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LotjaGi6g1v0211000.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0211000
Transcript ID LotjaGi6g1v0211000.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description CTD small phosphatase-like protein; TAIR: AT5G46410.1 SCP1-like small phosphatase 4; Swiss-Prot: sp|Q54GB2|CTSL2_DICDI CTD small phosphatase-like protein 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S1P8|A0A151S1P8_CAJCA CTD small phosphatase-like protein 2; Found in the gene: LotjaGi6g1v0211000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:50838019..50851318) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CGCAACGGTCGAAGGCGTAGATCATCAAATCTCCGCCGTCCGTAGCATAATCCAACAACGCATAGTTACACTTGCTCTCT CTCTCTTCACCCGCGGAACCAAAATCAATGGAACTCTAGAGAGAGAAACTAGAGAGAGAGTGAGAGAGACAGAGAGTGTG TGAGGGTTGGTTCAGTTCCTAACTAGTTTGCTAGCTTCCACAGGTAATTGTCCTTCTGGAACTTCACTGTGTGTGACATT TTTCAGCTACAGCTTCTTTGTTTGTACTCATGGAACTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGATTATGTACTGCTAAGTAAAT GCAAGTTGAACTTTTTTTTTTTTTTCAGTTATGATTTTGATTATGTTTTTTTATTTGGTTTGTTAAGGAAGTTGGAATTT GCTTAGTTTTTTGTGGGATAATTTCGGGGTTGACTTGTGATTTGGCGCGCCAATTGGTGAGTTTTGTGGGTTTTGAGTTT CTTTCTTCTGGGTTTTGGGTTTTGACTTTTGATTATGTTGCTCATGTAATTCTGGTTGTCTATGTTGGTAATCCTTGGAA AATCAATGGAGATGTCAAGCATAAGGTGGTGGTGGTGGTCAGAAAGTGCACTTTTTTAGTTTTTGATTGTGAATGGAACA TTTCTAATTAGGTTTTTAGGGGTCTGTGGGGGGAGTAAAATCTATAATTTTTCCAAAAAGGAATCTTTTTAAATTTTTAT GTTTGTTAGATAATGTTATGCAGGATGAAACTAGGTTGTTCCGAAATGGGGCAATCGCCCCGTCAAGAGAAAAATAATTT CTTAATAGAATAGTATATAAATGTGATATCCCCCTCAAATTTTTATACTGAATCTTTTAATTAGCCATTGATAATTCTGC TTATTGTGTTCAATTTTTGCCCCTGGACTTATTCTTTCTGGTTCCTTCCATGATATGACTATGTCTCCTTTAACTGAGAT 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CAAAGTTTATATGCGAAACCGCTACTTGATATACTGGATCCTGATGGAAGGTTTATTTCTCGCCGTGTGTATCGGGAATC ATGCCTTTTTTCAGATGGAAATTACACCAAAGATCTTACTATATTAGGTGTTGATCTGGAAAAAGTTGCAATAATCGATA ATTCACCTCAGGTATATAATCTATCCCTCTCTTTTGTTAGTTCAACTAGATATCTTTCTTTTAGTTCCCTATTTCTAAGC AGTTTACGAACTTGAAAAAATATGTCTAAGAAAAACTATAGGCCAAACCATTAAGAGAGATTTAGAAATAAATGGTCTAT