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LotjaGi3g1v0000800.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0000800
Transcript ID LotjaGi3g1v0000800.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Calcium-transporting ATPase; TAIR: AT3G21180.1 autoinhibited Ca(2+)-ATPase 9; Swiss-Prot: sp|Q9LU41|ACA9_ARATH Calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type; TrEMBL-Plants: tr|I1M613|I1M613_SOYBN Calcium-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0000800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:159346..186495) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AATAATAGCAGTAGCAACATGACGTCGACGTCACGAGGTTCCTCCTCCTCCTCCAATGGCCTCCTCCCCGTCACCATCAC CAGTAACCACCCTGACGTCGACGTCTCAACTAATGGCGACCACTATGATGACGACGACGACGACGACTTGCTCGTTGATC CAAACGACCCTTTCGACATTACCCAGACCAAGAATGCACCTCCCGAAACCCTCAAGCGTTGGCGAGTAAGACATAAATCA CATCATCCCCTTTTTCATTTCACTCACTCACTCACTGTGTTTAGAAAGAATAGCATGTTTGGATGGATCAAATTTGACAC CCAAGCCAAAAGTTACTCAGAAGCAAGCACAATTCATTTTGATTCTAGAATCAATTTTACAACAACTTATAACATGCACT GAATGTCATATCTCATTACAATTTTGTTTGGTTCTTTTTCGCTTATTTTGCAGCAAGCAGCATTCGTGCTCAATGCCTCC AGGCGTTTTAGATACACTCTTGACTTGAAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGCAAAAGAAAAGCATGATTCGAGCCCACGCGCA AGTCATAAGAGTAATGTTTTTCTTATTACTCCCAATACAACCTTCCCAATTCTTTAAGTTTTTTCTTTTCTAATCATTGA ATTATTCTTCTATTAGGCAGCTTTGCTTTTCAGATTAGCTGGTGAACGCGAACTAGGTAAACTTATTTTCTTAAATTATT TATACATGCACCACCTTCCCTTCTGTCACCTTACCTGCTACTGCCGCCAAAAGCTTCTTCCAAGCAATAGTAACATATTA ACCTGGATCCCCTGTAAAATAGAGCAGAGATCATCACAAAATGCAGCATTGTGAGTCATAAATAAAACCCCCAAACAAAT AGCCACATTGCTGCATTCAGTTGTTTTCTGTTTTTCTGGAACTTGCCTTCTGAAAGCTAGTACTGGTAGCAGCAGATCCT 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AATGATTTTGGAATTGTAGATACTTTTCTGGCCATACGAAAGATTTAGATGGAAATGTGCAATTTATTGCCGGCAAGACT AGTATTAGTGACGCAGTAGATGGGGTCATCAAAATTTTTACCATTGCAGTAAGTGTGAATTCTGAGTTTTGTTTATTACA TTGTTTTCTCTTAAATCTTTTGTGATAGTTTTTTCAACTAAATATAGAACCACACAGGTAACAATTGTGGTTGTTGCTGT GCCTGAAGGCCTACCTTTAGCAGTTACCTTAACGTAAGTACATGTGGCTAGTTATTTTATAGAAGTTATAGGGTGAAGTG GTCCACCGGTGATCCACTATCAGTTGTTGATATAATGATTTTTTAATTGATGATCCTGAATCAACAGCTATCAATAGTGA ATTTCTGGTGGACCACTTCAAAATTGGTCCACCCTATAACTCCGTAGCTATTTCATTGTACAAGACACAATATGTAGCCA AAATTAAGTACTCCTATGTTGCTTTTTATTCTAATGTGTAATTTTCTTCCTCAACCACTCTCATGACAGCCTGGCATTCT