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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0147300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0147300.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glucan synthase-like protein; TAIR: AT3G14570.1 glucan synthase-like 4; Swiss-Prot: sp|Q9LUD7|CALS8_ARATH Putative callose synthase 8; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SK62|A0A0S3SK62_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0147300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:19781911..19800850) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGATGGAGATTGTGCCTGCAGAACCGATTGAGGGCATATATTTTGAGCAAGGAGAGTCCTCTACAGCGAGAAGCCATGA CCCCTTGGCCATTACCAGTGTCAGTAACAGCGGCGGCGACGTTGGTTATGTTCCAGGACCCTTTGATAGTGAAAGGTTGC CAACAGTTTTCGCTTCCGAAATAGAAAGGTTCCTTCGTGTGGCCAACTTGGTTGGGAAGGAGGAACCTCGTGTTGCTTAT CTGTGTGAGTCATTTTTCTTTTCTAGGTTTTCTATTCTGGGTGTATATATTTTTTTTTTTTACAAAAATGTTCGAAATGA TAGAAAACACTTCAGACTACGGGATAGGACGCCAGTGGCCAGCAGAGGCCCACTCTTGGGTAGGAGTACCAGGGATTTTC TCGAGAAGGGTTGCCCACCAATTGAGATTTTACTTGATGTAGGGGGATTCGAACCCTCAACCTATGAGGATGTGAGAGTT GAACCCGAAACATGTGGCTAGTTGTGCCAACCCAAGTTAGCCGGGTGTATATATATGTTATGGAAGTCCCTCTGCAACTG ATTATTTTTTTTAAGTATTTGGGGTTTCTTGTTTTTTTGGTTGTGTATGTTGATTGAGTTATATGCTAGATTATGGCTAC AAAATAAATTTTTCATTAAAGGCTAGTTTTGCCTTTTTATAACCTTAATTATGGTAGTTAAAGAAAAATGTAGTTGAAAA AGAGGCTCAATTTATCCAATTACCTTATTCTTGGTGAAGAAATTGCATCAAGACACAAACAGTCATGATGAAGGTTTAAA ATACACGGGAAAAGGAGAATTGCATCCATGATCCATGCAGTTCTGTGCTCTCAATTTCAAGATGTTAGTGTCTATTCTTG TCTATTCTCTTCTTCAATTGGCAAACAGTTGTACATTGTAAGAGTGCAAAGTTTAAGTGTTTCCATATCACTTTATTTTA 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CTCAACAAAGTAAAAGCATGATTTTGATGCAGGCTGTGAACCTGGGAAGGCAACTGCTAAGTGCTAATTATCAGCTTGGA TTCAGATTTTTCAAAGCATTCCTGTTCATTGGTGTTATTGCCCTCATAATTACTCTTTCCTTTATATATCAACTTTCATC GATGGACCTTTTTGTTTGCTGTCTGGCATTCATGCCAACTGCATGGGGATTGATAATGGTAATAATCTTTAGCAACCCTT TTTTTTAACATATCTTTAGCAACCTTGGATGAGCTAAATTGTCACCTTTTTTAATTTGTTCCTTGCTTTTTCCCTGTGAG GCTGTGACTTAATCCATGTAGGAGGCCATTTGAATACGGACTTATTGAAGCTTATGTATAAGAAAAAACACTGTATAAGC TCTAACAAGTGCTCTTTGTCTTACATCCAAGCGGGTTCTAATTAATATATTTTGGTGGTTCAGATAGCACAAGCTGCAAG GCCAAAGATAGAGCATACAGGATTGTGGGACTTCACCCGTGCACTTGCTAGAGAATTTGACTACGGAATGGGGATAGTTC