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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0346900 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0346900.1 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | UDP-glucose 4-epimerase, putative; TAIR: AT1G30620.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9SA77|ARAE1_ARATH UDP-arabinose 4-epimerase 1; TrEMBL-Plants: tr|I3T3Q3|I3T3Q3_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0346900 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:65953673..65965788) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGTCGCAGTATTAACGGCATTATGCATTTTGATAATCAAGAAATCTCCATCTTTTACTTCTCCTAGTCCGGTACTCCTTC AAATAGACATAAACAACACATATATTTAGGGCATTAGTTTTAACACCCCCTTATTAATCTCACACCCTCTTTTATTTTCT AAATTCCCTTAATACCCTCTCTTATAAAGAGATAATTAAAGTGTGATAGTATTTTCACACCTACTAACTATGAAACATTT TCACACTCAATGAGTGAGAAAATATTTCACACTCACTAAGTGTGAAACACAATTGTGTGAATCGAGTATGTTCATTCTCT CTTTACCTTCTTCCTTGGGTGTGAAACACGATTCAGTTTCGCACTCAAGATCAGGAGTGTGAATGAACCGACTGTTGAGA ATTTTATGTTCAATTTTAAATTTTTCGTTTCTTTAAAATTAGATTTCACACTCAAGTGTGTGAAACATTTTCAAATTTCA CACTCAAGAGTGTGAGTTATTGAAATGTTAATAATTTTATTTTTAAAAATTATTTTTTTTGTTTTTTTATATTTTCATTT CACACTCAAGAGTGTGAAATCCTTTCAAATTTCACACTCAAGAGTGTGAAGGAACCAACTGTTAAGAATTTTATTTTTAA TTTTAAATATTTCATTTTTTATAATTAAATTTCACACTCAAGTGTGTGAAACATTTTCAAATTTCACACTCAAGAGTGTG AGTTATTGAATTGTTAATAATTTTATTTTTAAAAATAATTTTTGTTTTTTTTTTATATTTTCATTTCACACTCAAGAGTG TGAAATATTTTCAAATTTCACCCTCAAGAGTGTGAAGGAACCAACTGTTAAAAATTTTATTTTTAATTTTAAATATTTCA TTTTTTTTATAATTAAATTTCACATTCAAGAGTGCGAAAAAGGCAAGCTCACACCCTAATGTCAAACTTTCCCTTATATG GTTTGAATTTACCACCCTGCTCACACCCTAATGTCAAACTTTCCTTCCCGTTCAAGGTTCCATAGTCAGACCTTATCATA ACAACAACAAAGCCATTGTCCTTCCCCACCAACCGAGCCCAATCAAAGACTTTCATGCCGATTTTGGAATTTCTACAAAC AACAAATACGGTTAGCTTTTTATTTAATAAAGTCAATCAATTGTATATATCATATTAAGCACATGAGATATGTGAATCTT ATCAGTGGTGAAGGCTTCTGTACATTCTACCATAACAACATGAGATAATGCATTCATGTCATTTATTGCATTCATTAAAT CTTCATCCTCCTTCAATATGTGACCCCATTCTTTCATATCATCAACTTCATTATCTACTTCTTTCACATGATCCACCTTG