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LotjaGi6g1v0365800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0365800
Transcript ID LotjaGi6g1v0365800.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase-like; TAIR: AT1G07150.1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13; Swiss-Prot: sp|Q54R82|MKKA_DICDI Mitogen-activated protein kinase kinase kinase A; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7FU42|A0A1J7FU42_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0365800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:67822155..67865597) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAGCAGTACTCTTTAGATTACCGATCTATATGATTGTTTAGTGTGTTTGTGACAAAACAAGGAGACATTGCTCCAAGATT TAAGGATAGCCAACCGGCAACGAATAACGTCTACAAACTCTCCATTCCCTTTTGTTATGATCTGGTGTTGTTTTATTTGT TTGCTTCTTATTTGTTTAGCCAAACCAAACCAAACCCCATAAACCTGAAAATAGCGGAGAGCGTTTGTTGTATTACCGGA GCTTCTCTCCACCAGAGCGGTTTTCCGATTTTAGGGAAACCGCTCTACCCATTCAGATACTTTCTTATCGAATCCTTGCA GCAACCACATCGGTTGACTTGGATTTGGATTGGATTGGTGTTTTTTCATTTTTATGTTTTATTCATCTGATGAATTGTTT GTTTGTGGATTTGTTTAGTGTCATCAATAAGGGTCCTCGATCAACCTGTTTTCTCTTTTCTCTTGTGGGTATTTCCGGAG GTAGAATTTTTTTCCATGTTTGATGAACAGGGGAATTTGGTATAGTGTATGATATTTTTTCAATATATAAATAAAATTTT CATTTCTTGAGTTGGGAATTTTGCATAGTTCCTAGTTCAAGAGATTGATACATATTTGGTGGGAATAAGAAGAAGCATTA TGAGTGCAATGTGCCAATCTGTACGTGATTGTGAATGGGTGAAGGGTAAAATGGTTGGATCAGGATCTTTTGGCAGTGTA CATTTGGCCATGAACAAATCCACCGGTGGACTTTTTGTTGTGAAATCAGCACGCTCAGGGACAGGACGTGAGGCTCTGAA TAATGAGGCCAAAATCCTAAAAGCTTTGAAACCATCACCTTACATTGTCCAATGTTTGGGAACAAAGGAAGACAGAGGAG GAAACCTCAATGTTTTCATGGAGTACATGGCAGGGGGTAGTTTAGCCGATGTGTCTCACAAATTTGGCGGGTCATTACAT 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GTATGAAATGATCTTACAGCCACGGATCATCTCCAACCATCATCATATCATCTTCATTGTCGGTGTAGACAACCTGCCAT TTTTTTGCTGAACCACAGAGCTCACCCTTGATGTCAAACATCTCTTCCAATTTCCTAAGCAGGTCCTCATATCCATCAAA CTGTGTTAAGTCCACAGCCCTTCCAACAGCCATACCTTGCATGTGAACCTGGAACAATATTAAACTCATCATAAATAATG TCATTTCAATTTGCAGGTACTGCCCTCTGGTGAAATAGAGAATATTATGCTAAGCCACTTTCCTAGTCCAAAAAAACAAG GTTAGCAGCAAAAATTTGATTGGAATTATCCAAACATAAAGAAAGTAAAGGCCTCTTAAACCTACTATACCGGCTAATAG AAGGCTTATTTGGTTTGAGAAAATATTTTATGTTTCCATCTCCTACTTCGATTAATAATTACATAAATATAATTTTATTT TCACTTCGTTCTTCGTCAAAGATTTATTACTAGAAATGTGAAACAAAAAATAAAATTCTCACCGTTTCTTGTAGAAATCC TTAATAATATGAAACAAAGTGAAAATAATGTGGCACTTTGTAACTTGTAAGTGTCATGAACCAACTTCCCCAAAAGCTTA AGCAATTGGGTGAAAAACATGAATGGTTTAATTTTATATTTCCAACACACCCCACTCACACGAGCCCGTTGAGTTTAAAG CGTAGATAGTGCACAGGTCCACACACCATGTGCTACAATCAACTATTTATTAAATAATGGGAGGCAACAAGGATCGAACT CTAAATCACTTGGTCATAAAGAACTTGATACTATGTCATGAACCAACTTCCCAAAAGCTTAAGCTCACACATGAATAGTT