Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0457600 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0457600.6 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11; TAIR: AT4G04885.1 PCF11P-similar protein 4; Swiss-Prot: sp|Q0WPF2|PCFS4_ARATH Polyadenylation and cleavage factor homolog 4; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HJ63|A0A1J7HJ63_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0457600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95119514..95131924) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGCAACTAGTATATATGTTACCAGAGGATTGAATGATATGATAGAGAGGGTGATAGATAGTGCATTGCTTTGCAGGGTTT GCACACGCATGTCGAATCACGTTCATACATAGTCGCTACTCCCAAACTACCCATCCAATTCATACCCACAGCGCCGTCCC ATTCAAATTCGATGGTGCGGTGACGGTGCACCACCACCACCACCATGTGACCAAATTCAAAACCCTAACCCTAACTCTCT GGATTGAATTTTCTGATTCCCCAAAATGAGCAGCAATGACATGATGGGGCAGAAGCTTCCCCCTCCGACACTGGTGGATC GATTCAAGGCTCTACTCCGGCGACGCGATGATGACCCTCGCTTTAGGGCTTCCGAAGAGATTGTCCAGATTTACGAGCTC TTGTTGTCTGAACTCACCTGCAATCTCAAGCCCATCATCACCGATCTCACCATCATCGCCGAGCAGCAGAGGGAACACGC TGAGGGCATTGCTGATGCTATTTGCACCAGGATTCTCGAGGTCTGTCTCCGTAGCCGCAGATTTTTTTGTTCATGTTTAC CCTTCCCCCCTTTCCACCACCGATCATATGGTTCAATCAAAGCTATTATTTCAATTTTCTTCAGTAGATTCCTCTTCTTT TTATGTTAATTTCCTTCTTTCATCGCGCTTCTGGGTTTCACAAGTCTAGCGATTATTTACCATTATCTGTTATCGTGATG TAAATTTGGATAAAGCCCTCGTTGTTGCTTCAGAAATGGTTAATAAATGCACACACAGAGCTAACTCTGCTGAAATTGAC CACCACCATCACCTTCGTTATTACTACTTTTATCCAACTAAAACACAATCAGTAGCTACTGGCATTTGAAGAAATTGGAA TAGTACCATTTAACATAACGGATAATTGATTGGCACCGCTAATATCTTCCAAATAGTACAATTTAGACAAACAAGCATTC TACGCATTTGAGCACTTAATCAATTTCAGGAAATGCCAAGGGTGTACACAAGTGAACACGGACCCACATGCTTATACATA CATATTTTTATATTTATAAGATTCAGGCCTGTTATCTGAACTTTGAAGAAAATTGTTATTGTAGTATTGCTGAAATGTAG ACTTTTGCACTCTCCATGTTTTCCATATCCTCACATATCCACCTCTCTCTCTCTTGGTGCGTGTATATTTAAATGGGTTA CCTTAAGTTTGAGTATGCTGGTAGTTATGTAATCTTAGGATTTCTAGTCTTACCATGGCTGAAAAGGGAACATTGATTTC AAATAAATGAGAATGTGCAAGGCTGCAGTTGAATGTTAAACTAATTCTTGTATTAGATTGAATAATTTTGTTTGGGAGTG CTGCCGTAGACTGAATATTATGACTTGCATCATGCTTTAATATATTGTCAATTTTCAATCCTATTAAAACAAAGCACGCT TTGTTAATATTTTTATAAGAAAGTATGCTTTTCTTATCATTTACATACCAAGTATCTTTTTTGTAAATTAGCTTATCTTT GTCTAAATTAGTGATATCTGAGGCAGAATAATTAAAATTGTTAAATTACGATTCCATTAGTAAATTTCAAGAGTGACTGT TGACAATAATGATGCAGAGACTCTTACTAAGGTATTGTGTCTTGCCTAAACCCTGTGTTAAGGTTGAGTTTTAGAGATTA