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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0314300 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0314300.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Cytosolic purine 5-nucleotidase; TAIR: AT5G48960.1 HAD-superfamily hydrolase, subfamily IG, 5'-nucleotidase; Swiss-Prot: sp|Q54XC1|5NTC_DICDI Cytosolic purine 5'-nucleotidase; TrEMBL-Plants: tr|G7JR10|G7JR10_MEDTR Cytosolic purine 5-nucleotidase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0314300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69084538..69094356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATCCAAATCCAAAATCCAAAAAGAAAAAAAAAATACTAGATTCTGTGTCAGTGTTCTATCTTCCACGACCAAGTCTCA CTCACTCACACTTTCACTTTCACTTTCACTTTCAGTGTTCTCCGACACACATTCATTCTCCTTTTACTTTGCTCCATCCA ACACATGTATGCGGCGGAGCTTCTCAGCATCTTCGCCGTGCACGGCGGAGGAGATGCCACGCTCTCAGTTACCGCCGCCG CCGCCGCCAACAACAGATTTTTCAAAACCTCAGCTTTCACGACACCCACTTCCCACAACGCTGCGAATGTGAGGCTGGCC AAGGCATTGACGCGTTGTCGCTGCACCGTTGACTCCAAGCCCGTCGGCGGCGACGTTTTCTCTGTGACGCCGCCGAACAA GTATGACGTGGATTACCTCGGCGAGAGCACCAAAGGGGATTTGAATGTCAAGTTGGAGCATCTTGAGGCTTTTGGTAAAT TTTGAAACTTTTCAAAATTCCCAGTTTGGTCCTCAGTTTTATTCTCAATTCGGTTTTAGACTTTATTTGTTGCTTGTGGT TTTCGGTTTGTTGTTGTGTTGCTTAATAGCTTGATTGCTTACAGGAACAAGACATTGAACAATATTGCTGTTCATTTATG TGCTAAAAAACATAGCTTGGACCAGATTCATTTGTTTGTAGCACAACCAACTATACTATGCTACATTATTTTTACCTTTA TTTTAATATTTGCTTAAAAATGATGAATATAATACTTATGGTTACAAAAATATCAAATTGCTTTCATTTATTGTTTTTGA AGATTTTATTTTCATCCTTTCATGGACTAATTTTTGAAAACAGAAATAAAGTGAGAACAAGGTGATGTTTTTGTGTTAGT AAAAGCAGAAAATGTTTACTCAAACTAAATATGTACTTAATTTCTCTATGAATATTAATGTCCTTTGTAATATTTACAAA ATATCAGTCATAATTACGGATATGGCTTTCGTAATTTTGTGATAACAAGACAAATATTGGTCTCCACTCTCCTCCATTGT AGGAATTGATGGGCAGGCGATTGAGGAAGTGGCCAGAGCAGAGGCAAGAGAAGCAGAAGACTTGCTAAAAGACCTCGGTA TTCCGGTGCAGTAAACTCACTCCCTCTGCTTACTTGCTCCTTTTCTAGTTAGTTGATATTTTTGGTTTGGAATATAGTGG TCTACACTTGTGTCTTCTATGGTATTAGTTGGCGAACAATTATTAGTGTATGTAGTGGCTTCTGTGTACTACTCCCTCCG TTCCTATATATAAGTCACAAATAACTAATTCTCTTAGATTAAGAAAAGTAGTTACTAGTAATAAATTTGTAAAAAAAAAT GATTTACTTTCCTAGATTACCCTTATTTACTTTCCTATAATTTTCTCTCTCCAAGTTAATATTCTAAAGTTTATCATCTC TTTCATATTAAATATGAGGGTGAACTTGGAAAAAATTATTTAATGCTTCCTAGATATTAGAAAATGACTTATATTTTGTA ACAATTTTTTTTCAAAAAATGTGACTTATAATAGGGAACGGAGGGAGTACTATATGGACTTTTGTACTAATCTTCCTCCT