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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0075200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0075200.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | SANT domain-containing protein 2; TAIR: AT3G12590.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|A0L6Y9|MURA_MAGMM UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QSQ7|A0A0B2QSQ7_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0075200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:10854588..10874311) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAATAAAAACCAGCGAGGACAGAGACAGTGACACAGATTCGATTCATGAAACCATTTCCCTTTTCCTTTTTCCAAAATC ACAGATTCATTCATCCATATCAATGTCTTCTTCTCCTTCCACTACCTTCAGTCCCTGTCGGAGCCCCGCTCCAGCACCAA GTACCAGGATACACCTTGCTACCTTTTCCAGGTTGAGATCCTCCTTCCTCAAGAAGCTCCCGGAGCCCCTCCGTCGCGCC ATCGCCGACTGCCTCTCCTCCACTTCCCCCTCTTCCGCCATTGAACCTTCCAGGACCCTCCGGGTTCGTCTTTTTCTTTT TATCCTCGTAATTTAATCTTTGATGCTGGCAAATGGAAATTGAGTTTAATTTTGTTAAACTAGTTTTCTACTTTTATTGA TGATGTGGATTGTTCTTCTTAGAGCTTGTGTAATCACATTGTTACTCTTCCGTTTAGAATGCTGGAAGCTAAGAGAGTGT AGTAGAAGGGACTTTACTAGGATGATCAAGTGATCAACCTTAGCTTCTTACATATGATGGTGAGCTGTATTAGAGGGACA CTTTACTAACTTGAAAAAACTTGGGAATCAAAATCTCACACAATTCGAACTCGAGGAAGGATCACAAGTGCAATTAAGAC TAAAGAATTTTCCCTTTTCTGGTCTTTTACCCGGATATTACTCAACAAATGACTTTCTCGGGAGTTTGAGCTTATGTTCT TACTCTTACGGGTCAACACATGATTGCATTTGCTTGTTTACCGCTACAACAACACATTGCATTTACTTCCTCTTTATATA TAATCTCCCCCAGGATAGATTTGTTTGTTGTTGGTCAACGATTTAAATGAGTATTGCTACAAGAACTAGAAATTCTGAAA GTAATTTCAAAATAAGGGAAATGCTAAACATTACGAATCAATTATTCACAAAAATATACGAATGAAGGGCGTAGCATTTG 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GAATCAGTTTTCTTTCACTCTGAGAATGGAGTTGTGGCCTTATATAACCAACCAGACATGATGCTCCTTCCATTAGTCTT GCATACATTAACTAAGCATATTGTGTTCTTATTCTTCCGAGATACTCTGTTGTTTTTTAAAATTGTAGTCTGCATGCAGT TATATTTGCAATAAATAAATTTATTGTCTTCATGTAGAACGATTTAGGCTCTGAATCTAAATGGGTATTTGAGTGAAGTT TGACAACGTGATTAGAGAATCATTTCACATTCATATTCATGTCTCTCTCTGCTGCCTGAAGTTTAAAATTTTTATTCTTT TCATTTTATTGTTATATCCATTTCTTCTATTGGGTCTTAGAGGCTTCATTTATTTTTTATTTTCCTCCTTTCATCAACAG