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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0045300 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0045300.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | myosin; TAIR: AT4G33200.1 myosin; Swiss-Prot: sp|Q0WPU1|MYO15_ARATH Myosin-15; TrEMBL-Plants: tr|K7M5Y2|K7M5Y2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0045300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:7642870..7662762) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAGTTTCCGCATGGGCTCCAAGGTTTGGGTCCAGGACAGGGACCAGGCATGGGTTGCTGCTGAAGTCCTCGCCTCCGA CGGCGGCGGCAACCGTGTACAGCTCGTCACTGATTCCGGCAAGAAGGTGAGTTTGTTTGTTGCTGGTTGATGCTGTATAT TTTCTGGTTGATTGTTGTTGGTGATTTGAATTTTGGAGGATTTTTTGGGAGTTGCGGTGGTGCAGGTTTTGGCTTCGCCG GAGAAATTGTGTCCGAGGGATGCGGATGAAGAGGAGCACGGCGGAGTTGAAGATATGACGAGACTCGCTTACCTGAATGA GCCAGGGGTGTTGTATAATCTTAAGAGAAGATACACTCTCAATGATATCTATGTAAGTGTTAAAATTGATTGGGTTGGGT TTTGTTTCATAGATAGATTAAGACTTAGAGTGTGTTTGGATTGGCGCTTTTTTTATAACTTAACTTCGGTTTAGTCGCAT TTAACATTGTGCCGACGTGTTTCGGAGTTTAATTTTCGCATTCAGTTGGATTGGCCTGGTCTTAAACCAAGTTAAGTTTA AGCCAACATTTTTCGAGCTTTTTAGCATTTACTCGCTCGATAGTGCTATTACCTTATGATCCAACGAGATTCATTTTGTA AATACACGGTTACAGATGAACGAACATATTGAACATTGGAAATGACATATGGAACATTCAAGCCACGAGTTAATCCAAAC AAAGTGCGTAATCCAAACACATACTTTATGTTCTGTTCATGTTAAAACTGCTGTTTAAACTTTTAATGCGTTACGTAATG TTATTTTGAACTTCTAAAGTGTAAGTGAACTTTGCCTTTAAAATGTCAGCTTAAAAAGGTACACGGAGAGTAGTTTTTTA GATGTTCAGTTGAGGATAACTACGAGTAATTTAGAATTTTGCTATCTTCAAAGTAACTATTTATTACCGGAAAATGATTT 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CACAGCACACTTCATTTATTCCTTGAAGTCTTCCTTTCCACTCTTCCTTTATTATGTTACTTTTTTTGAAATGCTTTATT ATGGCAAGTTTCAATCATTCATGGCTTTTCATTTCCCCCCACCCTCTCTTAACTAAAATTTACTTGTTCAGGTGCCATCT TTCTTCATCCGTAAGCTAGTTACCCAGGTTTTTTCCTTCATCAATATTACACTCTTCAACAGGTAAAAACAATGATTACA TGAACTTATTTTTGTAGCCTCAATTCATTAATTTTTTACTTTTGTTGGGTAGTGTATTTTCCTTAGTGCAGTTCTCCTTT TATTTTTTAAATTTTTATCTTCCCGTTATTTTTGTAGTCTTCTACTGCGCCGTGAATGCTGCACGTTCTCCAATGGTGAA TATATGAAGTCTGGTCTGGCAGAACTTGAGAAATGGATAGTCAATGCAAAGGAGGAGGTAAACTGAACTGGCTAATACTG CAAGATTTTGGTTTTGTGCATTTGGCTAAGTACTTGTTAAATGTAGTATGCAGGAACATCCTGGCACGAGCTGAATTATA TAAGACAAGCTGTTGGGTTCTTGGTATATACACTGCCTTATTTTGGTTGGACTTCTAATGTTGTTAAGTAGAACTGCTTT ATCTTACTTTGCTTTCTTTGTTTAAATTATACAGGTAATACATCAGAAGAGGAAGAAATCTTTGGATGAAATTCGGCAAG ATCTTTGTCCGGTATGATTATTATATTAAGGAGATGCAGTGCCGTTTTCATCCCTTTGAAGTTTAAACTTTAAACTGAAT