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LotjaGi1g1v0282700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0282700
Transcript ID LotjaGi1g1v0282700.2
Related isoforms 7
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like kinase; TAIR: AT1G70250.1 receptor serine/threonine kinase; Swiss-Prot: sp|P93604|LRK10_WHEAT Rust resistance kinase Lr10; TrEMBL-Plants: tr|G7I978|G7I978_MEDTR Receptor-like kinase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0282700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:68933274..68955511) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TAAACATGGGGGACCCAAATCGCACAATCATGATATTTAGGGGACCAAAAGTGCAATTAAGCCATCACAAAAGTACAATA GGATGCTTCACACGCTTAATAGGCAGTTCAATACAGAACTATTATATATTGCTTTTTTTATGGCATATTAACGGTATAAC TGAGACAAACAAAAGGCAAAAGAAAATGACGTCTATTTCACCATTGACCATTGTTAGCTATAGTCACTCTAACTCCTGGA TTACTTCTAAATCTTGGGGTAGTTGTCTTGCAGCAACACCCGACGTAGCACTTGTTCTTCTCAGTCCTGCACCTGCTGAA GAAGTGAAAGGATTAGGAGGTATTGGAGTTGTGTCTGCATCTCCTTCTAACATTTGAAGCACCATTTGCATTGATGGTCT ATCCATGGCATGCCACTGGATGCACCAAAGTCCCACAATAGCTAGTTTCCTTGCAATTTCTGCATCCCCTTCTTCTTCAA TATGGATTCTCATTTCCTCGTGTTCCTCCAAAAGATTATGAATCCATTCTGGGTAGTAAACCTGGCTACCATTTTCCTCC ATGTCTTCCGTGATCTTCCTCCCTCCTATTGTTTCAAGCAACATCATTCCATAGCTATAAACATCTGACTTGTAAGAAAC ATTGCCAAAGTTTCTTGAGAACACTTCAGGAGCAATGTACCCCAGAGTTCCTCTAGCTGCAGTCATTGACACTATGCTCT CATCCCTTGAGCACAATTTAGCTAGACCAAAGTCACATATTTTTGGAGCAAAGTTGTGGTCTAGCAACACATTTTGAGGC TTGATATCAAAGTGGAGAATGCGCTGATTACAACCTTGGTGAAGATACTCAATTCCCTTGGCTATTCCTAAAGCAATTTC ATGAAGTCTTTTCCAACCAAGGAAGTTTTGCCTGTTGTCTGGTGAATTGATGAACTTCTGGAGTGAACCGTTTGGTAAGA 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GTGTGCACGTTGTCATCTTTGCGACAGACGCAAAGGTGTCACCATAGTCAACTTCCATATTGTTGCTTATTTCCAATAAC AACTAGTCGAGCCTTGCAACAGTCTATGGAGCCTTGCAACAGTCTATCGAGCCTTGAAAAAGAGATATGGTCAAGGTGAG ATGAGATGCAAAAAATAATTCTTGAAAGATGACATTTGTAGAGACCCGAATCCGACATTGATTATGATCATTACACAAAA CCTTTTTGGTGATCAGAGTATCCAAGAAAAGCACATTCAACAGATTGGGAGGTGAGCTTTGTGCGTTCTTGGGGAGGAAG ATAAAGGCAACACACACAAACAAAGGTGCGAAGGTTAGTATATATGAGTGGATGACCAAATAACCGAGTGAAAGTAGTGT CATTGTTCAAACATGGAGAAGGCAAGCGGTTGATGAGATGCACAACAATGGAGAGATCTTCACACCAAATCGAGTTGACT CTAATACCATGTCAAAAACCAATTATCCCAAAAGGTTAAGTTGTTGGTTAAGGGTCATATGAATGTTTTATAGTATATAC AAACACGTCCTCTCACGCAAGAGCCTACTTGGGCTTCAAAGCGTGGATAATGCACATGTCCATCTATGATGTGCTTAAAT TCCATTTTTTATTAGATAATGAGTGCAGCAAGATTCAAACTCTAGATCGCTCGGTCATAGAGGCTCTGATACTATGTCAA