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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0445100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0445100.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Light-mediated development protein DET1; TAIR: AT4G10180.1 light-mediated development protein 1 / deetiolated1 (DET1); Swiss-Prot: sp|Q9ZNU6|DET1_SOLLC Light-mediated development protein DET1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HE53|A0A1J7HE53_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0445100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:94032434..94046064) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTACTTCGTTAATTCCTATGCGTTGAAAATTCGTCACACACCATGCTCGCTCGCATTTGAGCTTCGCTTCGGTTATTAT TACTTCTCAATCGATTTCCAATTTTCCATGATCGTTGTGTTGCTAATTTTGCTGTTAGAGACTCGTATTCAGGCTCTGCT GTGTGCCGCGTGTTTTACCAATTAGCATTGTGATATGTTATGCTCTTTGCTTCACAAGTTATTCATGTATATATGTATTT TTGATGTAGAATGACAGATTCAATGTGCCGCGGTTGGCTCGAAGCTACACTAGCCGTGCAGTTAAGGACCGGACCGTATC AATGGCATTGGTGAGTGACACTCTGGGACAGAAGGGAGATGTGGCCAGCTCTTCTAGTGTTTTGGTAATCTGATTGCTCA ACCTTGCATTTTCATGGTTAATTTATTTTCTGTGGTGTGTTTATACTTGCAACAAAAAGATAACAAGACATAGCAAATAT AAAAGAGAAGTTTATAGTAATTTCTAAGCTGGAAAGTATGCCAACCGTGAATTTCGTTACATATGTTGCAGTTAAGTAGG AAGGTTTAAAAAATTGGGACTTCTAAATTGCTAATTGTAAATTAATAAAGTCTGTTTGATTCTTTCCTCCATTAAGGAAA ATCATATAATTCTATCCTTATTTATCATGACTGAGTATTTTTTTTGTTTGTGCATATGTTTGTGTCTGCAGGCATATGAA TTGGTCCAAGGGGCACTTGTAAGTATTATTTATTTCTTTTGTTATTAATTTCATCTAGCAGGAACTTGTTTACATTTTGC AGAGAGTTAGTGTTTTCAACTTTTAGATTTCATACTGTGTTCCCTTCAATCCATTAGGGAGTGTTGTATTCAGTTGAAAT TTATATCTTGTTTAGTTGCTCTTTGCTGACAATGTAGAAGATCTTCCGTCATTGTTCTGTATGTCACTCGTTCCATGTTG 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AATTTAGAAAGAATTATCTCATTGACCAATATAATTTATTTGCGATAAGCAATGACCCTTTTTTAAAAGGAATTATCTCA ATATTGTGAATAAAGATACCTAATTACTATTAAATTTTTCCAATATTATTATTTTTTAAGTAATTTATTATTATAGTAAG GAATAAGGATATTTATTATTTTCCTGTAAAAAAAGAGGATATTTATTATTTTGTGGTGTGACCTTATCCATATATGCACG CTAATGAAAGAGAAAGAGTAAAAGAAAGGAAAGGAAAGTTGTGGTGTTTGATTGGGGGTTGCATTTTGATTGCAATTGCA AAGGAAGAAGACGACGAAGAAGAAAAGTGAGTGTGTGAAAGGGAATTCGATGCACGACACACACGGGGTGGTGATGTGGC ATCTTCGAACTCCATTACTTCATTCTCACTCACCCCAATTTCATTTAAATTTCTAGATTCCCAAAATCCCCTCACTCTCT CTCGCTCTCACGCCGCTGCTCTCTTCCCGTCAACACCGCTTCCCGCCGTGCCCTCCCTCCGGTAACCTCTCTGATTCTCT GCTTCCAAACTCGCTTTCTATTTCTCTCTGATTTTCAATTGTATGTAACTGTGTATTGTAATCCTCATGTGTCTACTGTT CAACCTGAGTTGCGAAATTTCTAGCTCCATCGAGTAGTTATGTTGTAGATTTAGCCGAACATAGCATTGTTCATACCTTC TTCATGTTGTAGCTATACATGCTCCGGTGTTTGATTTGAGGTTCCTCAAACTACAACATGAGTTTTTAGGGTAGTTTAGT TTAATATAAATGATCCTATAGAAAATAACTTGTCTGATATGATTTGTTTTCTTCACTTTCAGGGTAAAGTTGTCAAGTTT