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LotjaGi1g1v0175900.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0175900
Transcript ID LotjaGi1g1v0175900.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase family protein; TAIR: AT4G28880.1 casein kinase I-like 3; Swiss-Prot: sp|Q93Z18|CKL3_ARATH Casein kinase 1-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|I1K9C5|I1K9C5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0175900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:33735715..33749489) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCCAACGCAGAGCAACAACCTCAGACAGCAAATGTTACTATTTTGCTTTCTCACTTTCTTCCTAGCTAGCTAGATAGAGA GCTTCACTTCACATAGCCAATTCAACACTGCCATTGCTATTGCCATTGCATTGGTTCAGTTTCCATGGAGAGAGTTATCA GAGGAAAGTATAAAGTCGGTCGCAAAATTGGTAGTGGATCCTTCGGTGAAATTTATATTGGTCAGGATCAGGAACATTCA GTTTTCATTTTAATTTTAGTAATTTATTCATTTTTGTTCAACATGTGTTTGTTATATTGCCTTTACCAGGGTCGCATGTC GACACTTCTGAGATTGTGGCCATCAAGATGGTGAGTCAATTCTTTGTAGTTTTAATGATTTCATAATCTTAATTTTAAGG GAACTTAATTGAAAATCATCAATTCTTTGTCGACACCTCTAGGGTGTTGATGAAGTAAAGAGAAGTAGAAGGTATTTAGT AAAAAGGAAAGCATTTATTTTTTTAAAACACAAATACTCTCTCTATTTTTAATTATAAGTCATTTTTAGGACAAAATTTA TATCAAGTGATTGACATTTGTTTTTAGAAATAAAATCTACTGGTCAATGTTTGGATAGAGAACTTAATGGAAATAGATTT TAAGAACTTAATCTAAGTTTTTTCTTTTTTTAATTCTGAAATCAAAGTTTTCTTTTTAATTCTGAAATATAACTCACCTT AATATTTACAAAACATTAAATACATTTTTTTCTAATTTTATCCTCATATTTAATATGAAAGATGATTAGTTTTTGAAAAT TTATTAACTTGGAGAAATAAAATTCATGAGAAATTAAACATAATTAAAGTATAGACAGAAGTTAAGTAAATTTGTAAGTT TTTAAATAAGAGTAATTTATGCAAATTAATAATTTTTTTTTGCAAATTCATTTATTGTAACCACTTTTCTTAATCAAAGA 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GACTCTCTTGTATTTCTCTCCGATTTCCTAATTAGGAGTTAGGAATTTGTGTGAATAATATCATGATTCTGTTTCGGGTA TATCGATTTACCCAACAAATCTGGTATCTTCATATAACTTCCAAGGTTATGGTAGAAAATACATTCTATATTTTTTTGGT ACTTATCATCGGTATCAGAGCACTAGTTGTGGTGCCCTAGCCAAGAAGATCAAACAACAAAACAACAATAAAAAGGATAT GACTGGAGGTTTTGTGAATTCATTTTCATCAAAGACAAGGACAAAAATCATTGGCATGTTGTGAGAGTTACAAATAGTGT GAGGGAATAAGAAACAGTTTTAGATTGGTGGAGAGAACTCGATGAGCGAAATCAGAAGAAGAAAGAAAGGAGTGCATCAG AGGCATTACAGAGGGAAAAGTAGGAAAGAAAAGTACTCAAGGCTAAGACGAAGATGACGCTAGCGGCAACAGAGGTGAGT GATGGGCCATCTACAGTTTCAGGATGGCTGAGAAAGCATTTGAAATAGAGACTTAGCTTTGATCCTACAAGGAGATGGTA TCGTTGGATCCATCAGAAACCGACAATGATGGATAAACACAAGCATCCTCTGCCACCAGTGTTGAATAAAGGATTGACCA AGGTGGCGTCAGCTGCGAAGCTCCAATAACAACTCTTCACATCCGTAGGGATTAAGTTGTTGGGTGATAGAAAGAAGGGA TCGGTGCCCCAAAATTACAAGGCACATCATTCACGGTAGGGTTGTAAGGGGGCGGAGAACCCACCTCTACCGTTGGATCG GCATAGTCACAATTTTCTGTTTAGGAAGATGAGATCGCTCAAGCAATTACCACCTAAACAACCTAACAACATGGTGCGTC