ATATGATCCCCTTCAGCCACATTATCGATTTTCTCAATGAGCACAGGAGACATGATTAGCTATCATGAAATGGAAAAGAG TAAGAATCAAAAAGAAAAATTCACAAACAAGTAAATTTCACACTTTTGAGTGTGAACGGAACAACTATTTTCCACTCCAT AGTGTGAACTACAAACCAAATTCACACTCTAAAGTGTGAAATACGAACAACAGTGATAAAATGAAATTTTCACACAACGA AAGGAAGAAGGTGAAGAGAGAATGAACATACCTCGGTTCACACTTATAAAGTATGAAATGTTTTCATATATATTAAGTGT GAAAAGTGGCAACGAATAAAACTATGAGATGAGTGTAAAAGTGAAGGGTTGTGTGACAAAGAAAGATGATGGTAGTGATA AGGTAGGAAAAGGGATATGTTTGGAATGAAATTAAATTTTAAGGGTATTTGATACATTTTGGTGCATAAAAGAAGGGTGG GGGATTAATTGAGGGGGTGTTAAAACTAATGCCCATATCTATAATCTATCTATAATCTATAATCTATAATCTATCTATAA TCTATAATATATAATATATATAAAAGCAAAGTTTTGCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGTCATTCAACAATTTATTCCAATAA CTATGGAAGCTGGGCATGGATATTTTTGTAAAAGGTCATTTTATTTCACTCAGGTTTGATCTCAGCCGTTCATTCATATC AGTTTCACTCCTTCTTTCATTCAAGGGATTTATTAAATTTGTGAAACGCTTTTCAGTTTCAACAAAATACAGACGCTTCC CCTTTCACCTTTACCTTCTTCCTTTTCTCCTTCTCTCAGCCGTTTCACGAACTTGAAAAGGCAGACACATGGTTTCAAGT TCGTTTAAAACCTTCTCTCAGACACTGCTTTTCCGTGTCTGCCTCTGATTTCCAGCACCTCCTCGACACCCTGCCTCGCC CTTCCACCGCCGTCTGGAACACCTTCATCATCGGCTTCATCTGCGACCAGAAGCCCCTCGACGCCCTCCTCCTCTACGCC CACGTCTCTTTCGGGTTTTCAGGATCTCAGGGAGGATATTTGTTTTGCCATGGTAACCCCTGTCGCAGGTACCTTGGCCA CTGGGATTGGGGCTTTGACGGGTGGTCAAGGAACTGGCTAGATGGCGGTTATGCAAATGAAGGGGAGACAAAGGATTTTT GGAGGGTTCGAATCAAAGTAGGGAAGGCGGTCTGCTCCGTTTAGGTATGTATTTCATCTCTGGTGGTCTCTAGGATTCTG AACTGATATCGTTCCCTTTGTTTTTTTTCCACTTCGTGATGGAGATGATTTTTGGCTAAGCAAATTTGATTCAAATTGTT CACTGTGATTCTTGTCTTGCAGATTTGGTGCGCCTTTGCTGAGATTATGGGGTTCCAGTTTGTGCATTGGTGTCGTTCTT CTACGTTGTTCTTGATTGTGGTATTGAATTTCCTTTCCCTCTCTCTCTCTTTGTTGTTCCTGAAAGGCCCAATTTTTTTT GTCTCTGATGATTGATTCCCAATTTTTCCATCCTTAGAATGGGGCAGCTTTGTTGTTAGGTCGCAATAACCTCCATTCTA TAAATTAGTTTACTTTAAATGTATTATATTGAAGTTTGAAAGATGGCTAAAATTGAGTTGATGCATCTGTGTTGATGGTG AAGGAACAGTTCAGTAGAATCAGCCAAGGCTGATGGGCTCAATGCAGTGACTAGGGTTGGAATCCTTTGTGATCTTTATT GGAGCTTTTTGGTTTTCAGTGAGAACAAAGATTTAAACCTGATAATTTTAATTTTTTATAATTTCCTGTACATATTGATA ATTATACTGTTGATCTTTTCCTTTCTAGAGCTTGCCATAATTAAAGGAGGCAATTGATTCATCTTTTTGTTATTTTGATT