CCGAGAGTTCAATACATTGTAGAGTATTATGGTATCGTTTGACTTATGCAGCTGACCCTACCTAGTGGGGAAACACTTAG TTGTTGTTGCTGATTTTCTGTACTTAAAGAAGTATAGTATATAATAAAGCTATACATAAAAGGCATGCGGAAAATTAGGT ATATATTATTAAATCTTAGTAACAATTATCTTTGGGGAATGCAGCAGCGAGCCGATGAGCACTAGGCTTTGACTTTCATT AAAACTGAATAAAAAGGGTAGAAACATGTGAGATTCCTTTCATTGAGTAAATAAATAACATGGTGGGTTTGGATGAGAGG AAAAGGGTGGGGAAGAAGGTAAATTGACTCAACCCTTGTTTGAAGTTTCTTGAATGTGGGAGGGAGAAGTGTCTCCTCCC CCTCCTCCACCTCGAAGCTTCAAAATTATTTCCCCCTCAAATTTGGGCTGGGTTTAAAGCTTTATTTTAAATTAAATAAA GGCAAATAACCGTCATTCCCTTCCTTCACTCACTTAAACATCCAAACAAGAAGAAATAACTCCCTTTCCTTTCCCTTCCC TTCCCTTTCCATCTCTCTGCACTCACTTTATAATATCCATAGGTCCTGGATGAGGGAGGGGAGAAAAATATTTTCTTCAC TGAATATTTTTGTATGTGTAATCCTTTCACTCTTATAAAACATTTCAGGTTTTCCGTTTGCAAGTGAATAATGGTATTCC CATAAAGAGTTGGTTTGATGATCCATTAGATTCTGCACTGATGTCATTACTTCCCTTTCTAGAGACCTTGGCTGATGCTG ATGATGTCCGTCCTATCATTGCAAAGAGATATGGTAACAAAGAATAAGGTTTCTTGTTACACCAAATTTAGCTGCTCTTC TACTTTCTCTAGGTTTAAGAAAATTTGGCCTCTAATTAGATGCTAAGGTCCCCTTTCCGTTTGAGCTTGAGATGAATTAA CCTATACAATAAACTATTGGTTGTCTTTTGGTTGAGTCCAAAATTGGTTCCTATTTCTTCTCAGTTGACAAATCTGGAGT TCTCAGTTTCTCTTGAAAGGTAGTTTTATCAAGTATCTCTGTTTCTTTTCTCCCTCTATTAGTCTTTGACTTGTATAGTT GAAGTTCATATATTCTATGTGGGTGTACATGAAGTTTATCATATTATGGAGGGCAAATCAATTGTATGTGTACCAATAGA AATGGAGACTGTATCGAGTTTTTACTTGGTCTTTGTTTATCTTTCTTGTCGTATGATCATCTAGGATTGTGATTCAAGTA TTATTCTATGCATCATTGATGCATGTGTTATCAAAGGTGGCAGAAAAGTTTAGTTCACTATCTAAAAAGAAAATTGAACA AAATGTTCAAGGATAGTAAAAATACTAGGATAAACTTATTATGAGTAAGTACAACTGTACAACTAATTGAAAAAATCTCA AATAGGTTTAGAACTGAAATTTTAACAATCAGGTTAACAGTTGCATGGCTGAGATGGAAGAGTGTATGTGAATCAGTCTT TCAAGCAATAAGTCATCAGTAGTCAACAAATTTGAAACATATACCTAAAATTGCAAAGAAATGAAAGATCATAGATATGA AACACTCAACAAGTTTATTGGAATAATTGAATAATGTATTGTTGAGGATGCTCAGTGACAATCTTATTTCAATTAAGGTT TCAGGTGCATTTATAAGAAATCACAGAAGATAAATGTGAAATTAGTTATATTCTTAATCAAACTTCAACTCAAACCCACA CTCTAGTAAAAAGTTATAGATTAATTAATCATCAAAGGCATCTAAATGTTAACACTTAGGTCTATTATAGACCCATTAAA GCCAAACAATCTAATAACTATCCTGATTCTAAGCTAGAATAAGATAATCCAAAAATAGAATAGAATCTATAATTTTACTT CGAGCTGGTCAGCTTTTGTTACATTTGTACACTGAAATGCAACTTGTTTCTGGGATTAAAATCATGCTGGATTTGAAAAT