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LotjaGi1g1v0033100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0033100
Transcript ID LotjaGi1g1v0033100.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description NBS-LRR disease resistance protein; TAIR: AT5G66900.1 Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family; Swiss-Prot: sp|Q9FKZ1|DRL42_ARATH Probable disease resistance protein At5g66900; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TSV7|A0A072TSV7_MEDTR LRR and NB-ARC domain disease resistance protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0033100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:4220436..4235663) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGAATGGAGAGAGTAATTCACTATATTTTTTTTATCAACAACAACTTGTGTTTGACTTTTTTTATTTATTAATGTTGTTC ACCAATATATCCCATGTTTGTTTAACGCAGCTCTCTCACCCGGATTGGATCAAAGTTTCTTCAAAAGATCCCTGGAGCAA ATTTGGTTAGTACTAACTAATACATACATATGCTTATTTTTTCCTATAAAAACATGGTGTTGACTTTCTATTTATGATCA TCTTTCTGATTAACGTACAGTGTGTTTGGTTTGTTGGTCCAGGCAGATCATGGCTATGATTGCAGATGCAGTTGTGGGTG AACTGGTTTCGCAACTTCTGAGTAAGGTTTTAGAAATGAAGGACAGGGCTAAAAACTTCAAACCCACTCTGCTGAAGTTG GAGAACACCCTGAAATTATTACAACCAGATGCGGATGAGATAGAAGCAGAATACGCGAAACTGGATCGGGCATCGGAAAC CGAGGGGTTGAAGAAACTTATGAAGAATGGAACGAAACTTGTTCAGGATTGCTCTAAGAAATTCCCGTGGTTGAAGCGTT TTTGGACTAAGGCTAAATATCAAAAGGAACTTGATGAGCTGCATAAGTCAATTGAAACCTACTATAGCCTAAAGATCCAA GGTCAGACGTTGGCGACTGTGTTGCGGGTCGAGAATAAGGTTGATAGGCTTGGTTTACCCTCAAACGATAGGATTGAATT CAGGGCTGTTTGCACGCCTCTCGACCCCCCTTCATTCACTGTTGGCTTGGATAAGCCTTTGGATGTGTTGAAGGGGATTC TGCTCTCCAAAAAGGCTAATGTCACGGTCACAGTCCACACAATAACAGGTTCGGAGTTTTGATATATTCATACTTTACTT TTCTTTCATTTCATTTTCACTCGTTTTTCCTTCTACATTTCTTTACATTTTTAATTCAATCACATCATCATCTAGGAAAA 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AACAATGAAGCCTAGAAAAAGCAATTTGTCGCTGCTGAATGTACATTTTTTTAGATTAATGTACAGCTGGTTCTCCTGTA AGACTTGCAAAACCTGCTTCACATGCTCTAAATGCTATTTCTTTGTTTTACTGTAAATCAGAATATCATCAAAATAAACT ACAACGAAAGAACCAATGAAGGGACGAAGAACCTGGTTCATCAGCCGCATAAAAGTGCTAGGGGCGTTTGACAACCCGAA AGGCATCACCAGCCATTCATAAAGACCATCTTTGCTCTTGAAAGTTGTCTTCAACTCATCTCCAGGTCTGATTCTGATCT GATGGTAGCCACTGCGCAGATCTATTTTGGTAAACACCTTAGAACCAGCCAGCTCATCAAGCATGTCTTCCAAGCGGGGG ATTGGGAAGCGATACTTGGTGGTGATCTTGTTGATGGCTCTACTATCCACACACATTCGCCACTGACCTCCTTTCTTAGG GACAAGGAGCACAGGTACAGCACATGGGCTCATGCTGGCACGAATAAAGCCTTTCTTCAACAAATCTTCAATCTGCTCCC TCAAGATCTCATTCTCCTTGGGACTCATGCGGTAATGGGGAAGGTTTGGCAGGATAGCACCTGGAATCAGGTCTATTTGG