TATCAAAGCAGCCTCTTAAAATAGGCATTGAGGGATAATGGAGAATGGATATTAGTATTACATATACCATAAGTTCTCAT TTTGTGAAGATGCATGCTTTATATTTAAGCTAAGCCTCTGAGTGTCAAGTTATAAAGGAAATTTCACCATCCTGAACCTA GGTTTACAAAACCTGCGTAAACAACCTATCTAGTTTGAGAAATTGCGTTGCCATTTCCTCTTTTAAATATCTGTTGGAGT CCTTCATTTACAATGAACATAGATTGTGTTTGCAAAGGTTTCATAAACGTCTTCAAAGGTTGATACTTTATGTAATCCGC TTTATCATTTACTTATCTCCTTATCATTATATCCCCTTCCCCTAGCTGATTTTATTTTTCCCTTTGGGTCATACTAGTGT CAAACTTGCATGTGAATGTGTTATGTCAATATCTTTCTGACACGCAACAGCCTACTATTTACTTCACCACTTGTTATTTT CTTCATCTCATTATTGTTTCTGACTATCACTCTGATTTTGTCATATGCTATTTTTGCTAGCGTAGTTTGATGTCCAGAAA GTAAATATCACTGTTATGTCCTTATGTAGAGCCCTTCTTCGTCCAGAAATTCACCTCGTGGAATATTCTGCACCCGTACA TTGAATCTGCGGTCGATCAGTGTAATTGGATATGACATGGACTATACTTTGGTCCAGTATAATGTGAGGGTATGTCTCTG TTCCATGTATCATATAGTTTATGTAAACTATTATAATTTTAATGACATTGCCTGCAGATATAAGTATATGATTTCCTTTT TTCAATTTTCAGTTGCATGACATGTGCAACATTTGTCAACAATTTTATGCACTATAAGACTTTTGAAATTTTGGCATTAT GTTATACTGACTCTGACTGAGCCATCACAAAAGTCAATATACTCAATACTCAATAGTACTATTTTATACTCATTCGTCCT TTGATATTTGTTAGTTCTTATGTTACACACTAGTAAAAGTCCAAAGTATTTCCCCCTTAATCTGTGCTTGAAGTTTTTAT TTTTGTGTGTTAAAAACATGAAATCATTAGCATAGTACTACAAATCATATCAGTCTGAAAGAGGTTATTTATTGTTTTGT ATTTCTTATGGAACTTCAGTTTTATTTCTATTTATTTAAATTGTCTTTTCTGATATTGACAATGCTCTTACAGGCTTGGG AAGGGCGGGCTTATGACTACTGTATGGAAAACCTTAAGAATATGGGCTTCCCTGTTGATGGGCTTGAATTTGATCCTGAC CTGGTAACGTGTTCTCTCTAGCAAGCTGAAGGCACTTGGCAATCCATATCATCTCATGTTTGGTGAAATGATCTTTGCAT TCCATTATAAATTGTTCAGGTAATTAGAGGCCTTGTCATAGACAAAGAGAAAGGCAATTTGGTTAAAGCTGATCGATTTG GTTATATAAAAAGAGCCATGCACGGCACCAAAATGTTATCTACTCGAGCTGTTAGGTAAGTGTCTGGCATTGTAATTTTG ATTGCTGATAGAAATCTATGCAGAACCCTCTTGCTCACTCATTATATCAACACAACACACTCTGCACTAACTCATAGAAA CACATCACTTTAGGCTACCAAGAAAGTGCATTCAAGATAAATATGTTGTTCTACACTGGTTAGTAATGAAGTATGGAAAT TGACACTTTATTCAAATAGCCAGACCAACACAATCAAGTTTTCACCTTAGGTTTCTGTTTAACACAGAAAGTCTTCTGAA ATAACCCTAGATTGGTGCAGTATACGTTTGCACATGGATCATTTCATTGAGTCATTGCCTTGCAGCACAGCCTTCACATT GATATATGTATACACAATTACACACCTGTGTGCGTGTGCGCACAGTAATAGCTCTGTAGATGTCATTTATCAAAAATTGG AGTTAAAGTTTCTGTAGTGCTACTTAATTTTATATGCAATGGAAGTGAGATGTACGGGAGAGAACTGGTGGACCTGCGAA AGGAGAGTAGATGGGAGTTTCTCAATACACTGTTCTCTGTGTCTGAAGCTGTAGCCTACATGCAGGTATGTCATCGCGTT GAAGATCACTCAGCTTTCAGTGATGTAGATATATTCAGCTATAATAGTCTTTTTAAAGTAGCATTCAAGTCTTAGTTCAT GTGATGAGACTTCACTGATGATGTATAATTTCTATCAGATGGTTGACAGATTGGATGATGGGACAATACCATCGGATCTT 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AATGTGCTGACATTGATTTAAAAAAAATTAAAAAATAATAACACATCAGAAATTTAAATTTAATTAATAAAAATAAAACA