TATGAATGTTTTAGCCTATTTTATATGGGAATTACACTGGTAAAGCTTAAATTTATTTGGATTGCAAAAATGTATCTCGT TTCTGACATGAAAACCATGCTACAATTGTAAACTTTGAATGTTTGAGCATATTTACATTGTTAAAGCTTAAATATATTTC CATCTATTGTGTGGAACTGATCCACAAATCGGACTCCATCACTTCGGCATCATAAAGTATTTGGCCATCTATCAGGTCTG AGGTGGAATTCTTCATCCTTATAAATTTCAATTACTTGTCAAGTCCTGAAAGGTAATAAACTAGCTTCTTTTGCTTTTCG TTCTTGTATGAACTTTGATCAAACTAACTAATTGTTAAATTTTATTTTCTAGATTATCCTTTTAAGTTCTGGTCTGAAGA ACTAATTTACATCTTGCATAAATAACCTTCTAACTTCCAAGTGGCTTGTTGCTATGTTTTTACCTTCACAGTGTACACTC CACTGGAGATCTTGATTATTAGACTTATTGATACCTATCCATTTCCTTGATATCAATACCTGTTCCCAACTTTCATGTGT ATAAGGACTTGATGTAAGGAAACGGTTCACACAGGTGGAAAGAGATTATAATCATTCTATGGACATCCCTGATACATTTG GCTGCACTGCTATACTTCACTAGCCATAAATTACTTTGGTCATCCTTGATATTGGAACCTTGTGATATGAAAGAGTGACA CATTTAATTGATTTGTACTGCTATTACTTGGTTTTTAGAACAAAAGAGATGTCAAAGTAAGATTGAATTTTCTAATTATG AGAATGAGCTTGTTTCAATGGTTTAAAAGTGTAAAGAATATCCCTTTATAGGTAATCAGTTTGGCTGGCAGCTGGTGGAT GAGGAATACTCATGTTATCAATAGGTGTGGTATATTCTATTAATATTAGATTCTTATTCAACCATATCAACCTTGGTACA GTGAATTTGAGGTAATCTATTTTAAAAAAGGACTACAACTATTATTAATATTATCAGTCTGCTACAGTGGATATGAAACC GAGAGTACAGCAACTATATGTGAGGAAATGGAAGGATGGGAAGCTAAGTGGTTGTACATATGATATGAACATCATATGCT CTAGGGTTAACATGTGCTGATGTTGTGGTTCCTTCTGGGACAAAAGTGAGAAGAGAGGTGGTTTGGTGACAAGTACTTGA ACTGCTAAAACTTCCTTTAGGTTTAAATTCAAAGTTGATGGACTTCACCTGTATGAAATAGCTGACTATCAATTCTTTGA TGATTGTCTGCTATTTCTTGCTATGGTCATCTGCTTTCATGATTTTGCATCCATTGTCTGCAGGTCTGTGAAGAAACTTT TATTAGATTATCCCTCTAATGGCTGTCTAATAGGTATGTACATTTTGTTACAGTCTGGAAGCAATTCTTAGGTATTTGTT AATTATCTGAAGAAATTGTAAAATCCTACTTGAAATGTTAAATCGTTGTTATTTCACTGGTAGTTCCTTTCCTCTTCCTG TTCTTCATTTCTGGCCATTTGTTATTTTGTCATTTACAATTGTCCATCATTGTATTCAGAAATACAAATGATTTGCTACT GAACACTCTAGCCAGAATTATTGGATTGACTATATAAAGAAAGGTATACATCATGTTAAAGTTGTAAAGGAAGAATATGT GTGGGGGAAACTGGATGAAAGTCGATTTATATGATGTAGTAACAAAAGTAGATTAGGATAATAAAGGGATTTATACAAGA TATAAAGCAAAGTATACTGACCCTTATTTATAAGGTTCTATCAACATATACTAGGGTGTATTATACACCATTAATTAGCT AGGAAATAGTTAGAGATTGAAATGATTTTCTGTGATTTCTTGCTAATCCGCTGTTATTTTCTAGCTAACTTTCTAGCATG TGATTGCATTAGATATTATCTACAATTTTGTACATTCATCTAATGAAAGAGATAGACAGATATTCACCTATGTTTTGAGG