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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0061300 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0061300.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | XH/XS domain protein; TAIR: AT3G48670.1 XH/XS domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8VZ79|IDN2_ARATH Protein INVOLVED IN DE NOVO 2; TrEMBL-Plants: tr|K7LRJ4|K7LRJ4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0061300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:11139672..11153642) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCTAATGACTTGGACTTTCGTTTCATTTACTCAAAGAAACTAACGTCACCGTGTAATACAACTAGTAGATAATTGAGATT CTTAAACATCTAGTCTAGGTTTGATCATTAAGAAGTGCTTATAGAGAAACATTTGTTGGAAGATGTCTACCAATTTAACG AGATTTTAGGGAGCCAAGAGACTAGTCTCAAGGTTACTTTGCTACCGGATACATACTTTAGGAAAAAACAAAACTAACAT TAGAAAAAAATGGGAAAATTTTAGAGGACCCAGAAAAATAATTACAAGGACCAAATTCAGAAATTAGATAGATATCGATT CTGCGTAGTTGAAGAGCATGTTTGGGTAGCTGTTTTGTTTCTGTTGTGAATGCGATTTTCACAATTCCAATCCAAACGTG AAAAGAATTTTTGGGTTTCCATTTTCTGTTGCAACATTGCTTTTTCTCTCTTCTCTCTTCTCAGGTATTGCACAGTTCCA TTCCGTTTAGCTTCAATTCAAGTATTTTTCTTTTCCACATTTTTCATTAGGGTTTGTCAGAAGTAAAATCAAACTCTAAA TATGCAGGTAATTTGAATTTGTATGATGATGGTGAACCATACTCATGAAGGGAATGCCAGTAAGCAATGCAATGCTTCAG TAAACCTTCACAAGGAAACTGAGCCCCAGAAACAAATAATGATTGATAAAGCTGCAGTTATGAGCAAACTCAAACAATCT CTGGACATGGTACTATTAATTTCAATTTTTCTAATTTTCTTCAATATATTTACAATTTTTTACATGGAGCCTGTATTTGA CTATTTGCTATGAAATGCTATAAGATGCATGAGAAATAGTCGACCACAAAGGAATTCTATATTGAAAGGAATCACTTATT TTTCATATTTCAATTTTTTTTTTGTCAATGAGTCTCCAAACCAGCTGCTTGCATTTGTATTTGAGAAATGCGAGACTTTA 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GCATTGGGAAATGGTTAAAAGCAAGAGGGGAATGATGTGAAGGTTTGTATTAACTAGTTACTATATAATGTATTTAGGCG ACTGTATTTTTCTCATGAACTGTATTGCAAGAACTCAAAGAAGGTTTTTTAAAAGGATAGATTACTGCTTTTGATGTTTT CTTTAGAAACTACCAGTTGATTTATAGTAATCAGAATCCCCTCCCTCCTTTTCTTATTAAGATCATCTCATGTCACATAA CATTGTCATACGAAACATTCTCTTTGTAAATATTCAGAAGGTCCCACCTATTTAATACTTATGAAAAAGGAGACAGACTC AATTTCAACATGATTATGTGATGTGAAATTTACATATGACAGATCATGATTCCCCTTTTCACTTGATTACTGATAGGCTT AATTGCAATTTTGGTCCCTGACGTTTACCAATTCCACGATTTTAGTCCCCCACCTAATTTAATTACACGGATGGTCCCTG ACTTTGTTGGTCGTCTGCAACGTTGGTCCTGCCGTTTATTTGTTAACGGAGGAGGCTTACGTGGATGTCCAATTGGAGAG AGAAAGAAGGACTGAAGAGAGAGGGAAGCATGCGAGTTGCACGTGAGACCTGCAACGATCATCTTCTACCCTCTTCCTCC TTAAAAAACAGAGCACCGTGAGGAAGATGTTTCGAAGCTTGAGATTGAGCGAAAAAGGAAGAGATAAAGAACGAACGAGT CCCTGGAGGCAAGGAAGAAGATTGAATCAGTTGCTGGTCTCTTTCTCTCTCCAATTCGACTTCCACATCAGCTAAGTGAC CATCCACGTAAACCTTCTTCGTTAACAAATAAATGAAAGGACTAATGTTGCAGACGACCAGCAAAGTCAGGGACCATCCG