AATTAAAAAATCTAACCCTAAATTAGTAATAAACAAAATCAAATTCCTCCCAAATAAAAAACTAATCCTGTAATCCACCA TCTTCATCCCCAATTTCCCCAAATTAGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTACAATTTCCTCTCCATTCTCTCTTTTTCTTCACC ACCCCAACCCCAACAGCCACCACCACCAACCACTAGCCAACGCCCACCACCACCTACCAAGATTCCAACCTCCACCCCGA CCCCATCCCCTACCACGAAGATCTGTCTGAGTGCGACGGAAAGAAGAAATTGAGAGGGAAAGAGCAAGACGGCTGGGTGC GATGGAGGACGGATCTTCTTCCCTAGATCCGGTGCCGCCACGCCACCACTGTCTTCTCTTCTCTGCGACTGCTCTTCTTC ATCTTCTGGCCGAGAGGACCAGACTCGACAAGGGCTTGAAGAGAAGGTTGTGGACCTAATTAAATTCAGGTCTTGGAAAT GGCTTAAATAAATGTAAGGATAAAGGATTCAATTTCTCGTCCTAGTGAATGCTTAGGGAAAAACACAAACTGGAAGAACA ACTAATTCTCCTCTTGATGGCAACTTACCAAACTCTGTTTTGAGCTCTTCGTGTGCTCTGTTTCGGTTCGCCAGGAGCTT GAAAATTGCTAGTCCGGTGCGTGTATTGCAGGTGTAGGAAGGGACTGTAAGCTGCTTTGTTTTATTGCTTTTCTCTTTGG TGTTTCAATTTACTCTTATTGTATCTGGCTTGTGGAGCCACTGGATAGATATTTCGTTGGTATTAAGGCACACACTTGTA AAGATGAAGAATTGTATTATTATGATTTTGAAGAGTGGAGAGATTAATTGATGAATTGAAGAAGAATGTGGATGGGTGGG 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GCTAATTTTACTACTTATGATCATGGTACTTTATGTATCATCTTCTGCAGGTGGTTTATACTCAGGGGGAAGTGCACAGA TGGTTGAAAATTCTCTTGATATCCATGGAGATGAGATATTATATGTTGGTGACCATATTTACACAGATGTCAGTCAATCC AAGGTTAATTTGCGATGGCGAACAGCATTGGTTTGTCGTGAACTGGAAGAAGAGGTTGGTACAATCAGTTTATATTTGAC TCGTAATTTTTAGTAAAAAATCTTGAAAACTTCCTCTTATGAAAAGAATATTCCTTGTTATGAAAAGAGTGTTTGACTCC TATTGGACTTGTTATGAAAAGAATACTCCTTGTTTTGAGTAAAAAATGATTGTATTTCTTGTTAACTCAGCTGAGATGCA AATCATTTTCGGTAACTTTTAATGTTGAACTTACGTACTGTTTAAAGCAAAAGTAATGCCTTGACTGGATCCTAAACTGC AGTACAGTGCCTTGATTCATAGCCGGAGTCAGAGAGAATCATTAGTGGAGCTTATAAATCAAAAGGAGGTTCTAGGGGAT CTCTTTAACCAACTTCGGCTGGCTCTGCAAAGGCGAAGCAAAGACCGTCCTGCTCAAGTAAATATTGGTTTTATAATCCT ATTTTATATTCTGTTTTTTATGCTTTATTTGTACTGACATCACACCTCATACCATTGTTAAAGTATTAGCCACTAAAGAA TTTTCTTTTGCATTCTTATGATAGTATGTGGTCAACCTTTGCTGCTACTGCTATTATGTTCTTGCCTCATTCAGTTCCCT TTAACCTTCCTAATCTAAAATCTAAATATTAATGCAGTAATTAATCTTCCCAAACATCTCAATAATTAATCCTGGTTTAG TAGCGTGTTATTCACTTATGGATCATTAGCCTAATTAGTAACTTTCTTGGATTTTGGAAGCCTTTTCCTTCCATATATTG AAACCTTCTTAACTTTTTAACTACCCCTAGGTTGACCTTATCTGACTACTTGGTTCCCTGTTTAGAGGTATCAAGAATAC CTTTTCTTTATATTTATTTTGAAGCTGTGTTGTGTGTGTACACACGCATATAGACCTAATAATTAAATACTAACTGTAAG CAAGGTTGCCGTCTTGCCGATAGTACGCTACAGGGCTGTCAGTGCGTAGCAAAACTGGCCACTCCTCAATCCTAATTGCT GTGCAGTGTCACGGTTTAATGTAGCAGTCATTGTGGCCTCTAATGTGAAAACCCTCACTCCTTCACACATTTCTTCCTTT