TTTTTGGACCTATAGCTATTTTGGCATGGCTACCAATCATTAAAGCCTTCCATGCTCGTATCCTCTTCAACGAGGCATTC AAAAGGCACTTGCAAATCCAACCAATTCTTGCAGGAAAAAGGAAGAAGCACAGAACTTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0147300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGGAGATTGTGCCTGCAGAACCGATTGAGGGCATATATTTTGAGCAAGGAGAGTCCTCTACAGCGAGAAGCCATGA CCCCTTGGCCATTACCAGTGTCAGTAACAGCGGCGGCGACGTTGGTTATGTTCCAGGACCCTTTGATAGTGAAAGGTTGC CAACAGTTTTCGCTTCCGAAATAGAAAGGTTCCTTCGTGTGGCCAACTTGGTTGGGAAGGAGGAACCTCGTGTTGCTTAT CTGTGTCGAGTTCACGCCTTTGTAGTTGCGCACAACTTGGACAAAAATTCTAGTGGAAGGGGTGTTAGACAATTCAAAAC TTCACTCCTTCATAGACTTGAACAGGATGAGAGAGTTACAAAAAGGAAGGGGAAGAGTGACATTCGTGAACTTAAGGATG TTTACCATGCCTATAGGGATTATTTTATTAGACATCATCAGGCATTCGATCTAGAGCAAAGTCGTAGGGAGAAATTGATA AATGCACGGAATATTGCTTCTGTTCTATTTGAAGTACTCAAAACAGTTACGGATACAGCTAGTTCTCAGGCATTTATTGA AGGGAAAGCAATCCACAAAAAAACTGAGTTTAACATTCTTCCACTTGAGCAAGGAGGCATTCAGCATGCAATTATGAAGC AGCCTGAGATTAAGGCTGCCATTGCAGTTATTCGCAATGTTCGTGGTTTGCCCCCAGCTCAAGATTTCAAGAAACATGGA GCCTTTGTAGATCTGTTTGATTTTCTTCAGCATTGTTTTGGATTCCAGGAGGCCAGTGTTGCAAACCAAAGGGAACATCT TATTCTACTCCTAGCCAACATTCAGACTCGGCAAACTCACAACCAGACATCTGTTTTGAAGTTAGGAGAAGGAGGCGTGG ATGAACTTATGAGGAAGTTTTTCAAAAATTATACCAACTGGTGCAAGTATTTGGGAAGAAATAGCAATATCCGCTTACCT TTTGTCAAACAGGAAGCCCAACAATACAAAATTTTGTATATTGGCCTTTACCTGCTCATATGGGGGGAGGCAGCTAATTT ACGGTTCATGCCAGAGTGTCTCTGCTATATCTTTCACCATATGGTGTATGAATTGCATGGAGTTTTAAGCGGTGCTATCA GCTTAACAACATGGGAAAAGGTCATGCCTGCATATGGAGGAGAACCAGAGTCTTTCCTTAATGATGTTGTCACCCCCATA TACGAAGTTATAAGAAAGGAAGTTGCCAATAGCAAAGGCGGGACAGCTGATCATTCTGCATGGAGAAACTATGATGATCT GAATGAGTATTTCTGGTCCCCTGATTGTTTCAAAATCGGTTGGCCCATGCGTCTGGACCATGATTTTTTCGAAGTAAAAT CTGTAAAGAAACCCGATGTCAAGAATGCTCTTGTTGAATCACCTGGTGATAGAAAAGAAAAGAAGAACGAAGAAGCAGAG GTGTCAGTGGGAAAGGATACTGGGGACGAAAACCACGAACCACAATGGCTGGGAAAGACAAATTTTGTAGAGATTCGCTC ATTTTTGCAAATATTTCGAAGCTTTGATAGAATGTGGAGTTTTTATATTTTATCCCTTCAGGCCATTATAATCATCGCTT GCCATGACGTGGGATCTCCACTTCAGTTGTTTGATACCACAGTATTTGAGGATATAATCAGCGTCTTTATCACCTCTGCA TTTCTTAAACTTCTTCATGCAATTTTAGACATAGCTTTTACATGGAGAGCGAGATGTACCATGGAATATTCTCAAAAAGT GAAACTTGTGATGAAGCTGGTCTTTGCTGTTATATGGAATATTGTTCTTCCCCTTTGCTATGCTAACTCAAGAGGAAAAT ATACTTGTTATTCCACAAAGTCTGGAACCAGGGTTGAGGAATGGTGCTTTACTTCCTACATGGTTGCTGCTGCAATATAC TTGACGAGTAATGCCGTTGAATTGGTTTTATTTTTTGTCCCTGCTGTGGCCAAGTATATTGAGGTCTCTAATTACCAGAT