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LotjaGi1g1v0060300.11

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0060300
Transcript ID LotjaGi1g1v0060300.11
Related isoforms 14
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Disease resistance protein; TAIR: AT3G14470.1 NB-ARC domain-containing disease resistance protein; Swiss-Prot: sp|Q7XA39|RGA4_SOLBU Putative disease resistance protein RGA4; TrEMBL-Plants: tr|G7K723|G7K723_MEDTR Disease resistance protein RGA4; Found in the gene: LotjaGi1g1v0060300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:8442499..8483901) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTGCATTTAACTAGCTATTTCCAGACTTTTGCTACTACTATATCCACACTTTGCTTTAGAGCTCATCCAAGCAAAACCAG CCCCTGATCTTCTTCCCTTTTCAACTTTTGCATTTCTGAAAATGGCTGAGGCCTTACTAGGAGCTGTGTTTGAGAAATTG ATCTCTCTAGCTCAGAATGAATTTGCAACCATCTCTGGAATCAAGGGAAAGGCTGAGAAGCTATCACACACTCTTGAACT GATCAAGGCTGTTGTTGAAGATGCTGAGAAGAAAGAGATAACAAACAAATCTATAAAGGTTTGGCTGCAGCAGCTCAAAG ATGCTGTCTACGTCCTAGATGATATCCTTGATGAATGTTCCATAGAATCACTTCGACTTCAGGGATTGTCCTCTTTAAAA CCAAAGAACATCAAGTTTCGCTATGAGATTGGCAACAAGCTGAAAGAGATTGCAAGGAGATTTGATGAGATTGCTGACTG TAAGAACAAGTTTGCTCTGCAAGAGGGTGTTAGGGAAAGGTCAACTGAAGTTGCTGAATGGCGCCAAACCAGCTCGTTCA TTCCCCAACCTAAACTATATGGACGAGAAGATGATAAGAAGAAGATTCTGGAGTTTCTTCTCAGCCAAGCACGCGAGTCT GACTTCCTTTCCATCTATCCCATTGTCGGCTTAGGTGGCATGGGAAAAACAACACTTGCTCAAATGGTCTACAATGATGA TCAGGTAACAAGCAATTTCAACATCAAAGTTTGGATTTGTGTTTCTGAAAATTTCTCTGTTCAAAGGATTTTGTGCTCCA TCATAGAATCTATTACAAAAGCAAAACATGAATGCTTGAATTTAGATGTAACCGAAAGAAAGGTGCAAGAACTGTTGCAA GGTAAAAGATATTTGCTGGTTTTGGATGACGTGTGGAGAAAAGATGAAGAAATGGAATTTGGTTTAACCCAAGACAAATG 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TCCAAAACATTTATATTGAAGAAAAAATGATACACTAAAACACTTGCTTTTGTTAGTAGTTAAGTTAGACACTCAAAATA ATACTAAACTCTCTTTAACACTTACAAGCTCGCTGAAGGTTTTCTTACATTTTTCTTTTCAAACTAATGGACAGCCACTC TATTTTTTGACTTTTCAAAGTTCCAACCAATAAAGTAATCACAATAGACTTGTACTACAACACGTTGCTAACTTTTGTAT ATTCATTGCTAAGCAGGGTGACTTTGGTCTTTTCAGCCTTCATGATTGGAATCCAATGACACTCGTAGCTTCATTGAAGT TTCCTTGATAAAGACAGCATTTAACTAGCTCTTTGCAGACTTTTGCTACCACTATCCACACTTTGCTTCAGATCTCATCC AAGCAAAACCAGTCCCCGATATTGTTTCCTTTCCAACTTTTGCATTTCTGAAAATGGCTGAGGCTTTACTTGGAGCTGTA TTTGAGAAATTGATCTCTCTAGCTCAGAATGAATTTGCAACCATCTCTGGAATCAAGGGAAAGGCTGAGAAGCTATCACA