GTTCTCTACTTTCTAGCGTATGATTGCATCATATATTAGCAGCAATTTCGTAAATTCATCTAATAAAAGGGATAGACATA TATACACTTTTAATTAACAACGGAAATGGTCAGAAATGTTCTTGTTCAACACTGCAGTTTGGCCAAAGGGGAGACTATAT GTACATGGTCACCGCCAACATTTTCAACTTCTTTTGATGCGGCTACATGAAATAATTTGTGGCTCCCTCACTTTTTTATT TTTATTCAACTAGGACTTTAGGAGCCCTTCTTCCACATGCCACAGAAGTACAAATAACACCCTCTTTATTTTTTTCTGGT TATCTTCTCTAAACTCAACGGTGTATACAATAGTGAGCTTCGGTTTCTTCCTTTTTTAACTTCTTACTTTCCCTTTTCAT AGTCCACCACTTTTCCTTCTTATATAGTCTTCACCCCCAAGCCAAAAATATGTTTTCACCATTACCTGTGTAAGATTCTA 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AAACGAGATTTATGTCTTGCAGCTTGATTCCCCAGCATGGATTGCTTTGACTGCAGTCAAAATTAATAGCTACTGGACTT GCTGAAGTTCCATGTATGTCTTCATATGACACTTTGCTTATCTTCACCCCAGAACTCTGTTTTCAAATTATTCATGATTA GGTTATTATTGAATCGGAAAGAATGAATGGTCAAATTAGTCCCTAAAAGTGTTAAACGCTAGCAAGTTCGTCAAATTGGT CCATAAAAGTGTTTTCAAATTATTCATGATTAGGTTATTATTGAATTGGAAAAGGTGAATGGTCAATTTGGTCCCTAAAA GTGTTGAGCGTTGACAAGTTCGTCTGTAGATAAAAGAAATATTTCTGCGGTCCCTAATTGTGTAAAATGCTAGTTAGAGA CTAACTTGACTAACGTTTTATCTAACCACAAAGACTAAATTCACCCAAATTTAATACAATTAAGGAACGCACCGGTATTT TTTAAATCTAGAGACGAACTTGTCGGCGTCCAACAGGACCATTTCACCATTCCCTCAATTTGAAATTAAGCATGTAATAA TAATCCTGGTTTGTAGAGATCAATCTTACTGACCTGGTGAGGACATTGCCTGCCAGGGCAATATCTTTGATCAATAATGA TGGGATTGTAGACATTTTGCATGATAAGTTTCCTGAACACAATGTCTCTTACAAATCCATTGCTTGGTCTCGCCCATGAT TTGATCCTAACTCCATTATCGGTTTTGGTGAACACTGAATTGGTCACTGTCACGTTCCTCACTCCTGCCTCATTCGAAGA AGTTCCCAAGCTCCCAATGC 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0211000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCCATCCCTAAAAATGAAGAGCAAAGTAAGTGTGAGCTGTTTAACAGAAAGAACAGATCTTCTTCATGTGTGTCCAAA ATCAAAGATAATTTCCAAAAATCCATGCTCTAAGATAATGATTTCTGCTCAAACGGTAGAAATAGACACTACTATCCAGA ATTTCCTTGATGTTTCCTCAAAGCCGCCCAAAGACATTGCAAGTGATCAATCCATTGACAAAAAAGAATTTCTGGATAAC GAAAATTCTGTCCTGGAAAGAATGGAACTGAACAACCCCTGTACAACAAACTTTGAGACAATTTTTTCTCCTGCTTTTGA GCCCATTGAAGTCAATTCCCAACATTATACTGAAAAAGATGCAGGGAGCATTTGTGATACTAACATGGCAGGATTAGGAG CTGATGAGGGAAGAAATATTTGTGGCTATGAAACATGTGATGTTTCAGACTTCTACATTTCTGACATGATCATCTCAAGC TTACCCATTGGTGGAAATGCCTTTGACGATGATGATGTCGGTGAAACCAATTGCCTCTCTGACTATGGATCAGATGAGCC