ACCTATCATATCTAGTTTTTTGAAGTTTCGTCATTCACGGAGATGCTAGTGAAAATTCAAACCTAATTTGTTAATATGAA ACCTATATATGGATGTCAATTTGATAGAACATTGAAGAGAAAACTAATTTATTGAATTTCTTTGAAAATTCCTATTCCTG TTACTTGTATCTAGATGATACCAGTGCTGGATATGGATATGTTTATACCTTTCTGGATATCACTTATTGAGAAGGGAATT AAAAAAAGAAATTAGAAGGATAGGAAGGCACTTCAAGGGGACTGTTTCCTCCTCCCACTCTTCTCTACTTTCTCCTTTTC TGCCCTCTTTCTTTTCCTACTCACATTTTCCCGCCTTCCCCAGCCAGTTGGTTCCCTCTCTGGTCTTGATTGCCTTCTGC CATATGTGCTGGGTATTATACTCCCCATCCCCTCAGTTATTCATATCACTCCCACCGCCAATATTGACTCCTGATCTCTT GCTCTCCCTCCGGTTCTTCTTAACATATATCTTCATTAGTAGTGCCAATTATGCCCTATTAGATGGACAGTTAATTCACT GTCAAGGAAACATTTTTGGTCCCATTCAGTGTGAGATCTTCCTTTTACCCCATGTGCCATTCCTCCTATGTTAGTTCTTT TCTTGTATCTGTAACGTTTTACATGTGTAATGGACGCAATATTCTATATTCTTGGTGGAGGAATGGTAGCAATGCACTCT TTGATACACTCTCCAACAAACTCCATGTGGTAAGTTTATTTTTCAAAAAGTCAACAATTTTTTTTTTAAGAATGGAGGTA AATATGTTGACTTCTGCGCATTGGGTGTGTTTAAATATGTTACTATTATTTCTCTTCTTTATATACAATATGTCTAATGT CTTAAGCAATTGGAAAGAATGCTAATTTATTTCTTCAACAGGCATTGACTGTCAGGCAAATCTATCGAATCAGTACTATG TACTGGGATGACAAGTATGGAACCCAGAGTGTGTCCAATGAGGCAAGTTGTCTCTTTAATTGATTCAGAATACAATAGTG GAGTGCTTTCTTTAGCGTTCTGAACTATATATGCTGTACAGGTAGTTAGTGAGATGAGGGAAATTGTCAGCAGCAAAGAC AATCAGAATATAACATCAAACTCTTTCTTACTGGATGATGATATGAGGTACATTGGTTTCTCATCCAAGTTATTTTAACT TGCAGTTTTACACACATGATTGCTTGATGAATTAGTATGAATGGTTGCCATCGCTTGCTGATGACAACAGCTTAATTTTT ACTTGAATTAAGCTTTTCTGCTTCTAGGTTTTAAAATTGTAACCGTACCTCATGCCAAAAGTTCAATATTTAAGCTAAAA ATCAAGTAACTTAGTTATGTCATGCAGCGTATCGGGTCAATTGGCACAATTTTTTTCTTGTTGCATTTCTTTTTCATGCT GAATAAGAACGATGAAAGAATGCGTCATCCATTTAGAATTTTTATGACTCATGGATGTCAGTTTCTAATTCTTATGAAAA TTACTAGCTAAAAGTAGCCAGTGAGACCCATGGTTTCTTTCAATTTACATAAGTTTTAGAAAGAAATTTGAAATTGCACC AAACTATTAGTTATGGAATATATTTGTATCATCACTAAGAAGGCAAAAGCTTTTTATTCCTTTTCTTTAACCTTCGATTC TTATTGCAGCATTCCTTTCTCGGCTGAAGACATCGACATGGCAATTCCTGCTATAGATCCTGATGAGATTGATCTGCCAG CATTTGTGCCCGAATATTCTTGTGCTCAGTTTCTTAATCCGATTCAGACGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0045300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTTTCCGCATGGGCTCCAAGGTTTGGGTCCAGGACAGGGACCAGGCATGGGTTGCTGCTGAAGTCCTCGCCTCCGA CGGCGGCGGCAACCGTGTACAGCTCGTCACTGATTCCGGCAAGAAGGTTTTGGCTTCGCCGGAGAAATTGTGTCCGAGGG ATGCGGATGAAGAGGAGCACGGCGGAGTTGAAGATATGACGAGACTCGCTTACCTGAATGAGCCAGGGGTGTTGTATAAT CTTAAGAGAAGATACACTCTCAATGATATCTATACATACACAGGGAGCATTTTAATAGCTGTTAATCCCTTCACAAAGCT CCCTCATTTGTATGATAACCATATGATGGAGCAGTACAAGGGAGCTCCATTGGGTGAGCTAAGCCCACATGTTTTTGCTG