ATTATCACTGGTCTCTCTTCTGAAATGAGTACATTGTAAGATTTTCTTAAAGAATTTGGTAAAAATGAACTGGTATTGAA ATATATTATAGTTGTTAAAACAGTTAAACTCAAAATGCTAATCAAAGTCATTATAAGCTGTTGTGTTTGTTGTAATTACG AACTGCATTTTCTTATCTAATATTTCGTTAGTATTTCAATTATTATTTGAGTCGCTGCTGTTTAGGTAGTTCTTCAATTG TTGTAGCTATCCTTTCCAGGTGCATGCAGATCAAAAGCTTCCTTCACTTTATCTTTTGGACAGTATTGTGAAGAATGTTG GCCAGGAATATGTTAAATACTTCTCTTTACGGCTACCTGAAGTAGGTCAACTAGAGTTGTATTCTTTTTTTAATTCATAA AGCATGAAATCATTTTATTCTGTTATTGAAACTTTGTAGTTCTATTGTCTCCAAAGGTTTTCTGTGAGGCATACAGGCAG GTTCAACCTCACTTGCATTCTGCTATGCGTCATCTCTTTGGTACCTGGTCCAAAGTCTTCTCTGCTCCTGTTCTACGTAA GATTGAAGCTCAATTGCAATTTTCACGAGGAGTTAATAACCAACCATCCAATGTCAATCCCCTCAGGACTTCTGAATCAC CTCGACCAACTCATGGGATACATGTTAATCCAAAATACGTAAGACAGATGGAATGCTCTAGTTCAAATATAGATAGTGTA AGCTTTTATTTTTTGTGTAATCTGTCTTCTATACATACTTTGCAGGGAGTAGGCTGCAGCTTGATTACTTGCTGATTTGA AAAGGATATGTTTGGTTTTGATAATTTTTAAATGTGATGTTTTGTGTGTCGCAAATATTGTTAATTTGTTCAGCTGCTAA GGATCTCTCAGAATTTTTTTCATTGAATCTCCTCTCATTAATGTTCTTTAGTTCCCTTGAAGCAGTTAAAGTTCTGGATG ACATATTAGATAAATTCATGTTTCTAATTTGCACTTTGCACTTTGTTCTACAAGAAAAATGATTCTGCTTATATCTGTTA GTATGCTCCTGCCAATAGAGATCCTTCAAACTATAAGATGCAATCTGACAGAGTGTTTGGTTTCATCCTCACAGGTTGGA GGTGAAAGGTTGGACTCAACAGGGACAGGAGGTAATACAAGCTTTGGCCTCGTAGCTAACAAAATCCATCAATTTGGGCC TAGTAGGCATGGAAGGTCCTCCTCACCATCAAGAATTGGAATTGATATGCCTTTGTCCACATATGCGGATGAATATCCCG CTGACAATTCTACTGGCAGGACAATTGAGAGAGAATCTCCTCATCATGCAGTTGATTATGGAGTAGTTAAAACATTAGGT AGAGAAGAAGAGTTGAGTGAATGGCAGAGAAAGCAGTTTTCTGGTGATAGTCGGAAGAGATTTCAAACTATGACATACAG TCTTAGTAACGGACAACAGCGTCAAAGTCCTAGAGCTCTGATTGATGCATATGGAAGTGACAAAAGTCAAGAAACTTCTA GCAGTAAACCTTTCTTAGTTAAACGGCTTGGTAGAAATGGTATAGACAAGGTTTCGACAACGTCATGGCAGAATACTGAA GAGGAGGAGTTCGATTGGGAAGATATGAGTCCAACATTAGTAGAACATAATAGAAATAATGGTTTTCTGCAGTCAACTAC TGGTTTCACCACGGAAATGCCAGTTACTGTTGCAGCTAATGCAATTTCTTCTGAGCAAGATACCAGGACGGGTTGGTCTA GTGGGTCTCAGCTTCTTCCGGTTGATGATTCCTCAGTTATAGCCGAAGATGTATTCGCCTCTTCAGCTGTATGTTTCCTG AACTTCTATCTTTTATCCTTTATCTTTCTAATTTATATAACAACCACGGAAACCATTTTCGACTAGGTGGGATCAGCTGC ATGGATATGACAACACTATAATAGCAATGCGACTTTTTATCTTTCTACTGTTTAGCTCTTTAATATGATTGGTGATATTG TGTTTTCCCTCAAATGCATGTTTTTGGCATGCCAGTATGTGCTACTTCATGAATCATATACCATTGGTACTTCAAGATCC AGTCATTATTATCTGGTGATGAGCGTTGCTAATTGCTTTTCATGAGAAATTCGAATCAAATGAAATGTCTTGCTTTTATT