CACTCTTGAACTGATCAAGGCTGTTGTTGAAGATGCTGAGAAGAAAGAGATAACAAACAAATCTATAAAGGTTTGGCTGC AGCAGCTCAAAGATGCTGTCTACATCCTAGATGATATCCTTGATGAATGTTCCATAGAATCACTTCGACTTAAGGGATTG TCCTCTTTAAAACCAAAGAACATCAAGTTTCGCTATGAGATTGGCAACAGGCTGAAAGAGATTGCAAGGAGATTTGATGA GATTGCTGACTGTAAGAACAAGTTTGCTCTGCAAGAGGGTGTTAGGGAAAGGTCAACTGAAGTTGCTGAATGGCGCCAAA CCAGCTCGTTCATTCCCCAACCTAAACTATATGGAAGAGAAGATGATAAGAAGAAGATTGTGCAGTTTCTTCTCAGCCAA GCACGCGAGTCTGATTTCCTTTCCATCTATCCCATTGTCGGCTTAGGTGGCATGGGAAAAACAACACTTGCTCAAATGGT CTACAATGATGATCAGGTAACAAGCAATTTTGACATCAAAGTTTGGATTTGTGTTTCTGAGAATTTCTCTGTCCAAAGGA TTTTGTGCTCCATCATAGAATCTATTACAAAAGCAAAACATGATTGCTTGAATTTAGATGTAACAGAAAGAAAGGTGCAA GAGCTGTTGCAAGGTAAAAGATATTTTCTGGTTTTGGATGACGTGTGGAGAAAAGATGAAGAAATAAAATTTGGTTTAAA CCAAGACAAATGGAATAAGCTGAAATGTTTGTTGTCATGTGCATCCAAAGGAGCTTCCATTTTAGTATCCACTCGCGATA TGGAGGTTGCAACAATTATGGGAACATGCCAAGCTCATCATTTGTGTGGTCTCTCTGAGGATGAATGTTGGATGCTATTC AAACAATATGCATTTGGAACTGTAAAAGAAGAACGTGCAGAGCTTGTAGTTATTGGCAAAGAGATAGTAAAGAAATGCGG AGGATCACCTCTTGCAGCACAAGCACTAGGAGGTCTCTTACACTCAAGGAATGAAGAAAAAGAATGGCTTGAAGTTATGA AAAGTGGGATTTGGAATTTAGCGGGTGAAAATTCTATTTTTGCTGTCTTGAGATTGAGCTACTTTCATTTAACGCCAACA ATAAGACAGTGTTTTGCATTTTGTGCCATGTTTCCTAAAGATACAGAAATCATGAAGGAAGATTTAATTCATCTTTGGAT GGCTAATGGGTTTATATCACCAAGGGAGAACTTGGAGGTGGAAGATGTTGGAAATATGATTTGGAATGAATTGTATCAAA AATCATTCTTTCAAGATATGAGGTTGGATGATTATTCAGGTGACATTCATTTCAAGATGCATGATCTTGTCCATGATCTT GCTCAGTCAATAATGGGGCAGGAGTGCATTGTTTTGGGCAGTGCAAACATGACTGATATGTCAAGAAGCACCCACCATGT TGGTTTTGGCTCTGGTTGGGATCTATCCTCGCTGCACAAGCGCGCCTTCAAGAAAGTTGAATCCATGCGAACATTTTATC AGTTAAATGTCTACGACCGTGTTTCTGGTTGCATCCCAACCCACCGCAGTCTTCGGGTACTACGCACAAGTTCTTCCAAC TTATCATCACTCAAGAGTTTAATTCATTTGAGGTATTTGGAACTTTTCCGCCTTGAGATGGAAACCTTGCCCGACTCAAT TTATAGCTTGCAGAAATTGGAAATCTTGAAATTGAGATCTTTGAAAAAACTTGTTTGTCTACCTAAAGACTTGACTTGCT TACAGGATCTTAGACATCTTGTCATTGAAGATTGTTATTCATTGTCTTGTATGTTCCCTAACATTGGGAAATTATCCCGT CTGAGAACGTTAAGTAAGTACATTGTCAGTTCAGAGATTGGGCATAGCCTGGCAGAATTACATGACTTAAAACTCAGAGG AGATTTGCGCATTGAAGGACTAGAAAATGTTGGCAGTTTATCCGAAGCTCAAGAGGCCAACTTGATGGGTAAAAAAGACA TCCACAAATTAGAGTTGATATGCGACAAGCTGTTTCACACAAAGCCATATGCTACTAATCCGGAGCTAGTACTTAATGCT CTTCAACCTCACTCAAATCTCAAGAATTTGAAAATAGAATACTATGCAGGATTAAAATTCCCAACCTGGATGGAAATGCT