TTGCTGATGCATCTTATAGAGCAATGATGAATGAGGGTAAGAGTCAATCTATCTTGGTCAGCGGTGAAAGTGGCGCTGGA AAAACGGAGACAACAAAATTGATTATGCAGTATCTCACCTTTGTTGGTGGACGAGCTGCTGGTGATGATAGATCAGTAGA ACAACAAGTTCTCGAATCGAATCCACTTTTAGAGGCATTTGGTAATGCAAGGACTGTTAGGAATGACAATTCAAGTCGAT TTGGGAAGTTTGTTGAAATTCAGTTTGATTCAAATGGTCGAATATCTGGTGCTGCAATTAGAACTTACTTATTGGAAAGA TCACGAGTAGTGCAGATAACGGATCCTGAAAGAAATTATCACTGCTTTTACCAGTTGTGTGCATTTGAAACGGATGCAGA GAAATATGAATTAGGACATCCAAGTCACTTCCACTATTTAAATCAAAGTAAAATCTATGAACTAGATGGTGTAAGCAATG TGGAAGAGTACGTGAGGACCAGGAGAGCAATGAACATTGTTGGCATTAGTCATGAGGATCAGGAAGCCATATTTCGTACC TTAGCTGCAATTTTACACTTGGGAAACATTGAATTTTCTCCTGGAAAAGAGTATGATTCATCAGTAATAAAGGATGAAAA ATCAAGATTTCACATGCAGATGGCGGCTAATCTCTTCATGTGCGATGTAGACCTACTGCTATCAACATTGTGTACTCGTT CAATACAAACTCGAGAAGGAAGTATTGTGAAAGCCCTTGATTGCAACGCTGCTGTTGCTGGCCGGGATACTTTGGCAAAA ACTGTTTATGCTCGTTTATTTGATTGGCTTGTTGATAAGATTAATAGGTCTGTTGGGCAAGATATTAATTCCCAGATGCA AATTGGAGTGTTGGATATTTATGGTTTTGAGTGCTTCAAGGATAATAGTTTTGAGCAATTCTGCATCAATTTTGCAAATG AAAAGCTTCAGCAACATTTTAATGAGCATGTATTCAAGATGGAGCAGGAGGAGTATGGCAGAGAAGAAATTAACTGGAGT TACATTGAATTTGTAGACAACCAAGATGTTTTAGATTTGATTGAAAAGAAACCCATTGGTATCGTCGCTCTGTTAGATGA AGCTTGCATGTTTCCAAAGTCAACACATGAAACATTCTCAACCAAGTTGTTTCAGCATTTCCCGTCTCACCCTAGGTTGG GAAAGGAAAAATTCTCGCAAACAGATTTTGCCATTTCTCATTATGCTGGAAAGGTCACTTATCACACAGATACCTTTTTA GACAAAAATCGTGATTATGTTGTTGTAGAACATTGTAATCTATTATCTTCTTCAAAATGCCCCTTTGTTTCTGGTCTCTT CCCATTGCCACCGGAGGAATCTTCAAGGTCATCATACAGGTTCTCTTCAGTAGCTTCTAGATTTAAGCAACAACTTCAAG CACTCATGGAGACCCTTAATTCAACAGAGCCTCATTACGTACGATGTGTTAAGCCAAATTCTTTGAATCGACCCCAAATG TTCGAGAATGGCAGCGTCATCCACCAATTACGCTGTGGGGGCGTTCTTGAAGCTGTTCGGATAAGTCTAGCAGGTTACCC TACTCGAAGAACTTACTCAGAGTTTGTAGATCGCTTTGGGTTAATAGCCCTGGAGTTTATGGATGGAAGTTATGATGATA AAGCTGTGGCTGAGAAAATTTTGCAAAAGCTCAAGCTTGAGAATTTTCAGTTGGGTAGGACCAAAGTATTTCTCAGGGCT GGTCAAATTGGCATTTTGGACTCCAGACGTGCTGAGGTTTTGGACAATGCTGCAAGGTGCATTCAGCGGCAACTGAGGAC ATTTATTGCACGCAGGGTTTTCATTGCAGTCAGAGCTGCTGCAGTTTGTCTTCAGGCATGTTGCAGGGGATACATTGGCC AAAAGATGTATGCTTCTAAAAGGGAGACAGCAGCAGCTATCTCTGTTCAAAAGTATATACGTATGTGGCTACGGAGGAAG ACGTACATGAAATTATGTTCTTCTGCTACTATCATTCAATCCTGTGTTCGAGGTTTCATGACTCGCCAGCGATTTCTGCA TATTAAAGAGCATAGAGCTGCTACTTCTATTCAGGCCTGTTGGAGAATGTACAAGTTTAGGTCAGCTTTCCACCGACATC AAGCTTCAATTGTGGCAATACAATGCCTTTGGCGGCGTAGACAAGCAAAACGAGAGCTTCGTAGACTTAAGCAAGAGGCC AATGAAACTGGTGCCCTCCGTTTAGCTAAGAGTAAACTTGAGAAGCAATTGGATGAGCTCACATGGCGTTTGCATCTTGA