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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0211000 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0211000.2 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | CTD small phosphatase-like protein; TAIR: AT5G46410.1 SCP1-like small phosphatase 4; Swiss-Prot: sp|Q54GB2|CTSL2_DICDI CTD small phosphatase-like protein 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S1P8|A0A151S1P8_CAJCA CTD small phosphatase-like protein 2; Found in the gene: LotjaGi6g1v0211000 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:50838019..50851318) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGCAACGGTCGAAGGCGTAGATCATCAAATCTCCGCCGTCCGTAGCATAATCCAACAACGCATAGTTACACTTGCTCTCT CTCTCTTCACCCGCGGAACCAAAATCAATGGAACTCTAGAGAGAGAAACTAGAGAGAGAGTGAGAGAGACAGAGAGTGTG TGAGGGTTGGTTCAGTTCCTAACTAGTTTGCTAGCTTCCACAGGTAATTGTCCTTCTGGAACTTCACTGTGTGTGACATT TTTCAGCTACAGCTTCTTTGTTTGTACTCATGGAACTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGATTATGTACTGCTAAGTAAAT GCAAGTTGAACTTTTTTTTTTTTTTCAGTTATGATTTTGATTATGTTTTTTTATTTGGTTTGTTAAGGAAGTTGGAATTT GCTTAGTTTTTTGTGGGATAATTTCGGGGTTGACTTGTGATTTGGCGCGCCAATTGGTGAGTTTTGTGGGTTTTGAGTTT CTTTCTTCTGGGTTTTGGGTTTTGACTTTTGATTATGTTGCTCATGTAATTCTGGTTGTCTATGTTGGTAATCCTTGGAA AATCAATGGAGATGTCAAGCATAAGGTGGTGGTGGTGGTCAGAAAGTGCACTTTTTTAGTTTTTGATTGTGAATGGAACA TTTCTAATTAGGTTTTTAGGGGTCTGTGGGGGGAGTAAAATCTATAATTTTTCCAAAAAGGAATCTTTTTAAATTTTTAT GTTTGTTAGATAATGTTATGCAGGATGAAACTAGGTTGTTCCGAAATGGGGCAATCGCCCCGTCAAGAGAAAAATAATTT CTTAATAGAATAGTATATAAATGTGATATCCCCCTCAAATTTTTATACTGAATCTTTTAATTAGCCATTGATAATTCTGC TTATTGTGTTCAATTTTTGCCCCTGGACTTATTCTTTCTGGTTCCTTCCATGATATGACTATGTCTCCTTTAACTGAGAT GTGTTTGAAGATATAGTTCTATGTGGCTGCTATGTTTTCCTTAAGGCTTCTTGGTAAAATCATTATTCGGCAAATTATGC AGTTTGCTTGCTTTGGTTTAAGATAATTTCTTATTTGTTATAACATTTTTTTTGTTTATCCTCTACTTTGTAATCTCTCA CCTCTCTTCTCTTAATGAGATCATTTATTTTTATAACTTTATGAAGAAAAGACCTGGACTTTCAGTTTCCGATTCTAAAA TGCACATTTCTTAATGCTGACACTGAAATATTGCATGCTATTTGAGTTACAGTTCTTTGTTCCTTTAAAGAATCCTCAAT GCATATTTTACCTCTTGTGGATTACATACTTTCTAATTTGGTATATCTGTTCCCTTTTCTTTGTACAGCAGCCTCTGCTG CCTTGACTGCCTAGAGGGACCTTCGTTCCCCACACATGTGCCCAGAGCCAGACTGCTGTGCCTATAGTAAGCATAAATCA