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LotjaGi1g1v0175900.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0175900
Transcript ID LotjaGi1g1v0175900.4
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase family protein; TAIR: AT4G28880.1 casein kinase I-like 3; Swiss-Prot: sp|Q93Z18|CKL3_ARATH Casein kinase 1-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VDN0|A0A072VDN0_MEDTR Casein kinase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0175900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:33736674..33749450) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTTGCTTTCTCACTTTCTTCCTAGCTAGCTAGATAGAGAGCTTCACTTCACATAGCCAATTCAACACTGCCATTGCTA TTGCCATTGCATTGGTTCAGTTTCCATGGAGAGAGTTATCAGAGGAAAGTATAAAGTCGGTCGCAAAATTGGTAGTGGAT CCTTCGGTGAAATTTATATTGGTCAGGATCAGGAACATTCAGTTTTCATTTTAATTTTAGTAATTTATTCATTTTTGTTC AACATGTGTTTGTTATATTGCCTTTACCAGGGTCGCATGTCGACACTTCTGAGATTGTGGCCATCAAGATGGTGAGTCAA TTCTTTGTAGTTTTAATGATTTCATAATCTTAATTTTAAGGGAACTTAATTGAAAATCATCAATTCTTTGTCGACACCTC TAGGGTGTTGATGAAGTAAAGAGAAGTAGAAGGTATTTAGTAAAAAGGAAAGCATTTATTTTTTTAAAACACAAATACTC TCTCTATTTTTAATTATAAGTCATTTTTAGGACAAAATTTATATCAAGTGATTGACATTTGTTTTTAGAAATAAAATCTA CTGGTCAATGTTTGGATAGAGAACTTAATGGAAATAGATTTTAAGAACTTAATCTAAGTTTTTTCTTTTTTTAATTCTGA AATCAAAGTTTTCTTTTTAATTCTGAAATATAACTCACCTTAATATTTACAAAACATTAAATACATTTTTTTCTAATTTT ATCCTCATATTTAATATGAAAGATGATTAGTTTTTGAAAATTTATTAACTTGGAGAAATAAAATTCATGAGAAATTAAAC ATAATTAAAGTATAGACAGAAGTTAAGTAAATTTGTAAGTTTTTAAATAAGAGTAATTTATGCAAATTAATAATTTTTTT TTGCAAATTCATTTATTGTAACCACTTTTCTTAATCAAAGAGAATTAGTTAAAAGTTTTTTTTGATAAGCCAAATTGTAT 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AAACCATGCATAAAATTATCAAATATTCAAATCTAAGGTACGTATGCCATAACAATTTAACAAAGCATCAATACAAATTA TGATAAATGTAAGACAATAGTAACAAATAGGTCACTAGAGGTTATATGAGTGGAACGAACAGTGGCTGTAAATGCAAGAA TGATGATTGATTTTGTTAAAAACCTTAAATTGGTAGGTTAAATGTCTGAAATGCCCCTGTACTACTCTTTTTTTGACATT TCAGACCAAGTAAGCTAATCTCGTTGTAATGTTACGATATTAAAAGAGATTAAGAGATATCTCTAGAGATCACATGAGAT ATGAAAAAATAGTTATTACCGCGTGTTGATCTCGTTTTTGGTACCAGATATCGTAATCTTGTAAGAGATTAAGAGATATC TCTAGAGATCGACAACAATGTTATCACTAATAGTCTTTAACCTATTGACAATCATTTTAAACTTTCAAGCAATTCTTACG TCATGACACTGCACAAATCTAAAGCTGAAGATACATTAAAATAATAATAATAACATTAGAATTCATCTTGGAGTTATTTT GGTATTATCATTGTATTTTGATTTGTTGTGCCTAATAGATGCTTGTTCATAAACGAATTATTCATAATTTTCAAGATTTA TAATTACTAGAGAACCATACAATGGAGCATTGTTAGTGGGAGGCAAAGCCTAAGTATGTGTGAAGCTAAGAGTCGCAAAT TAAAATTAGAATCATGCAAAACTGGATGAAACATATATATGATAGGTACTCACGGTTAGTAGTTAGTGAGCTTGGAAGTT