CAATGCGGAAAATGATGGCAGACAAAGCCTTGGTAAGTATCTTATCATTCTTCAACAATCACCGCAATATTCTTACTTCT AAGTTATATGCAACTATTTGTCATATTTAGTGTAAAAAGCTTTTCAAACAACGTTGCAGGTACGAAGGCTGTCAGCATGC GAAACTATGGGCTCTGCTACCACAATTTGCAGTGATAAAACTGGAACTTTGACCTTAAATCAGGTGGGTTCCATCGTTGG AGGATTGGATAGTCTAAGATGAATACCATGAGATATACTCCCTCCGGTCCTATTTATAAGCAACAAAAAAAAAATTCACA TAGTTTAAGAAATGTAGTTAAACTAGATAAAATGCATTAAATTTGTCTTAAATTAAAATGAACTTCCAAAATTACCCTTT GTTATTAGTGTTGGAAAGTGGAAAAGAAAGAGAATAATTAATGAGACACATTTTACAAGTTAGAATTAATAAGGGCATCA TTGGAAAAAATTAATTAATATAGCTCAAACTTTCATTTGGTTCTTATAAAAAGAACCAAGATTTTTCTTCTCTTTCATGC TTATAAATAGGACCGGAGGGAGTACATATTTTTGTTTCATTTCCATTTTTCTTTGAAAATGCTGGACTGCTATATGGTTG GGACAAGAACACATAACTAAAGCAAATATGGAAAAATAGAGAAGGAGCTCAGAGAACAGATCAGCAAGTCTATAATTTGC TTCAGTTGTTTGATAGACCCATTCTTGCACGTACAACGTATCCATCTTTTTGTTTTTCGGGGTCACATTATTGGTGCAAG CACATAAATATGAGAAGAGAGAGATGGCATAGTAAGGGATTGAATCTCATCCAATGCCAATTGAGCTATCCATAATTTTG TTCTAGGCACAATCTATACAATAGGTTACAAGCTATTTGTTCATTCTGTCCAACTGTTAGCTATATGCATTTTCTTCCTT CATTTTGTTTAAACTTGATTTATCAGCATTTGACTGTAGCTTACTTTTGGAATTATAGATGACTGTAGTTGAGACATATG TTGGGAGGAAGAAACTAAATCCACCAGATGACAAGTCAAAATTGCATCCAGAAGTTTTATCTCTGATAAATGAAGGCATA GCAGAAAATACAACTGGCAATGTTTTTGTGCCAAAGGTCCGTCTTTCATCTCCATTTTACTAACTATATCTAAGATTTCA TTTATGTTACCCAATGATCTTCTCAGTCTAATATTAACAGTTCTCATGGTTTTATTCGATTTACTGTTCGATAACAGAAT TATGATTGTCAAATAGACAAATGCATACTCATGCAACCACAGTATTTGGAATTCTAGATGCTTGCATGTGTGCATTTGTC TTCAATGATCTGCAACAATTCCAGTAGTACTTCATTACACGTTAGGTGCAATGAGGATAGCATGTAACTTACTAATAAGT ATCTGTTAATTCGGAAGATCTAGAATATAGTCGGATTTAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAGACCGTCCTACTAACAAGT TACAACTACGTTAAGATATCTGCAAAATGGACAACTAAGATAATTTTTACGCAGGGTTTTGAAACTTCAGAATTTGATTT TAAAAACAAGAGTTAAAAGTACCCACCAATTCGACGTACCTATTGCTCCAAATCACAAGGATTTCCCTTTGATGCGTGGT ATTATGAATGGAAAAAAAAGTAGATGTGAGGAGAGATTTTCTTACTCAAATGGGTTATTCCGTTTGACTTGATTAGTCGG AGCATAATGTGGTTTCCCGCTACCAGAACAAGGAGGGACAAAAATGTTAAAAATTGGGGTTTTGGTGTTACAATATATGT ATCCCTTCAAAGTTGTCAATATTAACCAATACCTTATATAAGCCAACAAATAATAAACAAATTGGATTTATTTATTTTCT TTCCCTAGTTTGAGATCGCTCTGGCCTTGTGAACGGTAATAGCATACAAATTGTTAGATAGTTCTTCACTGACCTTTTCC TGTACCTTTTAAGTGGTAAATTTCTGGTTTTTATTTCATCTATTTTATGTGATAGCATTTGCTTTGGTAGGATGGTGGAG AGACAGAGGTTTCAGGATCTCCTACTGAGAAGGCAATTCTTTCTTGGGCTGTGAAGGTACTCATGCTGAAAGTTTCCTAT