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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0198800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0198800.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC1 protein kinase; TAIR: AT5G24810.1 ABC1 family protein; Swiss-Prot: sp|P73627|Y1770_SYNY3 Uncharacterized protein sll1770; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RN26|A0A0S3RN26_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0198800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:41847507..41873193) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CATTTTCTATATATTAAAGACTATAATTTATCAGCCACCATGCTTCAGGTATACACGGCAACATTATCTGCCTTGTAAAT ATGGCTTATTTTGGGCTTACTGCCGTGCTGCTGTCCGATTAATAACATTGGTATATACGATAAATATGTATCTTTTTTGT AGGATTTTCCTTTGATTCTTTCCTAGTGTTTTCTGTTATCTGTTAATGTCCGACGTTCTTCTTTACAATCTGGTCACTCT TCCACATCGGTCTCTTTGGCCTTAAAATAACCTTCATTCCGTGTTTTAGGTTGCCTGTGAGAATGGGGTGGGGAAACATT TACAGAAGACGTATTAGAGTATTCACCATGGCCTTAGCAATATACCTAGATTATAAGGTAAGCTACAACGGTTGCTCAAA TTTCTTTTGTTTTTTTGTCCATATAATTAAATTACACTTCTTACTTTCTGTTATTTGTCTCTGTAGGGTGTACAACAACG AGAGAAATGGACTAACAAATCTAGACAACCTGTACTGTGGGAGAAGGCTCATGAGCGCAATGCTAAGCGGGTTCTAAATT TGATACTAGAGATGGAAGGTTTGTGGGTGAAACTTGGGCAATATATGTCAACACGTGCAGATGTGCTTCCTGCAGCTTAT ATACGTCTTCTGAAGCAGTTACAGGACTCTCTTCCTCCTCGCCCCTTGGAAGAGGTTATTCTCTTAATGTTTTTTTTATA AATAATGATACTTAAGTTTAAGAAATCGAAGACAAGAAATATGCTTTTCGGAAATGATTTACTGTATAAGCCTATTAGGT TTGATAAGAAAATAATGTTTCTCATTTTTAAGCTACATTGAATGGACTGTGTAATGCACACTTTGTTTGATGAAAATAAA CTTGTTAGTTTGGAGTTTGGACTTCACAATCCATGATCAAGAATAAGGGGCCTTCATTTGCTAATCAACATAAGAATTTC 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TTTTTATCCCAATCCTCAGCTTCAGGGGGGGAATACTCAGGAAGTTGAGTCTCCAGAATTGTCTGTTATTCCTCTTCTAC AGGATCCCTTGATGCCTTCCTCTATTCCTATCACTGAGGACAGTGATGATGATGACAATGGTCCTGAACTAGTACCAAAT CAGAATGATGACAATGGTCCTGAACTAGTACCAGATGAGAATGATGACAATGGTTCTGAAGTAGTACCAGATCAGAATAA TGTTGACAGGTTCAGGATAAAGTACCAGCGGAAAGTAAAACTCGTCCTGATCCAACAACAAGTCCAATCGTCTGATCCTG AGGTAAGTGTTGCGAACCCTGAGCCTAGTAATTCCTATGAGCATAACCTTGATGACTTACCTATTGCCTTACGAAAAGGA AAACGTTCTTGTGCCAAGTACCCTATATCCCAGTTTGTGTCTACTCAAAATCTTTCTGTGCAGCATCAGAGTTTTATTTC AGCTATTGACTCTATTAGAGTCCCTACATCAGTACAAGAAGCATTAAAAGATAAGAACTGGATTCAAGCCATGAATGAAA AGATGCATGCACTGGACAAAAATGGAACTTGGGAGATTGTTGAGAAGCCAAATGACAAGAGGACAGTAGGTTGCAGGTGG ATTTATACCGTGAAGTACCGATCTGATGGCACACTTGACAGGTATAAGGCGAGGCTAGTTGCAAAGGGATACACCCAGAC CTATGGAATTGATTATGAAGAGACATTTGCTCCGGTAGCAAAAATGAACACTGTAAGGATCATTCTTTCCTTAGCAGCTC