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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0417200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0417200.6 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glycine-rich protein; TAIR: AT5G47020.1 MraZ; Swiss-Prot: sp|Q5H8C4|VP13A_MOUSE Vacuolar protein sorting-associated protein 13A; TrEMBL-Plants: tr|V7CH42|V7CH42_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0417200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:91504959..91516239) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTACAGAAATCTCTATTGAAGCTTTCATAGGGATGGATTATGCTAGTAACTTCTCTTTTGTGCTTTATTTGTTGGATG AGTGTAGGAAGGGATATGGTACTATCAGTGCTGCTGGTGGGATGGGATGGGGTGGAGGCGGTGGAGGAAGACTATCACTT GATTGTTACAGCATCCAAGAAGATCTAAAAATTACTGTCCATGGTTTGCTCCAATTCACTTTCTGTACATGGTTAAACCA ATGATGACTCCAGCTTGATATTTAATTATACTGCAAGAATCTTAAGTTTAATCTACGCGAATCAAAGTACCTGTTGAGAT ATTAGATATGTTTTGTTATGATAAGATAAAATTAGATTTGAGATAAGTTATGTTATGCACATAAGATCTGAATATTTTGG TGGTGCTACACTATGCATATGATAGTTTTATTTCTTTTGATAAGAAGATTTTGGTTGACATTGTCATAGTTGTATCATTT TTTTTCTTTCTTTCTAAATAACATAATATGCAAGTGTCATTGTTCTTATGAGGATAGTAAGAAGTAACTTCTACATGCAT TTGTTGTGACACAGGAGGTTTGAGTATTGGCTGCCCTGGGAATTCTGGAGCAGCTGGCACATTTTTCAATGCAAATTTAC TAAGTTTGAAAGTTAGCAATGACAATGTCACAACAGAAACTGAGACTCCTTTGCTTGACTTCTCAACCAGCCCTTTATGG TCCAACGTTTATGTGGAAAATAATGCGAAAGTTTTGGTTCCACTTGTCTGGTCCAGAGTTCAGGTAAGAAAGTTATACAC GCTATGTACTACCACAGACATACACACAAGCACATATTGCCATTTTATCCATTATCTATTTTTGAAAGTTTGCTTCTTTT GGTGTTGCAAATTTTAATTAGCAAAGCATGCTTACACTGGTTTGTTGCCGTAAAAATTCTTGTATCAGTCTCACTTTCAT 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AGTCTTTCTATTCTTTTGTCTGGATTGAAAAATTATTATTGAAAGTAAGAGACTAACTCCCTTAGGTTAAGGATAAGTTA TTTTTCAAGCGCTGAGAAAAGGTAAAACAAAACAAAACAGCATAAATAAGGAGAGTTGGAATGCAGTGAGGCAGCCCAAT CCCTCTGCAAATCTAATAATACTTGCAAATGCATTGAATGTACTTTCCGAAATTTTATTGAACCATGCAAGTTAATTTTC AGGAATGTCCTCTGGGTACTTACAAAGATGTTGATGGTTCTGATCCACATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGATCTTCTT CCGAACCGTGCAAATTTAATATATCAACGAGGTATGTTTGATGGTGTAGCTTGGCTTTACATGCCCAACTTTATATCCTC TCTCAATTTTAGGATGCTCCTTTACACTGCAGGGGGGGTTACAAAGCGTTCTTGTCCATATAAATGTATATCAGACAAGT ATCGGATGCCCAACTGTTATACACCTCTAGAGGAGCTTATTTATACATTTGGTGGTCCCTGGCCATTTTCAGTAATGTTG TCATTAGTTTTATTGCTTATGGCTCTACTACTAAGTACTTTGAGAGTCAAGTTGATTGGTTCTGGTTCATATCATAGTTC