GACCAGGAAAAGTTCTGCTGCTTCTACCTATTCAACTGCAACCACAAGGGCAAGAGACGCTAGGCGTCAAAGGAAAAGAG GAAAAATCCGTCCTGGGAGGTATATTGACATGAGAACTTTTCAAATGTTGTTTTTCATTAGTTACAATCAGGAATTCAAA TTGCGATCTGGAACCGCAATAGCGGCCGCAACGTTAAGGGTTTTGGAGTCCCGGCAGCAACATTGCAGCCACAATGCAGA TCGTAATTTAAAACCCTGGTTACTATTTTGAAAATGAAGTAATAGTATTTTATTCACTGTTGTAGTGCTGATGAGGAGAT GGCCTTAGTGGAGCATTTGAAAGGAATGTCTCTAACAGTGGAAGCTAGACGTGAGCTGAAATCTTTGTTGGTTTCCCTTA TGATGTTTGGAGAGGGTGAAATTGCAAGGAAGCTACAGCAAATGGGGGAGAACTTCCAATTTTCTCATATGGCAGCAGTT AGATTAGCTGAAGATACAATATCCAATGATACCATAAATGAGCAAGCACATACGCTAGAGCAATATACCCGAAAAGTAAA GGTTGAAATGCACAATTTAGAGGCTCTCTCATGGAGGATAAAAGTTTTTTTGCCCTACGAGTGAACTTAACAAATTAAGA TAGAAATTTTCTGCTTGGAGTTTGATGATGTTGGTGCGTTTGGGTTTTTAGTTGTTTCTGGGTTTAAAAGGATGTGGGTG GATGATGAAGACGAAGAGGATGAAGGTGGATGAAAATTATGAAGGTTTATCTTTCTTTAAGGTCTTGAATCCATTCAGAA CTATGACTGTGTAATTCCGCTGAATTTATTGTTATCATTGTATAACGAAAATTATCTTGTAAGTTAGGGAAACATGAATA ATTTTTTTTACGAATAAATGAATTAAAATAACATTGTTGGAATTTTTTAAAAACCGATTAATATTTTATCCCAACTCAAA TGTTTCAATTATATCTAGGTCTCTAGTACGCTTTACTACCGGAAGACTCAACCCACAATATGGTTGCATAATCTTAATAT CCCACCATCGGAAGGACGATATGATTGTGAAATTGATAGTAGTG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0075200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTCTTCTCCTTCCACTACCTTCAGTCCCTGTCGGAGCCCCGCTCCAGCACCAAGTACCAGGATACACCTTGCTAC CTTTTCCAGGTTGAGATCCTCCTTCCTCAAGAAGCTCCCGGAGCCCCTCCGTCGCGCCATCGCCGACTGCCTCTCCTCCA CTTCCCCCTCTTCCGCCATTGAACCTTCCAGGACCCTCCGGGACTATCTGGCAGCCCATGCAACCAGAGATGTGGCTTAT AGTGCAGTTCTGGGACATACTATTGCAGAAAGGGAGCGAAGTCCTGCTGTAGTCACAAGGTGTGTGGCAATTTTGAAACG GTATCTTCTAAGATACAAACCCAGCGAGGAGACATTACTTCAGATAGATTGCTTTTGTTCAACCATTATTGCTGAATGTG AAATTAACCTGAATCGGCCATGGTCAATATCTTTGAATCAAAAATCTGCTGCATCCACAAATACATCTCCTTTGCCTATA TCTACCTTTGCTTCTGAGGCAGTTGTTAAGTCGCTGAGTTATGTGCGTTCCCTAGTGGCACAACACATTCCGAAACGGCT TTTTCAACCAGTTTCATTTGCTGGACCACCTTCTGCATCGGGACAATCACTGCCCACACTGTCATCGTTGTTGAGAAAAT CCTTCAATTCACAACTATGTCCAGTAAGTGTCCCAGAAACAGTGGAGAGAGCTTCAGTCACTTCAACAGTTTCAAAGTTA TCTAAACTTGAAAAATTTGATGAAAAAGATGAACTTGGGTTCATTGCCCATGATGTTCTACAATGGCGTTGGCTTGAGGA ACAGCAGTCCTCAACAGTGCAAGCTGACAATGACCGTGCTGTGAATTCACAAGACATGAAATCACAAAATTTCTTAGAAG