ATGCAAAGTTTTGTCTTGGTGGATTCAGCCTAGAATCTATGTTGGACGGGGGATGCAAGAAGACCAGGTTTCAGTTTTAA AGTACACAGTGTTTTGGGTATTGGTGTTATCATGTAAATTTTTGTTCAGCTACAGTTTTGAGATTAAACCACTTATAAAA CCAACTAGACAGATTATGAAAATTGGCCAACAATATGAGTGGCATGAGCTTTTTCCAAAAGTCAAAAGTAACGCTGGTGC AATTGTGGCCGTATGGAGCCCTGTAGTAATTGTATTTTTTATGGATACACAGATTTGGTATTCTGTTTTCTGTGCAATAT TTGGTGGACTTTATGGAGTTTTGCATCACCTTGGTGAGATAAGAACCCTAGGAATGCTGAGAAGTCGATTTAACTCCTTG CCTTCAGCATTTAATGTCTGTCTGAACCCACCTTCGTCCAAACGCGGTAAAAAGAAAAGAAAAGGTCTCCTCAGCAATAT ATTTCAAAAGGTGCCTGATGAAAAAAATGCTACTGCCAAATTTGTGGTGGTATGGAATCAAATTATATACCATCTTCGTC TTGAAGACTTGATTAGTAACAGAGAGATGGATTTAATGATGATGCCTGTGTCTTCAGAATTGTTTTCTAGGAAGGTTCTT TGGCCTGTTTTTCTCTTGGCAAATAAGTTTTCTACAGCTTTGACCATTGCTAAAGATTTTGAGGGAAAGGATGAAATTCT TGCCAGAAAAATTACAAGAGACATATACATGTTCTATGCTGTAAGAGAGTGCTACCAGTTACTGAAATACGTCCTTGAGA TTCTTATTGTGGGTAGCATGGAGAAAAGGATCATATTTGATATACAAAGTGAAATTGAAAAATGTATTGAAGAATCAAGT CTACTGAAGAACTTCAACTTGAAAGTTCTCCCAGATCTACATGCAAAGGTCATTGAGCTAGCTGAACTCCTGATTGAGGG AGATAAAGACCAGCAGCACAAAGTCGTGAAAGCTTTACTAGATATGTTGGAACTTGTAACAAATGATATGATGACTGATT CCAGAATATTGGATATGTTTCACTTTCCTCAACAAAGTGAGCGTGGGTTTGTCTATTTTAGAGATGATGATCAACTATTT GTCAATGATGAAACGAATAGTGGATTCTATCCATTTGCCAATGAGAATTCTATCCATTTTCCCTTGCCAGAAAGTGGCCC TCTCATGGAAAAGGTGATCAAGCGTTTTCATTTGTTGCTTACTGTCAAAGATACAGCTTTGGACGTGCCGGCAAACTTAG ATGCTCGTAGGCGCATATCATTCTTTGCTACTTCTCTGTTTTCTGATATACCAGACGCTCCAAAAGTGCTCAATATGCTG CCTTTTAGTGTCATGACTCCACACTACATGGAAGACATTAATTTTTCAGTGAAGGAGCTTGGTTCAGATATAGAGCAGGA TTCCATCATCTTTTACATGCAAAAGATATTTCCAGATGAATGGAAAAACTTTATGGAACGTATGGGTTGTGAAAATCCCC AGAGTTTAGAAGATGAACTCAAGACAGAAGAGCTTAGACTGTGGGCTTCATTCCGGGGCCAGACACTGAGCAGAACAGGT TCATTAGAGGGATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0147300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMEIVPAEPIEGIYFEQGESSTARSHDPLAITSVSNSGGDVGYVPGPFDSERLPTVFASEIERFLRVANLVGKEEPRVAY LCRVHAFVVAHNLDKNSSGRGVRQFKTSLLHRLEQDERVTKRKGKSDIRELKDVYHAYRDYFIRHHQAFDLEQSRREKLI NARNIASVLFEVLKTVTDTASSQAFIEGKAIHKKTEFNILPLEQGGIQHAIMKQPEIKAAIAVIRNVRGLPPAQDFKKHG AFVDLFDFLQHCFGFQEASVANQREHLILLLANIQTRQTHNQTSVLKLGEGGVDELMRKFFKNYTNWCKYLGRNSNIRLP FVKQEAQQYKILYIGLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIFHHMVYELHGVLSGAISLTTWEKVMPAYGGEPESFLNDVVTPI YEVIRKEVANSKGGTADHSAWRNYDDLNEYFWSPDCFKIGWPMRLDHDFFEVKSVKKPDVKNALVESPGDRKEKKNEEAE