TTAGCAATTTTTTAGTGGTTTAGAAGATTAATGAGGTATGTTGCCTATGAATAAGAGTGGTCAGACAACATTGGGTCCAC CTTTTGCATCACTGGGAAATTGGAATTAGAAAGAGGGTCGAGACTCTCTTGTATTTCTCTCCGATTTCCTAATTAGGAGT TAGGAATTTGTGTGAATAATATCATGATTCTGTTTCGGGTATATCGATTTACCCAACAAATCTGGTATCTTCATATAACT TCCAAGGTTATGGTAGAAAATACATTCTATATTTTTTTGGTACTTATCATCGGTATCAGAGCACTAGTTGTGGTGCCCTA GCCAAGAAGATCAAACAACAAAACAACAATAAAAAGGATATGACTGGAGGTTTTGTGAATTCATTTTCATCAAAGACAAG GACAAAAATCATTGGCATGTTGTGAGAGTTACAAATAGTGTGAGGGAATAAGAAACAGTTTTAGATTGGTGGAGAGAACT CGATGAGCGAAATCAGAAGAAGAAAGAAAGGAGTGCATCAGAGGCATTACAGAGGGAAAAGTAGGAAAGAAAAGTACTCA AGGCTAAGACGAAGATGACGCTAGCGGCAACAGAGGTGAGTGATGGGCCATCTACAGTTTCAGGATGGCTGAGAAAGCAT TTGAAATAGAGACTTAGCTTTGATCCTACAAGGAGATGGTATCGTTGGATCCATCAGAAACCGACAATGATGGATAAACA CAAGCATCCTCTGCCACCAGTGTTGAATAAAGGATTGACCAAGGTGGCGTCAGCTGCGAAGCTCCAATAACAACTCTTCA CATCCGTAGGGATTAAGTTGTTGGGTGATAGAAAGAAGGGATCGGTGCCCCAAAATTACAAGGCACATCATTCACGGTAG GGTTGTAAGGGGGCGGAGAACCCACCTCTACCGTTGGATCGGCATAGTCACAATTTTCTGTTTAGGAAGATGAGATCGCT CAAGCAATTACCACCTAAACAACCTAACAACATGGTGCGTCCAGTGGTTTGTGTGTCTTTGTGGGTAGAAAAGGCAGAGT CGTTACATGTGGGAAGGACATCGAATGAGTGGATCGGGAGACCACCATCAAAGCTGCTGAATCCATATCCTTGAAGGTTA GAGAAGGCAAAGCAGTCACCGGCTAAACTGCCGAACTTGTGAGGTGGTGACAAGTGTGACTTGGCGTTGCTGGATGTGTA GGCATGTGATTGGGTGGAGAGACATGAACACAAAGGAAGGAGGGTTTGGAGGGTTGAATGTACAATTTAGACTTACCAAA TGGGCCAATCCTTAATCTCATATTAGAGGAATTGGGCCTAGTGAAGATTGGACCCAACTTGGAAAAGGAATGTCGTTTTA AACATGCAACTATGCAACAAATATGTTGGGTTATTGAGTGTGACACTAATTACCCAAAGCTTAAAAGGGGAAGGAACAAA GAAGATTATAGAATTTTTGTAATTTTTTTTTTAATTTTGGATTAGATTTTAGGCTTGTATTATGTCCTTCACCTCGAGGA CAAGGTAGGCTTTCAGGGGGGTATTGATAGGTACTCATGATTAGTAGTTAGTTAGCTTGAAAGTGTTAGTGGTTTGTTAG TTGGTTAGAAGGTTAATGAGGCATATAGCCTAAATATAAGAGTGGTTAGAGAGAATTTGGGTCATCATTTTTATCATTGG AAAATTGGAATTAGGAAGAGGGTTGAGACTCTCTAGTATTTATCTCTGATCTCTTAATTGAGAATTGAGGATTTGTGTGA ATAATATCAGGATTCTATTCTAAGTATATCGATTTACCTAGCAAATCCTGTATCTTCCTCTAGTTCCCTATTGGTTCTTG TGTGAAATACATTATATATTTTTTGGGTTATTATTAACATATCTTAGTTTTGAAGACTCAACATATCTTATGTTATAATT TGATTGGTTGAACTTGAGGTCATTCCTCCTAAGGGAAAATTTCTTAATCTATTTTTCTTGCTTTTAGGTACTTTGCAAGT CATATCCGATGGAGTTTAGTTCTTACTTTCATTATTGTCGCTGTTTAAAATTTGATCAACGACCAGATTATGGATTTTTG AAGGGCCTATTTCGCGATTTGTTCACCCGAAAAGGTACTAGTTGATTGTTTTATCCCATGCCTTGCTTAAGATGTCATTT CATATGGTTAGATTATTTTTGCCCAATTAGCATTAACTTTCATTTTAGTTTTGTTTGATTTATGTAAGAGCAAGCTACCC CGTATAATGAGATAAGACAATTGGTGTTGTTATCGGCATCTATTGTATAAGTATAATATCTAATCGAAATATAACTATTA TAGTATGTAGTAAATTTCAACTTTACTATTTTGGGTCTTGATTTTGTCCAACTCACCTAAGTTATTAGTTGTTTCAACTT GATAGCAACATACTAAAGATTATTCAAAGCTGTATAGAAATTTCTAGATTAATTTATTTTTCATCCCCAAATTTTGTTCC