CATATTTGCCTGGAGATTGCCTTTGCCTTTGTATTATCTTCACATTGATTCATTAATTTTTCATAGTTAGAGTAAACTAG CAACTTTCAGTCCTTACTCCTTTTCTTTTAAAATTTGCCATGTACTCAGGCATGGGCCGCATGTCTAATGGTTTTGTTTA TCATTAACTACGTTAAGATCATTTCTTTTAGTATACTTTAATAGGAAATTGAATTTACCAATATTTTGCTGATAGATAAT GGAATTGAAAATTCATATATTCTCTAGTTCATCTCTTCTAGTATAATTTTATAGGAAATTGAATTTGACAATATCTTGCT GATAGATAATGTAATTGAAAATTCATATATTCTCTGCAGTATTCTCGTGTACCACTGGGTCAGGTATCTGGATTCCAGAA TCCAATAAATCAGAGTCTAGGCTCTGGTCAGCGTAATGATGCTTGGAAGATTTCTAGTCATCCATCTAATTCTACACGAC ACCCCTTTAATGTTATGGGAGGAGGTAGAAATCTTCTGATGCCTCCTATTGATAACATTCCCAATACTGATGTAAACTCG TATGGTGCTCGGCTGGCTGCGTCAAGGATGCTTCCTGGTCTCAAGTCCAATGTGGAGGGTGGTCCTCCACCAGTTTTGCC AGCAACTTTTGAAATGAGGCCCTCTGTAAATGTGCATGCTGCTCGTCCTCCCAGCTTAAACCCTGCATTTCAGTTTAAAA ACAATGTCAGATTTGAATCAATAAATGCTAATAATAACAGTGCAAATCATGGTCCCAATAATTCCTTGCTTATGCGTGAG CAGTCATTGTACAATGTTGAGGACAAAGACTTTAGTAAAGGGAACCTATATCAATTGCCTAATCAGCAATCTGGTCTGGT TTCATCTAACCCACAAAACCGAGGACAAGCACCTCAACTACAGTTTTTTCCCTCTCAGGATCCGGCAGCATCACAATTTA GTGGGAGCTCTTTTCAAGGACATGGTGGTGCTAGAAATACACATTTGTCAAATGCGCCACCAAACATGCCATTCCCTTTA CCAGGCCAAAATATGGTGAATAACTCTTTACATTTTCTGGGGGGAGCCTTGCGACCCTTACATCCAGCCCGGCCGCCATT GCTACCTCATCCTAATCATACTCCTCTTGTTTCAAGTCAACGGCCAACTGTTCCATATTCTAATTTGTTTAGTTCACTCG TCGCCCAAGGTGTAATCTCATTTCCTAATCAGGCTCCTGCACAGGTAACTAAATCTTTTAAGTTTATTTATTTTTCCTTT CTCCTGCCATTGTTGATCTGATTGTGCAAACCAAGTGTAATGAAATTGAGTTACTTGTTTTTAGGATTCTGTTGGAATTG AGTTCAATCTGGATATTCTGAAGGTGCGTCATGAATCTGCAATCAGTGCTTTATATGGTGATCTCCCTAGACAATGTACA ACTTGTGGTCTCCGTTTCAAATGCCAAGATGAGCACAGTAATCACATGGATTGGCATGTGACTAAGAACAGGATGTCTAA AAACCGTAAGCAGAAGCCTTCTCGTAAGTGGTTTGTGAGTGAGAGGATGTGGCTTAGTGGTGCAGAGGCATTAGGAACAG AATCAGCTCCAGGTTTTTTGCCAAATGATACGGTTGAGGAAAAGAAAGATGATGAAGAGTTGGCTGTTCCTGCTGATGAG GACCAGAATACATGTGCATTATGTGGAGAACCTTTTGATGAGTTTTACAGTGATGAAACGGAGGAGTGGATGTATAGAGG AGCTGTGTATCTTAATGCACCCAACGGAACAACAGCAGGTTTGGACAGGTCACAATTAGGCCCCATCATTCATGCTAAGT GCAGATCTGAATCTAGTGTGGCTCCATCAGATGATTTTGTGCTGGATGAAGGGGTACGCCTTTTACAATTTTCTTAGTTT CATTCTCATTATTGTTCAAAATATGAGCATGCATCGACCAGCATTTTGATCATTTGAACGATTATAATTTGTATTTTTCC CAACGCTTCCTGTTATGGTTTTACTTTCCCATCTGTAAAATGTACTTTTGAGGTGAGGGATAGGGTCCAATGTGTGACAA CATGAGTGGGATGAAATAAAATCGGCAATTCTTACTGTGAGGCAGGGAAGATTCTACAACACTGGATCCAATTATCCATG