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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0084800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0084800.5 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Subtilisin-like serine protease; TAIR: AT5G58830.1 Subtilisin-like serine endopeptidase family protein; Swiss-Prot: sp|Q39547|CUCM1_CUCME Cucumisin; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RKM9|A0A0S3RKM9_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0084800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:12273531..12294730) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCATTTTGATCTATTGATATCCACGTGCTTGGAATACCCGCACGCCAATGGTTGATGCTTTTTCCACTACAAATACTCTT TGGTGGAAGCATAGACTCATAAATCTTATCCTCCTTGGAAACATTTTCTGCTTATCATTTTGATCTATTGTGGCCATTAT GGTCTCTTTAATGCCATGCCTTTTCATTCTCATCTTCATTCTGACAATCACTCACACATATTGTAGCAATGATCGCAAGG TTAATATATACATCTCCAATACTTATTGTTATTTAGACTGTACAAATGTACAAATTTTGTGGCTATCTCTTGTGTAAGTG TAATACACTTGTTTATATTCCTTACTCAGTTTTATCGTTTTTCAATATATAAGCGATAATTTATGCAGCACTATACCTGT AACTTGTAGAGTTTATTTTCATAAATAAACTTTGCAATATATGGACGTCAAAAAACAGCCATTAATTCTAGATGTCCGAG TGTCGGCCAAAAAATAGTGGTAGATGAATTATTTTTATTTTCAATCTTATCAAGAAGGTATATGTTGCGGTTTTTAATTT TCTACTGTGAATCTAGAAAAATTTGGTTCTCGGGTTGTCTAAATGACCCATGAGAAAGTTTGGTGAAATAACACATCATC AAATCACATTGAAGGTAAGTGAGTTGAAATTTTTATATTTTATTTATTAATTTATTTCTAACTCACTTATCTCCAATATT GTAATTGGATGATTGGTTATTTCACTCAAACTTTCTCATGGGTCATTTAGACAACTCATTTGTAAGAACATAGTTCAGAA ATGAACGAGTTTTTAACATACTACACCACCATAGAATTGCACTATAATATGTTGCTCAAAATTTAATTTACTCTCGTGTT TAATAAAAAAATTTACTCTTGAAATTAATCATTGATAATTTCTTAATGCAGACTTACATTGTGTACATGGGTGATCATCC 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AGCTATGCTTGATTTAGATTTAACTGCACTTTTGGTTCTCGTAGTTTAGCCGTTTAGGGATTTTTATCCCCAATCTTCTT TCATAATTTTGGTCCCTTCATTTTAGTGATTTAACAAATTTGGTCTCCCACTTTTTTTTTTTGCAATTGTGTCCCTCTAG TTTAGTGATTTCTCAATTTTTGTTTTTTACACTATTGAAAAAAGGGTACCAAAATTGAGGAGTCATTAAACTTAGAGAAC TGGAATTGTGAAAAGAAAACTAAGATAATTAATCAAATGCACGATCACTAAAATAGAAGGTCTAAAATTGTGAAAATAAT ATAGGGGACCAAAATCACATAATTATAAACTAAGGATAAAAAGTGCAATTAAACCTTTAATCAAACAGGAAAGCTATTTC TTTTCATAATTCAGGTCATGGTGTGTTTTTTTTTAAAGGAATTCAGATCATGGTTTGAGAGTGGAGACTTGAGACTCAAA TATTTTCAAATTAAACATAAAATAATTTGTAGCAACATATGTTGTTTGTAAATGAAACTCAAGTTAGATATCAGAAACTA