AACTCTCTGAGCTAAACTATCGAGTGACCGAGCTGTGATAGTAGTTTTTTTTCAATAAGCAAGCTGTGATAGTAGTGGAA ATGATAAAGAGGAAGACTTGGATCTAGTAGAAGATGATTGATGATTATTATATAAGAAACTTTTATTTGAACTTTCATGC TTTTAGACAGTTTGGTTTAAGCCCTAGAGGCTTAAACTTATTGGTTACCTTGACTTTTCTTGGTATTTACTTGATGTTTT GTTTAATAGACCTATGGCTTTTTATTGTTAATTATGAGTGTTATGAATTTTGAGTTGTTTTAAATAATTTTTTTAGCATT TGTATATGCATTTATTATAAATCATAACTGAATTAAAATTGAAGTATAGAACCGCTATAGCATTTTTGGGTCAGCGACAC TATGTTCCACTATTCATGATTGACAACTAATTGTAAGATTTTTCATTGTACTTGAAAGACACTTGCAGCAACCAACATGA AAGATGAAGACCTCACTGAAAGCATGCAAAAGCTACTTATTGTTATGCAAAGACTGGATGAGAAAATTGCTCCAATGCTG GAGGAAGATGGGGAGCTCTTCAATTCAAGGTAAGCTCAGAGAATAGAACTCTCGATTTTTTTATGTCTGCCCACATGGCT ATTTCAATAACTGAGTTGCCATGGGAAAGAGTTATTGGTGATCTTGTTCTGTCAATATGCTCCAGGACGAACAAAGCTTA GACACAGTTCTATACATTGTATTTTTATTGTTGTCCAATTACAACATGACACTTGTGTTGGAAAATGAGAAGTTGATAGA AGTTATAACATTATTAAAAATATTTAAAAAGTGGGTACCCGATTTTGTCATTGCTGCTGGTCTTGCTTTTTGGTCATTTT ACCGCATGCATTTGTTATTCACTTGGATTATTTGTCTGCATTAGGTGGGGCTATCTATCTCGTGCTGGACTGTGGGATAA AAGTCACTTGATGAGACAAATTGAAAAGTAAGTGCTTTCTTTTTTATGCCACTGATCTCTATTTTAGCGTGATTACTCTC TGAATTCTGAATTAATTGAGTTTAAATTTATTATGGCAGATATGCTGATATTTATACATCTAGAGTGTCAAACTTTTTAT ATTACACCCCCTTCATGTATTTCCGCTCTCAGGAACAGGTATCCAGATAACCTTCTCTTTACCTTGTCATTTATAGCCAT GAACGATTAAGTTATTATTGTGTTGTTTGAATTGACTTTGATTTGTTTCTGTAGAATCTTGCGCATGACTCATACTCACA CTACTGTTCAGCACTCAATGATGACTTTTCTTCTTAGGGAAAAATTGCGGGAAGAAAAACGGATTAGTATAAGAAATAAA GAATCTGTTGTTGACATTGTTAGCAGATGTATCATTGTAACAGTATCCAATGCTGTGATGATGATGATACCTTGTATTAT TTGAAACTCATATAATATCCACGGAAGACTCATGTAGCATTTTTACCTTGGCCAAGTGGTGCTAAGTGGCCCCTGGTTAT AGGAGAGCAAAGCCCCACCAGGCAAAGAAGGGAAACACAAATGGCTAGAGATTTTGTTTCCAACTGATTGTGAATTTGGT GTTGATTTCAGCAATTTACATGATGTAATCAGATTGACAATTTGGCAATGCATTGTTAGAAATCATTGAACAAGTTCGTA TTCCCATATGTTTGGTTTAAATTCAAAGTTGATGTTAACCAATTTCTATTTGATTATTTTATGTTTTTTCTCCTATGAGA GTGTGAACAACAAAAAAACCTAGGACTAGCAATTAATTCATGAAATGTAAAAATTGAAT
CDS sequence (LotjaGi4g1v0314300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAACTTCAGTTTTATTTCTATTTATTTAAATTGTCTTTTCTGATATTGACAATGCTCTTACAGGCTTGGGAAGGGCG GGCTTATGACTACTGTATGGAAAACCTTAAGAATATGGGCTTCCCTGTTGATGGGCTTGAATTTGATCCTGACCTGGTAA TTAGAGGCCTTGTCATAGACAAAGAGAAAGGCAATTTGGTTAAAGCTGATCGATTTGGTTATATAAAAAGAGCCATGCAC GGCACCAAAATGTTATCTACTCGAGCTGTTAGTGAGATGTACGGGAGAGAACTGGTGGACCTGCGAAAGGAGAGTAGATG GGAGTTTCTCAATACACTGTTCTCTGTGTCTGAAGCTGTAGCCTACATGCAGATGGTTGACAGATTGGATGATGGGACAA