TTTTGTTGAGTCCTCATACTCAACATGATCTAACATTAAATTTTGAGGATGGAACCACATGACTTGTTTTGAGTCAATTT CGATAAGTATTTACCGGTACATTGGATTTCAATATATGTGTTTCACATATTTAATGAAACTAACTTTCGTGTTATATAAA CATCATGGTTAGCCTGCAAACTTTATGTGTGGTGTTTGTGCTCTTGTTAATGTTATATAATGATAGGATGAACAGTGCGC ATGAACAGTAGCAGCAGTAGCAGTTAGATTGCAGTTAGAAAGTTATTATTTAATTATTTGTTGGGGTAGTTATTGGGTTA GTTATTTACATCAGTTTATGTTAGTTATGTTCTATCAAAACTGCCTAGGGGTGGTTATTAAATTTCTGGTTATAAATAGG AGTTGTGGCTGTTAGTTTAGACATTCAGAAATTAGAAGTTGTGTGTTTGAGGAGAGGGACTGGACTCTCGAATTCCAGAA TCTATAGGAGAGGCTGGCTCTCGAAAACCAGAGTTGTATTACTATTTTATAATAAACACTGTTCCTATCAATTTTGTGCC TATTTAATCTCTTCTTTACTAACTCTGTTTGGTGTTATTCATTTCATGTGAGCTTGTGCATTTACTCCATGCAGTCTTCA GAAGATATTTATTTTTTTCTTCCTCTTTTGTATGCAGGGCACCACTGAGGAAGGTGGTCAAAGAAAACGAATTCGGAGTT GACTAGAGCTGACCATTTTTGTGCCCTGTAACTTATGAGTTTCTGTTTAGCATATGCTCTTACATTATTTTTGAAGTAGA GCTGAATCTTTTGTAATACATAGCCTCTTGCCTAAATCATGTACATGTATAGTTGCTCCAGTTCCAGTTCCGTGCAAATT TTTCTTGCTATCACAGGTTATATATACTCATCAATATTTTAGTTCCTGACAACTATTGTTAGCAAAAAGAAAAAGAAACT GTCAAAAAAACTATCGGATATTCGGATTACTAGTTCTACATTATTTTTGGGATGGGGGGCCATGGAGCAAGATGCTGTGT TGGATCAGTTATTTTATCTGGGAATTTGCAAAGATTCATGAGTATTACTTGCTGTCTGATTTACTGTATTTTATATATAA CTCATGCACACATGAGAGTGCAAATTACAGACATTTGATCTTTCTTCTTTCGTTAAATTAATTATGCCAGTCATTTCAGT TCCAATGGCTCTTTTCCATTACTATTTTTCTATTTCCTTTCCCTCTTGTTTTTTAGTCTGAATTGCAATTTGGCTCGTTT GTTTTATTTATTTTATCACGTTGATCTTTCTTTTGTTCGTCGAGAGAGAAACTCTTGCGCTGACTACCTGGCTCGAAACG TCTCTACCTTTTCTAATGTTGTCTGGGATAGAGGAGGGTCCTTGGGATTGTCTAGCTTTTTACTTGCTGATGTTGTGGCT TCTATACTGGGACCATTTTGATTATAACATTTGCTAAATTAATCACCATGAAAAGCTTTTTAATCGGTTGCTATGTAGAA CTCTTGCACGTCCTCTTTCTTTAAGGAAGCTCAACTAAAACTCCTAGGTATTTCATCCTACAAATCCATATTTATTTAAC TCTGTTTTTAAGATGACATGTTTTAGGAAAAAATTAAGAGTATAAAATGAAAGAACTTGTTCTTTTTAAAATCCTAAAAA AAAACCCTTTTTACATATTTCGATTGTTTCTCAAATTTGGGGTTTGGTAAAGATTTCTGTCTGTATGTTGGTTGAGCTTT ATAAGTTGGTTAGAAAAAAATTAAATAAGCCTACATCAATTTTGAACCCAATTTTAATCAAACACTACCTAATTTATTTA CTTGGGATTTGCATCAAAGTCCCAAACATGACATTAGAATTTGATGTAATGTTTCAAAAGACAAAGAACTAATGCGATTA AGACATTGATTGAACCCTTTCATTAAGAACTTAGGTGCATACACAATTTTTAGGGCCCTTTAACTATGGAGTTAGGCAAA CTTTACTTTCACAGAGTAAGTTTAATTTTGACCAAAATAAATAAATAAAGTAAGTTTGATATAATTAAGCTTAGCACAAT TAAGTTTGAAAAACGGACTTTGTGTCGAGAATAGATATAAAGGCAAAAATTGATAGATGGTTAGAAGCGTATTTTCGGGG GTTGACAAAGGCCACGTGCCCCCAAGAATTTCAATTGTTTTGTAGACTATGTATTTTTATGTAGAAACTTTCGTGTATTT