VSVGKDTGDENHEPQWLGKTNFVEIRSFLQIFRSFDRMWSFYILSLQAIIIIACHDVGSPLQLFDTTVFEDIISVFITSA FLKLLHAILDIAFTWRARCTMEYSQKVKLVMKLVFAVIWNIVLPLCYANSRGKYTCYSTKSGTRVEEWCFTSYMVAAAIY LTSNAVELVLFFVPAVAKYIEVSNYQICKVLSWWIQPRIYVGRGMQEDQVSVLKYTVFWVLVLSCKFLFSYSFEIKPLIK PTRQIMKIGQQYEWHELFPKVKSNAGAIVAVWSPVVIVFFMDTQIWYSVFCAIFGGLYGVLHHLGEIRTLGMLRSRFNSL PSAFNVCLNPPSSKRGKKKRKGLLSNIFQKVPDEKNATAKFVVVWNQIIYHLRLEDLISNREMDLMMMPVSSELFSRKVL WPVFLLANKFSTALTIAKDFEGKDEILARKITRDIYMFYAVRECYQLLKYVLEILIVGSMEKRIIFDIQSEIEKCIEESS LLKNFNLKVLPDLHAKVIELAELLIEGDKDQQHKVVKALLDMLELVTNDMMTDSRILDMFHFPQQSERGFVYFRDDDQLF VNDETNSGFYPFANENSIHFPLPESGPLMEKVIKRFHLLLTVKDTALDVPANLDARRRISFFATSLFSDIPDAPKVLNML PFSVMTPHYMEDINFSVKELGSDIEQDSIIFYMQKIFPDEWKNFMERMGCENPQSLEDELKTEELRLWASFRGQTLSRTG SLEG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 518 | 518 | - | – | |
| PANTHER | 41 | 1199 | 1159 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 41 | 1199 | 1159 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 49 | 197 | 149 | 6.6E-9 | ||
| Pfam | 61 | 181 | 121 | 9.7E-11 | ||
| SMART | 328 | 444 | 117 | 1.3E-74 | ||
| Pfam | 330 | 442 | 113 | 1.7E-38 | ||
| MobiDBLite | 465 | 493 | 29 | - | – | |
| TMHMM | 518 | 540 | 23 | - | – | |
| Phobius | 519 | 541 | 23 | - | – | |
| Phobius | 542 | 552 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 552 | 574 | 23 | - | – | |
| Phobius | 553 | 577 | 25 | - | – | |
| Phobius | 578 | 588 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 589 | 608 | 20 | - | – | |
| Phobius | 589 | 610 | 22 | - | – | |
| Phobius | 611 | 629 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 629 | 651 | 23 | - | – | |
| Phobius | 630 | 653 | 24 | - | – | |
| Phobius | 654 | 691 | 38 | - | – | |
| Phobius | 692 | 713 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 695 | 713 | 19 | - | – | |
| Phobius | 714 | 764 | 51 | - | – | |
| TMHMM | 765 | 787 | 23 | - | – | |
| Phobius | 765 | 784 | 20 | - | – | |
| Phobius | 785 | 1204 | 420 | - | – | |
| Pfam | 1089 | 1177 | 89 | 1.8E-23 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
| Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
| Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0147300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…