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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0052500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0052500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Proteasome-associated ECM29-like protein; TAIR: AT2G26780.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q5VYK3|ECM29_HUMAN Proteasome-associated protein ECM29 homolog; TrEMBL-Plants: tr|G7KCU1|G7KCU1_MEDTR Proteasome-associated ECM29-like protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0052500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:7391907..7418016) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCAAAACAGTCGTCTTATTGAGCAAGCAGCTGAGCAACATATAAATTGGTACAAAATCCATAGGGCGTTCCTTCCTACTT CCTTTACAAGAAGAAGAAAGAATCAAATCGAAGCGCAAAATGGCGGAACCACCACCATCTTCATCGGCATCAGCTGCAGC ACCACCACCACTCGCGGCGGCGAAGTCCGACGAGGAGATTGTAGAAATGCTCGATCGGATGCTCACTCGTCTTGCTCTCT GCGACGATTCCAAGCTCGAACCCTTACTCTCCAAGCTTCTCCCTCTCTCCATCTCCTCCCTCTCCTCTCCAGCCCTCTCC GTCCGCAACAAGGTATTTTCAATTTGCTTTGTTTTTGGAAGCGTAACCGCCAATTCGCAAATTCAATTCGATGTGATTAT GCTAGCAAAACTGTTGATTATGTGAATGTTGTTATCAATTTCATGAATAATCTCTCTTCTTTGGTTTCGGAGTGCTGAAT GAACTGAACTGATTGAAACGATTTGCTTTAGCTTAGTGAGATTGTGTTGCGTTTGTGAGAGTAATGATGAGTTTGCGTGC ATGTTCATAGGTTTTGTGCGGTTTATTTGATCCTCTGTTGCTGTAATTTTTGGTTTGTGGTGATTGGAGTGACGGCGAAG CGGTTTTGGAGAGTGATTCATGGTTGTCTACTTGTGTTTTTTTGGCAGGTTCTGGAGATTTTGAGTCATGTGAACAAAAG AGTGAAGCTCCAGCCTGAGATTGGTCTGCCTTTGTCCGAGTTATGGAAATTGTATTCGGAATCCGGTGGTACCCCGATCA TAAGGAATTTCTGTATTGTGTATGTAGAGATGGCTATTCAACGCGTCAATGCAAAGGTTTCTCATTCTCTATATCTTAGT GCCTGTTTGTTGTGGCTACAGGGTGTTTTGAGTCTGACAATTTCTGTTTAAGCACTTTGCTGAATCTTCGAAAGATAATT 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TAGAATGATAACTGTTTCTAGAATTTATTTCTCAGTTATTGGCATCATTGGTGCCTGCACATATACATTACAACAAGTTT AGATAGCATACAATTGGATGTGTTGTCTGTTTAAGGTTTTTTGTTTCTAAGTCATTAGGTTTCCAGGTTTTCTTTTGACT TTATCGGATTGTGATCTTATAAGATTAATAATTAGTAATGGTTGATTTTGGAAATAAGCTATATTATAGTGCAGTTGATC TAATAATTTATTCTGCTTCTGAAATAATCATGTGTGTTTCTCATTATGGTCTGTTTTCAGCATGCTGGAACTGCGATCCG TCCACATATGTCCGATTTAGTGTGCTGCATGCTTGAAAGTTTATCAAGCTTAGAAGACCAAGGACTCAATTATGTTGAGG TAAAGATATGTTCAATTAATGCATTTACTAAAATTTATTAATTCATGTTTGTTTGTATGTTTTACGTTGTCTCTTTATAG CTTCACGCAGCAAATGCTGGAATACAGACAGAAAAGCTTGAAAGTTTGAGAGTTTCCATTGCCAAAGGCTCTCCTATGTG GGAGACTTTGGACTCATGCATAAAAGTTGTTGATGCAGAATGCTTGGACATGTTGATCCCACGGCTTGCTCATTTAGTGC GATCTGGAGTGGGCCTTAACACTAGGTTTATTACTAATTCATTATGACATTTTATGCATTTTCTTTGGTATAGCATGCAT GCTTGAACTGTTCCAAATGATCTTTTCATCCTTTCGTTTTCCCTTTAAAATTTGAGGAGCTTTTGTTGATTCCGAGAGGG TTTAGTTTAAAAGGACTGTAGGATTAATGTATATCAGTAGATGCTTGATGTTTATGCTGAGATATCTTATTATATTCTAA