TTTTTATAATTTTATTTTTTCCCATGTAAAAACCTTAGATGCCCCTTTGGAGATGATATATGAAATTAATATTAGAATGC AAACAATATTAATGTTGGAACGAGAATAATTATATAAGTGTTACATGCTTGATTTTCTTTTAACAAAATTTTAGATTCGA GTATTATAGATTAAAAAAACTCCGCTAGAAGTGTTAGTTCCACTATAATGTGAATGTTTTCACCTTGAACAAAATTACCT CTCATGAAAGATACATGTAAGCACACAACAAAAAGAATAATGAATATGACAAGCAACCATTGTAAGAGTGAATAGTGAAT TACAACGTTAAAGACAAAAAGAGAGACGTTGTGAATTTTTTTAAAAGAATGATGAGGCTGTTAGTGAGGAAGAGTGTATA ATTTAAATGTGTCACTCTTGAGAAGAATAACTCAGATTGAAATAGATAAACATAAATTATTGAATTTGGTTTTCACAATC TAATTTATGAAATAAATAATATTTGACGGAAAGAAATAGATGAAACAATGAAGCCATATCATTGGTAAATATATATAGAG ATATAAAATAAAATAAAAAAGATTTCAGTTAACTTAGACAGCACGCATCCCTCCCATTATATAGGATGCCCCATCTGAAA GAACCTCATTCTTCCCATTCCCATCGAATCGAAACCCTAGTTGCTAATTTCTTCATCTCAACGCGCAATTCAAACATTCG TCGATCTGACAGAGCACGTCGTTCATCCGCTAACAACAACATCGCTCGCTTGAAGCTTCCTCCGACGGCCTCCACCGCTG CAAGCAGGATCTAGGGTTGTTCCCCGAGTCTTAAATACACGTTGTTAGGGTTTGGGTTTCACCAGGATAGGAATGAAATT GTTAGATACTTGAATAGAAACAGTTTCTTTTTTAAGATTTGGTGTTCTTATTTGTATTACACATTCTTATTAGTAATTTG TTGATTTTATCAATGGATATTGTAAGACCTGTTTGCTGGCTATTTTGTTCACTGCATTTCAATTCTGTTAATTCAACTTG ATTGGTAAAAAAGCAGAAATAATGGAAAGGAAATACTCTAGTTATCAAAGGACTAAGAGTATCCTTTGTTTTAGCCTCAA ATTATAAATTGCACATCTCAATATCCACCTTGTGCCTTTCTTCATATTCAAGGATGAAGCAACATGAATCATTGTCCATT GTAATACAAAAATGATTGAATTGAATCAAAATTAAACAATATGATAAGAAAAACACCAATGGATGGATAATACAAATATA TTTCAATATAATAGTTCTGGATGACATATTAGATAAATTTCATGTTTCTAATTTGCACTTTGTTCTACCATAAAAGTGAT TCTGCTTATGCTTATATCTGTTTGTATGCTCCTGCAATAGAGAGAACCTTCAAACTAAAAGGTGCATCCTATTCCTGACA GGGTGTTTGGTTTCATCCTCACAGGTTGGAGGAGGTAATACAAGCTTTGGCCTCGTACCTAACAAAATCCAAGCCTATTA GGTATGGAAGGTCCTACTCGCCATCAAATTGTTATGCCGTTGCCCACATATGTGCATGAATATCCAGCTCACAATTATAG GGGTAGGACAATTGAGAGAGAATCTCCTCATCATGGAGTTGATTATGGACTAGTTAAAAAATTAGGTAGAGAAGTAGAGT TGAGTGAATGGCAGAGAAAGCAGTTTTCTGGTGAAGGTCCGAAGAGATTTCAAACTTCTAAGACAACATACAGTCTTATT AATGGACAACAGCGTCAAAGTCCAAGAGCTCTAATTGATGCATTTGGAGGTGACAAACGGCTGGGTAGAAATGGTATAGA CAAGGTTTTGACAACGTCATGGCAGAATACTGAAGAGGAGGAGTTTAATTGGGGAGATATGAGTCCAAAATTAGCAGAAC ATAATACAAATAATGGTTATCTGCAGTCAACTACTGGTTTCACCACGGGAAAGCCAGTTATCGTTGGAGCTAACGCAATT TCTTCTGAGCAAGATACCAGGAAGGGTTGGTCTAGTGGGTCTCAGCTTCCTCCTGTTGATGATTCCTCAGTTATAGCAGA AGATGCATTCACCTCTTCAGCTGTATGTTTCCTCAACTTCTATCTTTTATACTTTATCTTTCTATACAATATAATAGCAA