CAGTGGTTTGTGTGTCTTTGTGGGTAGAAAAGGCAGAGTCGTTACATGTGGGAAGGACATCGAATGAGTGGATCGGGAGA 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AACTGAACGTGGATCCATATTGAAATCAAAGTAATAAAATCTTGCTTCTCCGGTCTACATAAAACTCAACATGTCAAGGT CTAGATTCTTTGTTGATATTTGATACCTTAAGAGACGTGAATTCGTGTTAGAATTTACTTAAACGTGAAACCAAGTATAC ACCAAGCCTCTTATCTCTTTTTTCCATGATAGATTACTATTCTTTTATATATATATATATATATTGTAGCATGTTAATCA TTTACTTTAAATTATTGTTTTGTTAAATTTGTATGAAGGAATTAGAAACATTATTTTTTACATTCAATTCGTAATGATAT GATATAATATTCTCTTTTAAATGTCTTACTATTTTTCAGGCTCCAATTGCTATCCTTAGTGATCTTGACCAACTAGATGT AGATAAGCATAAAGGTAACTTAGATCTTATATCATGCAATTGTAAAATTAAGTTCTATAATAGGTAAGAATTTGTTTTTA ACTTTATTCGATTTTCGCCTTATTATTTCCTTGTAAAATTAGTTACGAATTGAATGATATTTTGATGCCCATATATAAGG GGTAATGAAAAGAAAAGAAAACAATTGTTAGTTACGAATTGAATGATATTTTGATGCCCATATATAAGGGGTAATGAAAA GAAAAGAAAATAATTGTTGTTATATGTATTTCAATTATTTTTTATGGACCTTTGTTGCATGAAAAAAAAAAGTAGTATTA GATTCTAAGACACAATGCTATTGGGTTTATTTGGATAGCAAATGTTTACATCTTTTTCATTTGTTTTTTTAGCTTTAAGC CTGTATAAGTTCTTGATTATGAAAACTTTATAACATTTCCAGTATAATGTTGTTTAACATAACATGTTATGATTACTTTG ATTCATTTTTTCAGAAAATTATTCCATTCAAAATGCTGTAGAAAGACCATCAGTCAATTGTGATCCTCCACGTGTTTGTA TGGAGATAAGGGCACCTAACGTTCAAAATATTAATCACAAGATTCAGGTAAGAAATATTGTAATCAAAATTTCAACATGA CTTTCTTGCATCCCCATTTAATAAAATAAGTGAAATAAAACATTTTGATTTTTGAAAAAGTATTTCCACCATAGCTAAGT CCCTAATTCAAATTAAATTATTTATCACCGGTGAGGACTAATGTGGAATGACTGTGAATTACTTAAGAACTATATCATAC ACATAACTTATTATAGAAACTATAATTAGAGTGAAATACATCCAAATATTGTTTTACCCAATAGTATAGATTATCACCAC AAGTGTATGTAAGATGTCTTTCATTTATGCAAGATACAATTATTATATGTGGTAGTATAGATTGTTTTGGTTGTGAAAGC TTTGAAATGGTTTGTCAAAAAACATTTTTGTGGTAGTTTCTACCTAATCCATAGTTTATGAATTTTAAATGTGGATTCAA TCACACAAAATTGGCACTATTTTTTGGTGAAGCAATTTAGTTGAATGGGATACAATATTTGCAGACTGTGAATGTTGACT CATCTATTTCCAAAGTCTCTACAAATAATCTCTCAAAACCAAAAAGGCCCATGGAAACCTCAAAATTTGATCATGTATCT GGCAATAAATCTAGTGCTCTTGAAAGTTTTGTTCCTTCACTGCGCCGAGTTTCATCATTCAAATAGTCGGTAAAGAAATT ATTTATATAGCCAGAATTTTAACTTTAAACTATGATTTTCATTATTGATATTTCCCTGTATATTGATTGCAAATTATTTC ATCATAAATACTACAATGTACTATAGAGGGTTCATTTTGCTTATAAGATATAAATGTTTAAAGTGTCAAATACATTCTTT AACAGAAACAATAGACTGTCATGGAAGATGCCATTTCAATCTCTTCGAGCACGAGAGTTGTAAAAAGTGGAAAATTAACA GGGTTGGACACAATTGAAGAATAATGTATGATCTTAGTTGTTGATTGAAATCATACAAGGACCAAGCTCGAGGTAATTAG CTATAGAGCTTAATTGGGAGAGGAAATATGGAGGCTATGATGCCTAAGGGGATTTGTGTTTTCTCTATTATATTTATCTA TGACGAATCAAACATGCATGGATGAGGCTTCTTTCAGTCACATGTTGTTTTACTTTGATGAAGACTCAAATTTCGATTTC TTGTCTAGTGTGCAATTGAATATCTTTTTATACTATGAACACCATCGCAATATAATCGAGACATCACTCCTCCATAACCG AACCAGCTGCCCACCACGGTCTCTCAAGTGATTTCTTCTCCAAGATGCAAAAACACAAACCTCAAAATTCTTTGTCATCA