ATTTTGATTGGGAGTTGCAACAGTTTGATGTTAAAAATGCTTTCTTGCATGGAGATTTGGAGGAAGAGGTGTATATGGAG ATTCCACCGGGGTATGACCCTACTTCAGGAAGAAATAAGGTGTGCAAACTGAAGAAGGCCCTATATGGGCTCAAACAGTC 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TACACAGTATGTCCCCTCAGGACTTCAGTTGACTGATGTGCTCACCAAAGGACTTCCCTTGGAGCGGTTTCGAGAGCTTA CTTGCAAGCTGGGAATGATAGATATTCATTCACCAGCTTGAGAGGGGGTGTTGTAAATAAGGAATTAATATAAGAATTAT TATTAGAAGATTATATTCAGTATTAGGAGATTTATTCTCTTATTAGGAGATTGTGTACATAATTAGTTATTTCCTTATTT AGGATTAGTCTTCTTCTATATAATGTAATTACCCTTTGTATTCTGATTAAGAAGTAATAATACAATTTCTCCTACTTTCA AGTGAAACATTCACATTCACATGAGAAGGGAGGTTTTGCTCAATCTTACAGAAGTTTCGAACGCTGGTGAGTTCAGTTGA GTGATAGGGATGAGGCTATTCATGTAATTTCACTACTCCCTCCGTTCCTTTTTAAGTGTCGTTTTAGAAGAATTTTTTTG TTCCTATTTAACTGTCATTTTGATGTTTTAAGGTTCTATTTGTCAATTATACCCTTACTTTTTCAATAACTCCACTTCAC ATTTTCCATTAAACTCTCATTTCTCAATAACTATGAAGAGCTTTATGACTTTATGATTGGGTGAGAGTGGTAGATGGTTT AATGATATGAGAGAGTGGGAAAAAAACTAACAATTCACTATCTTGATTGGAGAGCTTTATGACTTTATGATTAAGGCGTG AGAGGGTAGAATGGGAAAAAACACTTTAACAATCCACTATCTTGGTTGGAGAGCTTTATGCTAAAATGACACTTTAAAAG GAACGGAGGGAGTAATAATTAGTTTCCTCCTAACTGTTTTACTGCCTTTTTGCATGCCTGAGTTATTTGAGCAAGAATTG ATATACCATGGAATTTATTTGTTTTACAGTAAGTTGAGTTATAAATACCACCAAAGCACACATGTTGGTGCTATGGTTTG TCAGAAGTGTATACTTCTTTGATTGACTGTAGCGTCTGTTCCGTGTTGTTATTAAGTTAAACTTTTTACCATCTTACAGT ATATCACATCCTGTACATTCACATTCCGTGCGGTTACCCTGAAATAATTATTTACCTGCTTATTATCTTGCAGAAAACTA AACCTTGAAGAGAATGTTGCAAACATTTGGCCAGGATTTGGATCAAATGGGAAAGATGTTATTAAGGTCAAATATTGATT TTTTCCTCCTAGCTGTAGCTCTGAAGCTATTATTTTAAAGAATGTTTTGGTCGTCTATTTCAGGTTCATCACGTGCTTAA CCATACATCTGGTTTGCACAATGCAATGGCAGACTTAAATCAAGAAAACCCTCTTCTGATGCTTGATTGGGATGAATGTT TGAAACGCATTTGCATGTCAGTACCTGAGACCGAGCCTGGCAAGGAGCAGATTTATCATTATTTGTCATTTGGTTGGTTG TGCGGTGGAATCATTGAGGTATGAATGCTTGCCCAACTGTGTCAATTTTTTTTTATCTACCAAAAAAACGATTATTTGCT TAAGCCCATTATAAGGACTAAGGAGTAACAGAAAATTTGTGAAAGCAAGGAACAGTAATAAAATGATATATTTGAGTAAT GTTACGGGGTGGGTGAAGGGCCACTTTCGTCCCTAAAGTTACAAGCGTCGGGCATATTAGTCCCTATTCTATGGAAATGT CGCCCGTAGTCCCAGATGTTGCAAAATGTCAAGCACGTTAGTCCCTGGCTTGGCTCCCGTTAATTCCACACCTGAGATAG GACTTTGTCAATTTCAGCAACTCCACACTCTACATCTCCTTCTCCCTCACTTTTCATAACTTCATCACACCTTTGCATCA TCTCCCTAATAAGATCCTCGATCACTCTCAGCTTCTTGAAGCACATCCAAAACAATGAAAACAGAGAAAACCCATGATTA CCAACGCAAAAAAGTTTTTTTCTTTCTTTCAAGAAATGCATGTTCAATAATTTTACACACACCCCAGAACAAGAAAGCGA AGAAAACCCAAGTTCGAAAACCAAAAAAGATTATAACTTTACTAAGAAACTCGGAAAACCCTCTATCATACTGTTGAACC AGGGGTGGTTTCTTCAGAGCTCAACGAACGAGGGGAGGCTTTAACCGGCGAAGGAGAGAGATCAGAGACAGTTCTCCTGA