TGCGACTTTTTATCTTTGTACTGCCTAGTTCTTTAATATGATTGATGATATTGTGTTTTCCCTAAAATGCATGTTTTTGG CATGTCAGTATGTGCACTACTTCATGAATCATATATCATTAGTACTCCAAGATTCAGTCATAATTTTCTGGTGATGGCAT TGCTATTAGCTTTTCTGAGAAGTTTGAATCAAATGAAATGTCTTGCTTTCATTCATATTTTCCTGGAGATTGTGTCCTTA TTTTGAATTATCTTCACATGGATTCATTAATATCCCATTGTTAGAGTAAACTAGAAACTTTTAGTGCTTTTCTTTTAAAA TTTACCATGTACTCAGGCATGGCTAATGGCTTTTGTTTACTGATGTTTTCCTTCTAGTATTTTGAATTTGATACGCACCT TTCAATTAACTACGTCGAGTTCATCTCTCTTAGTATAATTTAATAGGAAACGGAATTTGCTAATATCTTGCTGATAGATA ATGGATTTGAAAATTCATATATTCTCTGCAGTATTCTGGTGTATCACTGGGTCAGGTATCTGGATTCCAGAACCCAATAA ATCAGAGTCAAGGCTCTGGTCAGCGTATTGATGCTTGGAAGATTTCTAGTCATCCATCTGTTTCTACCCGACACCCCTTT AATATTGAGAACAAAGACTTCAATAACGGGAACCTACATCAGTTGCCTAATCAGCTAGCTGGCCTGCTTTCATCTAACCC TCAAAACCGAGGACAAGCACCACAACTACAGTTTTTTCCATCTCAGGATCCGGCAGCATCACAATTTAGTGGGAGCTCTT TTCCAGGACATGGTGCTGCTAGAAATACACATTTGTCAAACGCGCCACCAAATATGGCATTCCCTTTACCCGGCCAAAAT ATGGTGAATAACTCTTTTCATTTGCTGGGGGCAGCCTTGCCACCCTTACATCCAGCCCGACCCCCATTGCTACCTCATCC TTATCCTACTCCTCTTGTTTCAAGTCAGCAGCCAACTGTTCCATATTCTAATTTGATTAATTCACTCGTGGCCCAAGGTG TATTCTCATGGGCTAATCCGGTCCCTGCACAGGTAACTAAATCTTTTATAAGACCTTTTTTCCTTTCTTCTGCCACTGTT GATTTGATTGTACAAACAAAGAGTAATGAAATTGAGTTATTTGTTTTCAGGATTCTGTTGGAATTGAGTTCAATCTGGAT ATTCTGAAGGTTCATCATGAATCTGCAATCAGTGCTTTATATGGTGATCTCCCTAGACAATGCAGAACTTGTGGTCTCCG TTTCAAATGCCAAGATGAGCACAGTAATCACATGGATTGGCATGTGACTAAGAACCGGATGTCTAAAAACCGTAAGCAGA AGCCTTCTCGTAAGTGGTTTGTGAGTGTGAGGATGTGGCTTAGTGGTGCAGAGGCATTAGGAACAGAATCAGCTCCAGGT TTTTTGCGAACTGATACGGTTGAGGAAAAGAAAGATGATGAAGAGTTGGCTGTTCCTGCTGATGAGGACCAGAATACATG TGCATTATGTCTAGAACCTTTTGGTAAGTTTTACAGTGATGAAACGGAGGATTGGATGTATAGAGGAGCTGTGTATCTTA ATGCACCCAACGGAACAACAGCAGGCTTGAACAGGTCACAATTAGGCCCCATCATTCATGCTAAGTGCAGATCTGAATCT AGTGTGGCTCCATTTAATGATTTTGCGCTGGATGAAGGGGTACGCCTTTCATAATTGTCTTAGTTTCATTCTCCTTATTG TTCAAATTCTGAGCATGCATTGACAAGGCATTGTGATCATTTGAACGATTATAATTTACTTTTATTTTCCCCTACGCTTC CTGTTATGTTTTTACTTTCCCATTTGCAAAATGTACTTTTGAGGGGAGAGGTAGGGTCGAATGTGTGACAAAATGAGTGG GATGAATAAAATCGCCAAATCTAGTCGTGAGGCAGGGAAGATTCTGCCACATTGGATTCAAATATTCGTTCAACAACACT CCCATGTTTGG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0457600.