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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0445100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0445100.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase; TAIR: AT4G10030.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q57427|Y193_HAEIN Putative esterase/lipase HI_0193; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SD03|A0A151SD03_CAJCA Putative esterase/lipase HI0193 family; Found in the gene: LotjaGi2g1v0445100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:94039148..94046435) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGAATTGGTGGTGGGAATATCAACCCCAAAGACTTAGCTTTCACACACCCAATAAAATACAATATACATATTAGTATTA TTGTGCTGTAATTAATATTATTCGCGCCCCCTCTCTCTTTATTTCATCGCCGGAGTCACCACCGCATCTTTTGGTGTCTC CGTCAGCCATTTCCTCCGATCTACATTTTCCATTTCCTTCAGATGCCGCTCATTTCCAATCCTTCACCGTGCTGCGCCGC CACCGCGGTTAACTCCTCTTCGGAGAGGAAGGCGAGGTTCGCCTCTGGTCCACGGAGGAATTCCAATCCCAATGCCACGT CTCCCATTCTCCGGCTCACTCAGGTGCATTTCTTCCCTCTCTTATTTTCTCGTTACTTCGTTAATTCCTATGCGTTGAAA ATTCGTCACACACCATGCTCGCTCGCATTTGAGCTTCGCTTCGGTTATTATTACTTCTCAATCGATTTCCAATTTTCCAT GATCGTTGTGTTGCTAATTTTGCTGTTAGAGACTCGTATTCAGGCTCTGCTGTGTGCCGCGTGTTTTACCAATTAGCATT GTGATATGTTATGCTCTTTGCTTCACAAGTTATTCATGTATATATGTATTTTTGATGTAGAATGACAGATTCAATGTGCC GCGGTTGGCTCGAAGCTACACTAGCCGTGCAGTTAAGGACCGGACCGTATCAATGGCATTGGTGAGTGACACTCTGGGAC AGAAGGGAGATGTGGCCAGCTCTTCTAGTGTTTTGGTAATCTGATTGCTCAACCTTGCATTTTCATGGTTAATTTATTTT CTGTGGTGTGTTTATACTTGCAACAAAAAGATAACAAGACATAGCAAATATAAAAGAGAAGTTTATAGTAATTTCTAAGC TGGAAAGTATGCCAACCGTGAATTTCGTTACATATGTTGCAGTTAAGTAGGAAGGTTTAAAAAATTGGGACTTCTAAATT GCTAATTGTAAATTAATAAAGTCTGTTTGATTCTTTCCTCCATTAAGGAAAATCATATAATTCTATCCTTATTTATCATG ACTGAGTATTTTTTTTGTTTGTGCATATGTTTGTGTCTGCAGGCATATGAATTGGTCCAAGGGGCACTTGTAAGTATTAT TTATTTCTTTTGTTATTAATTTCATCTAGCAGGAACTTGTTTACATTTTGCAGAGAGTTAGTGTTTTCAACTTTTAGATT TCATACTGTGTTCCCTTCAATCCATTAGGGAGTGTTGTATTCAGTTGAAATTTATATCTTGTTTAGTTGCTCTTTGCTGA CAATGTAGAAGATCTTCCGTCATTGTTCTGTATGTCACTCGTTCCATGTTGCTCTAGCCTTTAGGCTAAAGAAAATTTGT AGTTTTGGAGTTGAGATGATTTCTGGAAGAATGTTGGACACAAATTATTGAAGCTTCCCTTATGCAAAAGAGAAGTTCTT TTTGTAAAAGGGAAGATTTTTTAAGAGCCTAAAAAATTGTACTTTCTGGAAAAAGAACCAAAATGATGAATCCTCTGTAC