TCCATTCTACTATTTTGATGCTAATTCTTTGTTTTGGTTAGCATCCAAAAAGAAGAAGCCTCAAACACAGTGAATGTATG TATTTTAATATGAGATTTACCATGCTTTGAGATTATACTTAAAACTGGGCTAAGAGTTTGAGGTTCATTAGAAAGCGTTT TGAGTTTCGGGATGTGAAGTTCATCACAACTTTGATGCAGATAGCTTCTTTTAGCTAGCATTTACTATAGAAACAATTTA ACTACAGTTGATTTTTCTTTGCTGAAAAGCTTTGTTTGCTGAGAAACATTTGAGTTCTCTACAAATGTATTGGTATAACG CTAAATTTTTTGTAATTTTTAGGGTTAATCAGTTCTTTGGTGTGATGAGGCTGCAACTCATGATGCTTATTCCCAAAAGA AGTATTAGTAACAACAACAGAAAAAGCAAAAGGAGGTGGCTTTCTCTCTCTATCAGCTTATTGTTTTCTTTTATTTTTCA GATACAAAGTAAAAGTTCATTTTTTCATTTGTTAAAGGTTGACTGAAGCTTGGCTTTGAGGCAGGACTCTCGAAAGCTAC 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CAAATAATTTTTTGGCATATTGAAAAAATTCAATTGAAACATTCACTGGAGACACACGGTTACCCTCAATGTTGTAAATA TGGGTGGAACTTAAATAATGTACATTCCTTCTCACGGTCTCTTTCTTTAATAAGATCTTAAGCTTCACATAGCTTTTTTG GCTTGCATTCCGTCTCATAATCTCTTTCTTTGTTGTCATTGTTTTTTGGAGGGCGTTTGACAACAGGTTTCTCCTTGGAT TTCATCTATTAGGTCTGTTATAGGATGGGAATATTGATGGGAGAACACTGTTTGGTTTGATTCAATGGAGATCATGGAAG TGGTTGTCTGCAGAAAACAAGGAATTTACTTCATCAATGTTTGAATGGTTAACTAATCTAATGGCATGCCTCGGTGGATA TTGATCAGTGCTTTTGGTTCAGGATGGCTTTTGATTTCAAGTTGCAATTGGGTTGGCGGTTGCTGCAATTTTGGATTTGC TTCTTGGATCCTGTATTGTTTCGCTAGAGGATGCTGACGTAGAGGACAAGATGCTGGTGGATTTTGAGATAGTAATTACT ATTGTAATAGCTACTGTCTTAGCTTTAGGCAGCATAGTTGGTTTTTTCTTTTTGTCTAATTTAATGGCCCATTGAATGTT TTGTGCAGAAGCCTCTCAATAAAAGTGAAGCAGTTGTTCCTTCTAATTTGCTGGATAATAGTTTGGCTTTTGATCCAGCC CTCAATAAGATTGCCTGACATGAGGGTGCATCAGACATGTAGCTTAATCCCTTTTTGTAATTTGGTATTTGATTTCTAAT GGGCAGAAGTGTTTGAATTCTGAACTGTACCATGAAATTTGCAGTGCTTTTTTCTTTTTACGGATTATTAGCTACACAAT TTTTATTTGTGGCTTTAATGTGATTGATCTACCTTACTCAATCACAATCCATAAAACTGAAGAAAAAAAAGGATGAAAGA TTAAGGATGAAATTTTGCGTAGAACAAACATAAGGGACAACTCCAAATGTAGAAATTCTTAAGAATGGCATAATTTATTT GACCTATAGTACGTTCTGTTAAAAATTGTGTTGATAATTTAAATAAAAAACATTAACAATTGTGTTGTTTCAAGTAAAAT AACTAAAAGGCTATGTAACATCATTAAGTCTATTAAAAAATATTACAAAACTTTGTCACTTAAAAAATATTACAAAACTT TGTCACTGATATAAATTAATGTGCAAATGATTTCATTAAATTAAAACATAGGGAAGTTAGCAAAGTCATGGAATCCAAAG GGGATTTTAGTGAAGCTTACAATTGAACAATAAAGGTACATAAATTGCTAAATTAATATTTTTAAGAAATATTGTGAGGA