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGCAGCAATGACATGATGGGGCAGAAGCTTCCCCCTCCGACACTGGTGGATCGATTCAAGGCTCTACTCCGGCGACG CGATGATGACCCTCGCTTTAGGGCTTCCGAAGAGATTGTCCAGATTTACGAGCTCTTGTTGTCTGAACTCACCTGCAATC TCAAGCCCATCATCACCGATCTCACCATCATCGCCGAGCAGCAGAGGGAACACGCTGAGGGCATTGCTGATGCTATTTGC ACCAGGATTCTCGAGGTGCATGCAGATCAAAAGCTTCCTTCACTTTATCTTTTGGACAGTATTGTGAAGAATGTTGGCCA GGAATATGTTAAATACTTCTCTTTACGGCTACCTGAAGTTTTCTGTGAGGCATACAGGCAGGTTCAACCTCACTTGCATT CTGCTATGCGTCATCTCTTTGGTACCTGGTCCAAAGTCTTCTCTGCTCCTGTTCTACGTAAGATTGAAGCTCAATTGCAA TTTTCACGAGGAGTTAATAACCAACCATCCAATGTCAATCCCCTCAGGACTTCTGAATCACCTCGACCAACTCATGGGAT ACATGTTAATCCAAAATACGTTGGAGGTGAAAGGTTGGACTCAACAGGGACAGGAGGTAATACAAGCTTTGGCCTCGTAG CTAACAAAATCCATCAATTTGGGCCTAGTAGGCATGGAAGGTCCTCCTCACCATCAAGAATTGGAATTGATATGCCTTTG TCCACATATGCGGATGAATATCCCGCTGACAATTCTACTGGCAGGACAATTGAGAGAGAATCTCCTCATCATGCAGTTGA TTATGGAGTAGTTAAAACATTAGGTAGAGAAGAAGAGTTGAGTGAATGGCAGAGAAAGCAGTTTTCTGGTGATAGTCGGA AGAGATTTCAAACTATGACATACAGTCTTAGTAACGGACAACAGCGTCAAAGTCCTAGAGCTCTGATTGATGCATATGGA AGTGACAAAAGTCAAGAAACTTCTAGCAGTAAACCTTTCTTAGTTAAACGGCTTGGTAGAAATGGTATAGACAAGGTTTC GACAACGTCATGGCAGAATACTGAAGAGGAGGAGTTCGATTGGGAAGATATGAGTCCAACATTAGTAGAACATAATAGAA ATAATGGTTTTCTGCAGTCAACTACTGGTTTCACCACGGAAATGCCAGTTACTGTTGCAGCTAATGCAATTTCTTCTGAG CAAGATACCAGGACGGGTTGGTCTAGTGGGTCTCAGCTTCTTCCGGTTGATGATTCCTCAGTTATAGCCGAAGATGTATT CGCCTCTTCAGCTTATTCTCGTGTACCACTGGGTCAGGTATCTGGATTCCAGAATCCAATAAATCAGAGTCTAGGCTCTG GTCAGCGTAATGATGCTTGGAAGATTTCTAGTCATCCATCTAATTCTACACGACACCCCTTTAATGTTATGGGAGGAGGT AGAAATCTTCTGATGCCTCCTATTGATAACATTCCCAATACTGATGTAAACTCGTATGGTGCTCGGCTGGCTGCGTCAAG GATGCTTCCTGGTCTCAAGTCCAATGTGGAGGGTGGTCCTCCACCAGTTTTGCCAGCAACTTTTGAAATGAGGCCCTCTG TAAATGTGCATGCTGCTCGTCCTCCCAGCTTAAACCCTGCATTTCAGTTTAAAAACAATGTCAGATTTGAATCAATAAAT GCTAATAATAACAGTGCAAATCATGGTCCCAATAATTCCTTGCTTATGCGTGAGCAGTCATTGTACAATGTTGAGGACAA AGACTTTAGTAAAGGGAACCTATATCAATTGCCTAATCAGCAATCTGGTCTGGTTTCATCTAACCCACAAAACCGAGGAC AAGCACCTCAACTACAGTTTTTTCCCTCTCAGGATCCGGCAGCATCACAATTTAGTGGGAGCTCTTTTCAAGGACATGGT GGTGCTAGAAATACACATTTGTCAAATGCGCCACCAAACATGCCATTCCCTTTACCAGGCCAAAATATGGTGAATAACTC TTTACATTTTCTGGGGGGAGCCTTGCGACCCTTACATCCAGCCCGGCCGCCATTGCTACCTCATCCTAATCATACTCCTC TTGTTTCAAGTCAACGGCCAACTGTTCCATATTCTAATTTGTTTAGTTCACTCGTCGCCCAAGGTGTAATCTCATTTCCT AATCAGGCTCCTGCACAGGATTCTGTTGGAATTGAGTTCAATCTGGATATTCTGAAGGTTCATCATGAATCTGCAATCAG TGCTTTATATGGTGATCTCCCTAGACAATGCAGAACTTGTGGTCTCCGTTTCAAATGCCAAGATGAGCACAGTAATCACA