AATGCCATCCCTAAAAATGAAGAGCAAAGTAAGTGTGAGCTGTTTAACAGAAAGAACAGATCTTCTTCATGTGTGTCCAA AATCAAAGATAATTTCCAAAAATCCATGCTCTAAGATAATGATTTCTGCTCAAACGGTAGAAATAGACACTACTATCCAG AATTTCCTTGATGGTAAGCACACTAAGCAGCAACTTGAAATTTCTTAAACTCAATCTTCCTTCAAGATTTCTGTCGAAGT ATTAATTTGATTTTTTTTCTTGTTAATGTCCATATATATATTTGTGCTTTTGCTTTACTTCAAGCTCTTGAACAGTTTAC CTTTTGCATTTTTTTTTTACATTTTATATAACATGCTGCTGATTGAGCTTTCATTTACGCAACATGCACAATCACATGAG TTTATGATTTTGAATTGTTGTGGACGATTGGTGACTTTGTGTTGTTCATAATTTATGGAACTCCAAGAATAACTTATGCT CCATGTCCTCAAAAAAAAAAAGGACAACTAATGCTCCAACTTTGGCAAGTCATGGAACTACTGGCAGATATTTTCCTTAA TTAAAAATAGGAGGATTTATCTGTGATATACCTGATGATATTCTACTCGGAGGGATAATTATTAGAACATCTTAATACAG GTAGTTTAGGGTTGTAGATCTTCTCTTATTAGTTTACCAATGACCATATTGTGTGAAAGGAGAGATGCACATAAGGTCCT CCTGCTCAGGGTGCCACACCCCTAGAGAATGAATTACAAAATGTCCTATACTAAGTCATAATGTCAATCTCTCACTACAT GGCTCTGTCATGTGAAAGCTCACATTAAGCATTTAACTCTTCTTCTTAGATAACAGAGAGAAAAGACATTGAAAGCATGA TATATACAAAACAAAAGATGCAATTACTACCACGAGGGAAATCCTTGATTAGACAAGATGGTTTATAAGTCTTTGTGATA GGAATTGAAAACAGAGTAGTATTTCTATTGTTACTCTCAGAGTCTAGCTCTGAGGAATTAGAGAATTACAGAAAATGGGG AATGGAAAAGAAAGAAAAAATCAGAGAAGAATGTTTTCTGCCCTTGGCCTGAGCCACCGCACTCACCCAATGATTGCCTA AACCTGTCTTTTACCCTCCGCTTCCTTATATGCACCCTCCCTCCCAATGATTCCCGTATCTTCCTCACCTATCTCTCCTC TCCATGTGTCCATTCTGTTAGCAGCCCTCCTCCTAAGTGCTAACAAACTGATTCCCACCTTTTCCTTCAACATTTCTTTC CTACCCTTACTCTTATTTTTCCTTCTATATACCCTCAAAGGAGGGACTGGCGCGGGTCCAACACTTTGCCTTGGTTGAGG GTTCCGAGCCACTTAGGCAAGGATTTAAAAGAATTCTCTATGCATTTATGACCTGAATTGAAGCTTCAAAATTTTGTTCT TTCTCTCATGCTTTGCACTCTAAAGTAGTCCTGAACACGTACCTAAAGTTTCTTCTTGATCAAAAACTTGGTCTTTTATC ACAAACCGAAATGGGGGGGGGGGGGGGGTTATTAGTCGCAACTTGCAAGGTTTTGGACTCGTTGCATTGGAGTTACCAAA GAAGCAATTGTATGTACTGGCATTATTAATATACGGCTATTAACTCATTATTAGGGGGTTGTCCAGAATTTGGTCAGTGA TTAGATTAGGAATGGCAGTTTTTTTTTTTCTTTGTGAGATTCGTTTGGTATTAAAACAATAATGCATAATATTTTTTATT TAGTAGAGTGGCCAACTATGATGTGAAGTACTCATGCAGAATTGTGTATCCATTTGTATCAGTTTGTTTCCTTCCTTGAT ATACTTTATTTATGTGCTGTAGTTGTAGGTTTTACATTCTGTACACTTATTTTCTCCCTAAAATTATTCTGAAATTATCT TAATCCCTTGCATTTGATAGTTCTTACTGTTTATCTATAGTTTCCTCAAAGCCGCCCAAAGACATTGCAAGTGATCAATC CATTGACAAAAAAGAATTTCTGGATAACGAAAATTCTGTCCTGGAAAGAATGGTAAAGTTTGATTGTATTGGCTTTATTA