GAATTTATGTACTAAATTTTATGGATGACACTCTGCCATATCATGCATGTAGGGGTCTACAATTAACACATTTGATCTCA AGAACAAAATGTTTCCTCTGATTTCCGCTGGGGATATACCCAACACTGCTGGTGGATTTAACGGTTCTATATCCAGGTAT CATCAGCAGTTAATGTGTATGATTTTTCTTTGTTGAAAATATTGGATTTCAGTTTTATATTTTAATATTGTTCAGGTATT GCTCAGAGAACTCTGTGGATAAAAATGCAGTGAAAGGGAAGATCGTTGTGTGTGATAACAGTGTGAATCCTGAGAAAGTT GGGGTTTTCAATGGGGCGGCTGGTGTTATATTTGGAGCAATTGGCCCAAAAGATCTGCCATCAATTTTCGCCCTGCCTGC AACATTCCTTAGTCAAGGGAAACTTAGAAATGTACAATTATACATTGAATCAACAAGGTATAACATACACACATAGCTTT TTAATGATATATAATGAGATGTATATATTGTTTTTAATGCAATTTTTGTTTGTAGATAAAAAATATATTAGGGATATATA TGTTTTTGTTCCTCCAAAAATAACGAGTTACTGATTTTAATCCCCTTTTATTTTTTATTGATTTTGGTCCTCTTAAAATA GCGAATTATTGATTTTGGTCCATCCATTCATTTTGTTTTGTGCATTAGTGATGGTTTTCAAAACCGCCACAAAATGTGTT ATTGGTTGTTTAAACCGCCTCAACGCAAACTAGATGAAGTGACCAAAATCAATAATTCGCCATTTTAGAGAAACCAAAAT CAATGAAAAATTATACGGGTACCAAATTCAATAATTTTCTATTTTATGGGGACTAAAAACATATTTAACCCTATAATAAT AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGTCCAACCAATTACCAGAAATGCA ACCGCCACAATATTGAAGAGTGATGAAGTCAAAAACACATTATCTCCTTATGTGGCTGGGTTCTCATCAAGAGGTCCAAA TCCAATCACTCCAAACATTCTCAAGGTAACTTCAAAGATATATTGAATTTGTCTTCTTTAAAATGTCAAATGCTCATTGC AATTAATTATTTCTTGATGTGGCATATATATATGCAGCCTGATATTGCAGCACCAGGGGTTAGTGTGTTAGCTGCATGGT CTCCACTTAACTCCATTTCAGAATTTGAAGGTGACAAAAGAAAATTGTCTTACAATGCAATCTGTGGCACTTCAATGGCT TGCCCTCATGCTGCGGCCGCAGCTGCGTATGTCAAATCATTTCACCCCAATTGGTCTCCTGCCATGATTAAGTCTGCATT AATGACTACAGGTATATAATTAACGACTCAGTCTACTGCTTCCGTTGCTGTAGGAAATTTATCATATTATGTTTTCATAG TTAGAATACTTGATTTTGTATTATAATTATGAGTTTATTACCCTCTCTGTTGCAATCAACAGCTACTCCAATGAGTTCTG CTCTTAATCCTGAAGCTGAATTCGCGTATGGCGCGGGGCAAATTAATCCTGTTAAGGCAGTAAATCCTGGTTTAGTATAT GATATTACTGAAGCAGATTATATCCAGTTCCTATGTGGGGACGGGTATACAGATAAAATGCTCCAACCACTTACACATGA AAATGTTAGTTGCCATGGAAAAGCTCAAAAGAGAGCTGCATATAACTTGAACCTCCCATCATTTGCCATTTATCATGGTA ATGTTGGAGTTTTCCCTCGTGTTTTCCGCAGAACAGTTACAAATGTTGGATCAGCAAAATCTACTTATAAAGCCACTGTA ATAACTCCATCCTTGTTGGATATTCAAGTGAAACCTGATGTTCTGTCCTTCACATCGATAGGCCAGGAAAAATCATTCTC AGTTGTAATTGAAGGGGCTCTCACTGTGAAATTAATATCTGCTACTTTGATTTGGGATGATGGGAATTTTCAAGTTAGAA GCCCAATTGTAGTGTATGGAGACCTACCAGAACCACCAGATATGTGAAACTAGAAAAAAAAAGTAAAATAAGGGAAGCAT ACTGCAGTTGGTTGCATAATCATTTTATAGCTTCGAGTTTATGAAGTTTGTAATAGCATCTTTGGTTATGCGATTGAAAA GCGCACAATCACTTCGGGGAAAAAGCTACAAATGTAGTTTATGTAATTACCGTGTTTTGGATTGTATGTCATCACTAATC CTATCATGTTGTGTATGTAAGCTCGAGTGGTCTTCCATAAAATAAAATAGTTTGTGAAAGAAATTCTCACTGCTCTGTTG GTATTTATGTAATGTGTTAGTGACTAGTGGGATGTTTATATCAGTGTTATCAAAGTGAGCCCCAGAAACTGGCGAGTAAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0084800.