAGTTTCTAAGTTTTGCTAAACGGTACAAGACATCTTCACAAGTTTTGGCGGCAGTTGCTAGTTATT TAGAATGCAAATATGGTTCCTCCATGGAAGGCACTGGGTGCAAAATTTATCATCCAGAACTTGAAGAAACGACTACAGAG 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TTTATTGAGAACTTGTTAAGCCTTGACAATCAGTTGGACATTGAAGACAGTCCTGCCCACGGAGTTCTACTTTCCAATAT TAAAGGACTTATGGACAGCATTTGCTGTTTATTTGGATGTGATAATGCAGCCAAGAGAAAGCTGATCAAATCTCCCGGGG AGACAGTGATAAGAGTTTTCAAATTTTTACCCAAGTACATCAAAGAGGAAGAGTTGGCAAAGAAATTGGTGGACTTACTA CTTCTGTTTGTGGCAAAGAAACCCGAAAGTTCAGATGTCTGTGTTGAAGTTTTGCAAGTCATTCAAAGTTTGATACCAAT ATTAGGATGTCGAAGTACTGCTAAAATTTTGAGTGCTGTTTCTCCTTTATATATTTCGGCCGGCTTGGATATGCGATTAA GAATCTGTGACCTTCTTGATGCCCTTGTAGCTTCTGATGAATCTGTAGTCTCAGTGGCAAAACTTCTTCGTCAGCTGAAT GCAACTTCTACTTTGGGTTGGCTCGATCATGATGCTATTTTGGATGCTTACAGAATGATTAATATTGATTTCTTCAGAAA TGTTCAAGTGGAGCACGCATTACTTATTTTATCGCATTGTGTGCTTGACATGTCATCAGAAGAAACAACTTTTATTTATA GTGCCCATAGCTCGTTGCTGTCTTTTGTTGATTTTTCTGCACTCATCCTTTGTCTAGAAGGAAGCAGTGATCAAGAGTTG CCTGTAATTAAAAACACTGATGCTTGCTGGACAAAATCATGCATCCAGCGCATAATAAAGAAATTTCTCTTGAAGCATAT AGCAAATGCAATGGATGGACTACTTGCTGTTAGAAAGGGATGGATGAAGCTGTTAAATCAAATGGTTTTGAAGCTTCCGG ACGTGTCAAACCTTAAATCACTTGCAGCCCTTTGCAATGAGGATGGTGAAGCAAATTTTTTTGACGATATAACTGATTCA GTGATCCGTAAGAGAGTGAAGGCATTGTCACGGTTTAGGAATGTTATATGCATGAATAAATTATCAGAGTTCGTCACAGA AAAAGTGTTAATGCGACTCTTCTTCAACATGATGTTTGATGAGAAAGAAGGAACGGCTGAACATATGAAAAATGCATGCA TTGAGACCATTGCTTCTGTAGCTGGTCAGATGGGATGGAAGTCATACTATGCATTATTGATCAAATGTTTTCGGGGAGTG TCCTCTAGTCCAGACAAGCAGAAACTCTTCCTACGCCTTATATGCTCTATTTTGGAAAACTTTCACTTTTCAGATCTTTC TCACAGTGAAGAACCAAAGGAATCTTCGGGTGGTGTTTCTCACTCAGGGGTAACTGACACTGTCTCTTCAGGTACTTTAG ACAACTTTTGTACTCATGACGTGAACACCGAGATACAGACTTGCCTCTATAAAGTCGTGCTTCCAAAGATACAGAAGCTG CTGGATTCTGATTCAGAAAGGGTCAATGTAAGTGTCAGTCTTGCTGCTCTGAAACTACTTAAGTTACTTCCAGGAGATGT TATGGACTTGTATCTTCCAACTATTGTTCATCGAATTTCAAATTTCTTAAAGAGTCATCTAGAAAGCATTCGTGATGAAG CTAGATCTGCTCTGGCTACCTGTTTGAAAGAACTTGGACTGGAATACTTGCAATTCATTGTAAAAGTTTTACAATCTACC TTAAAGCGAGGATATGAACTTCATGTCTTAGGATACACTCTTAATTTTATTTTGTCCAAGTGTCTTTCAAGTCCAGTTTG