TGCTGGATGTCGCGCATGGGAGGCAGCTCATTAGGCAGCTCCTCTGCAGTTAGCTCCTTGAACTCTTCCAACACTTCTAG TACCTCTGCTGGGATTGTCTCCTCCTCCTTCACAGCATTCAGCACGCCTTTTATCACAACTGGGCAGAAATATTTAATTT CTTTCACAGCGCCATCAAAATCCTTCCCATTCAGCACTAGGAAGTTAGTCTTTTTCTCTTCTGAACTCTGATTGAAATGC AGAACAGAAGCTATGGCAATCTTGTGATCACCCCAATTGAACAGCGTCACATTAGCCTTTCCTCTGTAGGTAATGTCTTT 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TTGCTTCATCCTGCGCCATGATCTAACTGCTGATTTCCCCTGTCGCTGCCTCCGAGCAACCAATCTATCCCACCATACAG CAGCAGTGCTCTTCAATTTGATGGCCACCATCTTCACCTGTTTGTTCTCAGGGATATCCATGATGTCGAAGAAACGATCG ACGCTAATCTGCCAATCCATGAACTCCTCTACGGTCATGTTTCCATAAAAGAATGGAATATCTGCTTTAATACGATAATC ATGGTTGTTTTTGCCTCCCTGTTCGCCGGCTTCTTCCTCTTCGAATACATCTTCGTCAGAACTAGAATCCTCTGCGGCGG CAGTATGGTTATTGTTGCCTCGACGTGGGATTCTCCTCTGAGGTTCGTCCTGTACTCGTGTCGTCATAAGGTTCACCAAG GTATTCATCGAATTACCCAGCGCCCCCATCTGTTGCGTGAGTGCTTCTATGGAGGTTGCGACCCTCTCCATATCGCCCTT ACTTGTTGGTTGTTCGTCTGCCATTGATCAGGTTGCAAAAAGACAGGATATGGCCTGCTCTGATTACCACTTGACACAGC GGAACGCACAAGGGTTTGCAAACACAAAACCCTAAGTAACAGAAAACCGGAATCCACCAGGATTTGAGAAAATTCTCGTT TTTTGATTGTCAATAATAATCTGAAATAGGCTATGCCTTACAAGTGCTTAAATAGGAAAAGAAAATATCCTAACAAAAAA ATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTAAAAATAAAATATTCTAATTGAAAAATAAATAAGTTCATAACAAAAAATAAG TAAGATCATAAAGATTCTAACTTAATTAAAAAAACATAATAAATCCTAAATTTATTTAGAAATACTAAAAATAATAACTT CCTAATTACTTGCTCCTGCATCAAACGGAAACCCGCGCAACATCTTCATCAAAACGTGCAGCAAGCCTGTCTGCGTCAGC 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ATTTTTTTTTGCTTAATTAAGTTTTTGGTCCCTAACCTTTGTCATAAATATGGTTTTAGTCTCTCGTCGGCGTAAAAGTG GGATTTTTTTTTCTTGAAGTGTGAACCCTGTACATTAGGTTCGATATCTTACAACCCCATATTTGTCAATAAAAATAAAA GTATATATGACCTGAAAATTCGCAATATATAATGTGAAATCCAGCATTTGAGAAACAAAAGCTCTTGTGCTTGGTAGAAA TAATATTGTTTGTGCTATTTGTATTTTATCGATTTATGAGCATTTTTTTTTTTTTCATTGATCAGGAAACTTGACATAGT TGACTATAATTACCGCTATGTTACTCAGTATGGTCTTCTTCGAGATTTAGCCATTTACCAAACTATCCATGAGGCAGAGG ACAAGGGGAGTAGACTAATTATTGAAAAAAATGGAAATAATCTTCTCAGATGGTGGGGTGTTGAGATTGCAACTCGAATA TTATCCATCTCAACTGGTTTGTTCATTTTTCTGCCTTAATGCACCCTACTGACACAGAAATTGATAGATTACTTTCAAGT TTATATTGAATATATTTTGCAGATGAAGCATTCCCTTCAGAATGGTGTAATAACTTGCAGACAACTGAAGTTGAAGCTCT GGTGTTGAACCTTCGAGGAAAGAAGTGCACGTTGCCAATGTTCATGAAAAATATGAATAAACTAAAAGTCTTGATATTGT CAAATTATGACTTCCCTCCTGTTGAGTTAGAGAATTTCGAGTTGCTTGAACATCTGCCTAGTCTTAAACGACTCAGGTTA GATAATGTTTCGATTCCTCTCCTCATCAAGGCCGAAGTGCAATTGAAGAATCTTCGAAAGTGTTCCTTTTTCATGTGCAA TGTGAATGAAACATTTAAAAATTCCAACACCCAAGTTTCAGATATGCTGCCAAATTTGGTGGAGATGGACTTCGACTATT