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCTCTTTAATGCCATGCCTTTTCATTCTCATCTTCATTCTGACAATCACTCACACATATTGTAGCAATGATCGCAA GACTTACATTGTGTACATGGGTGATCATCCTAAGGGCATGGACCCTGCATCTTCACCTTCTCTTCACATGGCCATGGCTC AAAAAGTTCTTGGCAGTTCTGAACCAGGAGCTATACTTCACAGCTACAAGAGCTTTAATGGATTCGTCATGAAGTTAACA GAAGAGGAGAAAGAAAGAATGGCAGAAATGGACGAGGTTGTCTCCGTTATACCGGACAGCAAATATATTCTTCACACAAC AAAATCGTGGGATTTCATAGGATTTCCTCAACAAGTAACAAGAGCAAGTATGGAGAGTGACATAATAGTTGGAGTAGTTG ACACTGGAATTTGGCCGGAATCAAAGAGCTTCAGTGACGAAGGATTTGGCCCTCCACCCAAAAAATGGAAGGGATCTTGC CATAACTTCACCTGCAACAACAAACTAATTGGAGCAAAATACTTCAACATCGATGGATCATATCGGAAAAAAGATATCAA ATCTCCTAGAGATCCAAATGGCCACGGGACACATACCTCCTCCACCGTGGCCGGAAACTTAGTCACTGCAAGCTTGCTTG GCTACGCCTCTGGGACGGCCCGCGGAGGAGTTCCGTCGGCTCGTGTCGCGATGTACAAAGCATGTTGGGTAAGCGGTTGC CGCCAGGCAGACACCCTTGCTGCTTTGGATGCAGCAATTGATGATGGTGTTGATGTGCTCTCTCTTTCAATTGGATTGGG TGGACTAGAGTACCCTGCCTATTTTCAAACTGGAACTAACATTGGAAGCTTCCATGCAATGAAAAGAGGCATATTTGTTG CAAATTCTGCTGGTAATTCTGGCCCTTATTTTTACACTATGACAAATTATCCACCATGGATGCTTTCTGTAGCTGCTAGT ACTTTTGACAGAAAGTTTGTTACCAAGGTGCGGTTGGGCAATGGTGTTGTTTATGAGGGGTCTACAATTAACACATTTGA TCTCAAGAACAAAATGTTTCCTCTGATTTCCGCTGGGGATATACCCAACACTGCTGGTGGATTTAACGGTTCTATATCCA GGTATTGCTCAGAGAACTCTGTGGATAAAAATGCAGTGAAAGGGAAGATCGTTGTGTGTGATAACAGTGTGAATCCTGAG AAAGTTGGGGTTTTCAATGGGGCGGCTGGTGTTATATTTGGAGCAATTGGCCCAAAAGATCTGCCATCAATTTTCGCCCT GCCTGCAACATTCCTTAGTCAAGGGAAACTTAGAAATGTACAATTATACATTGAATCAACAAGAAATGCAACCGCCACAA TATTGAAGAGTGATGAAGTCAAAAACACATTATCTCCTTATGTGGCTGGGTTCTCATCAAGAGGTCCAAATCCAATCACT CCAAACATTCTCAAGCCTGATATTGCAGCACCAGGGGTTAGTGTGTTAGCTGCATGGTCTCCACTTAACTCCATTTCAGA ATTTGAAGGTGACAAAAGAAAATTGTCTTACAATGCAATCTGTGGCACTTCAATGGCTTGCCCTCATGCTGCGGCCGCAG CTGCGTATGTCAAATCATTTCACCCCAATTGGTCTCCTGCCATGATTAAGTCTGCATTAATGACTACAGCTACTCCAATG AGTTCTGCTCTTAATCCTGAAGCTGAATTCGCGTATGGCGCGGGGCAAATTAATCCTGTTAAGGCAGTAAATCCTGGTTT AGTATATGATATTACTGAAGCAGATTATATCCAGTTCCTATGTGGGGACGGGTATACAGATAAAATGCTCCAACCACTTA CACATGAAAATGTTAGTTGCCATGGAAAAGCTCAAAAGAGAGCTGCATATAACTTGAACCTCCCATCATTTGCCATTTAT