TGGAAAGATAGATTACTGTTTGAAGGATCTGCTTTCTGTGATAGAGAATGACATTCTTGGAGATGTTGCTGAGCAAAAGG AAGTGGAAAAAATAGCTTCAAAAATGAAAGAAACAAGGATGAAAAAATCATTTGAAAGCTTGAAATTGGTGGCCCAAAAT GTAACATTCAAAAGCTATGCACTGAAGCTTCTTGCACCTGTGACTGCTCATTTGCAGAAGCATGTCACACCAAATGTAAA AGGAAAGTTGGAAAATATGTTGCATCATATAGCTACTGGTATTGAAAGCAATCCATCTGTAGATCAGACTGATCTCTTTG TCTTTATTCATAACATCATTGATGATGGCTTAAAAGATGAAGTTGGTTGGCATGAGAATAAATTGATAAAATTGGATGAT AAGAATAGTCATACTAATGGTAAAAGAATTTCTACAGGCCGTGTGGTTGCCAGTGGCTTATTGTGTTCCCATCTTATTAC AGTGTTTGGTCTCAGGATATTGCATAAACGTATGAAGGGTATGAAACAAGATGTAAAGGATGAAAATACTTTATCCTTAC TAGATCCTTTTATCAAGCTATTAAGTGATGGCTTGTGCTCTAAGTATGAGGATATCCTGTCTGCTAGCCTTGGATGCCTT ACTGTACTAGTAAAGTTGCCTTTACCATCCCTTCAATTACATGCTGAGAGAGTAAAGACCGCGGTGTTGGATATTGCCCA GAGTTCAGTGAACTCTAGCAGTCCTCTAATGCAGTCTTGTTTGACATTGCTGACTGTGCTTTTGAGGAACACTAATATTT CTCTTACTTCAGACCAAATACATCTACTAATTCAGCTTCCATTTTTTCTTGATCTTGAAAAGAACCCATCATTGGTGGCC CTATCACTTCTAAAGGGTATTGTCAGCCGCAAGCTTGTTGTACCTGAGATATATGATCTTGTTACTAGGGTTGCTGAGTT GATGGTAACAAGTCAAATGGAATCAGTTCGCAAGAAATGCAGTAAAATTTTGTTGCAGTTTTTGCTTGATTATAGACTTT CAGAAAAACGCTTGCAACAACATCTGGATTTCTTGCTCTCAAATTTGAGGTATGAGCATTCAACTGGACGAGAATCTATT CTTGAAATGATTCATGCTATTATCGTCAAATTTCCAAGAAGTGTTTTGGATGAGCAATCACAGACATTATTTGTCCATTT GGTAGCTTGCTTGGTCAATGATAATGATAATATTGTTCGTTCTATGAGTGGTGCTGCTATAAAGAAGCTCATTGGTTCTA TTAGTCCTAATTCACTTAATTCTATTCTTGATTATGCTCTTTCATGGTATTTGGGTGGCAAGCAGCAACTTTGGGGTGCT GCAGCACAGGTTTTAGGGCTGCTGATTGAGGTGGTAAAGAAAGGATTTCATAAGCATATAGACCGTGTCTTGCCAATGAG TTTCCGCATCTTGCAGTCTGCTATAGATGCAGTCACAAACAGTCAAGTGGGCTTTTCAGCTGAAACTACCGTTCCCTTTT GGAAGGAGGCATACTATTCTCTTGTTATGTTAGAGAAGATGATTCATCAGTTCCATGATTTATGCTTTGCACAGGATCTC GAGGATATATGGGAAGCAATATGTGAGATGATGTTGCACCCACACTCATGGATACGCAACAGATCAGTTCGCCTGATAGC TCTGTACTTTGCAAATGTAACAGATGTTAGCAGAGAAAATCATCAAAGCTCCTTCAGTAGTTATTTTCTTATGAATCCTA GCAGACTATTTTTATTAGCTACTTCTCTTTGCTGCCAACTGAAAATGCCACTCATAGATGTCGACGTCAATGTGATGACC CAGAATATTGTCTTTGCCATTTGTGGTGTCCATTCTTTAATGGGGCAAATAGGGTGCATAGATCCCCCAGCATTCTGGTC TACTCTTGAGCAACACGAGAAAGAGCGGTTTCTGAAAGCTTTTGACTTGATTGATTCAAGAAAAGGAAGAAGCATGTTCA