GCACTATGGTTGAACTGCCAGTTGTGGTCTCTAATAGTGTTTCTTTAACCAAGCTCAGGATTACAAACTGTTATATGCTT ACTAAACTTCCTGAAGAAATTGGGAAGTTGGTAAATTTGGAAACACTAAGCCTTAGTTCTTGCATTGATCTAGTAGAGTT GCCCCAATCAATCACTAGCCTTGAGAAACTAACATTCCTTGATATCTCTGATTGCATAAGCTTCACTAAGTTACCTGAGG ACATAGGCAAGTTGAGAAATTTACAAAAGCTCAATATGAGAGGCTGCTCGAGATTATCTGAGTTACCCAGCTCAATTATG GACATTGAAGCGTTAAAGGATGTGGTATGTGATGAAGAGGTGGCTGAATTATGGGAAGATTTCAGAATGGTCCGTGAAGA TATAAGGCTACAGGTCATTAAAACGGACTTCAGTTTAGATTTCCTTCATCTGCGCTGATGATTGGTGGGATGGCATCACA ATCAAGAGGGGACGAAATATCAAGAATTAAATTTCTGTGTTTTGTCATGATAGAATAAAAAAAAGTTGGTGATAGAATAA AAATATTATTGCATTTCCTGAAATTTGTAATGGAATAATATAGCATAGTATGAAACTATGAATTATGATTTATGAGTGTA TTATTTTCATTCCATAAATTATTATTTTCATTTTCATTTGTAGCCCTCTCCAAAATCTTTGTAATATATATTAAAACTTA ATTGGAAGTTTTGAGGTGTTGATATTTTAGTGTTTCAATTAACAAACATGATGTCATCTAAGAGCTAGTTGGAATAGAAC TCAAAAGGTGGGTGACATTGCTGTGTGG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0033100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCTATGATTGCAGATGCAGTTGTGGGTGAACTGGTTTCGCAACTTCTGAGTAAGGTTTTAGAAATGAAGGACAGGGC TAAAAACTTCAAACCCACTCTGCTGAAGTTGGAGAACACCCTGAAATTATTACAACCAGATGCGGATGAGATAGAAGCAG AATACGCGAAACTGGATCGGGCATCGGAAACCGAGGGGTTGAAGAAACTTATGAAGAATGGAACGAAACTTGTTCAGGAT TGCTCTAAGAAATTCCCGTGGTTGAAGCGTTTTTGGACTAAGGCTAAATATCAAAAGGAACTTGATGAGCTGCATAAGTC AATTGAAACCTACTATAGCCTAAAGATCCAAGGTCAGACGTTGGCGACTGTGTTGCGGGTCGAGAATAAGGTTGATAGGC TTGGTTTACCCTCAAACGATAGGATTGAATTCAGGGCTGTTTGCACGCCTCTCGACCCCCCTTCATTCACTGTTGGCTTG GATAAGCCTTTGGATGTGTTGAAGGGGATTCTGCTCTCCAAAAAGGCTAATGTCACGGTCACAGTCCACACAATAACAGG TTTATCGGGTGTGGGGAAGACTACATTAGCCCGCAAGTTTTGTTCCGATAAGGAGGTTAAAGATGAATTCAAGGAGAATA TCTTCTTCCTCACCTTGGGCAAAATAAGCAACTTGAATACAATAGTGGAAAAACTGTTTAAACACAATAATTACAAGGCG ACTGAGGTTGAAAGTGATGAAGATCTTGTAAACCAATTGGCAATTTTCTTTAAACAGATTCGGCAAATTAAAGGCCCAAT ATTGTTGGTACTGGACAATATTATCCCTGGATCAGAATCTCTTGTTGATAATTTTGTGTTCGAGATCCCAGACTACAAAA TTTTAGTGACATCAAGATCCGCAAAAACAAGGTTTGGCTCTCGTCAACTCTTGAAACCACTTGATTCAGATTTTGATATG GATCTATTTTGCCACTCAGCATCCCTAGATCAATTGAGCTCTAAAATTGCTCATGATGATGTGAAAAAGATAGTGAGAAG TTGTCGTGGTTCTCCCTCAGCACTTATAGTGACTGCCTCATCACTAAGGGGTCAAGAGGATCCGCTGGTTTGGAACAACA GAGCGAATGCATTGTCCAATGGTCACCAACCAAAACTAGATTCTAACAATGATGTGCTTAATTGTCTTCATAAGAGCTTA GATGTCTTGAATCCTAAGGCCATGGAGTGTTTTAAGGACCTAGGCTTATTTCCTGAAAATCAGAAGATTCCTGTTGCTGC CCTTGTGGATATGTGGGCAGAACTGCATACTGGAAATGATGCGAGTGCACTGGAAAATATTTATCAACTGGTCCACATGA ACTTGGCTGATATTATTGTGACAAGGAAACTTGACATAGTTGACTATAATTACCGCTATGTTACTCAGTATGGTCTTCTT CGAGATTTAGCCATTTACCAAACTATCCATGAGGCAGAGGACAAGGGGAGTAGACTAATTATTGAAAAAAATGGAAATAA