CTTTTATTACTTTATGATTCCCCCTCCCCCATTGATTTTGAAACTGAACTCATTTATTGAATCCCCGTGGCAGTTGGGGG TGAATTTTGATCATATCAGATCAAGTTCAACTATTCTTCACGTCTTCCCCTTCAATTCTGAGAAAAAGCGAGGTGGTGTT GCTGTGAAACTGGTAATCACTAAGAAAATTGTTCACCAGTGTAATCCCTTTATTTATTGTATCATACAATATTATCAGAC ATAAATGTCTATCCCTTGTACTTTTAATTTTTTTACTCTCACTTAATCACTTTTGTTTAGTTTACAGATGGGGATCTTGT TTACTTTGCTATAATGGAACCATATCACGTTTATGTGTTTTCCGTCATCTTTCATATGCCAATCTGAAAATACTTATTAT AATTTTCTTGGCAGCCGGATTCTGCAGTACATATACATTGGAAAGGAGCTGCAGAGATAGTTCTCGGAACATGTACCCAA TATCTTGATTCCAATGGTGACCTGCAATCTATTGAAGAAGAGAAGGTTAGGAGCAGCAGCTTCAAGTTGTAGAAAGTTTG TTGAGGGAATTAAAATCATTAAACTGAACAAATGGAGATTAAGAAAAAAACATTTTCTCTTGGTTGATTAAACACATAGA ATAAGGCTACCACCTGATCACTTTATTCATATCAAGTATCAAGTATCAACATGGCTACACTATTGTTTCAAGTTTCACTA ATGCCGTCATATGCAAATATATATTGGTGCTACTTTCATTTTCCCAAAATCATAGAAACTGATAGCAAAGTTGGTAATAT TTTCAGAATTTTGGTAGGTATATAATATCTATTAGAAATCTTTACTCTTCAGGTATTCTTTAAAAAGGCTATTGATGACA TGGCTGCTCGGAGCTTGCGTTGCGTTGCCATTGCATATAGACCATATGAATTGGACAAAATTCCATCTAATGAGGAGGAT TTGAACAAGTGGTCCTTACCAGAACACGAGCTTATTTTACTTGCTATTGTTGGAATAAAGGTAAAACGCAAGCCTTTTTT TCCTGTTGCGATGGAAATTTGTTCGTATCACATTAGGTTCAATTTTCTGAAGGTATAAATATACTTTAAATATCACAGAT TTGCAATGAAACTCAAATTTTGAGCTTGAAAGTATTCTCTAATGCTGTAAATGATGTTATTAAATATTTTGTTAATGAGC TTATGCTTTTAAATCAACCACGTATTGTATAGTCCTTTATCTAACACCCTGTTCAGGATCCTTGTCGCCCTGGTGTCAAA GATGCTGTGAGGTTATGCACTGCAGCTGGCGTTAAGGTAATAAATATATCATTTTACATTAGACGAGTAAAGTTTTCATA TTGAATTATTGATCCAACACCAAGGGTCTTGGTATTTAGATTTCAGTTCATTAATGACAGTGTTGGAAGAGAACGTCACC TCTGACTTTATTATAACTTGCATGAGTGTTTATCCAAATCATGGGAACCCAACAACACATTGTACATATATGTTGATGAA CTCACAGGTACGCATGGTTACGGGCGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATAGCTCTGGAGTGTGGAATACTGTTTTCAG ATGAAGATGCAATTGAGCCAAATATAATTGAAGGAAAGACATTCAGACAACTATCTGAAAAAGAAAGGGAACAAGTAGCC AAGAAAATAACGGTATATATGGTTCATTCATTTTGAATTCTCGTTATATTCATTAACAAACCTAAAAGTATATGACTTAA TGTTATTCATGGATCCCCATCTACTACTAATTAATATTTAATCTATTTTCATAAGGGAAATCTTTGGATTGATGGAATGG GGGGGAATGAAATAGAATCACATTGTGTTCCGTTGTTTGAATTAGTTAAAAGGGAATAAAATTGAACACAATGGAGCCCA TTCCATTGTATCCCCTCATTTTTTTTCTTCCCTCCCAATTTTGGGGCATATGATGGAATAAATGGTGATTTTATTTCTAT AATTATGAAATTATATTTTTTTCCTTAGTTTTTAGTTATTCTCAAAAGATGTTATCTGAAGGGTTTTTAAGGTAAAGGTA ATAAAGAAATAAAAATAAGTTATAACTCGTTCCATCTAGTGTCCAAATAATTGAATGATATTTTTATTCTATTCCATCAT