TGTCCTCATCTCTTACCACTTCTGTATATGAAGATAACAGTCAGCTGAATGTTGATAATACCCGATATAGACTTGTCTTC TTGTTGCTTAGGAAAATGGGGAAAATTGTTCTTCAAACTGATGATATTCAGATGGAAATAGTCTTCAAAAGTTATGGGAA CATTATCTCACAGATCAGTAAGGATGACAGCATGCATTATGCACAAGCTGTCCTGTTACCTCTGTATAAAGTTTCTGAAG GATTTGCTGGAAAAGTGGTTGCTGATAATCTCAAGAAGTTGGCAGAAGATACCTGTGCAAAAATAGAGAAAATTTTGGGT ACTGAGAACTTTGTGGAAGTTTATAACCTTATCAGGAAGAACCTCAAGTTGAAAAGAAATAAGAGAAAACAGGAAGAAAA GGTCATGGCTGTCGTAAATCCAATGCGAAATGCCAAAAGGAAAATGAGAATTTCTGCGAAGCATCGTGCCAACAAAAAGA GAAAGATTACGACCATAAAAATGGGAAGATGGATGCATTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0039400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATPSHAQAVKSLNKSPGRRRFVFKSFSERVDDIDIDVYRSLHKLKPEPSEGSSFFRDCLIEWRELNTAEDFISLYEEIM PWTQSLPLVLLHKETLISMLLSRLHMEARLSLDAILRLIAALARDLLEEFVPLFPRIVDALVSLLESGADREPDIIEQIF TSWSYIMMYLQKYLVHNPSDVLKVTAKLRYYKKEYVQQFMAEAMSFVLRNAPDEQLKRGIKRVFAEAAKKPSPYREYGVE ALLYNIMKGYSSRFHSKAERVLQILTSEAIYPFDDKVDQESRTILNIVKSVFSKVCENMEPEELDLVWNCLYKEVHECVS SGNNRHLRHNLSVLVSAVKIRNGQKVSDYKPMLALVLLLVRTFITPHGAIESKEDMYLVVNKVLKLMSAILEGLCHCSKL KISECAFQWAPIFKLRCPSLLCFIRKLLQKDPCLLPFRSHVLSAINDFMEISEEEAIHLLQSFCEKMRSDMRNSDFVDGA SAKELARIHSHLQGIISHWIRKINDIAHSDVSCQIDEDKLALLWGVVNCYSYMSIVEANPSLLVDLMDAIHQLLTVKPDT SRKAWESIIGASLGSYNRLYSDRNIGADETGKFLSFAKRYKTSSQVLAAVASYLECKYGSSMEGTGCKIYHPELEETTTE AVSIFADNLRHSDKEIRISTLKILCYYTSLGGENSLMDEPTEKRRRIEISPASNADCAGNNALQLLLLIEKTPISISTSR SIQRLISKIQMDLSAGRIPNVYVPLVLNGLFGILNNRFSYLWDPVLECIAVLISLHFSLVWDNLINYLEMCQAIMETSSN LLVCANGASLDQPTDLLGCFKFFVHRAYDCTPSVTILTSLLQALQKIPTVIEPRSRQFVPLFLKFLGYNAPDLRNCSVGL FDSRACKGKEWKAILKEWLNLLRLMNNSKSFYLSDFLKEVLQNRLLEDDDPEIQIRVLDCLLIWKDDYLTSYAEHLRNLI SSKNLRDELTRWSLSRESQMFKKESERVEECHRAYLVPLVIRILMPKVRKLKGLASRKKASICHRKAILSFIAGLDVVEL PLFFALLIKPLQIVEKTDGPANLFWTSHRGYTSEFQASSLLEYFTLDSLATLSWKKKYGFLHVIEDIVEVFDELHIRPFL YLLVGSVVRVLESCTSNLDNVKLNGLPSDEHHCSTSSNFPAEDNVLENQNLIGNTLKQLKDMRSLCLKIISLVLNKYDEH EFGSDMWDRFFSSVKPLIDKFKLETASSEKPSSLLSCFLAMSANHKLVPLLCSKESLVPDIFSIISVNSASEAVIYCVLK FIENLLSLDNQLDIEDSPAHGVLLSNIKGLMDSICCLFGCDNAAKRKLIKSPGETVIRVFKFLPKYIKEEELAKKLVDLL LLFVAKKPESSDVCVEVLQVIQSLIPILGCRSTAKILSAVSPLYISAGLDMRLRICDLLDALVASDESVVSVAKLLRQLN