AAAGAAAATAAGGGTTTCTAATGAAGATGCTAAGCAAATTGAAATTTCCAAACTTCAAAAGATGATAGAAGCTTTGAATC TTGAATTAGATGCGGCTAAATTGGCTACAATTAATGAGTGCAACAAGAATGCAGTTCTACAAAATCAATTTGAATTGTCA ATAAAGGAAAAATCAGCTTTAAAGAGAGAGCTAGTTGCTGTGGATGAAATACGAAAGGAAAATGCTATGTTAAAGGTTTC ATTGGATGCCTTTGAAAAGAAGTGCACAGCTTTGGAGGTTGAGCTTATAAATGCTCAAAAGGGTCGTGATGAAACCATTG AGAAATTGAGGGAATTTGAACAGAAGTGCTCTCAACTTGAGCAAAATGTGAAAAGTCTTGAGGAAAAGATGTTGAGTTTA GAGGATGAAAATCACGTGCTTCGTCAGAAAGCCTTAAGTGCTCCTCTTAAGAGTAACCGCCAAGGTTTTGCAAAGTCGCT GTCAGAAAGATACTCAAATGCAGTAGCTTCCCGCACAGAGAGGAAGCCCATATTTGAGTCACCCACACCTACAAAACTTA TTCCCACTTTCACACCAGGCATGTCAGACTCTCGTCGATCTAAATTAACAGCAGAGAGGCACCAGGATAACTGTGAATTC CTGTCAAGGTGTATCAAAGAAAATTTGGGATTCAAAAATGGCAAACCTCTAGCAGCTCCTATCATATACAAATGTCTTCT TCATTGGCATGCCTTTGAATCTGAGCGCACAGCCATATTTGATTACATAATTGAAGGCATAAATGAGGTTCTAAAGGCTA GGGATGATGATGATGTCTTGCCATATTGGTTGTCCAATACCTCTGCGCTTCTTTGCCTCTTACAGAGGAACTTACGCTCA AATGGCTTTTTAACTACCACTGGTCAACGCTATACTGGATCGGCTGGCTTGGCCAGCAGGACTGTGCATGGACCAAAATC TCCATTGAAGTTTATTGGATATGATGATGGTGTGTCACATGTGGAGGCTAGATATCCAGCTATACTTTTTAAGCAACAAC TAACTGCTTGTGTAGAGAAAATTTTTGGTCTTTTACGTGACGATTTGAAAAAGGAGCTTTCTCCACTTCTAGGATTATGT ATTCAGGCACCCAAAACAGGAAGACAGCATGGTGGAAAATTATCTAGATCTCCTAGTGGGCTTCCTCAACAACCATCTGG TGGTCAGTGGGCCAACATTGTCAATTTTTTGGATTCACTGATGAGCAAACTTCATGGGAATCATGTGCCATCTTTCTTCA TCCGTAAGCTAGTTACCCAGGTTTTTTCCTTCATCAATATTACACTCTTCAACAGTCTTCTACTGCGCCGTGAATGCTGC ACGTTCTCCAATGGTGAATATATGAAGTCTGGTCTGGCAGAACTTGAGAAATGGATAGTCAATGCAAAGGAGGAGTATGC AGGAACATCCTGGCACGAGCTGAATTATATAAGACAAGCTGTTGGGTTCTTGGTAATACATCAGAAGAGGAAGAAATCTT TGGATGAAATTCGGCAAGATCTTTGTCCGGCATTGACTGTCAGGCAAATCTATCGAATCAGTACTATGTACTGGGATGAC AAGTATGGAACCCAGAGTGTGTCCAATGAGGTAGTTAGTGAGATGAGGGAAATTGTCAGCAGCAAAGACAATCAGAATAT AACATCAAACTCTTTCTTACTGGATGATGATATGAGCATTCCTTTCTCGGCTGAAGACATCGACATGGCAATTCCTGCTA TAGATCCTGATGAGATTGATCTGCCAGCATTTGTGCCCGAATATTCTTGTGCTCAGTTTCTTAATCCGATTCAGACGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0045300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSFRMGSKVWVQDRDQAWVAAEVLASDGGGNRVQLVTDSGKKVLASPEKLCPRDADEEEHGGVEDMTRLAYLNEPGVLYN LKRRYTLNDIYTYTGSILIAVNPFTKLPHLYDNHMMEQYKGAPLGELSPHVFAVADASYRAMMNEGKSQSILVSGESGAG KTETTKLIMQYLTFVGGRAAGDDRSVEQQVLESNPLLEAFGNARTVRNDNSSRFGKFVEIQFDSNGRISGAAIRTYLLER SRVVQITDPERNYHCFYQLCAFETDAEKYELGHPSHFHYLNQSKIYELDGVSNVEEYVRTRRAMNIVGISHEDQEAIFRT LAAILHLGNIEFSPGKEYDSSVIKDEKSRFHMQMAANLFMCDVDLLLSTLCTRSIQTREGSIVKALDCNAAVAGRDTLAK