ATTAGTTACTGATAATTGTGCACATTACTCAGTGTTACATTCGCTCCTGGATAATTTTATTACCATTTTCCAACTAAATA GATATTTGTAGAAGCCGAGTGTAAGTTAACTTTCCTGTTGAGAAGTACAATGTATAAGAAAACACTGAGAGGAGAATAAG GGACTATTGGTGGGGGATGTGATTCTTCCATTCAATCTATGGAAGCTAAGTAGTTTTCTTGGCTTCCTAAAAAATAATTA TAGAATTTATGTCTACATCGATAACTTTTCAACTATACTTCTACTATATCCATGAGAGCTTTTCTGTAATGCACAACTCA 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TGTATATATATGTGTGTATATATATATATATATATATGTATATGCATGGCATGGCATTGCTAAAATTATTTCCACTTCAA TTTTTACAACAATGAAGTTCATAAAAGTGACATCTATTATAAAAATCAGATGCATAGCTATACATGGATATGTATTATGC TTTGTGGATCATTTATATTACTAAAACTGGAAAAAAAATATCCTTATGATTTGAGGAATGACGTGTAGGCCATATGGTGT ATATATGTTTACAAAAATCACAAATGGTTATTGATGTTTAACCATTTTGAGTTAGAAGTTTAAAAATAAGAGTTATTGAG AAACACATGGAAAATAGAAAATAGGTCAAAGTTCTTGATCTTTCAGCAGCTTTCCCATGGAATCAAGACATAATATGGTG TTCTTCTCCATACTTACTTAGTAATAATGCGCTCGAGTACTTATCTCATTCCTTCCAAATATTTATGCCTTTGCATGGCA TTCTTCACCAACTCTTGTGCTTCGGCAAAAAAGGATCGATAAAAGAAAAAATTGTCACTTTATTGAAATAAATTTGACTC TTCTAACCCATGGTAACATTCCTTCTCAATATATGCTAATAAATCACTAAAGTTGAGACAGCTGAATTTGATTGAGAACT AAGTGTTTTCTTTAAAGTCACTTAGTCTGACGGACTTGTTTGAGTATCTCTATTGGATAATATTCTGTTTCATTCACATT AATAATCATTTTTCCCCAATGCTTTATTTCTGAAATATTTACCTTAGCCTTCCATCATGCTCATTATATGCAGAGACACT TGTTCATTCTACATTGGAACCTTGTGATGATGCGGATTTCACTTTTACCGTCTTCTTCCATATGAAAGAGTATACAGTAT ATGTAAAACAGAGGCCTTACCTCCACACATTCTTGGAGAAAGTATCAGAGATGTTTGAAGTAGTTATTTTTACTGCCAGC CAAAGTTTATATGCGAAACCGCTACTTGATATACTGGATCCTGATGGAAGGTTTATTTCTCGCCGTGTGTATCGGGAATC ATGCCTTTTTTCAGATGGAAATTACACCAAAGATCTTACTATATTAGGTGTTGATCTGGAAAAAGTTGCAATAATCGATA ATTCACCTCAGGTATATAATCTATCCCTCTCTTTTGTTAGTTCAACTAGATATCTTTCTTTTAGTTCCCTATTTCTAAGC AGTTTACGAACTTGAAAAAATATGTCTAAGAAAAACTATAGGCCAAACCATTAAGAGAGATTTAGAAATAAATGGTCTAT CCGAGAGTTCAATACATTGTAGAGTATTATGGTATCGTTTGACTTATGCAGCTGACCCTACCTAGTGGGGAAACACTTAG TTGTTGTTGCTGATTTTCTGTACTTAAAGAAGTATAGTATATAATAAAGCTATACATAAAAGGCATGCGGAAAATTAGGT ATATATTATTAAATCTTAGTAACAATTATCTTTGGGGAATGCAGCAGCGAGCCGATGAGCACTAGGCTTTGACTTTCATT AAAACTGAATAAAAAGGGTAGAAACATGTGAGATTCCTTTCATTGAGTAAATAAATAACATGGTGGGTTTGGATGAGAGG AAAAGGGTGGGGAAGAAGGTAAATTGACTCAACCCTTGTTTGAAGTTTCTTGAATGTGGGAGGGAGAAGTGTCTCCTCCC CCTCCTCCACCTCGAAGCTTCAAAATTATTTCCCCCTCAAATTTGGGCTGGGTTTAAAGCTTTATTTTAAATTAAATAAA