GAGTTACAAAGTGATGGAATCCCAAGGGGATTTTAGTGAAGCTTGCAATTGAATATTAAATATTAAACATCATTAAGCCT ATTAAAAATGAAACTGATGTCAATTAACCACCCAATACACAACTACGAAAAAAACTAAAAGGCAAATAAGAATGATCCAG CTTCTTAGGGAAAATAGATTGATAAGCGATTTTTTTAAAGCATAAATTTAGAAGTTAATAGTTATTTAAATTTAATTATG AGATAAATTAGTATTTATTAGTCTATTTAAAATTAAATTTATTCTTGCCTTTTGGTTCCTTTCTTTGAAGTTAGAATCCA CACTCTTGAGCTCTATATATAGATACAATAGTATGTGCATAGGCATCAAAGCAAGAGCTAATATTTTGTCATGGCTAACT CTATAGGTTCATATTCTATTATGTCTCACTCCATTCCTCCCTTTGCATTTGCGGTTTTGCATACCGAGTCAAGGGTAATT GTTGATTGTGTTTCTCTATTGTTTTACTCTCTCTTCTGTGTTTTCATTTTAATAGTTTTTTTTGGGCTCTTATTTACTGG ATGCAGCACTACGGTAAGACTAATGAGGATGTGGTGGAATACTTACAACTCCCGGATGATGGAGATTTGATCCTTACTGA CTCATTAGGTGTGACCAAAGAGATATCCTTTACTGTGGTAGTCAAAAAAGCTTACCCAATCCTTGGATGGTGTGAGCTTC GCCAATTCTACAATTTTTCAGGAAATGTTTGGCTCCTTTTGAAACATGTGAACAACTAGCTAAGATACACTAATCAATAA AGACAAAAATAATATTAATCTACCATTTAAAACAACAAGTCAAAAGATAAAAACAAAATAATAAAAAAAACAAAAAACAA ACATTTAATTAAAAGAAACACATAAGAATTCATAAACTAATTTTTTTTATTATCTTTTACTCAATAAATTATATTTAAAT AAAAACAAAATTAACAAAAAAAACCAAAAAATGAATATCCCTGTGCATCGCACGGTAAAAAGTACTAGTATTTATATATT GTGCATGTCTATATATCTATAGATTTTATTTACTAATGGATGTGGACATTGTGATATTTTAATATATTTGTACACATTAC AAACTTGAAAGAGTTAGCTGGCTAAATATCCTATTAGACATATTAAAACAAATTTTATCAGTCACTTCTTTTTAATCTAT TAGATAAATGATTTTTATATTTTCTTATGCCGTTTATAAGTTTACAGCATGATGCTTCCTTTTGTGGTGGTGGAATTTGA TTGGAATTCAATGCGATGGCTGGATTTTTTCTTGGGGCGGGGGGGGACTTCTCGGGACTGTTTTTGTAGTCTGTTCTTCC AGCTGAGTTAGATAAAACATCTGGTGTATCTAAGTTTGAAGTTTCTATCTTCATTTCACGTTATGTAAATGTTTGAAGTA AAGCACTATGGACTATTATAATTTACGTCTTGTTGTTTGACAGATTTCTATGATAGGTCGGCTCTTATGGCCTTTGGGAG ATATAAAAATTCTGTGTAGTTTCTTTGGCTGTTTGATTATTTTATTGCTCAGAGTTAGGGATGGTAATGGGTAGAGTGTG GGTACCTATTCCCATACCCGCGTTTTCAAAAAGTACTCGTACCCGTCCCCATACCCGCGTGGGTAGCAATCTGAATGTCC GTCCCCGTACCCTATGGGTACCTATATGCCCGTACCCGTGCCCGTTACCCGCAATTTAGTTCATAAAAATTTAACTTTCT TCAATAAAAAATCAAAATACAACTGTTATTATAAAATAAAAATCATTAATTAAAATAAAAATGATCATCCGAGTAATTAA GAAGTAAAATCATTTGAATAAGTATAAATTTTATAAAATGGGTTATTTAACCCAAATTCTACCATAGGTCATTTAGACAA