ACGCACAAAAATGGAATGAAAATACTATCATAATGGAGAGTAGACAATATAGAGCTAACTTTATAATGATACAAAAAAAA AACAATATTACGAATAAGGAAGTAATATATCACCTAATTGTGGAAATAAATTCCTTGATCAGTAACAACTATTTAACAAT TAATCATAATTACATCCTTGGTCAACTACAGCTATATACAACAATTAATCTTATTTACAACTCTCTCTCCCTCTCCTAAT CAAGAACAATTATTGATCAGTAACAACTATTCAACTAATTAGCCAATCAATTTCTTTGACATCGTGGTGGACAGGCATCG GCGGCTGCGGCTGGAAATCAAGGTTGAAGAAGGAAGAAAATGAATGGAACGTAGCGTTTGGATGAAACGCAAGGTCTTTT ATGAAACACATCGTTTCATTCATTAATACATAAAACTCCAAATGCCGTAAAATGTTTGACCAAATGTTTAAATCTGGGGA AAAGCTAGGGTTTTCCTAGGTTTTCTATCTCCTTCCCTGTCGCGCCGCTATAGTGCTGCTGCTCACGTGAAAATGGTCGC AAATTGCGCGCTACCACTGCTACGCAAAACTCGCACTGCTACAGCCTTCGTCTTCGATCCGCCACGCTTTGCCGCAATGG CGGCAGTGTTGGCGAAGGGCGGTGGTTGTAGTGAAGGGTGTTGGTAGAGTGCTGGAGGTAGGGTGTTGGTGATGGTGGGG TAAGGGTGGTGGAGGCAATTCTAAGAGGGGTGGGTTTGGTTGTGGTTGTAATGGTAGTGTTGTAGGGCGGTGGTTGTGAC AATGGTTGTGGCAATAACGACAACAACAGTGCCAGTTGTGAAGGGTGGTGTTTGTGGTAGTAGTGGTGGCAATGGTGGTT GTGGGTGGTGGTAGTAGAGTGGTGGTGGTGGTCGTGGCGATGGCGGGGGTCGAGGAGTTGGTGATGGTGGTGGTGATGGT GGCGATAGTGGTGGCGACAATGTTGTAGATAGGTAGTGACGATGGCGAATGGTGGTGGTGGAAGTGGGTGGTGGTGATTA TGGGAATAGAGTTAGTGGTGGTTGATGTGGTGGTGGCGATGGTGGAAATAACGGTGGGAGTGGCGATGGCATTGGCGGCA TCGGTTGTGGTGGCATTGGTGGTGATGGTGGTTGTGACAAGTAGGTTATTCGTCACAATATTATCAGGACTTATCCATCG TCTATATTGTGGATTAAATAAGGCTTAATCCTCAAATAGTCCATGTCTTTGTCTCGCCGTCTGATGTAAGTCCATCCCCG AAAAATTTTGTGGAATACGTCCCCATTTTTGCAAAACGTCTGGAGCTAGTCTTCGCCGGAGCACGGCGAAGTGATGAAAT GGCATCGTGACTGTGTAAATGAAGCTTATATGACACTAAAAAAATATAAAAAAATTAATATGAAGTAAAAAATAAAAATA AAATTACACATCATAAAATTAAACTAAATTAAATTAAATTAAAAACTCAAATAAACCTCAATTCTAAACCCCTAATTCAT CTTCATTAACATGAACATTAATCTTCTTCAACATCATGATTGTTCTTGATATGAATTTTTTTACATTAATCTCATCTTCT TTTTCTTATTCATATTCTTCATAAAATTAAGAATAGTATACAAAATAAAATACCAAAACACCAAATTTAATTCCCCTGAT CTTCAATTAAAAAAAAATCCCCTCATCTTCAACATCATAACAGAAACCCAGAAACACAAAAATTAAATCTAGAAAACAAA AAACCCCGACCCCAATCAAATCCCGAACAAAAAACCCATGAGAGTCAGACCCATAAGTGGTGGTGGTGGCCAAGAAACTC AGAAGCAGTGGCGGTGGCCAAGCTGTCAGTGGTGGTGGTTGTGGCCAAGCTGTTATGGGGATTGGGCCAAGAAACGGGAA GAAGCTTTTTCCCAGCAACAAAATCCCCAATCAAACAGGTTATGGTGATTGGCATGATGACAGCGAGCACAACGTCTACG CCATCAATTGGACTCTTGACACAAATTATAGATAATAAAAGTCACCCGTGCAAATGCACGGACAATTCAGCTAGTATATC TCCTAATTGTGGGAATAAATTCTCTGATTAGTAACAACTATTTAACAATTAATCTTTATTACATCCTTGGTCAACTACAA CTATATACAACAATTAATCTTATTTACAACTCTCTCTCCTAATCAAGAACAAATCTTTGATAAGTGACAACTATTCAATT AATTAGCAAATCAACTTCTTTGACATTGGGTGAAATGCAGTGTTTGGATGCAATCATGAAACACGGTGTTTGGATGAAAC