GGCAAATAACCGTCATTCCCTTCCTTCACTCACTTAAACATCCAAACAAGAAGAAATAACTCCCTTTCCTTTCCCTTCCC TTCCCTTTCCATCTCTCTGCACTCACTTTATAATATCCATAGGTCCTGGATGAGGGAGGGGAGAAAAATATTTTCTTCAC TGAATATTTTTGTATGTGTAATCCTTTCACTCTTATAAAACATTTCAGGTTTTCCGTTTGCAAGTGAATAATGGTATTCC CATAAAGAGTTGGTTTGATGATCCATTAGATTCTGCACTGATGTCATTACTTCCCTTTCTAGAGACCTTGGCTGATGCTG ATGATGTCCGTCCTATCATTGCAAAGAGATATGGTAACAAAGAATAAGGTTTCTTGTTACACCAAATTTAGCTGCTCTTC TACTTTCTCTAGGTTTAAGAAAATTTGGCCTCTAATTAGATGCTAAGGTCCCCTTTCCGTTTGAGCTTGAGATGAATTAA CCTATACAATAAACTATTGGTTGTCTTTTGGTTGAGTCCAAAATTGGTTCCTATTTCTTCTCAGTTGACAAATCTGGAGT TCTCAGTTTCTCTTGAAAGGTAGTTTTATCAAGTATCTCTGTTTCTTTTCTCCCTCTATTAGTCTTTGACTTGTATAGTT GAAGTTCATATATTCTATGTGGGTGTACATGAAGTTTATCATATTATGGAGGGCAAATCAATTGTATGTGTACCAATAGA AATGGAGACTGTATCGAGTTTTTACTTGGTCTTTGTTTATCTTTCTTGTCGTATGATCATCTAGGATTGTGATTCAAGTA TTATTCTATGCATCATTGATGCATGTGTTATCAAAGGTGGCAGAAAAGTTTAGTTCACTATCTAAAAAGAAAATTGAACA AAATGTTCAAGGATAGTAAAAATACTAGGATAAACTTATTATGAGTAAGTACAACTGTACAACTAATTGAAAAAATCTCA AATAGGTTTAGAACTGAAATTTTAACAATCAGGTTAACAGTTGCATGGCTGAGATGGAAGAGTGTATGTGAATCAGTCTT TCAAGCAATAAGTCATCAGTAGTCAACAAATTTGAAACATATACCTAAAATTGCAAAGAAATGAAAGATCATAGATATGA AACACTCAACAAGTTTATTGGAATAATTGAATAATGTATTGTTGAGGATGCTCAGTGACAATCTTATTTCAATTAAGGTT TCAGGTGCATTTATAAGAAATCACAGAAGATAAATGTGAAATTAGTTATATTCTTAATCAAACTTCAACTCAAACCCACA CTCTAGTAAAAAGTTATAGATTAATTAATCATCAAAGGCATCTAAATGTTAACACTTAGGTCTATTATAGACCCATTAAA GCCAAACAATCTAATAACTATCCTGATTCTAAGCTAGAATAAGATAATCCAAAAATAGAATAGAATCTATAATTTTACTT CGAGCTGGTCAGCTTTTGTTACATTTGTACACTGAAATGCAACTTGTTTCTGGGATTAAAATCATGCTGGATTTGAAAAT TATGAATGTTTTAGCCTATTTTATATGGGAATTACACTGGTAAAGCTTAAATTTATTTGGATTGCAAAAATGTATCTCGT TTCTGACATGAAAACCATGCTACAATTGTAAACTTTGAATGTTTGAGCATATTTACATTGTTAAAGCTTAAATATATTTC CATCTATTGTGTGGAACTGATCCACAAATCGGACTCCATCACTTCGGCATCATAAAGTATTTGGCCATCTATCAGGTCTG AGGTGGAATTCTTCATCCTTATAAATTTCAATTACTTGTCAAGTCCTGAAAGGTAATAAACTAGCTTCTTTTGCTTTTCG TTCTTGTATGAACTTTGATCAAACTAACTAATTGTTAAATTTTATTTTCTAGATTATCCTTTTAAGTTCTGGTCTGAAGA ACTAATTTACATCTTGCATAAATAACCTTCTAACTTCCAAGTGGCTTGTTGCTATGTTTTTACCTTCACAGTGTACACTC CACTGGAGATCTTGATTATTAGACTTATTGATACCTATCCATTTCCTTGATATCAATACCTGTTCCCAACTTTCATGTGT ATAAGGACTTGATGTAAGGAAACGGTTCACACAGGTGGAAAGAGATTATAATCATTCTATGGACATCCCTGATACATTTG