TAGGTGCTGCAGCTCTTCTTGTAGGAGACATTGAAGATAAGATGAAGGGACAGCCATGGAAATATTTTGGAACTGATGAT ATGCCTTACCTGGATCAACTTATGCAGTCTTCTCCAGTAACATCAATTACTAATTCTGCATCCGCTCGTCCCCACCTGAG AGCAATAACAGCATCTAAACGCACCAAAACAGGCCCCAATCTAGTTTGGCATGATGCTCCTATGAGTACATACCGCCCTC GAGCTCGACAACTCTTCCAGTATCGTTGTTACAGTGATCAACAGCCTTTGCGATTGAGCCCTGCTGAGGTATGTGAAGTT ATTGCTGCAGTTTGCTCAGAGATTTCTTCACCAAATATCAATGTCATGACAGTGTCAACTGGGCTAAACAATAGCAGTGG AAAACCACCAATGGACGTGGCTGTGAATGTTCTTATCAAACTAGTGATTGACATGTATGTTTTGGATTCTCAAATTGCTA CTCCACTCACTCTTGCTATGCTTGAGGAGATGCTTAGTTCTTCTGAAACAGCTTGCAGGGTTCGAGCATTTGATTTAATT CTAAATCTCGGGGTTCATGCTCATCTCTTAGAACCAACAATCGTTGATGATGCTTCCATAATTGAAGAGGAATATTCTCA AGAATCCTTTTATGACAGTGACAATCAACTTATGGCCCAAGGGAGCAAAAAAGAAAATTATCAAAATAAATTGGACACTT TCTCAGCAATTAATAATTTAGAGTCTTGGATTTCGAATATTTTGTATGAAATACTACTACTTCTGGTGCAGACTGAAGAA AAGGAAGAATCTGTCTGGGCATCTGCATTCAGTTGTTTGCTTTATTTTGTTTGTGATAGAGGAAAGATCCGCAGAAACCA ATTGCAAGTTCTTGACATAAGGGTTATCAAAGCACTTATAGAAATCAGCAGGAAGAACTCTTGGGCAGAATTAGTTCATT GCAAGCTTATTTCCATGTTAGCTAACATGTTCTATGAAGTTCCTGATGAAGTTGTTGAGCCTTTACCTAGCATACCGAAA TTTCTTGTCAATCAACTTCATCTGATTGGAGGAGTTCAATTTCTTTTTCGTGAGTATGCCCTTGTGAACTCAAGAGAAGA GAGGAAAAATCTGTATTTGGTTCTTTTAGACTACGTTCTGAATCAGATTAATGAAACATGTGTAGCTACGGGAGACAATG AATACAGTCATGATGAGATTCAACCACTCGCTACTCTGCTTGCTCAAACTAATGCGGCTGATGCATTTTATATTTCTGTT AAACTGGGGGTAGAAGGGATTGGGGATATTTTGAGAAGATCAATTGCGTCTGCCCTGTCCAAATATCCCAACCGTGAACG TCTAAATACGCTATTGGAAGTTGTAACTGAGAAATTTGATACAATGATAAGTTCATTCACTCATTTGGATGGCGAGTTCT CTCATATGATTCAGATAACCAAAACTCACAAGCCTCTTCAGAATTTGAAAGATGTTGCTCTAAGTAATGACATTGGTCTG CAGGAAAAGCACTCATGGGTCACTTTACATTCCCTTATTCATTCTGAAAGAGTTGCTTGTCGTCAAAATGGGTATACCTG GTTAGGTGATTTGCTTATTGCTGAAATCAGTGGGGAAAGAGACGGGACTATATGGTCGAATATAAAATACTTCCGGCAGA AAATATCTCAAGCTGGCAAACAAGATTCTTCAGATATATCAGAAGCTCCTTTGCCCGTTTCACTTATGTGTGGCCTTTTA AAGTCAAAACATAACTATATTAGATGGGGATTTTTATTTGTTCTTGAAAGGCTTCTTATGAGATGCAAATTTTTGTTAGA CGAGTATGAAATGCAACAATTAAGGAGCAGTAATCTTGGGCATGGCCAGAATGATTGGCATCTTGAGAAAGCTCATGCAG TGGTTGACATAATGAGCAGTGCTTTGTTGTTTCAGATAAATGAGAAAAACTGCATCAATATGTATGAAACAGACCGCATC AATATTCTGAAAATGTGTGACATATTATTCTCCCAATTATGCCTAAGAGTTCCCCCTGCTATGGCTCTGCCCAATAGAGA