CCCCTTATAAAATTTGTATAAGTTAGGGATAAAAAACATATTTGACCCTAAATAAATCAATTAATAAAATATAGAAAATT CAACCAATTTATCTTAAATGTGATTGGTCCACCTAGACCATGGGTTATTTAACCCAAATTTTACCATGTCATTTAGACAA CCCCATTTTGGATAAAAAAGAATAAGTGGGAATTGAAGCTTTAAATTTATAAATTTAGATTATTAATAAACTCCTAAAGT TGTAGGTTAATAATTTATTTTAAAAATAAGTGAGAATAATTATGAACCATATATATAATATAAAGACTTCACTTACGTAT TTTTTAAGAGAAGTTAGGAAGTTATACTTTAAGTTTATTAAAATATACTACCAATTATGTGTATGTATATGTATAATATG TGTGCGAGTATGGGACGGGTTGGGTACTATAGTACCCATACCCGCACCAGTACCCATTAATTTTTGCGGGTATTTACTCA TACCCAAACCTCATACCCATTTAGCGGGTTTTTACCATACCCATTATGAGTATTTTTTGCGGATACCCAATGGGTCTCGG ACCCATTCCAATCCCTCCTCAGACCCACCTTGATTATTTATTCAAAGAATAATGAAACTTTTCTATTTTTAATTGGGTTT TCACCGGTGTTGTCAGAGGGATACAAGAAAGAAAGAAAGAAAATAGATGAAAGAAAACTATAAGGATTTACAAGGGGGAA TTTATAAAAGATAGGATGTATTATTTTCAGTTTAAATTTTTTTTTTCTTTTTTTGCTATTATTTGGTATTCAAATCAACA TCCATCTTACCCTTCTATTCAATTTGGTGATTCTGCTTCTTCTTTTTTGGGCCAGTTTTCTGTCTCTGAACCAGGGGTCA CTCATGTATAGTGAGGTGCAGGCTATATCGGCTCACATGCATGCTTCCTTTACGGCTCCTGAAGGAGTCTTATCGAGTAT GTCTCTTCATATTATTGAAAACTTCTCTGACAAAATCAAATGCACGGCACTCATCAGTCTAGTCTGACATTTTCTCCCTT GCAGGATAATCTGTCACGAGGAAATTTAGGTGCCGTCAAGGTTCTTCAAAACCTATTTCCAGAACCTGGAAGGCTTCAAT TTTACATGCTGACTTGGGAGATTCGAAATCTGTATCCTTGTAATATTTCCTTGTTGCCTGAAATAATTTGGTGTTGAATG TTAACTTTGATTGAAGCATAGTGTTAGAGAATGCCCCAGAGAAATTGTGTACCGTGTACTTGACTGGTTATCAGGTTAAT AAAATCTTTTCAGAGAATAAATTTGTTGCTGTGATGCACTTCACTGCTGTTGCATATGTGGGAGAAAGCACACTTTACCC TCTTAAGTAAGTACTTGTAACTTTTATTGGGGACAATATTTCCAGTTTAACAATTTGTGCGAAGTAGTAGTATAGAATTT GTGTGCATTTCTAATTTCCTCCATAAGTAGCATGAACAACAGATTGGCTTTTTAGACACAAATTGAAATTCTCAATTTTA TTATGAATTCTCTTTCAAGGTTTGTTTAACTAAGGTCTTGGTTTTGTGGATTCAATATGCTCTGCCTTTGATAATATACC TCTCTTAGTTAAAACTTAAAAGGTTGACATTCCTATAATTACCTTCATAGTGGTTTACTCAAAAGTTATCCTAGGCCCAA GGAAGTTACAAATAAAAAAAGTACATGATTGTGAAGTGAATGTTAAGGTTTCCAAATCAAAATTGATTCTAAATCTAGAT TATTTGGGATAAAGACCTAAATATGTTTTATGGGATTATGTCTATATGTTTTCTCTATTATGACTTATTTTAATTAGATT TAGCTGAGATGGATCAGTGTTAAAATTCATCCATTTCAATTCAACTTTTTTATGTTGTATAACTTGTTTGTCAGGGGTAT TATCTCAATATTACATCAAATACCTTGTTGGTATTGGAGTCTATGGCTAAATATGGTGTGAAGACGTTGATATATTCTAG