GCTGCACTGCTATACTTCACTAGCCATAAATTACTTTGGTCATCCTTGATATTGGAACCTTGTGATATGAAAGAGTGACA CATTTAATTGATTTGTACTGCTATTACTTGGTTTTTAGAACAAAAGAGATGTCAAAGTAAGATTGAATTTTCTAATTATG AGAATGAGCTTGTTTCAATGGTTTAAAAGTGTAAAGAATATCCCTTTATAGGTAATCAGTTTGGCTGGCAGCTGGTGGAT GAGGAATACTCATGTTATCAATAGGTGTGGTATATTCTATTAATATTAGATTCTTATTCAACCATATCAACCTTGGTACA GTGAATTTGAGGTAATCTATTTTAAAAAAGGACTACAACTATTATTAATATTATCAGTCTGCTACAGTGGATATGAAACC GAGAGTACAGCAACTATATGTGAGGAAATGGAAGGATGGGAAGCTAAGTGGTTGTACATATGATATGAACATCATATGCT CTAGGGTTAACATGTGCTGATGTTGTGGTTCCTTCTGGGACAAAAGTGAGAAGAGAGGTGGTTTGGTGACAAGTACTTGA ACTGCTAAAACTTCCTTTAGGTTTAAATTCAAAGTTGATGGACTTCACCTGTATGAAATAGCTGACTATCAATTCTTTGA TGATTGTCTGCTATTTCTTGCTATGGTCATCTGCTTTCATGATTTTGCATCCATTGTCTGCAGGTCTGTGAAGAAACTTT TATTAGATTATCCCTCTAATGGCTGTCTAATAGGTATGTACATTTTGTTACAGTCTGGAAGCAATTCTTAGGTATTTGTT AATTATCTGAAGAAATTGTAAAATCCTACTTGAAATGTTAAATCGTTGTTATTTCACTGGTAGTTCCTTTCCTCTTCCTG TTCTTCATTTCTGGCCATTTGTTATTTTGTCATTTACAATTGTCCATCATTGTATTCAGAAATACAAATGATTTGCTACT GAACACTCTAGCCAGAATTATTGGATTGACTATATAAAGAAAGGTATACATCATGTTAAAGTTGTAAAGGAAGAATATGT GTGGGGGAAACTGGATGAAAGTCGATTTATATGATGTAGTAACAAAAGTAGATTAGGATAATAAAGGGATTTATACAAGA TATAAAGCAAAGTATACTGACCCTTATTTATAAGGTTCTATCAACATATACTAGGGTGTATTATACACCATTAATTAGCT AGGAAATAGTTAGAGATTGAAATGATTTTCTGTGATTTCTTGCTAATCCGCTGTTATTTTCTAGCTAACTTTCTAGCATG TGATTGCATTAGATATTATCTACAATTTTGTACATTCATCTAATGAAAGAGATAGACAGATATTCACCTATGTTTTGAGG GTTCTCTACTTTCTAGCGTATGATTGCATCATATATTAGCAGCAATTTCGTAAATTCATCTAATAAAAGGGATAGACATA TATACACTTTTAATTAACAACGGAAATGGTCAGAAATGTTCTTGTTCAACACTGCAGTTTGGCCAAAGGGGAGACTATAT GTACATGGTCACCGCCAACATTTTCAACTTCTTTTGATGCGGCTACATGAAATAATTTGTGGCTCCCTCACTTTTTTATT TTTATTCAACTAGGACTTTAGGAGCCCTTCTTCCACATGCCACAGAAGTACAAATAACACCCTCTTTATTTTTTTCTGGT TATCTTCTCTAAACTCAACGGTGTATACAATAGTGAGCTTCGGTTTCTTCCTTTTTTAACTTCTTACTTTCCCTTTTCAT AGTCCACCACTTTTCCTTCTTATATAGTCTTCACCCCCAAGCCAAAAATATGTTTTCACCATTACCTGTGTAAGATTCTA GTAGTTTTACATCGTTCTCTAATAGATCACATCCGTTGAAATTTTTACATTACTAAAGTCTTACACTGATGTAAGTTGAT CCGCTCCTTATGGAATTATATTATATTAGTTAAAGTTTTCATCATTCAAAAAGAGGTTATGTAACATTTTGGTTTGAATG TTCATCTAAACACTGCAGTTAACATAGATCTTATAATCTTGGGTGCTGCAAGACTTCTGAATAATGATTCATTTATACCT