CACCAATTTAGTTTATCTTGTGCTTTATGGATGCAAGATGTGTGTGCGGCTTCCCTCACTTGGTAAACTGCCATATTTAA GAAGAATTGAAATAAGTGAAATGAATGATGTGCAGTATATGGATGATGACGAATCTGATGATGGTGTGGAGGTGAAAGCT TTCCCGTCATTAGAAGAACTCTCACTATCAGGATGCTCAAAGTTAGAGCGGTTGTTGAAAGTGGAAAGAGGAGAGAATTT CCCCTGTCTTTCTAGTTTGAGAATTAATAAATGCCCTAAACTTGAGTTGCCAAGCTGCTGCATTCCGTCACTCAAAAGCC TCGTTCTATTTGATTATACGAATGAGTTACTGAGGTCCCTCTCAGGTTTCAATGGCCTTACCTCCCTTTGGCTTTACGCT GGCGATGTAGACCTGACATCCTTCCCGGTGGGAACATTGTCTTCTCTTCGGACTCTGCAGATATATAGTTCCGAGGTATT GAAGGAATTACCAAATGAACTCTTCAAGAACCTCAACAATTTGGACCATCTGCAAATCGTTTATTGTAGGAAGCTGGAGT CTTTACCAGAGCAAGGGTGGGAAGGTCTCCGCTCCCTTCGAACTCTGCAGATTTGGGATTGTGGTGAATTGAAATCCTTG CCGGATGGTGTTCGACACCTCACTTCACTAGAGGTTTTGAAAATTTACGACTGCCCAGCATTAGCCGAGAGGTGTAAAGA GGGAACAGGGGAGGATTGGGACAAGATAGCGCACGTTCCCAAAGTAGAAAGTACTGCCCAGCATTAGCCGAGAAGTACAA ATTCTTATCTAATACGATGAAGACTCAGACTGATTCTGAATTCGGTGAGCTCTCTTTTCCCGAACAACTCCCGCTTTTTC TGTTTTTACTTTTCTCGTTGGGTAGTAATGTAATGTAAGTAATACATATATGTTTTTATGTTTTTGCAGGCTTGTAATTC TAATTCAACACCAATTTGGTTACTCTGCTATTTCTGATTCAATTTTTGGTTAATACCCAATCGAGGTGTGTGATTGTTAA TGTATATTTGAACTTTTTTGAATATTATACTGGTTCTGCTTCTGCATGCACTTCTACTGGTTCAAATGTGTGGAAAATTT ACTAAATTATTACCTTTCTACTGGTTCTTCTTAGGAATTTATTTGTGTATCACTTTCTAAGGATGATTTAGTGGATTAGT GGTTAACTACCTTGTGTATATTGTGAAATTTAACTCAGGAGCAAAGAAGGGAAATAAGGATTGATTAGTCATGATGAAAA GGAGGTGGAAAAGGCCTGCAATAACAAAGAAAACCAGCAATGACAGCAAGCTAAAGTTGCAGAATATGAAGAACATGATG AAAAGGAACTTTTTGTTAACAATTATAATGCTGCAGAGAGTGTGACATGGATTTCTCATGTATAATCTTTCCTGAAACTG GAAAAGGTCATTTCCAAGGTGACCAACAGACAGAAAAATTGTAGTTGGCACTTCAAGTCTTCAACAGATGTGAAAGTAAT CATGGATGATTTTTCAGTTCCTGGAATTAGCCGAATGGTGTCCAACACCTCACTTCACTCCAGCTTTTGAGAATTCAGGA CTGCCCAACATTAGCTGAGAGGTGTAAGGAGGGAACAGAGGTGGATTCGGACAAGATAGCGCACGTTCCCAAAGTTGAAT TCTGCAACGCGTAATTTTGCCTAATGGGGGAGAACTTGAACAACAATTTGGGTACTCTGCTATTTCTGATTCTATTTTTG GTTAATACATATCAGATGTCTTTGATCTTCCTTTTGGAGACTGGATTCCCTGACCAACTCTCAATCGAGGTGTGTGATAA ATATTACAATCCTCTATTATAATTATTTGTTTTTTATTGTTTTCAATTTTTGACTTTGTGTGTGGGTTTGATGAATATGG TATGGCCTGTTACAATCTTTTTGCAGTATTTATGTGAACTTGAATTATTTTGATTGATGATGTTTGTTGGACCTGCAAAT TTTTGAGGTATTGTAGGTTAAGTAGTGTAGGAAACTTTGATGATTTGTGTGAGTGTGTTCTTTATTCATGCTTTATGTGT CGTGTCATGTTAATTCATGATGCTTAAAACATTTATCTGAAGAGCAAAATTACAATTTGAATTGCTTTGCTTGCTATATG GTAGTGTATGTTGTTTGTGAAGTTGGTAAGATTAGATTGAAAATTGATAATGTATATTGATCTGTCATAACTCATTGATT