TACATGTGCAACATACGGGGAACCGGAAAAGATGCCCATTACAGAAGAAACGGAACAGGTATGAAATATTCTAAGTGTGA TTGAATTGTGAACTATAGTTGAGAACTTTCGTTTTTAACTACAGTCTATGTCTAATGTTTTCTTGGTTACTTTAATGAAC ATTGAAACCTATGTTAAATTGATATTCTTCAATTTCAGAAGCCAATTAATCCATATGGAAAAGCCAAGAAGATGGCAGAA GATATCATCCTTGATTTTTCTAAAAATTCTAAGATGGCCGTAATGATTCTGAGGTTTGTACTTTGCATTTAAGTTATTAG TGATTTCTCCAATGTTTCAAATAGCTTTTTTTTATGTCTTATTCATGTGCCCTTTGTTTCTTAAGTTATTAGTCAACATA TCTTACATGTAAGGAAACCTTGTAACAAGTGTTCCACGGTTTAAGTCAAATGCATTTTGTGATTTTTCTTTTCTTTGCTT TTTGGCATATAGATGTTATGAATCCGTATTATTAATGCAGACTTCTCATAATCTGCTACTTTATGATATATGACATTTTC TTCTGGGAAGGTTTGATTTGAAGGTGACCTAGACATGCACCTTCATGTGACAAAAATCTTTATTGCCATGTACTGATAGG AAAAAAGTATCAGTACTTAATTTTGGATTTCATAACATAAATAATTGTTAATTTCAAGTTAATAATTCCTACTATCCTAT GGTTTGTGACTATTGATAACTTTTCTTTGGGGAACATTCAGATATTTCAATGTGATTGGATCAGACCCTGAGGGCAGATT AGGTGAAGCACCGAGACCTGAACTTCGAGAGCATGGTCGAATTTCAGGCGCTTGCTTTGATGCAGCTCGTGGTATTACAT CTGGCTTAAAGGTATCCTGCTATTATAATTTTTACTTTATTCTTGTGCTGTTTTATTTTATAGAGAAGCTTAAGCCATCT GATTTTCCATTATGTAGAATTCTTCTATATATTATAATTTATTTCACTCTAGTCTGCTTTCACAGCCAACTTGAAAACCA GCCAAAAAAATTGTTTCTGAACTAATATGCCGGTATATAATGAATGTGTACTCATTGTATATGTTTCCACGATTTGCAGG TTAAAGGAACAGACTATAACACCCCTGATGGAACATGCGTTCGAGATTATATTGATGTAACTGACCTGGTTGATGCTCAC GTCAAAGCTCTTGAAAAGGCACAACCTGGTCAAGTTGGGATCTACAATGTTGGCACTGGAAAAGGTAAGTTTTACAATTT GAATATAGCATACTTGGACGGTTGGACCACCTTCTCTTTCACCAGAATCAATTCTGAAACCCGAAAGCTACTCACAGATT GATTCTGGCTTCAGAGTCAATTGTAGAAGTGTTTCCAAACTTGGACATAGTCTATCCAGATGTTTCATAGTTATCTCAAA AGTTCTCATAGTGGGGTTGTTTCTCAGGAAGATCAGTGAAGGAGTTTGTGGATGCTTGTAAAAAGGCCACAGGGGTGAAC ATCAAAGTAGACTTCAATCCCCGCAGGCCCGGTGATTACGCTGAGGTTTATTGCTACCCGGCTAAGATCAGACGTGAACT GAATTGGACTGCACAACACACTGATCTTCAGAAGAGCATACAAGTTGCATGGAAATGGCAGAAATCGCGTCCTGGTGGTT ATGGAGTATCATCTGCAATCTGAAGTTGCTGCTCTCATACATCATGGGGCTGAGGATTTTTTGGTTCTTAGGGAGTTAGT AGTTCATTCATTATACTTATATGTATTCAACATCTAATCATTCAATAATATAATGCCTAGGCTCTGGTATAGTTTTCCTA CATCTTTTGATTCTTCCATTCTAAATAAACATAAGGCATTTCCCTCCCTCTATATTTTTGTTTGTTTGTGGCTCTCTGCT