ATTACATTTACACTTTATGAGAGAGTTAAAGATAAATGAAAGAGAAAACAGAGATGTAATAGAAAAAGAAGAGAGATATG AAGAAAAAGTCAAGCGAATTTAGATGAAAGTGAAGCGGAGTGTGACTTATTTCTAAACCGCACATTTATCATTGATATTT CTTTCTTTTTCTGGTATATAATGCTTAAAGAAAAATAAGCTAACGCCTCAAAAACAAGGTGTCTGTCATTTTCAGCCAAA AGTGAACCACCCGGAGGAGGTTGATGGTGAATCACCAACCCATCAGAAACTTAATTTAGCTTTATCATTGCCAAAAATCT GCAGTCGCATTTCTCTCACAATGCAATCACACAAACCAACAATTGATATTTCTAAGCAGCGAGTCTATTTATATTATTTC CACTGAAAATACGTATAGACTATAGATAGAGAGAGGCAAACTGCTTTTACATTATGCAATCTATATACATTTCAGTAAAA AGAAATTCAACATATGAAATACATTCAATATTGATGAAGACTATATATGATATCAAGTTTCACTCACATTGCAGGCAATA ATGAAATGATATGTGCAGAAATTACAGTGTTTTTCAATTATGATCAACTTTTTTATTTTCAATTAAAGTGTATAAATTTA AATACAGCTCCTTGGGATGACCACTCCAATGGTACTGCCACCAGCATTTCTACAAGCTGATTTTGCAGAACCTTTCCGAT AAACGAGATTTATGTCTTGCAGCTTGATTCCCCAGCATGGATTGCTTTGACTGCAGTCAAAATTAATAGCTACTGGACTT GCTGAAGTTCCATGTATGTCTTCATATGACACTTTGCTTATCTTCACCCCAGAACTCTGTTTTCAAATTATTCATGATTA GGTTATTATTGAATCGGAAAGAATGAATGGTCAAATTAGTCCCTAAAAGTGTTAAACGCTAGCAAGTTCGTCAAATTGGT CCATAAAAGTGTTTTCAAATTATTCATGATTAGGTTATTATTGAATTGGAAAAGGTGAATGGTCAATTTGGTCCCTAAAA GTGTTGAGCGTTGACAAGTTCGTCTGTAGATAAAAGAAATATTTCTGCGGTCCCTAATTGTGTAAAATGCTAGTTAGAGA CTAACTTGACTAACGTTTTATCTAACCACAAAGACTAAATTCACCCAAATTTAATACAATTAAGGAACGCACCGGTATTT TTTAAATCTAGAGACGAACTTGTCGGCGTCCAACAGGACCATTTCACCATTCCCTCAATTTGAAATTAAGCATGTAATAA TAATCCTGGTTTGTAGAGATCAATCTTACTGACCTGGTGAGGACATTGCCTGCCAGGGCAATATCTTTGATCAATAATGA TGGGATTGTAGACATTTTGCATGATAAGTTTCCTGAACACAATGTCTCTTACAAATCCATTGCTTGGTCTCGCCCATGAT TTGATCCTAACTCCATTATCGGTTTTGGTGAACACTGAATTGGTCACTGTCACGTTCCTCACTCCTGCCTCATTCGAAGA AGTTCCCAAGCTCCCAATGC
CDS sequence (LotjaGi6g1v0211000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCATCCCTAAAAATGAAGAGCAAAGTAAGTGTGAGCTGTTTAACAGAAAGAACAGATCTTCTTCATGTGTGTCCAAA ATCAAAGATAATTTCCAAAAATCCATGCTCTAAGATAATGATTTCTGCTCAAACGGTAGAAATAGACACTACTATCCAGA ATTTCCTTGATGTTTCCTCAAAGCCGCCCAAAGACATTGCAAGTGATCAATCCATTGACAAAAAAGAATTTCTGGATAAC GAAAATTCTGTCCTGGAAAGAATGGAACTGAACAACCCCTGTACAACAAACTTTGAGACAATTTTTTCTCCTGCTTTTGA GCCCATTGAAGTCAATTCCCAACATTATACTGAAAAAGATGCAGGGAGCATTTGTGATACTAACATGGCAGGATTAGGAG CTGATGAGGGAAGAAATATTTGTGGCTATGAAACATGTGATGTTTCAGACTTCTACATTTCTGACATGATCATCTCAAGC TTACCCATTGGTGGAAATGCCTTTGACGATGATGATGTCGGTGAAACCAATTGCCTCTCTGACTATGGATCAGATGAGCC