TACCATCGGATCTTGGCCCCTTGGATTATAAAGGACTTTATAAGGCTGTTGGAAAAGCTCTCTTTTGGGCACATGTAGAA GGTCGTCTTAAGAGTGAGATCATGTCTAAGCCTGAACAGTTTGTGGAGCCAGATCCAGAATTACCTCTGGCACTTTTGGA TCAGAAGGAGGCTGGTAAAAAACTATTGCTCATTACCAACTCGGATTATCATTACACAGACAAAATGATGCGGCATTCTT TTAATCGATTCCTTCCAAATGATATGGATTGGCGAGATCTATTTGACATAGTAATTGTGTCAGCGAGAAAACCAGAGTTC TTCCAAACGTCACATCCCATGTATGAAGTGGTCACAGGCGAGGGTCTGATGCGTCCATGCTTCAAGGCTAAATTTGGTGG TTTATACTCAGGGGGAAGTGCACAGATGGTTGAAAATTCTCTTGATATCCATGGAGATGAGATATTATATGTTGGTGACC ATATTTACACAGATGTCAGTCAATCCAAGGTTAATTTGCGATGGCGAACAGCATTGGTTTGTCGTGAACTGGAAGAAGAG TACAGTGCCTTGATTCATAGCCGGAGTCAGAGAGAATCATTAGTGGAGCTTATAAATCAAAAGGAGGTTCTAGGGGATCT CTTTAACCAACTTCGGCTGGCTCTGCAAAGGCGAAGCAAAGACCGTCCTGCTCAAACACTTGCAGCAACCAACATGAAAG ATGAAGACCTCACTGAAAGCATGCAAAAGCTACTTATTGTTATGCAAAGACTGGATGAGAAAATTGCTCCAATGCTGGAG GAAGATGGGGAGCTCTTCAATTCAAGGTGGGGCTATCTATCTCGTGCTGGACTGTGGGATAAAAGTCACTTGATGAGACA AATTGAAAAATATGCTGATATTTATACATCTAGAGTGTCAAACTTTTTATATTACACCCCCTTCATGTATTTCCGCTCTC AGGAACAGAATCTTGCGCATGACTCATACTCACACTACTGTTCAGCACTCAATGATGACTTTTCTTCTTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0314300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MELQFYFYLFKLSFLILTMLLQAWEGRAYDYCMENLKNMGFPVDGLEFDPDLVIRGLVIDKEKGNLVKADRFGYIKRAMH GTKMLSTRAVSEMYGRELVDLRKESRWEFLNTLFSVSEAVAYMQMVDRLDDGTIPSDLGPLDYKGLYKAVGKALFWAHVE GRLKSEIMSKPEQFVEPDPELPLALLDQKEAGKKLLLITNSDYHYTDKMMRHSFNRFLPNDMDWRDLFDIVIVSARKPEF FQTSHPMYEVVTGEGLMRPCFKAKFGGLYSGGSAQMVENSLDIHGDEILYVGDHIYTDVSQSKVNLRWRTALVCRELEEE YSALIHSRSQRESLVELINQKEVLGDLFNQLRLALQRRSKDRPAQTLAATNMKDEDLTESMQKLLIVMQRLDEKIAPMLE EDGELFNSRWGYLSRAGLWDKSHLMRQIEKYADIYTSRVSNFLYYTPFMYFRSQEQNLAHDSYSHYCSALNDDFSS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| Phobius | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 5 | 24 | 20 | - | – | |
| Phobius | 12 | 23 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 19 | 470 | 452 | 6.6E-299 | ||
| PANTHER | 19 | 470 | 452 | 6.6E-299 | – | |
| Pfam | 22 | 462 | 441 | 1.2E-132 | ||
| TIGRFAM | 22 | 333 | 312 | 4.2E-104 | ||
| SUPERFAMILY | 22 | 463 | 442 | 1.09E-122 | ||
| Phobius | 24 | 28 | 5 | - | – | |
| Phobius | 29 | 476 | 448 | - | – | |
| Gene3D | 159 | 343 | 185 | 7.2E-50 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0314300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…