TVYARLFDWLVDKINRSVGQDINSQMQIGVLDIYGFECFKDNSFEQFCINFANEKLQQHFNEHVFKMEQEEYGREEINWS YIEFVDNQDVLDLIEKKPIGIVALLDEACMFPKSTHETFSTKLFQHFPSHPRLGKEKFSQTDFAISHYAGKVTYHTDTFL DKNRDYVVVEHCNLLSSSKCPFVSGLFPLPPEESSRSSYRFSSVASRFKQQLQALMETLNSTEPHYVRCVKPNSLNRPQM FENGSVIHQLRCGGVLEAVRISLAGYPTRRTYSEFVDRFGLIALEFMDGSYDDKAVAEKILQKLKLENFQLGRTKVFLRA GQIGILDSRRAEVLDNAARCIQRQLRTFIARRVFIAVRAAAVCLQACCRGYIGQKMYASKRETAAAISVQKYIRMWLRRK TYMKLCSSATIIQSCVRGFMTRQRFLHIKEHRAATSIQACWRMYKFRSAFHRHQASIVAIQCLWRRRQAKRELRRLKQEA NETGALRLAKSKLEKQLDELTWRLHLEKKIRVSNEDAKQIEISKLQKMIEALNLELDAAKLATINECNKNAVLQNQFELS IKEKSALKRELVAVDEIRKENAMLKVSLDAFEKKCTALEVELINAQKGRDETIEKLREFEQKCSQLEQNVKSLEEKMLSL EDENHVLRQKALSAPLKSNRQGFAKSLSERYSNAVASRTERKPIFESPTPTKLIPTFTPGMSDSRRSKLTAERHQDNCEF LSRCIKENLGFKNGKPLAAPIIYKCLLHWHAFESERTAIFDYIIEGINEVLKARDDDDVLPYWLSNTSALLCLLQRNLRS NGFLTTTGQRYTGSAGLASRTVHGPKSPLKFIGYDDGVSHVEARYPAILFKQQLTACVEKIFGLLRDDLKKELSPLLGLC IQAPKTGRQHGGKLSRSPSGLPQQPSGGQWANIVNFLDSLMSKLHGNHVPSFFIRKLVTQVFSFINITLFNSLLLRRECC TFSNGEYMKSGLAELEKWIVNAKEEYAGTSWHELNYIRQAVGFLVIHQKRKKSLDEIRQDLCPALTVRQIYRISTMYWDD KYGTQSVSNEVVSEMREIVSSKDNQNITSNSFLLDDDMSIPFSAEDIDMAIPAIDPDEIDLPAFVPEYSCAQFLNPIQT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1518 | 1518 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1518 | 1518 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 4 | 55 | 52 | 13.863 | ||
| Pfam | 7 | 43 | 37 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 35 | 780 | 746 | 1.22E-274 | ||
| SMART | 55 | 732 | 678 | 0.0 | ||
| ProSiteProfiles | 61 | 731 | 671 | 272.633 | ||
| Gene3D | 62 | 661 | 600 | 6.9E-248 | ||
| Pfam | 63 | 719 | 657 | 4.5E-249 | ||
| CDD | 75 | 719 | 645 | 0.0 | ||
| PRINTS | 91 | 110 | 20 | 1.3E-59 | ||
| PRINTS | 148 | 173 | 26 | 1.3E-59 | ||
| PRINTS | 195 | 222 | 28 | 1.3E-59 | ||
| Gene3D | 246 | 309 | 64 | 6.9E-248 | – | |
| Gene3D | 310 | 419 | 110 | 6.9E-248 | – | |
| PRINTS | 427 | 455 | 29 | 1.3E-59 | ||
| Gene3D | 436 | 621 | 186 | 6.9E-248 | – | |
| PRINTS | 480 | 508 | 29 | 1.3E-59 | ||
| Gene3D | 665 | 731 | 67 | 7.7E-15 | – | |
| Gene3D | 732 | 783 | 52 | 1.2E-7 | – | |
| SMART | 733 | 755 | 23 | 86.0 | ||
| SMART | 756 | 778 | 23 | 0.11 | ||
| ProSiteProfiles | 758 | 786 | 29 | 7.84 | ||
| Pfam | 758 | 772 | 15 | 0.1 | ||
| SMART | 781 | 803 | 23 | 0.026 | ||
| SUPERFAMILY | 782 | 880 | 99 | 3.01E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 782 | 810 | 29 | 7.218 | ||