AAGTTCTACTGAGCACCATAATAATCACCGTTTTCCATATCTTCTATCTCTGTCTGAGGTACTATTCTGATAACAAATTT CCGCTTTTTAATTAGTTATTTCTGCGGGATTAATTGAACCTGAACTCCTTTGAAACTATTTAACTCTAAAATATTTTTGC TGTTTGAAAACTAGGTGCGTGGAGCCAGAGCTGAAGAGACTCAAAGTCATGTACACAGAATGTACTTTATGGGTCCTAAT ACTTTTAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCCCACGCTATAATTGAAATTGTGTAAGAGAAACTACATATTCA TTTGTGCATGTCTTGGATCGTGATGTCATATATGTGGACTATGTGCTGATAAATTTTGAAAACATTTATTTTAGTTGAAA TTACCAATCTTCAGTGTTCTGAAGATCATGTCTTCCCTCTAAGTCAAACTTATCCTACAAAACTCCTGATATTTACCATC TAAACACTTATTTTCTCTTAACAGTTTCTACTGCAAAAAATGTCTTTGTTTAAAAGACATTCAGTAATGATTCTACATCA AGCATCTTAGTATAAAGGAAGAGATAGCTCAGCTTGGGAATATTAATGATATATAAGCATTCAAATCTCATTTAATATTA CCATATGTCATGATCTTTCGATATAGAATCTGTTAGAGGTGTAATTAATTTAGATGTCGTTTCACTTCATCTAACATCTT ATGCTTTTGGGACCATGACATGAACCAACCATCCTAAAAGCGCAAGCTATTAGGCGTGGATAAGTTAATGATTTTATATT TCAGCTTAACAATAAGTCTAGTTTCGATTAAGATTTGATCCTTACTGGGATGCAGGTATGAAGATGCTTTTAATAGATTT ATTGATGAGATCAACTCAGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAGGGATCAGTGCACAGTATACTTTCAGTCGTGGCATATCC TTGTGCTTGGTCCTGGAAACATTGGCGTCGAAGAGTTAAAATTAGTCGCCTTCAGGAATATGTCAAGTCTGAATATGACC ATTCTTGTTTACGCTCCTGCCGTTCCCGAGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTTGATTTGAAAAGCATTTAACATCATAA GTAACTGCTATAATTTCCTCAATTGGAAACACTTGGATTCACCAAGTTTTGTTGGTTATTTCTGTCATTGGATTTGGAGT TCCTAAAGGAAGTCACTACTTTTATATTCAGCTAGCAACTGGCAATATGGCTTTATATAATACAGATGTTGCCATGTTTA TTAGACTGCATTCCTTTATTTGCATTCCTTTTTTTTTTGTATAAAAAAAACACTGTTATTATAAGCATCAGTTTTATTTT TATTATGCATATGTATGCATACTGTGATTATAAACATCAGCATTATTTTTGTTCATACATATGTAAGTATAACATATTTT ATTTATATTCTTCCTGACTAGCTTGTATTGGAATGTAAAAAGGTTCCCATTGTGTTAAATGATGCAAACTTTCATATAAG AGGTGTCTTTGATTTAAGAAACAAATGATGCAGGTTGGGGCGACTCCGGATTTAATGGTCTCATACATTGATTTTTTCCT TGGTGGTGATGAGAAGCGATTAGACATTGTATCAATTATACAGGAGAGATTTCCCATGTGCATACTTTTTGGTGGGGATG GGAGTTACATGGCACCTTACAATCTTCACAGTGATGCACTGTTGACCAACCTCCTTGCCCAGGTGTCTCTTGATTATCAA CATTGCAAGATCTAGTCTGTTATTTTTTCTATATACATAACTGATACAAACCTAAACTTGATATCCACAGCATGTCCCAG CAACTGTTTGGAATCGTTTGGTAGCTGGCCTGAATGCTCAGTTACGGACAGTGAGGCATGGATCAATTCGTGTCACACTA GGTCCTGTTGTTGATTGGATAAATAGCCATGCAAATCCCCAACTTGAGTTCCATGGAGTTAAAATTGAGCTTGGATGGTT CCAAGCAACAGCCTCTGGTTACTATCAGCTGGGTATCGTGGTAGCAGTTGGGGATTATTCCCTTCATGATTTGCACCAGT CTGATACTTGGGTCGGTACTGATGAAGCTATGGGGTAATTAATGATCCTGAGTTAATGCTTTATACAAAAGACTGTAGCC