TAGAATCTCCATTTTGGTGCATACTTTGTTTACATTGATTGCAAAGATCCATATAGGAGAGCGGATATGCATTTAATTGA GTATAAAACCATCTTAGATCTTACTACTTCTGTCATTTTTATTGTTTTACATTGTTCATTATCCAAAATCATAAAATTTA GTTTCTGTTTTGTCATAACTTTATGAGTTACTTGATTTAATTCTCAATGTTTAGTAGTATTTAGGAAAAAATATTTTAAA ATTATTGTGCATTATTTTTTGTCTCGTCTGTGTTATATATATCTACTTTGTTAATGTAATGAAATCTGGTTTGGCAGGAT ACAAGTCTGACTATTTATTTGACTGGACGATTCTAAAATTTCAGCAGACAATGCTACAAAGTCAATCAAATGTTCGTAGT TCCTTGGCCCTAATTTTAAATAAATTTTCTTTTATTTACTTTATGCAGCTTCCCCTCCCCTTTGTTTCGTGGGTGAAAGT TTTCATGGAAACTATTGTGTGTGTATTTTAGATTTTCGTTGAACTGAACGTGGATCCATATTGAAATCAAAGTAATAAAA TCTTGCTTCTCCGGTCTACATAAAACTCAACATGTCAAGGTCTAGATTCTTTGTTGATATTTGATACCTTAAGAGACGTG AATTCGTGTTAGAATTTACTTAAACGTGAAACCAAGTATACACCAAGCCTCTTATCTCTTTTTTCCATGATAGATTACTA TTCTTTTATATATATATATATATATTGTAGCATGTTAATCATTTACTTTAAATTATTGTTTTGTTAAATTTGTATGAAGG AATTAGAAACATTATTTTTTACATTCAATTCGTAATGATATGATATAATATTCTCTTTTAAATGTCTTACTATTTTTCAG GCTCCAATTGCTATCCTTAGTGATCTTGACCAACTAGATGTAGATAAGCATAAAGGTAACTTAGATCTTATATCATGCAA TTGTAAAATTAAGTTCTATAATAGGTAAGAATTTGTTTTTAACTTTATTCGATTTTCGCCTTATTATTTCCTTGTAAAAT TAGTTACGAATTGAATGATATTTTGATGCCCATATATAAGGGGTAATGAAAAGAAAAGAAAACAATTGTTAGTTACGAAT TGAATGATATTTTGATGCCCATATATAAGGGGTAATGAAAAGAAAAGAAAATAATTGTTGTTATATGTATTTCAATTATT TTTTATGGACCTTTGTTGCATGAAAAAAAAAAGTAGTATTAGATTCTAAGACACAATGCTATTGGGTTTATTTGGATAGC AAATGTTTACATCTTTTTCATTTGTTTTTTTAGCTTTAAGCCTGTATAAGTTCTTGATTATGAAAACTTTATAACATTTC CAGTATAATGTTGTTTAACATAACATGTTATGATTACTTTGATTCATTTTTTCAGAAAATTATTCCATTCAAAATGCTGT AGAAAGACCATCAGTCAATTGTGATCCTCCACGTGTTTGTATGGAGATAAGGGCACCTAACGTTCAAAATATTAATCACA AGATTCAGGTAAGAAATATTGTAATCAAAATTTCAACATGACTTTCTTGCATCCCCATTTAATAAAATAAGTGAAATAAA ACATTTTGATTTTTGAAAAAGTATTTCCACCATAGCTAAGTCCCTAATTCAAATTAAATTATTTATCACCGGTGAGGACT AATGTGGAATGACTGTGAATTACTTAAGAACTATATCATACACATAACTTATTATAGAAACTATAATTAGAGTGAAATAC ATCCAAATATTGTTTTACCCAATAGTATAGATTATCACCACAAGTGTATGTAAGATGTCTTTCATTTATGCAAGATACAA TTATTATATGTGGTAGTATAGATTGTTTTGGTTGTGAAAGCTTTGAAATGGTTTGTCAAAAAACATTTTTGTGGTAGTTT CTACCTAATCCATAGTTTATGAATTTTAAATGTGGATTCAATCACACAAAATTGGCACTATTTTTTGGTGAAGCAATTTA GTTGAATGGGATACAATATTTGCAGACTGTGAATGTTGACTCATCTATTTCCAAAGTCTCTACAAATAATCTCTCAAAAC CAAAAAGGCCCATGGAAACCTCAAAATTTGATCATGTATCTGGCAATAAATCTAGTGCTCTTGAAAGTTTTGTTCCTTCA CTGCGCCGAGTTTCATCATTCAAATAGTCGGTAAAGAAATTATTTATATAGCCAGAATTTTAACTTTAAACTATGATTTT CATTATTGATATTTCCCTGTATATTGATTGCAAATTATTTCATCATAAATACTACAATGTACTATAGAGGGTTCATTTTG CTTATAAGATATAAATGTTTAAAGTGTCAAATACATTCTTTAACAGAAACAATAGACTGTCATGGAAGATGCCATTTCAA