TGATCAAGCCAATTAGAATTTGCTTATTTTGCAGACTTTAGGACACGTTGCAAAATTGATATATGTTTGTAGTTTTTTAT TTGTTGAGTTGATACAAAAATTGAGAAAGTCCAAGT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0346900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTAAATATGGTGTGAAGACGTTGATATATTCTAGTACATGTGCAACATACGGGGAACCGGAAAAGATGCCCATTAC AGAAGAAACGGAACAGAAGCCAATTAATCCATATGGAAAAGCCAAGAAGATGGCAGAAGATATCATCCTTGATTTTTCTA AAAATTCTAAGATGGCCGTAATGATTCTGAGATATTTCAATGTGATTGGATCAGACCCTGAGGGCAGATTAGGTGAAGCA CCGAGACCTGAACTTCGAGAGCATGGTCGAATTTCAGGCGCTTGCTTTGATGCAGCTCGTGGTATTACATCTGGCTTAAA GGTTAAAGGAACAGACTATAACACCCCTGATGGAACATGCGTTCGAGATTATATTGATGTAACTGACCTGGTTGATGCTC ACGTCAAAGCTCTTGAAAAGGCACAACCTGGTCAAGTTGGGATCTACAATGTTGGCACTGGAAAAGGAAGATCAGTGAAG GAGTTTGTGGATGCTTGTAAAAAGGCCACAGGGGTGAACATCAAAGTAGACTTCAATCCCCGCAGGCCCGGTGATTACGC TGAGGTTTATTGCTACCCGGCTAAGATCAGACGTGAACTGAATTGGACTGCACAACACACTGATCTTCAGAAGAGCATAC AAGTTGCATGGAAATGGCAGAAATCGCGTCCTGGTGGTTATGGAGTATCATCTGCAATCTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0346900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAKYGVKTLIYSSTCATYGEPEKMPITEETEQKPINPYGKAKKMAEDIILDFSKNSKMAVMILRYFNVIGSDPEGRLGEA PRPELREHGRISGACFDAARGITSGLKVKGTDYNTPDGTCVRDYIDVTDLVDAHVKALEKAQPGQVGIYNVGTGKGRSVK EFVDACKKATGVNIKVDFNPRRPGDYAEVYCYPAKIRRELNWTAQHTDLQKSIQVAWKWQKSRPGGYGVSSAI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 231 | 231 | 8.4E-149 | – | |
PANTHER | 1 | 231 | 231 | 8.4E-149 | – | |
Gene3D | 1 | 74 | 74 | 3.4E-19 | – | |
SUPERFAMILY | 1 | 225 | 225 | 4.51E-51 | ||
Pfam | 2 | 152 | 151 | 3.5E-23 | ||
Gene3D | 75 | 146 | 72 | 1.1E-12 | – | |
Gene3D | 147 | 231 | 85 | 1.0E-26 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
Molecular function | Coenzyme binding | Interacting selectively and non-covalently with a coenzyme, any of various nonprotein organic cofactors that are required, in addition to an enzyme and a substrate, for an enzymatic reaction to proceed. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0346900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…