ACAGTTTATTCCAATAATAATGGAGGGAGTGAGATCAACCATGTTTGTCCTACGAGAATTACTAGTAACAGTAGAAACCA TATATGAACCCACAAAAGAGAAACCATAAATGGATAGAAACAAAGATAAGGAACAAATTGTTGAATAGCTAAGAAATTTC CCCTGACCCATCTCTTTTGACATTTTTCTTGAACTGCTTGGTCAAGTGAGGTTGAGCCGCCTCCACGAAGGTTGTTCACT ATTATCTTCGTCCTCCCATTCGATGCCCTGCTTCTACATCCACATACTCAAGAGCTGTTCGATGCTGTCTATTGCACCGA CATTCTTTTTGATCTTTGAGATCTCAGAACAATGTTCCCTGGCCACCTTTTTGTGATATTCAATTGACATTTCCAAGGAT CCAGTTCTTGACTTCATGATCACAAAGAGGATTTGACAGATTTAATAGGTACTGAAAAAAGAAAAACGGATAGAAAGAAA GAACTCTCCTCCAAGGGTTTATTTTTTACCAAAAGTTTCCTTTTTTATCCAACTTTCTAAATTCTCTGAATGACTCCCTC CATCTTGGTTCCCATTATTTATCTTACAAATCCCCTCTAACTGTCCTTAACTAATTTCCCCTTATCTTTCTATCCTAACA ACTTGGAATAGCAAAATGAATGTATGATGTTTCGAAGCTTGTAGATTCTCTCATCAGGAAGCATGTCAGGGATGCAGAAG TCTTTTGTAACTAGTTGCTATTAGCTTTTAAGTTGCATGGCTTCTTGACAGTGTTCATTTTTATGTTTGTTTTATAAGTC CCTTATTTGTATCAGCTTGACAGGGTTTTTGTTTAATACTCATGACAGGAAAAATGTGGCATGTGGTAGAAAGAATCTTA AGCAGCTGCAGCATAGTCGGCCATACATGAGCAATCCATTATCTCTTAAAAAGATAACTGGAGGAATTAATGGTGGCCTG ATAAATGATGCTACCTTAAAATCACTAGACTTTAAAAGGGATCTTCTATTCCCACTTTCTCTGCTGTTGTGCAACACTAG ACCTGTTGGTCGTCAGGTAGTTAACTTATTTTCAGTGCTTCAACTCTCCACAGCAATAAACTGAACATTATCTAATACAT GACATATTTGTTTCAGGATACTGTGCAACTGCTGATCACTCTGATGCTTTTAGCAGATCTTTCTGTTACTCTCCTCATGT TACTTCAGTTCTACTGGATTTCTCTTGCAGCTTTTCTTTCTGTTTTACTAATCCTCCCTCTTTCTCTACTATCTCCATTT CCTGCCGGTTTGAACGCATTATTCAGTAAAGAACCTAGAAGAGCTTCACTTTCTCGAGTATATGCACTGTGGAGCGCTAC TTCTCTATCTAATATTGTAAGTTCTGTGCAATCCCATTAGGTATAGTTGCCACATTTGTGAATCATATGAGAAGCAGGAA GCATGCTTCTCTTGCAATTACAATATTATGCCGAGCTCATTGAACTTTAATAAAAAGTCGGGTCCTGCTAACCAGTGGCC ATAGGTCACTTGTTCAGAAATCCAAAAATAGAAACTTTTTTTAATTACAGTATATAATGCATGGGAAATGTTTTTTTGGT CCTTTGGCCACCAGTCTCCACGGGGAAAAGGGGCCCCACGTGACTAATCTGGCTCGGGATACGGTAGTGATGTCCCTGGC CACAAAGGTATTATTTTTTTACCTCAGAGGGGATCGAACCCGGGCCAGAAGCCTAGGTGAAATCCCTTAATGCATGGGAA ATGTTGAATTCAACATTTACCAAGAAAAATTTTCTTCCTCAACAGCTTCCCTAAAAAGTTTTATAATTGTAATAATCATT CTAATGCATTGATAATATTAAGGGCACCGGTTGATATTACCCTAAAAAGTTTATGATAATCATTTCATCATGAGTTGCAT GCAGAATTTTTCCCCATCATGCTTATGATACTTAACATTAATGTGATCATTCAAAATGAGGTGTAAGCAGTCTAGAATAG TTTTAAAGTGCCTAAATTACTTAGTAATCGTCACTGGATACACTCTGACTAGGTTTGTTGTGGGCAATCTTCTGTGTAAA CGTAGATTAGATACATAATGGGAATTGCTGGAATTTATCGAGTTACAAATGACGCTTGTATCAATTCTTTTAATGACTCC CCCTCACAGTTTCTCACACTGCAGAGGTGGCAAGGCCCTATATCCCTTACCATTGTTGGTTCAGGGGATGGCACTTACGG AGTTCTGGGCATATTGAATCCTTAACTTTATATATTCATGCAATCATTTGAAATATATTTCCTGCTTTTACGTAACACTT