TGTAATTAAATTAGGTGGGGGACTAAAATCGTGGAATTGGTAAATGTCAGGGACCGAAGTTGCAACTAAGCCTTACTGAT ACAGTTTTAGTTACATGTCATATAACTGTTGATGTTATTGCTGAAAGGTTGATTGATGTTTGTGATAGGAACAAGCATGA TGCATTTGGAGAGATAATTTCTGCATCACAGCTGGGTTTCAAGCATCCATATTTCCAAAGCTGCGAACCTAAAGGTTGTC TTTGACTATGATAAGCTGTTGGTTTTTACTAGAAATTAGGGTTCTATGGGCGTCTTGCTGAGAAACAAACTGCAACAATA GCGACAGCCCTTATACTATTTCAAGCATGGGAGAAGACATTGATGTTAAACTTGTCTTACTTTACTAACCATTTATTTTT AGCATGTTTGTTTGATTACTTGCATTTTGGTATGACTATATTTTCCTGTCTCTATGGCTATGTTTGGATTGGTGGGATCT GGTGAATGGAATGTGCCATTCTATTCTATGGCGTGTTTTTGTTTCTCTTCGTCGCATGCTATTATTATTTTGTGACTTGA AAAGAAGCTTTCAATCAATAACGTGATTGAATTATTCTGATTGATTATTCTATGACTGAGCTGCCTAATTATCAGAAATG AGTGTCACCTACGTAGTATCCCCAAACCTTAGCTCTTTAAGTAGCTGTTTGGGCCATATTAGTTCACAGGTGGCAGAGGC CATGGCAACTTCTACACTTGATCTTGCCACTATAGTTTATTTCTTGCTTTTCCATGAAATCAAGTTGTCACCAATGAAAA TACAGTAGGCAGAAGTGGATCTCCTGCCAGTACGAGAGTCTGCCCAATTTGCATCAGATTAACCTACAACTCGTGCATGA CCTTTGTCTTCATACAAAAGACTGTTCCCGGAGCTCCTTTAATATATTTTAGAATGCAGATTATAGCATGTCAATTTCCT TCACAACAAAACTGGATCTACCAAACAATGTCCTTGGTGATTGTTTCAGATATAAAGATTTACGGAGATGACATACTAGT CCAGATGACTCCCCCTAAGCAACAAGCCCATGAGGTTTCTCCATATACACTTCTTTAGCCAGATCACCATGAGGAAAACA TTTTTCACATCAAGCTGGTAAAGAGGCCGGTGAAGAATAGCATCCCTAGATAGGAATACTAGAATAGAGGCCATTTTAGC CATTGGAGAGAAAGTGTTACCATAATCCAAGCCAGATATTTTTGTGTACCCTTTCGCAACCAATCGGGGTTAAGTCTATC AACCTTGTCTCCATGACCAATTTTCACAGTGAAAACCCAACTGCAACTAACAACAGATTTCCCTGAAGGAAGGAGAAAGA GGTCCCAAGTACCATTGTTCTAAAGTGCATACGTCACACGTCTGCTTAATAAGTAGTATATTCCTTTTACTTTGGCTTGA GGAGCGAGGCTTTTGCTTCACATTTTATCAAGGCTTTTGCAATGCTTGTGCAACCAATCCCAATTATCTTACATAAATTT AAACATACTTGCGGTTACCTCATCTCTTCCAATGTCTCTCATAATATAGTAATTTATCATCTACCTTAATAAAGTGAAAT ATATGATGATTATTTTTTTTTAAGTAAACGTTAATGGTTAGTAATGTTAATAAATTAGTCATCCATCAAGATTCGAACTC TGAACTTTTTTTCTTTATTTCCTCCAACCCTTATGTCTCATAATTCCTACCATTTGAGCTAATCTTGAGGGACAAGAGAT ATGATTAATGATGTGATGAAAAACAAAAGAGATAAAAAAAATGGAAGAATGTGAAAGTAATATGTGAGAAAGAAAAAGTG TGTGAGTATATCATGACTCTTGGATTTCTCACAGTACCTATTGTAAACAATGTGAAATTATGAAATGCAACGTTTTGAAT GCGTAAGGTCACCATCATGAACCCATAAAGTGAGAGCATCTGCTTTTAAGGTTCCAACATTGCTCCAACTCATTCTACAC 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CTCTGTAGAGCGCAAGAATTTTGATGAGCTTCAAGAAGCCCGAAATGAATTGATTAATGATGTAAGTCTATACTGGTACA TTACTCTCTGAAAATTTCATTCAATTTTTAAAGATTGCTTGAATGATATTGGAATAATGTTTTTCTCTCATGTAGGACAT TATGGAGAAGAAGTCAAAATATGTTCGTATTGGAGTTAAGAGAATGGGGGAGATTGACACTAGACCCTTCCTTGAAGCAA TGAAGGAAAGATATAATGAGGAAGAAGCTGCAGTGAGAGCTTCAGAACTGAGTTCAATGTGGGCAGATTATCTGAAGGAC ACCAATTGGCATCCATTCAAAGTTGTCACAATTGAAGGGAAAGAAAAGGTATGTCTTTGTTAATAAGTCCAACATAGATT