GGCTCGGAGGCAGAGGGGGCAAACCAGACCTTCTTGCCGGCGGCGTGGAATACCTTGGCTAGTACGCCGCCAGATAAGGT GAGGCAGAAACCGTGCGGCGAAGAACGTGGAAAGGAAGAGAAATGGCGGAGAACCCATGGCGGGTGAGATCTTCCTGGTC AGAGAACAACTTCTTGGCGCTCGGTTCCCTGGAGGAAGAAGAAGACGACGTCGAGCAGCGCTTGTTGGCGGATGCGTGGA AACGGCGGCAGCGGCGTCGCTTGCAGGCGCTGCAGCTGTTGAGGTGCATCATGGAGAACTGGCTGGTGGTGGGGTCCACC GCTCTGCCGGTGGTGCTGGTGTTAAGAATGGGTTCTTGTTGTTGGCTTTGACTCTGATCACCGCACATTTGACACTTCGG ATTCAGAACCCTAATTGCAATGGTGGGTTCTTCTTGTTGGTTCTGAATCTGTTGGTGCACTTCACCCATTCTTGAACCCT AATTTCGTTTTTTCTTTTGGTTTTGTTTTGTTCCTCGCTCAGAAATGTTTGGTTTTGGAGTGAGGAGGAAGAAGATGATG GAGAGATTGAAGCTTTTCTGATTTGGGGATTTTGGACAGGGACTAAATTGAAGTTTTTAAGTTTTCCCAAAAAATTTCCC AATATTTAAATCCACGTGGAAAGTCCACAGGGGCACATAACGTGCCAAATCACCCTTCTCGTTAACGTTCACTGACGGGA GCCAAGCCAGGGACTAACGTGCTTGACATTTTGCAACATCTGGGACTACGAGCGACATTTCCATAGAATAGGGCCTAAAT TGCCCGACGCCGGTAACTTAACGGACGAAAGTGACCCTTCACCCAATGTTATGCTTGTGTATAGCTTATCTACAAACGAG CCTATGGCATGTCTCACCAATTTGTTGATGGCAGTGTATATAAGAGTTTTTTGTGATAGTGTTTTGATAAAATAGGAACC TTAGTGAGGTTGCATTCCACCCCCAATTCTCAGTGATCAAAAGTTGCTAAACCAAGTACTAGTAATTTGTTTGTCCCGGT AAGATTTCTATCTGATTATTTATTTGGATAAAACAGCATGCCTCTGGTAAGAAATTTCAGGAGATTCTTGAAGAAGCAAT AGTCCGTCCCCTACATATTGAAGGCGAGCTATATATAGGGATTCCCCCAGGCAAGTTTTGATGAATTTATTCTTTTTATA AGATGATATTAAAGTTGTATTTGTCTATTTGGCTTGCATATGAAATCGTTTTAGTTTATAACAGCCGCTAGTGAGTGTCC TTGACACTAATTAAAGAATCGAAAGTAGAAAGCATTTATAGAAAAGTATAACATATAAAGTTACTAATATGTTAAATGCC ATACTTTTCAATAAATACTTTTTATTTCTTGATTCCTCAATCTTTTTTTCAAGAGATTCATTGGTAATTCTTATTGCTTA CTTTATACGATTCTTGTTAAAGAAAATTTTCATTGGATCTTAGTTTCTTTGTAAATTGTAACCATGCATCTTTGCTCATA TTTTAGGGGTGGAAGCACGACTTGCAGCTCTGACTGTAGATACAGATGATTTAAGCAAGCTGTCAGCAATTCCTACCCGT CCTGACCTTCCTTCCACCTTCCAACCGCAGCAAATAGCCCGATCAGCAACGACTCTGCCTGCTGTTTTCAACACACTGCA TGTTCGGCGTGCCATCATACCAGCTGCTAATGGACATTTATCTGCCCGGGCACTTGCACGCTATTATGCAGCCCTAGCTG ATGGTGGTAAGATACCACCACCTCATTCTTCTGATTCTAAGCCAGTACTCGGAAGTCATCCGCACATCCCCAAATTATCT TCTCAGAAGGCTCCCCAAAATAGGAAATGTTTTAGGCGGAAGGAAGCAACTTTACCTTCCATGAGCAATACTAGAAGTTA CGAAAAAGTCTCTAGTTCTGAAAATTTTGAGGTTAGTGAGGGCAGAAATACTTGCAGAGATAATAACAGTAGCGATGATT CCAGTAGTAGCAACGTGGATAGTAATCTGCGCACCTGTGTTCCTGGTAAGGTCTATAGAAATCCGAGGATTATTGATGAA TTCTTGGGTGCAGGAGAGTGTGAGAATTTAGCTTTACCAAATGGGGGTTTCGGCCTAGGATTTAAGAGATTGAGTTCTAA CAATGGGTCTTCCATTGCGTTTGGTCACTCTGGAATGGGTGGCTCCACAGGGTTTTGTGATGTCACTAACAGGTTTGCCA TTGCTGTGACACTAAACAAAATGTCCTTTGGTGGTGTATCGGCAAAAATTGTCCAACTTGTTTGTTCAGAGTTGCAAATT CCGGTACCTGACGATTTCTTAAGGTTTATGGCTCAGCAAAGTGGACAGGATGAGCAGTTAAGTCTGGGGAGGCCTCTGAT TAATTGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0198800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGGTGGGGAAACATTTACAGAAGACGTATTAGAGTATTCACCATGGCCTTAGCAATATACCTAGATTATAAGGGTGT ACAACAACGAGAGAAATGGACTAACAAATCTAGACAACCTGTACTGTGGGAGAAGGCTCATGAGCGCAATGCTAAGCGGG TTCTAAATTTGATACTAGAGATGGAAGGTTTGTGGGTGAAACTTGGGCAATATATGTCAACACGTGCAGATGTGCTTCCT GCAGCTTATATACGTCTTCTGAAGCAGTTACAGGACTCTCTTCCTCCTCGCCCCTTGGAAGAGGTCTATGGCACGATACA GAAAGAGTTGGGGAAATCAATGGATGAGCTATTTTCTGTTTTTATCAATGAACCTTTGGCAACAGCATCGATAGCTCAAG TCCACCGTGCAACTTTGCTCAATGGACAGGAGGTGGTTGTGAAAGTACAACATGATTCTGTCAAGACAGTCATATTGGAG GACTTAAAAAATGCAAAGTCTATTGTTGACTGGATTGCATGGGCTGAGCCACAATATAACTTCAATCCTATGATTGATGA ATGGTGCAAAGAAGCTCCCAAAGAACTTGACTTCAATCATGAAGCTGAAAATACTAGGACAGTGGCTAAAAATCTTGGCT GCAGAAACAAGTATGATGGAAATATTAGTTCCAATAGAGTGGATGTGTTGATCCCAGACGTAATTCAGTCTACAGAAAAA GTCCTTGTTTTAGAATACATGGATGGCATTCGGTTGAATGATTTAGACTCACTGGAAGCTTATGGAGTAAATAAACAAAA TATTGTTGAGGAGATTACTCGTGCCTATGCCCACCAAATATATGTTGATGGATTTTTCAATGGTGATCCTCATCCAGGAA ATTTTCTTGTAAGCAAGGAATCTCCACATCGTCCCATTTTACTTGACTTTGGGCTTACAAAGAAACTATCAACCACCATT AAGCAAGCACTTGCAAAGATGTTTCTGGCGTCAACTGAGGGGGACCATGTGGCCCTTCTCTCTGCCTTTGCTGAAATGGG GCTTAAGTTGCGTCTGGACATACCGGAGCAGGCAATGGAGGTAACGACTATATTCTTCCGTGAAACGACGCCAGCAAATG AATCCTACAAAACAATGCAATCTCTATCCGATCAAAGAACAAAAAATATGAAGGTTATACAGGAAAAAATGAACCTTGAC CAGAAAGAAATGAAACGCTTTAATCCCGTTGATGCATTTCCTGGTGATATTGTAATATTTGGAAGGGTTCTTAATCTTCT AAGAGGTCTGTTATCTCCCCCTGTGATGCCCACTGTAAGGATTATTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0198800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGWGNIYRRRIRVFTMALAIYLDYKGVQQREKWTNKSRQPVLWEKAHERNAKRVLNLILEMEGLWVKLGQYMSTRADVLP AAYIRLLKQLQDSLPPRPLEEVYGTIQKELGKSMDELFSVFINEPLATASIAQVHRATLLNGQEVVVKVQHDSVKTVILE DLKNAKSIVDWIAWAEPQYNFNPMIDEWCKEAPKELDFNHEAENTRTVAKNLGCRNKYDGNISSNRVDVLIPDVIQSTEK VLVLEYMDGIRLNDLDSLEAYGVNKQNIVEEITRAYAHQIYVDGFFNGDPHPGNFLVSKESPHRPILLDFGLTKKLSTTI KQALAKMFLASTEGDHVALLSAFAEMGLKLRLDIPEQAMEVTTIFFRETTPANESYKTMQSLSDQRTKNMKVIQEKMNLD QKEMKRFNPVDAFPGDIVIFGRVLNLLRGLLSPPVMPTVRII
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 9 | 432 | 424 | 4.1E-213 | – | |
| PANTHER | 9 | 432 | 424 | 4.1E-213 | – | |
| CDD | 89 | 343 | 255 | 5.19962E-92 | – | |
| SUPERFAMILY | 91 | 313 | 223 | 8.39E-21 | ||
| Pfam | 108 | 212 | 105 | 6.6E-29 | ||
| Pfam | 241 | 301 | 61 | 6.3E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0198800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…