CGATACGCAACATGAGAGAAATTTAAATTGCTACAGTTCAAGCAAAAAGTATGATGGTGATAACCATATCCTTGAACAAG ATGCTTTTCACAAGGATGGACATAATGAGGAAGAAGCTGATAGAAGATCCAACTGCTCTAGTAACTGCCGTCTGGATCAT GAGACTGCATCAACGGCAGCGCTTCTTCTCCAAGGACAAGCTATTGTCCCAATGCAATTAATTGCTCGTGTTCCTGTTGC TTTACTATATTGGCCATTGATGCAATTGGCTGGAGCAAGAACAGATGATATTGCATTGGATGTAGCTGTTGGAAGTAAGG GAAGAGGAAACCTGCCTGGTGCCACATCTGATATAAGGGCCACCCTTCTCCTACTACTTATTGGTAAATGCACTGCAGAT CCTGGCTCTTTCGAGGAAGTTGGTCGAGAAAAGTTTTTTAGGGAACTTTTGGAAGACACAGATTCAAGGGTGGCATACTA TTCTTCTTCTTTTCTGCTTAAGGCATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0075200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSSPSTTFSPCRSPAPAPSTRIHLATFSRLRSSFLKKLPEPLRRAIADCLSSTSPSSAIEPSRTLRDYLAAHATRDVAY SAVLGHTIAERERSPAVVTRCVAILKRYLLRYKPSEETLLQIDCFCSTIIAECEINLNRPWSISLNQKSAASTNTSPLPI STFASEAVVKSLSYVRSLVAQHIPKRLFQPVSFAGPPSASGQSLPTLSSLLRKSFNSQLCPVSVPETVERASVTSTVSKL SKLEKFDEKDELGFIAHDVLQWRWLEEQQSSTVQADNDRAVNSQDMKSQNFLEVGAAALLVGDIEDKMKGQPWKYFGTDD MPYLDQLMQSSPVTSITNSASARPHLRAITASKRTKTGPNLVWHDAPMSTYRPRARQLFQYRCYSDQQPLRLSPAEVCEV IAAVCSEISSPNINVMTVSTGLNNSSGKPPMDVAVNVLIKLVIDMYVLDSQIATPLTLAMLEEMLSSSETACRVRAFDLI LNLGVHAHLLEPTIVDDASIIEEEYSQESFYDSDNQLMAQGSKKENYQNKLDTFSAINNLESWISNILYEILLLLVQTEE KEESVWASAFSCLLYFVCDRGKIRRNQLQVLDIRVIKALIEISRKNSWAELVHCKLISMLANMFYEVPDEVVEPLPSIPK FLVNQLHLIGGVQFLFREYALVNSREERKNLYLVLLDYVLNQINETCVATGDNEYSHDEIQPLATLLAQTNAADAFYISV KLGVEGIGDILRRSIASALSKYPNRERLNTLLEVVTEKFDTMISSFTHLDGEFSHMIQITKTHKPLQNLKDVALSNDIGL QEKHSWVTLHSLIHSERVACRQNGYTWLGDLLIAEISGERDGTIWSNIKYFRQKISQAGKQDSSDISEAPLPVSLMCGLL KSKHNYIRWGFLFVLERLLMRCKFLLDEYEMQQLRSSNLGHGQNDWHLEKAHAVVDIMSSALLFQINEKNCINMYETDRI NILKMCDILFSQLCLRVPPAMALPNRDDTQHERNLNCYSSSKKYDGDNHILEQDAFHKDGHNEEEADRRSNCSSNCRLDH ETASTAALLLQGQAIVPMQLIARVPVALLYWPLMQLAGARTDDIALDVAVGSKGRGNLPGATSDIRATLLLLLIGKCTAD PGSFEEVGREKFFRELLEDTDSRVAYYSSSFLLKA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 10 | 1154 | 1145 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 91 | 980 | 890 | 3.8E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0075200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…