AAAATACCCAAATAATAGAGTGATATTTTTATTTCATTCTATTATGTTCCACTCCATTCATTATGATCCATTTCATTCTG TTCAATCTCGTTCCACGGATCCAAACATAGCCTAAAGGATCCCTCCATTTTAATATGTACTTATTATTTGCAAAATATAT AAAATTATATAGGTGATGGGAAGGTCTTCTCCAAATGACAAGCTTTTGCTCGTTCAAGCACTTCGTAAAGGTGGTGAGGT TGTTGCAGTCACAGGAGATGGCACCAATGATGCTCCTGCGCTTCACGAGGTTCGTATATTTCTTGCAAAAACTAGAAGAC TTAAAATACTTTTTAAATTTTTTATATCTCACTATGCTTCACTTGATTACTTAGATTTAAAATTTTCTCAAAAAATAATA AACTTCTATGGATAATTTTTTTTAAGAAAGGAATTTCCTTTAATACTTCTTTTCATTTTACTATTAAGTAGAGTGTTGGC TACTTAATAATGAAATGAAACATAAACCTAATAAAAACAATTTTGCAAATGAAAACAATGTATGACAAATTGTTTTAAAA ACATAAAATAACAGCCTTAATAAAAACTATGATATTCGAAGGATAAAAACACATTTAAAACAAAATATTATGAAGTTTTG TATTTTAAATACTATCATATGATGAACCTACTTGGAATGCATATATATTTGTGCACAAATAATTCATATATGTACGCTAT ATGTGTATTTCTATCTACGCACATATCAGAGTAGTTTGAATGTGCTTTTGTCTAGTCCATCTCTATTATGTCATTAGATG GAATGTATTTTTGACAAATTGCAATGTACATACACACACACCCATCATGTGTACATGTTGGATATTGTATAATAGATTGA CTTCACCATAAAGTCATAAACTGTTCTAACTGTGGAGAGTACAGTTCTCGATACTTTTAGATATTGCCCTAATGTGTTCG TGATTACTCTATGCCATTAGATTGACAACATCCTGTAATTGATAATAACTAGCTGATTATATGGTTGATATCGTGTTTTA CTATTTTGTATTTTAGGCAGATATTGGTCTTTCTATGGGCATTCAAGGAACTGAAGTTGCCAAAGAAAGCTCAGATATTA TAATACTGGATGATAACTTTGCATCAGTAGTAAAGGTAAGAATGCTAGTTGACTTCACATGCTCAAGTGAATAGTCATAC ATTTTTTTGACTCCAGCTTTAGATTTATGTTATATTGTTCATTTGTTCCATGTATTCCAAAGTTTTTCTGGATTTTCAAA TAGCTCATAACAGTTTAAATGTTTTTAATGTGGTTTCTGTACTTTTAAAAATCTTTAAAAAGGTTCTTACAGGATGACAA TCATGGTGCATTTCATAGTATTTCTAAATTTCAAATAACATTGAATAAAAATGTACAAACGATAAAATATTTAAAAAATT ACATACAAATTACAAATGAATCATGAAAGTAATACTTATTTAAATTGGGAAAAAAATATAAAAATAAAATTGTGACCTGC TATTATTTGTGTTTTTAGACTTAATAGTGTGTCAAACTATTTTTTTAGAGAACTAAAGTTTTTTTTAGCGAATTAAAAGA TTTTATTCATAAAATTGTGGAGGGGAAACCCCAACGAAAGAGAACTATAGACAAAACCCGGTAAGAGTGCGAAGGCAAAG TCCCCCCCCCCCAAAGAAAAAATACAGAAACCCCACCTAAGAAAGAGTGAGCTACAAAACCCCAAAAGAACACCCCGCCA AAGTCACCCCCAATAGTGTGTCAAACTTTAAGTTTATAAACTTAAATTTTTTAGTCATAAAGAGTTTTGATATTAAAAAT TTAAAAGTATATAATGTGGAATGTACACTTTTTTGCATTAAATGATAGTAGCTTCAAAAAGTTCTCATATCTAAAGGAAT TAAATTTAAAACGCTTAAAGTTGATTAAGATATGTTTACTCTAACTTATATATCATTTGATATTGATTGGAACTCATGTG GATTACACCAAATTTGGAGAGAACATACTAAATTGGGACGGCCTATATGATTTAGGGGATCCCTCATGACTTTTGACCAA AGTAAAAGAATGTATAAAAAGAGTGTTAGAAAGTTTGTTAGTGCTCTACTAGACCTATCAATTTGACCACTATTTTGTTA