TGTTGATGCATATTTGAACTTGAATTTAAACTTTCTGAATGTTGCCGCACATTTTGGTTTAGTTTCATCAATAATGTAGT TTTGCTGGTTTGGGGGAGTTGTGTGAGTTCACTAGCTTGGTTGTGCAGGCAATTCTACTGGTTCAAATGTGTGGCAAATT TATTATTTTAATACATTTTGTGTATATTGTAACCTTTATCTACTGCTTCAGTACTCAAAAGAACCCTTCATATGGGGAGC TTCAAAAGGCAGAGCCAACCAAAGGGAGCAAGATGATGCACCTAGGAGAAGCTTTCAGCCATAAAAGTAATCTGTCAAAT TGAGCTTGCTCTCGATGAATGAAATGCTGAGAGGGTTGATCCTTTCTACTTCTCATGGTTTGTCCACTATTGTCAAATTC AGTGCTTCAAGAAGAATTCCTTCATGGAATTTCATTGTAAGAGAGAATTCCACAGGCTTGCTTGAAGACCTTGTAGATAT TGCTCCTGAATATGAAGATGATGAGTTCCTCACTGAACCACCAGATTCTAATTCGATGGAGGCAGGCATGGACCACAATT CAGGCACAGAAGATAGTTATTTCAAAAGATAAATTATTTTCCATGTTCTTTTTAATATTTTGGTTGTATTGCTTTCTCCA TTGTAAATAGTAAGAAATCTGGTCTTGGAGGGTCTCTATTCTTGATTTGACTGGCATGACTCACCATTTGGTTCCTCACT AAATTAAATTATTGGATGATTGGAAATACAATATATTTTTCACATTGGGGTGAGAAGTGATCACGGAAAAACCTTGATTC TATATAGAATTTGTTTCTAATGCCAGGAGGCAAATTAAAGATATATTAATCATTTAGTGAGATACTTTGTTTCTCACTAA ATTAAAGATATATTAATCATTTAGTTAGTACTTTGTTTCTCAC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0060300.11) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCTGAGGCCTTACTAGGAGCTGTGTTTGAGAAATTGATCTCTCTAGCTCAGAATGAATTTGCAACCATCTCTGGAAT CAAGGGAAAGGCTGAGAAGCTATCACACACTCTTGAACTGATCAAGGCTGTTGTTGAAGATGCTGAGAAGAAAGAGATAA CAAACAAATCTATAAAGGTTTGGCTGCAGCAGCTCAAAGATGCTGTCTACGTCCTAGATGATATCCTTGATGAATGTTCC ATAGAATCACTTCGACTTCAGGGATTGTCCTCTTTAAAACCAAAGAACATCAAGTTTCGCTATGAGATTGGCAACAAGCT GAAAGAGATTGCAAGGAGATTTGATGAGATTGCTGACTGTAAGAACAAGTTTGCTCTGCAAGAGGGTGTTAGGGAAAGGT CAACTGAAGTTGCTGAATGGCGCCAAACCAGCTCGTTCATTCCCCAACCTAAACTATATGGACGAGAAGATGATAAGAAG AAGATTCTGGAGTTTCTTCTCAGCCAAGCACGCGAGTCTGACTTCCTTTCCATCTATCCCATTGTCGGCTTAGGTGGCAT GGGAAAAACAACACTTGCTCAAATGGTCTACAATGATGATCAGGTAACAAGCAATTTCAACATCAAAGTTTGGATTTGTG TTTCTGAAAATTTCTCTGTTCAAAGGATTTTGTGCTCCATCATAGAATCTATTACAAAAGCAAAACATGAATGCTTGAAT TTAGATGTAACCGAAAGAAAGGTGCAAGAACTGTTGCAAGGTAAAAGATATTTGCTGGTTTTGGATGACGTGTGGAGAAA AGATGAAGAAATGGAATTTGGTTTAACCCAAGACAAATGGAATAAGCTGAAATGTTTGTTGTCATGTGCATCCAAAGGAG CTTCAATTTTAGTATCCACTCGCGATATGGAGGTTGCAGCCATCATGGGAACATGCCAAGCTCATCATTTGTGCGGTCTA TCTGAGGATGAATGTTTAATGCTATTCAAACAATATGCATTTGGAACTGTAAAAGAGGAGCGTGAAGAGCTTGTAGCTAT AGGCAAAGAGATAGTAAAGAAGTGCAGAGGATCACCTCTTGCAGCACAAGCACTAGGAGGTCTCTTGCACTCCAGGAATG