CACAACCGCCCAATAATAGTTAGCTAGTCAATTAGTTGGATTAATGAATAAGTCATGCTGCATACAAATATGAAGAGGGG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0052500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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CCTGCTTTAAAGGCAAAATTAATGTCTACATTCTGTCGATCTATTGCAGCAGCAAACAGTTTCCCATCCACCTTGCAGTG CATTTTTGGTTGCGTCTATGGGAGTGGTACCACATCAAGGCTGAAGCAATTGGGAATGGAATTCACTGTGTGGGTATTTA AGCATGCAAAAATTGAGCAGCTTAGGTTAATGGGTCCTGTTATTTTAAGTGGAATTATGAAGTCCCTTGACAACCATTCA AGTTTAGACTCAGATGCCAGTGTTCGGGAAGTAAAAACTTATGCTTTTCAGGCAATTGGGTTGCTTGCACAGCGCTTGCC TCACCTTTTCAGTGAAAAGATTGACATGGCTGCTCGTCTCTTTGACGCACTGAAAGCTGAATCCCAGTCTCTTCGTTTTG TTGTTCAAGAAGCAACAATATCTCTTGCTGCAGCATACAAAGTAGCCCCATTAACCGTGTTACAAGATTTGGAGACGCTT CTGCTAAAAAATTCTCAAGTGGAGGAAAGGGAAGTGCGATTTTGTGCTGTAAGATGGGCAACATCTTTGTTTGATTTTCA ACATTGTCCGAGTCGTTTTATTTGTATGCTAGGAGTAGCAGATTCTAAATTAGATATCAGAGAAATGGCACTTGAAGGCC TTGGTCTTCTTAAAAATGAAAGTCAAATTGCTGGTCTCACATATCCCAAATTTGGTATGATGCTGGATTACATTCTAAAG CAACAGCCGAAGTTGTTAGAGTCCACTGAAATTAGAGAACAGAGCCTTCTTTTCCCCTCAAATACGTATGTGGTCATGAT TAAATTTTTGTTGAAGTGCTTTGAGTCAGAGTTGGAGCAGAACAAATCCTTGGAAGGATCATCTGAATTTCTTTCTTCTG TGAAAACATTCTGTGTGCTTCTGGAACATTCTATGTCATTCGAAGGCTCTGCTGAGTTGCATGTCAATGCTTCAAAAGCG 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TTATCAAGCTTAGAAGACCAAGGACTCAATTATGTTGAGCTTCACGCAGCAAATGCTGGAATACAGACAGAAAAGCTTGA AAGTTTGAGAGTTTCCATTGCCAAAGGCTCTCCTATGTGGGAGACTTTGGACTCATGCATAAAAGTTGTTGATGCAGAAT GCTTGGACATGTTGATCCCACGGCTTGCTCATTTAGTGCGATCTGGAGTGGGCCTTAACACTAGAGTTGGTGTAGCAAAT TTCATTACCTTGTTGCTTGAAAATGTTGGTGTTGACATCAAGCCATATGCAAATACACTGGCGAGGTTGTTGTTTACAGT TGTTAAGGAAGAAAAAAGTACTACTGCAAAACGTGCCTTTGCAAGTGCCTGTGCAAAAGTCTTACGTTATACAGCAGCTT CACAAGCCCAAAAACTTATTGAAGATACTGCAGCTTTGCATGCTAGTGACAAGAATTCTCAAATTGCATGTGCTTTTCTC TTAAAGAGCTATTCATCCATGGCAGCGGATGTTGTTGGTGGATATCATGCAGTTATCATTCCAATCGTTTTCTTTTCAAG ATTTGAAGATGATAAAAAAGTCTCCGACCTATTTGAAGAACTATGGGAAGAATATACAAGTGGTGAACGAACCACTCTCC AATTATACTTGGGAGAAATTGTTTCACTTATTTGTGAGGGCATGTCGTCTTCATCATGGACAAGTAAAAGAAAATCTGGA CAGGCTATATGTAGGCTTAGTGAAGTTTTGGGTGAATCTCTTTCCTCTCACCATGATGTTCTGCTTCAATCTCTCATGAA GGAAATCCCTGGTCGCCTATGGGAGGGAAAAGAGGTGCTATTGCTAGCATTAGGTGCCCTATCTACATCCTGCCATCAAG CAATTTCTGCTGATGGTTCTGCCACTTCCATTGCCATTCTTAATTTGGTATCATCAGTATGCACCAAAAAGGCTAAAAAA 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Protein sequence (LotjaGi1g1v0052500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEPPPSSSASAAAPPPLAAAKSDEEIVEMLDRMLTRLALCDDSKLEPLLSKLLPLSISSLSSPALSVRNKVLEILSHVN KRVKLQPEIGLPLSELWKLYSESGGTPIIRNFCIVYVEMAIQRVNAKEKEDLAPELLVNISKLPLQHQEIILRIIVKVIG ECHSSQIGDGVVAKYKTVKNSQDKELFIEFCLHTMLYQGISQRSQQQMRSDGFPPGLSVAQANRVTGKQQLLSGELLLRK