CTTTCATTTTGTGTATCATTTAATTGAGTGTGACCCACCATGGTCAAGAAACATGCTAACTCTCAAGCTGTACAATTGTC TAAATTGTCTAAGATGTGTATTTACTCAATTTGTGTAGGTTGTTCGCTGGGGGCGTTCTGTTTATGCAAATATTCAGAAA TTTATTCAGTTCCAGCTCACTGTTAATGTTGCTGCTCTTGTAATCAATGTTGTGGCTGCAATATCTTCTGGTGATGTTCC TTTAAATGCAGTACAGGTAACCGCCCTCTTTCGTTAATTATTACACTCTTGTACTTGTATGTATGATTCAAACTACATTA GAATAATCTCTGTTTTACTTGTCTGTGGCTATAGCTTTTGTGGGTCAACCTCATCATGGACACACTTGGGGCTCTTGCAC TGGCTACAGAACCACCAACAGACCGCCTTATGAAAAGATCACCAGTTGGCCGAAGGTTTGACTTGACTTTTTTACCCAGC TTAAGCTTAATATTTAGGGAGCGATTGGGCAAACAACTTAATTAAGCGCTTACGGCATTAAACGCTTATGTGATAAGTGC TTATGTGGTCACATTTTCTTTTTAAAATTTGAGGCACCAATAGTGCTATAAACGGTTGATTTTGGCTTAGAATTAACGTT TGTGTGCGCGTTTTCACTATGTTTTTATTATGTTTGGCTTTCAGGGAACCTCTTATAACAAACATTATGTGGAGGAACTT GATGGTACAGGTAAAATCTAATTTATTCTATGCAGAGACTTGTTAATGTCATCATTGAATTGGAAACATAGGGAACTTCA GATATTAAGACTTAAATGAATATTTGATTTTTTGCTGCAGGCCCATTATCAAGTAATTGTTCTTCTGGTTCTTAACTTCT GCGGTGAAAGTATACTACATCAAGATTCTCAAACACAGACCATACAATTGAAGAATACTTTAATTTTCAACACATTTGTC ATGTGCCAAGTAAGTACATCATACATGTTAATGAAAATATAAGATATTTGGCTGGCCCTAACATTAGGGAAGCCACTATT TAATGCCTTCGCTTATTATTCTATGAGTGTAGTTTCTCCATGGTTGATGGCTTGAACCCATGTAAGTGTGTAACCGCCTC AGACATCTTATATGAGATGTCTTTTTAATTGTCATGGCAAAATCTAATTAGTAGGGCAGAAAATGAGACACAAATTAGGG ACAAAAGATTTTCATTCCTCTTACCAAGATACCGCCTTCAGACACCTACATTAGATGTCTTTTTAATTGACATGACTACA ATTTAATTGGCAGGACCGAAACTGGAATACAAATTAGGGAAAGAAGATTTTCATCCCTCTTATTTAATAAGGCCACGAAA TATAGATTAGTATAGAATTTTGCTATATTTGCTAGAATGTCATAATTTCATATTTGCTAGAATGTTATAGTCTAATTAAT CAGTATATTATTTAACAGGTTTATGATGTTTTCAATTTACAGATATTCAATGAGTTCAATGCTCGAAAACCAGAAGAAAT GAATGTATTCCGGGGAGTGACTAAGAACCGTCTCTTTGTGGGAATTGTTGGAATGACCTTCGTACTTCAGGTGAATAGGC ATCCCTCTTGTTATCTGTATGCTTAATTGTCAACATTTAAGTGCATTTCTGACTTTGAGTCAAATTGTTAGATAATCATC ATCGAGTTCCTTGGAAAGTTCACGAGTACAGTTAGGCTTGATTGGAAGTTGTGGCTTGCTTCTCTCTGTATTGGGCTTTT CAGGTTAGGTAACTCACCTGCAATAGGTTGATTATGAACACTCTCATGGTTATCGGGAGTTCTTGATCGGTTCTCATTTT ACTCTATGATAACCAGTTCTACCGTCTTAA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0000800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACGTCGACGTCACGAGGTTCCTCCTCCTCCTCCAATGGCCTCCTCCCCGTCACCATCACCAGTAACCACCCTGACGT CGACGTCTCAACTAATGGCGACCACTATGATGACGACGACGACGACGACTTGCTCGTTGATCCAAACGACCCTTTCGACA TTACCCAGACCAAGAATGCACCTCCCGAAACCCTCAAGCGTTGGCGACAAGCAGCATTCGTGCTCAATGCCTCCAGGCGT TTTAGATACACTCTTGACTTGAAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGCAAAAGAAAAGCATGATTCGAGCCCACGCGCAAGTCAT AAGAGCAGCTTTGCTTTTCAGATTAGCTGGTGAACGCGAACTAGTGACAAGTACAACAGTGTCATCCTCAACTCATGATG GTGACTATGAAGTTGGGCTTGAACAACTTGTTTCGTTGTCTAAGAATCAGAATATTTCTGCCTTACAACAATATGGTGGG GTTAAAGGATTATCAAAATCACTAAAATCAGATCCGGATAAAGGAATTAATGGAGATGATGTTGATCTATTAAAGAGGAA AAATGCATTTGGAACTAATACATATCCTCGGAAAAAAGGGAGAAGTTTCTGGAGGTTTCTATGGGAAGCTTGGCAAGACC TGACCCTTATAATATTAATTATAGCAGCTGCGGTGTCTTTGGTTCTTGGAATAAAAACAGAGGGTTTGGAAGAAGGATGG TATGATGGGGGAAGCATTGCGTTCGCAGTTCTTCTTGTCATAGTAGTTACAGCTGTCAGTGATTATCGCCAATCTCTGCA GTTTCAGAACTTGAATTCAGAAAAGCAAAATATACAATTGGAGGCTATTAGAGGTGGCAGAACAATAAAAATATCGATAT TTGATATTGTTGTTGGCGATGTAGTACCCCTTAAAATAGGAGATCAGGTTCCTGCTGATGGAGTTTTAATCACTGGTCAC TCACTTGCCATTGATGAATCCAGTATGACTGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCACAAAGCACCTTTTTTTATGTC TGGTTGCAAAGTAGCAGATGGATTTGGTGCTATGCTGGTAACCGGTGTTGGTATAAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGG CAAGTATCTCAGAGGATACTGGAGAAGAGACTCCATTACAGGTGCGTTTGAATGGAGTAGCAACTTTTATTGGTATTGTT GGGCTTTCTGTAGCTGTTTTGGTGCTTGCAGTCCTCTTGGGAAGATACTTTTCTGGCCATACGAAAGATTTAGATGGAAA TGTGCAATTTATTGCCGGCAAGACTAGTATTAGTGACGCAGTAGATGGGGTCATCAAAATTTTTACCATTGCAGTAACAA TTGTGGTTGTTGCTGTGCCTGAAGGCCTACCTTTAGCAGTTACCTTAACCCTGGCATTCTCAATGCGGAAAATGATGGCA GACAAAGCCTTGGTACGAAGGCTGTCAGCATGCGAAACTATGGGCTCTGCTACCACAATTTGCAGTGATAAAACTGGAAC TTTGACCTTAAATCAGATGACTGTAGTTGAGACATATGTTGGGAGGAAGAAACTAAATCCACCAGATGACAAGTCAAAAT TGCATCCAGAAGTTTTATCTCTGATAAATGAAGGCATAGCAGAAAATACAACTGGCAATGTTTTTGTGCCAAAGGATGGT GGAGAGACAGAGGTTTCAGGATCTCCTACTGAGAAGGCAATTCTTTCTTGGGCTGTGAAGCCGGATTCTGCAGTACATAT ACATTGGAAAGGAGCTGCAGAGATAGTTCTCGGAACATGTACCCAATATCTTGATTCCAATGGTGACCTGCAATCTATTG AAGAAGAGAAGGTATTCTTTAAAAAGGCTATTGATGACATGGCTGCTCGGAGCTTGCGTTGCGTTGCCATTGCATATAGA CCATATGAATTGGACAAAATTCCATCTAATGAGGAGGATTTGAACAAGTGGTCCTTACCAGAACACGAGCTTATTTTACT TGCTATTGTTGGAATAAAGGATCCTTGTCGCCCTGGTGTCAAAGATGCTGTGAGGTTATGCACTGCAGCTGGCGTTAAGG TACGCATGGTTACGGGCGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATAGCTCTGGAGTGTGGAATACTGTTTTCAGATGAAGAT GCAATTGAGCCAAATATAATTGAAGGAAAGACATTCAGACAACTATCTGAAAAAGAAAGGGAACAAGTAGCCAAGAAAAT AACGGTGATGGGAAGGTCTTCTCCAAATGACAAGCTTTTGCTCGTTCAAGCACTTCGTAAAGGTGGTGAGGTTGTTGCAG