ATCCGTGTTTCCTGCTTCTGAGCAGTACACGGTCCTGCCTGCTCTTGAAGATGATGTTAAAGTTGGCGGTATTTCTCAAA TCATATCATATGAAGAAGCCATGATGGTTCAAGAAAGTGCTAGCTTATATTCAGCCATGACTCAGATTAGATCAAGCAAC CTGGAATCTGATGCTAAAAATGACATGGATAAGGCGGAGTCCTTTGATCCGCAATCATTTATCAAGAATTTACCAGAACT ATCTGAAGCAGATTTAAGTGGCCAGCCCACATTAATCCCTAAGCAATCTCCAAAAAGGAAGTCAATAACCCTAGTGCTTG ATTTAGATGAGACACTTGTTCATTCTACATTGGAACCTTGTGATGATGCGGATTTCACTTTTACCGTCTTCTTCCATATG AAAGAGTATACAGTATATGTAAAACAGAGGCCTTACCTCCACACATTCTTGGAGAAAGTATCAGAGATGTTTGAAGTAGT TATTTTTACTGCCAGCCAAAGTTTATATGCGAAACCGCTACTTGATATACTGGATCCTGATGGAAGGTTTATTTCTCGCC GTGTGTATCGGGAATCATGCCTTTTTTCAGATGGAAATTACACCAAAGATCTTACTATATTAGGTGTTGATCTGGAAAAA GTTGCAATAATCGATAATTCACCTCAGGTTTTCCGTTTGCAAGTGAATAATGGTATTCCCATAAAGAGTTGGTTTGATGA TCCATTAGATTCTGCACTGATGTCATTACTTCCCTTTCTAGAGACCTTGGCTGATGCTGATGATGTCCGTCCTATCATTG CAAAGAGATATGGTAACAAAGAATAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0211000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPSLKMKSKVSVSCLTERTDLLHVCPKSKIISKNPCSKIMISAQTVEIDTTIQNFLDVSSKPPKDIASDQSIDKKEFLDN ENSVLERMELNNPCTTNFETIFSPAFEPIEVNSQHYTEKDAGSICDTNMAGLGADEGRNICGYETCDVSDFYISDMIISS LPIGGNAFDDDDVGETNCLSDYGSDEPSVFPASEQYTVLPALEDDVKVGGISQIISYEEAMMVQESASLYSAMTQIRSSN LESDAKNDMDKAESFDPQSFIKNLPELSEADLSGQPTLIPKQSPKRKSITLVLDLDETLVHSTLEPCDDADFTFTVFFHM KEYTVYVKQRPYLHTFLEKVSEMFEVVIFTASQSLYAKPLLDILDPDGRFISRRVYRESCLFSDGNYTKDLTILGVDLEK VAIIDNSPQVFRLQVNNGIPIKSWFDDPLDSALMSLLPFLETLADADDVRPIIAKRYGNKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 460 | 460 | 5.3E-135 | – | |
PANTHER | 1 | 460 | 460 | 5.3E-135 | – | |
Gene3D | 274 | 458 | 185 | 3.8E-69 | ||
SUPERFAMILY | 278 | 454 | 177 | 5.5E-58 | ||
ProSiteProfiles | 284 | 443 | 160 | 46.753 | ||
SMART | 287 | 431 | 145 | 6.5E-63 | ||
CDD | 289 | 421 | 133 | 3.21593E-57 | – | |
Pfam | 290 | 450 | 161 | 1.5E-53 | ||
TIGRFAM | 290 | 453 | 164 | 2.1E-64 | ||
Coils | 461 | 461 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Phosphatase activity | Catalysis of the hydrolysis of phosphoric monoesters, releasing inorganic phosphate. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0211000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…