CGTTTTAATCTACAATTTCATTTTCTTAATTTCAGGAGATTATTGATGATGACGATGAAAAGCTGAATGGTCTCAAAAAT GACATTGGTGAAGGGGCATACAATGCTGTTGTGACTGCTTTAGTAGAGTTCAATGAATATAATCCTAGTGGGCGATACGT AACCAAAGAATTATGGAACTATAGAGAGGGAAGGAGAGCAACTCTGAAAGAAGCAATTCAGGATCTTATCAGGAAAAGGA AAATGAGCCAGAGACACTAGAGGTGGGTAATGTGATGCTTTTGTTGTGTATACAACTATATAATGGATTTATGTTACTGC ATTTTTCATACAAATTGTGTAGCTAGAACTTGGAAACAAAAAGATTAAAGCTGATTGGTATATGTAGCTTTAGTTACCTA TAACTAAAGTTGCCCAACTTTATTTCTCTTGATGGTTTGTTTTCTCAAGAAACTAGTTGATTTATAGCATTCTGAATCCC CTTGTGCTTTTTCAATATTGCTACTGTTATCATTCTAATTACTGTGTCATGTAATATTGAATTTTATTGCTGAAAGGTTG 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0061300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAAATACAGTCAAGTGCTAGGCAATACTTACAAAGAATTTCTAACGATCATGAGAAGCTTAAATTGCAACTGGAATC TCAGAAAAGCGAGCTCGAGTTGCGAAAAATTGAACTGGAAAAGCGTGAGGCACATAATGAAAGTGAAAGAAAAAAGCTGG CAGAAGATATTGCAGAGAATGCAGTGAAGAATAACTCTCTTCAGATGGCTTCTCTGGAGCAACAGAAGGCGGATGAAAAT GTTATGAAACTGGCTGAATATCAAAAGAGAGAAAAAGAAAAACTCCATGCTAAAATCATTCAGCTTCAAAAACAACTGGA CATGAAACAAAAGCTGGAATTGGAGATTCAACAGCTAAAAGGATCATTAAGTGTTCTGAAGCACATAGAAGATGATGAAG ATGTTGAAGTTCTGAACAAGGTGGATGCTTTACACAAGGATTTGAGAGAAAAGGAGGAGTTACTTCAAGACTTAAATGAA TTGAACCAAACACTAATCGTCAAAGAGAGGAGGAGTAATACCGAGCTGCAAGAAGCTCGAAAAGAATTGATTGATTACAT TAAAGAGACGTCATTTCGATCCCATATTAAGCTGAAGAGAATGGGGGAAATGGACACTGGACCATTCCTCGAAGCCATGA AGAAAAGATATAATGAAGAGGAAGCTGAAGAGAGAGCTTCAGAACTATGTTCATTGTGGGCAGAATATCTGAAGGACCCA GATTGGCATCCATTCAAAGTTGTCATAATTGAAGGGAAAGAAAAGGAGATTATTAAAGATGACGATGAAAAGTTGAATGG GCTAAAAAATGACATCGGTGAAGGGGCGTATAAAGCAGTGGTGACTGCTTTAACAGAGATAAACGAATACAATCCCAGTG GGCGATACATAACCTCAGAATTATGGAACTATGAAGAGGGAAGGAGAGCAACTCTGAAAGAAGGAGCGCAAGTTCTGTTG AAGCATTGGGAAATGGTTAAAAGCAAGAGGGGAATGATGTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0061300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKIQSSARQYLQRISNDHEKLKLQLESQKSELELRKIELEKREAHNESERKKLAEDIAENAVKNNSLQMASLEQQKADEN VMKLAEYQKREKEKLHAKIIQLQKQLDMKQKLELEIQQLKGSLSVLKHIEDDEDVEVLNKVDALHKDLREKEELLQDLNE LNQTLIVKERRSNTELQEARKELIDYIKETSFRSHIKLKRMGEMDTGPFLEAMKKRYNEEEAEERASELCSLWAEYLKDP DWHPFKVVIIEGKEKEIIKDDDEKLNGLKNDIGEGAYKAVVTALTEINEYNPSGRYITSELWNYEEGRRATLKEGAQVLL KHWEMVKSKRGMM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 329 | 328 | 5.0E-158 | – | |
| PANTHER | 2 | 329 | 328 | 5.0E-158 | – | |
| Coils | 11 | 54 | 44 | - | – | |
| Coils | 85 | 129 | 45 | - | – | |
| Coils | 141 | 189 | 49 | - | – | |
| Pfam | 199 | 329 | 131 | 3.4E-55 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0061300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…