TCACAGGAGATGGCACCAATGATGCTCCTGCGCTTCACGAGGCAGATATTGGTCTTTCTATGGGCATTCAAGGAACTGAA GTTGCCAAAGAAAGCTCAGATATTATAATACTGGATGATAACTTTGCATCAGTAGTAAAGGTTGTTCGCTGGGGGCGTTC TGTTTATGCAAATATTCAGAAATTTATTCAGTTCCAGCTCACTGTTAATGTTGCTGCTCTTGTAATCAATGTTGTGGCTG CAATATCTTCTGGTGATGTTCCTTTAAATGCAGTACAGCTTTTGTGGGTCAACCTCATCATGGACACACTTGGGGCTCTT GCACTGGCTACAGAACCACCAACAGACCGCCTTATGAAAAGATCACCAGTTGGCCGAAGGGAACCTCTTATAACAAACAT TATGTGGAGGAACTTGATGGTACAGGCCCATTATCAAGTAATTGTTCTTCTGGTTCTTAACTTCTGCGGTGAAAGTATAC TACATCAAGATTCTCAAACACAGACCATACAATTGAAGAATACTTTAATTTTCAACACATTTGTCATGTGCCAAATATTC AATGAGTTCAATGCTCGAAAACCAGAAGAAATGAATGTATTCCGGGGAGTGACTAAGAACCGTCTCTTTGTGGGAATTGT TGGAATGACCTTCGTACTTCAGATAATCATCATCGAGTTCCTTGGAAAGTTCACGAGTACAGTTAGGCTTGATTGGAAGT TGTGGCTTGCTTCTCTCTGTATTGGGCTTTTCAGGTTAGGTAACTCACCTGCAATAGGTTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0000800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTSTSRGSSSSSNGLLPVTITSNHPDVDVSTNGDHYDDDDDDDLLVDPNDPFDITQTKNAPPETLKRWRQAAFVLNASRR FRYTLDLKKEEEKEQKKSMIRAHAQVIRAALLFRLAGERELVTSTTVSSSTHDGDYEVGLEQLVSLSKNQNISALQQYGG VKGLSKSLKSDPDKGINGDDVDLLKRKNAFGTNTYPRKKGRSFWRFLWEAWQDLTLIILIIAAAVSLVLGIKTEGLEEGW YDGGSIAFAVLLVIVVTAVSDYRQSLQFQNLNSEKQNIQLEAIRGGRTIKISIFDIVVGDVVPLKIGDQVPADGVLITGH SLAIDESSMTGESKIVHKDHKAPFFMSGCKVADGFGAMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPLQVRLNGVATFIGIV GLSVAVLVLAVLLGRYFSGHTKDLDGNVQFIAGKTSISDAVDGVIKIFTIAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAFSMRKMMA DKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTLNQMTVVETYVGRKKLNPPDDKSKLHPEVLSLINEGIAENTTGNVFVPKDG GETEVSGSPTEKAILSWAVKPDSAVHIHWKGAAEIVLGTCTQYLDSNGDLQSIEEEKVFFKKAIDDMAARSLRCVAIAYR PYELDKIPSNEEDLNKWSLPEHELILLAIVGIKDPCRPGVKDAVRLCTAAGVKVRMVTGDNLQTAKAIALECGILFSDED AIEPNIIEGKTFRQLSEKEREQVAKKITVMGRSSPNDKLLLVQALRKGGEVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLSMGIQGTE VAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGAL ALATEPPTDRLMKRSPVGRREPLITNIMWRNLMVQAHYQVIVLLVLNFCGESILHQDSQTQTIQLKNTLIFNTFVMCQIF NEFNARKPEEMNVFRGVTKNRLFVGIVGMTFVLQIIIIEFLGKFTSTVRLDWKLWLASLCIGLFRLGNSPAIG 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 29 29 -
Phobius 1 205 205 -
MobiDBLite 1 61 61 -
MobiDBLite 33 48 16 -
Pfam 49 92 44 7.3E-16
PANTHER 57 580 524 0.0