LGILNVIQAMELAPELVYPLYIAASVDREERVVKRGEELLKKANGANLDDLNLINRLFLLFNGTVGVEHVDLESRVSPGG PALKAKLMSTFCRSIAAANSFPSTLQCIFGCVYGSGTTSRLKQLGMEFTVWVFKHAKIEQLRLMGPVILSGIMKSLDNHS SLDSDASVREVKTYAFQAIGLLAQRLPHLFSEKIDMAARLFDALKAESQSLRFVVQEATISLAAAYKVAPLTVLQDLETL LLKNSQVEEREVRFCAVRWATSLFDFQHCPSRFICMLGVADSKLDIREMALEGLGLLKNESQIAGLTYPKFGMMLDYILK QQPKLLESTEIREQSLLFPSNTYVVMIKFLLKCFESELEQNKSLEGSSEFLSSVKTFCVLLEHSMSFEGSAELHVNASKA LLIIGSHMPEVVASHYALKVSWLKQLLSHVDWDTRESIARLLGIVSSALPIPALSDVISDLTSFFSQTNKLRFETQHGTL CAIGYVTADYLSRIPSMPEKLLQNTLKCLVDVVNSETSALAAVAMQALGHIGLRTSLPPLNDSNSDGILITLNEKLSKLL LGDDIKAIQKSVISIGHICVKETSSTQLDIALNLIFSLCRSKVEDILFAAGEALSFLWGGVPVNADIILKTNYTSLSMAS NFLTGDLDSSLSKQCPNGQSEYGEDYHVSVRDAITRKLFDVLLYSSRKEERCAGTVWLVSLTKYCGNHPTIQQMIPEIQE AFSHLLGEQNELTQELASQGMSIVYDLGDESMKKNLVNALVSTLTGSGKRKRAIKLVEDTEVFQDGALGESASGGKLNTY KELCSLANEMGQPDLIYKFMDLANYQASLNSKRGAAFGFSKIAKQAGDALKPHLSSLIPRLVRYQYDPDKNVQDAMVHIW KSLVADSKKTIDENLDLIIDDLLVQCGSRLWRSREASCLALADIIQGRKFYEVEKHLKRLWSGAFRAMDDIKETVRTSGE KLCRSVNTLTTRLCDVSLTDMSDARKAMDIVLPFLLAEGILSKVDNVRKASIGVVMKLTKHAGTAIRPHMSDLVCCMLES LSSLEDQGLNYVELHAANAGIQTEKLESLRVSIAKGSPMWETLDSCIKVVDAECLDMLIPRLAHLVRSGVGLNTRVGVAN FITLLLENVGVDIKPYANTLARLLFTVVKEEKSTTAKRAFASACAKVLRYTAASQAQKLIEDTAALHASDKNSQIACAFL LKSYSSMAADVVGGYHAVIIPIVFFSRFEDDKKVSDLFEELWEEYTSGERTTLQLYLGEIVSLICEGMSSSSWTSKRKSG QAICRLSEVLGESLSSHHDVLLQSLMKEIPGRLWEGKEVLLLALGALSTSCHQAISADGSATSIAILNLVSSVCTKKAKK YREAAFTSLEQVIKAFGNPEFFNMVFPLLFELCNSVPVKSGQALVSDAAKAELESVEETSVPHDKIVDCLTSSIHVAHIN DILEKQKSLIHMYSVLLSPEHKWTVKTTTFTSIKELCSRLHSVVKDSMESQGPASISSLVQEMFHSISPKVLHCISTVKI AQVHVSAAECLLEIIKLSRDVTLDSTINEEFKEELLHQYEIEKNGEAKSLLKTCVSILQDTKP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 26 | 1812 | 1787 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 26 | 1812 | 1787 | 0.0 | ||
| Pfam | 31 | 518 | 488 | 2.0E-147 | ||
| SUPERFAMILY | 325 | 991 | 667 | 1.23E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 922 | 1789 | 868 | 1.3E-47 | ||
| Gene3D | 1067 | 1228 | 162 | 5.1E-7 | ||
| Gene3D | 1327 | 1696 | 370 | 1.6E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Proteasome assembly | The aggregation, arrangement and bonding together of a mature, active proteasome complex. | ||
| Molecular function | Molecular adaptor activity | The binding activity of a molecule that brings together two or more molecules through a selective, non-covalent, often stoichiometric interaction, permitting those molecules to function in a coordinated way. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0052500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…