ACAAGGTTTTTTATGAAACACATCGTTTCATTAATTGATACAGAAAACCCCAAAATGTCCTAAAATGTTTGACCAAATGT TTAAATCTAGGGGCAATCTAGGATTTTCACCTCAGTTTGCCTAGGTTTTCTATCTGCTTCCCTGTCCCGCCGCTATAGTG CCGCTCCTCACTAGAAAATGACCGCAATTGCGCGCTACCACTGCTTTGCAAAACTTGCGCCGCTACATCCTCCGTCGTTG ATCCACCACACTATGCTGTAATGGCGCGCTATTAACACTTATCCCAAAAACTTAAATTGTTAAGTATGAATTATATATAT GATTTTATATTATTATTTTTACACCATCTAGAATAGAGTTCAGTAACCCATAAGATAAGTTAGACAACCACCATATATTA TCACGGTTTCATTTGACAAGTTCATGTAAATACTTCACATGACAAGACAAATGTTATCAGTGTCTCTCTTTATATCATTA AATACGTTAAACACTCAATATTTAAGTGGTTATCTAAGTTAACAATGAGAGTTATTTAACCACCTTAGTAGACCAATAAG TAGTTTTCTCACTGTTACATGCATGTTTCTTGCAGACAGCATTCCTTGGATTTTAATTGATATATTAGGTACGCACATGC CTTCCCTTATGTCAGTTACCTATATGTTGAACAAAAAATAAAAATAAAGAGTCAATTACCTATTTGCAAAAAAACTAATG TATTATCTGCATTAATTATTTCTTTTATGTTTACCATTTAATATTCAACATTAAAAGACAAATGTTATCAGTGTCTCTCT TTATATCATTAAATACGTTAAACACTCAATATTTAAGTGGTTATCTAAGTTAACAATGAGAGTTATTTAACCACCTTAGT AGACCAATAAGTAGTTTTCTCACTGTTACATGCATGTTTCTTGCAGACAGCATTCCTTGGATTTTAATTGATATATTA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0282700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAAATTCTACACTTTGACATCAAGCCTCATAACATTCTTCTTGATGAAAATTTCAATCCAAAAGTTTCTGATTTTGG ACTTGCAAGGCTCTGTCCTACAGATAATAGCATTGTGTCTTTGACAGCAGCAAGAGGAACCATAGGATACATGGCACCAG AGCTATTTTACAGAAATGTTGGCACTGTCTCTTACAAAGCTGATGTGTATAGCTTTGGGATGTTACTTATGGAGATGGCA GGTAGAAGGAAGAATTTAAATGCATTGGCTGAGGAGTCTAGCTTTAGCCAAATTTATTTCCCTTTCTGGGTTCATGACCA GTTAAACGATGGAAGGGAAATCACAATTGAAAATGACACTGATGAGGAAATGAAGTTGGCAAAGAAAATGATGATTGTGG CTTTGTGGTGTATACAGACAAAGCCTACTGATCGTCCTCCAATGGATAAAGTGTTGGAGATGCTTGAAGATCATGAGGAA TTACAAATGCCTAAAAAGCCTTATCTATATGCACAAGATTTACCAGCAGAGTATGCAAATGACAACACATGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0282700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKILHFDIKPHNILLDENFNPKVSDFGLARLCPTDNSIVSLTAARGTIGYMAPELFYRNVGTVSYKADVYSFGMLLMEMA GRRKNLNALAEESSFSQIYFPFWVHDQLNDGREITIENDTDEEMKLAKKMMIVALWCIQTKPTDRPPMDKVLEMLEDHEE LQMPKKPYLYAQDLPAEYANDNT 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 180 180 6.8E-103
Gene3D 1 171 171 2.9E-40
PANTHER 1 180 180 6.8E-103
Pfam 1 153 153 4.1E-24
SMART 1 155 155 0.004
ProSiteProfiles 1 161 161 23.651
SUPERFAMILY 2 156 155 7.19E-37
ProSitePatterns 3 15 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0282700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…