TGTCCCTTCAAAGAGGATGGTTCACTTTTCTTGGATTTTCTCTTAATTGGAGTTACTGCAACCTTTTATGATATCAAATG CTGAAATGTCAAACAAAATTTGTTAAAACAAATCCATTAGTTATTTACCCACCTGTTCAATAAGCTTCTTAACAAAATAG ATTTGAAACTGAATGAACACATTTAGTTGAAAATTTATAAAATGAAGTTGGATGGTTGCCAATACCGTACATTTTTTCAT TTTGAAGAAGTTAATGAATCTCATCGATGTGCTTTTCATGTAATGCTATAAAGATGATAAAGCAGCAAATTCTTTTCAAA AGACTAATGCTAAAAAATAATTTTGTATACAGGTGAGATGGAGTTCTGTTATGGACAAATCTTTGCCTGATCCACCAACA 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TGAAGAAGCAAATTTGTGGTACTTACTCTGACCTATGATAACAATGCTAGCTGTTATATATTTATTTTTATCAGGCTTAG CTAGTTGAGGGAGATTAGGTCCTGTCAAATCCACAAAAGTGAGGAGTATATTGTAGAGGATAAAGTGCGAAATTATAACC ATTGATTGGGAAATCTGTGAAGATGTTAAGAACTTATAATTTGATACACATGCATGTATTTTATCACTCTATTTCCCATT GATTTTTTAATCAAGAGTGATACTTGTATTTTATTCTCCAAAGTGCACCCCTCACTTTAAACAAGTCAAATCTCGTGTTT ATGATAAGAATAAATGAGTCATAGTGAGAGGTCCTGCATGAGAGTTAAATTTGATATTTAGTCTGTTCTACTGAAGAAAT AATTCCATGGTTAATGTATTTACTGATGCTGGGATTAATGGTAATAGTTTTCAACGTTAGAAAATAGTGTGTAGCCAATA ATGTTTTACGCTTCTGTTCATAGGAAAATTGTTGAAGACGTACCTCGTGGTGTGCATGTGAACTTTTTGAAAGCAGAGAG AAGCCTACATAGATGGGCTCTAGAAGATCTTCAGCGAATCCATGCTGCTGAGGAGATTGCTGCTGAGGAAGGAGGCGGAG TTGAAATGCATGTCCTTGAAGATGCTGGCCACTGGGTATGTTATGTTATTTGGTTATATTTTTTTAGTGTATGGTCCTTT ACTATGCTTGTCTTTTACCTCACATATTATGTTATATGGTTAAATTTGCTGGAATTACTTGTCATTCGTATTTGTAGTGT GATTCAAGACATGGTTTGATCTTTTGTGGGTAACATTAAACATGGACTGAGGATGAAATTTGTTTTGTGGAGCTTGCTGT TAAATCATTCAAAAGAGGATTTAACTTTGTCTATCAACAGGTACATGCTGATAACCCTGATGGACTGTTCAGAATACTGT CATCCTCTTTCCAGGGAGTCAAGGCGTGAGTCTACAAATATGTACACTTTTAATGTAATTTCTAACTTATTTGGGATGGG ATGACCTTCATAGTTTGATGCTATCAACTGCTCTTTACTCCATTTCCAAATTTTCTCCGGCTATCACTTCTGTATATAAA CTTATTGTTATTTTATTAGAGTCATGCTAACCAAGTGCCCTTAGGGTAGTGGTTAAGGAATCAATAAATAGAGTTGTTTT TATCAAAATTCACAGTATTCAATATTTTATTAATTTCAAAAGTTGCACTTTCTAATAGATATGCAGTTGTGGCTGTATAG TCAATCTTTGTAATAAGGTTGAAGCTGATGATATCTGTACATACTCTGTCATTTCCCGGGTTGTATAGTTTCTGTCAGCA CTTCTGTCTCCATTAGAGCCTTCCATACCATACCTACTGTCAACATGTGTGTGCTGCTAGTGCCCATAAGGTGAATTTTT TTTTTCTTTCGAAAATGAGCCCATAAGGTGAATATAACACGGAATAGTGTAATGAATTTCAAAAGTTGATTTAAGATCAT CTAGATAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0445100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCGCTCATTTCCAATCCTTCACCGTGCTGCGCCGCCACCGCGGTTAACTCCTCTTCGGAGAGGAAGGCGAGGTTCGC