ATGTGCGCCTATGTGTTCAGGGTGTGGCTTTTATCTGTTGCCTAGTTCACTATGCAGTATCCCACCTTCACCCTGACGAG GCAAGTACACGTAGTGTCAAGAGGTAATGCTTGAATTTATCTCAAACAAGACCATATAACAAGGAAACCTACATTTCTTG TTTAAATTTTCCTGTGACAGTACAGTAAGAAATCAACTTGGCATTATTTATTTTCAACTTTTTGATACAATTCTCTTGCA GGGAAGATGATAAATGCTGGCTTTTGCCTGTCATCCTTTTTCTATTCAAGTCTGTACAAGTCCGTTTAGTCAATTGGCAC ATAGCGAATCTAGAAATCCAAGATTTTTCTCTATTCTGTCCGGATCCAGATGCTTTTTGGGCTCATGAATCTGGTTTATG A
CDS sequence (LotjaGi2g1v0417200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTATGCTAGTAACTTCTCTTTTGTGCTTTATTTGTTGGATGAGTGTAGGAAGGGATATGGTACTATCAGTGCTGC TGGTGGGATGGGATGGGGTGGAGGCGGTGGAGGAAGACTATCACTTGATTGTTACAGCATCCAAGAAGATCTAAAAATTA CTGTCCATGGAGGTTTGAGTATTGGCTGCCCTGGGAATTCTGGAGCAGCTGGCACATTTTTCAATGCAAATTTACTAAGT TTGAAAGTTAGCAATGACAATGTCACAACAGAAACTGAGACTCCTTTGCTTGACTTCTCAACCAGCCCTTTATGGTCCAA CGTTTATGTGGAAAATAATGCGAAAGTTTTGGTTCCACTTGTCTGGTCCAGAGTTCAGGTAAGAGGCCAGATCAGTGTAT ATAGTGGCGGAAGCTTAATCTTTGGACTGTCAGATTATCCAATTTCTGAATTTGAGCTTGTTGCAGAAGAGCTTTTATTG AGTGATTCTATTGTAAAGGTTTTCGGTGCATTTAGAGTTTCTGTTAAAATGCTACTCATGTGGAACTCCACGATTCAAAT TGATGGTGGTAAAAGTACTGTTGTGGCTGCTTCAGTACTTGAAGTGAGAAATCTTGCTGTTCTAAGGCAAACCTCTGTCA TTAGTTCAAACACGAACTTGGGCTTATATGGTCAAGGACTGCTACAATTGACTGGTGATGGTGATGCAATCAAAGGCCAG CGACTATCCTTGTCTCTCTTCTATAATGTAACTGTTGGATCAGGTTCTTTACTTGAAGCTCCTTTGGATGATGATGCTAG TAGAGGCACGGTGACAACACATCTTTGTGATACACAGAGATGCCCGATAGATTTAATAACTCCACCTGATGATTGTCATG TCAATTATACACTCTCCTTCTCACTTCAAATTTGTCGAGTTGAGGATCTTCTTGTAAATGGTAAAATGAAGGGAAGCATA ATTCACATTCACAGGGCAAGAACTGTGATTGTTGATACTGAGGGTATGATTACTGCATCCGAATTAGGTTGCACTGAAGG TATTGGCAAGGGAAACTTTTTGAATGGAGCTGGCGGTGGTGCTGGACATGGAGGAAGAGGAGGATCTGGATATTTCAATG GGAGAATGAGTATTGGCGGTGATGAATATGGAAATGCTATTCTTCCATGTGAATTGGGTAGTGGAACTAAGGGCCCTAAT GAGTCATATGGGCATGTTGTTGGAGGCGGGATGATTGTGATGGGATCCATTCAGTGGCCACTTTCGAGGCTTGACCTTTA CGGGTCCTTGAGGGCAGATGGTGAAAGCTTTAGCAAAGCAATAACAAGCAGTGATGGATCTTTGGTTGGTGGTCTTGGTG GAGGTTCTGGTGGAACAGTCCTGCTTTTCCTTCAAGAACTCAGGATTTTGGAGAATTCCTCCTTATCAGTTGTTGGTGGC AATGGTGGCTCCCTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTCGAGTTCATTTCCATTGGTCAAAGATTGGTATTGGGGAGGA GTACGTGCCTGTTGCAAGTATCAGTGGCACCATGAACTATAGTGGAGGAGCTGGGGACCATGATGGCCTTCATGGACAGG AGGGTACCATAACTGGGAAAGCATGCCCTAAAGGCCTTTATGGAATTTTCTGCGAGGAATGTCCTCTGGGTACTTACAAA GATGTTGATGGTTCTGATCCACATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGATCTTCTTCCGAACCGTGCAAATTTAATATATCA ACGAGGGGGGGTTACAAAGCGTTCTTGTCCATATAAATGTATATCAGACAAGTATCGGATGCCCAACTGTTATACACCTC TAGAGGAGCTTATTTATACATTTGGTGGTCCCTGGCCATTTTCAGTAATGTTGTCATTAGTTTTATTGCTTATGGCTCTA CTACTAAGTACTTTGAGAGTCAAGTTGATTGGTTCTGGTTCATATCATAGTTCAAGTTCTACTGAGCACCATAATAATCA CCGTTTTCCATATCTTCTATCTCTGTCTGAGGTGCGTGGAGCCAGAGCTGAAGAGACTCAAAGTCATGTACACAGAATGT ACTTTATGGGTCCTAATACTTTTAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCCCACGCTATAATTGAAATTGTGTAT GAAGATGCTTTTAATAGATTTATTGATGAGATCAACTCAGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAGGGATCAGTGCACAGTAT ACTTTCAGTCGTGGCATATCCTTGTGCTTGGTCCTGGAAACATTGGCGTCGAAGAGTTAAAATTAGTCGCCTTCAGGAAT ATGTCAAGTCTGAATATGACCATTCTTGTTTACGCTCCTGCCGTTCCCGAGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTGGGGCG ACTCCGGATTTAATGGTCTCATACATTGATTTTTTCCTTGGTGGTGATGAGAAGCGATTAGACATTGTATCAATTATACA GGAGAGATTTCCCATGTGCATACTTTTTGGTGGGGATGGGAGTTACATGGCACCTTACAATCTTCACAGTGATGCACTGT TGACCAACCTCCTTGCCCAGCATGTCCCAGCAACTGTTTGGAATCGTTTGGTAGCTGGCCTGAATGCTCAGTTACGGACA GTGAGGCATGGATCAATTCGTGTCACACTAGGTCCTGTTGTTGATTGGATAAATAGCCATGCAAATCCCCAACTTGAGTT CCATGGAGTTAAAATTGAGCTTGGATGGTTCCAAGCAACAGCCTCTGGTTACTATCAGCTGGGTATCGTGGTAGCAGTTG GGGATTATTCCCTTCATGATTTGCACCAGTCTGATACTTGGGTCGGTACTGATGAAGCTATGGGGAAAAATGTGGCATGT GGTAGAAAGAATCTTAAGCAGCTGCAGCATAGTCGGCCATACATGAGCAATCCATTATCTCTTAAAAAGATAACTGGAGG AATTAATGGTGGCCTGATAAATGATGCTACCTTAAAATCACTAGACTTTAAAAGGGATCTTCTATTCCCACTTTCTCTGC TGTTGTGCAACACTAGACCTGTTGGTCGTCAGGATACTGTGCAACTGCTGATCACTCTGATGCTTTTAGCAGATCTTTCT GTTACTCTCCTCATGTTACTTCAGTTCTACTGGATTTCTCTTGCAGCTTTTCTTTCTGTTTTACTAATCCTCCCTCTTTC TCTACTATCTCCATTTCCTGCCGGTTTGAACGCATTATTCAGTAAAGAACCTAGAAGAGCTTCACTTTCTCGAGTATATG CACTGTGGAGCGCTACTTCTCTATCTAATATTGGTGTGGCTTTTATCTGTTGCCTAGTTCACTATGCAGTATCCCACCTT CACCCTGACGAGGCAAGTACACGTAGTGTCAAGAGGGAAGATGATAAATGCTGGCTTTTGCCTGTCATCCTTTTTCTATT CAAGTCTGTACAAGTCCGTTTAGTCAATTGGCACATAGCGAATCTAGAAATCCAAGATTTTTCTCTATTCTGTCCGGATC CAGATGCTTTTTGGGCTCATGAATCTGGTTTATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0417200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDYASNFSFVLYLLDECRKGYGTISAAGGMGWGGGGGGRLSLDCYSIQEDLKITVHGGLSIGCPGNSGAAGTFFNANLLS LKVSNDNVTTETETPLLDFSTSPLWSNVYVENNAKVLVPLVWSRVQVRGQISVYSGGSLIFGLSDYPISEFELVAEELLL