CAATATTATATTTCCAATAGTAAATATCAGTGAAAACAAAAAAAATGAATACAGAATAATTTCTCAAATTGGGTGTTGAA TGATTTTATTCCAGATAAGTTGTTTGATAAAGACCCTGGTCTGGAGCATGGAAAAATGCTGGAACTTATATTGTGCATAA CAATGCTGGGATAACAAATATTGGAACTTTGATAGGTACCAGCAATGAACAACAAAGAAAGACTCTATTTGATTGGAAGA ATGCTATGAAACTTACTAGAATTTGGGAGGCCTAACTTAACCCAAAAGCTAGCTCTAGAGTAGAGGGTTGTTCTAACCTT TATAAAGGCTATCTATGTCATCTTTAGCCAATGTGAGACTTCTATCACACTCCCTCACGCCCAGCGCTGGACATCTAGAG CGTGGAATATGCAAGACGGGAACGGGACATCTGCGGGGCGACCCAAATATGGGAACTCTCCACCAACAAATGGATCTAGG ATAGGCTCTGATGCCATATTAGTATTTGGGAGGCCTAACTCAACCCACAAAGCTAGCTGTAGAGTTGAGGGTTGCTCTAC CCTTTATAAAAGCTATCTATGTCATATCTCTAACCCAATGTGGGACTTCTAACAAAAAAAACTACACAAAGTCCCCAGTA TTTGAGAGACCACAACTCTGCCCAAAAAACTCTAATTACAATCTAGATACCCTATCTATCCCCTTTCCCTCCTATTTATA GCCTCTCCTCGCTCGATCTCTCACTCCCTTAAACTGATCGTAACTCTGTTGAACTGATTAACCATTCTACTAACTATCAA CTAGTAAAAATAACAACACCCCCTTAACATATCTTATTCCTATCAAACTTCCTATGGCAATAAGGCGGGGCAGGCAGGAG TGCTTCAACGCTCCCCGTCCCCGATTCTCTCATCCGCCCCCATCCCTATGGCGGGTGAATTTTTCCCTTATCCCCATTTC CCACGGGGATCCAACCCTGTTTCCCACGGGGATCCAACACGTCATTAATTTTTTTAAAAATATATAGAAAATACATAAAT TTATGCAATAAAAAACCATAACTGTCAATGCAACCACATGAAATGCAATACAAATAAATAATAAACTTCAAATAACATTA ATTGAAGTTCATCACAAAATATGTGAAATCTACAAAATAAGAAATTTGAAAAGTAAAGACCAACATTATATCGATCGAAA TCTGAAGTGTAACACTCAAAACACACCCTTAAACATTCAACTCATCCAAAAAAGTGAAGTCTTCATTATAAGCAATCTAA AATTTATCTCAAGCTAAGATTTTTATTGAAATTAGTTTCTAGCTTTTTCATAGTGGGCTGTGTTTAGGGCCTTTATAATT TTGTATTTATTTATTAGCAATTTAATTTTTTTATCAAGGGTATTATTGTATTTTCATTTATATATATGAGGTGGGGACCC TGCGGGGCAAGGAGACTGATCCCTACCCCGTCCCCAAATTTGTCCCAAGGGATTTTTCGTCCCCATCCCCATGGGGAAAT TATCCCAAGATCTGCAGGTGGTAATTGCCATCCTATCCATTTTTATGTTTATCTTGAATTTGGGCTCGCTCTAGCTCAAC TCCAATAGCTAGCTCATAAGTTATAATTCCCGAAACTTCTATAAGCTCTACTTTCAACACACCCCACATACTCATGATTG GACATCTAGAACATGCAATTATAGAACTGCTTTTATATTGCACTAGGTAAGCCATGGGGCCAGGTAGATTCTAGACAGTA GGTGACCGAATACCAGATCTAGGATAGGCTCTATACCATCTTAAATTTGGGCTAGGCCTAACTCAACCTCAAAAGCTAGC TCATGAGATGGGGGATTGCCCAATCCTTTTATAAGCTTGCTTTGGCCGTAGCCCATATCCCTAACCAAATGTTGGATCTC AACAGTTAAATTCACTGATATGCCATTATGGATAAAATGCTGTCAATAATGAAGATAGATTCTAAATACGTCATCAGGAG CTAAAAATCATCTGCAATTCTGTAAAATGAAGATGCATCATATAACTGCAATACAGTGCACTTAAATTAATACACAGGAA AAATATAACAAGAATGCTGCATGACTCTGTAAATGCAAAATAGGAAGGGGGTGCAGAGTGCACCACACCAAAATAAAAAA CAGTTATGCTACCTTGGTGCAGCTTCGTATTTGCCTGCTTGTGACTCCTGGGGAGACCGCAGGCATGATTTTTCAGCGTC ACAACTTACTGAAGGGATATCAGATCGATTAACATTTGATGGTTCAGAATGCTGGTCAGACTCAGCATCCAAAGATGGAA TGGACTGGTCATCACCCAACCTTCCTGACAAAGTGACTGTTGGCAAACTTTCTTCTGCATTAGAATTCTCAAGTAGCTGA AATCCAAAGAGCCTACAGCCATTTCCAGTGCCTTGTCTCTTTTCTCCAGATTCTTTAAGCTATAGGTGAAAAAGTTTCTG TTGAGTTTTCCATCTAGTAGACCAAATGTTGACTTGTTGGAAGCAGAGTTATTCCCACCAAAACAAAAAAAGCTAGTTGC AGTAGAATTGAATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCTCTAAGGAGGGTTTGGATTTCTTGAGCATGTGTTTGGAGA GAAATGCTGATAAGAGGTGTAGCGCTGAGGAGTTACTAAGCCATCCATTTGTTTTCAAAGAATAAACAATATGCTTCCTC ACCAACATGTGTGTTGGAGATTCATAATTTTGAGGATACTTATGAATCAGAAGGACATGAAGCACTAGTTTAGGGTCATC AGGGAATTGGATTACTGTTAGATCGGATGAAATGTAGAACAAGTGTATTAAATATAGACAAAGGACTCAATTGTACAGCG TTGTGTAGAAGACAAATATATAGGTTGTCAGAGTTTTAATGGTTGTAGACTTGTAGAATTGATTAGTGTTGCTAGTCACA AATTTGTAATTGAAGGATACCTTATCTTACGTGACATGAACGATCAAGTCCTGCATGTTGTTTTTGGTTTTTTTGTTTTG TTTTACTTTTTATCATCATTTATCCATTAATCAATGTAGATAGGCTTGGGATTGATGAATAAGGAAAAATCAAATTTTGC ATA 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0365800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTGCAATGTGCCAATCTGTACGTGATTGTGAATGGGTGAAGGGTAAAATGGTTGGATCAGGATCTTTTGGCAGTGT ACATTTGGCCATGAACAAATCCACCGGTGGACTTTTTGTTGTGAAATCAGCACGCTCAGGGACAGGACGTGAGGCTCTGA ATAATGAGGCCAAAATCCTAAAAGCTTTGAAACCATCACCTTACATTGTCCAATGTTTGGGAACAAAGGAAGACAGAGGA GGAAACCTCAATGTTTTCATGGAGTACATGGCAGGGGGTAGTTTAGCCGATGTGTCTCACAAATTTGGCGGGTCATTACA TGAAGAGGTGGTTCGGGTGTATACTAGAGAAATTCTTCAAGGGTTAAAACACCTTCACCAACATGGAATCGTGCATTGTG ATCTCAAGTGCAAGAATGTGCTTTTGGGTTCATCTGGTAATATCAAGCTAGCAGATTTTGGATGCGCTAAAAGGGTCAAG GACTTGAATAATGACCGTGGAGGTTTGGCAAATTCTTTGCTGTGTGTTGGTGGCACTCCGCTATGGATGGCTCCTGAGGT ATTGAGGAATGAGATGCTGGGTTTTGGTGCAGATATATGGTCTTTGGGGTGTACAGTTATTGAAATGGCTACTGGGAGAC CTCCTTGGGGTGTTGTTGAGGGATCTAACCCAATGGCTTCTGTGTTGAGGATTGCTCATGGTGATGTGGTGCCTCACTTT CCATCACATATCTCTAAGGAGGGTTTGGATTTCTTGAGCATGTGTTTGGAGAGAAATGCTGATAAGAGGTGTAGCGCTGA GGAGTTACTAAGCCATCCATTTGTTTCAAGGAATAAACAATATGCTTCCTCACCAACATGTGTGTTGGAGATTCATAATT TTGAGGATACTTATGAATCAGAAGGACATGAAGGCACTAGTTTAGGGTCATCAGGGAATTGGATTACTGTTAGATCGGGA TGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0365800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSAMCQSVRDCEWVKGKMVGSGSFGSVHLAMNKSTGGLFVVKSARSGTGREALNNEAKILKALKPSPYIVQCLGTKEDRG GNLNVFMEYMAGGSLADVSHKFGGSLHEEVVRVYTREILQGLKHLHQHGIVHCDLKCKNVLLGSSGNIKLADFGCAKRVK DLNNDRGGLANSLLCVGGTPLWMAPEVLRNEMLGFGADIWSLGCTVIEMATGRPPWGVVEGSNPMASVLRIAHGDVVPHF PSHISKEGLDFLSMCLERNADKRCSAEELLSHPFVSRNKQYASSPTCVLEIHNFEDTYESEGHEGTSLGSSGNWITVRSG 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 10 308 299 1.2E-76
CDD 12 275 264 3.06071E-137
SUPERFAMILY 13 287 275 5.13E-79
ProSiteProfiles 13 275 263 44.909
SMART 13 275 263 5.8E-84
Pfam 15 275 261 5.5E-61
PANTHER 17 280 264 2.4E-89
PANTHER 17 280 264 2.4E-89
ProSitePatterns 19 42 24 -
ProSitePatterns 130 142 13 -
MobiDBLite 301 320 20 -
MobiDBLite 303 320 18 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0365800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…