AAGAAAAAGAATGGCTTGAAGTTATGAAAAGTGGGATTTGGAATTTAGCGGGTCAACATTCTATTTTGGCTGTCTTGAGA TTGAGCTACTTTCATTTAACGCCAACAATAAGACAGTGTTTTGCATTTTGTGCCATGTTTCCTAAAGATACAGAAATCAT GAAGGAAGATTTAATTCATCTTTGGATGGCTAATGGGTTTATATCACCAAGGGAAAACTTGGAGGTGGAAGATGTTGGCA ATATGATTTGGAATGAATTGTATCAAAAATCATTCTTTCAAGATATGAAGTTGGTTGATTATTCAGATGTTATTCATTTC AAGATGCATGATCTTGTCCATGATCTTGCTCTTTCAATAATGGGGCAAGAGTGCATGGTTTTGGGAAACACAAACATGAC AGATTTGTCAACAAGCACCCACCATGTTAGCTTTGACTCTGGTATGGATGTATTGTCACTCCACAAAAGTGCCTTGAAGA AAGTTGAATCCTTGAGAACATTTTACCAGTTAAAAGTCTCCTACAGCGTTTCTGGTTGCATCCCAATACACTGCAGCACT CTTCGGGTATTACGCACAAGTTCTTTTAATTTATCACCACTCAAGAATTTAATTCATTTGAGGTATTTGGAACTTTTCAA GCTTGAGATAGAAACCTTGCCCGACTCAATTTATAGCTTGCGGAAATTGGAAATCTTGAAATTGAGATCTTTGAAAAAAC TTGTTTGTCTACCTAAAGACTTGACTTGCTTACAGGATCTTAGACATCTTGTCATTGAAGATTGTTATTCATTGTCTTGT ATGTTCCCTAACATTGGGAAATTATCCCGTCTGAGAACGTTAAGTAAGTACATTGTCAGTTCAGAGATTGGGCATAGCCT GGCAGAATTACATGACTTAAAACTCAGAGGAAATTTGCGCATTGAAGGACTAGAAAATGTTGGCAGTTTATCCGAAGCTC AAGAGGCCAACTTGATGGGTAAAAAAGACATCCACAAATTACAGTTGATATGGAACAAGGAGGTCCACTCAAAGTCATAT GCTACTAATCCGGAGCTAGTACTTAATGCTCTTCAACCTCACTCAAATCTCAAGAATTTGAAAATAGAGGACTATGCAGG ATTAAAATTCCCAACCTGGATGGAAATGCTCACCAATTTAGTTTCTCTTGATCTTTATGGATGCAAGATGTGTGTGCGGC TTCCCTCACTTGGTAAACTGCCATATTTAAGAAGAATTGAAATAAGTGAAATGAATGATGTGCAGTACATGGATGATGAC GAATCTTATGATGGTGTGGAGGTGAAAGCTTTCCCGTCATTAGAAGAACTCTCACTATCAGGATGCTCAAAGTTAGAGCG GTTGTTGAAAGTGGAAAGAGGAGAGAATTTCCCCTCTCTTTCTTATTTGGGAATTTCTGATTGCCCTAAACTTGAGTTGC CAAGCTGCTGCATTCCGTCACTCAAAAGCCTCGATCTAGTTGATTATACGAATGAGATACTGAGGTCCCTCTCAGGTTTC AATGGCCTTACCTCCCTTCGGCTTTACGCTGGCGATGTAGACCTGACATCCTTCCCGGTGGGAACATTGACTTGTCTTCA GACTCTGTCGATATCTGGTTTCGAGGTATTGAAGGAATTACCAAATGAAATCTTCAAAAGCCTCAACAATTTGGAGCATC TGGAAATCGTTAATTGTAGGAAGCTGGAGTCTTTACCAGAGCAAGGGTGGGAAGGTCTCCGCTCCCTTCGAACTCTGGAG ATTTCGACATGTGGTGAATTGAAATCCTTGCCGGATGGTGTTCGACACCTCACTTCACTCCAGCTTTTGAACATCCGTTA TTGTAGAAAGCTGGAGTCTTTACCAGAGCAAGGGTGGGAAGGTCTCCGCTCCCTTCGAACTCTGATTATTTGGGCATGTG GTGAATTGAAATCCTTGCCGGATGGTGTTCGACACCTCACTTCACTCCAGCTTTTGAACATCCGTTATTGTAGGAAGCTG GAGTCTTTACCAGAGCAAGGGTGGGAAGGTCTCCGCTCCCTTCGAACTCTGATTATTTGGGGATGTGGTGAATTGAAATC CTTGCCGGATGGTGTTCGACACCTCACTTCACTCCAGCTTTTGAGTATTGCGCTCTGCCCATTAGCCGAGAGGTGTAAAG ACGGAACAGGGGAGGATTGGGACAAGATAGCACACGTTTCCAAAGTACAAATTATTAATTCTTCAGACTCTATTTCTGAT