ATCCGTGTTTCCTGCTTCTGAGCAGTACACGGTCCTGCCTGCTCTTGAAGATGATGTTAAAGTTGGCGGTATTTCTCAAA TCATATCATATGAAGAAGCCATGATGGTTCAAGAAAGTGCTAGCTTATATTCAGCCATGACTCAGATTAGATCAAGCAAC CTGGAATCTGATGCTAAAAATGACATGGATAAGGCGGAGTCCTTTGATCCGCAATCATTTATCAAGAATTTACCAGAACT ATCTGAAGCAGATTTAAGTGGCCAGCCCACATTAATCCCTAAGCAATCTCCAAAAAGGAAGTCAATAACCCTAGTGCTTG ATTTAGATGAGACACTTGTTCATTCTACATTGGAACCTTGTGATGATGCGGATTTCACTTTTACCGTCTTCTTCCATATG AAAGAGTATACAGTATATGTAAAACAGAGGCCTTACCTCCACACATTCTTGGAGAAAGTATCAGAGATGTTTGAAGTAGT TATTTTTACTGCCAGCCAAAGTTTATATGCGAAACCGCTACTTGATATACTGGATCCTGATGGAAGGTTTATTTCTCGCC GTGTGTATCGGGAATCATGCCTTTTTTCAGATGGAAATTACACCAAAGATCTTACTATATTAGGTGTTGATCTGGAAAAA GTTGCAATAATCGATAATTCACCTCAGGTTTTCCGTTTGCAAGTGAATAATGGTATTCCCATAAAGAGTTGGTTTGATGA TCCATTAGATTCTGCACTGATGTCATTACTTCCCTTTCTAGAGACCTTGGCTGATGCTGATGATGTCCGTCCTATCATTG CAAAGAGATATGGTAACAAAGAATAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0211000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MPSLKMKSKVSVSCLTERTDLLHVCPKSKIISKNPCSKIMISAQTVEIDTTIQNFLDVSSKPPKDIASDQSIDKKEFLDN ENSVLERMELNNPCTTNFETIFSPAFEPIEVNSQHYTEKDAGSICDTNMAGLGADEGRNICGYETCDVSDFYISDMIISS LPIGGNAFDDDDVGETNCLSDYGSDEPSVFPASEQYTVLPALEDDVKVGGISQIISYEEAMMVQESASLYSAMTQIRSSN LESDAKNDMDKAESFDPQSFIKNLPELSEADLSGQPTLIPKQSPKRKSITLVLDLDETLVHSTLEPCDDADFTFTVFFHM KEYTVYVKQRPYLHTFLEKVSEMFEVVIFTASQSLYAKPLLDILDPDGRFISRRVYRESCLFSDGNYTKDLTILGVDLEK VAIIDNSPQVFRLQVNNGIPIKSWFDDPLDSALMSLLPFLETLADADDVRPIIAKRYGNKE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 460 460 5.3E-135
PANTHER 1 460 460 5.3E-135
Gene3D 274 458 185 3.8E-69
SUPERFAMILY 278 454 177 5.5E-58
ProSiteProfiles 284 443 160 46.753
SMART 287 431 145 6.5E-63
CDD 289 421 133 3.21593E-57
Pfam 290 450 161 1.5E-53
TIGRFAM 290 453 164 2.1E-64
Coils 461 461 1 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphatase activity Catalysis of the hydrolysis of phosphoric monoesters, releasing inorganic phosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0211000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…