TCTCTTCGAGCACGAGAGTTGTAAAAAGTGGAAAATTAACAGGGTTGGACACAATTGAAGAATAATGTATGATCTTAGTT GTTGATTGAAATCATACAAGGACCAAGCTCGAGGTAATTAGCTATAGAGCTTAATTGGGAGAGGAAATATGGAGGCTATG ATGCCTAAGGGGATTTGTGTTTTCTCTATTATATTTATCTATGACGAATCAAACATGCATGGATGAGGCTTCTTTCAGTC ACATGTTGTTTTACTTTGATGAAGACTCAAATTTCGATTTCTTGTCTAGTGTGCAATTGAATATCTTTTTATACTATGAA CACCATCGCAATATAATCGAGACATCACTCCTCCATAACCGAACCAGCTGCCCACCA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0175900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGAGAGTTATCAGAGGAAAGTATAAAGTCGGTCGCAAAATTGGTAGTGGATCCTTCGGTGAAATTTATATTGGGTC GCATGTCGACACTTCTGAGATTGTGGCCATCAAGATGGAGAACAAGAAAACTACACATCCGCAGTTACTGTATGAGGGCA AGTTATATAGTATTCTTCAAGGAGGATGTGGTATTCCGAGAATGAAATGGTGTGGTACTGATGGAGATAACAATGTTCTC GTTCTTGAACTTCTCGGACCGAATCTTGAAGATTTCTTATGCTACTGTGGTGGGAAGTTTTCATTAAAAACAGTTTTGAT GTTGGCTGATCAGATGCTTACTAGGACAGAGTATTTGCATTCCAAGGGATTCTTGCATAGAGATATGAAACCAGATAACT TCCTTATGGGTCTTGGGAGGAAAGCTAACCAGGTTAATATGATTGATTTTGGACTTGCAAAAGGATATAGGGACCCTAAT ACAAACAAGCATATCCCTTACAGAGAGAACAAAAACTTAACAGGAACTGCACGCTATGCAAGTTGCAATACTCACCGAGG AATTGAGCAAAGTCGTCGAGATGATTTGGAGTCTCTTGGCTATGTTCTTATGTATTTTATAAGAGGAAGCCTTCCTTGGC AGGGTCTACAAGCTGCCACCAAAATGCAAAAATTTGAAAAACTTTGTCAAACCAAGTTATCAACTTCCATTGAGGTACTT TGCAAGTCATATCCGATGGAGTTTAGTTCTTACTTTCATTATTGTCGCTGTTTAAAATTTGATCAACGACCAGATTATGG ATTTTTGAAGGGCCTATTTCGCGATTTGTTCACCCGAAAAGGATACAAGTCTGACTATTTATTTGACTGGACGATTCTAA AATTTCAGCAGACAATGCTACAAAGTCAATCAAATGCTCCAATTGCTATCCTTAGTGATCTTGACCAACTAGATGTAGAT AAGCATAAAGAAAATTATTCCATTCAAAATGCTGTAGAAAGACCATCAGTCAATTGTGATCCTCCACGTGTTTGTATGGA GATAAGGGCACCTAACGTTCAAAATATTAATCACAAGATTCAGAAACAATAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0175900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MERVIRGKYKVGRKIGSGSFGEIYIGSHVDTSEIVAIKMENKKTTHPQLLYEGKLYSILQGGCGIPRMKWCGTDGDNNVL VLELLGPNLEDFLCYCGGKFSLKTVLMLADQMLTRTEYLHSKGFLHRDMKPDNFLMGLGRKANQVNMIDFGLAKGYRDPN TNKHIPYRENKNLTGTARYASCNTHRGIEQSRRDDLESLGYVLMYFIRGSLPWQGLQAATKMQKFEKLCQTKLSTSIEVL CKSYPMEFSSYFHYCRCLKFDQRPDYGFLKGLFRDLFTRKGYKSDYLFDWTILKFQQTMLQSQSNAPIAILSDLDQLDVD KHKENYSIQNAVERPSVNCDPPRVCMEIRAPNVQNINHKIQKQ 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 361 361 7.3E-183
Gene3D 1 335 335 6.7E-103
PANTHER 1 361 361 7.3E-183
SUPERFAMILY 5 290 286 4.59E-82
ProSiteProfiles 9 277 269 28.344
SMART 9 291 283 6.6E-13
Pfam 9 228 220 1.1E-28
ProSitePatterns 15 38 24 -
ProSitePatterns 124 136 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0175900.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…