SDSIVKVFGAFRVSVKMLLMWNSTIQIDGGKSTVVAASVLEVRNLAVLRQTSVISSNTNLGLYGQGLLQLTGDGDAIKGQ RLSLSLFYNVTVGSGSLLEAPLDDDASRGTVTTHLCDTQRCPIDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGKMKGSI IHIHRARTVIVDTEGMITASELGCTEGIGKGNFLNGAGGGAGHGGRGGSGYFNGRMSIGGDEYGNAILPCELGSGTKGPN ESYGHVVGGGMIVMGSIQWPLSRLDLYGSLRADGESFSKAITSSDGSLVGGLGGGSGGTVLLFLQELRILENSSLSVVGG NGGSLGGGGGGGGRVHFHWSKIGIGEEYVPVASISGTMNYSGGAGDHDGLHGQEGTITGKACPKGLYGIFCEECPLGTYK DVDGSDPHLCIPCPLDLLPNRANLIYQRGGVTKRSCPYKCISDKYRMPNCYTPLEELIYTFGGPWPFSVMLSLVLLLMAL LLSTLRVKLIGSGSYHSSSSTEHHNNHRFPYLLSLSEVRGARAEETQSHVHRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPHAIIEIVY EDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVVAYPCAWSWKHWRRRVKISRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGA TPDLMVSYIDFFLGGDEKRLDIVSIIQERFPMCILFGGDGSYMAPYNLHSDALLTNLLAQHVPATVWNRLVAGLNAQLRT VRHGSIRVTLGPVVDWINSHANPQLEFHGVKIELGWFQATASGYYQLGIVVAVGDYSLHDLHQSDTWVGTDEAMGKNVAC GRKNLKQLQHSRPYMSNPLSLKKITGGINGGLINDATLKSLDFKRDLLFPLSLLLCNTRPVGRQDTVQLLITLMLLADLS VTLLMLLQFYWISLAAFLSVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSKEPRRASLSRVYALWSATSLSNIGVAFICCLVHYAVSHL HPDEASTRSVKREDDKCWLLPVILFLFKSVQVRLVNWHIANLEIQDFSLFCPDPDAFWAHESGL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 624 | 624 | - | – | |
| PANTHER | 19 | 1179 | 1161 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 19 | 1179 | 1161 | 0.0 | – | |
| SMART | 548 | 596 | 49 | 0.0012 | ||
| Phobius | 625 | 645 | 21 | - | – | |
| Phobius | 646 | 1028 | 383 | - | – | |
| TMHMM | 1029 | 1051 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1029 | 1051 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1052 | 1056 | 5 | - | – | |
| Phobius | 1057 | 1080 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 1058 | 1080 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1081 | 1091 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1092 | 1118 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 1095 | 1117 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1119 | 1137 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 1138 | 1160 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1138 | 1155 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1156 | 1184 | 29 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0417200.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…