TCAATTTTTGAAGAGGACTCAGACTCAGACTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0060300.11) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAEALLGAVFEKLISLAQNEFATISGIKGKAEKLSHTLELIKAVVEDAEKKEITNKSIKVWLQQLKDAVYVLDDILDECS IESLRLQGLSSLKPKNIKFRYEIGNKLKEIARRFDEIADCKNKFALQEGVRERSTEVAEWRQTSSFIPQPKLYGREDDKK KILEFLLSQARESDFLSIYPIVGLGGMGKTTLAQMVYNDDQVTSNFNIKVWICVSENFSVQRILCSIIESITKAKHECLN LDVTERKVQELLQGKRYLLVLDDVWRKDEEMEFGLTQDKWNKLKCLLSCASKGASILVSTRDMEVAAIMGTCQAHHLCGL SEDECLMLFKQYAFGTVKEEREELVAIGKEIVKKCRGSPLAAQALGGLLHSRNEEKEWLEVMKSGIWNLAGQHSILAVLR LSYFHLTPTIRQCFAFCAMFPKDTEIMKEDLIHLWMANGFISPRENLEVEDVGNMIWNELYQKSFFQDMKLVDYSDVIHF KMHDLVHDLALSIMGQECMVLGNTNMTDLSTSTHHVSFDSGMDVLSLHKSALKKVESLRTFYQLKVSYSVSGCIPIHCST LRVLRTSSFNLSPLKNLIHLRYLELFKLEIETLPDSIYSLRKLEILKLRSLKKLVCLPKDLTCLQDLRHLVIEDCYSLSC MFPNIGKLSRLRTLSKYIVSSEIGHSLAELHDLKLRGNLRIEGLENVGSLSEAQEANLMGKKDIHKLQLIWNKEVHSKSY ATNPELVLNALQPHSNLKNLKIEDYAGLKFPTWMEMLTNLVSLDLYGCKMCVRLPSLGKLPYLRRIEISEMNDVQYMDDD ESYDGVEVKAFPSLEELSLSGCSKLERLLKVERGENFPSLSYLGISDCPKLELPSCCIPSLKSLDLVDYTNEILRSLSGF NGLTSLRLYAGDVDLTSFPVGTLTCLQTLSISGFEVLKELPNEIFKSLNNLEHLEIVNCRKLESLPEQGWEGLRSLRTLE ISTCGELKSLPDGVRHLTSLQLLNIRYCRKLESLPEQGWEGLRSLRTLIIWACGELKSLPDGVRHLTSLQLLNIRYCRKL ESLPEQGWEGLRSLRTLIIWGCGELKSLPDGVRHLTSLQLLSIALCPLAERCKDGTGEDWDKIAHVSKVQIINSSDSISD SIFEEDSDSD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
CDD 2 119 118 9.80026E-16
Pfam 6 101 96 1.2E-24
PANTHER 23 794 772 7.4E-185
PANTHER 23 794 772 7.4E-185
Coils 31 51 21 -
Gene3D 135 314 180 7.9E-36
SUPERFAMILY 138 417 280 2.1E-64
Pfam 155 383 229 5.4E-50
PRINTS 178 193 16 5.4E-18
PRINTS 251 265 15 5.4E-18
PRINTS 355 369 15 5.4E-18
SUPERFAMILY 481 887 407 5.55E-31
Gene3D 497 657 161 1.4E-13
Gene3D 658 866 209 1.4E-24
Gene3D 867 996 130 5.4E-17
SUPERFAMILY 878 1093 216 8.73E-36
PANTHER 926 1010 85 7.4E-185
PANTHER 926 1010 85 7.4E-185
PRINTS 951 967 17 5.4E-18
PANTHER 955 1032 78 7.4E-185
PANTHER 955 1032 78 7.4E-185
Gene3D 997 1097 101 1.0E-19

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ADP binding Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0060300.11, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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