GTGGACAAGATTTAATGTTTTACAGAAGCAGCAATATTGTGGCTAGGATTTTCGATCGTCAACTTCGCACTCCTGCTCCT GGCACTAGTGTAATTTCTCCGTAATCATAATTATGTCTTCTGGAAATTCTTGCAAATGTGGTCATGTTTTGCCTCTTTTT AGTTTACCGACTTGTCCGATGAATAATTTTTAAAAGCTGAGGTGTGGAATGGTTAATGAAATTCGAATTAAAAATGTTTA CATGGTTTTTACTTAGCTGTATAAGTTTGGAAGCGCTTCAGAACAGTTTATCTGACTCTGTTGAATTGAGCCGTTTCAAG TATAATGTTTTTTATGTTGAAACTTGAAATACAAAAGTGTATTTGGAGTGCCATTGTGGAAAATATGCTTTTCTGAGAAA TTTGTAAAATTGGTGTCTTGTTCCTTTGTTGAAGGAACCTGAATTGAATTTAATTTTTGCAGGTGTAATTTACTTCTTGC AGGTTCATCATGCTCGCAAATTCTATGAAAACTTAGTACCTAGTTACACAGTCTATGAGGTTGAGTGCCCGGACCATTCG TTTCGTAAATTCACAGATGATGGTCAATACCTTATAAGTTTCAGCAGAAATCATCAAGAGTTGATTGTTTATAGGCCTAG GTGGCTTTCCTTTTCATGCAAAGATGAAGATTGTGACCAGCATGATTTGCCATCAAAAGCAAAGAGATTTGATAGTTTTT TCACTCAATTATATTGTGTGCCTCTTGCCTCTTGCAATGAACTTATATGTAAAGATTTTTTTCTTTACATGGAGAGTAAT CAATTTGGACTGTTTGCTACTTCTACTGCCCAAATACATGATGCGCCTGCTGTTGGAGGAGCTGTCCAGGGTGTTCCTTC AATTGAAAAGATAACTTTTCACCTCTTGAGGTGCTTTTCTTTATATTCAATTTTTTCATTTTCAGATCTTCAAAATCATA TCAGCAATCATATTCTGGTTATTTTGTACTTATGTCATTTTCCCCCTGATTTCTCACCTATTATACTTAGATTGGAAGAT 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TGAATTTAGCAGACTTTATTTCGTGCTTTAAATTTATTTTTTGTTATTTAGGTCCTGAAGCTGGTAGTATGGATGGTCGT GCAAAAAAGATCTCTTCGTTTCTTTTTCATCCAATTTTGCCCCTTGCTCTATCTGTTCAACAGACTCTGTTCTTGCAGCC TTCAGTTGTAAATATTCACTTTCGAAGATGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0445100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTGGTGAGTGACACTCTGGGACAGAAGGGAGATGTGGCCAGCTCTTCTAGTGTTTTGGCATATGAATTGGTCCA AGGGGCACTTGTGAGATGGAGTTCTGTTATGGACAAATCTTTGCCTGATCCACCAACAGCTGTCTTTCTGCATGGGATCC TGGGTTGCAGGAAAAACTGGGGAACTTTCGTTAAGAGATTGGCAAAAGAGTTTCCTATGTGGCAGTTTCTTGTAGTAGAC CTACGATGTCATGGTGATTCAGCTTCAATGAGGAAGAGAGGGCCCCATTCTGTTCAATCTGCTGCTCTTGATGTTTTGAA ACTGGTTCGGGAGCTAAGAATAACACCTCGTTTGTTGGTTGGTCATAGTTTTGGAGGAAAAGTTGTTTTGAGCATGGTGG ACCAAGCTGCAAAACCTCTTGCTCGACCAGTGAGAGCATGGATTCTTGATGCAACTCCTGGAAAAGTTCGAGCAGGTGGA GATGGAGAGGACCATCCAGCAGAACTCATATCCTTCCTAAGTACACTGCCAAAGGAGGTCTCTTCAAAGAGGGATGTTGT GAAAGCTCTTATTCAACAAGGGTTTTCTAATGATGTGGCACAGTGGGTTGTGACTAACTTACGACCAACCGGCTCTCCTG GTTCAGGCTTCTCGTGGGTGTTTGACTTGAGGGGGATAGCAGAAATGAAAATTGTTGAAGACGTACCTCGTGGTGTGCAT GTGAACTTTTTGAAAGCAGAGAGAAGCCTACATAGATGGGCTCTAGAAGATCTTCAGCGAATCCATGCTGCTGAGGAGAT TGCTGCTGAGGAAGGAGGCGGAGTTGAAATGCATGTCCTTGAAGATGCTGGCCACTGGGTTCATCATGCTCGCAAATTCT ATGAAAACTTAGTACCTAGTTACACAGTCTATGAGGTTGAGTGCCCGGACCATTCGTTTCGTAAATTCACAGATGATGGT CAATACCTTATAAGTTTCAGCAGAAATCATCAAGAGTTGATTGTTTATAGGCCTAGGTGGCTTTCCTTTTCATGCAAAGA TGAAGATTGTGACCAGCATGATTTGCCATCAAAAGCAAAGAGATTTGATAGTTTTTTCACTCAATTATATTGTGTGCCTC TTGCCTCTTGCAATGAACTTATATGTAAAGATTTTTTTCTTTACATGGAGAGTAATCAATTTGGACTGTTTGCTACTTCT