TGGATTGGCATGTGACTAAGAACCGGATGTCTAAAAACCGTAAGCAGAAGCCTTCTCGTAAGTGGTTTGTGAGTGTGAGG ATGTGGCTTAGTGGTGCAGAGGCATTAGGAACAGAATCAGCTCCAGGTTTTTTGCGAACTGATACGGTTGAGGAAAAGAA AGATGATGAAGAGTTGGCTGTTCCTGCTGATGAGGACCAGAATACATGTGCATTATGTCTAGAACCTTTTGGTAAGTTTT ACAGTGATGAAACGGAGGATTGGATGTATAGAGGAGCTGTGTATCTTAATGCACCCAACGGAACAACAGCAGGCTTGAAC AGGTCACAATTAGGCCCCATCATTCATGCTAAGTGCAGATCTGAATCTAGTGTGGCTCCATTTAATGATTTTGCGCTGGA TGAAGGGGTACGCCTTTCATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0457600.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSNDMMGQKLPPPTLVDRFKALLRRRDDDPRFRASEEIVQIYELLLSELTCNLKPIITDLTIIAEQQREHAEGIADAIC TRILEVHADQKLPSLYLLDSIVKNVGQEYVKYFSLRLPEVFCEAYRQVQPHLHSAMRHLFGTWSKVFSAPVLRKIEAQLQ FSRGVNNQPSNVNPLRTSESPRPTHGIHVNPKYVGGERLDSTGTGGNTSFGLVANKIHQFGPSRHGRSSSPSRIGIDMPL STYADEYPADNSTGRTIERESPHHAVDYGVVKTLGREEELSEWQRKQFSGDSRKRFQTMTYSLSNGQQRQSPRALIDAYG SDKSQETSSSKPFLVKRLGRNGIDKVSTTSWQNTEEEEFDWEDMSPTLVEHNRNNGFLQSTTGFTTEMPVTVAANAISSE QDTRTGWSSGSQLLPVDDSSVIAEDVFASSAYSRVPLGQVSGFQNPINQSLGSGQRNDAWKISSHPSNSTRHPFNVMGGG RNLLMPPIDNIPNTDVNSYGARLAASRMLPGLKSNVEGGPPPVLPATFEMRPSVNVHAARPPSLNPAFQFKNNVRFESIN ANNNSANHGPNNSLLMREQSLYNVEDKDFSKGNLYQLPNQQSGLVSSNPQNRGQAPQLQFFPSQDPAASQFSGSSFQGHG GARNTHLSNAPPNMPFPLPGQNMVNNSLHFLGGALRPLHPARPPLLPHPNHTPLVSSQRPTVPYSNLFSSLVAQGVISFP NQAPAQDSVGIEFNLDILKVHHESAISALYGDLPRQCRTCGLRFKCQDEHSNHMDWHVTKNRMSKNRKQKPSRKWFVSVR MWLSGAEALGTESAPGFLRTDTVEEKKDDEELAVPADEDQNTCALCLEPFGKFYSDETEDWMYRGAVYLNAPNGTTAGLN RSQLGPIIHAKCRSESSVAPFNDFALDEGVRLS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 33 | 164 | 132 | 6.0E-39 | ||
| SUPERFAMILY | 34 | 160 | 127 | 9.94E-35 | ||
| ProSiteProfiles | 35 | 163 | 129 | 35.594 | ||
| PANTHER | 36 | 905 | 870 | 3.4E-160 | – | |
| SMART | 38 | 160 | 123 | 4.1E-37 | ||
| CDD | 43 | 160 | 118 | 8.47575E-49 | – | |
| Pfam | 91 | 145 | 55 | 2.5E-7 | ||
| MobiDBLite | 166 | 184 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 166 | 194 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 592 | 652 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 593 | 651 | 59 | - | – | |
| ProSitePatterns | 757 | 777 | 21 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0457600.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…