ATSTLGWLDHDAILDAYRMINIDFFRNVQVEHALLILSHCVLDMSSEETTFIYSAHSSLLSFVDFSALILCLEGSSDQEL PVIKNTDACWTKSCIQRIIKKFLLKHIANAMDGLLAVRKGWMKLLNQMVLKLPDVSNLKSLAALCNEDGEANFFDDITDS VIRKRVKALSRFRNVICMNKLSEFVTEKVLMRLFFNMMFDEKEGTAEHMKNACIETIASVAGQMGWKSYYALLIKCFRGV SSSPDKQKLFLRLICSILENFHFSDLSHSEEPKESSGGVSHSGVTDTVSSGTLDNFCTHDVNTEIQTCLYKVVLPKIQKL LDSDSERVNVSVSLAALKLLKLLPGDVMDLYLPTIVHRISNFLKSHLESIRDEARSALATCLKELGLEYLQFIVKVLQST LKRGYELHVLGYTLNFILSKCLSSPVCGKIDYCLKDLLSVIENDILGDVAEQKEVEKIASKMKETRMKKSFESLKLVAQN VTFKSYALKLLAPVTAHLQKHVTPNVKGKLENMLHHIATGIESNPSVDQTDLFVFIHNIIDDGLKDEVGWHENKLIKLDD KNSHTNGKRISTGRVVASGLLCSHLITVFGLRILHKRMKGMKQDVKDENTLSLLDPFIKLLSDGLCSKYEDILSASLGCL TVLVKLPLPSLQLHAERVKTAVLDIAQSSVNSSSPLMQSCLTLLTVLLRNTNISLTSDQIHLLIQLPFFLDLEKNPSLVA LSLLKGIVSRKLVVPEIYDLVTRVAELMVTSQMESVRKKCSKILLQFLLDYRLSEKRLQQHLDFLLSNLRYEHSTGRESI LEMIHAIIVKFPRSVLDEQSQTLFVHLVACLVNDNDNIVRSMSGAAIKKLIGSISPNSLNSILDYALSWYLGGKQQLWGA AAQVLGLLIEVVKKGFHKHIDRVLPMSFRILQSAIDAVTNSQVGFSAETTVPFWKEAYYSLVMLEKMIHQFHDLCFAQDL EDIWEAICEMMLHPHSWIRNRSVRLIALYFANVTDVSRENHQSSFSSYFLMNPSRLFLLATSLCCQLKMPLIDVDVNVMT QNIVFAICGVHSLMGQIGCIDPPAFWSTLEQHEKERFLKAFDLIDSRKGRSMFMSSSLTTSVYEDNSQLNVDNTRYRLVF LLLRKMGKIVLQTDDIQMEIVFKSYGNIISQISKDDSMHYAQAVLLPLYKVSEGFAGKVVADNLKKLAEDTCAKIEKILG TENFVEVYNLIRKNLKLKRNKRKQEEKVMAVVNPMRNAKRKMRISAKHRANKKRKITTIKMGRWMH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 759 | 759 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 2703 | 2703 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 92 | 1047 | 956 | 6.58E-18 | ||
| Phobius | 760 | 781 | 22 | - | – | |
| Phobius | 782 | 1026 | 245 | - | – | |
| Pfam | 891 | 1550 | 660 | 1.8E-94 | ||
| Phobius | 1027 | 1048 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1049 | 2014 | 966 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 1553 | 2431 | 879 | 2.3E-41 | ||
| Phobius | 2015 | 2034 | 20 | - | – | |
| Phobius | 2035 | 2706 | 672 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0039400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…