CATGGTAATGTTGGAGTTTTCCCTCGTGTTTTCCGCAGAACAGTTACAAATGTTGGATCAGCAAAATCTACTTATAAAGC CACTGTAATAACTCCATCCTTGTTGGATATTCAAGTGAAACCTGATGTTCTGTCCTTCACATCGATAGGCCAGGAAAAAT CATTCTCAGTTGTAATTGAAGGGGCTCTCACTGTGAAATTAATATCTGCTACTTTGATTTGGGATGATGGGAATTTTCAA GTTAGAAGCCCAATTGTAGTGTATGGAGACCTACCAGAACCACCAGATATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0084800.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVSLMPCLFILIFILTITHTYCSNDRKTYIVYMGDHPKGMDPASSPSLHMAMAQKVLGSSEPGAILHSYKSFNGFVMKLT EEEKERMAEMDEVVSVIPDSKYILHTTKSWDFIGFPQQVTRASMESDIIVGVVDTGIWPESKSFSDEGFGPPPKKWKGSC HNFTCNNKLIGAKYFNIDGSYRKKDIKSPRDPNGHGTHTSSTVAGNLVTASLLGYASGTARGGVPSARVAMYKACWVSGC RQADTLAALDAAIDDGVDVLSLSIGLGGLEYPAYFQTGTNIGSFHAMKRGIFVANSAGNSGPYFYTMTNYPPWMLSVAAS TFDRKFVTKVRLGNGVVYEGSTINTFDLKNKMFPLISAGDIPNTAGGFNGSISRYCSENSVDKNAVKGKIVVCDNSVNPE KVGVFNGAAGVIFGAIGPKDLPSIFALPATFLSQGKLRNVQLYIESTRNATATILKSDEVKNTLSPYVAGFSSRGPNPIT PNILKPDIAAPGVSVLAAWSPLNSISEFEGDKRKLSYNAICGTSMACPHAAAAAAYVKSFHPNWSPAMIKSALMTTATPM SSALNPEAEFAYGAGQINPVKAVNPGLVYDITEADYIQFLCGDGYTDKMLQPLTHENVSCHGKAQKRAAYNLNLPSFAIY HGNVGVFPRVFRRTVTNVGSAKSTYKATVITPSLLDIQVKPDVLSFTSIGQEKSFSVVIEGALTVKLISATLIWDDGNFQ VRSPIVVYGDLPEPPDM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 6 | 6 | - | – | |
| Phobius | 7 | 17 | 11 | - | – | |
| Gene3D | 15 | 105 | 91 | 1.7E-21 | ||
| Phobius | 18 | 22 | 5 | - | – | |
| PANTHER | 19 | 728 | 710 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 19 | 728 | 710 | 0.0 | – | |
| Phobius | 23 | 737 | 715 | - | – | |
| Pfam | 28 | 105 | 78 | 1.2E-14 | ||
| CDD | 102 | 558 | 457 | 3.30602E-111 | ||
| SUPERFAMILY | 104 | 587 | 484 | 1.44E-77 | ||
| ProSiteProfiles | 109 | 583 | 475 | 25.394 | – | |
| PRINTS | 125 | 144 | 20 | 1.7E-11 | ||
| Pfam | 126 | 575 | 450 | 4.7E-42 | ||
| Gene3D | 127 | 597 | 471 | 9.2E-181 | ||
| PRINTS | 191 | 204 | 14 | 1.7E-11 | ||
| Gene3D | 323 | 461 | 139 | 9.2E-181 | – | |
| CDD | 330 | 454 | 125 | 1.46887E-14 | – | |
| PRINTS | 521 | 537 | 17 | 1.7E-11 | ||
| ProSitePatterns | 522 | 532 | 11 | - | ||
| Gene3D | 600 | 729 | 130 | 3.9E-35 | – | |
| Pfam | 631 | 727 | 97 | 7.6E-24 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0084800.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…