TATTTGGAATATTGCTTGATATTTAGTTTATCTTAAATCTTGGCTACACATTATTAGGACTATGAAATAATGATGTAAAA GGAAAGTGATTTTGGCACCCCAAATCACACCCACCTTTTTTTCCCAAAATCCTAAAATACACTATCCCCTATTCTTCTTC CCACAACCTCACTCAGTTTAAAATACCCCTTACCATTCTTCATCTTCACCTTCATCTTCTTCTTCCCTCAACCTCACTCA TCACCTTCATCTTCTTCCTTCTCGCCCCCAAGCCCCAACTTGTTCGAGAGAATTCTATCCTTCATTGTTGCTAATTAATT TAAAATATACTACCAAGTTTTAAAACCCGATAGATAAAAAACACACTTCTTAAAAATACACTACCAGAATATGTCAAAAA CAAACTTCTTAAAAATACACTACCGGAATTTTCAAGATTTCGGTATCTTAAAAACACATAACTCGGTTTTAAAACAAAAC ACCGACATTTTAAAATACATTACCGAGTGTCGAAGACGGCATTGTATATGACAAGATCGCCTAGTATACACAAGTTTTTC CTTGTGCAATCTTGGAAAAGGGAATTTTCACCCGCTATTGTAGATTTTTTATATTCTAATCAACAAAGTTAATCTTTTTT ATACATTTGACCCCAATTTAGCTTAAATTATATCAGGACCCAACCTCTCTCTTCCTCTACCTCTTTACCACCATAGTCCC TCCCCTCAACCTCCACACCCTCCACCACAACCACCATCACCACCACCAGATCTTCTTCTCCCTCCTCCACCGATCATCAT CCACTACAAAAAAAGTGGGATTTAACCACCGCTGAAAACACTCAGCGTCGGTGGGAAAAATAACGCTAAATTTGGCGACG CAAAATATTTGGCGG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0175900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGAGAGTTATCAGAGGAAAGTATAAAGTCGGTCGCAAAATTGGTAGTGGATCCTTCGGTGAAATTTATATTGGGTC GCATGTCGACACTTCTGAGATTGTGGCCATCAAGATGGAGAACAAGAAAACTACACATCCGCAGTTACTGTATGAGGGCA AGTTATATAGTATTCTTCAAGGAGGATGTGGTATTCCGAGAATGAAATGGTGTGGTACTGATGGAGATAACAATGTTCTC GTTCTTGAACTTCTCGGACCGAATCTTGAAGATTTCTTATGCTACTGTGGTGGGAAGTTTTCATTAAAAACAGTTTTGAT GTTGGCTGATCAGATGCTTACTAGGACAGAGTATTTGCATTCCAAGGGATTCTTGCATAGAGATATGAAACCAGATAACT TCCTTATGGGTCTTGGGAGGAAAGCTAACCAGGTTAATATGATTGATTTTGGACTTGCAAAAGGATATAGGGACCCTAAT ACAAACAAGCATATCCCTTACAGAGAGAACAAAAACTTAACAGGAACTGCACGCTATGCAAGTTGCAATACTCACCGAGG AATTGAGCAAAGTCGTCGAGATGATTTGGAGTCTCTTGGCTATGTTCTTATGTATTTTATAAGAGGAAGCCTTCCTTGGC AGGGTCTACAAGCTGCCACCAAAATGCAAAAATTTGAAAAACTTTGTCAAACCAAGTTATCAACTTCCATTGAGGGATAT TGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0175900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MERVIRGKYKVGRKIGSGSFGEIYIGSHVDTSEIVAIKMENKKTTHPQLLYEGKLYSILQGGCGIPRMKWCGTDGDNNVL VLELLGPNLEDFLCYCGGKFSLKTVLMLADQMLTRTEYLHSKGFLHRDMKPDNFLMGLGRKANQVNMIDFGLAKGYRDPN TNKHIPYRENKNLTGTARYASCNTHRGIEQSRRDDLESLGYVLMYFIRGSLPWQGLQAATKMQKFEKLCQTKLSTSIEGY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 238 238 3.1E-144
Gene3D 1 239 239 3.7E-83
PANTHER 1 238 238 3.1E-144
SUPERFAMILY 5 238 234 2.56E-69
ProSiteProfiles 9 240 232 28.739
Pfam 9 224 216 5.8E-29
SMART 9 237 229 1.0E-10
ProSitePatterns 15 38 24 -
ProSitePatterns 124 136 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0175900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…