TCTTCTCAGATGGTGGGGTGTTGAGATTGCAACTCGAATATTATCCATCTCAACTGATGAAGCATTCCCTTCAGAATGGT GTAATAACTTGCAGACAACTGAAGTTGAAGCTCTGGTGTTGAACCTTCGAGGAAAGAAGTGCACGTTGCCAATGTTCATG AAAAATATGAATAAACTAAAAGTCTTGATATTGTCAAATTATGACTTCCCTCCTGTTGAGTTAGAGAATTTCGAGTTGCT TGAACATCTGCCTAGTCTTAAACGACTCAGGTTAGATAATGTTTCGATTCCTCTCCTCATCAAGGCCGAAGTGCAATTGA AGAATCTTCGAAAGTGTTCCTTTTTCATGTGCAATGTGAATGAAACATTTAAAAATTCCAACACCCAAGTTTCAGATATG CTGCCAAATTTGGTGGAGATGGACTTCGACTATTGCACTATGGTTGAACTGCCAGTTGTGGTCTCTAATAGTGTTTCTTT AACCAAGCTCAGGATTACAAACTGTTATATGCTTACTAAACTTCCTGAAGAAATTGGGAAGTTGGTAAATTTGGAAACAC TAAGCCTTAGTTCTTGCATTGATCTAGTAGAGTTGCCCCAATCAATCACTAGCCTTGAGAAACTAACATTCCTTGATATC TCTGATTGCATAAGCTTCACTAAGTTACCTGAGGACATAGGCAAGTTGAGAAATTTACAAAAGCTCAATATGAGAGGCTG CTCGAGATTATCTGAGTTACCCAGCTCAATTATGGACATTGAAGCGTTAAAGGATGTGGTATGTGATGAAGAGGTGGCTG AATTATGGGAAGATTTCAGAATGGTCCGTGAAGATATAAGGCTACAGGTCATTAAAACGGACTTCAGTTTAGATTTCCTT CATCTGCGCTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0033100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAMIADAVVGELVSQLLSKVLEMKDRAKNFKPTLLKLENTLKLLQPDADEIEAEYAKLDRASETEGLKKLMKNGTKLVQD CSKKFPWLKRFWTKAKYQKELDELHKSIETYYSLKIQGQTLATVLRVENKVDRLGLPSNDRIEFRAVCTPLDPPSFTVGL DKPLDVLKGILLSKKANVTVTVHTITGLSGVGKTTLARKFCSDKEVKDEFKENIFFLTLGKISNLNTIVEKLFKHNNYKA TEVESDEDLVNQLAIFFKQIRQIKGPILLVLDNIIPGSESLVDNFVFEIPDYKILVTSRSAKTRFGSRQLLKPLDSDFDM DLFCHSASLDQLSSKIAHDDVKKIVRSCRGSPSALIVTASSLRGQEDPLVWNNRANALSNGHQPKLDSNNDVLNCLHKSL DVLNPKAMECFKDLGLFPENQKIPVAALVDMWAELHTGNDASALENIYQLVHMNLADIIVTRKLDIVDYNYRYVTQYGLL RDLAIYQTIHEAEDKGSRLIIEKNGNNLLRWWGVEIATRILSISTDEAFPSEWCNNLQTTEVEALVLNLRGKKCTLPMFM KNMNKLKVLILSNYDFPPVELENFELLEHLPSLKRLRLDNVSIPLLIKAEVQLKNLRKCSFFMCNVNETFKNSNTQVSDM LPNLVEMDFDYCTMVELPVVVSNSVSLTKLRITNCYMLTKLPEEIGKLVNLETLSLSSCIDLVELPQSITSLEKLTFLDI SDCISFTKLPEDIGKLRNLQKLNMRGCSRLSELPSSIMDIEALKDVVCDEEVAELWEDFRMVREDIRLQVIKTDFSLDFL HLR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
ProSiteProfiles 1 150 150 9.588
PANTHER 2 788 787 6.1E-236
Pfam 3 121 119 7.1E-18
SUPERFAMILY 138 414 277 2.18E-31
Gene3D 145 305 161 7.8E-21
Pfam 172 391 220 2.8E-15
PRINTS 182 197 16 8.3E-11
PRINTS 261 275 15 8.3E-11
PRINTS 348 362 15 8.3E-11
Gene3D 521 787 267 2.1E-38
SUPERFAMILY 555 761 207 1.41E-27
PRINTS 734 750 17 8.3E-11

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ADP binding Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0033100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…