ACTGCCCAAATACATGATGCGCCTGCTGTTGGAGGAGCTGTCCAGGGTGTTCCTTCAATTGAAAAGATAACTTTTCACCT CTTGAGATTGGAAGATGGATCAATCCTGGATAAGAAGGTCTTCTGTAATGACTTTGTTAATTTGACTCATAATATGGGGG TCTTCTTGTATGATGACCTACTGGCAATTGTATCACTTCGCTATCAAACCATACACATTCTTCAAATTAGGGACTCTGGA AACCTTGTAGATGTACGTGCTATTGGGGAATTCTGCCGTGAAGATGATGAACTTTTTCTCAACTCAAATGCTCAGTACAT GGCATTGTCTGACAAAAACCAACAGCATCAGTTGCCTGGGAACCACACAGAAAATAACATACATCAAGATCAAGGCCAGC CTAATCTGGGGAGGTCTTTTCTAAGTGGTATAAAGCAGCGATTGCTTTCATTCATATTCCAGGGACTATGGAATGAAGAA AGAGATGATACCTTGAGGGTCCAAGGACTAAGGAAGAAGTTTTATTTCCACTTTCAAGATTATGTTGATTTGATTATCTG GAAGGTGCAATTCATGGACAGACATCACTTGCTAATCAAGTTTGGTAGTGTAGATGGAGGGCCTCAGGTGTCGCGAAATG CTGATCACCACCCAGCTTTTGTTGCTGTGTATAACATGGATACAACTGAAATTGTATCTTTTTATCAGAATTCAGCAGAT GAGCTATACACGTTGTTTGAGCAGTTCTGTGACCACTTCCATGCAACGTCAAGGAATTCAATGTATATGAATTTCATATC ATCTCATTCAAATAATATTCATGCACTGGAGCAGCTAAGAAGCATAAAAGATAAGGCAAGCAACTCTTCACAGTTTGTGA AGAAGATGCTTGCCTCTTTGCCTTTCAGTTGTCAGTCACAGAGTCCTTCTCCTTACTTTGACCAATCTCTTTTCCGGTTT GATGATAAGCTGATTTCTGCAACAGATCGGCATAGGCAATCAACTGACCATCCAATCAAGTTCATTTTAAGGAAACCTCC GTATTCTCTCAAATTTAAGATTAAGCCAGGTCCTGAAGCTGGTAGTATGGATGGTCGTGCAAAAAAGATCTCTTCGTTTC TTTTTCATCCAATTTTGCCCCTTGCTCTATCTGTTCAACAGACTCTGTTCTTGCAGCCTTCAGTTGTAAATATTCACTTT CGAAGATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0445100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALVSDTLGQKGDVASSSSVLAYELVQGALVRWSSVMDKSLPDPPTAVFLHGILGCRKNWGTFVKRLAKEFPMWQFLVVD LRCHGDSASMRKRGPHSVQSAALDVLKLVRELRITPRLLVGHSFGGKVVLSMVDQAAKPLARPVRAWILDATPGKVRAGG DGEDHPAELISFLSTLPKEVSSKRDVVKALIQQGFSNDVAQWVVTNLRPTGSPGSGFSWVFDLRGIAEMKIVEDVPRGVH VNFLKAERSLHRWALEDLQRIHAAEEIAAEEGGGVEMHVLEDAGHWVHHARKFYENLVPSYTVYEVECPDHSFRKFTDDG QYLISFSRNHQELIVYRPRWLSFSCKDEDCDQHDLPSKAKRFDSFFTQLYCVPLASCNELICKDFFLYMESNQFGLFATS TAQIHDAPAVGGAVQGVPSIEKITFHLLRLEDGSILDKKVFCNDFVNLTHNMGVFLYDDLLAIVSLRYQTIHILQIRDSG NLVDVRAIGEFCREDDELFLNSNAQYMALSDKNQQHQLPGNHTENNIHQDQGQPNLGRSFLSGIKQRLLSFIFQGLWNEE RDDTLRVQGLRKKFYFHFQDYVDLIIWKVQFMDRHHLLIKFGSVDGGPQVSRNADHHPAFVAVYNMDTTEIVSFYQNSAD ELYTLFEQFCDHFHATSRNSMYMNFISSHSNNIHALEQLRSIKDKASNSSQFVKKMLASLPFSCQSQSPSPYFDQSLFRF DDKLISATDRHRQSTDHPIKFILRKPPYSLKFKIKPGPEAGSMDGRAKKISSFLFHPILPLALSVQQTLFLQPSVVNIHF RR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 31 | 296 | 266 | 5.2E-32 | ||
| SUPERFAMILY | 38 | 290 | 253 | 3.52E-24 | ||
| Pfam | 48 | 289 | 242 | 3.4E-14 | ||
| PANTHER | 284 | 801 | 518 | 5.3E-228 | ||
| Pfam | 383 | 802 | 420 | 1.0E-148 | ||
| SUPERFAMILY | 553 | 717 | 165 | 4.08E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0445100.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…