CTCTGGTCCACGGAGGAATTCCAATCCCAATGCCACGTCTCCCATTCTCCGGCTCACTCAGAATGACAGATTCAATGTGC CGCGGTTGGCTCGAAGCTACACTAGCCGTGCAGTTAAGGACCGGACCGTATCAATGGCATTGGTGAGTGACACTCTGGGA CAGAAGGGAGATGTGGCCAGCTCTTCTAGTGTTTTGGCATATGAATTGGTCCAAGGGGCACTTGTGAGATGGAGTTCTGT TATGGACAAATCTTTGCCTGATCCACCAACAGCTGTCTTTCTGCATGGGATCCTGGGTTGCAGGAAAAACTGGGGAACTT TCGTTAAGAGATTGGCAAAAGAGTTTCCTATGTGGCAGTTTCTTGTAGTAGACCTACGATGTCATGGTGATTCAGCTTCA ATGAGGAAGAGAGGGCCCCATTCTGTTCAATCTGCTGCTCTTGATGTTTTGAAACTGGTTCGGGAGCTAAGAATAACACC TCGTTTGTTGGTTGGTCATAGTTTTGGAGGAAAAGTTGTTTTGAGCATGGTGGACCAAGCTGCAAAACCTCTTGCTCGAC CAGTGAGAGCATGGATTCTTGATGCAACTCCTGGAAAAGTTCGAGCAGGTGGAGATGGAGAGGACCATCCAGCAGAACTC ATATCCTTCCTAAGTACACTGCCAAAGGAGGTCTCTTCAAAGAGGGATGTTGTGAAAGCTCTTATTCAACAAGGGTTTTC TAATGATGTGGCACAGTGGGTTGTGACTAACTTACGACCAACCGGCTCTCCTGGTTCAGGCTTCTCGTGGGTGTTTGACT TGAGGGGGATAGCAGAAATGTATCAATCTTATGAAGAAGCAAATTTGTGGAAAATTGTTGAAGACGTACCTCGTGGTGTG CATGTGAACTTTTTGAAAGCAGAGAGAAGCCTACATAGATGGGCTCTAGAAGATCTTCAGCGAATCCATGCTGCTGAGGA GATTGCTGCTGAGGAAGGAGGCGGAGTTGAAATGCATGTCCTTGAAGATGCTGGCCACTGGGTACATGCTGATAACCCTG ATGGACTGTTCAGAATACTGTCATCCTCTTTCCAGGGAGTCAAGGCGTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0445100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPLISNPSPCCAATAVNSSSERKARFASGPRRNSNPNATSPILRLTQNDRFNVPRLARSYTSRAVKDRTVSMALVSDTLG QKGDVASSSSVLAYELVQGALVRWSSVMDKSLPDPPTAVFLHGILGCRKNWGTFVKRLAKEFPMWQFLVVDLRCHGDSAS MRKRGPHSVQSAALDVLKLVRELRITPRLLVGHSFGGKVVLSMVDQAAKPLARPVRAWILDATPGKVRAGGDGEDHPAEL ISFLSTLPKEVSSKRDVVKALIQQGFSNDVAQWVVTNLRPTGSPGSGFSWVFDLRGIAEMYQSYEEANLWKIVEDVPRGV HVNFLKAERSLHRWALEDLQRIHAAEEIAAEEGGGVEMHVLEDAGHWVHADNPDGLFRILSSSFQGVKA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 21 | 41 | 21 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 388 | 362 | 3.6E-189 | – | |
| PANTHER | 27 | 388 | 362 | 3.6E-189 | – | |
| Gene3D | 101 | 386 | 286 | 1.9E-37 | ||
| SUPERFAMILY | 109 | 382 | 274 | 9.65E-29 | ||
| Pfam | 119 | 376 | 258 | 4.9E-17 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0445100.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…