| Pfam | 783 | 802 | 20 | 0.053 | ||
| Gene3D | 784 | 832 | 49 | 5.8E-13 | – | |
| SMART | 804 | 826 | 23 | 0.0069 | ||
| ProSiteProfiles | 807 | 834 | 28 | 7.657 | ||
| Pfam | 808 | 825 | 18 | 5.9E-4 | ||
| SMART | 829 | 851 | 23 | 3.1E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 830 | 859 | 30 | 7.437 | ||
| Pfam | 831 | 851 | 21 | 6.4E-4 | ||
| Gene3D | 833 | 882 | 50 | 4.3E-5 | – | |
| SMART | 852 | 874 | 23 | 28.0 | ||
| ProSiteProfiles | 853 | 882 | 30 | 7.126 | ||
| Coils | 866 | 886 | 21 | - | – | |
| Coils | 915 | 942 | 28 | - | – | |
| Coils | 974 | 994 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 985 | 1061 | 77 | 3.8E-5 | – | |
| Coils | 1002 | 1050 | 49 | - | – | |
| CDD | 1112 | 1485 | 374 | 0.0 | ||
| ProSiteProfiles | 1161 | 1461 | 301 | 50.148 | ||
| MobiDBLite | 1286 | 1306 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1292 | 1306 | 15 | - | – | |
| SMART | 1336 | 1443 | 108 | 1.4E-38 | ||
| Pfam | 1337 | 1440 | 104 | 4.2E-22 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Motor activity | Catalysis of the generation of force resulting either in movement along a microfilament or microtubule, or in torque resulting in membrane scission, coupled to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Actin filament organization | A process that is carried out at the cellular level which results in the assembly, arrangement of constituent parts, or disassembly of cytoskeletal structures comprising actin filaments. Includes processes that control the spatial distribution of actin filaments, such as organizing filaments into meshworks, bundles, or other structures, as by cross-linking. | ||
| Cellular component | Myosin complex | A protein complex, formed of one or more myosin heavy chains plus associated light chains and other proteins, that functions as a molecular motor; uses the energy of ATP hydrolysis to move actin filaments or to move vesicles or other cargo on fixed actin filaments; has magnesium-ATPase activity and binds actin. Myosin classes are distinguished based on sequence features of the motor, or head, domain, but also have distinct tail regions that are believed to bind specific cargoes. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0045300.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…