PANTHER 57 580 524 0.0
Gene3D 60 115 56 2.9E-30
SMART 157 231 75 1.7E-4
SUPERFAMILY 158 1024 867 1.96E-117
Pfam 159 226 68 2.2E-13
TMHMM 206 228 23 -
Phobius 206 231 26 -
Phobius 232 242 11 -
Phobius 243 262 20 -
TMHMM 243 260 18 -
PRINTS 244 264 21 4.5E-8
Phobius 263 392 130 -
Gene3D 277 366 90 6.8E-23
Pfam 280 479 200 1.2E-35
SUPERFAMILY 280 374 95 8.63E-23
PRINTS 325 339 15 8.3E-35
TMHMM 355 377 23 -
Gene3D 367 520 154 7.1E-35
TMHMM 392 414 23 -
Phobius 393 417 25 -
Phobius 418 446 29 -
TIGRFAM 438 531 94 8.6E-23
Phobius 447 473 27 -
TMHMM 447 469 23 -
Phobius 474 834 361 -
SFLD 483 827 345 0.0
SFLD 483 827 345 0.0
PRINTS 494 515 22 4.5E-8
Pfam 498 789 292 1.7E-18
SUPERFAMILY 499 880 382 1.65E-56
PRINTS 501 515 15 8.3E-35
ProSitePatterns 503 509 7 -
TIGRFAM 578 1025 448 5.2E-166
PANTHER 582 1024 443 0.0
PANTHER 582 1024 443 0.0
Gene3D 584 675 92 1.4E-124
PRINTS 668 679 12 8.3E-35
Gene3D 676 820 145 1.4E-124
PRINTS 690 700 11 8.3E-35
TIGRFAM 741 855 115 9.6E-32
PRINTS 775 794 20 8.3E-35
PRINTS 799 811 13 8.3E-35
Gene3D 821 1023 203 1.4E-124
Phobius 835 855 21 -
Phobius 856 866 11 -
Pfam 860 1024 165 4.4E-44
Phobius 867 884 18 -
Phobius 885 981 97 -
Phobius 982 1002 21 -
TMHMM 982 1004 23 -
Phobius 1003 1013 11 -
Phobius 1014 1032 19 -
Phobius 1033 1033 1 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleotide binding Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose.
Molecular function Calcium-transporting ATPase activity Enables the transfer of a solute or solutes from one side of a membrane to the other according to the reaction: ATP + H2O + Ca2+(cis) = ADP + phosphate + Ca2+(trans).
Molecular function Calmodulin binding Interacting selectively and non-covalently with calmodulin, a calcium-binding protein with many roles, both in the calcium-bound and calcium-free states.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.
Biological process Calcium ion transmembrane transport A process in which a calcium ion is transported from one side of a membrane to the other by means of some agent such as a transporter or pore.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0000800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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